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大数据怎么分析?
FlowJo 2014-12-19 00:56
现在的流式仪越来越先进,科研需求也越来越广,我们采集的数据也越来越大,有一用户的一个FCS数据达到了700M甚至1G多,因为他分析的是表达量很低的干细胞,采集了30多million的细胞。那这么大的数据在flowjo上能分析吗? 在一个相当配置的电脑,如4GB内存的电脑上,神奇的flowjo表示分析起来无压力,顶多反应时间多几秒钟而已。但是关键是你的电脑必须是64位的,下载使用64位的flowjo V10,就可以啦。32位的电脑是有点吃力了,不推荐。现在你是不是松了一口气呢,加载你的大数据测测你的电脑和flowjo的极限吧!
个人分类: FlowJo使用|4382 次阅读|0 个评论
玩猎射小绵羊,预测自己寿命长短
热度 3 zhpd55 2014-1-31 14:30
玩猎射小绵羊,预测自己寿命长短 诸平 据物理学家组织网 2014 年 1 月 29 日报道,中年人的缓慢反应时间有可能会在未来 15 年后增加死亡的风险 , 这是根据发表在《公共科学图书馆·综合》( PLOS ONE )杂志上最新的研究而得出的结论。来自伦敦大学学院( University College London , 简称 UCL )和爱丁堡大学( University of Edinburgh )的研究人员观察了美国年龄在 20–59 岁之间的 5134 名参与者 , 其中男士 2342 人的相关数据之后得出上述结论。这项研究始于 20 世纪 90 年代 , 参与者到 测试中心 ,接受反应时间的测量。其实任务很简单 , 当测试者在电脑屏幕上看见正在吃草的羊群中,突然有一只羊跑出时,即可点击图形下方的箭形按钮,先后有五只羊离开羊群,即对 5 次反应时间进行平均就可以得到测试者的平均反应时间。值得注意的是如果在羊离开羊群之前就点击按钮放箭者,将以 3 秒钟计入。随后对其参与者进行跟踪调查,统计在未来 15 年内 , 究竟有多少人去世,还有多少人健在。研究结果发现总共有 378 人在此期间死亡,占统计总数的 7.4% ;但那些反应时间比平均反应时间更慢的人群中,死亡人数所占比例达到 25% 。在研究人员将参与者的年龄、性别、种族、社会经济背景和生活方式因素考虑在内之后仍然如此。但是反应时间与死于癌症或呼吸道疾病之间没有然后关系。来自 UCL 流行病学和公共卫生系的领导作者 Gareth Hagger-Johnson 博士说 : “反应时间被认为是反映中枢神经系统的一个基本方面,而信息处理的速度被认为是一个基本的认知能力。我们的研究表明 , 对成年人进行一个简单的反应时间测试后可以预测生存者 , 而且与年龄、性别、种族和社会经济背景等因素没有任何关系,反应时间可能表明我们的中枢神经和身体的其他系统工作情况。如果人总是对新信息反应迟钝,则可能会遇到早逝风险的大问题。在未来 , 我们可以用反应时间来监测健康和预测寿命。就眼下而言 , 一种健康的生活方式是人们延年益寿可以做的最好的事情。” 反应时间测试请浏览 : www.bbc.co.uk/science/humanbody/sleep/sheep/reaction_version5.swf ; PLoS ONE 原文请浏览 : http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0082959
个人分类: 健康生活|5388 次阅读|6 个评论
黄灯亮多长时间合适?
