很显然，基因不是癌症机理的唯一解释。

至少，关于癌症干细胞的假说也很有提示意义。

人们早就发现生命中存在着一些具有无限繁殖潜能的细胞，它被称为“干细胞”，也称“起源细胞”。这种细胞数很少，但却具有不朽生命力及无限且多方向繁殖能力，就像“种子”一样，在一定条件下能够源源不断地产生各种类型新的细胞，它是形成哺乳动物体内成千上万种类别的组织器官的原始细胞。在发育过程中，从最原始的干细胞开始，逐渐产生了结构和功能上稳定的各种不同细胞，这一过程称为细胞“分化”。打个隐喻，新生儿哇哇坠地，逐渐发展成遵守社会规则的良民（也就是结构/功能稳定的各种正常细胞），而良民又各有社会分工；这叫做“分化”，即“发育成熟”。人们因此猜想：也许癌症就是因为一些干细胞“误入歧途”，导致了它的子代细胞发育不成熟（或者说是干细胞的分化异常），促使了癌细胞的大量繁殖。这可以解释很多癌症现象，包括化疗耐药等，因此，颇受重视。

最近，美国俄克拉荷马大学癌症研究院的学者说他们发现了一种新的、仅存在于癌症干细胞中的蛋白，这又激发了人们最终彻底消灭癌症的勃勃野心。他们认为：研发出专门攻击这类蛋白的药物，就能够截断癌症的源头（干细胞），从而达到彻底消灭癌症的目的。

然而，人们同时发现：高度分化的细胞在一定的条件下可以表现为“去分化”，所谓“去分化”即从一个分化程度较高的状态转入分化程度较低水平。也就是说：原本行为正常的成年/老年人，退回到孩提时代，变得像不懂事的孩子，想怎么样就怎么样，不按照社会规范行事。换句话说，成熟细胞的去分化也可以致癌。看来，上述的干细胞来源说充其量只能是癌症发生学的一种可能。

然而，更值得重视的是2006年的《科学美国人》报道了一个著名实验：将已经癌变的干细胞移植到一个新的微环境中，这些干细胞并不产生肿瘤；相反，将正常干细胞移植到先前受放射线破坏的微环境中，则会变生成癌症。这个似乎提示，环境（微环境）也起着重要的作用。

此外，还有实验研究表明：非干细胞在特定条件下有可能逆向转化为干细胞。看来，这些事实又促使癌症的干细胞说变成了一个“鸡”与“蛋”类似的新的悖论！也许，最初的突变既有可能发生在干细胞本身，使它们的自我更新失控，克隆出带有癌化倾向的子代细胞；也有可能是它们的子代细胞癌变了，在某种机理作用下，突变不断累积，并逆向地影响到祖细胞（干细胞与最终成熟的细胞之间隔着好多代，祖细胞是两者中间一代的细胞）。当然，也可能还存在其他机理。

总之，随着生物学机理研究的深化，人们越发发现癌症问题的错综复杂。同为某种癌症，每个个体所患的也不尽相同！不仅仅症状、性质不完全一致，而且，起因可以各有千秋，并不存在划一的机理和解释！错的只是人们太愿意把扑朔迷离、千变万化的真实世界，人为地纳入自我设定的简单理论框架中，然后妄想着用一种通用的方法，一劳永逸地解决难题。

看来，过去那套因果律、线性思维等的研究方法，在癌症探讨中，顾此失彼，捉襟见肘，严重制约了认识的深化。