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科学网 标签 系统与合成生物学 相关日志

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相关日志

人类社会的运作机制
benlion 2020-10-2 08:39
- 科学与文化的 历史哲学 人类文明 一万年,以宗教形成和农业起源为标志,而后,文字起源和城市形成,发展了手工业与商业模式。在轴心时代,奠定了一神论宗教( 波斯 和 希腊 化时期)和三大哲学体系,经历 中古代 (自然观测与 工程 制造)的数学和技术与 艺术 发展,从大航海时代到 火星计划 时代,建立了 法治 社会(政务与文官)与 金融 机制(伦理与市场),形成了科学与工程偶合的工业化过程 - 创新 驱动发展模式。 (科学范式和 教育 与 企业 模式 - 生物学法则的群体生存,也是社会机制的伦理原则) ( Bj.Zeng - 系统 与 合成 生物学的BSSE偶合模式与NIBC会聚技术) 人类文化与科学的发展 - 公元前两千年建立了一神论宗教与精神-自然-社会(儒-释-道-墨家)哲学的思维模式, 公元后两千年建立了S(T)EA(M)体系,从大航海时代到火星计划时代,经历4次科学与3次工业革命,形成了人文与科学 哲学 和设计艺术,从实验医学与循证医学到系统医学与 精准医学 的发展历程,而将进入第4次工业革命时期。 附 - 可观测 的 宇宙 ( 138 亿年)与 地球 的世界 历史 - 从 以色列 -环 地中海 ( 罗马 )到 中国 ( 春节习俗 )-环太平洋(欧洲的延伸,包括,俄国、拉丁美洲与北美和澳洲)的发展过程 - 古典 文明与中世纪的 拜占庭 和 查理曼 与 哈布斯堡 王朝-从路易 十四 (牛顿与康熙同时代)到 十六 ( 美国 独立与 法国 革命)和科学与工业的建立时期。 ---(2011年-2020年网络日记)---
个人分类: 系统医学与药物学|2479 次阅读|0 个评论
宇宙 - 生命与机器的理论和技术
benlion 2020-4-20 16:51
《结构论》 - 4 世界与 4 轴心时代和《星际情殇》 - 历史哲学和诗歌与绘画与《火星社会》 - 纳米机器与生物工业等:公元前 2 千年,一神论宗教和三大哲学体系奠基,公元后 2 千年,建立了人文哲学和科学哲学,以及法学与金融机制,并从 手工业 作坊 发展到科学实验与机器化工业 - 仪器与技术和数学与软件,以及传媒与数据库,构成科学 - 艺术和工程发展的基础。 (中科院微生物所 原址 ) 附 - 出生在茶马古道的 相中 ,芍药园里的嫩苗和小溪流里的螃蟹,来自外公(湖北武昌)的望远镜和姑奶( 上海 川沙) 的万花筒,在童年时代留下了深刻的印记。 --- ( 2020 年网络日记) ---
个人分类: 未来世界|1404 次阅读|0 个评论
纳米机器 - 人工智能与合成生物
benlion 2020-4-11 09:59
系统医学范式 - 系统(个体化)与合成(工程) 生物学 的BSSE偶合(转化)- 精准医学模式,包括, 系统遗传学 与生物工程 - 细胞仿生学与输卵管生物反应器等概念与方法体系 - 1-生物系统理论(结构论)与图论-网络拓扑学,2-太阳能-生物电子学(细胞通讯与分子电路)设计,3-细胞发生动力学,4-自动化细胞的系统设计与NIBC会聚技术等。 1 )1991-1993年系统科学-人工智能-基因工程整合的太阳能-生物电子SBE技术,系统医学-心身关系(神经-内分泌生理与遗传学)- 实证分析与系统综合的方法,生物信息控制系统 - 自组织系统结构论。1994-1997年系统生物工程与系统遗传学和输卵管生物反应器与细胞仿生工程,DNA测序、合成和引物设计与差异显示表达分析,基因片段的设计与组装合成全基因,耐药细胞系与连续突变筛选方法。 2 )1996年组织第1届国际转基因动物学术研讨会与筹备 协会 - 1999年建立geno-brain Biosystem Network网站与阐述 BSSE (生物系统的科学与工程) 方法和筹备国际协会与会议 - 生物系统的分析和genomic intelligence(基因组与大脑智能)与人工生物系统设计 - a实验生物学-分子生物技术与b计算生物学-生物信息技术整合方法,c细胞通讯的基因组程序编制与分子电路模块的装配等。 3 )2008年成立系统生物工程研究所ltd.,2009-2010年论述细胞传感器与反应器和纳米机器设计3条原则,2009年第11届国际分子系统生物学会议和2010年加州纳米技术暨expo展览发表纳米机器设计,2012年国际 系统医学 大会 邀请做学术报告。2014年启动细胞分析与合成Molnet1.0项目,复杂系统疾病的遗传学机理和神经元-细胞网络设计与天然药物分析的微流控芯片等。 注 - 1996年与美国avigenics公司有关输卵管生物反应器,以及与L.Hood有关转基因会议的通信,2000年与N.Seeman讨论生物计算机,以及与M.Tomita有关BSSE会议的通信。 - 1999 年10月和12月在国际刊物刊登会议通知与网站,10月L.Hood和12月H.Kitano分别注册系统生物学域名,分别从a与b阐述系统生物学研究,2001年AP.Arkin论述c工程设计等。 - 1999-2001 年在biosystem network网站列有R.Rosen和D.W.Thompson有关1968年系统(理论)生物学与1910年合成生物学(化学概念)术语的文献,以及E.Kool-E.Hafen-T.Pawson等的文献。 - 2000 年第一届系统生物学国际 会议 ,2003年 贝克利 建立合成生物学研究中心 和2003年 MIT 的iGEM和系统与合成生物学(系统生物工程) ,2004年第一届国际合成生物学 会议 等。 附 - 曾邦哲( BjZeng ) ,出生在茶马古道上的湘中,在小溪流和芍药园、万花筒和望远镜的世界度过了童年时代,1972年翻阅中西医药书籍,1976年科学启蒙和埃舍尔绘画等。