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国内期刊对2019-nCoV主题文章发表反应也是很快的!
After50 2020-2-12 09:54
国内期刊对2019-nCoV主题文章发表反应也是很快的!
个人分类: 教学资源|1787 次阅读|0 个评论
武汉市交通隔离对2019-nCov传播的影响
SDUAN 2020-2-5 01:36
武汉市交通隔离对 2019-nCov 传播的影响 2019-nCoV爆发于2020年中国春运(1月10日至2月8日),武汉作为重要交通枢纽,使2019-nCoV以武汉为中心广泛快速扩散。早期各地的病例发病均与武汉相关。2020年1月23日10时起,武汉城内及离汉交通工具均暂停运营,随后多座湖北省城市也相继发布封城通知( http://wjw.hubei.gov.cn/ ) 。武汉市长表示,目前已有 500 多万人离开武汉( http://ent.chinanews.com/sh/2020/01-26/9070484.shtml )。 我们收集 2020.1.16至2020.1.25日的武汉 的累计百度迁出指数 ( https://qianxi.baidu.com/?from=mappc ) ,发现 74.1%的武汉 的累计百度迁出指数 (CBMI) 前往了位于湖北的其他地级市, 5.6%的武汉迁出人口进入河南,其他各省占比不高( 图 1b)。在湖北省内,大多数武汉迁出人口进入孝感(20%)、黄冈(19%)和荆州(10%),其他地级市占比不高( 图 1c)。 我们采用中华人民共和国及各省卫生健康委员会 2020年1月16日至2020年2月1日24时间公布的2019-nCoV相关数据。为了预测了隔离政策对2019-nCov 疫情的影响, 我们开展了武汉 CBMI 与 2019-nCov 病例的相关性分析。 我们测试了 2019-nCov 报道各地病例数目与武汉迁出规模指数 的相关性(图 1 )。我们发现中国大陆其它地区的 2019-nCoV新型肺炎 病例人数与从武汉输出的累积人口规模指数高度相关(图 1d, R 2 =0.50 p0.0001)。此外,湖北省内非武汉各地的病例数(2月1日)也与(1月16日-25日)间累积的武汉CBMI高度相关(图1e, R 2 = 0.81, p0.0001)。我们进一步发现武汉输出是与全国其它区域(图1f,R 2 =0.43-0.51)和湖北省其它市(图1f, R2=0.62-0.88)的感染病例相关性是非常稳定。我们的结果证实了武汉输出人口与各地发生的病例呈显著相关性。 图 1: 武汉输出人口与各地病例的相关性 在图 1d中我们也观察到,河南省的武汉CBMI(5.6%, 图1b)较大,总体感染人数却偏少,我们推测河南省较早的干预措施(如交通管制,确定定点医院等)显著延缓2019-nCov的扩散。(http://www.hnwsjsw.gov.cn)此外,在图1b中武汉输出的人口规模指数较低的浙江省(0.8%)和广东省(1.8%)的总体感染人数偏高。浙江省新冠病毒感染以人口密度较高,与武汉通商频繁的温州市最严重。1月19日至1月23日,武汉迁入温州的累积指数(0.11)位列浙江省内湖北流出人口第一目的地,我们推测部分患者于武汉封城前回到温州,导致新型冠状病毒在温州的广泛传播。同样,广东省重要城市与武汉市经济联系、人员交流密切,导致感染新型病毒风险也较高。 随后,我们进一步分析了不同地区的新型肺炎死亡率(图 1g)。发现湖北省的死亡率(3.24%;武汉:5.45%)远远高于中国内陆其他地区(0.19%) 通过分析各地的潜在病例的排查率(图 1h),我们也发现武汉地区对潜在病例的排查远远不及中国内地其他省份。我们推测这 可能与患者病程较长,且与医疗资源有限有关。 从公共卫生的角度来说,对已经确诊的病人进行有效隔离、减少接触是最重要的。我们的结果证实,武汉市的强制性交通隔离极大地减少了 2019-nCov 在全国范围的扩散。同时,我们的结果也说明封城前武汉市输出人口会导致了湖北省内其它城市的严重疫情扩散。 作者:Gehui Jin1, Jiayu Yu1, Liyuan Han1, Shiwei Duan1,* 1.Ningbo University *: duanshiwei@nbu.edu.cn
个人分类: 野谈|2078 次阅读|0 个评论
新冠疫情爆发后,77篇研究2019新型冠状病毒(2019-nCoV)的论文或期刊通讯全文,敬请收阅
jinhejiang 2020-2-4 18:54
2019新型冠状病毒(2019-nCoV),因2019年武汉病毒性肺炎病例而被发现,2020年1月12日被世界卫生组织命名。冠状病毒是一个大型病毒家族,已知可引起感冒以及中东呼吸综合征(MERS)和严重急性呼吸综合征(SARS)等较严重疾病。新型冠状病毒是以前从未在人体中发现的冠状病毒新毒株。 新型冠状病毒给人类带来了严重的灾难,严重威胁到了人类健康,在此搜集罗列了一些研究论文以供大家研究学习之用! 通过数学建模预测武汉冠状病毒感染情况 Nowcasting and forecasting the potential domestic and international spread of the2019-nCoVoutbreak originating in Wuhan, China: a modelling study. The Lancet In press, corrected proofAvailable online 31 January 2020 Joseph T Wu, Kathy Leung, Gabriel M Leung Nowcasting and forecasting the potential domestic and international spread of th.pdf 2、对 2019-2020 年中国新型冠状病毒(2019-nCoV)基本繁殖数量的初步估计:疫情爆发早期的数据驱动分析 Preliminary estimation of the basic reproduction number of novel coronavirus (2019-nCoV) in China, from 2019 to 2020: A data-driven analysis in the early phase of the outbreak Shi Zhao, Qianying Lin, Jinjun Ran, SalihuSabiu MUSA, Guangpu Yang, Weiming Wang, Yijun Lou, Daozhou Gao, Lin Yang, Daihai He, Maggie H WangbioRxiv 2020.01.23.916395; doi: https://doi.org/10.1101/2020.01.23.916395 1-s2.0-S1201971220300539-main.pdf 3、新型冠状病毒 (2019-nCoV) 的全基因组进化分析否定了近期重组事件导致病毒出现的假设 Full-genome evolutionary analysis of the novel corona virus (2019-nCoV) rejects the hypothesis of emergence as a result of a recent recombination event D. Paraskevis, E.G. Kostaki, G. Magiorkinis, G. Panayiotakopoulos, S. TsiodrasbioRxiv 2020.01.26.920249; doi: https://doi.org/10.1101/2020.01.26.920249 1-s2.0-S1567134820300447-main.pdf 4. 中国武汉一种新型冠状病毒肺炎的诊断和治疗感染方法 Measures for diagnosing and treating infections by a novel coronavirus responsible for a pneumonia outbreak originating in Wuhan, China Microbes and InfectionIn press, Available online 1 February 2020 Fei Yu, Lanying Du, David M. Ojcius, Chungen Pan, Shibo Jiang Measures for diagnosing and treating infections by a novel coronavirus responsib.pdf 5.中国 客运 列车对 2019-2020 年新型冠状病毒(2019-nCoV)传播的影响:疫情爆发相关数据驱动分析 The association between domestic train transportation and novel coronavirus (2019-nCoV) outbreak in China from 2019 to 2020: A data-driven correlational report Travel Medicine and Infectious DiseaseIn press, corrected proofAvailable online 30 January 2020Article 101568 Shi Zhao, Zian Zhuang, Jinjun Ran, Jiaer Lin, Daihai He 1-s2.0-S1477893920300181-main.pdf 6.新型冠状病毒(2019-nCoV)将成为全球下一次健康大威胁?从拉丁美洲旅行医学会角度,我们能为旅行者提供什么临时建议? The next big threat to global health? 2019 novel coronavirus (2019-nCoV): What advice can we give to travellers? – Interim recommendations January 2020, from the Latin-American society for Travel Medicine (SLAMVI) Travel Medicine and Infectious DiseaseIn press, journal pre-proofAvailable online 30 January 2020Article 101567 Cristian Biscayart, Patricia Angeleri, Susana Lloveras, Tania do Socorro Souza Chaves, Alfonso J. Rodríguez-Morales The next big threat to global health_ 2019 novel coronavirus (2019-nCoV)_ What a.pdf 7. 对 2019-nCoV 的新理解 Emerging understandings of 2019-nCoV TheLancet,Emerging understandings of 2019-nCoV,The Lancet,2020,ISSN0140-6736, https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30186-0.(http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0140673620301860) 1-s2.0-S0140673620301860-main.pdf 8.中东呼吸综合症冠状病毒起源和2019-nCoV Origins of MERS-CoV, and lessons for 2019 - nCoV The Lancet Planetary HealthIn press, corrected proofAvailable online 31 January 2020 John S Ji 1-s2.0-S2542519620300322-main.pdf 9. 2019-nCoV的早期爆发认识 Offline: 2019-nCoV outbreak—early lessons The LancetVolume 395, Issue 102211–7 February 2020Page 322 Richard Horton 10.