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相关日志

origin高手请进
热度 2 yhliu971225 2012-12-3 08:46
origin高手请进
copypage图片至word中,怎么会是下面的样子,而其它图片都还好。就这一张图片是这样。 改了optionpagecopy/export page settingsclip border中的参数为零也没有解决问题。被困扰了一天了。快疯了。 Help me!
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origin 学习中
hdu016 2012-11-26 11:37
总算明白有些图不是matlab图,而是用origin作的,最近准备学习之,不知道有什么好的资料可以学习的,现在只在小木虫中下载些相关的资料。 希望大家推荐一到两本书啊。谢谢。
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在Origin 中定义箱形图(boxplot)的颜色和填充样式
Bearjazz 2012-9-9 08:54
在 Origin 中定义箱形图( boxplot ) 的颜色和填充样式 熊荣川 xiong rongchuan 六盘水师范学院生物信息学实验室 xiongrongchuan@126.com http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz 软件提供的统计图往往是默认的形式,它的颜色和样式往往都是一个预设的初始状态,虽然能满足一些非正式的需求和大多数的要求。但是在一些正式的文档中(如等待发表的文稿、报告 ppt 等) , 我们往往对统计图的样式和颜色有更加具体的要求。本文将就 Origin 中箱形图的颜色和填充样式做个简单的示范。 之前我们已经讲过如何用 origin 制作箱形图 http://bbs.sciencenet.cn/home.php?mod=spaceuid=508298do=blogid=609967 以及如何制作分组箱形图 http://bbs.sciencenet.cn/home.php?mod=spaceuid=508298do=blogid=610390 本文将在对已完成的分组箱形图进行颜色和样式修改 为了图文并茂,请下载pdf观看 在Origin 中定义箱形图(boxplot)的颜色和填充样式.pdf 修改前效果如下图 修改后如下图 首先在箱形图的空白区域双击鼠标,弹出“ Plot details ”的对话框 点击左边“ Layer1 ”前面的的“ + ”号,下拉出多个 sheet ,右边也发生相应的变化 选择右边的“ Group ”选项卡,在编辑模式 ”Edit mode” 中,有两个选项,默认为 Dependent 模式,表示对所有的箱形图进行编辑。因为我们要对每个箱形图进行不同的编辑,所以在这里我们选择独立 Independent 编辑模式。 然后再依次点击左面 sheet A1 ,右面 Pattern ,对 sheet A1 所代表的箱形图 A1 进行编辑 左面“ Border ”区域编辑箱形图的边框, Fill 区域编辑箱形图内部颜色样式,分别进行修改 点击 Apply 按钮完成对箱形图 A1 的修改 同理,选择不同的 sheet 之后选“ Pattern ”对不同的箱形图进行编辑。 就这么简单,祝您科研愉快!
个人分类: 我的研究|29129 次阅读|0 个评论
所谓数据处理软件
热度 1 yufree 2012-9-8 15:54
要是猜得不错,国内本科生最先接触的图表可能就是柱形图、折线图、饼图、散点图,稍微进一步就是线性回归,明白R^2超过几个九就可以,多数大学毕业生的数据处理水平过个n年也还是停留在这个水平。到了研究生阶段就更乐呵了,不少大仙都是把excel当原始数据收集软件用(当然不少分析软件兼容excel导入也是个问题),做个线性回归就上origin、sigmaplot……统计分析更是到处求spss、sas的破解版……个别人张口闭口matlab,却也只是做做回归……我要是excel的设计者,估计先被气死再被气活然后思考下人生再来个自我了断。 先列举下excel可以做的东西,放心都不给教程,总不能让F1键当摆设吧。 线性回归 非线性回归 多元线性回归 描述性统计 单因素方差分析 双因素方差分析 假设检验(F、t、z检验) 抽样 生成随机数 傅立叶分析 规划求解(包括线性规划、非线性GRG、演化) 如果你的统计学水平能达到考研数一的水平的话,那么你就会发现excel完全可以配合你的知识来使用,够用。当然你说excel是收费的,没错,但多数高校都采购过excel,这样即便你在文章中注明使用excel也不存在问题,倒是上面提到的那些破解版不见得满大街都有卖的,随意在文中注明风险不小。要明确一点,多数数据处理软件不是免费的,但经典的算法都是公开的,所以有时候可以说我在数据处理中用了什么算法而绕开软件,其实诸如Scilab、R、freemat……等数据处理软件都是免费的,当然不是每个人都习惯那些操作界面,但前面这句纯粹胡说八道,对于对数据没概念的人学习任何一个软件都是一样的,那些看似高端的话等你实际把玩过这些软件再说吧。如我一般的穷学生,别人写好了软件让你用还懒的看quick start之类的小教程那不是高端,是虚伪。多数非计算学科的科研工作中涉及的数据处理量根本就是毛毛雨,本来用的次数就有限还挑三拣四是很无聊的,更不用说多数人的数据处理模式根本就是照着文献搬的,美其名曰工具就是这么用,根本没有基本的数据分析意识,多数的数据分析都是为了寻找原始数据或现象中的规律或验证自己的假说。 根据假设选工具,根据结果给结论,这是最基本的,文献大都默认了这一点,所有算法都有自己的适用范围,不加区别的乱用,甚至文章中都不提使用原因是很多研究工作的通病,因为有前人的文献,所以很多时候审稿人也会默认这样是可行的,但可行不代表无疑。有个思想实验叫中文房间,其中一个延伸版就是外面的人给房间中的人递中文纸条,房间里的人完全不懂中文但有一本中文百科大全,他只需要对着长得差不多的字去看这个条目对应的可回答的项目并抄下来然后传递出去就可以了,这时候外面的人自以为跟房间里交流的不错,事实上里面的那个是个水货,完全不懂中文。在今天的话题里,中文纸条就是数据处理的过程,房间里就是不少研究生的真实写照,房间外就是审稿人,那本百科全书就是文献。其实在国内,有不少审稿人自己也是搬着本百科全书在理解。也许你会说这只是一个小部分,我只要说明白了问题不必解决每个细节的合理性,但这样就完全隐藏了你自己的真实水平,出来混都是要还的,这绝不是危言耸听。我最反感两个人实际都不懂却非要讨论一个专业话题,要么就是互相吹捧,要么就是互相谩骂,不幸的是,国人在这件事上乐此不疲,很少听到有营养的讨论。 此外,也就人说excel图不漂亮,其实图表的格式都是可以自定义的,所谓的不漂亮只是默认格式不漂亮。又有人说了,默认不漂亮就是大问题,我没必要去伺候一个工具。事实上学精一个工具要强于泛泛学习多个工具,软件的设计大同小异,学通一个,一通百通。况且所谓的默认格式漂亮也只是假象,更真实的情况可能是别人只教你这样用且告诉你这样出图写文章障碍少。为了方便,很多人放弃了更重要的东西——质疑。这样做不被质疑,但反过来想,被质疑才是知识进步的方式,总是不质疑也就总是做些边边角角的研究,创新性从一开始就被实用主义打败了。结果似乎是皆大欢喜:文章发了,职称升了,工资涨了。但这样做研究跟那些白领、公务员本质上没什么不同——学识不长,人脉关系网疯涨,社交水平不断提高,自我感觉层次长了不少。 坦言之,我不反对实用主义,也不反对掌握方法比内容更重要的观点。但实用主义不能是为达目的不论手段的借口,信息时代方法固然重要,但没有内容的骨架也是毫无价值,你可以搞个智能手机天天搜索,但这不是全部。kk在《失控》里说机器在向人进化的同时人也在向着机器进化,但人永远不会成为当前的机器,看不清方向很正常,但总是看得清方向同样可怕。并不是分清了轻重缓急就一定要把重的与急得做完了而放弃轻的缓的,要知道,进化并没让我们比两万年前的判断能力改变多少,我们会犯错,更重要的是,犯错也许创造未来。 最后附上wiki上一个数据处理软件的对比列表,免费的很多哦亲! http://en.wikipedia.org/wiki/Comparison_of_numerical_analysis_software
个人分类: 生活点滴|12033 次阅读|1 个评论
用Origin 绘制分组箱形图(boxplot)
热度 4 Bearjazz 2012-9-8 09:20
