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Circlize在线绘图环形热图 – bug修复版 2022-09-24
最近有热心网友反映,我们的在线绘制环形热图貌似有 bug ,于是后台查了下代码,经查,果然是 bug ,并及时向 circ lize   R 包大神进行了反馈。 ...
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在线绘制基因表达谱聚类热图heatmap 2022-09-23
聚类热图是生物医学论文中最常见的一类图。一般情况下我们认为cluster(聚类)、   heatmap(热图)两个词表达的是同一个意思,往往相互替代。然而这两 ...
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在线绘制“美貌与智慧并重”的圆形相关系数弦图,给文章加分! 2022-09-21
俗话说 “一图胜千言”,而一张“美貌与智慧并重”的图放在文章中,往往会让审稿人眼前一亮,无形中给文章加分! 相关系数是生物医学论文中最常见的一个 ...
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ChIP-Seq,MeRIP-seq峰(peak),eccDNA等基因组位置染色体分布可视化 2022-09-17
人类基因组由1- 22 、X、Y等染色体构成,染色体经过细胞学处理后会呈现出深浅不同的染色带。染色带的数目、部位、宽窄和着色深浅均相对稳定性,所以每一条染 ...
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不知道miRNA测序数据接头就没法继续分析了吗?教你利用clustalw和blat解决接头问题 2022-09-16
miRNA是一类长约22 nt的非编码小RNA。miRNA通过碱基互补配对结合到靶mRNAs 3’UTRs以调控数百个基因的表达。因此,miRNA参与几乎所有生命活动,与生物体的生长 ...
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来了,来了!GSEA官网更新,Mouse基因集终于有了“官方认证” 2022-09-15
    长久以来 G SEA 官网 都是“稳如磐石”,Human基因集占据着统治地位,而其他物种一直没有上线。研究其他物种(例如小 鼠)的研究者不得不 ...
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数据分析,从了解你的数据开始,数据探索性分析工具包pandas-profiling 2022-09-13
身处大数据时代,每天接收到海量数据,例如高通量测序产生的一个样品的原始 fastq文件就高达数十甚至上百GB,然而,对我们来说,真正感兴趣的只是最终产生的e ...
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安利一款纯Python编写的GTF处理脚本 – GTFtools 2022-09-07
日常数据分析中,我们遇见最多的可能就是序列,例如基因组序列,C DS 序列等等,它们一般以fasta格式存储。由于序列一般按照从5 ’->3’ 存储,并且每个 ...
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