新冠状病毒(2019-nCoV)与SARS存在交叉保护表位 Identification of potential cross-protective epitope between 2019-nCoV and SARS virus Journal of Genetics and GenomicsIn press, journal pre-proofAvailable online 30 January 2020 Tianyi Qiu, Tiantian Mao, Yuan Wang, Mengdi Zhou, Zhiwei Cao Identification of potential cross-protective epitope between 2019-nCoV and SARS virus.pdf 11.武汉新型冠状病毒(2019-nCoV)威胁全球健康 The continuing 2019-nCoV epidemic threat of novel coronaviruses to global health — The latest 2019 novel coronavirus outbreak in Wuhan, China International Journal of Infectious DiseasesVolume 91February 2020Pages 264-266 David S. Hui, Esam I Azhar, Tariq A. Madani, Francine Ntoumi, Eskild Petersen 1-s2.0-S1201971220300114-main.pdf 12、2019 年新型冠状病毒的基因组特征和流行病学研究对病毒起源和受体结合的意义 Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus implications forvirus origins and receptor binding The Lancet,2020,ISSN0140-6736, https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30251-8. 1-s2.0-S0140673620302518-main.pdf 13. 新型冠状病毒从发现到临床诊断 Novel coronavirus: From discovery to clinical diagnostics Infection, Genetics and EvolutionVolume 79April 2020Article 104211 Tung Phan 1-s2.0-S1567134820300435-main.pdf 14. 武汉市99名2019-nCoV肺炎患者的流行病学和临床特征研究 Epidemiological and clinical characteristics of 99 cases of 2019 novel coronavirus pneumonia in Wuhan, China: a descriptive study The LancetIn press, corrected proofAvailable online 30 January 2020 Nanshan Chen, Min Zhou, Xuan Dong, Jieming Qu, Li Zhang 1-s2.0-S0140673620302117-main.pdf 15. 2019-nCoV肺炎患者的感染和临床特征 Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China The LancetIn press, corrected proofAvailable online 24 January 2020 Chaolin Huang, Yeming Wang, Xingwang Li, Lili Ren, Bin Cao 1-s2.0-S0140673620301835-main.pdf 16. 临床批准药物中 2019-nCoV 冠状病毒 M 蛋白酶的潜在抑制剂 Potential inhibitors for 2019-nCoV coronavirus M protease from clinically approved medicines Xin Liu, Xiu-Jie Wang bioRxiv 2020.01.29.924100; doi: https://doi.org/10.1101/2020.01.29.924100 2020.01.29.924100v1.full.pdf 17、2019 年新型冠状病毒 (2019-nCoV) 的传播动态 Transmission dynamics of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) Tao Liu, Jianxiong Hu, Min Kang, Lifeng Lin, Haojie Zhong, Jianpeng Xiao, Guanhao He, Tie Song, Qiong Huang, Zuhua Rong, Aiping Deng, Weilin Zeng, Xiaohua Tan, Siqing Zeng, Zhihua Zhu, Jiansen Li, Donghua Wan, Jing Lu, Huihong Deng, Jianfeng He, Wenjun Ma bioRxiv 2020.01.25.919787; doi: https://doi.org/10.1101/2020.01.25.919787 73596293.pdf 18.2019 年新型冠状病毒的起源时间和流行动态 MRCA time and epidemic dynamics of the 2019 novel coronavirus Chi Zhang,Mei Wang MRCA time and epidemic dynamics of the 2019 novel coronavirus.pdf 19、SARS 冠状病毒特异性人类单克隆抗体与 2019 年新型冠状病毒纤突蛋白的强效结合 Potent binding of 2019 novel coronavirus spike protein by a SARS coronavirus-specific human monoclon alantibody Xiaolong Tian, Cheng Li, Ailing Huang, Shuai Xia, Sicong Lu, Zhengli Shi, Lu Lu, Shibo Jiang, Zhenlin Yang, Yanling Wu, Tianlei Ying bioRxiv 2020.01.28.923011; doi: https://doi.org/10.1101/2020.01.28.923011 2020.01.28.923011v1.full.pdf 20.武汉新型冠状病毒的进化来源和传染人的分子作用通路 Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission Science China Life Sciences pp 1–4 | Cite as Xu2020_Article_EvolutionOfTheNovelCoronavirus.pdf 21. 为什么蛇不可能传播新型冠状病毒? Why snakes probably aren't spreading the new China virus Ewen Callaway David Cyranoski Nature doi: 10.1038/d41586-020-00180-8 https://www.nature.com/articles/d41586-020-00180-8 22. 交流、沟通和合作能战胜2019 年新型冠状病毒 (2019-nCoV) Communication, collaboration and cooperation can stop the 2019 coronavirus Nature Medicine , 1–1 Rights permissionsfor article Communication, collaboration and cooperation can stop the 2019 coronavirus . Opens in a new window. Comments and Opinion | 27 January 2020 s41591-020-0775-x.pdf 23.我们应对SARS和2019-nCoV新型冠状病毒肺炎疫情对比 China's response to a novel coronavirus stands in stark contrast to the 2002 SARS outbreak response John Nkengasong Nature Medicine , 1–2 s41591-020-0771-1.pdf 24. 新型冠状 肺炎 病毒(2019-nCoV)或来源于蝙蝠! A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin Peng Zhou, Xing-Lou Yang Zheng-Li Shi Nature , 1–4 s41586-020-2012-7_reference.pdf 25.应对快速疫情需要信任 Rapid outbreak response requires trust Nature Microbiology 5 , 227–228 s41564-020-0670-8.pdf 26. 新型冠状肺炎病毒(2019-nCoV)爆发 Outbreak of a novel coronavirus Andrea Du Toit Nature Reviews Microbiology , 1–1 Outbreak of a novel coronavirus.pdf 27. 阻断武汉病毒 Stop the Wuhan virus Nature 577 , 450–450 Rights permissions d41586-020-00153-x.pdf 28. 对中国武汉2019年新型冠状病毒(2019-nCoV)爆发的新理解 Updated understanding of the outbreak of 2019 novel coronavirus (2019‐\nCoV) in Wuhan, China Weier Wang Jianming Tang PhD Fangqiang Wei PhD Journal of Medical VirologyAccepted Articles jmv.25689.pdf 29. 2019年新型冠状病毒``第一代''人际传播的潜力 Potential of large ‘first generation’ human‐\to‐\human transmission of 2019‐\nCoV Xingguang Li Junjie Zai Xiaomei Wang Yi Li Journal of Medical VirologyAccepted Articles jmv.25693.pdf 30. spike糖蛋白内的同源重组可能有助于从蛇到人的跨物种传播 Homologous recombination within the spike glycoprotein of the newly identified coronavirus may boost cross‐\species transmission from snake to human Wei Ji Wei Wang Xiaofang Zhao Junjie Zai Xingguang Li Journal of Medical VirologyAccepted Articles jmv.25682.pdf 31、2019 年新型冠状病毒疫情:病毒进化的证据 The 2019-new coronavirus epidemic: evidence for virus evolution Domenico Benvenuto, Marta Giovannetti, Alessandra Ciccozzi, Silvia Spoto, Silvia Angeletti, Massimo Ciccozzi doi: https://doi.org/10.1101/2020.01.24.915157 jmv.25688.pdf 32.新型冠状病毒:基因结构,复制和发病机制 Emerging coronaviruses: genome structure, replication, and pathogenesis Yu Chen Qianyun Liu Deyin Guo Journal of Medical VirologyAccepted Articles jmv.25681.pdf 33.