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人造生命,路还很远
songshuhui 2010-6-6 23:57
拟南芥 发表于 2010-06-06 12:53 作者/拟南芥 桔子 其实这篇文章是松鼠会资讯频道 一则新闻 的扩展。 5月20日,著名分子生物学家文特尔(Craig Venter)的团队在《科学》上发表了他的实验室在合成基因组方面的最新结果,这个成果很快被媒体解读为人造生命。 文特尔的实验室首先合成了蕈状支原体(Mycoplasma mycoides)的基因组。蕈状支原体是一种很小的原核生物,但是它的基因组也包含了超过100万个碱基对。随后,研究人员成功地把合成的蕈状支原体基因组移植到另外一类细菌山羊支原体中(Mycoplasma capricolum),并让新的基因组取代了宿主细胞原有的基因组。新的细胞包含了蕈状支原体的基因以及山羊支原体的细胞膜和细胞质。在新细胞分裂以后,山羊支原体的特征消失了,细胞只能合成蕈状支原体的蛋白质。 这项研究可以分为两个部分,一是合成基因组,二是把合成的基因组转入异种细胞,并让其完全取代细胞中原有的基因。 公众或许更加熟悉 基因组测序,如今,科学家已经通过这个方法陆续绘制了人类以及很多其他物种的基因组图谱。合成基因组和基因组测序正好相反,就是将已知序列的DNA片段用人工的方法合成出来。2002年,纽约州立大学石溪分校的生物学家成功地合成了脊髓灰质炎病毒的基因组。脊髓灰质炎病毒只含有约7500个碱基对,细菌的基因组就要大多了。这次凡特合成的基因组大概是脊髓灰质炎病毒的130倍。这次文特尔实验室采取的策略是,先合成与脊髓灰质炎病毒基因组大小相仿的DNA片段,然后利用酵母细胞把小DNA片段分步组装,直到装出整个基因组。 相比合成基因这个步骤,让新基因组取代宿主细胞的原基因组难度更大。这不仅意味着要把新基因组装入宿主细胞,还要让细胞自己的基因组消失。通过酵母组装的基因组转到山羊支原体内会遇到什么难处呢?山羊支原体属于原核细胞,而酵母则属于另一种类真核细胞。天然情况下,原核细胞有一种自我保护机制,它们给自己的DNA穿上一件衣服。外来的敌人,比如病毒的DNA没有这件外衣,因此一旦进入原核细胞很快就会被发现,然后被细胞消灭。问题在于,科学家通过酵母组装的新基因组没有穿上原核细胞能够识别的外衣,一旦进入寄主细胞内,就会被降解消灭。所以科学家在将新合成的DNA分离出来以后,给它们人工穿上衣服,并用遗传学的方法去除宿主细胞对DNA的识别保护机制,它的原基因组就会被新基因组设法分解消灭掉。 为了检测新合成的基因组被成功地转入宿主细胞,科学家还在其中设计了4个水印作为标记,其中一个水印包括了全部作者的姓名。 或许你会问,疯狂科学家们为什么要干预自然生命呢?其实,科学家们做这样的工作有着很现实的目的。首先,这一技术促进了生物学研究,通过改变合成的基因组,可以研究基因对应的生物功能。其次,科学家可以更方便地构建新的遗传环路,提供了从头合成基因的可能。在工业上,合成生物有多种应用,包括更快地生产病毒疫苗,以及将■CO2转变为石油等等。 在一些媒体的宣传中,这项研究被称为人工创造了新的生命。这种说法并不准确。研究人员仅仅是合成了细菌的基因组,而细菌中所有的其它部分都是天然的。而且,合成基因组也是照着天然存在的基因组做出来的。当然,科学家会在未来对合成的基因组进行修饰,这样就能获得一些具有新的性状的细胞,如同育种家们培养出了优良性状的作物一样。但是希望通过这种技术创造出全新形式的生命并不现实,制造出诸如弗兰肯斯坦般的怪物更是天方夜谭。 文特尔和他的合作者的研究虽然轰动,却并不突兀。这项研究以无数前人的工作为基础,并且还有很多问题留待解决。比如,如何通过改变基因组获得能够被预测的性状?这不仅需要技术上的突破,还需要对生命的基本规律有更深的了解。科学家们还有很长的路要走。 文字编辑:拇姬 删改版已发表于:新京报《新知周刊》
个人分类: 生物|2336 次阅读|0 个评论
[转载]“人造生命”诞生了吗?
