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影响SARS-CoV-2 S蛋白与ACE2和中和行抗体结合的关键氨基酸相关研究
IPBCS 2020-6-23 21:14
影响SARS-CoV-2 S蛋白与ACE2和中和行抗体结合的关键氨基酸相关研究 本文为读后感,原文见文后,读后感作者侯鹏姣 目前,由新型人类冠状病毒SARS-CoV-2引起的2019年冠状病毒疾病(COVID-19)是全球公共卫生的主要威胁。通过对该病毒的基因测序表明SARS-CoV-2与SARS-CoV相似性很高。因此,前期关于SARS-CoV的大量研究提供的有用信息,可直接用于对抗SARS-CoV-2。但是新型冠状病毒在某些方面(如抗原表位)也具有不同的特征,需要进一步深入研究。该博文介绍的主要内容是近期发表在“ Cellular Molecular Immunology” 的一篇研究论文,该文章揭示了SARS-CoV和SARS-CoV-2之间存在不同的关键抗原表位,这为疫苗和抗体的研发提供了更全面的信息。 前期研究表明,SARS-CoV-2使用与SARS-CoV相同的病毒入侵机制,即通过其表面的S蛋白中的RBD结合人类功能受体ACE2(hACE2)从而完成病毒的入侵,这是病毒进入靶胞的关键步骤。通过对两种病毒的序列比对发现,RBD的同源性只有73.5%,而 RBD 的功能基序(RBM)的同源性仅47.8%。尽管两种病毒RBM序列差异显著,但仍可以引起抗体交叉反应,因此其中的机制有待阐明。作者主要通过以下几个方面进行验证。 1. SARS-CoV 和SARS-CoV-2 RBD均通过与hACE2结合以感染细胞 研究者分别构建可表达S蛋白的 SARS-CoV 与SARS-CoV-2的假病毒进行细胞感染实验,实验结果显示,相对于对照组,表达ACE2的HEK293T细胞对SARS或SARS-CoV-2病毒更易感。 为了进一步探究S蛋白在SARS-CoV与SARS-CoV-2感染入侵种的重要性,作者又设计了合胞体实验进行验证。利用HEK293T细胞分别表达ACE2蛋白与SARS-CoV与SARS-CoV-2的S蛋白,发现两种细胞可融合形成合胞体。 除此之外,作者还通过BLI和ELISA实验定量的分析ACE2与S蛋白之间的亲和力,BLI结果表明, SARS-CoV-2-RBD 与hACE2结合的 解离常数为5.09nM,而对于SARS -CoV-RBD 为1.46nM。 2. SARS-CoV RBD 和SARS-CoV-2 RBD的独特免疫原性 基于两种病毒RBD序列之间的保守性(76%),作者进一步确定两种病毒的RBD是否引起交叉反应免疫反应,以提供对两种病毒的保护。 研究者首先设计体内免疫实验,分别用重组表达的SARS-CoVS和SARS-CoV-2 S蛋白注射到小鼠体内,引起小鼠的体内免疫反应。将小鼠免疫血清分别与两种病毒的RBD进行ELISA实验,结果表明小鼠的免疫血清对同种病毒的RBD具有强的结合能力,但是对另一种病毒RBD的结合能力较低; 研究者进一步利用小鼠产生的免疫血清,阻断ACE2和RBD之间的结合,证实了 免疫血清对相同病毒具有显著抑制作用,但对另一种病毒交叉保护效率很低。同时,作者结合加病毒中和实验,研究两种病毒之间的交叉免疫保护反应,结果显示,两种病毒之间交叉保护效率很低,表明两种病毒具有不同的免疫原性。 3. 确定影响SARS-CoV和SARS-CoV-2中影响RBD受体结合水平的关键氨基酸 高分辨率的晶体结构显示,RBM形成了S蛋白和ACE2相互作用的表面,结合结构生物学信息,作者设计了一系列突变以确定核心氨基酸。其中,9个氨基酸的突变( SARS-CoV-2 to SARS-CoV )可以使得SARS-CoV-2 RBD与ACE2之间的 亲和力完全丧失;而6种突变可以增强它们之间的亲和力。 作者进一步将 SARS-CoV 中的6个氨基酸替换为SARS-CoV-2中的相应氨基酸,亲和力显著降低。作者还进一步分析并确定了SARS-CoV和SARS-CoV-2中 RBD-ACE2 的关键识别位点是不同的,这也解释了为什么两种病毒无法引起交叉免疫保护。 4. 突变实验确定影响病毒中和实验和单克隆抗体结合的核心氨基酸 作者分别选取了6种中和性单克隆抗体:5种针对 SARS-CoV (80R, S230, m396, CR3022 和 N-176-15);1种 针对 SARS-CoV-2 (HA001)。