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tag 标签: 无参考基因组

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如何让无参考转录组数据更有效
热度 1 Bearjazz 2014-1-8 09:09
熊荣川 六盘水师范学院生物信息学实验室 xiongrongchuan@126.com http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz 无参考基因组的转录组数据通常使用从头组装的方式,因为二代测序技术很多都是断读段测序,不可避免地要产生一些“人工”基因,那么在这种情况下有什么方法或者原则可以优化结果,排除假阳性呢? 下面这些原则来自《基因九》 1、 单纯靠序列推断出来的开放阅读框最好大于100个氨基酸 2、 有效的基因应该在近缘物种中能找到同源基因
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