用 Origin 绘制分组箱形图( boxplot ) 熊荣川 六盘水师范学院生物信息学实验室 xiongrongchuan@126.com http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz 箱形图经常用来对多组数列的分布范围的比较。在我们的研究中又常常需要对对象进行多方面的比较。如 A 类群的身高与 B 类群的身高比较、如 A 类群的体重与 B 类群的体重比较等等,这个时候我们据需要用到分组比较——使用分组 boxplot 。 所谓分组箱形图,简单就是说,按因素对数据进行分组绘制 boxplot 。如下图 为了图文并茂请下载pdf文件观看 用Origin 绘制分组箱形图.pdf 具体绘制步骤如下 首先是数据的准备非常关键,每个单元数据组存放一列,分在一组要进行比较(箱形图紧挨着)的数据列相邻存放,组与组之间以空白列分开。如下图 注意,一般来说不要在 X 列(即列头部括号中有“ X ” 标记的列,通常为第一列)存放你的数据, 然后选中数据列,包括用于隔开分组的空白列 选择左下角箱形图标记,分组箱形图绘制便完成了。 就这么简单,祝你科研愉快!
个人分类: 我的研究|50324 次阅读|8 个评论
origin中图片转eps,然后eps转jpg
Irasater 2012-8-24 20:43
1.origin中图片转eps 首先选中一个图片,选择file--export graph,选择 eps格式,设置需要的图片尺寸即可。 2.eps转jpg 用photoshop将eps打开,然后设置好宽度和高度,另存为jpg即可 这样做的话,可能有个缺点,对于用word写论文的学者来说,可能直接把eps图插入word中更好!
个人分类: Notes|14623 次阅读|0 个评论
[转载]实战origin
pttianya 2012-7-23 21:45
转载自: http://bbs.sciencenet.cn/blog-5422-12666.html 实战 origin 作者: zagzig , 辅助: letao 、 ymq 、 valenhou 、 aint 、 zilu 来源: 日月光华 — 学科学术 — 化学版, 2004 年 7 月 4 日 至 15 日 基本入门   略加深入   推荐书目 安装   模板的使用   origin 使用手册 输入数据画张图   计算器   精通 Origin 7.0 拟和直线   制作并排的数据图     在 Word 中的使用   数据的处理、转换与生成   小技巧 作图规范 补充 重叠峰的分离 Origin 小贴士   峰面积的计算       制作对数座标的图        Origin 软件主要使用来做数据绘图用的。本系列文章将主要介绍 origin 的初级使用方法,为许多刚开始使用 origin 写试验报告的同学提供入门帮助。   前一段时间有人说 origin 要严打,我觉得只要自己小心处理,他根本无法抓住你用的是什么版。其他几款数据绘图软件据说也都很好。不过我从来没用过,这 5 年多来一直使用的是 origin ,对其使用方法也略有所得。 基本入门 安装   这里使用的是 origin7.0 。安装时请参考 Crack 下的 intruction.txt ,里面有 serial no. 的。 输入数据画张图   比如说你现在有一组数据想做图 ( 其中 a 列代表一系列点的 x 坐标, b 列代表该系列点的 y 坐标, c 列代表另一系列点的 y 坐标 (x 坐标同第一系列点 )) 。   打开 origin ,会看到 data1 数据窗口, 在窗口里空白处点右键 -add new column ,会看到表格增加一列,上面的数据输入表格里。   下面开始根据数据绘图。 选菜单栏中的 plot-scatter (这里选 scatter , line , line+symbol... 都可以,只不过出来的样式不一样,大家自己选选试一下就可以了)。这时跳出一个 select columns for plotting 的窗口,问你哪列数据做 x 轴,那列做 y 轴。我们点左面的 A ,然后点中间的 -X ,示意 A 是 X 轴,再点 B ,再点 -Y ,示意 B 列做 y 轴。这时点 Add 按钮,告诉程序说第一组数据是以 A 为 x 轴, B 为 Y 轴。这时,再单击 C ,点 -Y 按钮,单击 Add 按钮,示意第二组点时以 A 列为 X 轴, C 列为 Y 轴。最后点 OK 。这时会看到跳出一个 Graph 窗口,里面有坐标轴何我们要的点 。 a b c 1 2 3 2 4 7 3 7 10 4 8 11 5 10 14 6 11 19 7 15 21 拟和直线   先拟和第一组, 选菜单栏里的 data 看看 g1 data1.... 是不是被勾上了(默认应该时被勾上的),如果勾上了说明现在对的是第一组数据进行操作。 点菜单栏 analysis-fit linear ,这时会看到拟和出来直线了。拟和第二组, 选菜单栏里的 data-g2 data2 ,把第二组选中,这时对应的操作是对第二组的。同上 analysis-fit linear 。可以看到第二组也被拟和成直线了。   如果数据不是线性的,那么就拟和成非线性的, analysis-fit sigmoidal(S 型 ) 或 guassian( 高斯拟和 ) 或 nonliner curve fit 中的 fitting wizard( 选一个你觉得合适 的形状进行拟和 ) 。 这样最最最基本的 origin 作图就做出来了。   最后存盘, file-save project as... 。 在 Word 中的使用 方法一: 在作好的图旁边点右键,选 copypage (如果没有的话,说明你右键点错地方了,多换几个地方点点)。然后在 word 里面 粘贴 就好了,这样比较方便,不过有时候图会变形。还有一个致命缺点,就是容易被人家抓住你用的是盗版。 方法二: 在菜单栏里 file-export page ,可以输出各种格式的,对于图片格式来说,个人感觉 tif 的要比 bmp 和 jpg 的要好,那么我们就 输出 tif 格式的,把下面的 show export option 勾上,点保存 。如果是想插到 word 里面的话, DPI 选 72 比较合适,如果是打印实验报告的话 ,color depth 里直接选 monochrome 的就可以了 ( 毕竟不要彩打 ) ,点 ok ,就输出一个 tif 文件,最后在 word 里面插入这个文件就 ok 了。 作图规范 1. 坐标注释要正确。 双击坐标注释 (就是那个 x axis title) ,可以改成你要的文字,其中可以有拉丁字母(上面的工具栏中画着阿尔发和贝它的那个按钮,然后用 abc 来写拉丁字母),大小,字体,上下标,颜色(工具栏里都有选择) 2. 坐标刻度要为 1 , 2 , 5 或 10 的倍数。 双击坐标轴 ,跳出图样式修改窗口, 在 scale 标签卡下 ,最左面 horizotal 是横坐标, vertical 是纵坐标的。 increment 里面添单位刻度增加大小,一般添 1 、 2 、 5 或 10 这类的数字(不要添 3 、 7 这种 ) 。 3. 坐标刻度要向图内。 还是刚才那个修改样式窗口( 双击坐标轴 得到的窗口), 在 titleformat 标签下 , 左面 bottom top... 几个对应的是上下左右 4 个位置的坐标轴,其中 top 和 right 中的 show axix title 前面的框没有被勾上,说明这两个不显示。我们把 bottom 和 left 两个坐标中的 major 和 minor 下拉菜单中的 out 全改为 in 。最后点确定就好了 4. 图要被坐标轴框起来。 你可能不太懂什么意思,跟着我做完就知道了,呵呵。还是刚才那个修改样式窗口 ( 双击坐标轴 得到的窗口), 在 titleformat 标签下 ,把上坐标轴何右坐标轴中的 show axis title 前面的框勾上,并且把这两个坐标轴中的 majorminor 下拉菜单改为 none 。点确定。现在会发现中间的点或线被四周坐标轴全封闭在中央了,并且左和下坐标轴有刻度,剩下两个坐标轴没有。当然你也可以根据需要把上吓右坐标轴的刻度调出来,不过记住刻度要向内。 5. 图例。 这个图例可以放在图里,也可以放在下面图的说明中( Fig. 1 xxxxxxx 图,点是 xx ,圈是 xx ,三角是 xx) 。如果要放在图里的话,就把图例框拖到四个坐标轴围成的框内。 双击该框 可以修改注释。 