Fangjinqin 2010-6-4 18:35
人造生命诞生了吗? 方舟子 美国科学家创造出了史上第一个人造生命!这是近日很吸引眼球的一条 大新闻。领导这项研究的克雷格文特本人的说法是:这是第一个人造细胞, 是地球上第一个父母是计算机,却可以自我复制的物种。 在媒体上推波助澜的还有一些人文学者。他们有的对此推崇备至。例如美国 一位著名生物伦理学家声称这个成就结束了有关生命的存在是否需要特殊的力的 争论,是人类历史上最重要的科学成就之一,可与伽利略、哥白尼、达尔文和爱 因斯坦的发现媲美。有的则忧心忡忡地说,这项新技术有危险,要保护人类健康 和环境免受其害,应立即停止研究。奥巴马总统也紧急下令其生物伦理委员会 评估这项研究的风险。 与此形成鲜明对照的是生物学家们的相对冷淡。接受媒体采访的生物学家大 多认为这只是技术上的进步,而不是科学上的突破。有一位著名美国生物学家干 脆说这是炒作。文特是美国生物技术业的一个怪才,在许多方面更像一个商 人而不是科学家,非常自恋,自恋到用自己的名字命名自己创办的研究所,也善 于推销,炒作正是其特长。 我们先来看看这项研究究竟是怎么回事。文特等人要创造的是一种最简单的 细菌蕈状支原体。它的基因组(一个细胞内的全部基因称为基因组)的序列 已经被全部测出来了。生物的基因是由4种核苷酸(类似于4种字母)按不同的排 列组合而成的,它们的排列顺序就携带了遗传信息。蕈状支原体的基因组大约由 108万个核苷酸按特定的顺序组成。在遗传时,基因组要复制自己,以原有的基 因组为模板,用单个的核苷酸做原料,合成新的基因组。 文特等人的计划,就是想按照这种细菌的基因组序列,用化学方法把核苷酸 一个一个连接起来组成基因组。不过,按现在的合成技术,要一口气合成含有108万 个核苷酸的序列是做不到的,所以他们首先要化整为零,把基因组序列分成一千 多个片段,每个片段含1000个核苷酸,分别合成(其实是从另一家公司订购的)。 然后把这些片段放进酵母菌中,由酵母菌把它们组合成完整的细菌基因组。再把 基因组从酵母菌中提取出来,放进一种和蕈状支原体很接近的细菌山羊支原 体中。蕈状支原体基因组利用山羊支原体的蛋白质、细胞器等复制自己,形成了 新的蕈状支原体。 可见文特等人靠人工合成(指用化学方法)的只有基因组部分,就连这部分 的合成也还要借助酵母菌的生物合成,不过把这个细节忽略好了。但是基因组自 身是没法复制和制造新细胞的,还必须有蛋白质和其他生物分子和它一起工作, 还要有细胞质、细胞膜形成的合适环境,所有这一切一开始都不是人工合成的, 全都是现成的。所以这根本不是人造生命、人造细胞,其父母也不只是计算机,至 少山羊支原体也是其父母之一。 这也不是什么新物种。人工合成的基因组序列是根据蕈状支原体基因组复制 的,几乎完全相同(除了少量无关紧要的增减和突变),制造出的细胞也是 蕈状支原体,不是自然界没有的东西,其新颖程度还比不上用遗传工程方法创造 出来的新菌株。 如果不仅基因组是人工合成的,细胞的其他部分也都是人工合成的,那才算 得上是人造细胞。但是这一天仍然遥遥无期,因为细胞的组成极其复杂。例如, 对细胞中的蛋白质种类、功能和相互作用我们还所知甚少,更不要说把它们全都 一一合成出来了。其实,即使是对基因组蕴含的遗传信息,我们也所知甚少。如 果把细胞比作一台机器,基因组就是它的设计图。文特等人所做的,就是拿了一 张设计图做底本,然后一笔一划地把它照抄了一遍,对这张设计图的具体内容, 则不甚了然。不能说照葫芦画瓢地抄了一张设计图,就相当于制造出了机器。 那么这么做有什么意义呢?只是证明了他们有技术能力能把设计图抄得很 完整,而且抄得足够准确,内容基本无误,所以能被细胞识别、复制。细胞对基 因组的复制其实也是在抄,只不过抄的方法有所不同。细胞的抄法称为生物合成, 利用酶等生物大分子作为工具。而文特等人的抄法属于化学合成。 生物伦理学家认为文特等人的研究证明了化学合成的遗传物质和生物合成的 没有区别,生命活动不需要特殊的活力,所以欢呼这项成果极为重大。但是 这一点不需要文特等人来证明。活力论早在生物学界就没有了市场,生物学 家早就确信,只要只要两个分子的化学结构相同,不管用什么方法合成,其性质 就不会有任何区别。自从上个世纪70年代以来,生物学家已在遗传工程、分子克 隆实验中大量地用到化学合成的遗传物质,从不觉得用它们来取代生物合成的遗 传物质会有什么奇怪。如果化学合成的取代不了生物合成的,那必定是由于二者 的化学结构还存在差异,而不是由于后者存在特殊的活力。 人造细胞的支持者声称这项技术有广阔的前景,将来能够用于制造生 物燃料、疫苗等。但是用遗传工程的办法现在就都能实现这些作用,而且可以 更方便、更便宜地实现。所谓的人造细胞技术也没有出现新的或更大的风险。 反对者所担心的那些风险,遗传工程同样有,并不新鲜。 2010.5.30 (《中国青年报》2010.6.2) (XYS20100603)
个人分类: 科学论坛|2357 次阅读|2 个评论
人造生命系统养成器的组成性能的推测
biozhang 2010-6-1 11:16
张星元: 人造生命系统养成器 的组成性能的推测 大众媒体报道给我们留下的印象是: 人造细菌=细菌外壳+人工合成的天然基因组副本 这两者加在一起,就会形成生命系统了吗?我不信。 生命系统需要 代谢能的支撑 ,生命系统必须具备不断更新的 代谢网络 ,生命系统必须具备 细胞经济 智囊团,才能生存和参与竞争。因此所谓细菌外壳至少应该包括复制和转录人工合成的天然基因组的起始点、引导物和催化剂,以及已经存在的天然的主动输送机构;人工合成的天然基因组副本不但应该包括目标生命系统的蓝图还应该包括细胞经济智囊团的数据。这样,才能走出代谢网络合成的第一步,进而开始自主的生命活动。而所有这些都是有条件的,需要时间和空间的。
个人分类: 科学网上晒一晒|3753 次阅读|0 个评论
人造生命系统养成器(一个新物种)
热度 1 biozhang 2010-6-1 06:42
张星元:人造生命系统养成器(一个新物种) 今天清早读到一篇文章:人造单细胞细菌诞生是人造生命还是修改生命?很有意思。建议网上的生物学家好好读一读,网址是:http://nf.nfdaily.cn/ndzk/content/2010-05/31/content_12398489.htm 文特自己把这个所谓的人造生命称之为地球上第一个电脑制造的具备自我复制能力的物种,我认为有一定道理。我想还可以把它称为人造生命系统养成器。 生命现象,如新陈代谢、生长和繁殖等等,只能在处于空间与时间并表现为不同复杂程度的结构的天然物体中找到;我们称这些天然物体为有机体。每个有机体代表一个系统。细菌细胞是自然物体,是 有机体 ,是系统,是生命的基本单位。文特的团队把一个真正的生命系统(细菌细胞)改造成了人造生命系统养成器,一个新物种。 欢迎进一步阅读 人造生命系统养成器的组成性能的推测
个人分类: 科学网上晒一晒|5514 次阅读|2 个评论
“人造生命”成功的迷惑
xu782219 2010-5-30 16:12
人造生命成功的迷惑 9 天前, 2010 年 5 月 20 日 美国《科学》杂志报告说,美国 J 克雷格文特尔研究所的研究人员人工合成了一种名为蕈状支原体的细菌的脱氧核糖核酸( DNA ),并将其植入另一个内部被掏空的、名为山羊支原体的细菌体内,获得新生命,并在实验室培养皿中繁殖。这是第一个完全由人造基因指令控制的细胞。 领导研究的克雷格文特尔说:这是第一个人造细胞,这是地球上第一个父母是电脑、却可以自我复制的物种。 美国宾夕法尼亚生物伦理学家阿瑟卡普兰在《自然》杂志上评论说,文特尔的成果终止了有关生命的存在是否需要特殊力量或能量的争论。在我看来,这使它成为人类历史上最重要的科研成果。 文特尔首次合成单细胞生物的实验,说明生命是可以被造出来的,而且他们是人类首次合成生命者。既然生命可以被造出来,又可以肯定地说以前的生命不是被人类造出来的,那么,最初的生命是哪来的?如果也是被造出来的,是谁造的?
