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系统医学 - 系统与合成生物学: benlion 2020-10-4 21:22; 系统生物学（及其工程形态的合成生物学）与系统医学和系统遗传学与系统生物工程（细胞仿生工程与输卵管生物反应器）- 系统与合成（工程）生物学的BSSE（生物系统科学与工程）偶合模式和概念与方法体系，包括，a -生物（信息控制）系统理论 - 自组织系统结构论与图论- 网络拓扑学分析，b-太阳能-生物电子学（细胞通讯与分子电路）设计，c-细胞发生动力学，d-自动化细胞的系统设计与NIBC会聚技术等。 1996年在北京举办第一届国际转基因动物学术研讨会（暨生物技术与绘画艺术展览）与筹备协会，Bj.Zeng阐述生物系统（心理生理学与遗传学）理论与系统生物工程（细胞通讯和转基因技术与仿生学整合），1999年在汉诺威建立系统生物科学与工程（BSSE-Biosystem Network）网站*和筹备国际协会与会议，Bj.Zeng倡导从实证分析到系统综合（synthetic）和实验（分子生物技术）与计算生物学（生物信息技术）整合的方法，以及生物系统分析与人工生物系统的工程设计（genomic intelligence与细胞通讯的基因组程序编制与分子电路模块的装配）等 - 从分子（中心法则）与理论生物学转换到系统与合成生物学（ BSSE 偶合与转化模式）的过程。当系统生物学（思想基础 - 不存在两片完全相同的树叶，并探究为何不同的机理）在国际上（及其工程形态的合成生物学）发展起来之后，仍然出现混淆局部与系统或整体与系统，把局部（比如，作为方法之一的生物信息学，或作为方法之二的组学生物技术）当成整体，把整体（比如，鸟瞰到的森林景观）当成系统内在的关系网络（数学定量与技术操作）（比如，森林里动植物之间相互的生态关系），把局部与整体的同一化是简单的还原论，却并非是系统的思维模式。注*： 1999年-2001年列有R.Rosen和D.W.Thompson有关1968年系统（理论）生物学与1910年合成生物学（化学概念）术语，以及E.Kool、E.Hafen和T.Pawson等的文献。1996年和2000年Bj.Zeng的国际交流，包括，美国avigenics公司（输卵管生物反应器）、L.Hood（转基因会议）和N.Seeman（生物计算机）、M.Tomita（BSSE会议）等通信。附 - 《结构论》（1983-2016）- 4轴心时代与4世界理论 - 曾邦哲（ Bj.Zeng ）的探讨：I-系统医学与药物学的科学范式和精准（个体化与转化）医学的临床模式；II-道德经济学（论语与工匠）和城市群与地缘文化 - 《星际情殇》（2003-2006）- 幻象诗与显现绘画和火星社会（2017-2019）- 从中古代到近现代和后现代的学术范式和产业模式转换，包括，物理与生物科学、社会与认知科学的理论体系，以及社会运作机制转型，从地球文明拓展到行星际文明 - 外太空的医疗与生物技术探索等。 1）出生在茶马古道上的湘中，芍药园、万花筒和望远镜（奥匈语系文字，外公12岁失去了父母）是童年印记，1972年翻阅中西医药书籍，1976年家里的传统习俗和埃舍尔的几何绘画与物理学，导致了对科学与史学的兴趣，在中学时代，产生了光合作用仿生工厂、微电子遥控昆虫飞行和蚂蚁神经节网络结构的设想。1983年在生物物理学与心理生物学的交叉层面形成了结构论，1984年李约瑟的讲演和厦门大学人类博物馆的影响，走向了探索科学和文化的历史、哲学与社会学等。 2）1985-1994年湖南衡阳和湘潭的农学与医学院校任教动物学和医学遗传学与生药学，1987-1991年探讨拓扑生物学、诺依曼自动机理论、中西医学比较和行为与心身医学（神经-内分泌生理与遗传学）等。1991年论述系统科学-人工智能-基因工程整合的太阳能-生物电子SBE技术，1992-1994年提出系统医学-系统遗传学与生物工程和输卵管生物反应器与细胞仿生工程 - 网络拓扑学与生物电子学方法。 3）1994-1997年在中科院微生物研究所 - 贝克曼基因表达差异显示分析示范实验室，探讨生物系统理论（宝林曼公司细胞信号传导和代谢网络挂图）和生物信息技术与分子生物技术，1995-1997年开展基因片段的设计与组装合成全基因，建立耐药细胞系与连续突变筛选方法。 4）1997-2006年以色列特拉维夫、德国汉诺威和英国伯明翰，神经-内分泌与脂类代谢的细胞信号传导与基因表达调控研究。2002年在德国的医学检测（类脂），得到一个蓝白双色提袋和两件紫色衣裳的礼物（一件给女儿有一朵红玫瑰），2003-2007年探讨东西方文化与交流的历史，分析了犹太文化与道家-儒家文化等。 5）2007年参加“春晖杯”创新创业，回国参观了嘉祥曾子庙和苏州胥王园，2008年成立系统生物工程研究所ltd.，2007-2012年论述4次科学革命和第3次（计算机与互联网）与第4次（人工智能与合成生物）工业革命，以及生物工业和“社会-心理-生物”与工程医学模式等。2009-2010年论述细胞传感器与反应器和纳米机器设计3条原则，2012年国际系统医学大会邀请做学术报告。 6）2014年启动细胞分析与合成Molnet1.0的系统生物技术开发，以及神经元-细胞网络的系统设计与人工合成，用于天然药物次生代谢表达谱分析与药物发现的微流控芯片等。 ---（2011年-2020年网络日记）---; 个人分类: 系统医学与药物学|1972 次阅读|0 个评论

