标签: openbabel

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在ipython中使用openbabel: flowball 2016-5-3 19:35; 上次提到openbabel的python插件很好用，这里举个例子。 openbabel默认显示图片是用一个弹出的窗口，这里稍加修改，让图像内嵌在ipython文档中。修改 path_of_pylib/python2.7/site-packages/pybel.py, 约670附近，＃是原代码，后面四行是修改的 #root = tk.Tk() #root.title((hasattr(self, title) and self.title) # or self.__str__().rstrip()) #frame = tk.Frame(root, colormap=new, # visual='truecolor').pack() #image = PIL.open(filename) #imagedata = piltk.PhotoImage(image) #tk.Label(frame, image=imagedata).pack() #tk.Button(root, text=Close, command=root.destroy).pack( # fill=tk.X) #root.mainloop() from matplotlib.pyplot import imshow import numpy as np pil_im = PIL.open(filename) imshow(np.asarray(pil_im)) 效果如下：或者更复杂一些：还有：另外openbabel的python接口pybel允许建立和直接编辑分子的原子和键：保存出来坐标文件：; 个人分类: tools|4353 次阅读|0 个评论

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