热度 12 yusufma 2013-1-4 06:59
新交规关于“闯黄灯”的处罚 引起了网友热烈讨论,有人称之为“违反牛顿定律”,也不为过。从看见黄灯亮起到采取制动措施,再到汽车完全停止,是需要一个过程的。要求黄灯亮起时,所有未过停车线的汽车在到达停车线之前停下来,从物理上来说就是不可能的。那么,怎么样的要求才是合理的呢?我们本着科学的态度来讨论一下。 首先考虑人的反应时间。从看到信号到做出反应,这个时间一般大于 0.2 秒 ,这是指健康的年轻人。(当然,刘翔可以比这快不少。)我们以此下限来进行计算,假设在这段反应时间内汽车仍按原速度前进。 其次,来考虑刹车带来的负的加速度。这个数值和路面情况、刹车系统工作情况以及轮胎质量都有关系。我们来考虑最一般的情况,若干个不同来源的数据均表明 ,干燥的普通沥青路面刹车时的加速度大约负的 6.5 米/秒 2 ,我们假设采取刹车措施后汽车按此加速度匀减速运动,直至完全停止。 现在我们建立起了模型,用高中学过的运动学公式进行简单计算,计算结果可以用下图表示: 其中红线表示从信号亮起到汽车停止的总刹车距离,蓝线表示总的刹车时间。从这里我们看出,刹车距离和时间都和车速有关。 假设现在车速为 40 公里/小时,那么从信号灯亮起到汽车完全停下,至少需要大约 12 米距离。如果黄灯亮起时,汽车距离停车线小于 12 米,最佳判断应该是继续开过去通过路口,而不是刹车,否则汽车会停在路口中间,那样就太尴尬了。如果黄灯亮起时汽车距离停车线大于 12 米,当然最好采取刹车措施,避免闯黄灯(甚至红灯)。 现在说说黄灯亮多长时间合适。既然黄灯的作用是警告和清空路口车辆,那么就要保证黄灯亮时刚刚过停车线的汽车有足够时间在红灯亮起之前通过路口。如果路口宽度为40米,汽车行驶限速为 40 公里/小时(即 11.11 米/秒),那么通过路口需要的最少时间为 40/11.11=3.6 秒。考虑到离停车线 12 米之内来不及刹车的车辆也必须通过路口,那么总的时间为 (40+12)/11.11=4.7 秒。如果黄灯持续时间低于此数值,无法保证路口内所有车辆在红灯亮起之前顺利清空。 以上只是针对某一速度的计算结果,对于其他速度可以用类似方法计算。这个结果是保证信号灯达到设计初衷的一个下限。实际情况下,由于路面、车辆及司机的状况有所不同,情况会更复杂。但是有一点是肯定的,无论交规怎样规定,遇到路口适当减速,于司机、于大家都会更安全。 http://biae.clemson.edu/bpc/bp/Lab/110/reaction.htm#Type%20of%20Stimulus http://forensicdynamics.com/stopping-distance-calculator http://www.driveandstayalive.com/info%20section/stopping-distances.htm#stop-dist_table-for-dry-road http://www.racemath.info/motionandenergy/stop_distance.htm
个人分类: 其它|10309 次阅读|13 个评论
[转载]介电弹性体复合材料热力学研究新进展
hxiuzhou 2012-7-19 15:45
介电弹性体在电压的作用下可以产生大变形、具有高弹性能密度、超短反应时间、高机电耦合效率、轻质量、低价格等优良特性。基于其独特的机—电,电—机的换能特性,它可以被用来制作驱动器、传感器、能量收集器,被广泛应用于仿生领域,光学领域和航空航天领域。介电弹性体软质材料具有材料非线性和几何大变形特性,而且其承受的载荷还具有多场耦合特点,比如机械力场和电场耦合,机械力场、电场和热场耦合等等。介电弹性体的稳定性和大变形两大研究主题引起了研究人员的广泛兴趣。围绕着这两个主题,介电弹性体及其复合材料在多物理场耦合的本构关系、机电稳定性、突跳稳定性、超大电致变形机理、许用区域描绘及其应用器件的失效分析被研究人员深入而广泛的研究。