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杂说“尺”

热度 1 fdc1947 2020-9-15 08:26

杂说“尺” 尺是我国传统度量长度的基本单位。在人类的历史上，人们最早都是用自己的身体去度量外界的世界。 有人说，最早的时候人们把大拇指与食指张开，量得的长度就是一尺（据说商代的尺就是这样长）。也有人说，古人把手腕处的动脉称为寸口，从寸口到手掌根部的距离就是一寸， 一尺等于十寸。 总之， 尺或者寸是用来度长短的“基本单位” ，所以， 尺寸就有了“长度”的意思 。在长度这个近代才有的科学词汇出现之前，人们一般就用“尺寸”这个词来表示东西的长短或大小。 《说文》说：“ 周制寸、咫、尺、仞、寻、常诸度，皆以人之体为法 ”。汉代人就认识到人们以人体度量世界。其实世界各地几乎都是如此。例如英国人以脚（foot）为长度的基本单位，我们造了一个字来翻译这个长度单位，呎。不过现在我们不大用这个字，就直接称英尺。 孟子说：“度，然后知长短”。度就是“知长短”的意思（现代意义上的长度、体积、重量，古人分别称度、量、衡）。长短也就是尺寸。 商品的交换、国家要征收的税赋，都是需要量度的。商品交换要公平，国家税赋要有一定的标准。所以，长短的标准需要国家来规定，这就叫做“制度”。从字义上分析，“制度”的本义就是规定长度的标准，以后才引申到“各项规章制度”这样的推广的意义上去。 所以，一尺有多长，这个规定，即“制度”，是一种国家的权力，不是随便什么人都能够僭越的。发布标准的尺，也是国家权力的一种象征。 与历史上其他许多抽象的东西不同，我们讨论尺寸的大小时，非常幸运，是有实物作为标准的。 历史上存留下来的尺颇多，材质有铜、象牙、骨、木、竹等。 这样，我们能够知道历史上尺的长短的变化。 周代的尺约长23cm左右，据人们从实存的“商鞅量”（容量，用以盛谷物）推算，商鞅尺的长度为23cm多一点。春秋战国时期的尺大概就是如此。这样我们就能够理解《论语》中所说“可以托六尺之孤”。六尺还不到140cm，确实是需要受人照顾的未成年人。而荀子《劝学》中“口耳之间则四寸耳，偈足以美七尺之躯哉？”七尺之躯就是一米六十几的成年人了，这才是以后人们所说的“七尺男儿”。 根据可靠的实物，西汉尺的平均长度约为23.2cm，东汉尺与之相似而略长，约23.4cm。魏晋时期尺长又略有增长，约在24～24.5厘米之间。 南北朝时期，尺的长度大幅增加，到南北朝后期，增加到30cm。 唐尺存世颇多，长度多在29～30厘米之间。 宋代沿袭唐制，官尺由太府寺掌造，主要用来征收布帛之用,故又称为三司布帛尺,每尺长约31.6厘米。 传世的嘉靖牙尺,所刻线纹精密,每尺长32厘米，当是明朝官定的标准尺度。 清代的营造尺长32厘米。中国历史博物馆所藏“康熙御制”铭残牙尺，每寸合 3.2厘米，与紫金山天文台铜景表尺上的清营造尺长度完全一致。 这里，我们可以看到，随着时间的推移，尺子越来越长，这是什么原因呢？ 中国古代的税赋往往是实物税赋，即上交粮食和布帛（绢等），而布帛是要用尺计量的。政治清平、经济稳定的时候，尺的大小变化很小。如果朝廷“无道”，横征暴敛，官吏贪腐，中饱克扣，除了税赋数量的增加以外，把尺码变大也是一个办法，尺子长度就增加得快。到了改朝换代以后，往往把乱世间增加的长度又固定下来。这样千百年来，尺子就越来越长了。 到了1928年，比较讲究现代化的民国政府决定实行“万国公制”，而作为一个过渡，让原来的传统度量衡暂时使用。把公制的长度单位meter称为粎（音米），现在这个字也不用了，直接称米，又称公尺。为了好换算，把一尺定为三分之一米，这样的尺称为市尺。这个规定，一直应用到现在。 由于一般的尺是直尺，所以人们把形状如直尺的物件也往往称尺。如戒尺（过去法师用以警戒新僧人，教师以此警戒学生）、镇尺（用以镇纸张、书页）、铁尺（一种冷兵器）、计算尺（20世纪中叶，那是理工科大学生和工程技术人员必备的工具，利用对数，把乘除法化成加减法，用途相当于后来的计算器）等。 