右键该框选 property ,可以改框的样式,比如要去掉边框 ,在 background 中选定 none( 个人以为没边框好看些 ) 。如果不甚把图例的框给删掉了,不要着急,在工具栏里有 New legend 按钮,点一下就可以了。 6. 各组数据点差异要明显 。如果想改点的样式,那么就 双击图中的点 。会出现 plot details 框,如果有好几组点的话,先在 group 标签下面把 edit mode 改成 independent ,这样就可以随便改了。 左面的框中列出了有几组点,你可以选你要改的那组,右面的 symbol 标签中的 size 啊, color 啊都可以改成自己需要的, line 标签中也可以把线的样式改成实线,虚线等等。此时也可以在 plot type 下拉菜单中选你要改的类型。一般情况下,为了对比清楚点,最好实心的和空心的结合着用。线么,就 solid 、 dash 、 dot 、 dash-dot 好了,最好把线调的粗一点 ( 默认是 0.5width 的,建议改为 1.0 或 1.5 的 ) ,否则有的地方看不出来。 7. 在重要的地方标示。 比如图中有一个地方需要着重指出,那么我们就用箭头标一下好,左面的工具框里有箭头按钮,点一下它,在在图中需要的地方加各箭头就 ok 了。如果想加文字的话,那边还有一个 T 按钮,是加入文本框的。总之如果需要的话那个工具框里的很多东西都可以加。 补充 1. 发现刻度标尺标在外面也很漂亮。 2. 作图最好图中出现 “ 标题行 ” 和 “ 注释行 ” 。 标题行就是指一行黑体字,写清楚这个图是什么,如 "XPS of ZrxTiyOz" 等,注释行就是在图中每一条线的附近写清楚这是什么样品,如 “X=0.2", "X=0.4", "X=0.6" 等。   这里有个很好的参考范本,见: Kinetic study of the catalytic oxidation of alkanes over nickel, palladium, and platinum foils, M. Aryafar , F. Zaera*, Catalysis Letters, Volume 48, Issue 3, Jan 1997, Pages: 173-183. 3. 同一篇文章中图样统一。    切忌一篇文章中有的图框两面,有的图框四面。一篇文章中有的图用这个字体,有的图用那个字体。 4. 其他常见错误 在 The ACS Style Guide: A Manual for Authors and Editors 里有介绍 (p.283-291) 。  主要有:   · 线条太细,一缩小,几乎看不见。   · 点(如方块,三角,圆圈)太大,但线条太细。   · 点(如方块,三角,圆圈)太小,但线条太粗。 略加深入 模板的使用   可以做一些模板,就不需要在每次作图时重复下面的操作(如改变坐标注释字体大小、坐标轴线宽、添加 top 和 right 坐标轴,改变数据线的宽度等等 ) 步骤如下:   · 生成模板:对做好的一张图, 菜单 File-Save Template As... , 一张模板就诞生了。选一些比较通用的数据图,   生成不同的模板,以后会方便很多。   · 使用模板:对需要作图的一列数据, 右键 Plot-Template Library... , 选合适的模板, OK! 计算器   在用 origin 的时候,我们很有可能要作一些简单的计算,比如一些加减乘除或三角的运算 有几种选择,一种就是手头有计算器,一种就是用 windows 自带的计算器,还有一种就是用 origin 自带的 script window 来作(这个方法要比用 windows 带的计算器方便)。    选中菜单栏 -window-script window (或者直接按 alt+3 ),这时就会跳出一个 script 窗口, 在里面输入 1+1= 然后回车,就可以得到结果。 输入 sin(30*(3.14159265358/180))= 回车,可以得到 0.5 。   用这个计算器还有一个好处是可以设置一个变量值,比如像上面我们如果要求好几个角度的 sin 值,每次都要打一个 3.14159265358 很烦,我们可以先设定一个变量的值为 3.14159265358 ,比如输入 pi=3.14159265358 回车 这时再输入 sin(30*(pi/180))= 回车,得到跟上面一样的结果。 这个计算器可以计算的数学符号有: + , - , * , / , ( , ) , sin , cos , tan , exp , sqrt , ln , log , abs nint , rnd , mod 。   实际上计算器只是这个 script 窗口功能的很小一部分。这个窗口的实际作用使用来编程的类似 c 语言,什么 for, if, 都可以用,不过我们基本都用不到,我也不太熟悉。谁需要用的话自己翻一下手册好了。 制作并排的数据图 方法一: 先做一张图 , 在坐标轴外的空白处, 右键 Add and Arrange Layers... ,调整上下 , 或左右间距为 0 就并排连起来了,然后在新的 layers 添加需要的数据列。 方法二: 先画好你要并排的图,然后点击找到 “Merge” 的工具,就出现合并图的提示, 然后确定你是要列排还并排,也就是指定 rows 和 columns 的数目。 数据的处理、转换与生成 方法一:通过 excel 中转   我们得到的原始数据可能不是我们最终想要作图的数据。一般我们可以把原始数据导入 excel ,然后在 excel 里进行加加减减乘乘除除,得到我们想要的数据后,再 copy 到 origin 的 work sheet 中,最后作图。   或者,在 origin 里面的工具栏上有一个 open excel 的按钮,直接打开 excel ,然后处理数据,再利用 excel 表格里的数据直接作图,在 excel 窗口激活状态下,菜单栏 -plot ,再选中 excel 表格中的要做 X 的列,点击 select data for plotting 的窗口中 X 按钮。 Y 轴选择方法同上。最后点 plot 。不过这样比较耗费系统资源。 方法二:使用 origin 中自带的 work sheet 1. 导入 txt 数据。 菜单栏中的 file-import 中的 sigle ASCII 或 mutli ASCII 都可以导入文件,一个是导入单个文本,  一个是导入多个文本。通过 ASCII options 可以修改一些导入的设置。 2. 原始数据通过计算生成需要的一列数值。   ·excel 中只要在一个表格里输入等号然后是相应的计算函数再回车就 ok 了,然后一拖一列。   ·origin 中不是这样,例如原始数据有两列数,想得到第三列数 C 为 B 的开根号减 0.5 。先 点右键, add new column 生成一个新列。 右键点新列的标题(选中了这一列) -set column values... 这时回跳出一个对话框。在 col(C)= 的框框中默认的是 col(A)-col(B) ,也就是列 A 减列 B 的值,我们把它删掉。在 add function 下的菜单中选 sqrt() ,点 Add function ,然后下面回出现 sqrt(), 光标停在括号里面,再在 add column 下拉菜单中我们选 col(b) ,然后点 add column 按钮,会看到 sqrt 的括号里多了 col(B) ,最后再 sqrt(col(B)) 的后面添上 -0.5 ,变成 sqrt(col(B))-0.5 ,看看 for row 那两个框里的数是不是你想要算的初始和终止行,不是的话就改成正确的。最后点 ok 。 A B C 1 10 2.66 2 20 3.97 3 30 4.97 4 40 5.08   · 此外还可以生成一些列随机数,或归一化的随机数, 选中该列,菜单栏 -column- fill column with-rownumbers( 把行号添进来 ) , uniform random numbers 和 normal random number. 3. 排序。   右键选中要排序的列 , sort column 只对改选中列排序,其他不变; sort worksheet 所有列均按选中列排序 4. 统计。 右键选中列 , nomalize 归一化, frequency 计算出现次数。 5. 自动生成等差数列作为 X 轴。   有些实验数据它只给你列一些 Y 轴坐标,不给你 X 值(比如分析测试中心的多晶 X 衍射,它只给你一系列角度的衍射光强,角度是从 5 度开始以 0.02 度增长,但是没给你 X 值)。