抗维生素是新抗生素吗? 诸平 据德国哥廷根大学( University of Göttingen ) 2020 年 8 月 24 日提供的消息,研究人员开发出抗细菌感染药物的方法。有朝一日,抗维生素( Antivitamins )有可能取代抗生素 (antibiotics),以解决抗药性难题。有报道称: 如果我们不创新,到2050年,由于抗生素抗药性将使1000万人丧生 。 抗生素是现代医学最重要的发现之一,自从大约 100 年前发现青霉素以来,已经挽救了数百万人的生命。由细菌感染引起的许多疾病(例如肺炎,脑膜炎或败血病)已成功使用抗生素治疗。但是,细菌会产生对抗生素的抗药性,这使得医生们难以找到有效的治疗方法。尤其成问题的是病原体,其产生多药耐药性并且不受大多数 抗生素的影响。这导致受影响患者的疾病任其恶化,无药可救,只能坐以待毙——眼巴巴地看着具有致命后果的到来。因此,全世界的科学家都在寻找新的抗生素。现在,研究人员描述了一种有前途的新方法,其中涉及以 “ 抗维生素 ” 来开发新型抗生素。 该研究由哥廷根大学哥廷根分子生物科学中心( Göttingen Center for Molecular Biosciences at the University of Göttingen )的凯·蒂特曼( Kai Tittmann ) Kai Tittmann 博士 小组 与哥廷根的马克斯 · 普朗克生物物理化学研究所( Max Planck Institute for Biophysical Chemistry Göttingen )的 伯特·德·格鲁特的计算生物分子动力学小组 ( Bert De Groot's Computational Biomolecular Dynamics Group )以及美国得克萨斯 A & M 大学的塔格·贝格利 小组 ( Tadhg Begley's group from Texas AM University in College Station, Texas ) 合作完成的。 相关研究结果已经在《自然化学生物学》( Nature Chemical Biology )杂志网站上发表—— Fabian Rabe von Pappenheim, Matteo Aldeghi, Brateen Shome, Tadhg Begley, Bert L. de Groot, Kai Tittmann.Structural basis for antibiotic action of the B1 antivitamin 2′-methoxy-thiamine. Nature Chemical Biology , 2020; DOI: 10.1038/s41589-020-0628-4 。 实际上,抗维生素是抑制真正维生素生物学功能的物质。一些抗维生素与阻止或限制其作用的实际维生素具有相似的化学结构。在这项研究中,哥廷根大学哥廷根分子生物科学中心的凯·蒂特曼教授等人, 他们一起研究了天然存在的维生素 B1 抗维生素在原子水平上的作用机理。一些细菌能够产生这种重要的维生素 B1 的有毒形式,可以杀死竞争细菌。 凯·蒂特曼教授领导的研究小组,使用高分辨率蛋白质晶体学( high-resolution protein crystallography )研究了抗维生素如何抑制细菌中心代谢中的重要蛋白质。研究人员发现,通常在功能蛋白中可以观察到的 “ 质子舞蹈 ” 几乎完全停止了功能,并且该蛋白不再起作用。凯·蒂特曼教授解释说: “ 在复杂的齿轮系统中,抗维生素仅多一个原子就像沙子一样起作用。 ” 有趣的是,人类蛋白质能够相对很好地抵抗抗维生素并继续发挥作用。化学家伯特·德·格鲁特和他的团队使用计算机模拟来找出原因。 “ 人类蛋白质根本不与抗维生素结合,或者以不会被 “ 中毒 ” 的方式结合。” 随着病原体抵抗力的增强,科学家们正在寻找一类可以替代抗生素的药物。正在研究关闭细菌中维生素的抗维生素。科学家一直在努力了解天然存在的抗维生素如何发挥作用。 尽管我们许多人从未听说过抗维生素,但自从爱德华 · 梅兰爵士( Sir Edward Mellan )在 20 世纪 30 年代末 发现第一种 抗维生素(尽管他称其为 “ 毒素 ” )以来,科学家们就知道了所谓抗维生素,实际上就是阻止维生素起作用的物质。随着细菌对神奇药物产生快速抵抗的步伐,抗生素时代即将结束时,研究人员正在密切关注抗维生素,将其作为可能替代抗生素治疗细菌感染的新型药物的基础。 对于抗维生素研究的第一步,是搞清楚抗维生素是如何起作用的。例如,使维生素 B1 无效的抗维生素与维生素的区别仅在于一个原子,而对此看来似乎并不重要。 B1 抗维生素是天然存在的,由细菌产生,可以杀死竞争细菌。它的关键原子出现在一个似乎不重要的位置,加深了其神秘感。为了了解单个原子是如何做到如此有效的,研究人员使用 高分辨率蛋白质晶体学 ( high-resolution protein crystallography )对其进行研究。这使他们能够在原子水平上观察 B1 抗维生素和 B1 之间的相互作用。 他们看到的是,抗维生素完全中断了功能蛋白中的 “ 质子舞蹈 ” 。凯·蒂特曼( Kai Tittmann ) 说 : “ 在复杂的齿轮系统中,抗维生素仅使一个多余的原子像沙粒一样起作用,就会阻止其微调的机理。 ” (凯·蒂特曼小组是第一个在 2019 年 记录此 “ 舞蹈 ” 的人。) 抗维生素不会打扰人类 此研究的一项特别重要的发现是,尽管 B1 抗维生素可以阻止 B1 在细菌中起作用,但它不会干扰人类的维生素。这为研究者提供了希望,可以开发出靶向和中和病原体而不会对患者造成伤害的抗维生素。 伯特·德·格鲁特的团队创建了计算机模拟,以了解为什么人类不受错误原子的影响,并发现: “ 人类蛋白质根本不与抗维生素结合,或者以不被中毒的方式结合。 ” 抗维生素可能随时准备介入并替代失效的抗生素的可能性并不是完全意外的。 实际上 , 抗 维生素被 用于 开发抗生素和 抗增殖 药已有先例,例如百浪多息( prontosil )和氨喋呤( aminopterin )。而且已经有一些抗维生素药物在使用,特别是维生素 B12 、维生素 B9 和维生素 K 的拮抗剂。更多信息请注意浏览原文或者 相关报道 。 