由于最早用拇指食指量物称尺，人们把一伸一缩往前行进的一种虫子称为尺蠖（《尔雅·释虫》：“蠖，尺蠖”；《 埤雅 》：“ 布指求尺，一缩一伸，如蠖之步，谓之尺蠖” ）。 尺是长度的单位，但又是用来计量长度的工具。最早的形状是直尺的样子，但是实际上又发展为其他的各种量度功能，所以形状也多种多样了。 很早以前的木匠，就不但用直尺，也需要用矩尺来测量垂直线。再扩展一点，就是三角尺，初中的学生和教师都要用三角尺的。 学生学习平面几何，用直尺和圆规作图是必有的内容，直尺画直线、圆规画圆。有趣的是，真正起到“尺”的作用即量度长短的，不是直尺而是圆规。 像圆规那样形状用以丈量土地长度的工具是“弓尺”，现在看不大见了。 比例尺表示图上一条线段的长度与实物相应线段的实际长度之比。可以缩小，如1：50万的地图。也可以放大，如5：1的零件图。过去有一种缩放尺，利用平面四边形的不稳定原理，可以按比例把原图缩小或放大，但是这种尺实际使用时不很好使。 过去画工程技术人员，往往手里拿着作用与矩尺相类似的丁字尺，那是绘图要用的。 要画老裁缝，头颈上总是要挂着软尺，以测量顾客的身材；台板上总要放着直尺和裁衣尺，裁衣尺是一种头上逐渐弯曲的木尺，直的部分可以画直线，弯曲的部分可以画衣服腋下、裤裆等部分的曲线，并量度这些曲线的长度。 体育教师和野外测量人员总是带着长长的皮尺，以测量较长的距离。 机械加工过程中，用直尺测量的精度就太差了，需要用游标卡尺来测量长度或者直径。有时候，需要的精度更高，那就要用到千分尺。 用步枪射击，射击前要先定好步枪上的标尺。子弹行进的过程中受到地球引力的作用，要往下掉一点。定好步枪上的标尺，就是把枪口往上抬一点，以便使以抛物线路线行进的子弹能够正好打中目标。 古代天文仪器上有量度星星间视觉距离的刻度，被称为量天尺。 仙人掌科有一种攀援肉质灌木，分枝有三棱，相当长，故名量天尺，它的果实就是我们常常吃的火龙果。 在极其遥远的星团或星系中，有一类变星（亮度经常变化的恒星），称为造父变星。它的光变周期（即亮度变化一周的时间）与它的光度成正比。也就是说，观测到造父变星的光变周期，就可以得到它的绝对星等，再利用观测到的视星等，根据绝对星等与视星等之间的关系式，就可以计算出这些造父变星与我们的距离，也就是这些星团或星系与我们的距离了。正因为如此，一些科普文章把造父变星称为量天尺。这可是最大的一类尺子了，因为造父变星中距离我们最近的之一为“造父一”（即 仙王座δ，我国古人称造父一，这也是把这一类变星称为造父变星的缘来 ），距离地球也有891光年之遥。折合成公里，那就是8400000000000000公里（8千4百万亿公里）。好大的尺子哟！ 有时候，尺还被想象用以“量度”抽象的东西，例如 ，李白有这样的诗句：“仙人持玉尺，度君多少才；玉尺不可尽，君才无时休。”毕竟是仙人的尺子，可大可小。大的可以大到无穷。 上面所说的，是各种各样的尺子。而尺毕竟是长度的一个单位。在古人那里，一尺长往往就用一个尺字表示。 尺素，素是白色丝织品，这里指绢。在纸张发明以前，绢是可以写字而体积最小、最轻便的材料，贵族们可用以写信，所以尺素指书信。《文选·饮马长城窟行》：“客从远方来，遗我双鲤鱼；呼儿烹鲤鱼，中有尺素书。”书信有时候也称尺鲤。 尺牍，本指古代书写用的一尺长的木简，后借指书信。杜甫有诗句：“聪明过管辂，尺牍倒陈遵。” 尺牍这个词不像尺素那样过于“雅致”，过于贵气，甚至有一点“酸”。因而在一般情况下，普通人用得很多的是尺牍，那时候教人写信的书籍常常以《尺牍入门》之类的名称。 尺八是古代中国传统乐器，竹制，属边棱振动气鸣吹管乐器，原理与箫类似，因为管长一尺八寸，故得名尺八。 随着国际单位制（SI）制的推行和普及，尺作为长度单位的应用将越来越少，而作为量度工具的称呼，则不会消失，甚至不会减少。