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此“人造”非人造
宋建国 2010-5-29 18:15
《自然》邀专家评价人造生命诞生 八位不同专业领域专家分别发表了自己的看法 美国生物学家 Craig Venter 在实验室中制造出世界首个人造细胞,他将一段人工合成的基因组进行重塑和修饰后,植入另一种无 DNA 的细菌壳中,从而人工制造了一种具有自我复制功能的支原体丝状菌。《自然》杂志邀请了八位不同专业领域的专家,就人造细胞对其各自领域的影响和意义给出自己的评价和意见。 。 这个词如果是出于 《 自然 》 杂志编辑甚至专家们之口,不是出于浮躁浮浅,便是出于制造轰动效应的目的,完全是炒作。这种实验结果根本就不能叫做人造生命或人造细菌,只能叫做人工改造(杂交)的生命,或人工改造的细菌。同样的道理,通过自然的或部分人工的过程(如人工受精,试管胚胎)而完成的驴马杂交生下骡子,我们能说骡子是人造生命吗?类似的例子还有转基因动植物。事实上,人类远远还没有获得制造最简单的生命形式(如细菌)的能力。
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科学网对待“人造生命”的文章过于蔑视
chemicalbond 2010-5-25 11:19
近日,科学网很多文章讨论Craig Venter's 等人的人造生命。遗憾的是,几乎所有的文章的侧重点都是对此不屑一顾,认为相关新闻报道过于夸张。 虽然我对其中的实验细节是个门外汉,但是多年从事科研的实践还是养成了一点点嗅觉。个人觉得那个实验具有很多潜在的价值。不管那个实验象某些人描写的多么低级,它最少在某种程度上实现了人工调控。这一点可能是开创性的。以后的工作大概就是不断地完善了。 科学史上这种相似的例子应该很多。比如,最早的把无机物合成有机物,人工合成有生物活性的胰岛素,人工合成高分子材料。近年来也有人根据计算机模型设计出全新的具有特殊功能的蛋白质,如抗体。其它的热门课题还有化学上的人工控制化学键的断裂,物理上的人工控制核聚变,等等。 和认识自然相比,改造自然的难度更大,但是更有实际意义。 参考 http://www.nature.com/news/2010/100519/full/news.2010.253.html
个人分类: 学术与争鸣|3219 次阅读|4 个评论
人造生命:人类的不祥之兆
大毛忽洞 2010-5-25 08:28
人造生命:人类的不祥之兆 现在媒体上说的人造生命, 应该不是男人和女人配合造出来的生命。 如果人真的能造生命, 这可不是个好兆头。 如果真的能造生命, 例如, 把一个没有生命的东西赋予了生命, 接下来的事就是修改有生命的东西。 后果是未来世界充满了老不死, 老不死会破坏人类有史以来最大的公平法则: 人必有一死: 以死谢天,以死谢地,以死谢后代! 虽然这个世界还很不公平, 但是毕竟人人都要死去, 就这一点还是公平的。 假如人能造生命, 就必然会修改生命, 后果是造成那些老不死无限期地老而不死, 这对人类来说是太恐怖了! 假如秦始皇还活着, 假如汉武帝还活着, 假如唐太宗还活着, 假如赵匡胤还活着, 假如朱元璋还活着, 这太恐怖了 比尔 盖茨用了几十年的时间才搞明白: 【盖茨的话】 【发展中国家里有无数的人们生活在无法形容的贫穷和疾病之中。我花了几十年才明白了这些事情。每年有数百万的儿童死于那些在美国早已不成问题的疾病。麻疹、疟疾、肺炎、乙型肝炎、黄热病、还有一种以前我从未听说过的轮状病毒,这些疾病每年导致 50 万儿童死亡,但是在美国一例死亡病例也没有。 我们被震惊了。我们想,如果几百万儿童正在死亡线上挣扎,而且他们是可以被挽救的,那么世界理应将用药物拯救他们作为头等大事。但是事实并非如此。那些价格还不到一美元的救命的药剂,并没有送到他们的手中。 我们问: 这个世界怎么可以眼睁睁看着这些孩子死去? 答案很简单,也很令人难堪。在市场经济中,拯救儿童是一项没有利润的工作,政府也不会提供补助。这些儿童之所以会死亡,是因为他们的父母在经济上没有实力,在政治上没有能力发出声音。】 如果能用人造生命技术去修改已有生命实现长生不老,他们就会去追求自己的长生不老,而不管更多的儿童的死活。
个人分类: 以前和现在|3438 次阅读|3 个评论
克莱格·文特尔的“人造生命”与学术成就
xupeiyang 2010-5-25 07:20
主要研究成果与论著被引用情况: http://scholar.google.com/scholar?hl=enq=VenterbtnG=Searchas_sdt=2000as_ylo=as_vis=0 The sequence of the human genome stanford.edu A Sprague, T Stockwell, R Turner, E Venter , M Wang, M - science, 2001 - sciencemag.org Note to users. If you're seeing this message, it means that your browser cannot find this page's style/presentation instructions -- or possibly that you are using a browser that does not support current Web standards. Find out more about why this message is appearing, and what ... Cited by 7651 - Related articles - BL Direct - All 36 versions The genome sequence of Drosophila melanogaster fullerton.edu , R Svirskas, C Tector, R Turner, E Venter , AH Wang, X - Science, 2000 - sciencemag.org Note to users. If you're seeing this message, it means that your browser cannot find this page's style/presentation instructions -- or possibly that you are using a browser that does not support current Web standards. 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(io) Patent No.: US 6,797,466 Bl (45) Date of Patent: Sep. 28,2004 (54) COMPLETE GENOME SEQUENCE OF THE METHANOGENIC ARCHAEON, METHANOCOCCUS JANNASCHII (75) Inventors: Carol J. Bult, Bar Harbor, ... Cited by 2014 - Related articles - BL Direct - All 16 versions Genome sequence of the human malaria parasite Plasmodium falciparum Subramanian, C Mungall, JC Venter , DJ Carucci, SL - Nature, 2002 - nature.com The parasite Plasmodium falciparum is responsible for hundreds of millions of cases of malaria, and kills more than one million African children annually. Here we report an analysis of the genome sequence of P. falciparum clone 3D7. The 23-megabase nuclear genome ... 