一种巨蟹蛛血蓝蛋白与不同脂质结合的能力 通过测定一些结合动力学参数,评价了蜘蛛血蓝蛋白与不同脂质类结合的能力。从一种巨蟹蛛 Polybetes pythagoricus 血淋巴血浆中分离并脱脂得到一种含有血蓝蛋白的超高脂蛋白(VHDL极高密度脂蛋白)。血蓝蛋白分别与标记的棕榈酸、磷脂酰胆碱、胆固醇和三油酸甘油酯结合,形成几种人工脂蛋白结构。在体外有可能证实先前观察到的脂质-血蓝蛋白相互作用,从而证实了蜘蛛呼吸色素所起的载脂蛋白作用。用凝胶过滤层析法对脂蛋白进行分析,得到3个具有不同血蓝蛋白结构的亚组分。这四类脂质只与六角体结构(420 kDa)结合,可能与低极性位点结合。根据蛋白质相关脂类的放射性测量,计算了最大结合比(MR)、解离常数(Kd)和在低脂浓度(Eo)下的最大结合效率。根据双曲线结合模型,脂质/蛋白质比率随着每种可用的脂质浓度的增加而成比例地增加。每种脂类对血蓝蛋白的饱和度、亲和力和最大结合效率的值都不同。游离脂肪酸的脂蛋白比最高(41.5), 三油酸甘油酯的脂蛋白比最低(7.2) 。磷脂酰胆碱和胆固醇对血蓝蛋白的相对亲和力最高(Kd分别为63×10 -5 M和74×10 -5 M)。低浓度磷脂酰胆碱与生理浓度相似,表现出最高的Eo值。体外达到的最大脂/蛋白比值均大于 P. pythagoricus VHDL,指出即使在血脂浓度很高的生理条件下,血蓝蛋白也能发挥载脂蛋白的作用。 评论: 红色标记语句,是否暗示蜘蛛的血蓝蛋白对甘油三酯的转运能力比较差,如果这一组分含量太高,蜘蛛会患“高血脂”,生存质量大大下降??? 参考原文 Cunningham, M., Gomez, C., Pollero, R., 1999. Lipid binding capacity of spider hemocyanin. J Exp Zool 284, 368-373. Cunningham, M., Pollero, R., González, A., 1994. Lipid circulation in spiders. Transport of phospholipids, free acids and triacylglycerols as the major lipid classes by a high-density lipoprotein fraction isolated from plasma of Polybetes pythagoricus . Comparative Biochemistry Physiology Part B Comparative Biochemistry 109, 333-338.
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昨天参观了芝加哥科学与技术博物馆,看了里面的一个有关蝴蝶迁徙的电影 Flight of the Butterflies 。蝴蝶春天从墨西哥出发,三代完成向北迁徙。第一代是在得克萨斯孵化、成长为蝴蝶,然后飞到美国中部平原,第二代在这里孵化、成长;然后在五大湖乃至加拿大繁殖出第三代。这个第三代是超级蝴蝶,要在秋天顺风飞行几千公里迁回墨西哥的高山,在那里过冬。 这个关于蝴蝶迁徙的研究,是 1950-1970 年代由加拿大动物学家 Fred Urquart 在各地的科学爱好者( citizen scientists )帮助下完成的。 片中高潮是在墨西哥的高山上发现的密密麻麻、比叶片还要多得多的裹在树木上的蝴蝶。那里, Fred Urquart 从落在地上的蝴蝶的翅膀上看到了他分发的、科学爱好者沾上的标签。这样,蝴蝶迁徙的路径最后得以确定。 我们很早就知道云南的蝴蝶会。类似的事情也应该发生在亚洲大陆,随便查了一下,似乎还没有这方面的研究。
Integrative Zoology 是国际动物学会和中科院动物所的合作期刊,主编为中科院动物所张知彬研究员,以下两篇文章均为编辑精选,推荐给大家阅读。文章标题及摘要均译成了中文,方便大家了解文章内容: 近期气候变暖对昆虫种群的直接影响 Direct impacts of recent climate warming on insect populations 作者: Christelle ROBINET, Alain ROQUES 期刊: Integrative Zoology Volume 5, Issue 2, pages 132–142, June 2010 摘要: 近期气候变化的影响在很多物种中被发现,特别是在昆虫中。本文综述了全球变暖对昆虫发育和扩散的主要影响。气候变化对昆虫影响的复杂程度远远超过昆虫对温度的平均升高而产生的简单的线性反应。它们因不同的季节和生物气候区而异。飞行期提前、冬季存活率的增高和发育速率的加快是昆虫的主要反应。昆虫和寄主对温度升高的不同反应很可能会破坏它们的物候同步性,但是适应性遗传过程也可能会很快恢复这种同步性。在很多案例中,气候变暖会导致限制目前物种分布范围的障碍的消除或者迁移。气候变暖也可能会有利于外来入侵物种的定殖和扩散。最终,相关知识会被补充,气候变化对生物的影响仍有待深入研究。 Effects of recent climate change have already been detected in many species, and, in particular, in insects. The present paper reviews the key impacts of global warming on insect development and dispersal. The effects of climate change appear to be much more complex than a simple linear response to an average increase in temperature. They can differ between seasons and bioclimatic regions. Earlier flight periods, enhanced winter survival and acceleration of development rates are the