介电弹性体的驱动电场与其击穿电场是同一数量级的,这大大的影响了它的商业应用。研究人员通过制备性能优异的介电弹性体复合材料来解决这一问题。大体上通过两种思路制备高性能的介电弹性体复合材料,一种是基于物理共混方法来制备颗粒或聚合物填充的硅橡胶复合材料,另一种是基于化学交联方法来制备丙烯酸互穿网络型的介电弹性体。从目前的文献来看,介电弹性体复合材料的研究多集中在合成、制备及其性能测试,理论研究则相对较少。   由哈尔滨工业大学复合材料与结构研究所冷劲松教授担任通讯作者撰写的《介电弹性体复合材料的热力学和热机电稳定性》一文考虑温度的影响,理论研究了介电弹性体复合材料的热力学行为。深入探讨等双轴载荷和不同温度条件下的机电稳定性,材料参数、热参数、电致变形参数和唯象学参数对稳定性的影响。该文发表在《中国科学: 物理学 力学 天文学》2012年第1期上。   构建介电弹性体复合材料热力学系统的热力学框架,建立耦合Ogden热弹性能、热贡献和电场能的介电弹性体复合材料的自由能模型,基于此推导出热力学本构关系,并深入探讨系统的热机电稳定性。数值结果表明,随着材料常数比减小、温度增加、电致伸缩系数减小和唯象学参数增加,介电弹性体复合材料的临界名义电场增加。 这一研究的创新之处在于通过构建介电弹性体复合材料热力学框架,提出综合考虑温度、拉伸、极化和掺杂等因素影响的自由能模型,研究复合材料的力学性能和热力学性能,为高性能复合材料制备和进一步研究其宏观力学行为提供理论基础。 ### 该研究得到了国家高技术研究发展计划(批准号:2006AA03Z109)资助。 新闻来源: EurekAlert ( http://chinese.eurekalert.org/zh/pub_releases/2012-02/sicp-ndi022912.php ) 来源文献: 冷劲松, 张震, 刘立武, 等. 介电弹性体复合材料的热力学和热机电稳定性. 《中国科学: 物理学 力学 天文学》, 2012, 42: 61–77 Leng J S, Zhang Z, Liu L W, et al. Thermodynamics and thermo-electro-mechanical stability of dielectric elastomers composite (in Chinese). Sci Sin-Phys Mech Astron, 2012, 42: 61–77, doi: 10.1360/132011-480
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[转载]各种迷宫的差异
chinaneonate 2011-10-1 07:21
T迷宫、Barnes迷宫、Morris水迷宫比较 打印 引用 发布时间:2011-05-24 T迷宫、Barnes迷宫、八臂辐射迷宫、Morris水迷宫比较 在非临床有效性研究过程中,主要采用行为学试验研究药物对动物学习记忆功能的影响。人和动物的内部心理过程是无法直接观察到的,只能根据可观察到的刺激反应来推测脑内发生的过程,对脑内记忆过程的研究只能从人类或动物学习或执行某项任务后间隔一定时间,测量他们的操作成绩或反应时间来衡量这些过程的编码形式、贮存量、保持时间和它们所依赖的条件等等。学习、记忆实验方法的基础是条件反射,各种各样的方法均由此衍化出来。目前已经建立了大量的学习记忆研究的行为学方法,各有优缺点。现将常用的迷宫简述如下。 1、T迷宫实验 观察指标:动物完成实验所需的时间、每次探索和前一次不同臂的比例。 优缺点:优点是T型迷宫未提供奖惩条件,完全是利用动物探索的天性,因此能最大可能的减少影响实验结果的混杂因素。缺点是啮齿动物有天生的偏侧优势,即动物在T型迷宫中更偏向于一边走(左边或右边),而且这种现象存在种系差异以及性别差异。 由于动物每次转换探索方向时都需要记住前一次探索过的方向,因此T型迷宫实验能很好的测验动物的工作记忆,从而测定动物的空间记忆能力。