翻开任意一本科技期刊，浏览一下各个论文的图表，我们会发现多数图（figure）都是复合图，也就是由多个小图片（panel）组成。有些期刊限制每篇文章图表的数量，只有使用复合图才可以把所有结果加入到图表中。那是不是只有这种情况才需要用复合图呢？其实不是，使用复合图可以更加集中，更有条理地表达你的结果，会使你的读者更容易理解你的论文。那么制作复合图时需要注意什么呢？ 1. 如何决定哪些图可以放在一起组成一个复合图？这要根据图片所要表达的含义来决定。假设有这样一个试验：体外培养的成纤维细胞加入TGFβ刺激后，我们通过RT-PCR发现基因X的表达增加，Western blot 又发现蛋白X的水平也增加。那么这个RT-PCR和Western blot的结果就可以放在一个图里，因为它们都是说明TGFβ增强X的表达，这张图就有两个panel. 如果我们在mRNA和蛋白水平都分别做了TGFβ不同时间和不同浓度刺激的情况，这张图可能就变成了四个panel. 如果我们又做了免疫荧光染色，那我们可以再加一个panel. 总而言之，这张图表达的含义是TGFβ诱导X的表达。 假设我们下一步试图探索一下其中的机制，我们可以在实验体系中加入TGFβ受体的抑制剂；还可以用siRNA敲低SMAD1, SMAD2或者SMAD3来看一看TGFβ是不是通过canonical sigaling来诱导X的表达，具体通过哪个SMAD。这些关于机制的研究可以放在一起组成另一张图。通常一张图对应于结果部分的一个小节。 2.复合图的格式要求：图中的每个panel需要标上序号，一般期刊都要求用大写字母（A, B, C, D…），最好是用黑体。每个panel之间要留有一定的空白使它们相对独立，当然也要注意节省空白的空间。因为期刊对文章可能有页数限制，为了符合要求，期刊可能会缩小你的图表。对于同样大小的图来说，空白越多，每个图片所占的位置就越小，读者看起来就越困难。通常图片的顺序也和文字一样，从左到右，从上到下，如下面的图1. 但是如果图片的大小不一样，为了能将它们排得紧凑，先从上到下，再从左到右，也是可以接受的，如下面的图2. 当然你也可以把图2中小图片的序号改一下（比如将B和C对调）。但是要注意的是，在文中描述结果时，最好是按图片的序号依次提到这些图片，而不要跳来跳去的。也就是说，先说Figure 1A, 再说Figure 1B, Figure 1C, 等等。如果你改了图片的序号，可能相应要调整一下结果部分那几句话的顺序。 还要注意的是投稿时每一个复合图应该都已经组合好，一张图占一页纸，不要让你的读者（审稿人）翻了好几页才看完一张图。 3. 复合图的图表说明：复合图的图表说明（figure legend）首先要有一个小标题来总结这张图的结果，然后分别提到每个小图片就可以了。比如我们前面说的TGFβ诱导X表达的图，可以这样写说明： Figure 1. TGFβ induces X expression. Fibroblasts were stimulated with TGFβ at various concentrations for 24 h (A, C) or at 10 ng/ml for different periods of time (B, D). The mRNA levels of X were measured by RT-PCR (A-B), and the protein levels of X were measured by Western blot (C-D). 图表说明里没有必要重复对结果的描述（比如说在哪个浓度表达量最高，哪个时间点表达开始上升之类），因为你的读者可以从图里看出来。如果有什么特别需要提醒读者注意的可以加一句“Note that…”但是要少用，更多的应该是考虑什么样的图能让你的读者对你的结果一目了然，不需要你的特别提醒。 （此文由LetPub编辑原创，转载请注明来自LetPub中文官网： www.letpub.com.cn/index.php?page=sci_writing_31 ） 进一步了解， 请点击查看： www.letpub.com.cn SCI论文英语润色 │ 同行资深专家修改 │ 专业翻译 │ 格式排版整理 │ 联系我们