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如何用 Roam Research 备课？

热度 1 wshuyi 2020-9-9 10:22

工欲善其事，必先利其器。对老师备课来说，这句话也成立。 题图：Photo by Markus Winkler on Unsplash 需求 作为老师，备课是一件日常工作。 有人可能觉得准备一门新课，确实需要花很多时间。一旦内容成型，讲了一轮之后，下次讲课就可以“按下重播键”，把 PPT 重新念一遍，根本费不了多少力气。 作为懒人，我着实很羡慕那种理想状态。如果有这种一劳永逸的课程，请告诉我。可惜我自己的课，却从来不是那么讲的。 我教的是技术类内容。2009 年开始给本科生上课，到现在 11 年了。09 年时候的前沿技术，到了今天已司空见惯。如果把当年的讲义直接拷贝来使用，我反正是不敢上讲台的——丢不起那个人。 学生们的生活经验也在发生变化。2012 年的时候，我讲信息系统开发，很多例子还可以用电脑硬件打比方。因为当时的大学生们熟悉电脑，至少大概了解自己的电脑有多大的内存和硬盘。今天很多学生，每天只是抱着个智能手机搞定一切。你问他电脑的内存有多大？他告诉你说 512G 。不了解内情的，还以为他是专门从事数字货币挖矿业务的土豪呢。 为了让学生能够更好地吸收知识，授课的内容和方式就得不断变化，与时俱进。因此备课这事儿，是不能偷懒的。在面对每一届学生的时候，都得不断调整。 这谈何容易？ 痛点 《我爱我家》里面，傅明老人提到自己对电脑的需求，说要把一家人犯的错误都记下来，等到批评教育的时候，可以打开电脑信手拈来。从而避免想批评晚辈，却想不起来具体事例的尴尬。 这虽然是个喜剧里面的桥段，但是却有现实的意义。就是我们想要论证某个观点的时候，例子并不一定是现成的。 老师讲课也是一样。在现场，你发现学生对于某个概念不是很理解，于是试图打个比方，来帮助他。结果搜肠刮肚，就是找不出来合适的比方。有的时候类比的结果，是学生更加茫然。 那么下一轮备课的时候，你肯定是希望找到更合适的比方，以便破除尴尬，让你的讲解更为生动流畅。可是你明明记得自己曾经在某个时刻某个地点，曾经想起过一个特别有意思的恰当比方，却就是想不起来了。 另外注意我上面这段话，其实包含了一个隐含条件，就是你下一轮备课(也许相隔了整整一年)，你还能记得起来一年前自己课上遭遇的问题，并且着手去应对。 能有如此准确记忆的人，其实并不多。大部分人，都是到了课堂上，幻灯翻到了那一页，才发现“船到江心补漏迟”。 分析 问题出在哪儿呢？ 其实教师备课的时候，遭遇的最大问题，是“上下文”的错位。 你积累内容的时候，可能并不需要这些内容。等到你需要使用这些内容的时候，却根本找不到它们。因为它们并没有形成一张网络紧密连接，让你可以通过上下文有效联想到它们。它们是零散的，满地都是，你慢慢找好了。运气好的话，总会效率低下地最终找到。 而你准备讲义和幻灯的时候，面对的只是一篇文稿，或者一份 PPT，之前课程讲解中遇到的问题，自己的思考等等，全都不在这里。你想要透过幻灯上的寥寥数语，试图回忆起来学生当时的反馈。这任务难度确实有点儿太高了。 所以，看似讲课的时候，教师只是非常潇洒地拿着一个 U 盘拷个 PPT，然后就侃侃而谈。实则这背后，应该是一套系统在发挥作用。 包括但不限于： 资料采集 资料整理 撰写文稿 设计大纲 幻灯制作 反馈记录 项目管理 尝试 从教这些年里，我也曾尝试过用不少工具来完成备课中的上述任务。 例如，从系统自带的资源管理器(或者 macOS 下面的 Finder)一直用到 DevonThink，用来采集图片、文本片段、视频、文档等资料。 用印象笔记， Bear， Milanote 等来整理笔记项目。 使用 Word, Scrivener, Ulysses 来撰写文稿。 利用幕布、workflowy, dynalist 来制作大纲。 用 Powerpoint, Keynote, Prezi, iMindmap……直到 Markdown 文档，来制作幻灯。 用 org-mode, Bear, Notion 来做反馈记录。 用滴答清单和 Trello 来做项目管理。 但是，实话实说，这些工具用来备课，效果总是不大好。 这里所谓的效果不好，并不是指这些工具本身不好用。恰恰相反，上述工具列表中，许多都是非常有特色的优秀应用。 按照 UNIX 系统的设计思路。每个应用，应该在某个方向上做到极致，然后把不同的应用配合起来， 形成1+12的效果。 从道理上讲，这没有问题。但是在实践中，不容易实现。 因为工具的切换，是有成本的。尤其是当你完成某个任务，需要连续通过若干个工具配合时，成本其实很高。 例如后一个工具不一定支持前一个工具的导出内容，那就会使得配合无从谈起。 这直接导致了，我本来就是想轻松写文章和备课，却把格式的转换和自动化脚本钻研得颇为深入。 这算是收获了一种副产品吧，不过代价实在太高了。 而即便通过 Markdown 这样的通用格式，把工具间配合能力打通。你依然有可能因为需要打开额外的工具而产生怠惰，结果该干的事情，被拖延，或者干脆忽略。 例如我课后本来是应该认真记录反馈的。但是我真的懒得记。