下面举个例子,下面据个例子,有一系列 Y 值,其 X 值分别对应 1 , 1.5 , 2 , 2.5 , 3 , ... X 值 1 1.5 2 2.5 3 ...         A(Y) 10 20 25 10 20 25 30 35 50 ...   首先, worksheet 中必须没有 x 轴(也就是每列的标题的括号里的字母不能是 X ),如果有的话, 右键该列标题 -set as-Y 或者 Z ,这时左键单击作为 Y 轴那列的标题, 选中该列,菜单栏 -format-set worksheet x...- initial 是起始值, increament 是增长步长。这时看到 worksheet 中该列标题多了个三角标示。 点菜单栏 plot-line-A 做 Y 轴, X 空着 ,点 OK ,会看到出来的图自动给你加上了横坐标,并且是每个点相隔固定步长。 重叠峰的分离   几个单独的峰由于靠得很近,会导致形成一个重叠峰的形成。如果想计算几个峰之间的面积比的话,就需要先把这个重叠峰分离成几个单独的峰。举个例子,比如在做聚合物多晶 x 射线衍射的时候,不同晶型的衍射峰与无定形部分的衍射峰彼此重叠,这些峰对应的面积比与它们之间的含量比成线性关系。通过计算晶体衍射峰的面积与无定形衍射峰的面积,就可以大致的到聚合物的结晶度。   将数据作图后(注意,这里的数据一般间隔的非常近,所以作出的图点与点之间也比较连续),检查菜单栏 data 中看需要分峰的数据是否被勾上了。没勾的话就选中。 ※ 注意, 如果数据的 x 范围很大,而需要分峰的部分很小,比如,整个数据的 x 轴的范围是 0-100, 而需要分的重叠峰的位置在 40-60 ,其他部分均为平的基线或其他无关的峰,那么我们就需要在 worksheet 表格里把 0-40 ,以及 60-100 的数据都删掉,只留 40-60 这段范围的数据。这步是一定要做的,否则分出来的峰非常不准。 ※   删除不需要的数据后,在 graph 窗口中可以看到只留下了重叠峰的数据图,这时点 菜单栏中的 analysis-fit multi peaks-guassian or lorentzian (这两个什么区别我也不是很清楚,感觉作出来的图是一样的),选中一个拟和方法后,会跳出一个对话框 number of peak ,问你要分成几个峰,输入个数确定后,又跳出一个对话框问你估计的半峰宽。这里用它的默认的就好了。   然后在图上观察你认为的几个单独峰的位置,双击你认为的位置后,会出现一条垂直的虚线,直至将几个峰的峰值位置选好后,可以看到这个重叠峰就被分成了几个单独的峰。其中 绿色的拟和曲线 是被分成的每个单独的峰, 红 的是这几个绿色峰的加和,红色的线应该跟你原来的重叠峰吻合的非常好。根据图中的信息框的内容可以得到拟和出来的峰函数的系数值。根据 result 窗口里面的信 息可以得到峰额面积,半峰宽以及中心位置。 峰面积的计算   对于峰面积的求解,可以通过 origin 的 integrate 命令 ,这个命令求的是以 y=0 为底的区域的面积,所以,如果我们要求面积的峰被 y=0 切割开的话,我们可以通过平移的方法,先将峰的整体移到 x 轴的上方。   在求峰面积之前,我们还应该把多余的数据删除掉,比如我们要求的峰是从 x1 开始,到 x2 结束,在小于 x1 和大于 x2 的区域均是基线部分的话,我们只留 x1 到 x2 之间的数据。 在 worksheet 表格中插入两列 (C 列, D 列 ) 将峰的起始点跟终止点的坐标填入 C 列和 D 列,如右。其中 A 列和 B 列是峰的数据。    点菜单栏 plot-line ,以 A 列为 x 轴、 B 列为 y 轴,和以 C 列为 x 轴、 B 列为 y 轴作图,这时做出来的图应该是一个峰加上一条以峰的起始和终止为终点的线段。检查菜单栏 Data 中峰的数据 (Data1) 是否处于激活状态,是的话就不用管,不是的话就激活(就是在 data1 前面有个勾)。   点菜单栏 analysis-calculus-integrate ,这时 result 窗口里会出现计算的结果。这个结果是对峰的曲线到 y=0 直线进行的积分。 点菜单栏 Data ,激活线段的数据( Data2 )。 点菜单栏 analysis-calculus-integrate ,这时 result 窗口里会出现计算的结果。这个结果是对线段到 y=0 直线进行的积分,也就是这个梯形的面积。   用两组面积相减(如果是向上的峰,就用峰的积分减线段的积分;如果是向下的峰,就用线段的积分减峰的积分),就可以得到峰的面积了。 A B C D x1 y1 x1 y1 .. .. x2 y2 .. .. .. .. .. .. .. .. . . . x2 y2 注: 积分时,可能会积出来的面积是负值,这是由于从 x1 到 x2 积分和从 x2 到 x1 积分的到的 是相反数 造成的。计算时直接用绝对值就 ok 了。 另一种方法    菜单 tools-baseline tool ,可以让 origin 决定 baseline ,也可以自定义 baseline 。然后用第二个 tab 里面的 peak tool 自动寻找出所有的 peaks ,不过这个工具不是很好用,有时候找到的 peak 太少,有时候找到的太多。下面的 可选项 check tip marker ,最后用第三个 tab 进行积分, 选择 use tip marker 。 制作对数座标的图   双击坐标轴, Scale 选项卡下, Type 的下拉菜单中选 log10 。
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[转载]用origin画三维图
ywmucn 2012-7-5 15:57
转自: http://hi.baidu.com/yinbory/blog/item/55f178d0f17daf29960a1617.html 首先导入excel表 (1)把C(Y)改成Z【双击C(Y)】 (2)C(Z)-- Edit -- Convert to martrix -- Sparse XYZ (3)view -- Show XYZ (4)martrix -- set dimensions -- 设 行 列 值(开始可设的很大) -- X(0.01-0.03);Y(0-1) (5)Plot -- contour Plot -- gray scale map
个人分类: 选题&投稿|5480 次阅读|0 个评论
[转载]如何用origin做带error bar的曲线
hjlyyc 2012-5-29 07:26
(1)作等值误差曲线 只要在xy两列数据之后再添加一列数据(Y的误差值) ,选择该列,右键菜单选择 Set As-Y error ,在画图即可。 (2)作不等值误差曲线 如果要作正负值不同的误差线该如何呢?方法如下:对于附件data图中的数据,AB列是xy值,CD列是y的正负误差值。 data 选中四列,先画出等值误差线图,如附件graph1所示, graph1 然后再 双击图中的误差线,进入error bar菜单 ,再右边direction菜单下方有三个勾选选项,分别是plus、minus和X error bar,选择相应data并定义正负误差,如图err所示。 err 再点却确定即可。最终图如附件finalgraph。 (3)作带标准偏差的曲线 对于得到的一组平行数据,有些专家在审稿的时候,要求把标准偏差在你的曲线上反映,比如下面的一组数据。浓度是已知的,作为 X轴的数值;强度是由仪器测量的,平行测量了4次,取强度的平均值作为Y轴的数值。(下表中的数据是胡乱编的,只是说明下用origin如何做带标准偏差的曲线图而已) 第一步,把数据输入到 origin中,如下图,一定要设置好X轴值和Y轴值,不要混了。 第二步, 对你的平行数据进行统计:Statistic-----descriptive statistics-----statistics on rows(or statistics on columns)进行上步操作之后会生成一个data;(该data基本上包含所有基本统计数据:平均值、最大值、最小值、标准偏差等)。当然对于这个数据来说统计的时候要按行来进行,不能按列。结束后会生成一个表,如下图,这个表里会包含一般统计要求的统计项。 第三步,开始作图: plot-----line+symbol-----弹出“select data to create new plot”对话框,然后选择x轴,y轴,偏差等即可。即在对应的X,y,yEr选上相应的项。 第四步,生成曲线,这时候曲线上已经带上了标准偏差的大小,根据这个可以很明显的看出第四组数据的离散性最大,标准偏差最大。 对于柱状图,同样适用,只不过在“ plot”选项里选择“column”即柱状图即可,同样这组数据用柱状图反应出来如下。 FROM : http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=3893886 http://bbs.instrument.com.cn/shtml/20100825/2743068/