major insect responses. Differential response of insects and hosts to warming up might also lead to disruption of their phenological synchrony, but adaptive genetic processes are likely to quickly restore this synchrony. In a number of cases, warming results in removing or relocating the barriers that limit present species' ranges. It is also likely to facilitate the establishment and spread of invasive alien species. Finally, knowledge gaps are identified and future research interests are suggested. 中国的带羽毛恐龙及鸟类主要特征的演化 Feathered dinosaurs from China and the evolution of major avian characters 作者: Xing XU 期刊: Integrative Zoology Volume 1, Issue 1, pages 4–11, March 2006 摘要: 近年来在中国辽宁早白垩世的沉积中发现的带羽毛恐龙,不仅为鸟类起源于恐龙的假说增添了最强有力的支持,还为鸟类羽毛和飞行的起源提供了重要的信息。对性状演化的初步分析表明,鸟类的主要骨骼学特征在手盗龙类演化的早期阶段就已经出现。已有的证据表明,最初的细丝状羽毛很可能在基干虚骨龙类中演化,羽状羽毛(包括具空气动力学功能的羽毛)在非鸟手盗龙类中已出现。这说明羽毛的演化早于鸟类及其飞行的起源。这里提出一个演化模型来描述羽毛演化的主要阶段,显示出羽毛演化过程兼具渐变与创新;而近年来提出的一些发育模型则认为羽毛是一种全新的演化产物,与爬行类的鳞片没有同源关系。尽管传统观点认为非鸟兽脚类恐龙是一类奔跑型动物,但最近发现表明与鸟类亲缘关系最近的兽脚类恐龙可能是树栖的。许多鸟类的特征,例如叉骨和羽状羽毛等,是在地栖环境中演化出来的,但另一些特征,如足部的改变,则有可能是在树栖阶段发生的。因此树栖习性对鸟类飞行起源可能亦有所贡献。 Recent discoveries of feathered dinosaurs from Early Cretaceous deposits in Liaoning, China, have not only lent strongest support for the dinosaurian hypothesis of bird origins, but have also provided much-needed information about the origins of feathers and avian flight. Preliminary analysis of character evolution suggests that the major avian osteological characters were acquired during the early evolution of maniraptoran dinosaurs. The available evidence also suggests that the first feathers with a filamentous morphology probably evolved in basal coelurosaurs and pennaceous feathers (including those with aerodynamic features) were developed in non-avian maniraptorans, indicating that feathers evolved before the origin of birds and their flight. An evolutionary model is proposed here to describe the major stages of feather evolution, a process characterized by a combination of both transformational and innovative modifications. This model is different from some recent developmental models, which suggest that feathers are evolutionary novelties without a homologous relationship to reptilian scales. Although non-avian theropods are traditionally regarded as distinctly cursorial animals, recent discoveries suggest that the closest relatives of birds might be arboreal theropods. Many bird features, such as the furcula and pennaceous feathers, evolved in a terrestrial context, whereas others, such as some pedal modifications, may have evolved in an arboreal context. Consequently, arboreality may have also contributed to the origin of avian flight.
