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linux安装盘包含两张或以上iso文件: ppthelion 2016-11-30 15:19; 先mkdir /media/ cdrom, 然后mount至这个文件夹，执行install, 然后静待出现eject DVD 1 and insert DVD 2 to continue弹窗， ctrl+shit+T开启新的终端，umount这个目录(不能直接原窗口，不然打断安装进程)。重新mount第二张iso, 点继续。。 ok; 个人分类: Study_little_thing|2 次阅读|0 个评论

[转载]【转载】vmd 的linux安装: chnfirst 2012-9-4 16:48; 1.安装手册VMD Installation Guide Version 1.9.1 http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/current/ig.pdf 2.在64位LINUX中安装支持CUDA的VMD和NAMD http://www.mdbbs.org/viewthread.php?tid=23298 基本环境如下：我使用的 OS 是 CentOS 5.4 的 64 位版，显卡是一个两年前买的 8500GT ，驱动是 195.36 版。 1、安装 64 位 LINUX 。 CentOS 的安装可以选择默认设置，但是为了安装显卡的驱动，需要定制安装开发工具和开发库，不要配置防火墙和 SELINUX 2、安装显卡驱动程序。安装完成后，进入图形界面，把驱动程序文件（ NVIDIA-Linux-x86_64-195.36.08-pkg2.run ）复制到 /home 路径下，编辑 /etc 下的 inittab 文件，把“ id:5:initdefault: ”中的 5 修改为 3 ，保存退出；因为 CUDA 的驱动需要在文本界面下安装。重新启动系统，进入文本界面，进入 /home 路径，运行 ./****.run 开始安装显卡的驱动，安装后会提示安装完成，再改回 /etc 下的 inittab 文件，可以使用“ vi ”等编辑软件把“ id:3:initdefault: ”中的 3 改为 5 ，保存退出后，重新启动进入图形界面，这个过程中会出现 nVidia 的画面，表明驱动安装成功。 “ vi ”有命令方式和编辑方式两种运行模式，具体使用方法请搜索有关资料。 3、安装预编译版本的 VMD 。 1 、在 /home 下解压文件（ vmd -1.8.7.bin.LINUXAMD64.opengl.tar.tar ），进入 /vmd-1.8.7 目录。 2 、 ./configure LINUXAMD64 3 、 cd src 4 、 make install 5 、命令行下运行 vmd ，显示图形界面，安装成功。 4 、安装编译版本的 NAMD 。这个安装还不成功，还请各位指教；主要问题是解压文件（ NAMD_CVS_Linux-x86_64-CUDA.tar.tar ）后，进入 NAMD_CVS_Linux-x86_64-CUDA 路径，运行 ./namd2 ，提示找不到 libcudart.so.2 文件，把此路径下的 libcudart.so.2 文件复制到 /user/lib64 路径下，重新运行 ./namd2 ，又提示有冲突，尚未解决；曾经试着安装 CUDA 的 SDK ，仍然不成功。 5 、测试运行 IMD 。这个测试在 32 位 CentOS 下是成功的；测试文件见附件；这是 namd 网站提供的 IMD 示例；运行方法是： ./namd2 glpf.namd ，根据情况应该指定 glpf.namd 的路径，如 ./namd2 ../imd_gpu/glpf.namd 。因为是交互式的，所以 namd 停在字符界面，等待与 vmd 连接。连接方法是，在命令行运行 vmd ，然后在主窗口的 Extensions/Simulation/IMD Connect(NAMD) ，在弹出窗口的 Hostname 中填写“ localhost ”，在 Port 中填写“ 3141 ”，按下 Connect 按钮后，开始模拟。一些使用体会： vmd 在 linux 下的运行效果比 windows 下要好；在 windows 下用 vmd 打开较大的 pdb 文件时，比如 9M 以上的 pdb 文件，在进行一些操作时是要出错的。 CUDA 可以极大的提高 vmd 的运行效果；在不支持 CUDA 的情况下，在 Linux 下打开有 30 多万个原子的模型时，模型几乎不能用鼠标翻转，而在同样机器上安装 CUDA 驱动后，转动模型几乎没有延迟！！！ 3. VMD的安装教程 http://hi.baidu.com/hzw83/item/7adf2999c679978d59146179 VMD的安装教程一、vmd 1 dowload : vmd-1.8.7.bin.LINUX.opengl.tar.gz 2 vi vmd-1.8.7/configure 修改第16行和19行，安装位置 3 ./configure LINUX OPENGL FLTK TK ACTC CUDA IMD LIBSBALL XINPUT LIBTACHYON VRPN NETCDF TCL PTHREADS SILENT 4 cd vmd-1.8.7/src make install 5 使用vmd时不要使用scim输入法，使用ibus(fedora12自带）就ok. 二、我最近安装成功了，您可以试试： 1. Download the VMD for linux code form http://www.ks.uiuc.edu/Development/Down ... wnload.cgi 2. Extracting the VMD source. This will produce a subdirectory named vmd-1.8.6. Thus, cd there. 3.修改configure文件中安装位置，或不修改，则为默认安装位置 ./configure LINUX. 