在少年时代,设想光合作用仿生工厂、微电子遥控昆虫和蚂蚁神经节网络的构造等。1985年厦门大学毕业,在生物物理学与心理学和仿生学与遗传工程的交叉层面形成了结构论。1994-1997年在北京中科院微生物研究所,1997-2006年留学以色列特拉维夫和德国汉诺威-英国伯明翰,2008年在江苏成立系统生物工程研究所ltd.,开展神经-内分泌和脂类代谢的细胞信号传导与基因表达调控和生物信息与系统生物技术研究等。 著述结构论(1983-1986)- 4世界与4轴心时代理论(2013-2016)和星际情殇(2003-2006)与生物工业(2009-2012)- 火星社会(2017-2019),探讨了城市群与地缘文化和道德经济学与SEA(TM)模式,以及极端环境下的医疗与生物技术发展等。1987-1991年在中西医学比较、医学遗传学与生药学和诺依曼计算机模型与分子细胞生物学,探索实验与系统科学整合的方法。1992-1994年提出系统医学-系统遗传学与生物工程和输卵管生物反应器与细胞仿生工程 - 网络拓扑学与生物电子学方法。1996年组织第一届国际转基因动物学术研讨会(暨生物技术与绘画艺术展览),1999年建立geno-brain生物系统网络的网站 - 系统与合成生物学的BSSE(系统生物科学与工程)偶合模式。2007-2012年论述4次科学革命和第3次(计算机与互联网)与第4次工业革命(人工智能与合成生物)和“社会-心理-生物”与工程医学模式。 --- (2020年4月网络日记)---
个人分类: 系统医学与药物学|1473 次阅读|0 个评论
结构论 - 4轴心时代与4世界理论
benlion 2019-5-31 22:35
人类的演化:从动物到上帝 O 网页 - 城市群 O 网页 与地缘文化 - 科学与工业革命 * O 网页 - 李约瑟难题 O 网页 与钱学森之问 O 网页 - 4 轴心时代与 4 世界理论 - 系统医学 O 网页 - 结构理论 O 网页 和系统 O 网页 与合成生物学 O 网页 的 BSSE 方法、系统遗传学 O 网页 机理与系统生物工程 O 网页 技术 - 纳米机器与工程医学等。 注 * :上世纪进入后现代社会的自动化与信息化 O 网页 ,本世纪将进入的是智能化与有机化 - 人工智能与基因工程 O 网页 等整合的 NIBC 会聚技术,包括,生物计算机 O 网页 和细胞工厂与生物能源技术 O 网页 等。 欧盟系统医学组织 O 网页 , ETH 大学 D-BSSE 机构 O 网页 , MIT 大学合成生物学中心 O 网页 ,纽约大学系统遗传学研究所 O 网页 - 系统演化理论 evolutional theory of systems 和 4 轴心时代与 4 世界理论( 1983-2016 年),包括, 1- 系统医学范式与个体化与转化医学 O 网页 模式, 2- 星际情殇 - 幻象诗 - 显现绘画, 3- 道德经济学 - 城市群与地缘文化与 4- 机器理论 - 人工智能与细胞仿生学等。 1996 年 BjZeng 组织第 1 届国际转基因动物学术研讨会(及生物技术与绘画艺术展览)与筹备国际协会(邀请 Transgenic research 为会刊) O 网页 - 1999 年建立 Biosystem Network 网站与筹备 2001 年 BSSE 国际会议 - 系统与合成生物学偶合 O 网页 概念的生物系统结构论和实验、计算生物学与人工生物系统的工程设计方法等。 注 - 系统 O 网页 与合成生物学 O 网页 - BjZeng 论述细胞分子网络的生物系统分析与人工生物系统的工程设计 - 1992-1994 年提出系统医学 - 系统遗传学与生物工程 O 网页 和 BSSE 概念、原理与方法体系 - 图论与网络拓扑学和生物电子学等, 2009-2011 年阐述纳米机器设计 3 原则和 4 次科学与 4次 工业革命等。 - 1994-1999 年 BjZeng 列有 R.Rosen 和 D.W.Thompson 有关 1968 年系统(理论)生物学与 1910 年合成生物学(化学概念)术语的文献。 - 网络日记( 2011 年 -2019 年)为备忘录,请勿转载(包括评论),“网页”为参考资料 -
个人分类: 系统医学与药物学|1985 次阅读|0 个评论
近现代与后现代科学发展
benlion 2019-1-11 08:42
Nature 最新观点:哪些生物系统需要工程(合成生物学)改造? O 网页 - 合成生物学是未来!人工设计植物光呼吸过程,大幅增加光合作用效率 O 网页 - 人工神经元的计算速度或远超人类大脑! O 网页 - 微生物活体医疗工程: 合成生物学工具箱 O 网页 - 凯泰资本战略投资美国生命工坊( LifeFoundry ),前瞻性布局合成生物学创新方向 O 网页 - 本世纪的科学与技术核心,必然是物理学 - 生物学 - 心理学整合的生物系统与机器系统的研究与开发。 合成生物学研究所介绍:苏黎世联邦理工生物系统科学与工程系 O 网页 - 帝国理工学院合成生物学中心 O 网页 - 麻省理工学院( SBC @MIT )简介 O 网页 - 加州大学伯克利分校合成生物学研究所 O 网页 - 加州大学旧金山分校系统与合成生物学中心 O 网页 - J. Craig Venter 研究所 O 网页 结构论 O 网页 - 4 世界与 4 轴心时代( 1983-2016 ): I-系统与综合哲学,A 系统医学 O 网页 - 系统遗传学与生物工程 O 网页 (系统与合成生物学 O 网页 的 BSSE 概念)与方法 -B 纳米机器与工程医学等; II-历史与社会哲学,C 道德经济学 - 城市群 O 网页 与地缘文化, D 星际情殇小说 - 显现绘画与幻象诗等。 1991-1999 年 Bj.Zeng (曾邦哲)提出系统医学、系统生物工程和系统遗传学与输卵管生物反应器,以及细胞仿生工程与转基因技术整合的网络拓扑学分析、生物电子学设计,阐述了系统与合成生物学的 BSSE (生物系统的科学与工程)概念、结构论原理和实验与计算生物学的方法体系,包括,分子细胞生物系统 - 1- 生物系统理论与图论 O 网页 - 网络拓扑学分析, 2- 太阳能 - 生物电子学(细胞通讯与分子电路)设计, 3- 非线性细胞动力学, 4- 细胞仿生学与转基因技术整合等。 ( 1 ) 1991 年系统科学 - 人工智能 - 基因工程整合的太阳能 - 生物电子 SBE 技术, 1992 年系统医学 - 心身关系(神经 - 内分泌生理与遗传学)与图论 - 网络拓扑分析, 1993 年生物信息控制系统 - 自组织系统结构论, 1994 年系统生物工程 - 非线性科学与细胞发生动力学 - 细胞仿生与分子计算机等。 ( 2 ) 1994-1997 年,在中科院的基因测序、合成和互联网生物信息与生物技术中心, PCR 引物、基因片段的设计与组装合成全基因和 mRNA 差异显示表达分析(贝克曼公司仪器)等。 1994 年系统遗传学 - 转基因技术与禽类输卵管生物反应器, 1997 年耐药细胞系与连续突变筛选方法等。 ( 3 ) 1996 年 BjZeng 组织第 1 届国际转基因动物学术研讨会(及生物技术与绘画艺术展览)与筹备国际转基因协会(邀请 Transgenic research 为会刊) - 阐述生物系统理论与系统生物工程研究,细胞与分子(信号传导与基因调控网络)生物系统的分析与工程设计。 ( 4 ) 1999 年建立国际第 1 家系统与合成生物学( BSSE 偶合模式) biosystem network 网站与筹备 2001 年国际会议 - 倡导 a 实验生物学 - 分子生物技术与 b 计算生物学 - 生物信息技术整合方法的生物系统分析,以及 c 基因组智能与人工生物系统的工程设计 - 细胞通讯的基因组程序编制 O 网页 与分子电路模块的装配等研究。 2003 年第 19 届国际遗传学大会重述了经典、分子与系统(图式 - 结构)遗传学与方法等。 ( 5 ) 2007 年 BjZeng 称系统生物科学与工程( BSSE - 相应 RI.Kitney 的系统与合成生物学 O 网页 )将带来生物医学和制造工业革命, 2008 年第 20 届世界哲学大会阐述系统与合成生物学的结构论基础。 2011 年 BjZeng 把计算机与互联网列为第 3 次工业革命和论述了 4 次科学与技术革命和 4 次工业革命等, 2012 年国际系统医学大会邀请 BjZeng 做报告。 ( 6 ) 2008 年 BjZeng 成立系统生物工程研究所 ltd. , 2009 年发表细胞传感器与反应器设计原理, 2010 年 BjZeng 在加州纳米技术与 EXPO 发表了纳米机器设计的 3 条原则等。 ( 7 ) 2014 年启动系统生物技术的微流控芯片 - 细胞分析与合成芯片 Molnet1.0 研究项目,在纳米技术 - 信息技术 - 电子技术与生物技术( Nieb )整合的层面,开发用于药物分析与筛选的软件设计与生物芯片等。 注: *1994-1999 年 BjZeng 列有 R.Rosen 和 D.W.Thompson 有关 1968 年系统(理论)生物学与 1910 年合成生物学(化学概念)术语的文献, 2000 年与 N.Seeman 讨论生物计算机, 2001 年在 biosystem network 网站列有 E.Kool-E.Hafen-T.Pawson 等的文献。 - 1996 年美国 avigenics 公司与 BjZeng 通信之后开启了输卵管生物反应器项目。 - 1999 年 10 月和 12 月 BjZeng 在国际刊物刊登国际会议通知与网站及链接 O 网页 ,涉及系统科学和纳米 - 计算机 - 神经与生物科学等, 10 月 L.Hood 和 12 月 H.Kitano 分别注册系统生物学域名,分别从 a 与 b 阐述系统生物学研究, 2001 年 AP.Arkin 论述 c 工程设计等。 附 - 儒 - 释(禅宗) - 道家与社会 - 精神 - 自然哲学 - 康德:我头顶的星空 O 网页 和我心中的道德法则 O 网页 - 计算机科学史前史简评 O 网页 :从莱布尼兹开始 O 网页 - “ 东学西渐 ” :历史暗河中的传奇 O 网页 - 法国启蒙哲学和伏尔泰 O 网页 的自然神论 O 网页 - “ 欧洲的孔子 ” 魁奈与《经济表》 O 网页 - 梵高对莫奈说: “ 浮世绘 O 网页 就是我们的信仰! ” O 网页 - 荣格心理学与佛教唯识学思想之异同 O 网页 - 乔布斯 O 网页 :禅修是了悟生命本质的修炼 O 网页 - 你的善良必须有点锋芒 O 网页 —— 爱默生 O 网页 - ( 2011 年 6 月 -2019 年 1 月总结 - 网络日记) -
个人分类: 国际化社会|1884 次阅读|0 个评论
人类医学简史 - 系统医学与纳米机器
benlion 2018-11-6 21:37
美国发布《寻找宇宙生命的天体生物学策略》 O 网页 - 脑科学与人工智能的结合:生物神经网络与人工神经网络 O 网页 - 基于人工神经网络,探索抑制神经元的生物学意义 O 网页 - MIT 将生物学机制引入神经网络,新模型或揭开抑制神经元功能 O 网页 从 1979 年 LY.Wei 发表 3P 医学(预测与预防和精准医学)和 2003 年 S.Benner 的个体化医学,到 2004 年 L.Hood 提出 4P 医学(预测与预防和个体化与参与),核心在于系统医学 - 系统(个体化)与合成(工程)生物学体系的建立,以及生物技术与医药企业的管理(传播学与博弈论)模式。 1992-1999 年 BjZeng 在分子细胞生物学层面的生理学与遗传学、细胞仿生与转基因技术交叉,提出了系统遗传学与系统生物工程的网络拓扑分析 O 网页 和生物电子技术设计方法,以及从数学与理论生物学和化学与分子生物学转换到 BSSE (理论和实验、计算 O 网页 与工程)转化概念和 NieB (纳米和信息、电子与生物)技术的方法体系。 核心技术是人工细胞设计与合成 - 传感器与反应器和微流控芯片与数据分析软件等。 