很久很久以前(大约2007年下半年),本人在读博士期间,主要参考以下两篇文献(一本生物信息分析方面的书,一本HMM的教程类的文章): R. Durbin, S. Eddy, A. Krogh and G. Mitchison, 1998. Biological Sequence Analysis: Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acids. Cambridge University Press, Cambridge. Lawrence R. Rabiner, 1989. A Tutorial on Hidden Markov Models and Selected Applications in Speech Recognition. Proceedings of the IEEE, Vol. 77, No. 2, pp. 257-286. 整理了一篇《An Introduction to Hidden Markov Model》,主要对离散型的HMM进行了系统介绍,包括前向算法、后向算法、Viterbi算法以及参数估计算法(其实是著名的EM算法),包括实现和理论两个方面。 缘于文中很多语句是直接从相关文献copy得到,故打算只做为自己和周围的几个朋友学习参考之用,从未打算扩散,但却被人传到了 百度文库 上,居然下载阅读还需支付两个“财富值”。其实本人并不知道这篇拙文被传到了百度文库,是Ranjan Rajendran告诉我的(他在搜HMM时,找到了这篇文章,无法下载,就通过email联系我,我这时才知道)。 是可忍,孰不可忍。 因此,本人决定将其贴于此处(本文见 HMM.pdf ),供有需要的朋友参考。不过,其中许多内容并非本人原创,请大家注意甄别,给您的学习工作带来的麻烦之处,敬请谅解。