4. cd src. 5. sudo make Install 6. But before using the VMD, Please do this : sudo apt-get install csh. 装好后运行前视个人机器环境也许还需要： sudo apt-get install csh sudo apt-get install libstdc++5 64位系统下 1。解压 2。./configure LINUXAMD64 OPENGL FLTK TK ACTC IMD SPACEBALL LIBTACHYON VRPN NETCDF TCL PYTHON PTHREADS NUMPY SILENT 3。cd src 4.make install 5.vmd 默认安装位置在/usr/local/bin下，可以把它拷到vmd目录下三、【SimuWorld：转载请注明来源，谢谢合作！】 VMD依赖于众多其它库，因此从头编译不是一件轻松事。不过官方网站上已经提供了多种预编译版本，覆盖了Windows，Linux，MacOS等几乎所有平台。安装步骤可以简化至仅仅5步： 0. 下载文件并解压缩 1. 编辑configure文件。主要是修改目标文件的安装路径，$install_bin_dir和$install_library_dir。前者是可执行文件路径，后者是依赖文件路径。 2. 执行./configure进行配置。此命令会回馈预编译程序的编译配置选项，例如 using configure.options: LINUXAMD64 OPENGL FLTK TK ACTC CUDA IMD LIBSBALL XINPUT LIBTACHYON VRPN NETCDF TCL PYTHON PTHREADS NUMPY SILENT 表明此文件支持的一些功能。 3. 最后一步是进入src子目录，执行“make install”。这样可执行文件及其依赖的库一并被复制到第一步指定的目录中。 4. 这一步是可选的，仅为使用方便。一种做法是在自己的home目录创建一个符号链接；或者添加一个PATH环境变量来指向实际的可执行文件，这样在不同目录下都可以方便地使用VMD。这种方法也可使得多版本并存成为可能。参见：http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/current/ig/node6.html 4. 【求助】linux下VMD的安装 .threadtags_tag {margin:0px !important;background:none !important;padding:12px 0 !important;color: #444 !important;} .threadtags_tag span {border:1px solid #E3EDF5; padding:10px 14px 10px 32px; background: url(http://images.5d6d.net/dz7/default//tag.gif) no-repeat 10px 50%;} .threadtags_tag a{color:#09C !important;} http://simulation.5d6d.net/thread-7485-1-1.html 我在 http://www.ks.uiuc.edu/Developme ... cgi?PackageName=VMD 下载了 vmd -1.8.6.bin.LINUX.opengl，怎样安装？我安装configure 中的说明，输入./configure LINUX MESA FLTK TK TCL SILENT，直接结束没有任何输出，只生成了一个configure.option 文件，没有Makefile文件，到src 目录执行make 也提示错误。 Follow the instructions carefully cd src make install 1 Extract compressed archive 2 ./configure (Parameters have stored in configure.option and will be read,you needn't modify it beforce run "./configure") 3 cd src 4 make install 5 vmd (VMD will boot up) 问题在这里： ./configure后面是让你根据所用的操作系统选后缀的，并非要全部写上，我装在redhat和Centos上时就选的是LINUX，所用命令为“./configure LINUX”，就搞定了。只运行“./configure”会报错，后面必须加和操作系统匹配的后缀。; 个人分类: Linux|0 个评论

Ubuntu11.04下安装ns-allinone-2.34的总结: martydingjie 2011-7-25 15:12; 安装ns-allinone-2.34的经历，让我深深感到学习WSN的难度。由于对linux系统的恐惧，想在windows xp下安装ns-allinone-2.34，于是先安装了cygwin，然后安装ns-allinone-2.34时关键时刻总出错，网上对这种新版本的ns2的安装解决方案也没有，最后只能放弃，开始了linux安装之旅。步骤一、安装linux系统之Ubuntu 在网上能下载到 Ubuntu 11.04 http://www.ubuntu.org.cn/ ，据说是最容易和简单的linux系统，很欣慰，于是开始装。同时在该网站上下载了 wubi.exe ,能帮助初装的人在windows下自动安装 Ubuntu 11.04 。 1、在电脑里整理出10G大小的磁盘空间，用以安装 Ubuntu 11.04。点击 wubi.exe ，出现自动安装的界面，设置好安装的磁盘位置，大小，以及用户名和密码等（这个很重要，也一定要记住），系统就会进入自动安装过程，要保持网络连接顺利。 2、上述过程结束后，电脑将重启，同时进入到windows和ubuntu两个系统界面选项，此时移动上下键，选择ubuntu，进入到ubuntu的自动安装界面。