Cell 专访 - 未来是合成生物学 O 网页 - 网络空间复杂性的系统研究方法 - 结构论 O 网页 - 生物学神经网络 O 网页 - 网络药理学进展 O 网页 - 网络药理学在中药研究中的最新应用进展 O 网页 - 合成生物学视频专题:构建细胞信号网络 O 网页 - 一种高效分析生物学网络的算法 O 网页 为什么乔布斯临终时叫儿子去学生物技术? O 网页 - 生物技术,诞生于 65 年前这一顿夜宵 O 网页 - Nature : 2018 年新兴生物技术展望 O 网页 - “ 医药界诺贝尔奖 ” 揭晓! CAR-T 产品获最佳生物技术产品奖 O 网页 - 系统生物工程(系统与合成生物学),就是开始于 1991 年 BjZeng 发表的系统科学 - 人工智能与基因工程整合和 “ 太阳能 - 生物电子技术 ” ( SBE )方法,以及 1992 年探讨 “ 社会 - 心理 - 生物 ” 医学模式提出的系统医学与图论 - 网络拓扑学的数学模型与方法等。 在传统医学有效的治疗与经验知识,有其内在的科学机理,医疗是实践应用,而科学是揭示其机理。系统生物学与合成生物学的核心方法,仍然是 BSSE (生物系统的科学与工程)偶合与转化模式和网络拓扑分析与生物电子技术设计的方法体系。 贝索斯成全人类首富 O 网页 - 2018 年蓝色起源公司成功发射火箭 O 网页 - 贝索斯:要帮下一代人做太空企业家 O 网页 - 2017 全球医疗器械公司 20 强排名 O 网页 - 2018 年度全球最佳 10 强制药公司 O 网页 ​​​​ - ( 2018 年 11 月网络日记) -
个人分类: 工业化科学|1783 次阅读|0 个评论
系统生物技术 - 实验室4.0
benlion 2018-9-8 18:05
合成生物学 O 网页 : 21 世纪最重要的生物技术平台 O 网页 - 掀起第三次生物技术革命 O 网页 - iGEM :来自远古生物的恩惠:鲎与合成生物学 O 网页 - 中国科学家在合成生物学领域实现突破 O 网页 - 天大、清华、华大基因 4 篇 Science 报道合成生物学重大进展 O 网页 - “ 研究背景: 2008 年, J. Craig Venter Institute 独立完成了支原体基因组的人工合成; 2010 年, J. Craig Venter Institute 又实现了由化学合成的基因组所控制的细菌细胞的创造,论文报告了从数字化的基因组信息开始,设计、合成和组装了一个 1.08 兆碱基对的蕈状支原体基因组,将其移植进一个山羊支原体受体细胞,从而创造了一个仅由合成染色体控制的新的蕈状支原体细胞,该研究是科学史上具有里程碑意义的突破。 2014 年,由约翰霍普金斯大学 Jef D. Boeke 等领导的小组实现了首条酵母染色体( S. cerevisiae chromosome III )的合成。 ” - 摘录 在这个之前的背景: 1994 年中国 BjZeng 提出系统遗传学与系统生物工程,以及基因组蓝图设计与组装生物机器的仿生工程与转基因技术整合, 1995 年采用基因片段组织合成(表皮生长因子,南京药科大学)的全基因(在中科院微生物研究所生物信息的互联网数据库与分子生物技术中心)。 2008 年天津大学成立系统生物工程教育部重点实验室, 2014 年纽约大学建立系统遗传学研究所。 第一届 iGEM 是 2003 年 T.Knight 与 D.Endy 在 MIT 大学举办,并建立了 Bio-brick 的标准件方法, D.Endy 在只是助理教授,也因此而与胡德院士都成为奥巴马的总统科技顾问。系统与合成生物学起点于中国 BjZeng 的 BSSE 概念与偶合模式,并称为在遗传育种与杂交实验、分子遗传学与转基因技术之后的第三代系统遗传学与生物技术。 揭秘克隆猴:从多利羊到中中猴,这步为何跨越 21 年? O 网页 - 日本干细胞临床疗法促进软骨重生 O 网页 - 干细胞与再生医学研究发展的新领域 O 网页 - 从 1997 年克隆多莉羊到 2001 年发现细胞周期调控机制 O 网页 的科学家获得诺奖,再到转基因打靶技术与胚胎干细胞技术 O 网页 研究获得诺奖,而到转入 4 个基因的 IPS 细胞 O 网页 获得诺奖,而后,就是基因组的人工程序设计与分子模块建构的合成生物技术 O 网页 发展 - 与系统生物学偶合的转化科学,包括,细胞计算机 O 网页 、工程免疫细胞治疗与细胞工厂等。 史上最全 100 位世界名人邮票 O 网页 - 邮票上的人物 O 网页 - 法国生理学家贝尔纳 O 网页 - 人类出非洲和摩西出埃及,从以色列宗教中心到联合国总部的建立,经历了四个轴心时代的发展,古典文明的中心在中东,而中古代文明的中心在中国中原地带,近现代科学与工业发源中心在欧洲北海区域,而后,就是北太平洋的大湾区。 从 1865 年法国贝尔纳提出的实验医学 - 实验生理学与生物化学到循证医学的临床,从 1992 年中国 BjZeng 提出系统医学 - 系统遗传学与生物工程(系统与合成生物学的 BSSE 偶合模式)到精准医学的临床,这都是科学研究范式与应用应用模式的整套体系。 从医学与伦理学到系统医学与道德经济学,从李约瑟难题与钱学森之问到 4 世界与 4 轴心时代理论,构成欧亚大陆近现代的科学与工业发展史研究过程。 近代实验室, 1.0- 牛顿 - 波义耳时代的作坊模式; 现代实验室, 2.0- 卡文迪许 - 爱迪生时代的专业实验室, 3.0- 精密仪器时代的规模型实验室; 后现代社会, 4.0- 自动化实验室仪器与计算机数据化时代。 - ( 2018 年 9 月网络日记) -
个人分类: 系统医学与药物学|2319 次阅读|0 个评论
火星 - 诺亚方舟
benlion 2018-7-11 15:59