我记录的时候，怎么描述“第 28 页幻灯这个位置图片换一张”，或者“第 40 页这里，视频太长需要剪短”？如果用页码，那么一旦我对幻灯进行修改，页码就都无效了；可如果采用的是上下文的详细描述，那就得写不少字了。 而且这种反馈，即便是能够记录下来，真正动手去做，恐怕真得拖到下一轮教学(毕竟这一轮已经过去，人得往前看啊)。到那时候，想把散落在不同工具里面的内容链接起来，并不容易。而且你到时还能否记得，当时是否进行了修改？各种版本该以哪个为准继续改动？ 诸如此类的问题，都会让你无所适从。能深入钻进去重新弄清楚来龙去脉的情况很罕见。即便做了，成本也是非常高的。 问题真的无解吗？ 不。 因为 Roam Research 出现了。 新方法 Roam Research 的主要特点，我在《 Roam Reserach 到底好在哪儿？ 》一文中，已经为你介绍过了。咱们简单归纳一下要点： 双向链接。 可以链接到 block 单位。 开放便捷的汇入和导出。 Web 界面，跨平台。 下面我们来看看，这些特点可以怎样帮助你更轻松高效地完成备课任务。 首先是资料的采集。 Roam Research 支持 Markdown 与 JSON 格式数据的导入。因此许多第三方平台都能自动导出到 Roam Research ，并且保持同步。 例如我最常用的 Readwise 。 Readwise 支持的导入内容渠道非常多。至今为止，我也没能开发使用全部的功能。但是对我来说，这些已经足够用了。 在 Kindle 电子书， Instapaper, Pocket, Medium，甚至是网页上面做标注(利用 Hypothes.is)，Readwise 都可以把它们同步汇入到我的 Roam Research 里面。 而且汇入的每一则高亮或者笔记，都有完整的元数据信息。例如采集渠道、原始网址、获取时间、资源类型等等。 由于信息的完整性，你整理起来就可以特别轻松，按照 Tiago Forte 提出的“渐进式总结”方法，可以从中抽取重点，添加标记，并且可以利用卢曼的 zettelkasten 方法，将其与笔记盒里面已有内容建立关联。 这里我圈画出 zettelkasten 这个单词，然后这则笔记就立即与 8 月 3 日的一则笔记当中的段落建立了链接。这可以算成是一种惊喜的意外发现(serendipity)。 实话实说，尽管才过去一个多月，我已经完全忘记了当初自己写过这样一段话了。 想想看，如果你平时积累资料能够这样被钩沉和发现，是不是很能提升你记录内容的意愿？并且提升效率呢？ 对于文稿的撰写，完全不需要离开 Roam Research 的环境。而且有意思的是你可以选择把某份材料的链接或者是内容嵌入摆放，然后利用大纲工具的特点，方便排布。 至于大纲，这里就不展开介绍了，因为 Roam Research 本身就是基于大纲的。 而有意思的是，因为 Roam Research 的导出内容是 Markdown，所以我原先为你介绍过的《 如何用 Markdown 做幻灯？ 》在这里完全适用。靠着用Keyboard Maestro编写的脚本，你甚至可以一键把当前的大纲转换成为漂亮的 Reveal.js 幻灯，就像这个样子。 对于课堂的反馈，我可以用另一个 Page 作为索引，把每次课的幻灯，课后的反馈都放在一起。而且利用链接，直接把需要改进的地方标示出来。 从图中，你可以看到，这开学第一课，原本可能多么狼狈。Reveal.js 幻灯无法正常本地播放，教室机器又没有联网，而且病毒还把我的优盘数据都给弄没了。 可是我为什么非常明智地带着一台刚好同步了数据笔记本电脑去了教室呢？ 因为在我的课前准备模板中，有个任务列表，是这样的： 我平时不可能自己记住这么多琐碎的事项。但是没关系， Roam Research 的任务管理功能都能帮我记住。每完成一项就挑勾，那么许多可能发生的问题就被消弭于无形了。 这里，是我第二课课前准备部分完成后的效果： 这里的链接，都是可以直达大纲形式幻灯的具体对应位置的，找起来非常方便。 而且 Roam Research 的双向链接，使你可以在后面浏览和修改幻灯源文件(大纲模式)的过程中，看到引用次数标记。 点击就可以看到与之相关的课前准备或者课后回顾上下文，使得你立即就明白后面该如何更好地迭代修改。 而且在索引页面上选择对应的标记，就可以只显示未完成的任务。这样就可以让你更轻松地聚焦，降低焦虑感。 当然，如果你愿意的话，也可以只看已完成的任务。总结经验，顺便增加一些 成就感 。 小结 以上是我使用 Roam Research 进行备课的心得。 简单回顾一下， Roam Research 可以一站式帮助我们完成以下备课中的资料采集和整理、文稿撰写、大纲设计、幻灯制作、反馈记录和项目管理任务。 我把上述经验，分享给同样热爱教学工作的你。希望对你的备课效率提升，能有一些帮助。 顺祝节日快乐！ 喜欢别忘了 点赞 ，并及时写下你的感受与 评论 。 也欢迎你 转发 给亲朋好友，让他们也加入咱们的讨论中来。 别忘了 关注 我的专栏“玉树芝兰”，以免错过更多的更新推送。 延伸阅读 如何用卡片法写论文？ 如何高效实践卡片式写作？ 如何交互可视化 Roam Research 局部笔记网络？ 如何判定本科毕业生的靠谱程度？ 如何用 LiquidText 高效阅读分析文献？

