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中医科学院与卡罗林斯卡学院展示“鱼的经络图谱 fish meridian”: 热度 3 rongqiaohe 2018-9-6 16:36; 经络存在吗？看得见吗？这个问题已经争论了几十年！最近，中国中医科学院张维波博士领导的小组与瑞典卡罗林斯卡学院的Fuxe博士合作，展示了黑裙鱼（ G. melanocheir ）的经络图谱，发现鱼的经络与人类经络的类似之处。他们的工作让国内外的人们能够看到经络的存在！ “经络看不见”的观点终将成为历史！ Figure 1 Sketch map of meridian-like tracks（类似经络的示意图）. BMT1 is the surface branch of back middle track along the dorsal fin. LMT1 is the superficial part of lateral middle track. BLT1 and BLT2 are the two tracks between LMT1 and BMT1. AMT1 and AMT2 are the two segments of the abdomen middle track. ALT1, AlT2, and ALT3 are three tracks between LMT1 and AMT1. AMT Z abdomen middle track; BMT Z back middle track; BLT Z back lateral track; LMT Z lateral middle track. 图2的结果：通过实验标记，展示了鱼有类似人类督脉的存在。 Figure 2. (A) The governor meridian on the middle back of human body ( 在人体中央的督脉 ). (B) BMT including BMT1 (arrow-), BMT2 (blue - arrow ), and BMT3 (red - arrow ) distributes on the middle back of fish body in different layers. BMT Z back middle track. � � 图3、从不角度展示督脉以及部分胆经。瑞典皇家科学院院士、瑞典卡罗林斯卡医学院著名神经科学家Fuxe(福克斯)教授提出的 “ 经络信号的容积传传输 ” 理论，对经络的基础提出了新的学说。在该理论假设的前提条件下，他们对鱼的经络进行了标记，获得了经络途径的显示。同时，他们也证明了督脉在黑裙鱼体内的存在和分布。参考文献 Weibo Zhang 1 , Ze Wang 1 , Shuyong Jia 1 , Yuying Tian 1 , Guangjun Wang 1 , Hongyan Li 1 , Kjell Fuxe 2 , * Is There Volume Transmission Along Extracellular Fluid Pathways Corresponding to the Acupuncture Meridians? JAMS 2017;10(1):5e19 http://dx.doi.org/10.1016/j.jams.2016.12.004; 个人分类: 学术交流|4959 次阅读|9 个评论

[转载]arvgis API中的map属性方法: linqy 2018-7-30 14:27; 1、鼠标在地图上面移动； 2、按住鼠标左键拖拽鼠标； 3、拉框放大地图； 4、拉框缩小地图。 https://blog.csdn.net/giserstone/article/details/46310531; 个人分类: ArcGIS 二次开发|902 次阅读|0 个评论

python3.6.5中的map函数: iggcas010 2018-6-19 16:35; 各位在用map函数时是不是也有个疑问，特别是3.x以上的版本，在2.x的版本中map函数很好理解，现在版本升级了反而越来越难搞了， map这个函数在高版本中竟然是一个对象了？？！完全是一脸懵逼的，而map后的对象有种“阅后即焚”的感觉，不信咱试试哈。如下举例： 1、想获取对象中的东西，也就是该对象到底是啥？ a= , ] a2=map(set,a) a2 mapobjectat0x000000000C462438 #a2是个对象啊 #将a2中的东西全部打印出来 foritemina2: print(item) {1,2,3,4,6} {2,3,4,5,6} a2 mapobjectat0x000000000C462438 #再次查看a2地址没变，但是再次遍历打印为空 foritemina2: print(item) #a2再也不愿意出来了见客了，只能使用它一次，再用它就不理你了 list(a2) , ] b2=map(set,b) b2 mapobjectat0x0000000002F49F60 list(b2) b2 mapobjectat0x0000000002F49F60 #用过一次它就消失了 list(b2) , ] c2=map(set,c) c3=c2 forijinc2: print(ij) {1,2,3,4,6} {2,3,4,5,6} list(c3) , ] f2=map(set,f) f3=copy.copy(f2) f3 mapobjectat0x000000000C3D1A58 f2 mapobjectat0x000000000C462748 #浅复制后的地址不同，我以为要成功了，其实不是 forminf2: print(m) {1,2,3,4,6} {2,3,4,5,6} forninf3: print(n) #仍旧“阅后即焚” #深复制 importcopy g= , ] g2=map(set,g) g3=copy.deepcopy(g2) g3 mapobjectat0x000000000C462AC8 g2 mapobjectat0x000000000C462908 list(g2) list(g3) #深复制后可以啊，可以用了，但仍旧是只能用一次，想用多少次就要先深复制几次 len(list(g3)) 0 #无奈而又不失礼貌的微笑有人要疑惑了，我想知道map后的对象到底是啥都不行吗？这个map太娇气了，欠揍。我也无奈啊！！！谁知道python开发者到底是咋想的啊，越来越差劲了。; 2681 次阅读|0 个评论

