bioconda是conda上一个分发生物信息软件的频道,现在已经有超过2700款软件。由于国内没有基镜像,下载安装生物信息软件速度十分缓慢,经常中断,生物信息人迫切需要一个国内镜像。Bioconda is a channel for the conda package manager specializing in bioinformatics software。 201 ...
肠型,Enterotype,是2011年在这篇文章中提出的,即将过去的2018年又有20多们肠道微生物的大佬对肠型的概念进行了回顾和确认。一直比较好奇怎样来用代码分析肠型,今天找到了这个教程,放在这: 这是那篇原始的文章:Arumugam, M., Raes, J., et al. (2011) Enterotypes of the human gut microbiome, Nature,doi://10.10 ...
阅读的综述翻译的中文杜标题是《肠道菌群失调促进结直肠癌的发生》,英文名为『Dysbiosis of gut microbiota in promoting the development of colorectal cancer』,文章地址在:https://academic.oup.com/gastro/article/6/1/1/4430984 从公众号 胃肠学术平台 中的推文中看到了这篇文章,于是决定读下。 阅读的要点 1. ...