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如何用 liquidtext 高效阅读分析文献？

wshuyi 2020-5-27 21:57

题图：Photo by Alina Grubnyak on Unsplash 读文献，最忌讳的就是线性阅读。要想把文献读出层次，构建成网络，从而提升理解和吸收效率，你就需要一款合适的工具了。 我之前写过一篇《 如何高效读论文？ 》，很受读者欢迎。 回顾一下，在那篇文章中，我们提到过，要想提高论文阅读的效率，一定要 避免线性阅读 的传统方法。 你要学会抓住重点，不断探索自己是否愿意读，以及衡量文章的质量。 当然，如果文章价值很高，却实在读不懂，我在 另一篇文章里 ，也给你提供了应对的方法。 相信你从那儿以后，也尝试了利用 Peter W. Carr 教授提供的这种思路，阅读论文更加灵活。 但是你也会体会到 理论和实践中的差距 。 如果工具不给力，总还是觉得有些麻烦和挫折感的。 例如说如果你喜欢 电子阅读 的方式，在平板电脑或者笔记本上面读文献、做笔记，你会发现目前市面上大部分的阅读工具，还依然都是线性的。 这种线性无关乎浏览。毕竟只要有翻页功能，你跳过去阅读都没问题。 关键问题，在于 链接 。 如果你不能把前后文里面的重点有效链接起来，那么其实你很难「跳」得动，「跳」得勤，「跳」得远。 因为你这一跳动，上下文就全都丢了。 好不容易形成的心流体验，好不容易碰触的思想火花，就因为「跳」不回去，中断了，熄灭了。 有人因此不得不退化到纸笔模式。所有论文都打印出来，然后用各种颜色的水笔甚至是便利贴来进行标注。有必要的时候拿出剪刀把论文大卸八块，然后再贴起来…… 这样虽然灵活性好了许多，似乎也能够很好地联系关键点和上下文。 可问题是，你积累的东西越多，后面重新整理成电子版的成本就越高。 当然，如果你能做到毫不拖延，每次都可以把一堆浆糊粘好的材料条分缕析加以录入整理……我只能表达对你强劲执行力的钦佩了。 一般人，会拖延，然后干脆放弃整理。那你所有记的东西都白费了。后面难以有效检索调用，甚至会不知道扔在了哪里。 所以，我不建议普通人，尤其是懒人（例如我自己），去做这种 高难度挑战 。 你还是尝试一下现代化的阅读和笔记工具吧，效果会好一些。 好的工具，可以让你在非线性阅读的同时，帮助你勾连各种要点，并且完整保管好上下文，让你在调用的时候如鱼得水，整理的时候游刃有余吗。 有这样的好工具吗？ 当然有。 我今天给你介绍的这款应用，叫做 LiquidText。 它曾经获得过苹果应用商店的编辑选择奖，以及被评为年度最具创新 iPad 应用。 你可能会好奇，在文献阅读和笔记应用领域，有这么多的产品，早已是一片红海了。什么功能没有被开发出来过？怎么还会给新来者一个足够的容身之地呢？ 为了解答你的这些疑问，我专门为你录制了一期视频教程，用实际的例子，给你介绍 LiquidText 的使用方式和突出特色。 顺便，我还提到了如何把它和 Roam Research 等工具相结合，从而更好地应用「第二大脑」，帮你进行高效思考和卡片式网络链接。 当然，和咱们前面介绍过的「 文献回顾工具篇 」联系起来，你从「文献阅读」到「分析整合」，再到「整理输出」的链条，就算是 完全打通了 。 视频 地址在这里 。 欢迎你看后把感受和问题写在留言区，咱们一起交流讨论。 喜欢别忘了 点赞 ，并及时写下你的感受与 评论 。 也欢迎你 转发 给亲朋好友，让他们也加入咱们的讨论中来。 别忘了 关注 我的专栏“玉树芝兰”，以免错过更多的更新推送。 延伸阅读 你可能也会对以下话题感兴趣。点击链接就可以查看。 如何快速写作论文初稿？ 如何用卡片法写论文？ 如何高效实践卡片式写作？ 如何用人工智能帮你找论文？ 如何选研究题目？