值得好好学习 http://shinyapps.org/apps/RGraphCompendium/index.php A Compendium of Clean Graphs in R 1 Preface 2 Introduction 3 Correlations 3.1 The Electoral Advantage of Being Tall 4 Histograms 4.1 Including “rug” Tick Marks 4.2 Including a Density Estimator 4.3 Including Numbers on Top 5 Line Plots 5.1 Regular Line Plot 5.2 Box Plot 5.3 Violin Plot 5.4 Combined Line and Bar Plot 6 Bar Plots 6.1 Including Error Bars 7 Densities 7.1 Standard 7.2 With a Histogram on Top 7.3 Including Text 7.4 Another Example 7.5 Highlighting Specific Areas 7.6 More Highlighting of Specific Areas 7.7 Still More Highlighting 7.8 Density Ratios 7.9 Many Density Ratios 7.10 Stacked Densities 8 Functions 8.1 Plotting a Function 9 Time Series 9.1 A Diffusion Process 9.2 A Sequence of Choices 9.3 The Electoral Advantage of Being Tall Revisited 9.4 A Sequential Test on π 10 Multiple Panels 10.1 Two panel plot 10.2 Buffon’s Needle 10.3 Anscombe’s Quartet 10.4 Four Quite Different Panels 10.5 Nine-Panel Posterior Predictives 11 Graphs for JASP 11.1 11.2 11.3 11.4 11.5 12 Miscellaneous 12.1 Funnel Plot 12.2 Network Graph 12.3 Questionnaire Graph 13 References
0 学过平面几何的人都能出题目自己来做，学习也就具有了研究的性质。 1984 年我曾整理三角形作图问题，送给刚到农村初中任教的弟弟——学生问及好有个应对。前篇博文介绍了已知三高、三中线、三角平分线以及一边之高、中线和对角平分线的作图。 此情可待成追忆：中学平面几何 http://blog.sciencenet.cn/blog-275648-837601.html 应行仁老师说“几何题，所用到的知识 不多，妙在想对思路；一旦解出，清清楚楚无可辩驳”；李轻舟老师也说“ 探索性平面几何题(包括尺规作图 ) 的思维要求并不比一些‘科研’低 ”。因而 再给出两组三角形作图，并 说几句感想 。 1 已知三角形边 a 和对角 A ，作线段 BC = a 和 ∠ BCQ= ∠ A ，作 BC 的垂直平分线和 CQ 的垂线交 于点 O ；顶点 A 在以 O 为圆心、 OC 为半径的弦切圆上。 (1) 给定一边、一角以及中线 m a ，容易确定三角形。 (2) 给定高 h b ，则以 B 为心、以 h b 作圆；过 C 点作该圆之切线交圆 O 于点 A (3) 给定中线 m b ，则以 B 为心、 m b 为半径作圆，与 直径 OC 的圆交于 E ，延长 CE 交圆 O 于 A (4) 给定角平分线 t b 不能（？）以规尺作出三角形（说明省略）。 (5) 给定 t a ， ATN 为角 A 平分线，记圆 O 半径为 R ， MN=δ ， AN=η ；基于三角形相似，有 δ / η= ( η – t a )/2 R ， ( η – t a /2) 2 =( t a /2) 2 +2 Rδ 。 2 Rδ 等于 BN 平方，取 BF=FA’= t a /2 ，有 η=NA’ 2 已知边 a 和高 h a ，线段 BC = a ，再给一个条件可在与 BC 相距 h a 的平行直线 L 上确定顶点 A 。 (1) 给定一边、一角以及中线 m a ，容易确定点 A 。 (2) 给定高 h b ，则以 B 为心、半径 h b 作圆；过 C 点作该圆之切线交直线 L 于点 A (3) 给定中线 m b ，则以 B 为心、以 2 m b 在直线 L 上截取 A ’ ；而 AA’ = a ( 两解 ) (4) 给定角平分线 t b 不能（？）