系统与合成生物学 - 体系结构: benlion 2018-7-15 06:43; - 1992年系统医学-1993年生物系统理论（图论与网络拓扑学分析）-1994年系统遗传学（细胞进化与发育的非线性动力学）与系统生物工程（太阳能与生物电子学设计）-1996年系统与合成生物学的BSSE偶合（生物系统的科学与工程转化）概念与方法。稻盛和夫每日一谈 O 网页 - 科学的起点是哲学，企业的起点也是哲学，这是就创造与创新而言的，而格物致知和知行合一，才能走向可操作的科学实验和可实施的企业方案。比如，从系统科学与综合哲学到结构论，理论与数学生物学 - 计算生物学与生物信息学，实验与分子生物学 - 纳米与化学生物学等交叉与整合，以及生物系统的科学与工程偶合，构成系统与合成生物学方法体系的发展。（中国）（日本）（美国）（德国）（以色列）结构论不同于构造论( http://www.doc88.com/p-509932323404.html )，而是系统科学的综合理论。霍金说 O 网页应该勇敢移民外太空，人类距离这个目标还有多远？ O 网页 - 摄星计划，探索半人马座 O 网页 - 霍金的物理学属于上世纪 70 年代之后的后现代社会，不同于生活在社会交织网的微观世界，而是仰望星空，飞翔在未来的宇宙时空里穿越星际。人类科学发现的两大飞跃，一是细胞的结构与生物进化，二是原子的结构与星系演化。《星际情殇》 -BjZeng （ bjTseng ）的理论出发点是外尔的规范场论和对称与破缺，而面向的是未来的星际文明 - 具体体现在系统生物工程的 “ 生态 - 制造 - 医疗 ” 综合体系和人工生物与智能机器设计的探索。一张通往 “ 三体世界 ” 的地图 O 网页 - 解开拉普拉斯月球之谜 - 引力三体问题 O 网页 - 三体问题有解了：用深度学习分析多体问题中的混沌现象 O 网页 - 从三体问题说起 - 混沌与非线性科学初探 O 网页 - （ 2018 年 7 月网络日记） -; 个人分类: 中国|2305 次阅读|0 个评论

系统医学体系结构: benlion 2016-10-8 10:27; 系统与合成生物学-系统遗传学与生物工程（生理学与遗传学和仿生学与转基因）-〉理论与计算（数学与网络生物学）和实验与工程（化学与纳米生物学）-生物系统科学与工程-整合与建构生物学（SCNB科学与Nieb技术） -（2011年-2016年网络日记）-; 个人分类: 系统医学与药物学|2250 次阅读|1 个评论

系统医学协会: benlion 2014-12-2 17:09; 系统医学于1992年在中国提出，1999年在德国建立英文网 - 公布了模型和方法体系，以及生物系统的科学与工程（当时探讨在瑞士设立协会）的概念和从实证到综合（synthetic）的生物系统与人工生物系统理论，包括，系统理论（ http://www.exploratorium.edu/complexity/CompLexicon.html ）、生物信息学和生物技术及基因工程方法等。意大利成立的系统医学协会（ http://www.medicinasistemica.it/index.php ）描述的系统医学，以及瑞士ETH大学的D-BSSE（ http://www.bsse.ethz.ch/ ）描述的系统生物学与合成生物学概念和方法等，比较符合我的思维和观点，应该可以提供比较合理的范式参考和研究与发展思路。也就是说：理论和方法的范式已经建立起来，接下来的是进行具体的科学发现和技术开发。生物的基因组、蛋白质、代谢组及基因序列、蛋白质结构和代谢分子的解析与合成等，已经可以成为规模化、程序化和机器化操作与计算机软件的数据处理等；然而，难题是生物系统的机理揭示和新的技术发明，以及数学模型、计算机模拟和微电子学原理、微-纳米加工等应用，以及生物系统的人工设计与制造。注：系统遗传学与系统生物工程是1994年在中国提出，其中，系统遗传学是在中科院的时期。 -（中医、西医与未来医学）-; 个人分类: 201415|1515 次阅读|0 个评论

