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基因的选择压力检测及检验图解教程(By Raindy)
raindyok 2013-12-2 09:45
【絮语】   对于基因选择压力的检测,Phylogenetic Analysis by Maximum Likelihood (PAML)可能是第一反应的分析工具,但PAML的操作令不少初学者望而却步,快速完成基因的选择压力分析,推荐使用一个在线服务器Adaptive Evolution Server。 【关键】   将序列基于密码子比对后,提交序列分析时,先选择一个最适的进化模型,再选择一个压力检测方法。 【网址】    http://www.datamonkey.org/ 【说明】   本文首发于本人QQ空间,为方便大家浏览,发帖科学网论坛,链接如下: http://bbs.sciencenet.cn/forum.php?mod=viewthreadtid=1311703fromuid=460481      转载请保留作者信息,谢谢!   PDF版文件,请移步我的网盘下载: http://raindy.ys168.com/ 生信软件目录    在线浏览版: http://user.qzone.qq.com/58001704/blog/1385877844 【结果】    最终生成数据结果,可以根据需要整理不同格式,如《 马铃薯Y病毒pipo基因的分子变异及结构特征分析 》:    SharmaS, Joshi G, Dash PK, Thomas M, Athmaram TN, et al. (2013) Molecular Epidemiology and Complete Genome Characterizationof H1N1pdm Virus from India. PLoS ONE 8(2): e56364. doi:10.1371/journal.pone.0056364
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