以规尺作出三角形 (5) 给定 t a ，可 如图 作 Rt Δ ADT ，记 ∠ T AD=γ， 有 h a = a ， 即 sin A/ (cos A +cos2 γ )= a/ 2 h a ，记为 tan φ ，有 sin( A – φ )=sin φ cos2 γ ，可求得 ∠ A （似乎不够简明直接，敬请高人出手） 。 3 30 年前进行三角形作图时内心充满愉悦——复习过去所学并能有所收获；写作前述博文同样充满愉悦。看到应老师的评论“ 我初二时 ( 1961年 ) 自问自答一道尺规作图题：平面上任给一条直线和在直线同一边的两个点，要求画一个园过这两点与这直线相切 ”，随即想到“连接两点、延长与直线相交，交点至两点距离乘积为切线平方，确定切点(两解)”；并说“我知道了。我在文中提及割线定理，应老师特地来'点化'。谢谢应老师啦”。内心之愉悦不说可知。 AP 为直径 ， DB ⊥ AP ， 切线长 PC 1 =PD 后又见到应老师说“知道割线定理后，用尺规作图来实现，只需要一个小技巧”，也就会心一笑，没有说话：直角边平方等于其投影与斜边之乘积。随即就想到另一个题目：作圆过给定一点 P 并与两边相切——以图示相似变换即可实现。 这些该是中学数学教师的功课。我曾就岩石强度准则做过类似功课，最终写成 Comparisonoftheaccuracyofsomeconventionaltriaxialstrengthcriteriaforintactrock.InterJRockMechMinSci ， 2011 ， 48 ： 852 – 863. 相关工作主要是增进自己的学术素养，尽管也提出单参数的正则抛物线准则和三参数的指数准则。 4 今年 6 月 27 日到复旦大学参加女儿的博士毕业典礼；听致词的一位同学说“复旦以自由和无用为灵魂”，颇有感触。我们确实过于功利——关心经费、关心项目、关心论文；许多人说研究的艰辛，说写作的困难，说发表的烦恼；而叙说读书、授课、写作之愉悦的却很少很少。 也许业绩考核使部分教师受压变形。学校制定的政策并不合情合理，可大家只能被动应付。就我所知，为了完成学校规定的业绩，少数同仁不得以申报没有新意的专利、发表没有读者的论文，内心充满苦痛而难以排解。 我曾多次说过，“我希望愉快地做一名正直的教师。因而，对于偏离正道的诱惑，抵御于内；对于偏离正道的逼迫，抗争于外”。当然，这并不容易，需要付出代价。 5 上周末回母校参加毕业 30 年聚会，大家叙说别后情形。我说，除了头发白了些，自己与 30 年前一样，没有什么变化呢。同学们竟认可我的说辞，有人说“社会变化啦，你不变怎行”。 许多同学知道我与勾 攀峰先生的争执，关切之情溢于言表。还好， 事情恰巧了结 。 ZWD 同学以兄长的口吻个别“教训”我有二十分钟之久，说“以后一定不允许这样”。不过， CW 同学在餐桌上所问“你这么干为什么？对你有什么好处”，使我略有些为难。我只得挺直腰、抬起头，说“不为什么。只是这样的事情总得有人去做啊。做成之后别有一种愉悦呢”。 6 我想，与 30 年前相比，现在的生活条件、工作环境已极大改善，需要的只是心态良好而已。也许，我们真该以“自由而无用的灵魂”，享受“阅读及写作的愉悦 ”。
1.left button, single click the Y axis; right button, choose 'format axes' 2. choose the window of 'left Y axis' 3. Change the direction in 'gaps and directions' at the top of the panel.
作者：蒋迅 这是我的朋友 Ben Lorica 利用一个作图的JavaScript包 d3.js 制作的几个图表。下面是几张截图。由于我无法嵌入JavaScript，所以不能动态地显现出他的图表。只好请大家到他的网站上去测试。我在图下面都给了连接。 U.S. Income Inequality: Share of Top Earners (1917-2008) 2010 U.S. Census Survey: Income by Ethnicity and Gender Diversity the 2010 Census 这个图类似于我曾经介绍过的“ 美国种族分布图 ”。 Ben Lorica 是一位数据工程师。他在 奥莱理媒体 任高级研究员，还开创了自己的公司 Verisi Data Studio 。我曾经写过一篇“ 新生的一类科学家 ─ 数据科学家 ”，就是在他的启发下写成的。
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