[转载]【转载】新冠肺炎各国疫情圈图在线绘制

陈明杰 2020-4-20 08:59

这个高大上的疫情图，看着就很绚。 最近发现一个能在线绘制这个图的网站，非常不错，输入数据即可绘制！ 其实就是一个极坐标的柱状图。大家可以试试！ 绘图地址

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[转载]还有中文PubMed网站你知道吗？

陈明杰 2019-11-14 22:03

对于科研工作者来说，无论你是写文章还是申请课题，都要阅读大量的文献。可找文献就好像一座怎么也迈步过去的大山，很多英文文献都不能免费下载，对日渐脱发的单身科研汪可谓是暴击伤害！ 之前小编也介绍过很多找文献的神器（除了Pubmed，你可能还需要这些文献数据库），可以回顾一下。 工欲善其事必先利其器，但要记 ...

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[转载]R包安装过程中出现ERROR: failed to lock directory解决

陈明杰 2019-11-10 13:59

出现错误提示： ERROR: failed to lock directory 原因：网络不好，以前安装的未成功，残留文件 解决：删除R目录下lib64/R/library中的000lock文件夹 或者安装时候用 install.packages(Rcpp, dependencies=TRUE, INSTALL_opts = c('--no-lock'))

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数据可视化（科研绘图）-基础篇

陈明杰 2019-9-12 07:44

科研绘图相关的基本知识，包括取色、P图等。欢迎下载查看！ 数据可视化（科研绘图）背景知识.pptx

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CFEA：游离DNA表观遗传修饰(5mC、5hmC、核小体定位）数据库

陈明杰 2019-8-31 17:06

cfDNA是疾病液体活检的一种强大工具，而cfDNA的表观遗传修饰对于疾病检测和分类也是至关重要的。 作者使用公共数据库数据，开发了标准化质控、分析流程，并构建了一个网络服务器，以在基因组规模上查询、可视化5mC、5hmC和核小体定位信息。 使用该数据库，用户能够： 1，浏览来自血浆或血清的cfDNA的表观遗传信息 2， ...

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RNA-seq测序中intronic reads占比较多的原因？

陈明杰 2019-8-23 07:17

使用 ReSeQC 做RNA-seq reads distribution时，会发现intronic占比比较多，大概30-40%，原因如下： 1，由于转录是个动态过程，期间会存在incompleted (nancant, on-going, co-transcripted,unspliced ...) spliced RNA，并且由于intron的长度一般是exon的20倍左右，所以即使有1%的incompleted spliced RNA，也会对这个分 ...

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MaxQuant处理质谱原始数据记录

陈明杰 2019-8-22 09:08

https://www.maxquant.org/ Win10 空间：10G以上 耗时：根据原始文件大小，约sample/4h，可以使用多核加速运行 1，载入数据，注意设置每个样品的Experiment，样品名 2，载入蛋白质fasta文件 注意把Label free quantification标签中的LFQ导出选中 3，运行 漫长等待后，结果文件见combined/tx ...

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[转载]METTL1通过m7G甲基化促进let-7 miRNA加工

陈明杰 2019-8-18 17:02

1，两种测序方法（BoRed-seq和MeRIP-seq）都鉴定了miRNA中的m7G修饰 2，甲基转移酶METTL1介导miRNA的m7G修饰 3， METTL1促进miRNA成熟并抑制肺癌细胞迁移 4，m7G通过拮抗miRNA前体中的G-四联体结构促进miRNA加工 参考： METTL1 Promotes let-7 MicroRNA Processing via m7G Methylation

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[转载]2019年影响因子下载

陈明杰 2019-6-23 13:52

2019年影响因子.xlsx 网上找到的，中文PubMed正在全面更新本站的影响因子，欢迎访问！ http://www.chinapubmed.net 3000多万篇 中英文双语 生物，医学文献检索平台。旨在翻译、分享生命科学、医学、药学等最新科技论文，提供文献检索， 免费下载全文 ，文章评论等服务，打造中文PubMed文献数据库！

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