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wbb121 2018-7-28 15:15

安装教程及其他参考 http://users-cs.au.dk/cstorm/software/tqdist/ 具体如下： wget http://users-cs.au.dk/cstorm/software/tqdist/files/tqDist-1.0.1.tar.gz cd path-to-file tar -xvf tqDist-1.0.1.tar.gz cd ./tqDist-1.0.1/ cmake . make make test make install 若没有安装cmake，参考 http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=spaceuid=3388297do=blogquickforward=1id=1126252 在make时出现错误 error: ‘strcmp’ was not declared in this scope 具体解决方法是在/tqDist-1.0.1/tqDist/中找到如下程序，在源代码开头加上下面的内容即可 #includecstring 需要修改的程序代码： pairs_quartet_distance.cpp triplet_dist.cpp pairs_triplet_distance.cpp quartet_dist.cpp 参考： http://users-cs.au.dk/cstorm/software/tqdist/ https://blog.csdn.net/dragoo1/article/details/9415379 若在 make install 时出现错误 CMake Error at tqDist/cmake_install.cmake:47 (file): file INSTALL cannot copy file /tqDist-1.0.1/bin/triplet_dist to /usr/local/bin/triplet_dist. 则使用命令 sudo make install

个人分类: 生物统计软件|1737 次阅读|0 个评论

CMake CTest的测试算例依赖设计

qiaol618 2015-4-3 23:27

运行算例的target不要这么做： runtests DEPENDS test1 tes2 ... 这样一个算例失败会导致整个runtests中止。应该这么做： ADD_TEST(test1 DEPENDS output1) ADD_COMMAND( OUTPUT output1 #How to generate output DEPENDS exec1 DEPENDS input1 ) 这样ctest会自动处理所有test case.

个人分类: 编程|3235 次阅读|0 个评论

什么是CMake？

weihuayi 2009-8-4 15:30

转载：http://tzc.is-programmer.com/show/476.html 正在学CGAL ，里面要用到CMake，找一些资料学习一下，呵呵。而且顺利的解决了自己的问题。 cmake 简介 CMake是一个跨平台的安装(编译)工具,可以用简单的语句来描述所有平台的安装(编译过程)。他能够输出各种各样的makefile或者project文件,能测试编译器所支持的C++特性,类似UNIX下的automake。 CMake 使用方法 CMake的所有的语句都写在一个叫:CMakeLists.txt 的文件中。当CMakeLists.txt文件确定后,可以用ccmake命令对相关的变量值进行配置。这个命令必须指向CMakeLists.txt所在的目录。配置完成之后,应用cmake命令生成相应的makefile（在Unix like系统下）或者 project文件（指定用window下的相应编程工具编译时）。其基本操作流程为： $ ccmake directory $ cmake directory $ make 其中directory为CMakeList.txt所在目录；第一条语句用于配置编译选项，如VTK_DIR目录，一般这一步不需要配置，直接执行第二条语句即可，但当出现错误时，这里就需要认为配置了，这一步才真正派上用场；第二条命令用于根据CMakeLists.txt生成Makefile文件；第三条命令用于执行Makefile文件，编译程序，生成可执行文件； CMake的执行就是这么简单，其难点在于如何编写CMakeLists.txt文件，下面结合例子简单介绍CMakeLists.txt的编写，看下面这个CMakeLists.txt #project name PROJECT ( test_math ) #head file path INCLUDE_DIRECTORIES ( include ) #source directory AUX_SOURCE_DIRECTORY ( src DIR_SRCS ) #set environment variable SET ( TEST_MATH $ { DIR_SRCS } ) #set extern libraries SET ( LIBRARIES libm. so ) #add executable file ADD_EXECUTABLE ( ../bin/bin $ { TEST_MATH } ) #add link library TARGET_LINK_LIBRARIES ( ../bin/bin $ { LIBRARIES } ) 或者用下面这个CMakeLists.txt #project name PROJECT ( test_math ) #head file path INCLUDE_DIRECTORIES ( include ) #source directory AUX_SOURCE_DIRECTORY ( src DIR_SRCS ) #set environment variable SET ( TEST_MATH $ { DIR_SRCS } ) #add executable file ADD_EXECUTABLE ( ../bin/bin $ { TEST_MATH } ) #add link library TARGET_LINK_LIBRARIES ( ../bin/bin m ) 这是一个测试数学函数的程序的CMakeLists.txt，#后面为注释的内容，CMake的命令全部为大写第2行指定生成的工程名为test_math 第4行指定头文件目录为include 第8行指定源文件目录为src，并将其赋值给环境变量DIR_SRCS 第10行设定环境变量TEST_MATH的值为环境变量DIR_SRCS的值，此处用于显示如何用环境变量对环境变量进行赋值第14行将数学函数库赋值给环境变量LIBRARIES，当然，可以不用这个环境变量，而在后面直接使用该库名第18行用于指定生成文件，将环境变量TEST_MATH目录下的所有文件编译生成../bin目录下的可执行文件bin 第20行指定../bin/bin执行时的链接库为环境变量LIBRARIES的值－libm.so 下面给出源文件 /src/main.c: #includestdio.h #include../include/a.h int main ( ) { double b= 25.0 ; double a= 0.0 ; a=get_sqrt ( b ) ; printf ( a is %lf, b is %lf \n ,a,b ) ; return 0 ; } /src/a.c #include../include/a.h double get_sqrt ( double var1 ) { return sqrt ( var1 ) ; } /include/a.h #ifndef A_FILE_HEADER_INC #define A_FILE_HEADER_INC #includemath.h double get_sqrt ( double var1 ) ; #endif 将CMakeLists.txt放在当前目录下，执行CMakeLists.txt $ cmake . $ make 即可生成可执行文件，在目录/bin下的bin文件，好了运行看其效果是否和所想一样。

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