武汉爆发不明肺炎 Outbreak of Pneumonia of Unknown Etiology in Wuhan China: the Mystery and the Miracle Hongzhou Lu Charles W. Stratton Yi‐\Wei Tang Journal of Medical VirologyAccepted Articles jmv.25678.pdf 34.人类常见呼吸道病毒检测进展 Recent advances in the detection of respiratory virus infection in humans Naru Zhang Lili Wang Xiaoqian Deng Ruiying Liang Meng Su Chen He Lanfang Hu Yudan Su Jing Ren Fei Yu Lanying Du Shibo Jiang Journal of Medical VirologyAccepted Articles jmv.25674.pdf 35. 新病毒感染引发的全球健康担忧 Global Health Concern Stirred by Emerging Viral Infections Guangxiang (George) Luo Shou‐\Jiang Gao Journal of Medical VirologyAccepted Articles jmv.25683.pdf 36. 冠状病毒感染与免疫反应 Coronavirus Infections and Immune Responses Geng Li Yaohuao Fan Yanni Lai Tiantian Han Zonghui Li Peiwen Zhou Pan Pan Wenbiao Wang Dingwen Hu Xiaohong Liu Qiwei Zhang Jianguo Wu Journal of Medical VirologyAccepted Articles jmv.25685.pdf 37. 瑞得西韦和磷酸氯喹能在体外有效抑制新型冠状病毒(2019-nCoV) Remdesivir and chloroquine effectively inhibit the recently emerged novel coronavirus (2019-nCoV) in vitro. Cell Research (2020) 0:1–3; https://doi.org/10.1038/s41422-020-0282-0 s41422-020-0282-0.pdf 38. 新型冠状病毒(2019-nCoV) 致病性和传播性及与其他病毒的比较研究 综述 Pathogenicity and Transmissibility of 2019 - nCoV —A Quick Overview and Comparison with Other Emerging Viruses 1-s2.0-S1286457920300265-main.pdf 39. SARS病毒、 MERS 中东呼吸综合症冠状病毒和新型冠状病毒(2019-nCoV)人畜共患病冠状病毒的出现对人类的威胁 Emerging threats from zoonotic coronaviruses-from SARS and MERS to 2019-nCoV Journal of Microbiology, Immunology and InfectionIn press, journal pre-proofAvailable online 4 February 2020 Ping-Ing Lee, Po-Ren Hsueh 1-s2.0-S1684118220300116-main.pdf 40.武汉 新型冠状病毒(2019-nCoV):预防病毒入侵措施需要保持规律性的体育锻炼 Opinion Wuhan coronavirus ( 2019 - nCoV ): The need to maintain regular physical activity while taking precautions Journal of Sport and Health Science In press, journal pre-proof Available online 4 February 2020 Peijie Chen , Lijuan Mao , George P. Nassis , Peter Harmer , Fuzhong Li 1-s2.0-S2095254620300144-main.pdf 41. 类风湿性关节炎(RA)药物baricitinib(巴瑞替尼) 可能成为治疗新型冠状病毒(2019-nCoV)急性呼吸道疾病潜在药物 Baricitinib as potential treatment for 2019 - nCoV acute respiratory disease The Lancet In press, corrected proof Available online 4 February 2020 Peter Richardson , Ivan Griffin , Catherine Tucker , Dan Smith , Justin Stebbing 1-s2.0-S0140673620303044-main (1).pdf 42. 爆发的 新型冠状病毒(2019-nCoV)可能由旅客传入巴基斯坦吗? Outbreak of novel Corona Virus (2019-nCoV); implications for travelers to Pakistan? Travel Medicine and Infectious DiseaseIn press, journal pre-proofAvailable online 4 February 2020Article 101571(作为邻国,感染风险较大,但已经在四个机场进行了热成像扫描控制病毒的传入,但缺少检测设备和检测能力) Ubaid Ur Rahman Qureshi, Sadia Saleem, Aisha Khan, Muhammad Sohail Afzal, Haroon Ahmed Outbreak of novel Corona Virus (2019-nCoV); implications for travelers to Pakistan_.pdf 43. 新型冠状病毒(2019-nCoV)的威胁激发了科学家的研究 New coronavirus threat galvanizes scientists BY JON COHEN SCIENCE 31 JAN 2020: 492-493 492.full.pdf 44.抗击 新型冠状病毒(2019-nCoV)感染风暴的挑战 The Novel Chinese Coronavirus (2019‐\nCoV) Infections: challenges for fighting the storm Matteo Bassetti Antonio Vena Daniele Roberto Giacobbe European Journal of Clinical InvestigationAccepted Articles eci.13209.pdf 45. 抗击武汉 新型冠状病毒(2019-nCoV)新进展 Updates on Wuhan 2019 Novel Coronavirus Epidemic Foster Kofi Ayittey Christian Dzuvor Matthew Kormla Ayittey Nyasha Bennita Chiwero Ahmed Habib Journal of Medical VirologyAccepted Articles First published: 04 February 2020 jmv.25695.pdf 46. 增强智能检测 抗击武汉 新型冠状病毒扩散 The Role of Augmented Intelligence (AI) in Detecting and Preventing the Spread of Novel Coronavirus Justin B. Long, Jesse M. Ehrenfeld in Journal of Medical Systems (2020) Long-Ehrenfeld2020_Article_TheRoleOfAugmentedIntelligence.pdf 47.Coronavirus: Stehen wir am Beginn einer neuen Pandemie? Beunruhigende Nachrichten aus China, erste Erkrankungsfälle in Europa. Das Coronoavirus breitet sich aus. MMW-Schriftleiter Prof. Johannes Bogner, München, berichtet aus infektiologischer Sicht über den derzei... Prof. Dr. med. Johannes R. Bogner in MMW - Fortschritte der Medizin (2020) Bogner2020_Article_CoronavirusStehenWirAmBeginnEi.pdf 48. 聚合酶链反应临床诊断住院病人的获得性肺炎 病毒 Clinical role of viral identification by a polymerase chain reaction-based diagnostic panel in adults hospitalized with community-acquired pneumonia Filippo Lagi, Simona Pollini, Lorenzo Zammarchi in Internal and Emergency Medicine (2020) Lagi2020_Article_ClinicalRoleOfViralIdentificat.pdf 49. 一种与控制新型冠状病毒(2019-nCoV)爆发相似的流行病预防策略 A strategy to prevent future pandemics similar to the 2019 - nCoV outbreak Biosafety and Health In press, journal pre-proof Available online 5 February 2020 Peter Daszak , Kevin J. Olival , Hongying Li 提出预防下一次流行病爆发策略:一是强化野外高致病病原体发现和预防;二是监控与野生动物频繁接触人群以便早发现流行病爆发事件,提高前期预防作用;三是改善野生动物交易市场的生物市场安全,减少和预防下一次流行病爆发。 main.pdf 50. 实验室检测新 型冠状病毒(2019-nCoV)指导手册(第三版 ) Technical guidance for laboratory testing of 2019-nCoV infection (third edition) Biosafety and HealthIn press, journal pre-proofAvailable online 5 February 2020 Bureau of Disease Prevention and Control, National Health Commission of People's Republic of China 1-s2.0-S259005362030015X-main.pdf 51. 中国武汉的一种新型冠状病毒引起的呼吸系统疾病 Emergence of a novel coronavirus causing respiratory illness from Wuhan, China Journal of InfectionIn press, journal pre-proofAvailable online 28 January 2020 Julian W. Tang, Paul A. Tambyah, David S. C. Hui 1-s2.0-S0163445320300384-main.pdf 52. 