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origin中做缩略图之法
plgongcat 2012-5-10 21:03
有时要做某个图形的缩略图,观看其宏观之趋势,我的法子如下: 1.先建立一个图层,右键选择properties,弹出窗口后,看print/Dimensions,例如设置width=5,height=3,unit=inch,确定后退出。 2.画出图形。 3.新建图层,将原图可缩小之。双击选择“2”(图层左上角),选择数据等画出图像。 4.调整2图大小,合适为止。 以上保证图缩小字体曲线依然清晰。
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oingin加单位埃
plgongcat 2012-5-3 15:08
7.5版本不能直接加埃,8.5在symbol Map-symbol-system可以加埃,但是保存位eps格式打不开,其它格式正常。 可以利用origin的ADD Text间接构造埃。先在text中写“o”(英文字母),并设置为上标;在添加text,写字母A;接着就是移动它们至美观。
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origin 输出图片
chnfirst 2012-4-25 13:18
宽8.25cm:单列还是双列? DPI:600 Color space:RGB Color depth: 256 color Compression:PackBits
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origin 平滑曲线
JiuBaiYi 2012-4-11 20:52
选中要平滑的曲线,双击或右键打开Plot Details,选择Line菜单项,在Connect文本框中选择想要的平滑曲线,比如Spline,或B-Spline。
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Nature 一篇1970年发表的论文引用了94615次
热度 2 xupeiyang 2012-3-9 10:28
这篇论文引用了94615次,是不是该刊引用最高的的一篇论文,有待查证。 Nature Volume 227, Issue 5259, 1970, Pages 680-685 ISSN: 00280836 DOI: 10.1038/227680a0 PubMed ID: 5432063 Document Type: Article Source Type: Journal View at publisher | Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4 Laemmli, U.K. MRC Laboratory of Molecular Biology, Hills Road, Cambridge Abstract Using an improved method of gel electrophoresis, many hitherto unknown proteins have been found in bacteriophage T4 and some of these have been identified with specific gene products. Four major components of the head are cleaved during the process of assembly, apparently after the precursor proteins have assembled into some large intermediate structure. 1970 Nature Publishing Group. Language of original document English Index Keywords EMTREE drug terms: carbon; virus protein EMTREE medical terms: article ; autoradiography; coliphage; gel electrophoresis; kinetics; metabolism; microbial genetics; structural gene MeSH: Autoradiography; Carbon Isotopes; Coliphages; Electrophoresis, Disc; Genes, Structural; Genetics, Microbial; Kinetics; Viral Proteins Medline is the source for the MeSH terms of this document. Chemicals and CAS Registry Numbers carbon, 7440-44-0; Carbon Isotopes; Viral Proteins Gadget timed out while loading Laemmli, U.K.; MRC Laboratory of Molecular Biology, Hills Road, Cambridge, Copyright 2007 Elsevier B.V., All rights reserved. Nature Volume 227, Issue 5259, 1970, Pages 680-685 Cited by since 1996 This article has been cited 94615 times in Scopus: SCPUPS 数据库 1996至今 引用了94615次 (Showing the 2 most recent) Hfner, A.-K. , Cernescu, M. , Hofmann, B. Dimerization of human 5-lipoxygenase (2012) Biological Chemistry Ordiales, E. , Martín, A. , Benito, M.J. Technological characterisation by free zone capillary electrophoresis (FCZE) of the vegetable rennet (Cynara cardunculus) used in "torta del Casar" cheese-making (2012) Food Chemistry View details of all 94615 citations Inform me when this document is cited in Scopus: Set alert | Set feed Other citing sources Web: 10069 times 网络引用 10069次 Patents: 9241 times 专利引用9241次 