Abstract The natural antivitamin 2′-methoxy-thiamine (MTh) is implicated in the suppression of microbial growth. However, its mode of action and enzyme-selective inhibition mechanism have remained elusive. Intriguingly, MTh inhibits some thiamine diphosphate (ThDP) enzymes, while being coenzymatically active in others. Here we report the strong inhibition of Escherichia coli transketolase activity by MTh and unravel its mode of action and the structural basis thereof. The unique 2′-methoxy group of MTh diphosphate (MThDP) clashes with a canonical glutamate required for cofactor activation in ThDP-dependent enzymes. This glutamate is forced into a stable, anticatalytic low-barrier hydrogen bond with a neighboring glutamate, disrupting cofactor activation. Molecular dynamics simulations of transketolases and other ThDP enzymes identify active-site flexibility and the topology of the cofactor-binding locale as key determinants for enzyme-selective inhibition. Human enzymes either retain enzymatic activity with MThDP or preferentially bind authentic ThDP over MThDP, while core bacterial metabolic enzymes are inhibited, demonstrating therapeutic potential.
这几天,细菌攻克1000倍浓度抗生素成为“超级细菌”的文章刷爆了朋友圈。这是人们第一次直观的看到超级细菌的演变,也让人们意识到抗生素这个对抗细菌的利器正在逐步丧失其优势。随着抗生素的广泛使用、甚至是滥用,细菌的抗药性正在逐步增强。 虽然,英国医生弗莱明(Alexander Fleming)于1928年发明了青霉素(盘尼西林)并且在改变现代人医疗卫生上做出了巨大的贡献,使人类进入了抗生素的时代。 但是,抗生素也是一把双刃剑。近年来,细菌耐药已经成为全球公共健康所面临的重要挑战。携带NDM-1、MCR-1等耐药基因的“超级细菌”大量出现令人闻之色变,而人类研发抗生素的速度远远赶不上细菌的耐药性的出现。 细菌出现耐药,与大量耐药基因的出现有关。 一个菌出现耐药基因并不可怕,可怕的是它会把这个基因再提供给其它细菌,提供给其它细菌也就算了,更可怕的是一旦转移到致病菌身上就可能引起抗生素控制不住的疾病。 耐药基因还能够在细菌,人体和动物肠道菌群之间传播。目前,人们并不清楚耐药基因尤其是具有水平转移能力的高风险等级的耐药基因是如何传播的。 近期,中科院微生物所朱宝利研究员作为通讯作者发表在美国微生物学会(ASM)旗下期刊Applied and Environmental Microbiology上的文章揭示了具有水平转移能力的耐药基因在细菌,人类和动物体内的传播网络。 他们对23000余个已知细菌基因组、980万个已公布人体肠道细菌基因、测序获得的30万个养殖动物肠道细菌基因中的高风险等级可移动性耐药基因进行了全面分析。 研究发现,可移动性耐药基因主要存在于4个细菌门当中的790个细菌种之中,其 丰度和转移频率在变形菌门中显著富集 。这些耐药基因在细菌间的近期转移形成了一张巨大的网络,由703个细菌种、16859个种间配对所组成。 对该网络进行解析,发现细菌个体间耐药基因的转移 由细菌种属进化关系所主导,又同时受制于生态屏障 ;这一规律同样适用于耐药基因在人体和动物肠道细菌群体水平上的转移。 进一步分析发现,41个人体和动物肠道菌群间相互转移的耐药基因中的33个存在于多种人体病原细菌中。 研究发现, 系统发生学及生态学是移动性抗生素耐药基因传播的动力, 人类及动物肠道菌群共享的移动性抗生素耐药基因在许多人类致病菌中也存在。 该研究首次以基因组学大数据为依托,深入解析了耐药基因在细菌间的传播网络和规律,对深入认识细菌耐药性的进化、细菌耐药的形成机制等具有重要意义。 朱宝利课题组长期致力于细菌耐药基因组学研究,先后在Nature Communications、Lancet Infectious Diseases等杂志发表系列研究工作,揭示了耐药基因在病原细菌、人体肠道菌群中的分布及传播途径和机制等。 2013年,朱宝利课题组胡永飞、杨犀等对来自三个不同国家(丹麦、西班牙、中国)的162个健康人肠道微生物元基因组(Metagenome)中的耐药基因进行了深入分析。从他们构建的人体肠道微生物基因的数据集中鉴别出1093个耐药基因,发现,人体肠道微生物中耐药基因的比例最高,耐药基因更倾向于存在某些特定的细菌门,如变形菌门。中国人肠道中含有70个耐药基因型,丹麦人45个,西班牙人49个。中国人肠道微生物耐药基因的丰度最高,西班牙人居中,丹麦人最低。对耐药基因单核苷酸多态性的聚类分析表明中国人肠道耐药基因不同于丹麦和西班牙人,进一步分析发现,无论在哪个国家人群中,四环素耐药基因型的丰度都是最高的。 文章中图片部分来自网络,部分来自论文。 参考资料: Hu Y, Yang X, Li J, et al. The transfer network of bacterial mobile resistome connecting animal and human microbiome. . Applied and environmental microbiology, 2016. 88-22. Hu Y, Yang X, Qin J, et al. Metagenome-wide analysis of antibiotic resistance genes in a large cohort of human gut microbiota. . Nature Communications, 2013, 4(2):405-415.
栗叶提取物可降伏 致命性葡萄球菌 诸平 The European chestnut ( Castanea sativa ), also known as the sweet chestnut, is a species of flowering plant in the family Fagaceae, native to Europe and Asia Minor, and widely cultivated throughout the temperate world. The tree attains a height of 100 feet (30 m). It has rugged, grooved bark and glossy, serrate, oblong-lanceolate leaves up to 11 inches (28 cm) in length. Image credit: Willow, Germany / CC BY-SA 3.0. 眼下正是栗子的收获季节,对于栗子的营养价值不用多说,但是您是否知道栗树叶子中含有能够降伏那些是某些抗生素也难以降伏的葡萄球菌 ( staph bacteria, staphylococcus ) 的活性物质。 