利用 中和抗体鉴定两种病毒的免疫原性,发现除 CR3022外,其他抗体只能结合一种病毒,假病毒试验也说明两种抗体均无法中和另一种病毒。 在此基础上,作者通过对 SARS-CoV-2 和SARS-CoV 设计出一系列突变实验,对影响RBD与中和抗体结合的核心氨基酸进行鉴定。 总体而言,以上研究表明SARS-CoV和SARSCoV-2之间存在不同的抗原表位,并对这些关键核心位点进行了确认。这表明有必要开发新的预防性疫苗和抗体药物来特异性控制COVID-19大流行。 原文链接: https://www.nature.com/articles/s41423-020-0458-z
个人分类: 读后感|5027 次阅读|0 个评论
好心劝我买驱蚊品防新冠病毒的朋友被我得罪了
jiasf 2020-4-7 08:48
有朋友微信告我,夏天要来了,买些驱蚊用品备用。 我回说夏天潮湿,倒是可以买些干燥剂樟脑丸,防止柜子发霉长虫。 朋友:樟脑丸又不能防蚊!蚊子叮咬可能传播新冠病毒,要防着点。 我:目前没有证据蚊子可以传播新冠病毒。新冠病毒病毒主要是在带有ACE2受体的哺乳动物间传播的。(后来查资料,说鸟类也带ACE2受体) 朋友:有专家说有可能性。 我:不要光听专家说,有些所谓专家并不懂。我们不是要学科学、用科学吗?要把科学道理搞懂。 朋友:你真是不知好歹,好心提醒,却反被你说成不懂道理,好无趣! 我当然感激朋友的好心,不过也希望普及点科学知识,只是客观讲点道理,希望朋友能理解,没想到还是把朋友惹恼了!看起来说真话、讲道理,真不总是丢人听!对不起了,我的朋友。 凡事总该有人言,众人皆默待何人? 三人言虎未必虎,唯求真理言务真。 真话当时遭人恨,但希他日知意纯。 只念真言于事补,言无不尽忘言轻。
个人分类: 生活点滴|4638 次阅读|0 个评论
ACE2抑制剂(ACEI)能够抗新型冠状病毒(2019-nCoV)吗
zzmoxue 2020-2-11 16:02
中国科 学院武汉病毒研究所石正丽团队发现 2019-nCoV 可以类似于 SARS-CoV, 通过 ACE2 受体蛋白进入人体。 那: 1)临床有高血压史、联合使用ACEI降血压的新型冠状病毒感染者与普通患者相比,疗效、病程或者死亡率具有显著差异吗? 2)ACEI干预,有可能会改变ACE2蛋白构象,进而阻断或者干扰2019-nCoV感染细胞吗? 欢迎讨论、有条件的科学家试验尝试。 Peng Z. et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature, 2020.
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武汉新冠病毒肺炎患者治疗中待回答的科学问题(同抗病毒药物/中和抗体/疫苗研发相关)
immunology 2020-2-11 14:01
武汉新冠病毒肺炎患者治疗中待回答的科学问题(同抗病毒药物/中和抗体/疫苗研发相关) 1 患者的轻症、重症、危重症和2019-nCoV载量的关系?和体内中和抗体水平的关系? 2 较 长潜伏期个案的比例和可能机制?【比如(1)10天以上潜伏期的患者(2)1例24天潜伏期(2020-02-10:medRxiv文章)(3)1例42天潜伏期( 2020-02-11 山西省晋中市卫健委官网),这些患者病史的准确性要反复核实!!!】 3 患者潜伏期、治疗期、康复期、康复后体内中和抗体的水平?中和抗体的保护性和二次感染的可能性? 4 轻症状/无症状(核酸确诊)个体自我康复是和病毒载量/变异相关还是和个体免疫差异相关? 5 治疗中针对病毒(Remdesivir等)、针对宿主ACE2及中药辅助等其他支持疗法,各单位的治疗方案(比如早期和联合应用等)的 数据 和效果及时共享和系统评估 。 2020-02-11 于遵义
个人分类: 科研工作者|2727 次阅读|0 个评论

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GMT+8, 2024-4-27 08:09

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