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如何用人工智能免费帮你改英文？

热度 1 wshuyi 2020-5-5 17:26

推荐给你一款最新的免费工具，解决你英文改写润色的后顾之忧。 题图： Photo by Amador Loureiro on Unsplash 痛点 作为非英语母语人士，你我从小学开始，英语都没少学。但真是「书到用时方恨少」。 一到真正需要 书面英文写作 时，难免在遣词造句上捉襟见肘。 有些专业，平时也就需要读读英文文献，倒还好说。但是有不少学科，研究生阶段导师是要求 用英文写作 的。 还记得我当年在计算机系读研时，导师布置了一个工作报告，让我把仿真和实验的最新结果，发给 UCLA 的合作团队。师兄很热心地嘱咐我，让先用中文写就，确认没有问题了，翻译成英文，之后再润色。 我觉得太麻烦了。 于是直接动笔用英文写。 当然，很快我就遭遇了卡壳。 但是，本着「初生牛犊不怕虎」的「后浪」精神，我真就拿着一个电子词典硬翻。 可大凡用过英文的同学都知道，一个中文单词，往往对应着若干种英文译法。 如果你每次都选第一个填上去…… 那次的任务，就算是完成了。 但是几年之后，我整理资料的时候，偶然又看到了那篇工作报 告，翻开读了不到 3 段，就笑喷了。 因为被美剧熏陶后，我深刻了解了用的那个词儿，在俚语里面，指的是啥。 然后，我就不由得时常脑补 UCLA 合作团队那帮美国人、印度人和意大利人拿到我那份报告时的表情。 想想都脸红。 成本 去年，在美国访学时，我买了 Grammarly 年度订阅。 实话实说，挺贵的。但是这钱不得不花。 因为彼时英文专业写作，已经成为了我的 刚需 。 虽然认识了不少美国同事和学生，但也不能随时都麻烦人家来帮着审核校订啊？ Grammarly 不仅可以检查语法错误，还可以给措辞造句，提供修改建议。甚至有些词被用得太多太滥，它也会提醒给你，让你避免落俗套。 这一年多以来，它帮我成功发布了 Towards Data Science 专栏文章，完成了 JCDL workshop 研究计划和演示，准备 UNT 研究生课程，撰写 IDD 期刊的特刊提议与征文通知，与许多学术界的新朋老友交流工作……可以说，在它的辅助下，我少出了很多洋相。 但是这款工具，对于咱们的平均工资水平而言， 确实贵了一些 。 我选择的是年度订阅，月均下来，还便宜一些。但是每年付费的一刻，要说不心疼，那是骗人的。 我也曾经把 Grammarly 推荐给自己的学生和同事。但是一看价格，他们都表示内心的躁动已然平静了下来。 当然，你也可以选择 Grammarly 的免费版本来用。只不过功能上，要差很多。 类似的语法检查工具，还有不少。但是我尝试的结果，是这些竞品的效果确实都远远赶不上 Grammarly ，难怪它在学术界有如此高的人望。 将就着吧。反正我已经续费到了 2021 年。 发现 今早，从 Jarod 那里，我听说了一款新的同类工具，叫做 Gramara 。 它的介绍词，就很吸引我。 因为它号称是 人工智能 加持的。 之前我曾经给你介绍过，人工智能 可以帮你作诗 、 帮你写文章 ，因此对于人工智能可以帮你订正语法错误，给出修正意见，毫不怀疑。 于是我马上 输入网址 ，注册了账户。 进入主界面，很清爽，空空如也。 左侧是输入框，可以输入文字。右边是提供修改建议的地方，右下角按钮是个帮助中心，可以直接向研发团队提问。 我直接了当，通过提问按钮，问了对方该工具和 Grammarly 的区别。 他是这样答复我的： 简而言之： 英语不好的，帮你改语法； 英语好的，给你提整句表述建议。 Grammarly 应该是它们最主要的竞品，因此对这个问题有备而来。还专门弄了个对比。 Grammarly 里面提示没问题的： 它这里都可以找到错误。 我觉得挺有意思。一款工具不止是帮你修正语法错误和措辞不清晰的地方，而且还可以用 正确的样例 辅助你改进自己的写作习惯，拓展你的常用句式。 授人以鱼的同时，还授人以渔，颇具 教育功能 。 这人工智能的应用很妥当！ 测试 但是我们也知道，一般这种用于广告宣传的对比，往往都是商家精挑细选一些自己擅长而竞争对手有疏漏的地方来比，做不得数。 想要了解这工具的质量，还是实际测试一下吧。 为了省事儿，我从 Medium 上 自己最新一篇英文文章 ，找了开头一些材料。 为了模拟日常输入的效果，我让机器一个字儿一个字儿打了进去。 不过，让我感到失(de)望(yi)的是，软件提示我说没有发现任何错误。 这说来也并不奇怪，毕竟这篇文章发布之前，我就用 Grammarly 检查过了。 但是说好的修改建议呢？ 我于是给开发团队发了个信息。 I was just trying to copy and paste a portion of my medium post on Gramara. It gave me no corrections or full-sentence change suggestions. Is it because I have not subscribed the pro mode? 编写完毕，发送之前，我转念一想，还是先用软件测一下我这个问题叙述是否妥当吧。 结果还真的发现了错误。 这么看，查错功能还是挺好用的。可是刚才的大段文字为什么没有效果呢？ 我发出这个问题后，很快就收到了回复。 他说： 大意是说，这款工具不像 Grammarly 是全文统一报错，而是一句句来。刚才截图里面显示的，是说我的最后一句输入没问题，也没有修改建议。把鼠标移到每一句上，就可以看到具体的报错和建议了。 我尝试了一下，果然如此。 时态的问题，清晰可见。 更好玩儿的是，开发者 Jack 还告诉我一个非默认设置功能。 在设置里， 开启翻译文本 。 这个功能，初看起来很多余。毕竟我现在想要写英文。中文我本来就知道啊，翻出来干什么？ 但是一旦尝试，我觉得尤其有用。也是这个工具的 特色 。 想想看，在修改过程中，你表述出来的意思是否已经偏离原意？这对于很多英语语感不够强的同学来说，着实是个问题。 现在有了这个功能，你可以看到修改后的英文，翻译成中文的释义。那么，这种「为了修辞舍弃表义」的错误，就可以很容易避免了。 模型 鉴于 Jack 这么及时热心的有问必答，我的好奇心驱使我问了一个可能不大该问的问题： 你应用背后的深度模型是 BERT 吗？还是更大的 Transformer ？ 问完之后，有些后悔。会不会被当成友商派来的探子？ 没想到，他听我讨论技术问题，兴趣大起，居然把底层模块基于开源库链接都发给了我。 真是实诚人啊！ 篇幅所限，我把相关的链接和具体的介绍说明，单独写了一个简短的图文。你可以在我的公众号后台回复：「gram」，获得相关的介绍。 费用 最让我开心的是，这款工具虽然也有订阅模式，但是免费版本比起 Grammarly 来，慷慨许多。 你看，免费模式下，功能还是挺全的。语法、拼写检查，以及句式建议，一应俱全。 只是锁定单一写作风格，而且会有每天 1000 个单词的字数限制。我觉得对于大部分使用场景（发个邮件，或者写文献阅读卡片）来说，应该是够用了。 如果你需要用英文作报告或者写论文，额度不够用的话，临时买上 1 个月的 Pro 版本应急，也算是可以接受的。 小结 本文为你介绍了一款基于深度神经网络的英文改写工具 Gramara 。通过试用，我发现免费模式的基本功能已经基本可以满足日常的学习和工作需求。尤其是其中的修改建议翻译功能，可以让你有效把握修改后英文的语义，避免偏航。 希望这款工具对你的学习和科研工作能有帮助。 祝顺利！ 喜欢别忘了 点赞 ，并及时写下你的感受与 评论 。 也欢迎你 转发 给亲朋好友，让他们也加入咱们的讨论中来。 别忘了 关注 我的专栏“玉树芝兰”，以免错过更多的更新推送。 延伸阅读 你可能也会对以下话题感兴趣。点击链接就可以查看。 如何高效做文献回顾？（工具篇） 如何高效读论文？ 如何快速写作论文初稿？ 如何选研究题目？