A- 第四次工业革命 O 网页 - 教育部 O 网页 与科技部的创新创业大赛 O 网页 - 地球不够用,可以再造一个吗 O 网页 - 把火星变成地球 O 网页 ,需要多长时间? O 网页 - 人类什么时候 O 网页 会移居火星? O 网页 - 在 2008 年成立世界上第一家系统生物工程有限公司,开发细胞分析与合成芯片等。 系统生物工程(系统与合成生物学)更重要的或必须的是用在外太空和地外星球, 2014 年美国宇航局和能源部已经在开展这个项目,最终目标是与火星计划整合或合作,解决在外太空和火星居住(或极端环境)的生态和医疗技术方案。 换掉衰老细胞,就能延长寿命:延缓衰老可能比你想的更简单 O 网页 - 克雷格 • 文特尔:把生命数据化、应用化,人类健康长寿不是遥不可及的梦想! O 网页 ​​​​ 2017 载入科学史的十大科学事件 O 网页 - 估计就 CAR-T 治疗颁奖会是用于这个免疫治疗的受体发现的,就如,最早 2007 年成功实现合成生物技术在酵母生产青蒿素,而获得诺奖的是发现青蒿素的屠呦呦,合成生物学 O 网页 ,有称为幕后英雄。 创新是指的合成生物学的工程设计,创新是产业化的概念,不同于诺奖的发现;但是,在范式上,提出系统医学 - 系统与合成生物学方法体系( BjZeng 和 H.Kitano 、 L.Hood )是生物科学与医学和生物工程发展的关键。 科学发现,比如,屠呦呦发现青蒿素,技术发明,比如, Crispr 基因编辑技术,工程设计,比如,两弹一星。诺奖颁发给 original 的发现、方法和技术发明,却不会颁发给工程设计和产品制造;然而,创新 innovation 是指工程设计与产品的制造,也就是产业化与商品化的经济学概念。 国创会:围绕创新链,实施六项创新驱动发展策略 O 网页 - 阿里的 “ 三个相信 ” 、本田的 “ 三喜欢 ” :企业究竟靠什么长寿? O 网页 - 关键是创新驱动发展的社会机制建立,需要从哲学的根基出发进行深化体制改革 - 即,改变拿来主义获得或赚取财富的思维模式,建立推进创造优质产品与服务为竞争优势的知识产权经济理念。 B- 书写未来的 20 项重大科技趋势 O 网页 - 基因电路,上演一场抗癌 “ 心机戏 ” O 网页 - CAR-T 传奇 O 网页 - Chimeric antigen receptor O 网页 - CAR-T 的现状和未来 O 网页 - 梳理 CAR-T 细胞疗法研究最新进展 O 网页 - 揭秘未来的 “ 活细胞 ” 药厂 O 网页 - 系统与合成生物学的建立过程 O 网页 纽约时报深度长文:我们的癌症精准医学观念太狭隘了吗? O 网页 - 精准医学的下一个开拓地 : 心血管病 O 网页 - 全世界,目前科学界和医学管理机构认可的医学体系,只有三套: 一是传统医学(中医药,即 TCM 等); 二是实验医学(实验生理学与生物化学方法, 1985 年法国贝尔纳论述),即西医 - 临床是循证医学,达尔文与孟德尔、巴斯德等是第一代生物学,沃森与克里克的 DNA 双螺旋结构提出、转基因技术等,这是奠基了第二代生物学; 三是系统医学(系统遗传学与系统生物工程, 1992-1994 年 BjZeng 在中国提出),即系统与合成生物学体系 - 临床是精准医学,国际上的起点是 1999 年美国的 L.Hood 院士和日本的 H.Kitano , BjZeng 在 1996 到 2000 年与这两个课题组都有通信,也就说,这是生物学第三代的起点。 见,下面的谱系图: ( Industry4.0- 第 4 次工业革命) 对应蓝色框的是这个学科体系的核心奠基人,而合成生物学的工程设计已经实现了 - 青蒿素在酵母的合成,禽蛋生产药用蛋白质,人工合成染色体, CAR-T 工程免疫细胞治疗,以及在开发用于外太空的生物能源等。 人类起源 O 网页 - 伊甸园故事 O 网页 - 传说中的诺亚方舟,到底在哪儿? O 网页 - 纳什与图灵|爱与宽容两场戏 O 网页 - 聚光主题放映 | 星际漫游 O 网页 - 人活着,重要的是健康和富裕,两者不是矛盾,却是两者都不容易,而关键在于自身的心态和努力,以及环境的文化与体制,包括,社区文化和公益制度。 - ( 2018 年 7 月网络日记) -
个人分类: 工业化科学|1728 次阅读|0 个评论
实验与系统医学极简史
benlion 2018-6-27 09:52
A- 中国苏州系统医学研究所 O 网页 - 刘德培院士有关文章提到中国 bjZeng 在 1992 年国际率先提出了系统医学的概念和模型与方法,德国系统生物学研究中心 O 网页 - WolkenhauerO. 在 2001 年最早论述了 Mesarovic D. 在 1968 年提出 systems biology 词汇(理论生物学概念)。 注: bjZeng 在 1992-1999 年的有关 R.Rosen 和 D.Thompson 文献,含有 1968 年的系统生物学词汇和 1910 年 S.Leduc 的合成生物学词汇,并提出了系统遗传学和系统生物工程概念和网络拓扑学分析与生物电子学设计的方法。 2001 年在 1999 年建立的 “biosystem network” 网站与筹备国际协会等,列有 E.Kool 、 E.Hafen 和 T.Pawson 等的文献,论述了 BSSE 的结构论原理(系统理论)与实验生物学和计算生物学结合的方法,包括,基因片段组装合成、耐药细胞筛选和细胞通讯的分子电路设计概念等技术。 B- 美国纽约大学系统遗传学研究所 O 网页 - MIT 大学合成生物学研究中心 O 网页 - bjZeng 在中国 2008 年成立世界上第一家系统生物工程(同型 analogy 于系统与合成生物学 - 见 MIT 大学网页)有限公司,开发细胞分析与合成芯片等。 1992-2004 年完成《结构论》和系统医学 - 系统与合成生物学( BBSE )的体系与方法建立 * , 1991-2007 年完成《星际情殇》和城市群 - 地缘文化与道德经济学的论述, 2007-2012 年完成工程医学与纳米机器理论和 4 次科学与 4 次工业革命的论述, 2012-2017 年完成 4 世界与 4 轴心时代理论和儒家 6 艺的管理模式探讨。 其中, 1994-2003 年 bjZeng 提出的禽类输卵管生物反应器(包括词汇)方案和细胞计算机(工程设计细胞)等,美国已经在 2015 年和 2016 年分别实现药用蛋白质的制造和临床治疗肿瘤。 