蛇年新春,我去中关村图书大厦,选择了几本书籍,计划细细研读或作为工具书,并推荐如下: 卢惠霖(译),基因论。北京大学出版社,2005:276页。 选择理由:摩尔根遗传学经典论著。 戎嘉余(主编),生物的起源、辐射与多样性演变-华夏化石记录的启示。科学出版社,2006:962页。 选择理由:本书有助于现生动物类群研究工作者,从更大尺度了解动物多个关键节点,特别是从化石的角度理解动物多样性演化机制。 赵铁桥(译),生物地理学-生态和进化的途径。高等教育出版社,2007:411页。 选择理由:生物科学与地球科学交叉,生态学与进化生物学交叉。 尹文英、宋大祥、杨星科等(编著),六足动物(昆虫)系统发生的研究。科学出版社,2008:405页。 推荐理由:该书对2005年以前,六足动物系统发生方面的国际前沿研究成果进行了概述,归纳出了一系列的热点科学问题,并尝试综合多学科对这些问题开展了研究。 刘凌云、郑光美(主编:第4版),普通动物学。高等教育出版社,2009:577页。 推荐理由:动物学研究生必备中文教科书。 周长发(编著),进化论的产生与发展。科学出版社,2012年:323页。 推荐理由:演化生物学之导论。 黄原(编著),分子系统发生学。科学出版社,2012年:533页。【作者赠送】 Bernd Mayer, Bioinformatics for Omics Data - Methods and Protocols. 2013: 584页。 推荐理由:本书由国际上一线生物信息学工作者编写,全面介绍了基因组、转录组、蛋白组、代谢组等多类组学数据的分析方法。 某些细节之妙,还需阅读一些原著。上网购得几本,待慢慢阅读,也和组员和学生共享: Quentin D. Wheeler (Editor), The New Taxonomy (Systematics Association Special Volumes). CRC Press, 2005: 256 pages. 推荐理由:老树新花,分类学研究必备参考书。 Emmanuel Paradis , Analysis of Phylogenetics and Evolution with R (Use R!). Springer, 2011: 400 pages. 推荐理由:R是开源软件。系统学工作者可以按照自己的思路,设计新的计算方案。 E. O. Wiley, Bruce S. Lieberman, Phylogenetics: Theory and Practice of Phylogenetic Systematics. Wiley-Blackwell, 2011: 432 pages. 推荐理由:20多年后的第二版。比较一下,掌握新的进展。 Maria Anisimova (Editor), Evolutionary Genomics: Statistical and Computational Methods, Volume 1 (Methods in Molecular Biology). Humana Press, 2012: 481 pages. Maria Anisimova (Editor), Evolutionary Genomics: Statistical and Computational Methods, Volume 2 (Methods in Molecular Biology). Humana Press, 2012: 571 pages. 推荐理由:基因组数据如何用于演化生物学之研究?统计学+计算方法。 恭祝大家蛇年吉祥如意,在专业上收获新概念、新理论、新方法、新成果!