新型冠状病毒感染对世界的警示 Novel coronavirus is putting the whole world on alert Journal of Hospital InfectionIn press, journal pre-proofAvailable online 4 February 2020 S. Khan, A. Ali, R. Siddique, G. Nabi 1-s2.0-S0195670120300438-main.pdf 53. 应对新型冠状病毒(2019-nCoV)爆发急需及时的心理健康疏导( 指导 ) Timely mental health care for the 2019 novel coronavirus outbreak is urgently needed The Lancet PsychiatryIn press, corrected proofAvailable online 4 February 2020 Yu-Tao Xiang, Yuan Yang, Wen Li, Ling Zhang, Chee H Ng Timely mental health care for the 2019 novel coronavirus outbreak is urgently needed.pdf 54. 应对 新型冠状病毒(2019-nCoV)的实验室安全指导 Laboratory biosafety guide for the novel coronavirus Biosafety and HealthIn press, corrected proofAvailable online 31 January 2020 Department of Health Science, Technology and Education, National Health Commission of People's Republic of China Laboratory biosafety guide for the novel coronavirus.pdf 55. 2019年新型冠状病毒(2019-nCoV)相关的家族性肺炎病例说明病毒存在人际传播——基于家族聚集病例的研究 A familial cluster of pneumonia associated with the 2019 novel coronavirus indicating person-to-person transmission: a study of a family cluster The LancetIn press, corrected proofAvailable online 24 January 2020 Jasper Fuk-Woo Chan, Shuofeng Yuan, Kin-Hang Kok, Kelvin Kai-Wang To, Kwok-Yung Yuen 1-s2.0-S0140673620301549-main.pdf 56. 2019-2020年新型冠状病毒(2019-nCoV)蔓延感染:基于四川重症监护病房准备经验启示 Novel coronavirus infection during the 2019–2020 epidemic: preparing intensive care units—the experience in Sichuan Province, China Xuelian Liao, Bo Wang, Yan Kang in Intensive Care Medicine (2020) Liao2020_Article_NovelCoronavirusInfectionDurin.pdf 57.一种新的发自中国的流行病:武汉冠状病毒综合诊 A new pandemic out of China: the Wuhan coronavirus syndrome Health Policy and TechnologyIn press, journal pre-proofAvailable online 4 February 2020 Donald R. J. Singer main.pdf 58.在新型冠状病毒爆发期间我们应该如何做?——对Jeffrey A. Woods博士的采访 Should, and how can, exercise be done during a coronavirus outbreak? — An interview with Dr. Jeffrey A. Woods Jeffrey A. Woods: 伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校 应用健康科学学院免疫学教授,致力于运动在免疫系统、肠道微生物群和抗衰老方面的研究 1-s2.0-S2095254620300120-main.pdf 59. 从一个到武汉旅游的非典型肺炎患者身体中分离鉴定出2019新型冠状病毒 (2019-nCoV) Genomic characterization of the 2019 novel human pathogenic coronavirus isolated from a patient with atypical pneumonia after visiting Wuhan Emerging Microbes Infections, 9:1, 221-236, DOI: 10.1080/22221751.2020.1719902 Jasper Fuk-Woo ChanORCID Icon, Kin-Hang KokORCID Icon, Zheng Zhu, Hin Chu, Kelvin Kai-Wang To, Shuofeng Yuan Kwok-Yung Yuen Genomic characterization of the 2019 novel human pathogenic coronavirus isolated.pdf 60.一种来自2019年中国肺炎患者的新型冠状病毒 A Novel Coronavirus from Patients with Pneumonia in China, 2019 .New England Journal of Medicine, 2020. 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DOI: 10.1056/NEJMc2001272 10.1056@NEJMc2001272.pdf 64.应用实时RT-PCR检测2019年新型冠状病毒(2019-nCoV) Detection of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) by real-time RT-PCR Victor M Corman, Olfert Landt, Marco Kaiser, Richard Molenkamp, Adam Meijer, Daniel KW Chu, Tobias Bleicker, Sebastian Brünink, Julia Schneider, Marie Luisa Schmidt, Daphne GJC Mulders, et al.,Eurosurveillance Volume 25, Issue 3, 23/Jan/2020 https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.3.2000045 eurosurv-25-3-5.pdf 65.武汉2019-nCoV2019年12月-2020年1月间人传人研究 Pattern of early human-to-human transmission of Wuhan 2019 novel coronavirus (2019-nCoV), December 2019 to January 2020. Riou Julien, Althaus Christian L.. Euro Surveill. 2020;25(4):pii=2000058. https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.4.2000058 eurosurv-25-4-2.pdf 66.运用分子技术诊断2019年新型冠状病毒(2019-nCoV)感染的肺炎 Molecular diagnosis of a novel coronavirus (2019-nCoV) causing an outbreak of pneumonia. Chu D K W , Yang P , Cheng S M S , et al. Clinical Chemistry. hvaa029.pdf 67.SARS病毒、中东呼吸综合征(MERS)病毒和2019新型冠状病毒:我们对冠状病毒研究够多了吗?——基于文献计量分析 SARS-CoV, MERS-CoV and now the 2019-novel CoV: Have we investigated enough about coronaviruses? – A bibliometric analysis. Bonilla-Aldana DK, Quintero-Rada K, Montoya-Posada JP, Ramírez S, PanizMondolfi A, Rabaan A, Sah R, Rodríguez-Morales AJ, Travel Medicine and Infectious Disease (2020), doi: https://doi.org/10.1016/j.tmaid.2020.101566. SARS-CoV, MERS-CoV and now the 2019-novel CoV_ Have we investigated enough about.pdf 68.SARS相似的冠状病毒出现给我国带来了新的挑战 Emergence of SARS-like Coronavirus poses new challenge in China Journal of Infection (2020), Ruichen Wang , Xu Zhang , David M. Irwin , Yongyi Shen , doi: https://doi.org/10.1016/j.jinf.2020.01.017 Emergence of SARS-like Coronavirus poses new challenge in China.pdf 69.信息公开和共享是控制疫情的关键。 Data sharing and outbreaks: best practice exemplified Heymann D. The Lancet. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30184-7 1-s2.0-S0140673620301847-main.pdf 70.德国新型冠状病毒(2019-nCoV)感染病例 Transmission of 2019-nCoV Infection from an Asymptomatic Contact in Germany January 30, 2020 The New England Journal of Medicine 2020 DOI: 10.1056/NEJMc2001468 10.1056@NEJMc2001468.pdf 71.新型冠状病毒(2019-nCoV)回顾 Return of the Coronavirus: 2019-nCoV Lisa E. Gralinski and Vineet D. Menachery Viruses 2020, 12(2), 135; https://doi.org/10.3390/v12020135 viruses-12-00135-v2.pdf 72.儿童感染新型冠状病毒(2019-nCoV)的诊断和治疗建议 Diagnosis and treatment recommendations for pediatric respiratory infection caused by the 2019 novel coronavirus Zhi-Min Chen, Jun-Fen Fu, Qiang Shu, Ying-Hu Chen… in World Journal of Pediatrics (2020) World Journal of Pediatrics https://doi.org/10.1007/s12519-020-00345-5 Chen2020_Article_DiagnosisAndTreatmentRecommend.pdf 73.