根据基因长度及位点分布识别全基因组上组蛋白修饰模式(密码)代码

热度 2 令狐昌贵 2012-4-13 14:55

折腾了几周，基于perl编程，根据基因长度及其在染色体上的位置分布信息，在全基因组上我识别出了42641个组蛋白修饰模式组合(也就是某些人说的组蛋白密码)，然后去除冗余，得到18506个不重复的组蛋白修饰模式。统计分析发现，其中大部分模式在全基因组上只出现了1次。出现次数大于等于4次的模式一共有927个。之前我在全基因 ...

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perldoc真是一个好东西~

令狐昌贵 2012-4-6 11:00

想学习好perl的，perldoc是一个不错的地方~，看看人家解释split多么清楚。以前很多人推荐，还不是很信，去过几次都浮光掠影没发现精华，今天算是领教了。 split /PATTERN/,EXPR,LIMIT split /PATTERN/,EXPR split /PATTERN/ split Splits the string EXPR into a list of st ...

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人生的六条真理

令狐昌贵 2011-12-20 13:39

1、不可能用你的舌头，舔到你所有的牙齿。 2、所有的傻瓜在读到第一条真理的时候，自己在尝试。 3、第一个真理是个谎言。 4、你正在笑，因为你也是傻瓜。 5、 ...

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各种格式转换在线工具

令狐昌贵 2011-11-21 15:08

http://www.bugaco.com/converter/biology/sequences/index.php Sequence conversion Provided by Bioinf @ Bugaco Conversion map: ace to clustal ace to fasta ace to fastq ace to fastq-solexa &nb ...

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Perl教学视频-探索Perl的世界-Superor作品

令狐昌贵 2011-10-18 14:21

from:http://bbs.chinaunix.net/thread-1707137-1-1.html 写在前面.非常非常感谢 Superor 拿出自己的 时间 ，为中国的 Perl 界做出了第一个中文视频教程，象别的语言都有很好的教程。Perl 的相比起来还是少.看视频，在入门时还是相当方便的，就象电影来看就好了。我基本 Superor 老师每出一集我都看了。希望大家也认真 ...

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perl基础：perl中@_,$_和$1,$2,...及其类似变量的含义

令狐昌贵 2011-10-17 22:10

Perl's a great language for special variables - variables that are set up without the programmer having to intervene and providing information ranging from the number of lines read from the current input file ($.) through the current process ID ($$) and the operating ...

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