我在读硕士研究生的时候,一方面是对动物学不感兴趣,另一方面是不希望浪费三年黄金时光,因此综合导师平时的教诲和自己的判断,选择了几本基础的动物学书籍,读了几遍。其中有 4 本,现在想起来还是一直有印象: 1) IMMS' General Textbook of Entomology; 2) The Insects: Structure and Function; 3) Invertebrate Zoology (Barnes); 4) Numerical Taxonomy。读书的本意是学学专业英语,掌握一些专业词汇。 等到下决心要读博士研究生的时候,自己才发现不同类群差异比较大,需要恶补的知识太多。当时对分类学比较痴迷,就决定从拉丁文入手,花了好几年把 Zoological Record 上姬小蜂的所有拉丁文输入到一个数据库中。后来由于 John Noyes 博士发布了一个权威的光盘,我也很少再去考虑使用这个数据库。尽管如此,几年的坚持还是让我自己广泛了解了包括分类学在内的不同学科的进展。同时,导师黄大卫研究员在系统发育领域的不断引导,也让我一直坚持阅读相关的文献。在购买在线数据库之前,我和我的同学都经常泡动物研究所的图书馆。这个图书馆和标本馆一样,在国内动物学同行里久负盛名,每年吸引很多学子来此访问。那时候,尽管每个课题组人不多,空间比较宽裕,但是很多本所的导师和学生还是喜欢享受安静的图书馆环境。有了在线数据库以后,特别是自己逐渐拓展到相关领域之后,我们就很容易获取感兴趣的论文。 自我感受:硕士研究生期间读了几本对自己有影响的好书;博士研究生期间在专业方面养成了点面结合的文献阅读习惯。
猪能有多高智商,恐受人冤枉; 鸟能有多大能耐,也被人低估。 骗人和唬人,是很高级的行为,绝大多数动物不会。 这些行为需要动物不仅知道自己想要什么,而且能够判断其他动物的想法和意图,然后还要采取行动。 知彼知己,是很高级的认知水平。人的心理学有较多研究,而动物的神经生物学,研究还不多。 最近有些研究提示,猪和鸟可能懂得骗和唬,如果这样,那么也许它们脑袋有些部分是很厉害的。 不可低估猪脑袋 英国St Andrews大学的Byrne和Bristol大学的Held今年9月28日在《当代生物学》杂志介绍猪的认知能力。猪是社会性动物,在野外生活时,一般家庭的组成是一只公猪、几只母猪及后代,它们一道觅食。猪能识别个体,如果发生冲突以前,两只猪有时间观察对方,那么直接见面时冲突会相应减少。猪有较好的空间记忆力,在某地发现食物后,过些时候还记得赶快去那找食物。如果猪发现两个地点的食物量不同,下次会先到食物多的地点。 猪骗猪的实验最初是Held和Byrne于2002年在《动物行为》杂志上报道。他们发现如果让两个同性的猪一道参加实验,其中A体重大于B,而且A打得过B(学术上把俗话的老大A称为dominant主导型,而下级B为subordinate服从型)。科学家安排先让B知道食物藏在哪,而A不知道。也就是人为地使B成为有知的猪,A为无知猪。B有知后,每次再进到同样的场合,很快直接走向上次食物藏匿点,而A则系统地搜寻食物。A偶尔碰到B,发现B已经在吃食了。这样的捷足先登的情况反复发生,几天后,A就知道跟着B,一旦到食物藏匿点,A本来就厉害,就很快挤走B,独吞食物。 当B看不到A的时候,或者B看到A走的方向是离开食物藏匿点方向时,B很快就会走向食物藏匿地点;相反,而当B看到A的时候, B就改方向绕道,不直接走向藏匿点。如果有两盆食物,一盆比另外一盆多,B特别会隐瞒大盆的地点。随着时间推移,B对A的欺骗程度增加。 而如果B和一个不抢食物的C一道出现在同样场合,B不惧C,就直接走向藏匿点。 对猪行为的解释有两种,一种认为猪很聪明,真的知彼知己,能判断其他猪的内心,科学上称它具有theory of mind。另一解释是猪没这么聪明,只是一般学习记忆:如果B直奔食物藏匿点,就会很快遭到A的打击排斥,B学会不自讨苦吃,所以压抑自己走向食物藏匿点的意愿,绕道徘徊。目前的实验,没有确定到底哪种解释正确。猪的智力到底有多高,尚待进一步研究。 迄今确切证明能知彼知己的只有很少几种动物,如猩猩和猴子。例如,美国的Hare(人名,非野兔)等2000年报道,主导型和服从型猩猩同时进入有食物场地时,服从型猩猩知道主导型是否看得见食物,无需学习,就能马上做出有利于自己的取食动作。 不能小看鸟脑袋 已知渡鸦(Corvus corax)会藏匿食物。