和T型迷宫类似的还有Y型迷宫,其实验的设计原理和实验方案和Y型迷宫都十分相似,只是把迷宫的形状由T型换成Y型。 2、Barnes迷宫实验 原理:动物利用提供的视觉参考物,有效确定躲避场所的臂所在的部。Barnes迷宫由一个圆形平台构成,在平台的周边,布满了很多穿透平台的小洞。平台的直径、厚度以及洞口宽度根据实验动物不同而不同。洞口数目由实验者习惯而定,一般为10到30个。在其中一个洞的底部放置有一个盒子,作为实验动物的躲避场所;其它洞的底部是空的,试验动物无法进入其中。实验场所和其它迷宫实验场所类似,要求能给实验动物提供视觉参考物。实验方案根据实验者的习惯以及不同的实验要求而定,每次训练后都用70%的酒精进行清洗,并变换正确的洞口,但洞口的空间位置不变,以防止动物通过嗅觉而找到洞口。Barnes迷宫一般采用强光、噪声以及风吹等刺激作为实验动物进入躲避洞口的动机。 观察指标:测定动物对于目标的空间记忆能力。实验时把实验动物放置在高台的中央,记录实验动物找到正确洞口的时间,以及进入错误洞口的次数以反应动物的空间参考记忆能力。也可以通过记录动物重复进入错误的洞口数来测量动物的工作记忆。 优点:不需要食物剥夺和足底电击,因此对动物的应激较小。实验对于动物的体力要求很小,能最低限度的减少因年龄因素所致的体力下降对实验结果的影响。实验所需时间较少,整个实验能在7~17天内完成。能防止动物凭借气味来完成实验。 3、放射状迷宫实验(八臂辐射迷宫) 原理:大鼠利用房间内远侧线索所提供的信息,可以有效地确定放置食物的臂所在部位。放射状臂形迷宫可以用于大鼠空间参照记忆和工作记忆的研究。参照记忆过程中,信息在许多期间/天内都是有用的,并且通常在整个实验期间都是需要的。而工作记忆过程与参照记忆过程不同,它只有一个主要但暂时的信息,由于迷宫内所提供的信息(臂内诱饵)仅对一个实验期间有用,而对后续实验无用,大鼠必须记住在延迟间隔期内(分钟到小时)内的信息。在臂形迷宫中作出正确选择以食物作为奖赏。 优缺点:适合于测量动物的工作记忆和空间参考记忆,并且其重复测量的稳定性较好。但有些药物(苯丙胺),可以影响下丘脑功能或造成食欲缺乏,影响迷宫中所采用的食欲动机,因此动物就不能很好的完成迷宫实验。 4、Morris水迷宫实验 原理:一种小鼠、大鼠能够学会在水箱内游泳并找到藏在水下逃避平台的实验方法。由于没有任何可接近的线索以标志平台的位置,所以动物的有效定位能力需应用水箱外的结构作为线索。迷宫由圆形水池、自动摄像及分析系统两部分组成,图像自动采集和处理系统主要由摄像机、计算机、图像监视器组成,动物入水后启动监测装置,记录动物运动轨迹,试验完毕自动分析报告相关参数。 检测指标:实验程序包括:(1)定位航行实验(place navigation),用于测量小鼠对水迷宫学习和记忆的获取能力。实验历时4天,上、下午各训练1次,共计8次。实验观察和记录小鼠寻找并爬上平台的路线图及所需时间,即记录其潜伏期和游泳速度。(2)空间搜索实验(spatial probe test),用于测量学会寻找平台后,对平台空间位置记忆的保持能力。定位航行实验结束后,撤去平台,从同一个入水点放入水中,测其第一次到达原平台位置的时间、穿越原平台的次数。 优缺点:Morris水迷宫是目前世界公认的较为客观的学习记忆功能评价方法。利用Morris水迷宫检测空间记忆学习能力。水迷宫与放射臂状迷宫相比较的主要优越性在于①在水迷宫中,动物训练所需的时间较短(1周),而臂形迷宫则需要几周的训练时间;②迷宫内的线索,例如气味可以被消除掉;③大的剂量-效应研究可以在一周内进行;④可以利用计算机建立图像自动采集和分析系统,这就能根据所采集的数据,制成相应的直方图和运行轨迹图,便于研究者对实验结果作进一步分析和讨论,用来研究有关大鼠运动或动机问题;⑤动物在实验中可以不禁食。从理论上讲,水迷宫实验是一个厌恶驱动的实验而臂形迷宫实验是食欲驱动的实验。
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