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Likewise, we lack precise knowledge about the real straining (and aggregation or agglutination) capacity of oikopleurid food-concentrating filters12. But even a very ... Cited by 658 - Related articles - All 7 versions Complete genome sequence of Neisseria meningitidis serogroup B strain MC58 Smith, CM Fraser, ER Moxon, R Rappuoli, JC Venter - Science, 2000 - sciencemag.org The 2,272,351-base pair genome of Neisseria meningitidis strain MC58 (serogroup B), a causative agent of meningitis and septicemia, contains 2158 predicted coding regions, 1158 (53.7%) of which were assigned a biological role. Three major islands of horizontal DNA transfer ... Cited by 719 - Related articles - BL Direct - All 7 versions JOURNAL Submitted (SEP-1996) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. MEDLINE PUBMED RP REVISIONS. COMMENT ualberta.ca , KV Small, CM Fraser, HO Smith, JC Venter , - , 1995 - wishart.biology.ualberta.ca ... 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Permission to republish or repurpose articles or portions of articles Cited by 493 - Related articles - All 23 versions Multifactorial analysis of differences between sporadic breast cancers and cancers involving BRCA1 and BRCA2 mutations oxfordjournals.org , LM Farid, D Venter , A Antoniou, A - JNCI Journal of the , 1998 - jnci.oxfordjournals.org Background: We have previously demonstrated that breast cancers associated with inherited BRCA1 and BRCA2 gene mutations differ from each other in their histopathologic appearances and that each of these types differs from breast cancers in patients unselected for family ... Cited by 385 - Related articles - BL Direct - All 8 versions Chromosome 2 sequence of the human malaria parasite Plasmodium falciparum O White, HO Smith, CM Fraser, MD Adams, JC Venter - Science, 1998 - scienceonline.org MJ Gardner, H. Tettelin, LM Cummings, S. Shallom, T. Mason, K. Yu, C. Fujii, J. Pederson, K. Shen, L. Zhou, GG Sutton, R. Clayton, O. White, HO Smith, CM Fraser, MD Adams, JC Venter , The Institute for Genomic Research, 9712 Medical Center Drive, Rockville, MD ... Cited by 390 - Related articles - BL Direct - All 7 versions Rapid cDNA sequencing (expressed sequence tags) from a directionally cloned human infant brain cDNA library , MB Soares, AR Kerlavage, C Fields, JC Venter - Nature genetics, 1993 - nature.com A human infant brain cDNA library, made specifically for production of expressed sequence tags (ESTs) was evaluated by partial sequencing of over 1,600 clones. Advantages of this library, constructed for EST sequencing, include the use of directional cloning, size selection, ... Cited by 337 - Related articles - All 2 versions Isolation of a candidate human telomerase catalytic subunit gene, which reveals complex splicing patterns in different cell types oxfordjournals.org , GR Hime, DJ Venter , PK Keese, EL - Human molecular , 1997 - Oxford Univ Press ... subunit gene, which reveals complex splicing patterns in different cell types Andrzej Kilian* , David DL Bowtell 1 , Helen E. Abud 1 , Gary R. Hime 1 , Deon J. Venter 1 , Paul K. Keese 2 , Emma L. Duncan 3 , Roger R. Reddel 3 and Richard