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探秘人类个体系统的逻辑结构

choudh 2019-11-12 18:13

人类的个体系统是指个人与自然界所组成的复合系统，这种系统是一个非常复杂的有机系统，每个元素之间都有着十分严密的逻辑关系，它们各司其责，而且相互制约、相互推动。然而，到目前为止，我们并不清楚地知道它的真实结构，并不知道个体系统中各个元素所起的核心作用，并不知道各个元素之间存在何种形式的逻辑关系。显然，弄清我们个体系统的逻辑结构，对于整个自然科学和社会科学的发展有着极为重要的意义。 人类个体系统的逻辑结构主要包括两个方面：层次结构与对称结构。 一、个体系统的层次结构 个体系统的形成和发展，主要是基于这么一个客观目的：人通过借助于外界的各种自然资源，可以有效地延伸、加强、拓展人的劳动器官。从整体上讲，个体系统可分为三个基本层次：资料、行为和意识。 （ 一 ）资料 较高等的动物由于能够对各种事物的价值特性进行分析与推理，较为容易发现各种外部物质和自然力量对于自己的生存意义，从而引导生物机体借助于外部物质和自然力量来替代、补偿、增强和扩展自己相应的劳动器官的劳动功能，以间接地作用于劳动对象，并获取更多的价值资源。 我们知道 生产资料（或劳动工具）的根本目的在于 延伸、拓展和加强人的劳动器官（包括手、脚、身体与大脑等） 的劳动功能 ；同样，消费 资料（或 消费 工具）的根本目的在于 延伸、拓展和加强人的 消费 器官 的 消费 功能 。 不难发现 ， “ 劳动能力 ”与“资料”的基本特性完全相同，因此“ 资料 ” 可以看作 一种特殊的 劳动能力 。 劳动能力与资料的逻辑关系如下图： （二）行为 价值的本质是直接或间接的有序化能量，就是有序化的功能，价值的增长过程实际上就是功能的有序化增长过程。 “有序”就是按照一定的规则进行排序，因此“有序化”实际上就是“规则化”。不难理解，“行为”的本质就是“有序化”，就是把许多无序化的资料，按照特定的规则和秩序，进行整理、监督、控制与使用，使资料的空间特性、时间特性、物理特性、归属特性、概率特性发生变化，从而改善其价值特性（即价值量或价值率）。由此可得： 行为 的 价值 本质 ： 行为 就是关于 资料 的规则体系 ，其客观目的在于改善资料的价值特性 。 资料与行为的逻辑关系如下图： （三）意识 主观的最终目的在于指导客观，人类所有主观意识均是由各种自然规律、社会规律反映到人的头脑中，形成了对于行为进行控制的各种规则，因此人类意识的根本目的在于对人类行为进行 “有序化处理”，从而使行为的运动遵循着一定的法则，即对人的行为形成相应的约束性规则。由此可得： 意识 的价值本质 ： 意识 就是关于 行为 的规则体系，其客观目的在于 改善行为的价值特性 。 行为与意识的逻辑关系如下图： （四）资料、行为与意识的逻辑关系 综上所述，资料 、 行为 与 意识 的相互关系主要体现在： 1、 行为 是一种特殊的 资料 。 行为 是关于 资料 的规则体系，其目的在于 改善资料的价值特性 ，并为 资料 的加速发展提供内在的动力，因此它是一种更高层次的 资料 。 2、 意识 是一种特殊的 行为 。 意识 是关于 行为 的规则体系，其目的在于 改善行为的价值特性 ，并为 行为 的加速发展提供内在的动力，因此它是一种更高层次的 行为 。由于 行为 是一种特殊的 资料 ，那么， 意识 也是一种更为特殊、更高层次的 资料 。 3、 资料 、 行为 与 意识 的相互促进、共同发展 。 行为 以 资料 为基础， 资料 以 行为 为导向； 意识 以 行为 为基础， 行为 以 意识 为导向； 资料 、 行为 及 意识 三者互为前提、相互促进、共同发展。 资料、行为与意识的逻辑关系如下图： 二、个体系统的对称结构 个体系统可分为资料、行为与意识三个基本的层次，其中每一个层次都含有两个对称元素：规范化元素与非规范化元素。 （一）资料的对称元素 资料非常复杂，可以从不同角度进行分类。根据价值系统的不同，资料可分为生产性资料与消费性资料；根据主体类型的不同，资料可分为个体性资料与集体性资料；根据载体的不同，资料可分为物质性资料与非物质性资料。 人们在利用资料的过程中，为了提高其价值的效率性，往往 要进行 一系列的 “规范化” 处理 ， 如内容的明确化、形式的标准化、数量的规模化、技术的专业化、主体的清晰化、过程的程序化、度量的精确化等。资料经过规范化处理以后，就形成了一种特殊的资料。由此，提出 “工具”的概念。 工具 的本质 ： 工具 就是规范化的 资料 。 之所以要对 资料 进行 “规范化” 处理 ，主要是基于如下目的： 内容的明确化有利于减少彼此的误会，形式的标准化有利于加强彼此的配合，数量的规模化有利于发挥规模化效益，技术的专业化有利于提高产品的精细化水平，过程的程序化有利于过程的监控与反馈，度量的精确化有利于过程的微观调控 。 工具与资料的逻辑关系如下图： 不过，并不是所有的资料都能够进行规范化处理，特别是对于那些具有发生随机性、形式多样性、运动多变性、内容模糊性、主体混合性、时间短暂性、价值零碎性、功能具体性、条件特殊性等特点的资料，如果进行规范化处理，将会大大提高其价值成本，反而降低其价值效率。由此，提出 “材料”的概念。 材料 的本质 ： 材料 就是 非 规范化的 资料 。 材料与资料的逻辑关系如下图： 随着 社会生产力的不断发展， 资料的内容越来越丰富，形式越来越多样，范围越来越广泛。一般来说， 人类的 资料通常会朝着两个不同的方向同时扩张：工具不断发展和材料不断发达。而且，许多的材料方式，将会随着环境的不断变化和条件的不断成熟，逐渐由非规范化走向规范化，从而逐渐转化为工具方式；相反，许多的工具方式由于环境的不断变化和条件的不断转移，逐渐由规范化走向非规范化，从而逐渐转化为材料方式。由此可见，工具与材料两者相互促进、相互转化、共同发展。 