Schematic of the Staphylococcus aureus accessory gene regulator system. Dr Cassandra Quave of Emory University and co-authors report the quorum sensing inhibitory activity of the chestnut leaf extract against all Staphylococcus aureus accessory gene regulator (agr) alleles. Image credit: Quave CL et al. Fig 2. Isolation scheme. (A) The bioassay-guided fractionation scheme is illustrated, demonstrating the path from raw plant material to isolated, active natural products. ( B) The corresponding HPLC chromatogram for the most active fractions illustrates how fractionation functions to increase the relative levels of active agents. Fig 3. European Chestnut leaf extracts inhibit all four S . aureus agr alleles a non-biocide manner. S . aureus agr reporter strains were treated with extracts 224, 224C, and 224C-F2 at a dose range of 0.05–100 μg mL -1 . Bioactivity guided sequential fractionation resulted in increased quenching of all 4 agr alleles in a manner independent of growth inhibition. Optical density of the culture is represented by solid black symbols; fluorescence in the agr reporters is indicated by the open symbols. The IC 50 and IC 90 for quorum quenching impact of each extract are reported in Table 3 . (A) agr I, AH1677; (B) agr II, AH430; (C) agr III, AH1747; (D) agr IV, AH1872. Fig 4. 224C-F2 blocks MRSA exotoxin production. (A) 224C-F2 demonstrates a dose-dependent effect in inhibition of de-formylated and formylated delta toxin, as illustrated in this HPLC chromatogram. (B) Quantification of delta-toxin confirmed the dose-dependent inhibitory activity of extracts, and the increased activity of the refined fraction 224C-F2 over 224 and 224C. (C) Extracts quench the hemolytic activity of both the S . aureus wild type and Δ hla mutant, demonstrating that in addition to preventing production of α-hemolysin (responsible for the major share of hemolytic activity), that extracts also inhibit PSM production, responsible for the observable hemolytic activity in hla mutant strains. All treated groups are significant in comparison to the vehicle control ( p 0.001). (D) USA300 (Δ spa ) was exposed to increasing doses of 224, 224C, 224C-F2, and vehicle control for 8 hrs. Western blot for α-hemolysin on supernatants demonstrated a dose-dependent decline in protein levels. Significant differences between treatment and vehicle are represented as: *: p 0.05; ‡: p 0.01; †: p 0.001. Fig 6. 224C-F2 attenuates virulence without any detectable resistance after 15 days of drug passaging. Cultures of USA500 isolate NRS385 ( agr group I) were passaged for 15 consecutive days in the presence of 16 μg mL -1 of 224C-F2. (A) The sum total peak area of de-formylated and formylated delta toxin was quantified for the mock vehicle control (DMSO) and treated group. A significant difference (p0.05) was evident for all treatment days. (B) 224C-F2 inhibited delta-toxin production over the length of the passaging experiment in the absence of growth inhibition. Significant differences between treatment and vehicle are represented as: *: p 0.05; ‡: p 0.01; †: p 