注 * :起点于中国的 1992 年而在 1992-1996 年国内和 1996-1999 年在国际阐述,国际学术共同体则是形成于 1999-2007 年。 C- 合成生物学迎来机器人革命 O 网页 - DNA 纳米与生物分子计算机 O 网页 - 生物狂人文特尔要借助机器合成生命? O 网页 - 环保燃料合成生物技术将为人类的太空探索提供必要的食物和燃料 O 网页 - 关于实验与计算生物学结合和工程设计的方法,在 1996-2000 年 bjZeng 分别与美国西雅图 L. 胡德院士( 2000 年与 R.Aebersold 建立研究所)和日本东京 M.Tomita (与北野宏明举办 2000 年会议)有过相关通信,而与 N.Seeman (与 T.Knight 在 1999 年举办分子计算机会议)通信探讨了生物计算机等。 在 1996 年和 1999 年 BjZeng 分别筹建的是国际转基因协会(并邀请了 Transgenic Research 作为会刊)和国际系统生物科学与工程协会。 M.Tomita 与文特尔在发表了有关 e-cell 模型的论文,因这个而 2000 年初 BjZeng 邀请(也发送到西雅图的华盛顿州生物医学协会) M.Tomita 参与 2001 年在北京组织第一届国际系统生物科学与工程( BSSE )会议,而 Tomita 与北野宏明将日本 11 月的第 9 届 JST 会议在 10 月通知为第一届国际系统生物学会议,而与 L. 胡德院士的 1996 年通信是因为制作了转基因小鼠的 Palmiter 与他同在华盛顿大学,而与 N.Seeman 讨论生物计算机是因为他在 1982 年提出的 DNA 纳米生物技术等。 而参加了 2000 年东京国际系统生物学会议的 AP.Arkin 在 2003 年建立了贝克利大学合成生物学研究所, Keasling 在 2007 年实现酵母合成青蒿素,同年苏新专与其导师米勒来华考证青蒿素的发现历史,之后米勒每年向诺奖和拉斯克奖推荐屠呦呦。 D- 1962 年 诺贝尔医学奖 得主:三位巨匠,开启了生命的双螺旋! O 网页 - 终身未嫁的十大杰出女科学家 O 网页 - 欧盟系统医学组织 O 网页 - 生命科学简史: 1/ 实验医学 - 实验生理学与经典遗传学的奠基,分别是法国 C. 贝尔纳、捷克孟德尔和美国摩尔根; 2/ 分子医学 - 分子遗传学与结构生物学的奠基,则是英国克里克、美国沃森和英国威尔金斯(及富兰克林 * ); 3/ 系统医学 - 系统遗传学与合成生物学的奠定,以 1992-1999 年中国 BjZeng 、 1999 年美国 L.Hood 和日本 H.Kitnao 为划界。 1999 年 -2007 年系统医学 - 系统与合成生物学的国际学术共同体形成,以 1999 年 BjZeng 和 L.Hood 与 H.Kitnao 为起点(或说开创了生物医学与技术又一个历史里程碑的世纪)。 2011 年底 Nature 专栏讨论系统生物学与中医药的资源开发, 2012 年国际系统医学大会召开邀请 BjZeng 在开幕式之后的下午做报告,并成立了欧盟系统医学组织与协会和 2015 年夏在瑞典斯德哥尔摩举办了夏季系统医学( summer school )课程。 注 * :富兰克林是威尔金斯实验室的科学家,以及达尔文进化论和贝塔郎菲系统论奠基了生命科学的理论基础。 - ( 2018 年 6 月网络日记) -
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结构论 - 4世界与4轴心时代理论
热度 1 benlion 2018-2-14 13:46
1983-2017 年 BjZeng 学术总结 - A 结构论 -4 世界与 4 轴心时代理论, B1 城市群, B2 系统医学, B3 道德经济学, B4 纳米机器等。 (生物计算机) 系统医学与药物学发展简史: 1983-2016 年曾邦哲( BjZeng )的学术思想 - 结构论 -4 世界与 4 轴心时代理论(科学范式与工业模式,以及李约瑟难题 - 钱学森之问等),包括 - A-1991-2004 年城市群与地缘文化模式分析 - B-1987-1991 年系统医学( 1988 年形成概念) - 系统遗传学与生物工程(生物学 3.0 - 系统与合成生物学的 BSSE 概念与方法) * , C-2004-2007 年道德经济学与行星际文明(轴心时代的文化起源和《星际情殇》及绘画与诗歌,在 2004 年预测 2009-2016 年危机),以及 D-2007-2011 年机器理论( 4 次科学 - 技术与工业革命 http://mp.weixin.qq.com/s/ZrnunkNoK28B4YXTBNiMVQ - 工程医学与生物工业) - 纳米机器(人工智能与合成生物)设计 3 原则等。 在 1992-1996 年 BjZeng 提出分子细胞生物系统 BSSE 体系的核心方法 -1- 生物系统理论与网络拓扑学(分子与细胞网络)分析, 2- 细胞分子电路概念图, 3- 生物电子学(细胞通讯与分子电路)设计, 4- 非线性细胞动力学等。 1996 年 BjZeng 组织第一届国际转基因动物学术研讨会与筹备国际转基因协会(包括邀请 Transgenic Research 为会刊) - 在国际上发起系统生物工程(系统与合成生物学的 BSSE 偶合与转化模式)研究, 1999 年建立 biosystemnetwork 网站和和筹备国际 BSSE 协会(倡导生物系统的理论和 A 实验 - 分子生物技术与 B 计算生物学 - 生物信息技术方法整合,以及基因组智能与人工生物系统的工程设计等研究)。 (一) 美国 L. 胡德院士和日本 H. 北野宏明, 1999 年分别从 A 与 B 开始系统生物学研究,以及注册域名 - 在 BjZeng 刊登国际会议通知与网站的 10 月与 12 月。 