文章： EXTRACT: interactive extraction of environment metadata and term suggestion for metagenomic sample annotation 2016 （ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26896844 ） 文章： Network construction and structure detection with metagenomic count data 2015 （ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26692900 ） 文章： COGNIZER: A Framework for Functional Annotation of Metagenomic Datasets 2015 （ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26561344 ） 文章： SUPER-FOCUS: a tool for agile functional analysis of shotgun metagenomic data 2016 （ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26454280 ）
前些天说“注疏”，说到数学玩儿家 Martin Gardner 的爱丽丝，后来又说起 薛定谔 的《 自然与希腊 》，那两个人没关系，那两本书也没关系，但在我这儿有点儿关系。 且说那年， 1965 年 7 月 16 日 ， 阿西莫夫 老师与 Basic Books 的出版商一起吃午饭，马丁也在。阿西很佩服马丁，读过他的每一本书——就像小时候我们读阿西的书一样（很奇怪那会儿阿西的书多而马丁的书少）。阿西说，马老师最成功的书就是那本爱丽丝的注疏 The Annotated Alice ，他从头到尾读过好多遍。马老师笑答， 如果我真想找乐，就会找本特别喜欢的书来给它做注释 （ find a book I liked very much and annotate it . ）（英文都引自阿西的自传 I, Asimov, a memoir , Bantam Books,1995 ） 阿西以前本来也做过类似的事儿，如 Asimov’s Guide to the Bible 和 Asimov’s Guide to Shakespeare ——我有前一本，但更想后一本，可还没见过呢。他做那两本书时，已经想好怎么回答读者的诘难：阿西怎么不老老实实写他的弱智科幻，却跑到他一窍不通的地方来？（ why doesn’t Asimov stick to his stupid science fiction and not try to thrust himself into fields he knows nothing about ? ） 尽管有位自负的矮个子（ short and conceited ）文学教授在 Times 上说阿老师的莎翁不值一评—— 20 多年后，他还耿耿于怀——但书卖得不错，所以阿西自信能把注疏的事儿做得很好。后来，他注释了《唐璜》、《失乐园》、《格列佛游记》和一些诗歌（遗憾的是，这几本书我都没见过）……他也许还想做荷马史诗，可原文是希腊文， you can’t go by any of the numerous translations . 我做翻译的时候也偶尔做些注释，一般背景的注释没什么可说的，还有的注释我自以为有点儿意思，因为那是我本来疑惑而后来大概明白的东西，我想应该与读者分享。记得 H awking 在“大尺度”（ The LargeScale Structure of Space-Time ）里用过一个名词： Horismos （第 6.2 节），意思是“边界”（如 the future horismos ），用它是为了与“视界”（ horizon ）对应，可这个词儿的根据呢？我在 海德格尔 那儿找到一段很有意思的话，算是解决了自己的疑问（读者读译文，是不会遇到这个问题的）。（那个有趣的名词，这儿不重复了；见 http://blog.sciencenet.cn/blog-279992-249068.html ） 在《时间空间和万物》的译后记里，我为我的注释找了一个借口，也确实是一种乐趣： 小书的可爱还在于作者引用了许多古典文学作品的片段，那些句子固然能唤起一些物理学的联想，还原物理学的艺术本色；而更多的大概还在增添作者写作的乐趣，读者阅读的乐趣，当然那也是译者翻译的乐趣 — 有关的背景我都尽可能多说几句，不怕跑题，不怕罗嗦。但愿读者能根据那些脚注去发现物理学以外的天地，去熟悉 Black, Corroll, Elliot ， …… ( 莎翁和弥尔顿当然不必说了 ), 但愿作者不会怨我把他的书引向了“绝对的他乡”。 其实，我还真做过一点注疏的，一本就是薛老师的那个演讲，还有一本是哈代老师的“自白”（ A Mathematician’s Apology ），不过因为版权的原因（用剑桥的 Canto 丛书版），评注很简略 (好像是不能超过原文的10%)，有点儿不过瘾。于是写了篇 20 页的后记，冒充“导读”——开头谈了我对那个 apology 的理解： 这篇自白，是哈代感觉失去了数学创造力之后的作品，是一个落魄的英雄的真言，少了英气却多了儿女情。“自白”（ apology ）是苏格拉底的传统，更准确的意思是“辩护”。哈代本想替数学辩护，尽管在人们看来数学不需要辩护，“因为不论从好的还是坏的理由说，现在没有哪样学科像数学那样被广泛承认，既能带来好处，也值得赞美”；但这并不令哈代满意，令他那样的“真”数学家满意。所以他要“辩护”（ defence ），不过，“我替数学的辩护也是替我自己辩护，因而多少有些自我和随意。”换句话说，哈代的“辩护”，更像纽曼（ John Henry Newman ）在 Apologia Pro Vita Sua （“为吾生辩护”，有人将这书名译为“生命之歌”）里的意思，是一曲“数学之歌”，也是哈代的生命之歌，因为数学就是他的生命。我们还可以说，“自白”是一篇宣言，关于数学美的宣言。当年哈代 63 岁，照他自己的观点，这把年纪不能玩儿数学了。他的话，更多是说给下一代人听的。
using System; using System.Collections.Generic; using System.Text; using System.Collections;//以上为引用各个命名空间 namespace AddressBook { public class Book { Record rec;//定义一个Record类 public ArrayList records;//定义一个ArraryList型实例 public bool state;//定义一个bool类型的公有变量 public Book()//初始化records和state { records = FileVisit.Fill(); state = true; } public ArrayList FillRecord()定义一个返回值类型是ArrayList的函数 { return FileVisit.Fill();//函数的返回值 } public void AddRecord(string name,string phone,string address) {//定义一个带有3个String类型参数的函数 Record record = new Record(records.Count,name,phone,address);//实例化一个Record类 records.Add(record);添加一条记录到records } public bool DeleteRecord(int _id)//定义一个返回值是bool类型，且带有一个int型参数的函数 { Record rec = FindRecord(_id);//定义一个Record型变量，赋值为FindRecord(_id)的返回值 if (rec != null)//如果rec为空 { records.Remove(rec);//删除rec return true;返回true } else return false;//如果不为空。返回false } public Record FindRecord(int _id)定义返回类型为Record、参数类型为int的函数 { foreach (Record record in records)//用循环一次检测并进行以下判断 if (record.Id == _id)//如果record.Id 与传进来的参数相等 rec = record;//赋值 else rec = null; return rec; } public bool ModifyRecord(int _id, string _name,string _phone,string _address)//定义bool类型的函数，带有4个参数 { Record record = FindRecord(_id);//实例化一个Record类型的类 //以下为对各个成员的赋值 record.Id = records.Count; record.Name = _name; record.Phone = _phone; record.Address = _address; state = false; return state ; } public void UpdateRecord()//更新records { FileVisit.Update(records); } } }
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