贝塔朗菲提出过机体（ organism ）生物学、机体心理学和理论生物学，理论生物学采用数学模型的生物系统研究，并发展到数学生物学和计算生物学。 1999 年 M. Tomita 和文特尔等 发表 e-cell 信号传导网络模型，日本 Sony 公司 e-cell 合作组 H. Kitano 的论文多发表在理论生物学杂志，也是在 1999 年开始采用系统生物学词汇论述 in silico 方法和 S . Leibler 的 代谢系统鲁棒理论等，属于生物信息学和生物软件技术的延伸， 2002 年称为计算系统生物学，但 E. O. Voit 等论述 80 年代已经采用计算机方法建数学模型；因此，可称系统生物学的计算生物学学派，包括英国的 D. Noble 等。 2001 年德国 O. Wolkenhauer 发表以系统论方法的系统生物学研究提及 Principia Cybernetica Web 网 (2000 年元月有链接我的网站 ) ，包括 英国 D. B. Kell 和 H. V. Westerhoff 等属于理论生物学和生物数学体系延续下来的路径，可称之为系统生物学的理论生物学学派。 1999 年我采用“ genomic intelligence ”和转基因技术、仿生学等整合，并以 4 颜色绘制概念图 - 含有病毒转染转基因、细胞通讯信号传导、细胞内分子元件电路、核酸与蛋白质信息转换到神经元树状网络、蝴蝶形态图式等，表达系统遗传学和生物工程概念。 如果，组学（ omics ）系统生物学体现的是实验方法和生物技术仪器设备，计算生物学建立计算机模拟（ simulation ）和生物系统分析软件，理论生物学建立数学模型和系统理论等；那么，工程生物学是设计与合成人工生物系统，合成（ synthetic ）生物学一词即有化学合成，也有系统综合、部件装配（ assemble ）和计算机图形合成等含义，包括构成生物系统的人工生物分子，比如，多肽核酸和 XDNA 等，以及分子元件设计和系统模块组装等。 美国 N. Seeman 提出 DNA 纳米生物技术和研究 DNA 分子计算机， 1999 年之后 T. Knight 从纳米 DNA 计算机研究转向细胞计算机的基因工程方法。工程或合成生物学包括 J. Nielsen 等的代谢工程和细胞工厂等研究领域。 续，系统医学 – 回忆录。
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