设为首页收藏本站

开启辅助访问切换到宽版

科学网 › 标签 › MaxQuant

标签: MaxQuant

相关帖子	版块	作者	回复/查看	最后发表

没有相关内容

相关日志

MaxQuant处理质谱原始数据记录: chinapubmed 2019-8-22 09:08; https://www.maxquant.org/ Win10 空间：10G以上耗时：根据原始文件大小，约sample/4h，可以使用多核加速运行 1，载入数据，注意设置每个样品的Experiment，样品名 2，载入蛋白质fasta文件注意把Label free quantification标签中的LFQ导出选中 3，运行漫长等待后，结果文件见combined/txt/proteinGroups.txt，其中LFQ即为所需的信息。 4，标准化，差异得到LFQ后，使用quantile标准化，使用ttest等按照fold change和p（fdr）筛选差异 5，功能分析 GO，Pathway，PPI等; 个人分类: 生物信息|8588 次阅读|0 个评论

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-6-7 04:35

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部