A. Jefferson ... Cited by 427 - Related articles - BL Direct - All 19 versions The diploid genome sequence of an individual human plosjournals.org Frazier, SW Scherer, RL Strausberg, JC Venter - PLoS , 2007 - biology.plosjournals.org Presented here is a genome sequence of an individual human. It was produced from ~32 million random DNA fragments, sequenced by Sanger dideoxy technology and assembled into 4,528 scaffolds, comprising 2,810 million bases (Mb) of contiguous sequence with ... Cited by 440 - Related articles - Cached - All 46 versions Genome sequence and comparative analysis of the model rodent malaria parasite Plasmodium yoelii yoelii , OR White, SL Salzberg, JC Venter , CM Fraser, SL - Nature, 2002 - nature.com Species of malaria parasite that infect rodents have long been used as models for malaria disease research. Here we report the whole-genome shotgun sequence of one species, Plasmodium yoelii yoelii, and comparative studies with the genome of the human malaria parasite ... Cited by 406 - Related articles - BL Direct - All 11 versions http://news.bbc.co.uk/2/hi/science_and_environment/10138849.stm 'Artificial life' breakthrough announced by scientists Page last updated at 13:58 GMT, Friday, 21 May 2010 14:58 UK E-mail this to a friend document.write(' Printable version '); Printable version News QA Ethics Profile Craig Venter is one of science's more colourful characters Maverick is a word that seems to follow Craig Venter around. The biologist and entrepreneur turned the effort to map the human genome into a competitive race and, in so doing, was vilified by the scientific community. Dr Venter has certainly not gained a reputation for modesty about his achievements. Is my science of a level consistent with other people who have gotten the Nobel? Yes, he was once quoted as saying. And he is a very wealthy user of Lear Jets and private yachts. But his efforts in the field of human genomics have undeniably helped speed up the entire process. After the publication of the human genome, Dr Venter turned his attention to another grand project: the creation of a synthetic life form. Scientists at the US-based J Craig Venter Institute have been busily working on the endeavour for more than a decade. They have now published details of the result, an organism called Synthia, in the prestigious journal Science. Born in 1946, as a boy, Dr Venter did not exemplify good scholarship and at 18 he chose to devote his life to the surfing pleasures of the beaches in Southern California. Three years later, in 1967, he was drafted into the Vietnam conflict. As an orderly in the naval field hospital at Da Nang, he tended to thousands of soldiers wounded during the Tet offensive. This inspired two important changes in him: a determination to become a doctor and a conviction that time should never be wasted. Life was so cheap in Vietnam. That is where my sense of urgency comes from, he said. Need for speed During his medical training he excelled in research rather than practice. By the 1980s, the early days of the revolution in molecular biology, he was working at the government-funded US National Institute of Health and soon realised the importance of decoding genes. Dr Venter says the synthetic cell could spark an industrial revolution But the work was messy, tedious and agonisingly slow. So, in 1987, when he read reports of an