2000 年 E.Kool 和 S.Benner 等在美国化学年会发表人工生物分子的合成生物学,参加 2000 年 11 月( 10 月发布的通知) M.Tomita 和 H.Kitano 在东京第 1 届国际系统生物学会议的 AP.Arkin 在 2001 年发表合成细胞生物学的工程设计方法。 2003 年 T.Knight 等提出 bio-brick 和举办 iGEM , 2004 年 A.Barabasi 发表网络生物学等, 2007 年瑞士 ETH 成立 BSSE 研究中心。 2007 年英国院士 Kitheney 称系统与合成生物学将导致工业革命, 2011 年 BjZeng 把计算机与互联网列为一次工业革命和论述了 4 次工业革命。 (二) 3P (包括精准医学词汇)在 1979 年美国中医杂志已经提出, 2003 年 S.Benner 发表个体化医学, L. 胡德在 2004 年提出 4P 医学,而精准医学模式在 2009 年国际系统生物医学会议得到阐述。 简单地说 - 系统医学是建立在系统与合成生物学基础上的科学范式,而精准医学是其工程应用的临床医学模式。 - 2003 年成立贝克利大学合成生物学研究所的 AP.Arkin , 2014 年开展 NASA 的合成生物学项目 - 可以用于太空和改造火星的计划 http://mp.weixin.qq.com/s/arJlkUam6w_fSruyqkZ_ew 。 - 2003-2007 年 keasling 成功实现在酵母表达青蒿素, 2011 年 12 月 Nature 专栏发表系列文章论述中医药的研究与系统生物学方法。 - 2012 年国际系统医学大会召开,并成立欧盟系统医学组织, 2015 年在瑞典举办了第 1 届夏季课程。 - 2008 年 BjZeng 成立 SBE 研究所 ltd. ,启动了系统与合成生物学的芯片实验室 - 细胞分析与人工合成( 1995 年 BjZeng 采用基因片段组装合成全基因的方法, 1997 年建立连续突破筛选耐药细胞的技术)开发项目 http://mp.weixin.qq.com/s/pP-jZPSv7_Fe9c1CUq1L1Q 。 - 2015-2016 年美国实现了禽类输卵管生物反应器( 1994 年 BjZeng 提出的方案, 1996 年美国 avigenics 公司与其通信之后开启的项目)表达药用蛋白质,以及实现了合成生物技术的工程免疫细胞治疗肿瘤的转化医学。 (上) (三) 附 -A-1991-1996 年 BjZeng 在中国阐述 1- 生物系统与人工生物系统研究 http://mp.weixin.qq.com/s/gmpQO1GhVmG3Q3bf7rvOFQ , B-1997-2006 年 BjZeng 在以色列 - 德国 - 英国探讨非线性细胞发生动力学与生物计算机(仿生学与转基因技术整合)等 http://mp.weixin.qq.com/s/_ALynn0F1di3E7aZNMMfSw 。 - 1991 年系统科学 - 人工智能 - 基因工程整合的太阳能 - 生物电子技术, - 1992 年系统医学 - 心身关系 - 图论与网络拓扑分析, - 1993 年生物信息控制系统 - 系统与综合哲学, - 1994 年系统遗传学 - 系统生物工程 - 非线性科学 - 细胞发生与进化 - 细胞仿生与分子计算机 - 转基因技术等, - 1995 年基因片段组装合成和输卵管生物反应器,差异表达分析与生物信息技术等, - 1996-1999 年生物系统与基因组智能 - 人工生物系统 - 细胞通讯与分子电路 -BSSE 与实验 - 计算生物学等, - 1997 年耐药细胞系与连续突变筛选方法等, - 2009-2010 年细胞传感器与反应器和纳米机器设计原则等。 注: *1994-1999 年 BjZeng 列有 R.Rosen 和 D.W.Thompson 有关系统与合成生物学术语的文献 - 分别是理论生物学与分子化学概念, 2001 年在 biosystemnetwork 网站列有 E.Kool-E.Hafen-T.Pawson 等的文献。 - 1999 年元月 BjZeng 建立生物系统网络的英文网站, 10 月和 12 月在国际刊物刊登筹备国际协会与会议的通知及其链接,同年 10 月 L.Hood ( 1996 年因联系 R.D.Palmiter 而有过通信) - 12 月 H.Kitano 分别注册系统生物学的域名。 - 2000 年初 BjZeng 邀请 M.Tomita 参与组织 2001 年北京第一届国际系统生物科学与工程会议,以及与 N.Seeman 讨论生物计算机等。 (下) - ( 2018 年 2 月 14 日总结) -
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第3代生物学
benlion 2017-4-14 20:47
A-1992-94 年 BjZeng 提出系统医学到 2003 年 S.Benner 的个体化医学概念,系统与合成生物学*奠基阶段; B-1996-99 年 BjZeng 筹备国际会议与协会到 2007 年瑞士 ETH-D-BSSE 研究中心成立,网络生物学与工程生物学的建立与发展。 附 -BjZeng 的学术贡献: 1983-86 年结构论 - 自然与机器, 1987 年探索系统科学与生物医学, 1991-97 年发表城市群理论 - 系统医学和系统遗传学与生物工程,图论 - 网络拓扑分析和太阳能 - 生物电子技术设计方法,以及细胞的仿生工程,转基因禽类输卵管生物反应器。 1996-99 年论述生物系统理论 - 实验与计算生物学和人工生物系统的工程方法等, 1997 年耐药细胞系连续突变筛选方法,系统与合成生物学转换到生物系统的科学与工程转化模式。 2003-06 年探讨道德经济学 - 精神与知识, 2007-11 年阐述 4 次科学 - 技术与 4 次工业革命, 2009-12 年论述细胞纳米机器与工程医学, 2013-16 年 4 世界与 4 轴心时代理论 - 科学范式与管理模式。 其中, 1996 年 BjZeng 组织 1stICTA 与筹备国际转基因协会, 1999 年建立 biosystem network 网站与筹备 BSSE 国际会议与协会。 2003 年 19thICG 阐述第 3 代遗传学, 2008 年成立 SBEltd. , 2010 年加州 Nano-Expo 提出纳米机器设计 3 原则, 2012 年国际系统医学大会报告等。 注 * : 1968 年、 1910 年词汇,出现在引用 R.Rosen 和 DW.Thompson 文献,分别属于理论生物学与合成化学概念。 -(2017年网络日记)-