0.001. Fig 10. Putative structures of ursene and oleanene derivatives found in the most active region of 224C-F2 (retention time of 21–49 min) were determined following MS analysis and database searches. Compounds are listed by Peak number, corresponding to Table 5 . Peak 31 was determined to be C 39 H 59 O 8 or C 38 H 55 O 9 with a relative abundance of 0.34%. Putative structural matches include: ( 31a ) escigenin tetraacetate (6CI); ( 31b ) tetraacetate (7CI, 8CI) 16α, 21α- epoxy-olean- 9(11)—ene- 3β, 22β, 24, 28- tetrol; ( 31c ) tetraacetate aescigenin; ( 31d ) triacetate (8CI) cyclic 16, 22- acetal-olean- 12- ene- 3β, 16α, 21β, 22α, 28- pentol; ( 31e ) triacetate (8CI) cyclic 22, 28- acetal-olean- 12- ene- 3β, 16α, 21β, 22α, 28- pentol. Peak 32 was determined to be C 35 H 59 O 6 with a relative abundance of 0.30%. Putative structural matches include: ( 32a ) stigmastane ( Fig 11 ) and ( 32b ) (3β, 4β, 16α, 21β, 22α) -16, 21, 22, 23, 28- pentamethoxy (9CI) olean- 12- en- 3- ol. Peak 42 was determined to be C 31 H 49 O 6 with a relative abundance of 1.43%. Putative structural matches included ( 42 ) amirinic acid. Peak 52 was determined to be C 32 H 51 O 7 with a relative abundance of 0.48%. Putative structural matches include: ( 52a ) 21-acetate protoescigenin, ( 52b ) 16-acetate protoescigenin, ( 52c ) 22-acetate protoescigenin and ( 52d ) 28-acetate protoescigenin. Peak 55 was determined to be C 30 H 48 O 5 , with a relative abundance of 4.11%. Putative structural matches include: ( 55a ) 16,21-epoxy-(3β,4β,16α,21α,22β)-olean-12-ene-3,22,24,28-tetrol(9CI); ( 55b ) asiatic acid; ( 55c ) arjunolic acid; ( 55d ) isoescigenin. Peak 60 was determined to be C 30 H 48 O 6 , with a relative abundance of 6.80%. Putative structural matches include: ( 60a ) camelliagenin E; ( 60b ) brahmic acid; ( 60c ) sericic acid; ( 60d ) belleric acid; and ( 60e ) 2,3,23,24-tetrahydroxy-(2α,3β)-urs-12-en-28-oicacid. Peak 64 was determined to be C 30 H 45 O 5 , with a relative abundance of 2.91%. The putative structural match is ( 64 ) ouillaic acid. 葡萄 球菌( staph bacteria, staphylococcus )是一群革兰氏 阳性 球菌,因常堆聚成葡萄串状而得名。多数为非 致病菌 ,少数可导致疾病。葡萄球菌是最常见的 化脓性球菌 ,是医院交叉感染的重要来源,菌体直径约 0.8 μm ,小球形,但在 液体培养基 的幼期培养中,常常分散,细菌细胞单独存在。葡萄球菌病主要是由金黄色葡萄球菌引起的家禽的一种急性或慢性传染病,在临床上常表现多种类型,如关节炎、腱鞘炎、脚垫肿、脐炎和葡萄球菌性败血症等,给养禽业造成较大的损失。病原典型的葡萄球菌为圆形或卵圆形,常葡萄状排列,革兰氏染色阳性,无鞭毛,无荚膜,不产生芽胞,在普通培养基上生长良好。葡萄球菌在自然界中分布很广,健康禽类的皮肤、羽毛、眼睑、粘膜、肠道等都有葡萄球菌存在,同时该菌还是家禽孵化、饲养、加工环境中的常在微生物。葡萄球菌可通过多种途径侵入机体,导致皮肤或器官的多种感染,甚至 败血症 。 据物理学家组织网( phys.org ) 2015 年 8 月 21 日 转载来自美国埃默里大学( Emory University )的消息,该大学的研究人员从欧洲栗树叶子中提取出可以解除致命葡萄球菌的活性成分。图 1 就是埃默里大学( Emory University )的民族植物学家卡桑德拉·库维夫( Cassandra Quave ),受到传统民间医学的启发,在意大利收集栗叶。美国埃默里大学和爱荷华大学( University of Iowa )研究人员合作研究发现,欧洲栗树的叶子含有可以解除危险的葡萄球菌的活性成分,但是又不会增加其耐药性。