C++中list, vector, map, set 区别与用法比较: linqy 2017-10-22 18:13; List封装了链表,Vector封装了数组, list和vector得最主要的区别在于vector使用连续内存存储的，他支持。 Vector对于随机访问的速度很快，但是对于插入尤其是在头部插入元素速度很慢，在尾部插入速度很快。 List对于随机访问速度慢得多，因为可能要遍历整个链表才能做到，但是对于插入就快的多了，不需要拷贝和移动数据，只需要改变指针的指向就可以了。另外对于新添加的元素，Vector有一套算法，而List可以任意加入。 Map,Set属于标准关联容器，使用了非常高效的平衡检索二叉树：红黑树，他的插入删除效率比其他序列容器高是因为不需要做内存拷贝和内存移动，而直接替换指向节点的指针即可。 Set和Vector的区别在于Set不包含重复的数据。 Set和Map的区别在于Set只含有Key，而Map有一个Key和Key所对应的Value两个元素。 Map和Hash_Map的区别是Hash_Map使用了Hash算法来加快查找过程，但是需要更多的内存来存放这些Hash桶元素，因此可以算得上是采用空间来换取时间策略。参考： http://www.cnblogs.com/smiler/p/4457622.html C++map 映照容器 http://www.cppblog.com/vontroy/archive/2010/05/16/115501.html C++STL中list队列用法实例 http://www.cnblogs.com/madlas/articles/1364503.html C++STL中vector容器的用法 http://xiamaogeng.blog.163.com/blog/static/1670023742010102494039234/; 个人分类: C++|10540 次阅读|0 个评论

Origin绘填充等值线图: zhanghouxing 2017-7-1 11:49; update:2017/7/26 先上一个图，说说填充等值线图是什么样子：采用origin绘图填充等值线图，需要注意一下三个要点：（1）数据准备 book表中的第一列和第一行用于定义等值线图的横纵坐标，其他值构成填充图。绘图时，是从上往下绘图，这样汇出的图和数据的对应关系是上下相反。如下：（2）移动或放缩图片画出来的Contour map，你会发现和其它简单的图不一样，不能选择。原来是这样，你需要点击图片边框处，才能选中，如下图，这时候便可以放缩操作了。关于移动，如果只选择图片区，不能移动，若要移动还要选取legend，这一点很重要。（3) legend前后的空白区初步绘出的图，legend前后有空白区，如下图，前面是白色，后面是黑色，修改方式：点击legend，选择property，然后按照下图方式设置：关于其它一下操作，比如等值线设置等等都比较简单，这里不讲了。最后上一个我最终得到的图：; 23931 次阅读|0 个评论