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生物机器
benlion 2017-3-23 11:31
企业:SBEltd. - 决策科学与管理– 设计艺术与传媒、工程与制造技术 A- 星际情殇 – 幻象诗与显现绘画 B -细胞纳米机器 - 人工智能与合成生物 协会:FSMP和BSNet – 学术会议与技术展览、艺术沙龙 研究机构:SysGene Institute 人类心理学-精神与心身(神经-内分泌-免疫-循环-代谢)健康的社会-心理调控和生理-行为治疗 - 神经网络的系统遗传学机制与人工机器设计。 - (2011年-2017年网络日记)-
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中国科学
benlion 2017-2-16 12:15
- 李约瑟难题与钱学森之问 1984 年李约瑟在厦门大学的讲演,直接导致了之后对中西科学-技术历史的探索,而钱学森之问,则引发了2010年以来对中国近现代化的历史思考。 导致了1992年-2003年的系统医学 – 系统遗传学与系统生物工程和系统与合成生物学 - 生物系统的科学与工程阐述,以及2007年-2011年论述第3次工业革命到4次科学-技术革命与2011年论述4次工业革命与社会转型等。 1 )系统医学,开始于1987年的中西医学理论比较和系统科学与哲学的思考– 提出图论与网络拓扑分析的数学模型方法; 2 )系统生物工程,开始于1991年冯诺依曼计算机模型与细胞生物学理论的思考– 提出太阳能-生物电子技术的工程设计方法。 3 )系统遗传学,开始于1994年转基因技术与细胞仿生工程和基因组稳态的思考– 提出细胞与分子生物系统的机理分析与人工设计。 实际上,系统医学 – 系统与合成生物学范式与模式,包括,系统遗传学与生物工程等,开拓于1992年-2003年而到2007年体系形成。标记事件,1996年北京1stICTA会议-1999年BSNet网站-2003年19thICG会议和2007年瑞士ETH-D-BSSE中心-2008年SBEltd.创立-2012年国际系统医学大会。 其中,a)1996年-1999年-b)2003年和c)2009年-2012年是关键时期: a )1968年系统生物学与1910年合成生物学 - 理论与分子生物学概念,转换到生物系统的科学与工程(BSSE) – 实验(biotech.)与计算(bioinformatics)生物学方法;b)细胞发生(Evo-Devo)动力学和分子与细胞图谱分析 – 及自动化细胞与生物(bionic)计算机等;c)细胞纳米机器设计与合成 - 工程医学等。 - (2017年网络日记)-
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科学方法与人文精神
benlion 2017-1-17 23:10
自从1972年形成了2个方面的潜意识 - 即,1)科学的探索与2)人文的思考,分别源于中西医学精美著作和有关孔子的社会政治。 探索的路径:结构论-1)城市群-紫色文明-生物技术-绘画艺术-道德经济学-工业5.0等,2)系统医学与药物学-系统遗传学-系统生物工程-系统与合成生物学-生物系统的科学与工程等。 (系统生物工程-系统与合成生物学,美国MIT大学网页) 1983-1986 年的结构论,开始于1983年感官的生态适应和生物体结构、功能与演化的大学文稿,以及中学时代对网纹重叠现象和毛线编织花纹的印记,形成了自组织系统的形态-结构发生和自组装进化与编织理论的观念。 1987-1991 年在西医解剖学与中医基础理论的比较,以及图论与计算机模型、细胞代谢与繁殖、内分泌生理与医学遗传的探讨等,包括,城市群的文化创造与传播等分析,形成了系统科学与人工智能、基因工程整合的“太阳能-生物电子技术”概念。 1992-1993 年分别在天津-太原、广州-长沙和新乡-武汉等全国和国际会议,论述了系统医药学概念与分子-细胞生物系统模型、城市群分析与经济-产业园的系统管理和结构论 – 从实证分析到系统综合的自组织化系统理论等。 1994-1996 年论述系统遗传学与系统生物工程 – 细胞信号传导-基因调控与代谢网络与进化-发育生物学和基因差异表达分析、转基因技术与计算机辅助设计等。1999-2003年倡导生物系统的科学与工程 – 实验与计算生物学和人工生物系统的工程设计和细胞发生动力学与自动化细胞– 细胞通讯的分子电路设计方法等。 2003-2006 年紫色文明 – 论精神与知识化社会和道德经济学,以及轴心时代文化的起源等。1996-2006年神经-内分泌与细胞发生的信号传导与基因调控研究,以及生物技术与绘画艺术等,2007-2012年论述科学-技术与工业革命和社会转型,2012-2016年论机器与工程医学和4世界与4轴心时代理论等。 注:轴心时代的文化 人类远古文明的集大成是埃及和巴比伦,约公元前2000年到摩西出埃及和以色列南北王国时期,印欧民族进入南亚和中国进入夏商朝文明,而在周朝-秦汉时期,人类进入了古典文明时期 – 即,轴心时代的犹太教(波斯时期)-儒家文化和佛教-希腊哲学等形成。 另外,欧洲唯独希腊拜占庭延续到15世纪,希腊并没有诞生出实证科学 - 而是诞生在英伦和查理曼欧洲的区域。 - (2017年网络日记)-
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