整个过程，由于各种笨笨的操作失误，我持续了将近5个多小时，实际上2个小时就可以搞定。不过我安装完后，很是兴奋，呵呵，第一次独立安装了linux系统，没有高手指点，安装后的Ubuntu系统很是漂亮，与多年前我对linux系统的印象完全不一样。记得五六年前，为了完成linux系统下嵌入式程序开发，研究过一些linux，对此深感恐惧和遗憾，那时的操作系统界面不是友好界面，什么都得靠指令，而且很多应用程序要经历诸多曲折才能安装在linux下。而现今的Ubuntu系统，已经呈现出比windows 7更好的性能，令人很是神奇！步骤二、Ubuntu11.04下安装ns-allinone-2.34.tar.gz 安装操作系统只是简单的一步，ns2的安装才是令人头大的关键。按照网上的指示，似乎安装ns2很简单，只要解压、安装就能成功，可事实是，由于我下载的版本很高，很多文件并没有相应的更新，在安装过程中，要手动修改文件。 1、更新Ubuntu系统文件，虽然系统是最新版本的，但是不代表里面的文件都是最新的，需要更新。使用快捷键Alt + F2，得到程序查找窗口，输入gnome termina，打开Ubuntu的终端，里面依次输入命令 sudo apt-get update sudo apt-get upgrade sudo apt-get dist-upgrade 即可。这里首次采用sudo时，需要用户密码，也就是安装ubuntu时设置的。 2、为了更好的安装ns2，还需要进行一些package的安装，打开终端，输入 sudo apt-get install build-essential sudo apt-get install tcl8.4 tcl8.4-dev tk8.4 tk8.4-dev sudo apt-get install libxmu-dev libxmu-headers 3、在 http://sourceforge.net/projects/nsnam/files/ 上可以下载到 ns-allinone-2.34.tar.gz，版本，将其放在/home/yourfile/下，这里yourfile是用户自己定义的文件名，在终端中输入 tar xvfz ns-allinone-2.34.tar.gz cd /home/yourfile/ns-allinone-2.34 ./install 4、上述安装会出现两个问题，导致ns2安装不能成功，这也是以前的版本为出现过的。这两个问题都需要手动修改一些文件。问题1、上述安装结束后，出现tcl8.4.18 make failed! Exiting！搜索网上解决方案如下， cd /home/yourfile/ns-allinone-2.34 cd ns-2.34/otcl-1.13 sudo gedit configure.in 在弹出的窗口文件中的 77 行处的 SHLIB_LD="ld-shared" 改为 SHLIB_LD="gcc-shared" 后保存退出。 sudo gedit configure 在弹出的窗口文件中的 6304 行处的 SHLIB_LD="ld-shared" 改为 SHLIB_LD="gcc-shared" 后保存退出。问题2、出现mobile/nakagami.cc:183:73: error: cannot call constructor mobile/nakagami.cc:185:67: error: for a function-style cast, remove the redundant ‘::GammaRandomVariable’ make: *** 等， cd /home/yourfile/ns-allinone-2.34 cd ns-2.34 sudo gedit tools 在弹出的窗口文件中找到 219 行，删除 ::GammaRandomVariable sudo gedit mobile 在弹出的窗口文件中找到 183 行，删除 ::ErlangRandomVariable ，找到 185 行，删除 ::GammaRandomVariable 5、至此，重新运行 ./install 应该能顺利安装ns2，此时需呀地环境变量进行路径的设置 sudo gedit .bashrc 在弹出的窗口文件最后输入 export PATH=$PATH:/home/yourfile/ns-allinone-2.34/bin:/home/yourfile/ns-allinone-2.34/tcl8.4.18/unix:/home/yourfile/ns-allinone-2.34/tk8.4.18/unix export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/yourfile/ns-allinone-2.34/otcl-1.13:/home/yourfile/ns-allinone-2.34/lib export TCL_LIBRARY=$TCL_LIBRARY:/home/yourfile/ns-alllinone-2.34/tcl8.4.18/library 6、关闭Ubuntu的终端，并重新打开，输入ns，命令提示，ns2尚未安装，并提示使用命令 sudo apt-get install ns2 即可。再次输入ns，出现%，代表你已经安装成功了也可以运行自带的实例进行测试: ns /ns-allinone-2.33/ns-2.33/tcl/ex/simple.tcl ，可以看到nam模拟窗口。注意：不要在终端中进入ns，而是直接的运行cd 安装路径/......./examples,然后再执行 ns example2.tcl 就可以了，不会出现以下的错误：warning: using backward compatibility mode error when calling class OldSim: example.tcl NS2的安装总算告一段落，着实让我兴奋了半天，以后的路还很长，因为这是一个对我全新的领域，充满着新鲜和迷茫呢！; 个人分类: 自学知识总结|9140 次阅读|0 个评论

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