automated decoding machine, he soon had the first one in his lab. This speeded things up - but not enough. Then came Dr Venter's real breakthrough. He realised that he did not need to trawl the entire genome to find the active parts, because cells already use those parts naturally. He switched his attention from the DNA blueprint to the messenger molecules (called RNA) that a cell makes from that blueprint. He was then able to churn out gene sequences at unprecedented rates. His success shocked some, most notably the co-discoverer of DNA, James Watson, who famously dismissed the relatively crude results obtained as work any monkey could do. The criticism, and the failure to secure further public research funding, prompted Dr Venter to leave the NIH in 1992 and set up a private research institute, The Institute for Genomic Research. And, in 1995, he again stunned the scientific establishment by unveiling the first, complete genome of a free-living organism, Haemophilus influenzae, a major cause of childhood ear infections and meningitis. His greatest challenge to the establishment came in May 1998, when he announced the formation of a commercial company, Celera Genomics, to crack the entire human genetic code in just three years. At that point, the public project was three years into a 10-year programme. Industrial revolution? Both efforts published their results in 2001. What some saw as Dr Venter's disregard for scientific conventions such as open access to data brought him opprobrium in some circles. Nevertheless, the financial rewards were enough to leave him in a highly unusual position for a scientist - with enough money and resources to do the science he wanted without having to tap the usual bureaucratic sources for funding and infrastructure. In 2006, he formed the J Craig Venter Institute which would spearhead the labour to create the world's first synthetic life form. Dr Venter kept the scientific journals and the media abreast of developments, trumpeting several key advances as he edged closer to his goal. Dr Craig Venter says yeast, chemicals, and computers were used by scientists But he has pursued other projects in the meantime. Dr Venter has roamed the oceans in his yacht, Sorcerer II, collecting life forms in an unprecedented genetic treasure hunt. The project aims to sequence genomes from the vast range of microbes living in the sea, to provide scientists with a better understanding of the evolution and function of genes and proteins. The synthetic life breakthrough, when it was announced, was not without controversy. But Dr Venter will have come to expect that. I think they're going to potentially create a new industrial revolution, he said of the synthetic microbes. If we can really get cells to do the production that we want, they could help wean us off oil and reverse some of the damage to the environment by capturing carbon dioxide. http://news.sciencenet.cn//htmlnews/2010/5/232504.shtm 否认要做上帝 克莱格文特尔:科学怪兽搞出了人造生命 内容提要:美国科学家克莱格文特尔5月20日宣布成功制造出人造细胞辛西娅之后,引起全世界的震动。文特尔这个极具争议性的人物也再次来到媒体的聚光灯前。有评论说,如果能够引领一个领域的科学家是大牛或者巨牛的话,他绝对是牛魔王级别的怪兽。 大器晚成的叛逆学者 文特尔的研究经历却远非一帆风顺的。1946年,文特尔在盐湖城降生,不久全家移居到了加州的密尔布莱,文特尔就在这里长大。上高中的时候,文特尔曾在游泳队中打破过游泳纪录,却差点因学习成绩不好而退学。他整天不是追女孩就是去冲浪。他弟弟,如今担任美国宇航局设计师的基恩说:他当时在学习上没什么动力,他对这些根本不上心。 越战爆发之后,他曾受征召加入美国海军。在新兵智力测试中,他得了最高分35000分,此后接受了医院医护兵的训练,并被派往越南战场,他对战争深恶痛绝,一直在设法回国。但越战对他影响很大,他因此意识到生命的珍贵。