2005年,美国Vermont大学的Bugnyar 和 Heinrich发现,如果当渡鸦X在藏食物时,让Y看到,而且X知道Y能看到自己藏食物的过程。然后,让X和Y进入实验场所,X赶紧把食物取出来。如果X在藏食物时,知道Z不能看到自己藏匿的过程,那么以后X和Z一道进入场所,X就不急于取出食物。特别是当Z靠近食物藏匿点2米内的时候,X不去取自己藏的食物。 2009年, 剑桥大学的von Bayern和 Emery发现寒鸦会看人眼色。做实验用的是人工饲养的寒鸦。如果生人在场,寒鸦不熟悉,寒鸦会在意此人注意力何在。如果这个人盯着寒鸦看,寒鸦就不敢取食,而如果他眼睛斜视,或头扭转成侧面,或闭上眼睛,或者干脆头反过来完全不可能看到寒鸦,那么寒鸦取食的潜伏期就短。以上这些不同情况中,越是人看到寒鸦的可能性少,寒鸦取食就越快。但是,如果在场的是寒鸦熟悉的人(如饲养者),寒鸦不怕,就很快取食,而不看这个人是否注意它。就是说,寒鸦不仅区别生人熟人,而且对于生疏的人,它还察言观色。 今年的有趣发现是bowerbird的能力。 众所周之,人世间千百年来,国王的建筑都用各种方式唬臣民,让他们觉得自己渺小,而突出国王。 最近,科学家发现,雄鸟也能唬雌鸟,只是方法稍异于国王,不贬低雌鸟,但思路也有相同点:突出雄鸟。 澳大利亚Deakin大学的Endler等,今年9月在《当代生物学》杂志发表论文,报道他们观察野外bowerbirds的发现。他们发现雄鸟做窝时,考虑了雌鸟的视角。雄鸟用石块、石片铺一条路通向自己的窝。它铺小石块时,做了仔细的安排:雌鸟进入巢通道的起点,石块较小,而越接近雄鸟窝,石块越大,这种由小到大的梯度,从雌鸟在地上行走的高度所形成的视角,正好造成一种视觉假象。本来透视的效果能够帮助雌鸟判断路的起点到窝的距离,而雄鸟石块的排列梯度破坏了自然透视效果,使雌鸟觉得从入口到窝的路途比实际要短。另外,梯度排列的石块更改了透视以后,让雌鸟从远处看过去,地上石块比较规则,可以突显窝中雄鸟,使雌鸟较快看到雄鸟。 雄鸟是否有意通过制造强迫的透视,造成距离和大小的视觉误导?雄鸟是否有意排列石块大小梯度?为了回答这些问题,研究人员将石块大小梯度反过来排列。结果发现:3天内,雄鸟就开始纠正被扰乱的梯度,2周内,原有梯度基本恢复。 Endler等文章中有思考和对照实验,值得对科学感兴趣的学生细读。 除了人以外,动物竟然知道透视原理,这是第一次发现。须知,几百年前世界上多数文化都不知道透视原理,中国画起初很多年也不懂透视。现在也有人忘记了学校教的透视原理。而鸟却会,挺奇妙的。 不要高估人脑袋 人类对于有趣行为的研究,迄今主要停留在描述和分析,机理了解极少。 所以,人还有很多不知道,对于日常常见的行为,都还是知其然,不知其所以然:人类并不理解猪怎么骗猪、鸟怎么唬鸟。 更高级的脑功能,人类理解就更少,何时能够理解?是否有极限? 目前全球人类的脑袋中,尚无答案。 Mendl M, Held S, Byrne RW (2010). Pig cognition. Current Biology 20:R796-R798. Held S, Mendl M, Devereux C, and Byrne RW (2002). Foraging pigs alter their behaviour in response to exploitation. Animal Behaviour 64:157 166. Hare B, Call J, Agnetta B and Tomasello M (2000). Chimpanzees know what conspecifics do and do not see. Animal Behavior 59:771785. Bugnyar T and Heinrich B (2005). Ravens, Corvus corax, differentiate between knowledgeable and ignorant conspecifics. Proc. R. Soc. Lond. B Biol. Sci. 272:164146. von Bayern AMP and Emery NJ (2009). Jackdaws respond to human attentional states and social cues in different contexts. Curr Biol 19:602-606. Endler JA, Endler LC, Natalie R. Doerr NR (2010). Great bowerbirds create theaters with forced perspective when seen by their audience. Current Biology 20:1679-1684. 发表于《北京大学校报》
