Deciphering the Diploid Ancestral Genome of the Mesohexaploid Brassica rapa renchunxiao 添加于 2013-5-30 15:20:13 265次阅读 | 0次推荐 | 0个评论 The genus Brassica includes several important agricultural and horticultural crops. Their current genome structures were shaped by whole-genome triplication followed by extensive diploidization. The availability of several crucifer genome sequences, especially that of Chinese cabbage (Brassica rapa), enables study of the evolution of the mesohexaploid Brassica genomes from their diploid progenitors. We reconstructed three ancestral subgenomes of B. rapa (n = 10) by comparing its whole-genome sequence to ancestral and extant Brassicaceae genomes. All three B. rapa paleogenomes apparently consisted of seven chromosomes, similar to the ancestral translocation Proto-Calepineae Karyotype (tPCK; n = 7), which is the evolutionarily younger variant of the Proto-Calepineae Karyotype (n = 7). Based on comparative analysis of genome sequences or linkage maps of Brassica oleracea, Brassica nigra, radish (Raphanus sativus), and other closely related species, we propose a two-step merging of three tPCK-like genomes to form the hexaploid ancestor of the tribe Brassiceae with 42 chromosomes. Subsequent diversification of the Brassiceae was marked by extensive genome reshuffling and chromosome number reduction mediated by translocation events and followed by loss and/or inactivation of centromeres. Furthermore, via interspecies genome comparison, we refined intervals for seven of the genomic blocks of the Ancestral Crucifer Karyotype (n = 8), thus revising the key reference genome for evolutionary genomics of crucifers. 作 者： Feng Chenga, Terezie Mandákováb, Jian Wua, Qi Xiec, Martin A. Lysakb,1 and Xiaowu Wanga,1,2 期刊名称： the plant cell 期卷页： 第卷 第期 页 学科领域： 生命科学 植物学 植物资源学 添加人是否为作者: 否 原文链接： http://www.plantcell.org/content/early/2013/05/06/tpc.113.110486.abstract?sid=82d07340-7ef9-4db7-b4bc-7046526245a9 白菜等蔬菜祖先基因 Deciphering the Diploid Ancestral Genome of the Mesohexaploid Brassica rapa renchunxiao 添加于 2013-5-30 15:20:13 266次阅读 | 0次推荐 | 0个评论 The genus Brassica includes several important agricultural and horticultural crops. Their current genome structures were shaped by whole-genome triplication followed by extensive diploidization. The availability of several crucifer genome sequences, especially that of Chinese cabbage (Brassica rapa), enables study of the evolution of the mesohexaploid Brassica genomes from their diploid progenitors. We reconstructed three ancestral subgenomes of B. rapa (n = 10) by comparing its whole-genome sequence to ancestral and extant Brassicaceae genomes. All three B. rapa paleogenomes apparently consisted of seven chromosomes, similar to the ancestral translocation Proto-Calepineae Karyotype (tPCK; n = 7), which is the evolutionarily younger variant of the Proto-Calepineae Karyotype (n = 7). Based on comparative analysis of genome sequences or linkage maps of Brassica oleracea, Brassica