文特尔凭着自己的聪明,终于找到了一个离开越南的借口,回到了加利福尼亚。 越战结束后,他才奋发学习,开始修读大学课程。不过他上的大学和他上的中小学一样,都属于二三流水平。他的学术生涯是从进入加州一所称为圣马帝奥学院的社区大学开始。之后文特尔在加州大学圣地亚哥分校得到了三个学位,分别是1972年的生物化学学士,与1975年的生理学及药理学哲学博士。 虽然上的大学无法和哈佛等常青藤联盟相比,然而工作以后,文特尔所到之处却能威震朝野。 一人单挑6国科学家 第一次大幅关于他的报道是成立塞莱拉基因公司,与人类基因组计划唱对台戏。人类基因组计划是由美国科学家于1985年率先提出,于1990年正式启动的。美国、英国、法国、德国、日本和中国等6个国家的顶级科学家共同参与了这一价值达30亿美元的人类基因组计划。按照这个计划的设想,在2005年,要把人体内约10万个基因的密码全部解开,同时绘制出人类基因的谱图。但是到1997年,在耗费了巨额资金和一半预定时间之后,多国合作小组仅完成了3%的测序工作。 在人类基因组计划进行的同时,文特尔创立了塞莱拉基因公司,并宣称他将在无政府投资条件下早于多国合作小组完成人类基因组计划。就在1991年,文特尔开发出新的测序技术,采用了如散弹枪等一系列新的方法并很快真的追上了多国合作小组。看到自己即将失利,多国合作小组在美国总统克林顿的撮合下开始与塞莱拉合作,在2000年6月完成了90%,2001年初完成了99%的人类基因组草图。 等到人类基因组公布的时候,是他第一次红得发紫的时候,和克林顿以及布莱尔携手宣布一项实验结果,可谓前无古人后无来者。有趣的是,他本人的基因图谱也在随后发表在了《自然》上,有谣言说根据他的基因推测他易患耵聍(也就是耳屎)、反社会、高血压和心脏病。 但随后他就被塞莱拉公司炒鱿鱼了。他当年因为学术圈不得志,开了塞莱拉公司准备垄断人类基因组的生意。结果最后半被迫半自愿的开放了基因组的源代码,不能为公司创造价值,不得不走人了事。 不过鉴于他在人类基因组研究中所做的杰出贡献,权威的美国《时代》周刊将他选为2000年度科学家和仅次于美国总统当选人乔治W布什的年度风云人物,又在2007年将他选进世界上最有影响力的人之一。 立志解放碳资源 被塞莱拉公司炒鱿鱼之后,他没忘记其目标以及投资人的意愿,即制造一种生物可以解决能源问题,而可能的方向就是人造一种藻。文特尔创建了克莱格文特尔研究所,这家研究机构跨足许多不同领域。2005年,他与其他人合伙建立了合成基因组公司,专门以经过改造的微生物生产作为替代燃料的乙醇与氢。文特尔的研究小组有一艘由游艇改装成的研究船,称为魔法师二号,专门研究海洋微生物。 早在文特尔的辛西娅诞生之前,就有科学家考虑人造人的问题,不过这都没能被很好的证实。虽然辛西娅离人造人差距还有十万八千里,但在伦理和国家利益的驱动下,人造病毒和细菌可能会快速进入进程,各国都会加紧破解发展文特尔的方法,以期在医疗、能源和生物武器等问题上有所发展。 3年前他接受《泰晤士报》采访时曾被问到,如果研制出人造生命,你觉得有什么意义?文特尔当时的回答是,在未来20年,合成基因组学将制造出任何东西。这会改变整个工业结构,让化学工业服务于生物工程,把生物圈的碳资源解放出来,燃烧它们,利用它们。这将是我这辈子最大的贡献。 人造细胞问世后,激起巨大反响。反对者指责克莱格文特尔想扮演上帝,人为创造出本不存在的生物。而支持者则认为这是生物学的一大进步,前途无量。 文特尔称不想扮上帝 克莱格文特尔告诉记者,他们用了四瓶化学物质为他们的人造细胞设计了染色体,然后把这个基因信息植入另一个修改过的细菌细胞中,这个由合成基因组控制的细胞具有自行复制的能力。文特尔透露,他们是经过15年的努力才研制出第一个合成细胞。 研究报告说,这项技术或可用来制造特定的藻类,以净化导致气候暖化的二氧化碳,可能为炼油厂生产新的碳氢化合物清洁能源。研究人员也希望研发的这项技术有助于加速疫苗生产,以及制造新食材和化学物质。 加拿大一家国际科技监督组织的托马斯警告,合成生物学是高风险、以牟利为前提的领域,人类对这方面了解得不多,不应贸然制造新的有机体。托马斯担心实验室内制造出的生命体,最终成了脱缰的有机体,对现有的自然生物多样性造成威胁,此外,它也可能用来制造生物武器。 在接受BBC访问时,文特尔表示他并非要扮演上帝,成为造物者,他指出,每当和生物相关的医学或者科学研究取得突破时,这种说法就会出现。他说,这项研究有助于将来量身定做生物,协助解决粮食不足、全球暖化和污染等问题。 全球科学界展开激辩 人造生命辛西娅问世后,有些科学家认为这种方法并没有前途,因为设计新的有机生物要花费很多年时间。加利福尼亚州拉霍亚市斯克里普斯研究所的生物学家杰拉尔德乔伊斯说:这项研究的功能非常强大,能够发行并控制一个基因组的每个基因字符,因为这意味着你可以植入不同的基因。 《人工生命》杂志编辑、美国里德大学哲学家马克比道说,辛西娅的出现在生物学和生物技术的发展上具有决定性意义。 美国宾西法尼亚大学生物伦理学教授阿瑟卡普兰对英国《自然医学》月刊记者说,文特尔及其团队的成就违反了一个生命本质的基本理念。 在这一领域工作的一些科学家说,他们担心的是,一旦这些新奇的有机体进入现实世界,人类还缺乏手段来制衡它们可能带来的风险。按照定义说,它们非常前沿,我们可能无法简单地将它们同某些已知的危险细菌和病菌相提并论。 在印度海得拉巴成立了细胞和分子生物中心的著名遗传学家PM巴尔加瓦也直截了当地表示,虽然文特尔是一名杰出的科学家,但这次他却夸大了自己成就的重要性。巴尔加瓦说:文特尔的团队从一个细胞中提取出DNA,然后用大量其他物质取而代之。这充其量只能算是多位点基因工程。 南丹麦大学的斯蒂恩拉斯马森的看法和巴尔加瓦不谋而合。他在一份公开的声明中说:在人们了解生命之时,在一个现代细胞中制造一个合成基因组目前具有里程碑式的意义。然而,文特尔团队的这种彻底的基因工程在我看来并不能称为合成细胞。 美国环境组织地球之友批评说,合成基因组是一项危险的新技术,在有效的规章出台之前,文特尔先生应该立即停止进一步的研究。部分非政府组织认为,即使是用在环境方面(比如人们希望细菌能够用来中和温室气体),合成细胞的作用也被夸大了。 更多阅读 英国BBC相关报道(英文) 学界担忧首个人造单细胞生物双刃剑效应 世界首个人造生命在美诞生 http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2010/5/232453.shtm 世界首个人造生命在美诞生 能够自己生长繁殖;为今后人造微生物的应用研究铺平了道路 美国生物学家克雷格文特尔制造生命的过程 据《每日邮报》报道,美国生物学家克雷格文特尔( Craig Venter )在实验室中制造出世界首个人造生命细胞。 克雷格文特尔将一种称为丝状支原体丝状亚种的微生物的DNA进行重塑,并将新的DNA片段粘在一起,植入另一种细菌中。新的生命由此诞生,这种新生的微生物能够生长、繁殖,并产生一代又一代的人造生命。植入的DNA片段包含约850个基因,而人类的DNA图谱上共有约20000个基因。 这个人造生命被戏称为人造儿(synthia),它是人类科学史上一个革命性的成果,为今后人造微生物的应用研究铺平了道路。在未来,人类也许能够建立微生物制造厂,制造出微生物药剂、微生物燃料,以及能够分解污染物的微生物清洁工。 然而,科学的发展总是一把双刃剑。道德主义者指责制造人工生命是渎神,是藐视生命。有人担心人造儿开启了潘多拉的魔盒,为未来制造生化武器奠定了基础,而实验室一个微小的失误就可能产生新的瘟疫,夺去数百万人的生命。 更多阅读 《科学》网站相关报道(英文) 《纽约时报》相关报道(英文) http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2010/5/232459.shtm 学界担忧首个人造单细胞生物双刃剑效应 美国私立科研机构克雷格文特尔研究所研究人员5月20日报告说,他们培育出第一个由人工合成基因组控制的细胞,从而向人造生命形式迈出了关键一步。