http://www.scopus.com/record/display.url?eid=2-s2.0-0014949207origin=resultslistsort=cp-fsrc=snlo=nlr=nls=mltEid=2-s2.0-0033515827mltType=keymltAll=timp=tsid=BNSE5fIFNGEH_CLZIqvQ8Z3%3a490sot=mltsdt=mltsl=639s=TITLE-ABS-KEY%28%28%22article%22%29+OR+%28%22bone+marrow+cell%22%29+OR+%28%22cell+differentiation%22%29+OR+%28%22cell+lineage%22%29+OR+%28%22controlled+study%22%29+OR+%28%22human%22%29+OR+%28%22human+cell%22%29+OR+%28%22mesenchyme%22%29+OR+%28%22normal+human%22%29+OR+%28%22priority+journal%22%29+OR+%28%22stem+cell%22%29+OR+%28%22stroma+cell%22%29+OR+%28%22Adipocytes%22%29+OR+%28%22Adult%22%29+OR+%28%22Apoptosis%22%29+OR+%28%22Bone+Marrow+Cells%22%29+OR+%28%22Cell+Differentiation%22%29+OR+%28%22Cell+Division%22%29+OR+%28%22Cell+Lineage%22%29+OR+%28%22Cell+Separation%22%29+OR+%28%28+%22Cells%22+%22Cultured%22+%29%29+OR+%28%22Chondrocytes%22%29+OR+%28%22Fibroblasts%22%29+OR+%28%22Flow+Cytometry%22%29+OR+%28%22Humans%22%29+OR+%28%22Mesoderm%22%29+OR+%28%22Middle+Aged%22%29+OR+%28%22Osteocytes%22%29+OR+%28%22Phenotype%22%29+OR+%28%22Stem+Cells%22%29%29+AND+NOT+EID+%282-s2.0-0033515827%29relpos=0relpos=0searchTerm=TITLE-ABS-KEY((\"article\")%20OR%20(\"bone%20marrow%20cell\")%20OR%20(\"cell%20differentiation\")%20OR%20(\"cell%20lineage\")%20OR%20(\"controlled%20study\")%20OR%20(\"human\")%20OR%20(\"human%20cell\")%20OR%20(\"mesenchyme\")%20OR%20(\"normal%20human\")%20OR%20(\"priority%20journal\")%20OR%20(\"stem%20cell\")%20OR%20(\"stroma%20cell\")%20OR%20(\"Adipocytes\")%20OR%20(\"Adult\")%20OR%20(\"Apoptosis\")%20OR%20(\"Bone%20Marrow%20Cells\")%20OR%20(\"Cell%20Differentiation\")%20OR%20(\"Cell%20Division\")%20OR%20(\"Cell%20Lineage\")%20OR%20(\"Cell%20Separation\")%20OR%20((%20\"Cells\"%20\"Cultured\"%20))%20OR%20(\"Chondrocytes\")%20OR%20(\"Fibroblasts\")%20OR%20(\"Flow%20Cytometry\")%20OR%20(\"Humans\")%20OR%20(\"Mesoderm\")%20OR%20(\"Middle%20Aged\")%20OR%20(\"Osteocytes\")%20OR%20(\"Phenotype\")%20OR%20(\"Stem%20Cells\"))%20AND%20NOT%20EID%20(2-s2.0-0033515827 )
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慢性肾病研究引用最多的论文 (引用7003次)
xupeiyang 2012-3-9 09:40
发表的期刊和年份 Journal of the American Medical Association Volume 289, Issue 19, 21 May 2003, Pages 2560-2572 ISSN: 00987484 CODEN: JAMAA DOI: 10.1001/jama.289.19.2560 PubMed ID: 12748199 Document Type: Review Source Type: Journal View references(81) View at publisher | The Seventh Report of the Joint National Committee on Prevention, Detection, Evaluation, and Treatment of High Blood Pressure: The JNC 7 Report Chobanian, A.V. b , Bakris, G.L. c , Black, H.R. c , Cushman, W.C. d , Green, L.A. e , Izzo Jr., J.L. f , Jones, D.W. g , Materson, B.J. h , Oparil, S. i , Wright Jr., J.T. j , Roccella, E.J. a a Natl. Heart, Lung, and Blood Inst., National Institutes of Health, Natl. High Blood Pressure Educ. Pro., 31 Center Dr, Bethesda, MD 20892, United States b Department of Medicine, Boston University School of Medicine, Boston, MA, United States c Department of Preventive Medicine, Rush-Presbyterian-St Luke Med. Ctr., Chicago, IL, United States d Veterans Affairs Medical Center, Dept. of Prev. Medicine and Medicine, Univ. of Tennessee Hlth. Sci. Center, Memphis, TN, United States e Department of Family Medicine, University of Michigan, Ann Arbor, MI, United States f Dept. of Medicine and Pharmacology, State University of New York, Buffalo School of Medicine, Buffalo, NY, United States g Department of Medicine, Ctr. Excellence Cardio.-Renal Res., Univ. of Mississippi Medical Center, Jackson, MS, United States h Department of Medicine, Univ. of Miami School of Medicine, Miami, FL, United States i Dept. of Med., Physiol./Biophys., Division of Cardiovascular Disease, University of Alabama, Birmingham, AL, United States j Department of Medicine, University Hospitals of Cleveland, L. S. Cleveland Vet. Aff. Med. Ctr., Cleveland, OH, United States Abstract "The Seventh Report of the Joint National Committee on Prevention, Detection, Evaluation, and Treatment of High Blood Pressure" provides a new guideline for hypertension prevention and management. The following are the key messages: (1) In