nigra, radish (Raphanus sativus), and other closely related species, we propose a two-step merging of three tPCK-like genomes to form the hexaploid ancestor of the tribe Brassiceae with 42 chromosomes. Subsequent diversification of the Brassiceae was marked by extensive genome reshuffling and chromosome number reduction mediated by translocation events and followed by loss and/or inactivation of centromeres. Furthermore, via interspecies genome comparison, we refined intervals for seven of the genomic blocks of the Ancestral Crucifer Karyotype (n = 8), thus revising the key reference genome for evolutionary genomics of crucifers. 作 者： Feng Chenga, Terezie Mandákováb, Jian Wua, Qi Xiec, Martin A. Lysakb,1 and Xiaowu Wanga,1,2 期刊名称： the plant cell 期卷页： 第卷 第期 页 学科领域： 生命科学 植物学 植物资源学 添加人是否为作者: 否 原文链接： http://www.plantcell.org/content/early/2013/05/06/tpc.113.110486.abstract?sid=82d07340-7ef9-4db7-b4bc-7046526245a9
随着网络等新型媒体的快速发展，传统出版和网络媒体之间有一场你死我活的较量。 以前关注过 维基百科和大英百科全书之间的较量 ，现在的中文媒介的 百度百科 和 互动百科 也很发达。 同时， 亚马逊网站 的发展也是比较神速，占领了世界很大的市场，这里关注一下传统纸质出版媒体企鹅出版集团（ Penguin Group ）和兰登书屋（ Random House ）的结合，对抗亚马逊。 欧盟企业竞争事务管理机构星期五（4月5日）批准了世界著名出版商企鹅出版集团和兰登书屋合并的计划。 两家公司的合并将创造全世界最大的出版集团，新创建的企鹅兰登书屋将控制全世界大约四分之一的大众图书市场。 欧盟委员会发表的声明说，这项合并计划“不会引起竞争方面的担忧，而合并后的新企业仍将面对数个强大的竞争对手”。 分析人士表示， 合并后的企业将会控制全球26%的大众图书市场，而法国出版商拉加代尔将以17%的市场份额名列第二。 在欧盟做出上述决定之前，美国企业竞争事务管理当局已经在2月份批准了这项合并计划。加拿大企业竞争事务局和其他管理机构目前仍然在评估合并可能产生的影响。相信不久必然批准。 一起对抗亚马逊 在企鹅出版公司和兰登书屋合并之后，作为兰登书屋母公司的德国贝塔斯曼传媒集团将拥有新公司53%的股权，这将涵盖两家公司目前在美国和其他6个国家的所有出版单元。 贝塔斯曼传媒集团星期五发表声明，对欧盟的最新决定表示欢迎。 这项合并计划被广泛看成是针对著名网购公司亚马逊（Amazon.com）发动的反制行动。 此前，亚马逊以低廉价格出售网络书籍，引起国际出版商的严重不安。 这次合并将不仅仅涉及两家公司在美国的出版单元，还还导致在加拿大、英国、澳大利亚、新西兰、印度、南非的两家公司出版单元的联合运作。 合并还将涉及企鹅出版集团在中国的业务，以及兰登书屋在西班牙和南美洲的业务。 两家公司最初是在2012年10月宣布这项合并计划的，预料整个计划能在今年下半年完成。 小资料： 企鹅出版社 成立于1935年，总部在伦敦，目前在全世界15家分支机构，雇员3500人，年销售数目110百万本，2011年交税10亿英镑。 兰登书屋 成立于1925年，总部在纽约， 目前在全世界15家分支机构，雇员5300人， 年销售量400百万（包括书本，音频和数码）， 2011年交税15亿英镑。 英文报道： Penguin and Random House merger approved by Brussels he proposed merger of Penguin and Random House has been given the go-ahead by the European Commission.
看过电影闻香识女人 (Scent of a Woman) 的人估计都会被男主角超人的能力所折服，瞎子艾尔 · 帕西诺能够通过女人身上的香味猜测姓名、辨别体貌特征和性格特点，甚至是家庭背景，虽然夸张点，但足以反映了一个有阅历男人的魅力。美国科学家发现企鹅也有如此般的 “ 特异功能 ” 。 通过体味识别信息在昆虫中普遍存在，但在企鹅中发现倒很新鲜，他们的研究论文 Odor-Based Recognition of Familiar and Related Conspecifics: A First Test Conducted on Captive Humboldt Penguins ( Spheniscus humboldti ) 近日发表在 PLoS ONE 上。科学家从企鹅的尾部一腺体获取一种气味分泌物，之后涂抹在狗窝里，观察企鹅在狗窝里的逗留时间。如果狗窝里的分泌物是企鹅的非亲缘不熟悉的，相比于非亲缘熟悉的逗留时间明显偏短，说明了企鹅对熟悉的气味更能亲近，企鹅能够分辨出熟悉的和不熟悉的气味。在第二个试验中科学家发现相比于不熟悉的亲缘，企鹅会逗留更长的时间在不熟悉的非亲缘的狗窝里，说明企鹅能够分辨亲缘和非亲缘，对新奇的气味比较感兴趣，而这据说可以避免自交衰败。这项研究有两个明显的意义，一是可以用于濒危动物的保护，如在设计迁地保护方案时，可以在迁入地加入动物熟悉的气味，帮助动物快速适应新的栖息地。另外，他们的研究也从新的角度解释了企鹅是如何避免近亲繁殖的。 令我困惑的是，从整个研究来看，企鹅好像既喜欢熟悉的气味，又对不熟悉的气味有偏好，好像有点矛盾。 被誉为现代生物学之父的达尔文娶自己的近亲结婚，结果其子女多不健全，人类好像缺乏避免近亲结婚的生物学机制，即使在上世纪 60 年代的中国依然有很多表亲结婚现象。现在近亲结婚在优生优育的国策下已经明显减少了，随着我国一个家庭一个孩的政策持续执行，近亲结婚的外部条件都不会存在。有一点我们人类不同于动物的区别就是，我们往往通过文化这种更强大的约束力来避免繁衍出孱弱的后代。
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