动(生)物学中几个术语辨析 前些日子我们所在征求修改研究所名称的建议时,有一个选择记得是Institute of Animal Sciences。Animal Science (动物科学)与Zoology (动物学)在内涵上还是有很大差别的(博文:动物研究所 还是 动物学研究所 http://www.sciencenet.cn/blog/user_content.aspx?id=29696 )。 如中国畜牧兽医学会 的英文译名: Chinese Association of Animal Science and Veterinary Medicine , 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 的英文是: Institute of Animal Sciences , Chinese Academy of Agricultural Sciences . 如果是这样,要是改为 Institute of Animal Sciences 的话, 动物研究所 可就被认为是畜牧(兽医)研究所了。 Animal Science (动物科学): 研究家养(驯养)动物的生物学的一门学问。这个领域最早研究的动物类群是家畜,现在范围已经广泛多了,包含一些伴随人类的宠物动物如狗、猫,马以及其他家养动物。研究的内容从组织器官和整体的生理学、生物化学,到生物分子和细胞的结构和功能等。重点在研究这些动物的生长、繁殖、营养等,主要关注如何提高这些动物的生产量,以及健康和福利等方面。现在国内的农业院校中的动物科学就是这个范畴(以前叫畜牧兽医专业)(是不是这样?)。 Zoology (动物学): 科学 研究(野生)动物的生物学的一门学问,是生物学的一部分。主要包括研究区系演化的动物分类学,研究动物分布的动物地理学,研究动物结构的比较解剖学,研究动物器官系统功能的生理学,研究动物遗传和发育机理的分子生物学、分子遗传学、发育生物学,研究动物习性的行为学,研究动物与环境之间相互关系的动物生态学,以及研究动物进化的进化生物学等等。从普通意义上讲,研究的对象主要还是野生动物。还有相近的名称有:Animal Biology (动物生物学), Zoological Science (这个术语就不好翻译了!) 还有两个术语:Biological Science (生物科学)和life Science(生命科学)。这两个术语应该是没有本质区别的,含义雷同(对否?请各位指正!)。所以以前高校中的生物学系(Department of Biology)在改为学院时,都称为生命科学学院(College of Life Sciences)。也有一种说法认为生物学(Biology)范围广,包含生物学科的全部,而生命科学(Life Science)特指微观生物学(Micro-biology)。Biology, Biological Science,Bioscience 和Life Science ,三个术语含义是不是没有本质区别? 至于宏观生物学(Macro-biology)与微观生物学的学科之分,具体细分起来也是很困难的,如分子地理学,分子生态学,生理学是否归属于宏观生物学?进化生物学归属于宏观还是微观?用基因组学的方法研究生态学问题,又如何归属? 但在实际生活中,这个学科归属问题有时候还是很重要的。如科学院和基金委组织的各类基金项目答辩(重点项目,重要方向项目,杰出青年基金项目等),在对答辩人进行分组的时候就会遇到这类问题,不同的分组有时候直接影响到结果。现在有些单位在职称晋升和研究生毕业获得学位的条件中,需要规定SCI论文的影响因子,不同学科的因子应该不同,那么在一个单位中既有分子生物学、生理学,又有生态学、分类学的情况下,学科的归属又会导致一些问题。一旦涉及到利益的时候,问题就来了。 (王德华 2008.7.25)