儿童感染新型冠状病毒(2019-nCoV)的诊断和治疗紧急建议 Diagnosis and treatment of 2019 novel coronavirus infection in children: a pressing issue Kun-Ling Shen, Yong-Hong Yang in World Journal of Pediatrics (2020) World Journal of Pediatrics https://doi.org/10.1007/s12519-020-00344-6 Shen-Yang2020_Article_DiagnosisAndTreatmentOf2019Nov.pdf 74.基于RNA的mNGS方法对武汉爆发的两例新型冠状病毒(2019-nCoV)肺炎的检测 RNA based mNGS approach identifies a novel human coronavirus from two individual pneumonia cases in 2019 Wuhan outbreak Liangjun Chen, Weiyong Liu, Qi ZhangORCID Icon, Ke Xu, Guangming Ye, Weichen Wu, show all Pages 313-319 | Received 27 Jan 2020, Accepted 30 Jan 2020, Published online: 05 Feb 2020 Download citation https://doi.org/10.1080/22221751.2020.1725399 RNA based mNGS approach identifies a novel human coronavirus from two individual.pdf 75.伊蚊(Aedes)、按蚊(Anopheles)、新型冠状病毒(2019-nCoV)、登革热(dengue)、沙门菌(Salmonella)和寨卡(Zika)等细菌或病毒携带者如何办理登机? What goes on board aircraft? Passengers include Aedes, Anopheles, 2019-nCoV, dengue, Salmonella, Zika, et al Author links open overlay panelMary E.Wilson Travel Medicine and Infectious Disease Available online 5 February 2020, 101572 https://doi.org/10.1016/j.tmaid.2020.101572 1-s2.0-S1477893920300223-main.pdf 76.宿主导向治疗(host-directedtherapy,HDT)治疗可降低新型冠状病毒(2019-nCoV)死亡率 Reducing mortality from 2019-nCoV: host-directed therapies should be an option The LancetIn press, corrected proofAvailable online 5 February 2020 Alimuddin Zumla, David S Hui, Esam I Azhar, Ziad A Memish, Markus Maeurer 1-s2.0-S0140673620303056-main.pdf 77. 中国防治新型冠状病毒(2019-nCoV)疫情中在武汉安排心理健康医务人员 The mental health of medical workers in Wuhan, China dealing with the 2019 novel coronavirus The Lancet PsychiatryIn press, corrected proofAvailable online 5 February 2020 Lijun Kang, Yi Li, Shaohua Hu, Min Chen, Zhongchun Liu 10.1016@S2215-03662030047-X.pdf 中文期刊论文 78. 新型冠状病毒_2019_nCoV_省略_的肺炎诊疗快速建议指南_标准版_.pdf 79. 新型冠状病毒感染性肺炎抗病毒药物合理使用与药学监护_边原.pdf 80. 2019新型冠状病毒感染的肺炎疫源地消毒措施_魏秋华.pdf 81. 新型冠状病毒_2019_nCoV_肺炎中医临床特征与辨证治疗初探_王玉光.pdf 82. 河南省新型冠状病毒_2019_nCoV_感染孕产妇管理策略建议_王新燕.pdf 83. home.php?mod=attachmentfilename=id=499911 84. 新型冠状病毒感染的肺炎诊疗快速指南_第三版_华中科技大学.pdf 85. 基于武汉新型冠状病毒肺炎快速传播的应对措施_欧阳芬.pdf 86. 灾害脆弱性分析在非封闭式血液内科_省略_应对新型冠状病毒.pdf 87. 新型冠状病毒感染的流行_医院感染及心理预防_心理预防.pdf 88. 基层医院应对2019新型冠状病毒感染的护理人力资源管理_陈秋香.pdf 89. 从五运六气辨识与防治新型冠状病毒感染所致肺炎_周铭心.pdf 90. 新型冠状病毒感染流行期间NICU的应急准备方案_王建辉.pdf 91. 口腔颌面外科新型冠状病毒感染预防的应急护理管理_彭雪.pdf 92. 湖北省儿童新型冠状病毒感染诊疗建议_试行第一版_赵东赤.pdf 93. 围产新生儿新型冠状病毒感染防控管理预案_第一版_中国当代.pdf 94. 输入型难辨性新型冠状病毒感染的肺炎一例及传播模式分析_李进.pdf 95. 自制防护面屏在新型冠状病毒肺炎防护中的应用_杨洋.pdf 96. 姜良铎从_气不摄津_认识新型冠状病毒肺炎_杨华升.pdf 97. 武汉2019新型冠状病毒_201_省略_CoV_肺炎的临床影像学特征初探.pdf 98. 新型冠状病毒的社区防控策略_李东.pdf 99. 大型综合医院发热门诊新型冠状病毒感染预检分诊管理实践_张丹.pdf 100. 医院血液净化中心应对2019新型冠状病毒感染肺炎的管理实践_.pdf 101. 新型冠状病毒感染肺炎的公众认知_态度和行为研究_齐晔.pdf 102. 新型冠状病毒感染医院内防控的华西紧急推荐_李舍予.pdf 103. 认识新型冠状病毒肺炎_关注疫情防控药物研发_刘昌孝.pdf 104. 新型冠状病毒感染疫情的社区防控_刘素珍.pdf 105. 新型冠状病毒感染性肺炎流行期间综合医院门诊管理探讨_熊彬.pdf 106. 新型冠状病毒感染肺炎基本再生数的初步预测_周涛.pdf 107. 中药连花清瘟治疗新型冠状病毒感染的肺炎回顾性临床分析_.pdf 108. 新型冠状病毒感染的肺炎的中医认识与思考_苗青.pdf 109. 基于中医药超分子_气析_理论探讨抗新型冠状病毒药物的研究.pdf 110. 中医药防治新型冠状病毒感染的肺炎各地诊疗方案综合分析_.pdf 与 SARS病毒相比, 2019 年 12 月 以 来 在 中 国 武 汉 市 爆 发 流 行 的 不 明 原 因 肺 炎 是 由 一 种 新 型 冠 状 病 毒 ( 2019GnCoV ) 感染引起的 , 并于 2020 年 1 月 12 日被世界卫生组织 (World Health Organization , WHO) 命名。 2019GnCoV具有 传染性强 , 人群普遍易感 . 临床症状以发热 、 干咳 、 乏力为主 , 严重者并发急 性呼吸窘迫综合征 . 2019GnCoV 肺炎的高分辨 CT 演变特点 : ① 病灶呈多发性 、 双侧分布 , 以胸膜下及 两下肺野多见 . ② 早期以胸膜下斑片状 、 团状 、 节段或亚段性磨玻璃影多见 , 常合并血管增粗穿行 ; 进展 期病灶增多 、 范围扩大 , 发展为双肺多叶受累的磨玻璃影与实变影 , 小叶间隔增厚及纤维化 , 也可呈 “ 铺 路石 ” 征 ; 重症患者表现为双肺弥漫性病变 , 呈 “ 白肺 ”, 常见支气管充气征及血管穿行 ; 缓解期可见较多 纤维化病灶。 2019-nCoV 属于 β 属的新型冠状病毒,有包膜,颗粒呈圆形或椭圆形,常为多形性,直径 50~200 nm 。 S 蛋白是病毒的主要蛋白之一,其编码基因用于病毒分型。 N 蛋白包裹病毒基因组,可作为诊断抗原。经过病毒序列比对分析,推测 2019-nCoV 的自然宿主可能是蝙蝠。在从蝙蝠到人的传染过程中很可能存在未知的中间宿主媒介。 根据对 SARS-CoV 和 MERS-CoV 的研究,冠状病毒对热敏感, 56 ℃时 30 min 、乙醚、 75% 乙醇、含氯消毒剂、过氧乙酸和三氯甲烷等脂溶剂均可有效灭活病毒, 氯已定不能有效灭活病毒。 题目: 中药连花清瘟治疗新型冠状病毒感染的肺炎回顾性临床分析 作者: 姚开涛,刘明瑜,李欣,黄继汉,蔡宏斌 DOI : 10.13422/j.cnki.syfjx.20201099 近期, 湖北省武汉市爆发了不明原因肺炎疫情, 2020 年 1 月 12 日,世界卫生组织正式将造成武汉肺炎 疫情的新型冠状病毒命名为“ 2019-nCoV ” 。国家卫生健康委员会(简称国家卫健委)发布《新型冠状病 毒感染的肺炎防控方案》将其命名为“新型冠状病毒感染的肺炎” ( novel coronavirus-infected pneumonia , NCIP )。据报道, 该冠状病毒属于包膜单股正链 RNA 病毒 ,病原体 2019-nCoV 及其基因组序列已被明确 ,为防疫工作奠定了重要基础。临床表现主要为发热、乏力、干咳,少数患者伴有鼻塞、流涕、咽痛和腹 泻等症状,重症可见呼吸困难并危及生命 。该疾病有较高的传染性,有研究者使用模型评估此次疫情的“基 本再生数” ( basic reproductive number , R 0 ) 甚至达 2.68 。根据国家卫健委公开的数据,截止到 2 月 4 日 24 时,全国累计报告确诊病例 24324 例,累计死亡病例 490 例, 推测其病死率 2.01% 。该疾病自爆发以来, 确诊及疑似病例人数不断攀升,目前已被国家卫健委纳入《中华人民共和国传染病防治法》规定的乙类传染 病,并采取甲类传染病的预防、控制措施。 2020 年 1 月 31 日被世界卫生组织列为国际关注的突发公共卫生 事件,成为继 2003 年严重急性呼吸综合征( SARS )之后,严重危害人民健康和公共安全的重大疫情之一。 目前尚无针对 NCIP 确认有效的抗病毒治疗药物,临床采用对症支持治疗、综合干预为主 。借鉴 SARS 和 甲型 H 1 N 1 流感爆发流行期间中西医结合对防控疫情发挥的重要作用,发挥中医整体论治优势,从改善临床 症状切入探讨中医药在防治 NCIP 中的疗效具有重要意义。 连花清瘟胶囊(颗粒)是基于中医络病理论于 2003 年 SARS 期间通过新药审批绿色通道研发的治疗流 感的创新专利中药,对病毒性呼吸系统传染病具有广谱抗病毒、有效抑菌、退热抗炎、止咳化痰、调节免疫 等系统干预作用 ,特别是对冠状病毒 SARS 和中东呼吸综合征( MERS ) 具有显著的抑制和杀伤作用。 该药先后 20 次被列为国家卫健委、国家中医药管理局发布的呼吸系统传染性疾病防治诊疗方案推荐药物, 成为应对呼吸系统公共卫生事件的代表性中成药,目前已被《新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案》 (试行第 四版)列为推荐用药。自疫情爆发以来笔者对收治的 NCIP 普通型患者,采用中西医结合方法,应用连花清 瘟颗粒联合常规治疗收到了良好效果,现将其病例临床资料总结如下。 1 资料与方法 1.1 临床资料 收集 2020 年 1 月 11 日至 1 月 30 日在武汉市第九医院、华润武钢总医院就诊的,经痰液、 咽拭子、下呼吸道分泌物等标本进行核酸检测判定为新型冠状病毒核酸阳性者的临床资料。 1.2 纳入标准 年龄在 18 周岁以上, 符合 NCIP 诊断标准的普通型 住院患者。 1.3 排除标准 ①重型、 危重型 NCIP 患者; ②非 2019-nCoV 引起的急性呼吸道疾病; ③任何其他慢性呼吸 道疾病、 呼吸系统细菌感染如化脓性扁桃体炎、 急性气管 - 支气管炎、 鼻窦炎、 中耳炎等其他影响临床试验 评估的呼吸道疾病; ④需每日治疗的哮喘患者, 胸部 X 射线计算机体层摄影装置( CT ) 证实存在严重的肺 间质病变、 支气管扩张等基础性肺部疾病患者; ⑤伴有严重的原发性免疫缺陷病、 获得性免疫缺陷综合征、 先天性呼吸道畸形、先天性心脏病、肺发育异常等基础疾病。 