今年7月份，APSIM Group主题帖有11篇，其中4篇没有被回复。求助关于模型算法的有8篇，涉及到蒸腾效率、高粱品种参数、农场污水降解模型等；关于APSIM脚本或应用的有3篇，涉及到组件增加等问题。在被回复的8篇中，有2篇得到满意答案，见下： 2010/06/29 问 ：APSIM是否包括西红柿模型？ 答 ：没有 2010/07/03 问 ：于播种后，间隔一定天数追施肥料，这种施氮方式是否可以模拟？ 答 ： 可以，但需要自定义。具体操作方法见下： It is a top up rule meaning that it will determine the amount to apply to keep the amount of N at a threshold (the value specified on the line Amount of N required in top 3 layers (kg/ha) : ). 请复制以下内容，粘贴到paddock节点。这样模拟树就增加了新组件，该组件可以实现设置施肥料和间隔天数。 manager name=Fertilise on days after sowing script text! .DaysAfterSowing = ) then apply amount = (kg/ha), depth = 50 (mm), type = () endif ]]/text eventstart_of_day/event /script ui category name=When should fertiliser be applied / modulename type=modulename description=On which crop is fertiliser being applied:wheat/modulename fert_das type=text description=Enter number of days after sowing:20/fert_das category name=Fertiliser application details / fertmodule type=modulename description=Module used to apply the fertiliser: / fert_amount type=text description=Amount of fertiliser to apply (kg/ha):150/fert_amount fert_type type=list listvalues=NO3_N, NH4_N, NH4NO3, urea_N, urea_no3, urea, nh4so4_n, rock_p, banded_p, broadcast_p description=Fertiliser type:urea_N/fert_type /ui /manager
笔者接触农业模型有近三年时间，但真正花时间去认真阅读农业建模书籍和文献是最近一年的事情。在这三年中，笔者收集了国内外主流作物模型软件、优秀作物建模书籍。笔者整理了一些资料，希望能与大家交流，起个抛砖引玉的作用。 1、三位专家 笔者非常佩服的一位作物建模专家是Jones博士，来自佛罗里达大学(UFL)农业与生物工程系的Distinguished Professor。他是DSSAT模型培训的主要组织者之一，也是那本经典建模教材Working with Dynamic Crop Models Evaluation, Analysis, Parameterization, and Applications的主编之一。他在UFL讲授的农业和生物系统建模(ABE5646C)可以在他的课程主页上下载到相关幻灯片和 handout。 课程地址： http://www.abe.ufl.edu/academics/course-listings/graduate/ABE5646C.shtml 配套教材： Working with Dynamic Crop Models Evaluation, Analysis, Parameterization, and Applications 笔者推荐的另一位作物建模专家是Christopher Teh Boon Sung博士，来自马来西亚布特拉大学农学院土地管理系。Sung毕业于英国雷丁大学，获博士学位。他写的Introduction to mathematical modeling of crop growth: How the equations are derived and assembled into a computer program是笔者所读过的通俗易懂的一本教材。我们可也在他所授课程主页上下载到相关的幻灯片，其中有份资料罗列了通用作物生长模型用到的所有公 式，并增加了批注，笔者认为这份资料对于刚走进作物模型建模大门的学生来讲，非常有参考价值。 课程地址： http://www.christopherteh.com/prt4301/index.html 配套教材：Introduction to mathematical modeling of crop growth: How the equations are derived and assembled into a computer program 笔者推荐的另一个作物建模专家是中国农大的李保国教授，我们可以在超星学术视频上可以看到李博士面向研究生讲授的农田土壤-作物系统建模及其应用视频。这也是我能找到的唯一一份视频教程。 还有一些非常优秀的作物建模专家，但是笔者没有能在网路上搜索到授课教程，在这里就不推荐了。有兴趣可以查阅笔者的另外一个帖子 6位作物模型模拟专家 。 2、五所大学或研究机构 说到大学或研究机构，笔者首先想到的一直支持和维护DSSAT开发的乔治亚大学和佛罗里达大学。这两所大学的农业与生物工程系一直是DSSAT培训 项目的主要支持单位。也是DSSAT培训的主要举办地点(每年的3月或5月份)。在美国，还有一些作物建模非常出色的大学，如内布拉斯加大学林肯分校农学 与园艺系和华盛顿州立大学生物系统工程系。 美国之外的大学，笔者肯定首先会想到荷兰瓦赫宁根大学，也一定会想到荷兰模型泰斗de Wit先生。这所学校与国内农大学保持着友好的合作关系，并为我国培养了许多优秀的作物建模专家或博士。由于荷兰派模型都是在基于FORTRAN语言的 FST平台研制出来的，而这种命令行式的模型运行方式，让像笔者这样习惯窗体操作的使用者们望而却步，所以笔者并没有真正试用过这些荷兰派模型。在这里笔 者非常想提到殷新佑(Xinyou Yin)博士。笔者有幸听过他的几次报告，对笔者的思路有很大的影响。 对于研制APSIM的CSIRO了解不多，笔者所知道仅限于APSIM和王恩利(Enli Wang)博士。 除上述谈到的单位之外，还有一些研究机构也在做作物建模研究，如FAO、IRRI、洛桑研究站等。 乔治亚大学农业与生物工程系 http://www.engr.uga.edu/ 佛罗里达大学农业与生物工程系 http://www.abe.ufl.edu/ 华盛顿州立大学生物系统工程系 http://www.bsyse.wsu.edu/ 内布拉斯加大学林肯分校农学与园艺系 http://www.agronomy.unl.edu/index.html 荷兰瓦赫宁根大学作物系统分析中心 http://www.csa.wur.nl/UK/ 3、三个模型 对于DSSAT，笔者是只听其名，未见其面。