persons older than 50 years, systolic blood pressure (BP) of more than 140 mm Hg is a much more important cardiovascular disease (CVD) risk factor than diastolic BP; (2) The risk of CVD, beginning at 115/75 mm Hg, doubles with each increment of 20/10 mm Hg; individuals who are normotensive at 55 years of age have a 90% lifetime risk for developing hypertension; (3) Individuals with a systolic BP of 120 to 139 mm Hg or a diastolic BP of 80 to 89 mm Hg should be considered as prehypertensive and require health-promoting lifestyle modifications to prevent CVD; (4) Thiazide-type diuretics should be used in drug treatment for most patients with uncomplicated hypertension, either alone or combined with drugs from other classes. Certain high-risk conditions are compelling indications for the initial use of other antihypertensive drug classes (angiotensin-converting enzyme inhibitors, angiotensin-receptor blockers, β-blockers, calcium channel blockers); (5) Most patients with hypertension will require 2 or more antihypertensive medications to achieve goal BP (140/90 mm Hg, or 130/80 mm Hg for patients with diabetes or chronic kidney disease); (6) If BP is more than 20/10 mm Hg above goal BP, consideration should be given to initiating therapy with 2 agents, 1 of which usually should be a thiazide-type diuretic; and (7) The most effective therapy prescribed by the most careful clinician will control hypertension only if patients are motivated. Motivation improves when patients have positive experiences with and trust in the clinician. Empathy builds trust and is a potent motivator. Finally, in presenting these guidelines, the committee recognizes that the responsible physician's judgment remains paramount. Language of original document English Index Keywords EMTREE drug terms: angiotensin receptor antagonist; antihypertensive agent; beta adrenergic receptor blocking agent; calcium channel blocking agent; dipeptidyl carboxypeptidase inhibitor; thiazide diuretic agent; alpha adrenergic receptor blocking agent; alpha adrenergic receptor stimulating agent; angiotensin receptor; diuretic agent; vasodilator agent EMTREE medical terms: age; blood pressure measurement; cardiovascular disease; cardiovascular risk; chronic kidney disease; comorbidity; diabetes mellitus; diastolic blood pressure; empathy; high risk population; human; hypertension; lifestyle; motivation; patient compliance; practice guideline; priority journal; review; risk factor; systolic blood pressure; treatment planning; algorithm; article; blood pressure; diagnostic test; drug antagonism; monitor; risk reduction MeSH: Adrenergic alpha-Agonists; Adrenergic alpha-Antagonists; Algorithms; Angiotensin-Converting Enzyme Inhibitors; Antihypertensive Agents; Blood Pressure; Blood Pressure Determination; Blood Pressure Monitors; Calcium Channel Blockers; Cardiovascular Diseases; Diagnostic Tests, Routine; Diuretics; Humans; Hypertension; Receptors, Angiotensin; Risk Factors; Risk Reduction Behavior; Vasodilator Agents Medline is the source for the MeSH terms of this document. Chemicals and CAS Registry Numbers Adrenergic alpha-Agonists; Adrenergic alpha-Antagonists; Angiotensin-Converting Enzyme Inhibitors; Antihypertensive Agents; Calcium Channel Blockers; Diuretics; Receptors, Angiotensin; Vasodilator Agents References (81) View in table layout Cited by since 1996 This article has been cited 7003 times in Scopus: SCOPUS数据库统计 1996年至今引用了7003次 (Showing the 2 most recent) Sarafidis, P.A. , Georgianos, P.I. , Germanidis, G. Hypertension and symptomatic hypokalemia in a patient with simultaneous unilateral stenoses of intrarenal arteries and mesangioproliferativ... glomerulonephritis (2012) American Journal of Kidney Diseases Hermida, R.C. , Ayala, D.E. , Mojón, A. Sleep-time blood pressure and the prognostic value of isolated-office and masked hypertension (2012) American Journal of Hypertension View details of all 7003 citations Inform me when this document is cited in Scopus: Set alert | Set feed Other citing sources Web: 242 times 网络引用 242次 Patents: 11 times 专利引用 11次 http://www.scopus.com/record/display.url?eid=2-s2.0-0038460302origin=inwardtxGid=BNSE5fIFNGEH_CLZIqvQ8Z3%3a2