人造生命相关技术的应用前景固然广阔,但其双刃剑效应绝不可忽视。 这些研究人员人工合成了一种名为蕈状支原体的细菌的脱氧核糖核酸(DNA),并将其植入另一个内部被掏空的、名为山羊支原体的细菌内。经过多次失败,他们最终使植入人造DNA的细菌获得新生,并开始在实验室的培养皿中繁殖。研究人员希望借此更好地了解驱动所有生命的基础机制,并利用基因工程制造某些种类的细菌,用于生产燃油或消解毒性废物等。 对于这项成果,科学界反应不一,有些科学家评价颇高,但也有相当一部分科学家心情复杂,态度审慎。 给出高评价的,有美国拉特格斯大学分子生物学家理查德埃布赖特。他说:这是人与自然关系的一个转折点,历史上第一次有人创造了一个完整的带有预定特性的细胞。斯坦福大学生物医学伦理中心主任戴维马格努斯甚至认为,这项研究可能开启基因工程新纪元。 20日出版的新一期《经济学人》杂志封面文章预测,将来有一天,新的细菌、动物或者植物等生命体将被电脑设计,最后被人类制造出来。在某种程度上,这种创造生命的举动比第一颗原子弹爆炸更能证明人类掌控自然的能力。 与此同时,也有相当一部分科学家的评价比较谨慎,认为文特尔研究所只是部分合成了现有细胞,并未跨越无中生有、创造生命的界限。波士顿大学生物医学专家詹姆斯柯林斯表示,他不认为上述合成的单细胞生物体意味着一种人造生命形式的诞生,它只是一个带有人造基因组的生物体,而非人造生物体。 美国总统奥巴马也注意到了这项成果。他当天致信负责生物伦理问题研究的一个总统委员会的主席、宾夕法尼亚大学校长埃米古特曼,要求委员会评估这类研究在医学、环境、安全等领域的影响。 事实上,近年来,克隆技术、干细胞技术和基因工程等飞速发展,但它们引发的伦理和道德之争从未止息。对待人造生命,在看到其巨大应用前景时,也要时刻警醒其可能带来的危害。 《经济学人》杂志认为,人造生命看起来是一件令人惊奇的事,这种技术具有众多优势。就短期而言,可以应用于制造更好的药物、农产品、绿色燃料以及促进化学工业的发展;但从长期来看,谁也不知道它可能带来什么样的后果,这种技术与生俱来地存在着危险,如果滥用可能导致恐怖的灾难。 该刊因此提出了这样的问题:如何控制这些能自我复制的人造生命?谁能拥有人造生命基本工具的专利权?这些问题的答案无疑在于各国政策制定者如何保持理性,戒慎警惕,对此类技术加强管制。 奥巴马在致信古特曼时也表示,需要确定这类技术的合适伦理界限,将其危害控制到最小程度。环保组织地球之友也认为,必须确保相关法规到位,以保护环境和人类健康免受这项有潜在危险的新技术伤害。 更多阅读 世界首个人造生命在美诞生 美研究人员首次合成人造单细胞生物 首例人造生命在美诞生 奥巴马下令评估伦理风险 特别声明:本文转载仅仅是出于传播信息的需要,并不意味着代表本网站观点或证实其内容的真实性;如其他媒体、网站或个人从本网站转载使用,须保留本网站注明的来源,并自负版权等法律责任;作者如果不希望被转载或者联系转载稿费等事宜,请与我们接洽。 打印 发E-mail给: 以下评论只代表网友个人观点,不代表科学网观点。 ? 2010-5-23 0:19:51 匿名 IP:117.131.30.* 欧美这帮人创造了现代文明,有一天也得毁了现代文明 [回复] 2010-5-22 23:53:49 匿名 IP:122.239.255.* 担心毫无必要,搞伦理学的就是找事,不然他们做什么 [回复] 2010-5-22 20:51:21 匿名 IP:210.34.20.* 引用:上个世纪是物理学给人类带来了灾难,本世纪该轮到生物学了....比原子弹更恐怖的发明 比原子弹可拍的发明是房改。科技变化永远没有民政变化震撼。 [回复] 2010-5-22 20:00:55 dxflqm IP: 觉得前几天刚开始的报道不准确 不知什么原因。 看刚开始的报道,我觉得就是转基因 看来今天的报道,说是人工合成的DNA,转入另一个生物 才知道 确实是人工合成的生命。 [回复] 2010-5-22 19:17:48 匿名 IP:124.115.220.* 毋庸置疑,这是一个伟大的进步,一次革命!但世界是否因而受益,就看人类智慧的平衡危机的能力了 [回复] http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/science.1190719 Published Online May 20, 2010 Science DOI: 10.1126/science.1190719 Science Express Index Research Articles Creation of a Bacterial Cell Controlled by a Chemically Synthesized Genome Daniel G. Gibson, 1 John I. Glass, 1 Carole Lartigue, 1 Vladimir N. Noskov, 1 Ray-Yuan Chuang, 1 Mikkel A. Algire, 1 Gwynedd A. Benders, 2 Michael G. Montague, 1 Li Ma, 1 Monzia M. Moodie, 1 Chuck Merryman, 1 Sanjay Vashee, 1 Radha Krishnakumar, 1 Nacyra Assad-Garcia, 1 Cynthia Andrews-Pfannkoch, 1 Evgeniya A. Denisova, 1 Lei Young, 1 Zhi-Qing Qi, 1 Thomas H. Segall-Shapiro, 1 Christopher H. Calvey, 1 Prashanth P. Parmar, 1 Clyde A. Hutchison, III, 2 Hamilton O. Smith, 2 J. Craig Venter 1 ,2 ,* We report the design, synthesis, and assembly of the 1.08-Mbp Mycoplasma mycoides JCVI-syn1.0 genome starting from digitized genome sequence information and its transplantation into a Mycoplasma capricolum recipient cell to create new Mycoplasma mycoides cells that are controlled only by the synthetic chromosome. The only DNA in the cells is the designed synthetic DNA sequence, including watermark sequences and other designed gene deletions and polymorphisms, and mutations acquired during the building process. The new cells have expected phenotypic properties and are capable of continuous self-replication. 1 The J. Craig Venter Institute, 9704 Medical Center Drive, Rockville, MD 20850, USA. 2 The J. Craig Venter Institute, 10355 Science Center Drive, San Diego, CA 92121, USA. * To whom correspondence should be addressed. E-mail: jcventer@jcvi.org