此研究成果 2015 年 8 月 21 日 在《公共科学图书馆 · 综合》( PLoS ONE )网站发表—— Cassandra L. Quave, James T. Lyles, Jeffery S. Kavanaugh, Kate Nelson, Corey P. Parlet, Heidi A. Crosby, Kristopher P. Heilmann, Alexander R. Horswill . Castanea sativa (European Chestnut) Leaf Extracts Rich in Ursene and Oleanene Derivatives Block Staphylococcus aureus Virulence and Pathogenesis without Detectable Resistance . PLoS ONE , published 21 Aug 2015, DOI: 10.1371/journal.pone.0136486. Fig. 1 The research of Emory Universityethnobotanist Cassandra Quave, shown collecting chestnut leaves in Italy , isinspired by traditional folk remedies. Credit: Marco Caputo 《公共科学图书馆 · 综合》( PLoS ONE )网站 2015 年 8 月 21 日 ,发表了的文章报道了研究者对栗叶提取物的研究发现 , 其中富含 ursene 和齐墩果烯( oleanene )衍生物 , 它们可封锁金黄色葡萄球菌毒性( Staphlococcus aureus virulence )和发病机理,而且无可检测的抗药性。 埃默里大学的民族植物学家,也是此项目的领导者卡桑德拉·库维夫,对于栗叶的研究兴趣来源于栗叶在民间传统医学中的应用。她说: “ 我们已经从这种植物中发现了一种系列化合物族 , ,而且这些化合物具有一种有趣的药用机理:并不是杀死金黄色葡萄球菌 , 而是这种植物提取物能够使葡萄球菌解除武装,改邪归正 , 本质上是关闭了 MRSA 产生毒素 , 导致组织损伤的能力。换言之,这种植物提取物已经使金黄色葡萄球菌无力造成危害。 ” 这一发现,无论是对治疗还是预防耐甲氧西林金黄色葡萄球菌( MRSA )感染,以及应对耐药病原体日益严重的问题,都是一种有潜力的新方法。根据美国疾病控制和预防中心提供的数据,仅仅在美国,耐抗生素细菌每年会造成至少 200 万人患病 ,2.3 万人死亡。耐甲氧西林金黄色葡萄球菌感染会导致由轻微的 皮肤过敏 ( skin irritations )发展到死亡。由于 “ 超级细菌( super bug ) ” 进化的菌株,对于医院患者之间构成威胁,而且累及免疫系统,甚至连年轻、健康的运动员以及身体亲密接触的其他人也难免遭殃。 卡桑德拉·库维夫说: “ 我们已经在实验室证明了我们的栗叶提取物,降伏甚至是超剧毒耐甲氧西林金黄色葡萄球菌( hyper-virulent MRSA )菌株,尽管它们能够导致健康运动员严重感染的菌株。与此同时 , 此提取物对于人体皮肤上的正常、健康菌不会造成打扰,使一切恢复平衡。 ” 卡桑德拉·库维夫她研究人和植物的相互作用,这是属于人类植物学的范畴。卡桑德拉·库维夫目前是埃默里大学人类健康研究中心和医学院皮肤病学系的一名教员 (FIG. 2) 。她对人类植物学感兴趣是从她在埃默里大学读本科时就开始的。 Fig. 2 Emory University's Cassandra Quave researches the interactions of people and plants -- a specialtyknown as ethnobotany. Credit: Marco Caputo 多年来 , 卡桑德拉·库维夫和她的同事们一直在研究意大利南部和地中海的其他地区农村居民的传统疗法。她说: “ 我强烈地感到人们之所以摒弃用植物治病的传统医学 , 是因为植物无法灭杀病原体,但是这并非是一个正确的选择。如果这些植物在对付疾病方面与其它药物一样有效,结果还会是这样吗 ?” 数以百计的实地访谈指引她去欧洲寻找栗树(齿栗 Castanea sativa )叶。 “ 当地居民和治疗师一再告诉我们,他们是如何用栗子树的叶子来制作茶饮和洗皮肤治疗 皮肤感染 和炎症的 ,” 卡桑德拉·库维夫说。 就目前的此项研究而言 , 卡桑德拉·库维夫与爱荷华大学( University of Iowa )的微生物学家亚历山大 • 霍斯威尔( Alexander Horswill )合作,而亚历山大 • 霍斯威尔的实验室专注于创建发现药物的工具 , 如在黑暗中可以使金黄色葡萄球菌菌株发光。 研究人员将栗叶浸泡在溶剂中,提取其化学成分。卡桑德拉·库维夫解释道: “ 要将栗树叶提取物中复杂的化学物质混合物分离成小批量含有化学成分较少的成分 , 对其进行测试 , 选择出最具活性的成分进行测试 , 这是一个系统的过程 , 需要在工作台上花费大量的时间。幸亏在埃默里大学读本科期间,就已经做了大量的实验工作,积累了化学分离技术的宝贵经验。 ” 此项研究提取分离产生了 94 种化学物质( Table 5. Mass spectrometry (m/z) analysis of 224C-F2 . The corresponding chromatogram is reported in Fig 9 ; putative structures in Figs 10 and 11 . ) , 其中 ursene 和齐墩果烯( oleanene )剂化合物的活性最强。测试结果表明 , 该提取物具有抑制 葡萄球菌 ( staph bacteria )的群体感应( quorum sensing ) 。所谓群体感应( uorum sensing )是指细菌能自发产生、释放一些特定的 信号分子 ,并能感知其浓度变化,调节微生物的群体行为。细菌群体感应参与包括人类、动植物病原菌致病力在内的多种生物学功能的调节。 有研究已证明细菌之间存在信息交流,许多细菌都能合成并释放一种被称为自诱导物质 (autoinducer, AI) 的 信号分子 ,胞外的 AI 浓度能随细菌密度的增加而增加,达到一个 临界浓度 时, AI 能启动菌体中相关 基因 的表达,调控细菌的生物行为。如产生毒素、形成生物膜、产生抗生素、生成 孢子 、产生荧光等,以适应环境的变化,将这一现象被称为群体感应调节 (quorumsensing , QS) 。这一感应现象只有在细菌密度达到一定 阈值 后才会发生,所以也有人将这一现象称为细胞密度依赖的基因表达控制 (celldensity dependent control of gene expression) 。耐甲氧西林金黄色葡萄球菌( MRSA )使用这种群体感应信号系统制造毒素 , 增加其毒性。 卡桑德拉·库维夫说: “ 我们能够在实验室跟踪其行径 , 展示我们的植物提取物封锁群体感应和完全关闭毒素生产。许多制药公司正致力于开发将单一毒素作为目标的单克隆抗体。这是更令人兴奋的 , 因为我们已经表明 , 用这种栗树叶提取物 , 我们可以关闭整个负责产生各种不同的毒素所有过程。 ” 栗树叶提取物一次剂量是 50 μg, 在实验室用于清理老鼠皮肤损伤处的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌( MRSA ) , 制止组织损伤和血红细胞损伤。此提取物的确不会丧失活性 , 即产生 耐药性 , 甚至连续使用两周后也未见产生耐药性。在实验室培养皿中对人类皮肤细胞的测试结果表明 , 此植物提取物不会损害皮肤细胞 , 或正常的皮肤微生态。 埃默里大学的技术转让办公室已经对这种植物提取物独特性的发现,提出了专利申请。研究人员正在对来自提取物的单个组分进行进一步测试研究,以便确定究竟是单个组分的效果最佳,还是组合成分的效果最佳。 卡桑德拉·库维夫说: “ 现在,我们是用一种混合物进行研究的。但是,这并非我们的最终目标。我们的最终目标是进一步将其提纯分离出简单化合物,使其有资格获得美国食品药品管理局( FDA )认定,可以作为一种治疗试剂。 ” 潜在的用途包括对足球垫或其他运动器材的预防性喷雾 ; 医疗器械和产品的预防涂饰,医疗产品如卫生棉球等。因为卫生棉球往往会为耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的生长提供良好的环境 ; 除此之外,用于治疗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌感染 , 也许可以与抗生素联合使用。 卡桑德拉·库维夫说: “ 乡间老妇的传统疗法很容易被人们忽视 , 只是因为它们不攻击和灭杀病原体。但有很多方法有助于治疗感染 , 在耐药细菌日趋严重的时代,我们需要关注民间古老的传统医学。 ” 更多信息请注意浏览原文。
