科学网上头条“ 中国近十年论文总引用次数超过四百万 ”，其中报道了十几个国家近十年引用次数最多的文章，竟然发现有两篇文章是生物信息文章，啥是惊讶，如下。 5. 法国（近十年论文总引用次数6,660,630） 论文： A Simple, Fast, and Accurate Algorithm to Estimate Large Phylogenies by Maximum Likelihood 被 引次数：2,995 领域：环境/生态学 发表期刊：《系统生物学》（ Systematic Biology 11. 西班牙（近十年论文总引用数3,256,075） 论文： DnaSP, DNA polymorphism analyses by the coalescent and other methods 被引次数：2,391 领域：计算机科学 发表期刊：《生物信息学》（ BIOINFORMATICS ） 两个都是生物信息学工具文章，还有一个生物信息学工具（MEGA）可能引用次数更多，就是因为这个工具使 Molecular Biology and Evolution 的09年的影响因子激增，当然Blast除外，这个是上世纪开发出来的。 这几个工具是做序列分析，分子进化等方面常用的工具。近几年随着测序的猛烈发展，也强烈推动这些工具的发展，估计在未来几年这些工具引用次数也会激增。 这几个工具我都用过，PHYML与MEGA很早就使用过，DnaSP还是最近接触。PHYML PhyML_3.0_win32.exe 主要是计算极大似然进化树，MEGA也是的,他还能计算NJ，MP等方法进化树，比PHYML强大很多。还有MEGA的最新版本MEGA5.03 MEGA5.03_Setup.exe 集中很多其他功能，能序列比对，集合了clustalw与MUSCLE，还有一些其他一些序列分析功能，比如计算祖先，序列之间的距离等等。DnaSP dnasp51001.msi 主要是序列分析，比如计算多态，序列间或各个位点的进化速度等等。 如果想学点生物信息与分子进化，或者想进这个领域，从学习MEGA和DnsSP是个不错的选择。 或者做分子方面的一些东西会使用这两个工具将会对工作有极大的帮助。这两个工具都有图形化界面，蛮傻瓜，比较好学。
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