系统生物学简史: benlion 2014-8-6 11:48; 20 世纪 60 年代贝塔朗菲提出理论生物学和系统论、数学方法的生物系统研究，在生理学和生物化学（ MA.Savageau ）层面的系统论和控制论发展， D.Nobel 发表心脏起博（ pacemaker ）数学模型和 R.Rosen 发展了数学系统论。 1968 年 Mesarovic M. 在国际系统论与生物学（ systems theory and biology ）会议提出系统生物学（ systems biology ）词汇， 1993 年 Zieglgansberger W. 和 Tolle TR 提出将系统生物学方法用于神经疾病研究。 1910 年 Leduc S. 提出合成生物学（ synthetic biology ）词汇和化学合成生命形态的概念， 1974 年 Szybalski W. 和 1980 年 Hobom B. 等表述为 DNA 分子基因重组概念， 2000 年发表 XDNA 人工合成的 Kool E. 重新提出合成生物学。 1992 年曾邦哲（ BJ.Zeng ）提出系统医药学（ systems medicine pharmacology ）概念和词汇，以及分子、细胞系统的发生动力学模型，论述了经络网络是图论与拓扑学模型、神经 - 内分泌与免疫调控的机能整合，代谢（消化 - 呼吸与泌尿）、循环等器官平衡稳态、分子细胞生物系统的节律与形态转换的病理与药物学研究， 1994 年提出细胞仿生工程、禽类输卵管生物反应器（ oviduct bioreactor ）和系统生物工程 (systems bio-engineering 或 biotechnology) 等概念，论述基因系统与蛋白质、酶系统等对应表达调控的进化与发育遗传机制和细胞动力学等研究的系统遗传学（ systems genetics ）概念，从而仿造与改造生命合而为人工生物系统（ artificial biosystem ）概念。 1996 年 -1999 年曾邦哲论述结构论（ structure theory ）和系统生物科学与工程（ BSSE ） - 生物系统与人工生物系统的理论与实验、计算与工程方法研究， 1996 年在第 1 届国际转基因动物学术研讨会讲述了生物系统论（ bio-system theory ）和系统生物工程，应用系统论方法（ systems approach ）的进化、发育遗传学与转基因生物技术的机制等观点， 1999 年在德国筹备国际会议、协会和建立网站（ genbrain biosystem network ， 10 月 Nature 和 12 月 Kybernetes 等），倡导以分子生物技术、计算生物技术和转基因生物工程等方法，阐述从分子、细胞到器官等层面，从实证（ positive ）分析到系统综合（ synthetic ）的系统生物科学与工程研究，以及细胞基因组是类同计算机软件系统的基因组智能（ genomic intelligence ）可以设计和编程，包括转基因（ transgenics ）与仿生学结合的细胞通讯分子电路设计概念图等。 1998 年生物制造（ J.Bollinger ）的概念提出和 DJ.Watts 和 SH.Strogatz 发表小世界网络（ small-world networks ）理论， 1999 年 S.Leibler 的生物化学和代谢系统鲁棒性（ robustness ）理论，以及 M.Tomita （以及 Venter J.R. 研究组）的 E-cell 模型等，切奇（ GM.Church ）的组学芯片系统（ systematic ）方法， N.Seeman 和 T.Knight 组织国际 DNA 分子计算机会议与维斯（ R.Weiss ）发表活体生物分子计算机等研究。 2000 年 L.Hood 和 R. Aebersold 等建立系统生物学研究所， H.Kitano 和 M.Tomita 举办系统生物学国际会议。 2001 年 O.Wolkenhauer 、 T.Ideker 和 L.Hood 与 H.Kitano 等，分别从系统论和数学方法、组学高通量实验与生物信息或计算机模型（软件）等论述生物系统研究， AP.Arkin 发表合成细胞生物学的工程设计方法。 2003 年国际形成系统生物学的理论和实验（ omics ）、计算（ in silico ）方法研究生物系统的概念共识， 2003 年个体化医学（ S.Benner ）和转化医学（ FM.Marincola ）等概念发表， 2003 年 -2005 年 T.Knight 和 J.Collins 等论述工程方法和人工设计的合成生物学概念， 2005 年 D.Endy 论述为工程生物学的人工生物系统研究。 2007 年瑞士 ETH 建立系统生物科学与工程（ D-BSSE ）研究中心，英国 RI.Kitney 提出系统与合成生物学偶合，曾邦哲论述不仅是生物医药而且是制造工业，将导致第 3 次工业革命。 - （ Systems Medicine – Systems Genetics Biotechnology ） -; 个人分类: 历史|3000 次阅读|0 个评论

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