1.4 分组方法 符合 NCIP 诊断标准的住院患者,分为常规治疗( 国家卫健委发布的《新型冠状病毒感染的 肺炎防控方案(试行) 》推荐治疗措施)和常规治疗联合连花清瘟颗粒( 1 袋 / 次, 3 次 / 日)。在常规治疗联 合连花清瘟颗粒干预的患者中, 选择符合纳入标准和排除标准, 且体温 37.2 ℃ 的患者为治疗组, 然后以年 龄、体温为协变量,使用 Logistic 回归模型计算倾向评分值,在常规治疗组按 1:1 比例匹配 21 例患者为对 照组。 1.5 评价指标 比较治疗组和对照组主要症状(发热、乏力、咳嗽)消失率、发热消失时间及其他单项症状 的消失率。 1.6 统计学方法 统计分析采用 SAS 9.4 软件。 所有的统计检验均采用双侧检验, P ≤0.05 表示差异具有统计 学意义。描述性分析的计数资料采用例数及构成比描述,计量资料采用 x ± s 描述。定量资料的组间比较采 用 t 检验,分类资料采用卡方检验或精确概率法。 2 结果 2.1 基线资料 收集符合要求的 NCIP 确诊普通型患者共 42 例,治疗组男性 16 例( 76.2% ),女性 5 例 ( 23.8% ),平均年龄( 57.1±14.0 )周岁;对照组男性 12 例( 57.1% ),女性 9 例( 42.9% ),平均年龄( 62.4±12.3 ) 周岁。两组患者年龄、性别,以及体温、血压、心率、呼吸、既往病史、发病到确诊的时间等基线资料,组 间比较差异均无统计学意义,具有可比性, 详细数据见表 1 。 表 1 治疗组和对照组基线资料( x ± s , n =21 ) 2.2 主要症状消失率的比较 ①基线资料为治疗组 21 例,其中发热 21 例( 100% ) , 咳嗽 15 例( 71.4% ) , 乏力 12 例( 57.1% );对照组 21 例,其中发热 21 例( 100% ) , 咳嗽 18 例( 85.7% ) , 乏力 13 例( 61.9% ) ; 组间比较差异无统计学意义。 ②治疗结果:与对照组比较,治疗组发热症状消失 18 例( 85.7% ) ,显著优于 对照组的 57.1% (  2 =4.200 , P =0.040 ); 咳嗽症状消失 7 例( 46.7% ) ,显著优于对照组的 5.6% ( P =0.012 ); 上述 2 个指标组间比较差异均具有统计学意义( P 0.05 )。两组间乏力症状消失率则无显著性差异( P =0.688 )。 详细数据见表 2 。 表 2 主要症状消失率在两组的分布情况 Table 2 Main symptom disappearance rates of treatment group and control group 2.3 发热持续时间的比较 治疗组共有患者 21 例,发热持续时间( 4.6±3.2 ) d ;对照组共有患者 21 例,发 热持续时间( 6.1±3.1 ) d ,组间比较差异无统计学意义( P =0.218 )。 2.4 其他症状消失率的比较 治疗组咳痰、气促症状消失率分别为 64.3% , 77.8% ,与对照组比较,差异均 有统计学意义( P 0.05 ) ;两组间其他症状消失率比较则均无显著性差异,详细数据见表 3 。 3 讨论 根据报道, NCIP 主要临床症状可见发热、肌肉疼痛、乏力、咳痰、气短、头痛以及咽痛、流涕、腹泻、 恶心呕吐等 。据国家卫健委发布的《新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案(试行第五版)》 中指出,该 病以发热、乏力、干咳为主要表现,少数患者伴有鼻塞、流涕、咽痛、腹泻等症状。中国工程院钟南山院士 接受新华社专访时亦指出, NCIP 确诊患者当中发热仍是最主要的和最典型的症状 ,故本研究选取以发热 为主要临床表现的确诊患者评价中药的疗效。同时, 针对 NCIP 确认有效的抗病毒治疗药物缺乏的现状下, 改善发热、咳嗽、乏力等与疾病相关的临床症状,对于缓解疾病严重程度、缩短病程具有重要临床意义。 本病属于中医学“瘟疫” 范畴,感受疫毒之邪为其主要致病因素,入里化热为重要病机转归,这与 NCIP 以发热为主要表现的临床特征是一致的。中药连花清瘟组方是应用中医络病理论揭示病毒所致呼吸系统传 染病传变规律, 以 “ 清瘟解毒, 宣肺泄热 ” 为治法研制的创新中成药。 全方以汉代张仲景《伤寒论》 麻杏石甘 汤合清代吴鞠通《温病条辨》银翘散为基础方,并汲取明代吴又可《温疫论》治疫证用大黄经验,配伍红景 天清肺化瘀,调节免疫,组方体现了两千年来中医药防治此类疫病的用药经验,临床适用于呼吸系统传染病 伴发热、恶寒、咳嗽、肌肉酸痛等。既往药效学研究证实, 中药连花清瘟明显抑制体外培养的 SARS-CoV 病 毒活性 ,同时对 MERS-CoV 活性具有一定的抑制作用,被列入《中东呼吸综合征病例诊疗方案( 2015 年 版) 》 ,多环节抗甲型流感病毒 H 1 N 1 和 H 3 N 2 ,明显抑制禽流感病毒 H 7 N 9 ,同时具有抑菌抗炎、 退热、止咳化痰、调节免疫等作用 。上述药效学研究结果证实中药连花清瘟具有“整体调节、多靶治疗” 的作用特色,也证实其理论与组方的科学性。 本研究纳入 42 例有发热症状的 NCIP 确诊患者,同时伴有不同程度的咳嗽、乏力、咳痰、肌肉痛、气 促、咽痛、恶心、呕吐、食欲减退、腹泻等症状。结果显示,常规治疗联合应用连花清瘟颗粒能够明显缓解 发热、咳嗽、咳痰、气促等临床症状,虽然在发热消失时间方面未显示出统计学差异,但较对照组平均缩短 1.5 d ,也显示出该药在改善发热症状方面有其临床优势。同时该药在改善乏力、肌肉痛、鼻塞、头疼症状方 面也显示出向好的趋势。这对于目前该病缺乏有效抗病毒治疗药物的情况下,发挥复方中药“整体调节、多 靶治疗” 的特色优势,对改善患者症状,缓解病情及缩短病程等方面具有重要的临床应用价值。 本研究初步结果与既往报道的中药连花清瘟临床研究结果是一致的,如 2009 年连花清瘟胶囊治疗甲型 H 1 N 1 流感随机、双盲、多中心临床试验 ,表明该药在病毒核酸转阴时间及全部流感症状缓解时间方面与 磷酸奥司他韦无差异,退热及缓解咳嗽、肌肉酸痛、乏力等症状优于磷酸奥司他韦。另一项连花清瘟胶囊治 疗甲型 H 1 N 1 流感随机、对照临床研究发现,该药与上述结果基本一致 。此外,对定点收治甲型 H 1 N 1 流 感医院——北京地坛医院连花清瘟用药回顾性分析 ,亦证实应用连花清瘟胶囊的退热时间、病毒核酸检 测转阴时间与奥司他韦相当。上述研究结果均是 2009 年甲型 H 1 N 1 流感爆发流行期间获得的临床证据, 说 明中药连花清瘟在防控病毒引起的呼吸系统公共卫生事件方面发挥了重要作用,结合本研究结果, 提示该 药对治疗 NCIP 具有一定的临床应用价值。 应当指出本研究参照国家卫健委发布的《新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案》普通型诊断标准收集和纳 入患者开展回顾性临床研究,尚未进行中医辨证论治,且样本量较少,缺乏病毒核酸转阴及血清学检查数据 支持,此为研究之不足。 后续将扩大样本量, 开展前瞻性、随机对照临床研究进一步评价中药连花清瘟治疗 NCIP 的临床疗效。 World Health Organization.Clinical management of severe acute respiratory infection when Novel coronavirus(nCoV) infection is suspected : Interim Guidance .https://www.who.int/zh/news-room/detail/30-01-2020-statement-on-the-second-meeting-of-the-international-health-regulations-(2005)-emergency-committee-regardingthe-outbreak-of-novel-coronavirus-(2019-ncov) , 2020-01-12/2020-02-03. 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[转载]bioRxiv:消化系统和呼吸系统均是新冠病毒感染的潜在途径
fqng1008 2020-2-1 16:27
Biorxiv近日更新几篇论文,分析了 新冠状病毒的基因特征、感染途径和潜在疗法 等。 研究人员在 2019-nCoV中发现4个独特的插入物,都与艾滋病病毒-1关键结构蛋白中的氨基酸残基具有同一性/相似性;而且,消化系统和呼吸系统均是2019-nCov感染的潜在途径;值得注意的是,恢复期SARS患者的血清,能中和2019-nCoV穗状蛋白驱动;2019-nCoVs最晚的共同祖先出现在流行前约0.253-0.594年,至少有两种不同的2019-nCoV病毒株与此次疫情有关,疫情可能在正式报告前几个月发生。 一、 2019-nCoV穗状蛋白中独特的插入物与艾滋病病毒-1gp120和Gag惊人相似 人们目前正在见证一场由 2019-nCoV引起的重大流行病。该病毒的演变仍然难以捉摸。印度理工学院等机构研究人员在2019- nCoV穗状蛋白中发现了4个插入物,它们是2019-nCoV独有的,在其他冠状病毒中不存在。重要的是,所有4个插入物中的氨基酸残基都与艾滋病病毒HIV-1 gp120或HIV-1 Gag中的氨基酸残基相同或相似。而且,尽管插入物在主要氨基酸序列上不连续,但2019-nCoV的3D建模表明,它们会聚构成受体结合位点。研究人员认为,在2019-nCoV中发现4个独特的插入物,都与HIV-1关键结构蛋白中的氨基酸残基具有同一性/相似性,在本质上不太可能是偶然的。 这项工作有助于阐明 2019-nCoV的进化和致病性,对该病毒的诊断具有重要意义。 作者: Prashant Pradhan、Ashutosh Kumar Pandey、Akhilesh Mishra、Parul Gupta、Praveen Kumar Tripathi、Manoj Balakrishna Menon、James Gomes、Perumal Vivekanandan、Bishwajit Kundu 相关论文信息: https://doi.org/10.1101/2020.01.30.927871 二、 消化系统是 2019-nCov感染的潜在途径:基于单细胞转录组的生物信息学分析 自 2019年12月以来,一种新发现的冠状病毒2019-nCov在中国湖北省武汉市引起肺炎暴发。与严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)一样,2019-nCov通过细胞受体血管紧张素转换酶II(ACE2)进入宿主细胞。 为了分析 ACE2表达细胞的组成和比例,探索2019-nCov在消化系统感染中的可能途径,第二军医大学附属长征医院研究人员,分析了4个含有肺、食管、胃、回肠和结肠单细胞转录组的数据集。数据显示,ACE2不仅在肺AT2细胞、食管上层和层状上皮细胞中高表达,在回肠和结肠吸收性肠上皮细胞中也有高表达。这些结果表明,消化系统和呼吸系统是2019-nCov感染的潜在途径。 综上所述,本研究为 2019-nCov在消化道及呼吸道的潜在感染途径提供了生物信息学证据,可能对我国制定预防2019-nCov感染的健康政策具有重要影响。 作者: Hao Zhang、Zijian Kang、Haiyi Gong, Da Xu、Jing Wang、Zifu Li、Xingang Cui、Jianru Xiao、Tong Meng、Wang Zhou、Jianmin Liu、Huji Xu 相关论文信息: https://doi.org/10.1101/2020.01.30.927806 三、 新型冠状病毒利用 SARS冠状病毒受体ACE2和细胞蛋白酶TMPRSS2进入靶细胞 一种新型高致病性冠状病毒 2019-nCoV在中国的出现,及其在国内外的迅速传播构成了国际关注的突发公共卫生事件。冠状病毒利用它们的穗状蛋白(2019-nCoV-S)选择和进入靶细胞,深入了解这一入侵过程可能有助于评估大流行潜力并揭示治疗靶点。德国汉诺威兽医大学等机构研究人员证明了2019-nCoV-S使用SARS冠状病毒受体ACE2进入,而细胞蛋白酶TMPRSS2用于2019-nCoV-S启动。 因此, TMPRSS2抑制剂可能构成治疗方案。 最后,研究人员证明了来自恢复期 SARS患者的血清,能中和2019-nCoV-S驱动的进入。研究结果揭示了2019-nCoV与SARS冠状病毒感染之间的重要共性,这可能使它们转化为相似的传播能力和疾病发病机制。此外,研究人员还确定了抗病毒干预的靶点。 作者: Markus Hoffmann、Hannah Kleine-Weber、Nadine Krueger、Marcel A Mueller、Christian Drosten、Stefan Poehlmann 相关论文信息: https://doi.org/10.1101/2020.01.31.929042 四、 新型冠状病毒的演变与变异 目前由新型冠状病毒( 2019-nCoV)在中国引起的疫情已成为全世界关注焦点。截至2020年1月28日,已有4631例确诊病例和106例死亡,11个国家或地区受到影响。复旦大学等机构研究人员,从全球共享禽流感数据库(GISAID)和国家生物技术信息中心核苷酸数据库,下载了2019-nCoVs的基因组和类似分离物。利用Lasergene 7.0和MEGA 6.0软件,研究人员计算了序列的遗传距离,构建了系统发育树,并对氨基酸序列进行比对。利用贝叶斯联合系统发育分析,计算了2019-nCoVs的核苷酸取代率和最近共同祖先(tMRCA)等分子钟相关特征。 分离株 EPI_ISL_403928与其他2019-nCoV相比,具有不同的系统发育树和整个基因组长度的遗传距离,在氨基酸残基水平上,分别存在22、4、2个多蛋白、穗状蛋白和核蛋白的变异。核苷酸替代率从高到低:核蛋白1.05×10 – 2、穗状蛋白5.34 × 10-3、多蛋白1.69 × 10-3,对整个基因组为1.65 × 10-3。 按照这种核苷酸替换率, 2019-nCoVs最晚的共同祖先出现在流行前约0.253-0.594年。分析表明,至少有两种不同的2019-nCoV病毒株与此次疫情有关,疫情可能在正式报告前几个月发生。 作者: Chenglong Xiong, Lufang Jiang, Yue Chen, Qingwu Jiang 相关论文信息: https://doi.org/10.1101/2020.01.30.926477