miR-181a是否能调节 白血病耐药细胞株K562/A02对道诺霉素(又称柔红霉素,daunorubicin)的敏感性,以及这种调节作用的内在机制如何?本研究发现白血病耐药细胞株K562/A02中的miR-181a水平要比白血病细胞株K562中的低。 同时K562转染了miR-181a抑制剂后细胞存活率上升;而K562/A02转染miR-181a类似物之后细胞存活率下降。而且miR-181a可以增强道诺霉素诱导的K562/A02细胞凋亡;而转染了BCL-2 siRNA的K562/A02细胞存活率下降。由此可见, miR-181a在K562/A02细胞的道诺霉素耐药性发展中起到一定的作用,而这种作用可能是通过BCL-2介导实现的。 图例: 白血病细胞株K562及其耐药株K562/02中miR-181a 和BCL2的相关性 miR-181a sensitizes a multidrug-resistant leukemia cell line K562/A02 to daunorubicin by targeting BCL-2 Hao Li, Lulu Hui, and Wenlin Xu Department of Central Laboratory, The Affiliated People's Hospital, Jiangsu University, Zhenjiang, China. The aim of this study was to investigate whether miR-181a could modulate the sensitivity of the leukemia drug-resistant cell line K562/A02 to the chemotherapeutic agent daunorubicin (DNR), and explore the mechanism of miR-181a on the DNR sensitivity of K562/A02 cells. MicroRNA microarray and stem-loop reverse transcription-polymerase chain reaction were used to detect the expression of miR-181a. The 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyl-2H-tetrazolium bromide assay was performed to quantify the effect of miR-181a on K562 cells growth and viability. Apoptotic cells were quantitatively detected using Annexin V/FITC and PI apoptosis detection kit. BCL-2 protein expression was measured by western blot. Luciferase reporter vector with the putative BCL-2 3' untranslated region was constructed to explore whether BCL-2 was a direct target gene of miR-181a. BCL-2 siRNA was transfected into the cell to explore the relationship between BCL-2 and DNR resistance. The miR-181a expression level was lower in the K562/A02 cells than in the K562 cells (P 0.05). K562 cells that were transfected with miR-181a inhibitor had a significantly higher survival than K562 cells, and K562/A02 cells that were transfected with the miR-181a mimic had a significantly lower survival than K562/A02 cells (P 0.05). miR-181a could enhance DNR-induced apoptosis in K562/A02 cells. BCL-2 siRNA transfected K562/A02 cells had decreased survival compared with the K562/A02 control group. In conclusion, miR-181a could play a role in the development of DNR resistance in K562/A02 cells and the over-expression of miR-181a could sensitize K562/A02 cells to DNR by targeting BCL-2. Acta Biochim Biophys Sin (Shanghai). 2012 Mar;44(3):269-77. doi: 10.1093/abbs/gmr128. 全文: http://abbs.oxfordjournals.org/content/44/3/269.full.pdf+html
2011年主题: 抗菌素耐药性:今天不采取行动,明天就无药可用 世界卫生日 World Health Day 4月7日是世界卫生日。每年的这一天, 世界各地 的人们都要举行各种纪念活动,来强调健康对于劳动创造和幸福生活的重要性。 1948年,第一届世界卫生大会要求建立“世界卫生日”以纪念世界卫生组织的诞生。自1950年以来,每年于4月7日庆祝世界卫生日。每年为世界卫生日选定一个主题,突出世卫组织关注的重点领域。 评论:“超级细菌”蔓延敲响公共卫生警钟 世界卫生组织将“控制抗菌素耐药性”作为2011年世界卫生日的主题。抗菌素耐药性这个影响人类健康的问题由来已久,近年来在多个国家发现的“超级细菌”更说明这一问题已日趋严重。曾发表相关报告的英国研究人员在接受记者采访时指出,这敲响了全球公共卫生体系的警钟。 http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2011/4/245826.shtm