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[转载]《Origin 7.0科技绘图及数据分析》
swlx888 2012-2-28 23:48
Origin为OriginLab公司出品的较流行的专业函数绘图软件,是公认的简单易学、操作灵活、功能强大的 软件,既可以满足一般用户的制图需要,也可以满足高级用户数据分析、函数拟合的需要。    Origin自1991年问世以来,由于其操作简便,功能开放,很快就成为国际流行的分析软件之一,是公认的快速、灵活、易学的工程制图软件。它的最新的版本号是8.5.1 SR2,另外分为普通版和专业版(Pro)两个版本。 借科学网博客的平台给大家分享《Origin 7.0科技绘图及数据分析》: http://www.cnmecha.com/forum.php?mod=viewthreadtid=604 转自:力学园
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origin滑动平均
热度 2 JiuBaiYi 2012-2-20 10:06
先画图 选择数据点 Analysis——Signal Processing——Smooth 画出移动平均线 方法选择:
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origin 生成的图导入word 的方法
热度 1 zhuangwei 2011-12-29 12:54
origin 生成的图导入word 的方法
刚刚有同学接到论文修改的编辑部要求:正文内所有插图,照片除外,要求全部提供矢量图。即直接用软件生成的图,不需要转换成jpg或tif格式,GIS生成图转换为EPS格式300dpi,并插入文内相应位置,以方便编辑部后期制作。 他原先用Origin 输出的是jpg格式的,要改成矢量图-----直接用软件生成的图。 刚刚和同学解决了这个问题,,方法很简单方法如下: (1)在ORIGIN画好图后,点击菜单栏 Edit\ Copy Page ,复制图表 (2)回到WORD 中,粘帖即可,得到矢量图。得到的矢量图缩放不会对图表的清晰度产生影响。 希望同学的文章顺利通过。 步骤(1)选择Copy Page 结果
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《Lancet》杂志高被引论文5篇(最高的9,807次)
xupeiyang 2011-12-26 15:29
检索时间:2011-12-26 9,807 Documents that cite: Set feed 文献引用 Turner R. Intensive blood-glucose control with sulphonylureas or insulin compared with conventional treatment and risk of complications in patients with type 2 diabetes (UKPDS 33) (1998) Lancet ,352(9131),pp.837-853. 349 Web pages that cite: 网络引用 Covered web sources: University repositories (e.g. MIT, DiVA, Caltech), theses dissertations. Web results brought to you by: for scientific information only 87 Patents that cite: 专利引用 Covered patent sources: US and European Patent offices, World Intellectual Property Organization. For more in-depth patent information click here: http://www.scopus.com/record/display.url?eid=2-s2.0-0032511583origin=resultslistsort=r-fcite=2-s2.0-0032511583src=pnlo=nlr=nls=imp=tsid=p2I6nlBhdhtkRZhOTxlpHxu%3a130sot=citesdt=asl=0 http://www.thelancet.com/ Most cited in The Lancet since 1996 1. Intensive blood-glucose control with sulphonylureas or insulin compared with conventional treatment and risk of complications in patients with type 2 diabetes (UKPDS 33) Research (1998) Lancet 352 (9131), pp. 837-853 Full text | PDF | Cited 9,378 times 还有这四篇大牛文 2. MRC/BHF Heart Protection Study of cholesterol lowering with simvastatin in 20 536 high-risk individuals: A randomised placebo-controlled trial Research (2002) Lancet 360 (9326), pp. 7-22 Full text | PDF | Cited 4,592 times 3. Effects of intensive blood-pressure lowering and low-dose aspirin in patients with hypertension: Principal results of the Hypertension Optimal Treatment (HOT) randomised trial Research (1998) Lancet 351 (9118), pp. 1755-1762 Full text | PDF | Cited 3,643 times 4. Peginterferon alfa-2b plus ribavirin compared with interferonalfa-2b plus ribavirin for initial treatment of chronic hepatitis C: A randomised trial Research (2001) Lancet 358 (9286), pp. 958-965 Full text | PDF | Cited 3,604 times 5. A randomised, blinded, trial of clopidogrel versus aspirin in patients at risk of ischaemic events (CAPRIE) Research (1996) Lancet 348 (9038), pp. 1329-1339 Full text | PDF | Cited 3,404 times
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