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从SARS-CoV、MERS-CoV到2019-nCoV所经历的冠状病毒感染
热度 1 jhsbj 2020-1-30 11:36
2019 年底以来武汉开始出现的新型病毒性肺炎,是20年来冠状病毒(Coronaviruses CoVs)大家族成员中的第三次从动物到人类所引起的暴发性传播。回顾先前引起全球性破坏的两次CoV暴发,对抵御,减小以致消除当前武汉病毒性肺炎的流行性传播具有重要的实际意义。 长期以来,人类冠状病毒(Human Coronaviruses, HCoV)一直被认为是无关紧要的病原体,仅在健康人群中引起“普通感冒”而已。 然而,到了21世纪,动物宿主体内存在的病毒中,出现了2种高致病性HCoV:即重症急性呼吸综合症冠状病毒(SARS-CoV)和中东呼吸综合症冠状病毒(MERS-CoV),导致两次全球流行,其发病率和死亡率令人震惊。 2019 年12月,另一种致病性HCoV,即2019年新型冠状病毒(2019-nCoV)在中国武汉被确认,已造成严重的发病和死亡。随着势态的迅速发展,目前尚不清楚本次暴发的最终范围和影响烈度。 冠状病毒是大型有包膜的正链RNA病毒,可分为4个属型:α,β,δ和γ,其中已知α和β型冠状病毒感染人类。常见有四种人类冠状病毒(HCoV 229E,NL63,OC43和HKU1)是全球性流行的病原体,约占成人上呼吸道感染的10%至30%。冠状病毒在生态学上具有多样性,而为数最多的病毒变异体藏在蝙蝠体内,提示蝙蝠是许多这类病毒的贮藏库。 在人类周边生存的哺乳动物可充当病毒存在的中间宿主,通过中间宿主能够促进病毒的重组和突变发生,从而扩大了病毒的遗传多样性。冠状病毒表面上的一种刺突(S)糖蛋白,被认为是与宿主细胞受体结合的关键分子,因而也是决定和限制宿主范围的关键因素。 忽视冠状病毒对人类感染的状态,直到2002年才发生了改变。主要是由于当时在中国广东发生了病情严重的非典型肺炎,该疾病是通过国际旅行传播到20多个国家/地区,引起了世界范围的关注。后来这种新的冠状病毒引起的疾病被称为重症急性呼吸道综合症(severe acute respiratory syndrome,SARS)。引起SARS的病原体最终确定为β型-HCoV,也称之为SARS-CoV。 因为早期病例曾在动物市场有过人与动物的接触史,因此,当时强烈怀疑SARS病毒是人畜共同传播性病毒。最初认为果子狸是致病病毒的藏身地。然而,随着更多病毒序列检测数据的浮出,逐渐达成的共识是,蝙蝠可能是致病病毒的天然存储库。 SARS 的常见症状有发烧,咳嗽,呼吸困难,偶尔还有水样便。大约20%-30%的感染患者需要使用呼吸机来辅助呼吸,患者死亡率大约为10%,在老年患者和患有其他疾病合并症的患者中死亡率更高。有人与人之间的传染,大多发生在医疗机构里。这种医院内的传染现象可以通过基本的病毒学原理来解释:SARS病毒S糖蛋白的人类受体,是人类血管紧张素转换酶2(human angiotensin-converting enzyme 2,ACE2),主要分布在下呼吸道而不是在上呼吸道。这样的受体分布可能导致上呼吸道症状的临床表现不明显,也能解释病毒释放和传播的高峰时段,往往出现在患者住院后的疾病发展后期(大约发病10天左右)。此外,SARS护理通常需要雾化呼吸的处置,这也可能进一步导致病毒在医院内的传播。 SARS 病毒在社区中也发生过几次严重的传播事件,例如,在香港大都会酒店中的小规模暴发流行,受感染的顾客通过旅行,从那里把SARS病毒传播到了国际之间。另一次SARS暴发发生在香港淘大花园住宅区,那里有300多名居民被感染,这些提供了SARS-CoV空气中传播的证据。20年过去了,对于与SARS-CoV传播相关的诸多现象,例如:从动物到人的之间的限制性传播是怎样进行的?冠状病毒的源头究竟在哪里?人与人之间的超级传播者现象又是如何发生的?等等事件的了解目前仍然所知甚少。 在经历了8098人感染,其中774人死亡之后,在传统公共卫生措施条件下,当时SARS的大流行趋于终结。此次SARS大流行使全球经济蒙受了300亿-1000亿美元的损失。SARS-CoV的大流行,表明了动物CoV会跨跃物种的屏障感染人类,使人们扩大了对SARS-CoV大流行严重威胁的认识。 冠状病毒第2次在人类的大规模传播始于2012年。当时在一名因呼吸衰竭而死亡的沙特男性的痰液中发现了冠状病毒。后来疾病和病毒分别命名为中东呼吸综合征(Middle East respiratory syndrome,MERS)和MERS-CoV。MERS-CoV也是一种高致病性的β型-CoV,能够跨越种属感染人类。 SARS-CoV 的传播特点主要表现为,病毒可在全球范围内迅速传播,在相对较短的时间内能够被遏制和清除。这与MERS-CoV的传播特点显然不同。MERS大多发病在中东,所以国人对此次传染印象普遍不深。MERS-CoV感染相对隐缓,多为散发性人畜共患的疾病传播方式,在人类中间的传播链有限。目前尚未发现MERS-CoV在社区里的持续传播;相反在医院里却爆发了病毒传播的事件,这与某个超级传播者的出现明显相关,其结果对于医院系统造成了灾难性的破坏。 跟据WHO数据,截至2019年11月,MERS-CoV总共传染了2494例患者,导致858人死亡,其中大部分在沙特阿拉伯。 目前,推测MERS-CoV的自然储存库是在蝙蝠,而导致在人类传播的主要感染来源,是来自中间宿主动物-单峰骆驼。 MERS 与SARS具有许多共同的临床特征,主要是重症非典型肺炎的类似临床表现。但是,两者也有显著的不同。MERS患者具有明显的胃肠道症状,并常常出现急性肾功能衰竭,其原因可能是由于MERS-CoV的S糖蛋白能与下呼吸道,胃肠道和肾脏中存在的二肽基肽酶4(dipeptidyl peptidase 4 ,DPP4)产生受体样结合所致。50%-89%的MERS患者需要上呼吸机进行机械通气,MERS的死亡率为36%。 尽管MERS并没有像SARS那样引起了国际性恐慌,但是,这第二种高致病性人畜共患的人类冠状病毒(HCoV)的出现,表明了该病毒家族对人类的巨大威胁。2017年,WHO将SARS-CoV和MERS-CoV共同列入优先对待的病原体名单,以激发和促进深入研究和开发针对HCoV感染的反制措施。 2019 年12月31日,中国报告了武汉市发生的一系列肺炎病例,其中多数报告中有暴露于出售许多活体动物的大型海鲜市场的患者。因此怀疑另一种致病性人畜共患性病毒HCoV的出现。到2020年1月10日,上海公共卫生临床中心的研究人员向公共数据库发布了完整的2019-nCoV基因组序列,证实了第三次冠状病毒的爆发性传播。 初步的研究结果显示,2019-nCoV与SARS-CoV具有某些氨基酸同源性,都可能以ACE2作为受体感染细胞。这些特征对于预测2019-nCoV传播和大流行的发展趋势可能具有重要的帮助。迄今为止,病毒感染和播散的情况仍在迅速发展,根据目前(2020-1-29)腾讯新闻的实时更新的报告,确诊病例数已增加到5974个,疑似病例9239个,治愈103例,死亡132例。武汉市一家医院的15名医务人员感染证明了2019-nCoV的人际传播。这种传播可能导致多大范围和多长时间持续流行的趋向,仍然是一个悬而未决的关键问题。 到目前为止,看来2019-nCoV造成的死亡率低于SARS-CoV和MERS-CoV的死亡率;但是,根据WHO的数据,SARS累积到一千病例的时间是4个月,而2019-nCoV只用了25天。希望这些数据和特点能为今后多HCoV的防疫工作带来有用的借鉴。目前,2019-nCoV爆发的最终范围和影响程度仍然尚待观察。 借鉴先前SARS和MARS人畜共患疾病暴发的经验,许多公共卫生部门启动了隔离,消毒,备灾和其他应对措施。武汉关闭了第一个确定与传染有关的海鲜动物市场,并进行了消毒处理。美国,日本,泰国和韩国等其他国家已经开始对主要入境口岸的武汉旅客进行入境检查,对发现的旅行病例,进行隔离和进一步的医疗处理。 此外在诊断和治疗方面,以SARS-CoV和MERS-CoV核酸序列做为原型,科研人员针对2019-nCoV的防治迅速开始研究和开发工作。中国科研单位和生物科技公司利用CoV的诊断平台,迅速完成2019-nCoV检测试剂盒的生产,从而做到及早对2019-nCoV感染病例做出诊断。 广谱RNA聚合酶抑制性抗病毒药remdesivir,以及lopinavir / ritonavir和β-干扰素在动物模型中显示出有对抗MERS-CoV的效果,目前正在评估是否也对2019-nCoV具有疗效。美国国家过敏和传染病研究所(NIAID)疫苗研究中心的科学家针对SARS-CoV或MERS-CoV已经建立的核酸疫苗平台,在SARS期间,从获得SARS-CoV的基因组序列到制备DNA疫苗开始一项1期临床试验,总共用了20个月的时间,此后,对于其他病毒性疾病的疫苗制备,他们的时间表已缩短为3.25个月。对于2019-nCoV,他们希望采用Messenger RNA(mRNA)疫苗制备技术能更快地完成疫苗的制备。至于疫苗的疗效还需要经过临床试验加以验证。 美国NIAID所长Fauci博士指出:虽然无法预测HCoV暴发的轨迹,但是,有效的反应就是要迅速采取行动,以经典公共卫生策略为基础,及时制定和实施有效的对策。此次,由以前认为是相对良性的病毒家族病原体所引起的又一次人类瘟疫的暴发,凸显了面对这种浮出的传染病的长期挑战和持续防备的重要性。
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2020年鼠年:新型冠状病毒,英文为2019 Novel Coronavirus (2019-nCoV)
wayneqi 2020-1-28 17:58
2020年真真正正的过了一回鼠年:人们都躲在家里不出门,出门也要戴口罩,甚至于眼罩…… 武汉起源的新型冠状病毒,英文为2019 Novel Coronavirus (2019-nCoV),传染性强,没有针对的药品。让全国都陷入应急备战状态。但是,面对疫情,目前能做的就是阻止起进一步扩散。每天起床的第一件事就是看又确诊了几例。关注自己工作,生活及老家的几个城市。心里默默的祈祷一下。 一星期前有机会到药店,想着回广州的时候可能要带口罩,就买了几个。当时店员只是说只有一种很贵的,我倒也没在意,买了就走。三天后,才意识到口罩买少了,再去周围的药店问,已经售罄了。不仅是口罩,消毒液,消炎水之类的也卖光了……老婆说口罩最好4小时换一次,焦急之情环绕全家。但是,又什么都做不了,想着估计很多人都没有准备呢! 已经在老丈人家里呆闷了一个星期了。楼上楼下加对门的都回老家了。我们也算正正经经的自我隔离了。还好家里过年准备了充足的吃的~~。各个地方都严阵以待,大街上行人寥寥。 全国假期延长,学生开学推迟,心中突然有种莫名的兴奋,那种打破生活常规的经历新鲜事物的新奇。如同在美国的时候,一下大雪就收到放假通知的小开心。 这次病毒的发生是人为造成的,不论是非功过,只希望能给人们敲响警钟,希望这疯狂尽快消退!!!