Toxicol Lett. 1995 Dec;82-83:83-90. Molecular biology of insecticide resistance. Feyereisen R . Department of Entomology, University of Arizona, Tucson 85721, USA. Abstract The widespread use of insecticides has amounted to a large scale 'experiment' in natural selection of insects by chemicals of toxicological importance to humans. Specific examples in which the molecular basis of insecticide resistance has been studied in detail are presented here. The biochemical/physiological mechanisms of resistance can be categorized as target site insensitivity, increased metabolic detoxification and sequestration or lowered availability of the toxicant. These are achieved at the molecular level by: point mutations in the ion channel portion of a GABA receptor subunit (cyclodiene insecticides); point mutations in the vicinity of the acetylcholinesterase (AChE) active site (organophosphorus and carbamate insecticide resistance); amplification of esterase genes (organophosphorus and carbamate insecticides); mutations linked genetically to a sodium channel gene (DDT and pyrethroid insecticides); and yet uncharacterized mutations leading to the up-regulation of detoxification enzymes, such as cytochrome P450 and glutathione S-transferases (many classes of insecticides). In several cases, the selection of a precisely homologous mutation has been observed in different insect species.
八爪鱼 发表于 2009-11-10 5:01 谁的高潮 喹喏酮是人类制药科学的杰作,符合人类几乎所有的希望:它是人工合成的物质,从未卷入演化的战争;它攻击细菌DNA的拓扑异构酶,这更是人类从未涉足的新地。它回应着人们热切的期望,用一个力挽狂澜的拉风姿势,标志一场新的战争开始了。 和其他的抗菌药一样,它也必须先进入细菌体内,然后才开始向异构酶发难。细菌们的确没遭遇过喹喏酮,但是这种攻击前奏,却再熟悉不过。不出所料,细菌细胞膜上某些特定通道的属性发生了变化、拓扑异构酶的合成数量在增加、针对喹喏酮的外流泵也被陆续生产组装出来、细菌编码异构酶的基因也发生了变异尽管异构酶有好多种,但它们在结构上均发生了不同程度的变化,喹喏酮想与之结合来发挥攻击效能,变得越来越困难。喹喏酮进入细菌的难度在增加、攻击目标越来越多、攻击难度在加大,而且还不断地被外流泵轰出细菌。这些策略按部就班,表现得相当成熟和系统,并且有效。 这些迅速出现的耐药机制其实并未超出人类的预料。但是不久,细菌在喹喏酮类药物上表现出了充满挑衅意味的新耐受策略,着实激起了人类无法掩饰的不安:进一步的研究分离出一种由质粒基因编码的特殊蛋白,这种蛋白的出现不是为了弥补其他系统的损失,而是为了专门针对喹喏酮。它们像保镖一样,常伴拓扑异构酶左右,防止喹喏酮靠近。 虽然这场战争还在继续,虽然这种保镖蛋白在耐受喹喏酮的过程里尚未发挥多么显著的功效,但这种蛋白的作用机制,不仅弥漫着-内酰胺酶特有的味道,并且的的确确是在菌城中新诞生的御敌方式。这让人们的幻想化为泡影。也许耐受磺胺的过程的确只是对已有策略的一种运用,但是发生在喹喏酮上的一切,向我们清楚地证明菌城里没有我们一厢情愿想象出的极限。漫长的历史赋予它们的,不仅是十八般武艺的应对方略,更是可衍生出各种耐药机制的顽强生命力。 而让我们更为沮丧的是,尽管无数次强调只有严格合理使用抗菌药物才能保住我们在菌城之战中仅有的一点先机,喹喏酮的滥用和误用却更加迅速的恶化着饱受折磨之后,人们以更彻底的方式伤害自己。最近一项针对急诊过程中的喹喏酮药物使用研究发现,所研究的一百例医案中,仅仅只有一例严格遵循了药物使用准则。虽然这个研究还不够普适,但也足以证明人类对自我控制的期待曾被解读为征服菌城的信心支柱并没有什么坚实的基础。耐喹喏酮菌株如约出现,在我们的怂恿下迅速泛滥。这一切自喹喏酮从20世纪60年代问世至今,不过数十年。这场战争当然还未结束,人们已经从四周的阴云里嗅到了熟悉的失败的气息。 种种的耐药危机围绕着喹喏酮。不管药学家们是最后还是最先绝望的一群人,他们仍在努力研究,不断改良这种承载了新世纪希望的抗菌药物。其实这种坚持已经和人类推崇的自我约束、理性坚韧等等高尚的价值无关。只不过我们退无可退,我们已无力承受失去喹喏酮的后果,尽管喹喏酮的未来,已经在磺胺的故事里依稀可见。 那出随着青霉素的登台渐渐被人遗忘的闹剧,现在被慢慢地回忆了起来。那时,虽然正在失去磺胺,但是青霉素奇迹掩盖了我们所有的过失。人们从未意识到磺胺的狼狈收场其实是在展示细菌世界的秘密以及我们轻浅的身影。没人再去探究我们在故事里疯疯癫癫的表现,是源于对疾病以及死亡无法抑制的恐惧,还是单纯由于我们的稚嫩和无知;也没有人细想我们的这些弱点充当了故事的前言,还是作为背景自始自终若隐若现。反正我们知道了那时不经意间翻过的一页上,记录着的是时间赐予菌城的延绵不绝的生命力,以及在这个漫长又短暂故事里人类自己的轮廓。 当菌城的力量再一次在喹喏酮的战争中示形,已经没有新的奇迹供人类挥霍,我们不得不再次直面内外交困的窘迫境地。 在菌城几十亿年的历史中,噬菌体、病毒以及各种各样新生物的出现,都曾带去巨大的危机,但也许直到最近的这半个世纪,细菌的世界才真正地面临巨大的考验。