千年基因联合Genalice提供最强的信息分析解决方案: alinatingting 2015-3-19 09:48; 近日，千年基因与欧洲著名的生物信息公司 Genalice 签署战略合作协议。双方将在海量数据的高效挖掘及精准分析方面建立合作，千年基因将应用专业的信息分析软件 Genalice Map 为全球研究人员提供最强大的信息分析解决方案。千年基因拥有最全面的测序平台，主要包括 HiSeq X Ten 、 HiSeq 2000/2500 、 454/454 + 、 Ion Proton 、 PacBio RS II 等，每天产出海量的测序数据亟待分析， Genalice Map 则能以超高的效率及精准度对海量数据进行处理及分析。以常用的比对软件 BWA 为例， Genalice Map 进行数据比对的效率比 BWA 提升了 100 多倍。对于人类基因组数据，从数据比对至变异检出最快仅需 30 分钟，同时 SNP 及 InDel 的检出准确性也大幅提升。因此，千年基因与 Genalice 的合作将使其信息分析实力得到空前提升。在面对海量数据的挑战时，千年基因将以更高的效率向研究人员提供更可靠的数据分析结果。对于此次战略合作，千年基因总部的 CEO Hyonyong Chong 表示，自 2014 年于全球首家提供 HiSeq X Ten 人全基因组测序服务以来，千年基因进一步巩固了其在测序科研市场的全球领导地位。 Genalice 提供的高质量及高效数据分析流程对于千年基因向客户提供更好的临床测序服务是至关重要的，基于此次双方的合作，千年基因将进一步实现其在测序临床市场的领导地位。自千年基因官网。; 个人分类: 公司资讯|2749 次阅读|0 个评论

[转载]ggmap quickstart: zhangdong 2014-10-4 23:01; source: https://www.nceas.ucsb.edu/~frazier/RSpatialGuides/ggmap/ggmapCheatsheet.pdf ggmapCheatsheet.pdf; 2101 次阅读|0 个评论