高达$195(个人用户)和$1,000.00(机构用户)的价钱，让许多人未见过这位模型中的贵族。 http://www.icasa.net/dssat/index.html APSIM是与DSSAT齐名的作物建模。你只要签一份协议，就可以在三年协议其内自由获得APSIM及升级版的安装包密码。APSIM开放了源代 码，这使我们有机会了解APSIM的内部运行机制。在APSIM主页上，官方也提供了一些指导教程，只要按照说明，短时间内就可能对软件进行操作。笔者试 图对APSIM进行汉化，也咨询了APSIM作者，但由于APSIM内部有Fortran、C++、VB和C#等多语言共存现象，汉化将是一个不小的工 程。笔者也不打算花精力去做这件事情。 http://www.apsim.info/ AquaCrop V3.1是FAO推出最新版本，在界面坚持简单明了设计风格，软件易于操作，功能强大。高亮之先生曾撰文对新版本进行了介绍，也给出了很高的评价。为了方 便国内学者的使用，作者对AquaCrop进行了汉化。到发帖日止，先后有近10个单位的老师或学生索取了汉化版，如果你也有兴趣，请与笔者联系。 http://www.fao.org/nr/water/aquacrop.html 在对APSIM和AquaCrop等软件进行操作后，我们应该对整个作物模型的运行过程有了个了解，但如果真的想在当地应用这两个模型，还需要做一些本地化的工作，这些工作主要涉及到一些模型参数本地化的问题。 4、二十二本书 国外关于作物建模的书有很多，笔者推荐几本可以下载到ebook或在google图书上能看到部分页面的优秀书籍。 作物建模基础： A: Working with Dynamic Crop Models Evaluation, Analysis, Parameterization, and Applications (推荐度：★★★★★) B: Introduction to mathematical modeling of crop growth: How the equations are derived and assembled into a computer program (推荐度：★★★★★) C: Agricultural systems modeling and simulation (推荐度：★★★★★) D: Software Engineering Techniques Applied to Agricultural Systems (推荐度：★★★★★) E: Mathematical Modeling for System Analysis in Agricultural Research F: Modelling for Field Biologists and Other Interesting People G: modeling biological systems_principles and applications(2nd) H: Mathematical Models in Biology An Introduction I: Biological Modelling and Simulation 作物建模高阶： J: advances in modeling agricultural systems (推荐度：★★★★★) K: Agricultural System Models in Field Research and Technology Transfer (推荐度：★★★★★) L: Crop-soil simulation models:Applications in developing countries (推荐度：★★★★★) M: Gene-plant-crop relations (推荐度：★★★★★) N: Agricultural Systems Management Optimizing Efficiency and Performance 农业软件工程技术： O: Software Engineering Techniques Applied to Agricultural Systems (推荐度：★★★★★) 作物建模数学基础： P: Maths from Scratch for biologists 作物建模统计学基础： Q: Contemporary statistical models for the plant and soil sciences (推荐度：★★★★★) R: Fitting models to bilogical data using linear and nolinear regression (推荐度：★★★★★) S: Design and Analysis of Ecological Experiments 建模工具： T: A Practical Guide to Ecological Modelling (推荐度：★★★★★) U: Modeling tools for environmental engineers and scientists V: Ecological models and data in R 5、六次定期会议或培训 DSSAT Training Program 每年3月份或5月份于美国乔治亚大学或佛罗里达大学举行 APSIM Training Program 每年一次，日期不固定，于澳洲 International Symposium on Models for Plant Growth, Environmental Control and Farm Management in Protected Cultivation 每两年一次 International Symposium on Applications of Modelling as an Innovative Technology in the Agri-Food-Chain: Model-IT 每两年一次 International Symposium on Modelling in Fruit Research and Orchard Management 每两年一次 Working with dynamic models for agriculture 不定期，法国 6、六种期刊 Field Crops Research Agricultural Systems Annals of Botany Ecological Modelling European Journal of Agronomy Journal of Experimental Botany 7、若干建模工具 底层编程语言，如C#；FORTRAN；FST、R语言、Excel、Matlab等 8、两个邮件列表和一个论坛 DSSAT@LISTSERV.UGA.EDU DSSAT官方交流论坛 APSIM@googlegroups.com APSIM官方交流论坛 http://km.fao.org/aquacrop_forum/ AquaCrop官方交流论坛
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