如果说在此之前的任何一次危机,都是来自其他物种 以及细菌群体内部的血肉之躯,这次来自人类的攻击则截然不同。在这场斗争中,菌城倾尽数十亿年历史的结晶与之角力的,是人类文明的力量。当我们依赖科技在菌城内寻找可乘之机,它们早已开始利用我们本性的弱点。 一直以来,人类凭借智力努力将自己从蛋白的世界分离出去,想要开拓一条全新的演化方向。这个选择是否能帮助人类真正离开自然的怀抱获得最终的自由,还未可知。细菌是我们在这条道路上必须面对的障碍之一。人们原本以为,喹喏酮寄托着人类新世纪抵抗细菌的希望,很可能是细菌从未遭遇过的强劲对手,甚至可能是最后一个敌手。可是短短几十年,细菌世界里蓬勃涌动着的生命力,在应对喹喏酮的新战场上变得越来越清晰,越来越不可回避。这对一心征服继而远离自然的人类来说固然是巨大的失落,从更现实的角度来看,既然如此,菌城的重新崛起似乎就是必然。这暗示我们虽然在自己选择的远离自然的道路上已经狂奔了几百年,不能征服自己,人类最终依然只会在自然的掌心徘徊。喹喏酮的出现,的确伴随着高潮,只不过,这高潮并不属于我们。 人类针对耐药性的研究还在继续着,我们对细菌的秘密理解得越来越透彻。科学家们做出无数种努力以图改变当前的局面:制定越来越细致严格的抗菌药物使用准则,希望延续目前尚有临床效能的药物的生命;开发出大量的新药,希望破坏细菌耐药力量的根源,让已经临床死亡的抗菌药物重新焕发生机;探索细菌新的弱点,以获得新的制药灵感。可是这一切好像都晚了。在泛滥的耐药性环境下,这些挣扎变得越来越无力:世界范围内,药物的滥用不仅继续而且还在恶化;包括舒巴坦在内的能破坏-内酰胺酶的新药陆续问世,可细菌很快又产生出在这个层面上的耐受;至于全新药物的灵感人们发现新药的问世一般需要十年,而耐药性的产生只需要两三年。 这让我们忍不住幻想时光能倒流,回到磺胺故事的开端。我们若从一开始就读懂磺胺的寓言,及早制定各种预防和挽救措施,即使磺胺的失去不可避免,也许发生在磺胺身上的故事就不会在所有其他的药物身上重现,所有之后出现的抗菌药物也都不会被细菌耐药的魔力浸染。 我们黯然回想磺胺的故事:它在青霉素问世前匆忙地出现,展示出神奇的抗菌效力,以及各种复杂的毒副作用,最后在细菌的世界里激发出几乎所有种类的耐药机制。而不管耐磺胺菌能获得多大程度的耐药能力,它们对任何一种其他的抗菌药都仍然敏感。还有这一切背后,我们忙碌而软弱的身影。 这个故事里每个片段都曾喧闹杂乱。如今我们回头看,才发现那些细节正汇聚成一条安静清晰的长流,漂浮着全部的秘密。这个寓言传递的是一个何等明确的信号,可惜一切都已经错过了。 昂明月而太息兮,步列星而极明。 现在,老故事再次上演,而且愈演愈烈。新世纪里,这个世界缓慢而决绝地变回旧样子。很多研究者们认为,尽管人类付出了巨大的努力,但当前几乎任何一种抗菌药物至少已有一种细菌对其耐药,这个趋势还在进一步恶化。这样的局面使得我们无法直面何以错过了磺胺的信息,最终让耐药性泛滥如斯。可能是因为磺胺出现得太晚;也可能是随后一切抗菌药物出现得太早;或者是这个世界风驰电掣地变化,我们根本无暇细读磺胺的寓言。 也许只是因为对于我们这些智珠在握的两足动物而言,寓言的声音太轻微。 The Tetons-Snake River By Ansel Adams (终于完) 本文在odette、桔子、seren、猛犸、白鸟老师等诸位松鼠帮助下完成。非常非常感谢。 建议阅读: 1Sulfonamides and Trimethoprim Chapter 23by Ola Skld 2Evolutionary Biology of Drug ResistanceChapter 2 by Fernando Baquero and Rafael Cantn 3Sulfonamide resistance:mechanisms and trends by Ola Skld 4Resistance to sulphadrug-based antifolate therapy in malaria:are we looking in the right place? By J. J. Platteeuw 5Folic acid antagonism of sulfa drug treatments by Ann M. Bayly and Ian G. Macreadie 6BACTERIAL RESISTANCE TO ANTIFOLATE CHEMOTHERAPEUTIC AGENTS MEDIATED BY PLASMIDS by J T SMITH BPharm 7Surveillance and epidemiology of MRSA bacteraemia in the UKby Alan P. Johnson, Andrew Pearson and Georgia Duckworth 8Involvement of the Leucine Response Transcription Factor LeuO in Regulation of the Genes for Sulfa Drug Efflux by Tomohiro Shimada, Kaneyoshi Yamamoto, and Akira Ishihama 9Multidrug Efflux Pumps and Antimicrobial Resistance in Pseudomonas aeruginosa and Related Organisms by Keith Poole 10 Acquisition and synthesis of folates by obligate intracellular bacteria of the genus chlamydi a by Fan, H 11 Fluoroquinolone Utilization in the Emergency Departments of Academic Medical Centers Prevalence of, and Risk Factors for, Inappropriate Use by Ebbing Lautenbach, MD, MPH; Lori A. Larosa, PharmD; Nishaminy Kasbekar, PharmD; Helen P. Peng, PharmD; Richard J. Maniglia, MD 12 Basic and clinical pharmacology 10th edition 13 Dictionary of Biochemistry and Molecular Biology 2nd Ed By J. Stensen 14 Introductory clinical pharmacology 7th Ed 15 The Desk Encyclopedia of Microbiology edited by Moselio Schaechter 16 药理学 人民卫生出版社 杨世杰 主编 17 医学微生物学 人民卫生出版社 周正任 主编 18 包括维基百科在内的各网站 文中图片均来自互联网,著作权属于这些图片的作者们。如果你们希望撤除,请通知我。 谢绝转载,本文只代表八爪鱼个人观点。