Logistic Map notes: sunoval 2014-3-26 23:28; 最近因为一个 project 的关系，需要用到非线性动力学的一些分析方法和技巧，因此花了点时间学习了下 nonlinear dynamics and chaos 的内容。我自己虽然不是主攻这个方向的，但是学习下来，还是感觉到这个领域的有趣，有料和有深度。虽然看起来理论性和技巧性的东西偏多，但是混沌的研究应该能够揭示自然更深层次的一些东西，同时这些研究在各个学科也都各有用武之地。作为一个形式简单的一维、二次映射， logistic map 通常被作为一个典型的非线性、具有 chaotic 特性的动力学系统作为入门研究。自从 1976 年被提出以来，关于这个系统的研究，不说汗牛充栋也算是不可胜数。你可以在网络上找到上千篇涉及到这个系统的文献。本文作为我学习的一个笔记，归纳总结了我所认为重要的一些 logistic map 的性质，难免会有遗漏，欢迎指正。所有的图像都在 Matlab 下编码实现 (available upon request) ，特此声明。 1. The logistic map The logistic map 本质上是一个参数 r-dependent 的 iterative map, 它的数学形式如下： (1) 对于最初提出的人口问题来说，代表的是在第 n 年的人口与最大可能人口的比值，r 则代表着人口出生率和死亡率所形成增长率。对于大于 3.57 的r 值，的最终取值严重依赖于初始值。关于初始值的一点微小变化，反映在最终值的路径将是一个巨大无比的变化，这也是具有 chaos 特性的系统的一个显著特征，我们将在后面的分析中观察到。下图所显示的是一个典型的logistic map 在 phase space 和随着时间的迭代路径。 2. Fixed point ( 定点 ) 解决一个简单的一元二次方程，我们可以很容易的找到这个动力学系统的 fixed point. (2) 这个二次方程的两个根，代表着这个系统的两个稳定点，分别是 (3) 3. Linearized stability 通过将非线性系统线性化，我们可以分析系统在 fixed point 附近的局部稳定性。 (4) 其中 λ被叫做系统的 multiplier 或者 eigenvalue. 将式子(3) 中所得的两个 fixed point 带入式子(4) ，我们得到 (5) 对于离散系统，我们知道系统获得局部稳定性的条件是，因此对于参数r -dependent 的 logistic map ，我们可以定性的得到 (6) 这里，通过观察我们可以发现，当 , fixed point is a non-hyperbolic fixed point, 事实上，根据 bifurcation( 分叉 ) 的定义，我们知道 is a transcritical bifurcation point of logistic map. . 当，从稳定的 attractor 转变为不稳定的 repeller, 同时 fixed point 变成正的，也即称为 attractor, 这种相互转换正是被称为 transcritical point 的原因。同样的道理，当是另一个 non-hyperbolicfixed point, 事实上这是一个 period-doubling bifurcation point of themapping. 对于初始的 mapping f, 我们得到 a transcritical bifurcation at , and a period doubling bifurcation at . 类似的，对于 map, a period doublingbifurcation 发生在， map, a period doublingbifurcation 发生在 . 随着 r 的增加， period doubling 发生在 and bifurcate 在。这些的序列遵循 Feigenbaum rule: (7) 也即，当 n 趋近于无穷，。 4. Logistic map bifurcation diagram Bifurcation diagram 显示的是系统的稳定的 fixed points 的分布情况，这种分布取决于的取值是不断变化的 , 如图所示。 · 当 , period doubling cascade of the sequence 决定了 attracting fixed points. · 当， fixed point 分布在整个的区间。这个时候，系统表现为 chaos 的特性。总而言之，对于 logistic map ， “depending on the value ofthe parameter r, orbits of the logistic map may appear orderly or chaotic”. 如图所示，横坐标轴显示的是作为参数的 r 的变化，纵坐标显示的可能的长期的 x 的取之情况。通过这个 diagram 前面我们所讨论的各种情况都变得显而易见的清楚。 5. Chaos and the Logistic Map 所谓的 chaos, 指的是在确定性的系统中所表现出的具有随机性特征的现象， i.e. “ Stochastic behavior in a deterministic system”. 根据 Strogatz , “Chaos is aperodic long-termbehavior in a deterministic system that exhibits sensitive dependence oninitial conditions”. 具有 chaos 的系统一般具备以下特征 · 对初始值敏感 - 意味着不可预测性 · Topological mixing · Density of periodic orbits · Strange attractors Sensitive dependence on 初始值，可能是 chaotic 系统最为显著，也最具困惑性的特点。它从理论上决定了 chaotic system 的不可预测性 (unpredictability) ，起始于非常接近的两个初始条件，经过一系列循环之后，相互之间的路径可能以指数形式迅速 divergence ，由此就引出了关于 Lyapunovexponents 的研究。下图显示的是，当 r 分别为 3.55 和 3.7 时， logistic map 的迭代情况，分别对应了非 chaotic 和 chaotic 的情况。对于每一个 r 值，我们取两个非常接近的 initialcondition (eps = 0.0001). 我们发现，对于非 chaotic 系统，经过 60 步的迭代之后，两条路径仍然吻合的很好；而同时对于 chaotic 的系统，在经过不到 20 步的迭代，两个 orbit 的差距迅速拉开，从一个方面反映了系统对初始值敏感和复杂性。 Lyapunov exponent 是一项非常有效的衡量系统离散型的指标。粗略来说，如果一个系统的 Lyapunovexponent 是大于零的数，那么整个系统就是指数发散的，是个 chaos 的系统，如果小于零，那么系统不具备 chaotic 的特征。如下图所示，我们可以看到 logistic map 的 lyapunovexponent 随着 r 值的变化的分布情况，同时我们可以看到，这个变化趋势与 bifurcationdiagram 是一致的。他们是从不同的方面展示的同一系统的同一特性： chaotic. 另外一个比较能反应 logistic map 的 parameter r dependent 的方法是 cobweb(stair) map. 对于不同的 r 值，我们可以看到不同的 map 递归情况。 6. 参考文献 Strogatz, S. H., 2006, Nonlinear dynamics and chaos (withapplications to physics, biology, chemistry a, Perseus Publishing. May, R. M., 1976, Simple Mathematical-Models withVery Complicated Dynamics, Nature, 261(5560), pp. 459-467. http://en.wikipedia.org/wiki/Chaos_theory .; 个人分类: 学习笔记|9958 次阅读|0 个评论

使用tda绘制aduna cluster map——以专利权人为例: 热度 1 lucheng918 2014-1-22 14:06; 主要是根据组绘制，选定数据添加到制定组，而后在绘图选项中选定，这是根据共现情况绘制的aduna cluster map。还有根据组生成共现矩阵：结果展示：; 个人分类: 技术控|6999 次阅读|2 个评论

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