个人分类: Q杂谈记事|13318 次阅读|0 个评论
发现新型冠状病毒的中间宿主很重要
热度 3 jhsbj 2020-1-26 15:42
世界卫生组织已经命名的2019新型冠状病毒(2019-nCoV)目前还在武汉肆虐。消毒,隔离,个人防护和对症治疗等传统公共卫生和医疗措施将对消除病毒的传播和感染发挥重要的作用。除此之外,找到病毒的动物宿主也是杜绝和将来预防瘟疫的再次发生的一个重要环节。 通常寄宿在人类以外的动物身上的病毒趋向于入侵特定的动物细胞,而对人类无害。比如,禽流感病毒就只会入侵鸟类的肠道和呼吸道。偶然,某种病毒会跃过物种屏障,去感染人类细胞。 目前为止,2019-nCoV病毒和来自蝙蝠的冠状病毒关系最为密切。中国疾控中心病毒所检测的结果发现2019-nCoV病毒与浙江舟山一种蝙蝠体内的冠状病毒有90%的相似性;国外的一项研究发现另一种蝙蝠携带的冠状病毒与2019-nCoV相似性达到96%。但,疾控中心的谭教授认为:即使病毒的同源性如此之高,也不能认定2019-nCoV就是来自这些蝙蝠。 武汉很多染病者都和市内的一个大型海鲜和生鲜市场有关系。这一源头显示,病毒从野生动物传播到人有极大的可能性。2019年底以来武汉出现的这次新型病毒性肺炎,是20年来冠状病毒(Coronaviruses CoVs)大家族成员中的第三次从动物到人类所引起的暴发性传播。 从新型传染病的角度对这种2019-nCoV的来源要予以密切关注。有专家认为:我们总是要警惕类似SARS的奇怪病毒。我们以为蝙蝠是最初源头,总是担心蝙蝠,但是病毒是怎样从蝙蝠传给人的?中间是不是还有一种动物?是仅仅人传人,还是有其他传播方式我们都是需要注意的? 在人类周边生存的野生动物可能充当病毒传播的中间宿主,通过中间宿主的环节有可能发生以致促进病毒的重组和突变,从而扩大了病毒的遗传多样性,也增加了感染人类的危险性。 动物既可能携带仅使其自身染病的病毒,也可能携带能够传染给人类的病毒。在SARS疫情中,狸,貉,猫和雪貂都发现了可以携带和传播的冠状病毒。 绝大多数新型传染病都有动物源头。人类和不同物种以及野生环境接触越密切,被感染的风险也就越大。相反,把人类栖息地与野生动物栖息地分开,就有助于降低风险。 和武汉病毒性肺炎发病有关的那个武汉海鲜市场。据说可以见到大约50个不同物种,其中包括:蛇,乌龟,野兔,狐狸,亚洲椰子猫和青蛙等。那些承受极大压力的野生动物被关在非常狭小很不卫生的封闭空间里。时常遭到高压水龙头的喷撒,粪便和尿液到处都是。各种各样的动物暴露在太阳底下,在不同种属的动物之间,病毒和细菌的交叉感染,不同病毒的重新组合都可能发生。 这种新型冠状病毒和SARS类似,跨越了种属界限,从动物传给了人类,尽管并不是常见的现象,但是其后果非常严重。如果目前还不知道2019-nCoV有哪些中间宿主?那么就需要做更加细致和深入的研究,弄清楚2019-nCoV的感染环节,不要漏掉任何可能存在的感染源。
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2019年冠状病毒(2019-nCoV)的起源
热度 3 zls111 2020-1-25 23:04
2019 年冠状病毒的起源 2019年新型冠状病毒的英文名是 2019 novel coronavirus,简写2019-nCoV. 2019 年冠状病毒就是今年导致武汉肺炎的罪魁祸首。那么这个病毒是怎么来的? 根据基因组序列分析,其与 2018 年报道的两株蝙蝠携带的冠状病毒( SARS-like )最相似,如下图,红色序列是 2019 年冠状病毒序列,与两个蝙蝠寄主病毒序列聚集在一起 。 根据进化树, 2019 年冠状病毒与两株蝙蝠些的冠状病毒聚集在一起,可以认为是 2019 年冠状病毒分支; 2003 的年 SARS 与其它蝙蝠携带的类似 SARS 病毒聚集在一起,是 2003 年 SARS 分支。这两个分支应该是有共同祖先。所以从某种意义来讲, 2019 年冠状病毒是 SARS-like 或者直接认为是类似 SARS 病毒。 图 1 2019 年冠状病毒与其它冠状病毒进化树,来自高福团队刚刚在 NEJM 发表论文。 所以从上述结果来看,现在发现与 2019 年冠状病毒最相似病毒序列是两株蝙蝠携带的病毒序列,所以当前认为 2019 年冠状病毒最接近的祖先就是这两株病毒序列。说明 2019 年冠状病毒最早起源是来自蝙蝠。但是我们一般知道蝙蝠病毒不会直接传播给人类。就像禽流感只会通过猪传播给人类,因为鸟类的身上流感病毒不能与人的受体结合而感染人类,因为人类与鸟类的这个受体差别太远,只有能感染猪了,才能感染人类,因为人类与猪的这个受体相似。 类似的, 2019 年冠状病毒要从蝙蝠感染某种哺乳动物,然后才能传播给人类。如下图, 2003 年 SARS 的中间寄主是果子狸, MERS 是骆驼。 图2 不同感染人的冠状病毒传播方式,来自 Origin and evolution of pathogeniccoronaviruses ,这些冠状病毒最开始寄主主要是蝙蝠和老鼠,中间寄主有果子狸( 2003 年 SARS , SARS-CoV ),猪,骆驼,羊和牛。 接下来就想知道, 2019 年冠状病毒与 SARS 和 MERS 有多像,有没有重组,以及与其最像似病毒序列到底有多像。我用了 2019 年冠状病毒与 SARS , MERS 和上面提到的与 2019 年冠状病毒最相似得两株蝙蝠寄主进行比较,如下图,确实与其最近的蝙蝠病毒序列很相似,特别是前面一部分,也就是 1 到 14000 个核苷酸位置几乎是相似 90% 以上(绿色曲线),但是后面就是与 SARS 差不多(绿色和黄色曲线)。说明 2019 年冠状病毒的 14000 到 30000 位置是来自那种病毒还不清楚。同时说明 2019 年冠状病毒可能是由不同冠状病毒的不同基因重组而来的。 武汉病毒所报道了一株蝙蝠病毒整条序列与 2019 年冠状病毒相似度在 95% 以上,说明这个蝙蝠病毒序列是 2019 年冠状病毒最近的祖先。 图 3 用 2019 年冠状病毒基因组序列搜索一株蝙蝠病毒序列(SARS-like,前面说的与2019-nCoV最相似蝙蝠病毒序列) ,SARS 基因组序列, MERS 基因组序列,曲线分别是绿色,黄色和粉红色。横坐标是基因组的位置,纵坐标是相似度,从下到上是 0 到 100% 相似。 总结一下, 2019 年冠状病毒现在发现的最相似的祖先是蝙蝠身上的病毒,至于通过那种哺乳动物传播到人类还不知道,但是可以确定的是在华南海鲜市场贩卖的野生哺乳动物。
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