工具与材料是资料的两种对称元素，共同构成了资料的对称结构，如下图： （二）行为的对称元素 人类的行为非常复杂，可以从不同角度进行分类。根据价值系统的不同，行为可分为生产性行为与消费性行为；根据主体类型的不同，行为可分为个体性行为与集体性行为；根据行为对象的不同，行为可分为人事行为、财产行为和物资行为。 人们在实施行为的过程中，为了提高其价值的效率性，往往 要 对行为 进行 一系列的 “规范化” 处理 ， 如行为内容的清晰化、行为过程的程式化、行为方式的标准化、行为技术的专业化、管理指标的精确化等。行为经过规范化处理以后，就形成了一种特殊的行为。由此，提出 “技术”的概念。 技术 的本质 ： 技术 就是规范化的 行为 。 之所以要对 行为 进行 “规范化” 处理 ，主要是因为规范化的 行为 往往具有科学而合理的 行为 程序、公开而透明的 行为 内容、清晰明确的 行为 主体、稳定而持久的 行为 方式，从而使 行为 具有更高的 价值 效益、更低的 行为 成本、更大的 行为 规模，更广泛的 行为 范围、更持久而稳定的 行为 力度，更高的 行为 可预测性。 技术与行为的逻辑关系如下图： 不过，并不是所有的行为都能够进行规范化处理，特别是对于那些具有发生随机性、形式多样性、运动多变性、内容模糊性、主体混合性、时间短暂性、价值零碎性、功能具体性、条件特殊性等特点的行为，如果进行行为的规范化处理，将会大大提高其价值成本，反而降低其价值效率。由此，提出 “个性”的概念。 个性 的本质 ： 个性 就是 非 规范化的 行为 。 个性与行为的逻辑关系如下图： 随着 社会生产力的不断发展， 行为的内容越来越丰富，行为的形式越来越多样，行为的范围越来越广泛。一般来说， 人类的 行为通常会朝着两个不同的方向同时扩张：技术不断发展和个性不断发达。而且，许多的个性方式，将会随着环境的不断变化和条件的不断成熟，逐渐由非规范化走向规范化，从而逐渐转化为技术方式；相反，许多的技术方式由于环境的不断变化和条件的不断转移，逐渐由规范化走向非规范化，从而逐渐转化为个性方式。由此可见，技术与个性两者相互促进、相互转化、共同发展。 技术与个性是行为的两种对称元素，共同构成了行为的对称结构，如下图： （三）意识的对称元素 人类的意识非常复杂，可以从不同角度进行分类。根据价值系统的不同，意识可分为生产性意识与消费性意识；根据主体类型的不同，意识可分为个体性意识与集体性意识；根据意识对象的不同，意识可分为人才意识、财富意识和物资意识。 人们在实施意识的过程中，为了提高其价值的效率性，往往 要 对意识 进行 一系列的 “规范化” 处理 ，主要包括：程序化、形象化、抽象化、特征化、典型化、逻辑化和系统化等方式。 意识经过规范化处理以后，就形成了一种特殊的意识。由此，提出 “科学”的概念。 科学 的本质 ： 科学 就是规范化的 意识 。 从规范化的具体内容来看， 意识的 这种 “规范化”主要包括：一是规范化的表述方式（如语言、文字、图像、雕塑、音乐、舞蹈、建筑等文学艺术形式），二是规范化的操作流程（如生活习俗、工艺品与食品制作流程等），三是规范化的逻辑结构 （如概念、公式、定律、理论等） ，四是规范化的判断标准（如审美判断标准、善恶判断标准与真假判断标准）。 之所以要对意识进行 “规范化”处理， 就是为了 使 意识 更加清晰明确，从而更加易于识别，易于理解，易于使用，易于判断，易于传播，易于继承，易于 规模化 发展 ，易于深入人心，从而提高意识的价值效率 。 科学与意识的逻辑关系如下图： 不过，并不是所有的意识都能够进行规范化处理，特别是对于那些具有发生随机性、形式多样性、运动多变性、内容模糊性、主体混合性、时间短暂性、价值零碎性、功能具体性、条件特殊性等特点的意识，如果进行规范化处理，将会大大提高其价值成本，反而降低其价值效率。由此，提出 “作风”的概念。 作风 的本质 ： 作风 就是 非 规范化的 意识 。 作风与意识的逻辑关系如下图： 随着 社会生产力的不断发展， 意识的内容越来越丰富，意识的形式越来越多样，意识的范围越来越广泛。一般来说， 人类的 意识通常会朝着两个不同的方向同时扩张：科学不断发展和作风不断发达。而且，许多的作风方式，将会随着环境的不断变化和条件的不断成熟，逐渐由非规范化走向规范化，从而逐渐转化为科学方式；相反，许多的科学方式由于环境的不断变化和条件的不断转移，逐渐由规范化走向非规范化，从而逐渐转化为作风方式。由此可见，科学与作风两者相互促进、相互转化、共同发展。 科学与作风是意识的两种对称元素，共同构成了意识的对称结构，如下图： （四）资料、行为与意识的对称结构 综上所述，资料的对称结构是工具与材料，行为的对称结构是技术与个性，意识的对称结构是科学与作风。 个体系统的对称结构如下图： 根据以上的分析： 1 、 工具 是规范化的 资料，技术 是规范化 的行为 ， 科学 是规范化 的意识。 2 、 材料 是 非 规范化的 资料，个性 是 非 规范化 的行为 ， 作风 是 非 规范化 的意识。 3 、由于 行为 是关于 资料 的规则体系， 意识 是关于 行为 的规则体系 ，因此 当 工具 是 资料 的主流部分时， 行为 可以近似地认为是关于 工具 的规则体系；当 技术 是 行为 的主流部分时， 技术 可以近似地认为是关于 工具 的规则体系；当 科学 是 意识 的主流部分时， 科学 可以近似地认为是关于 行为 的规则体系，还可以近似地认为是关于 工具 的规则之规则体系。 个体系统的 逻辑 结构如下图： 参考资料： 1 、统一价值论，仇德辉著，中共中央党校出版社， 2018 年 2 、数理情感学，仇德辉著，中共中央党校出版社， 2018 年 3 、情感机器人，仇德辉著，台海出版社， 2018 年

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科研工具汇总

wayneqi 2019-11-11 15:49

分子生物学综合软件 Vector NTI: 分子生物学综合软件; 2. DNAMAN： 核酸、蛋白序列分析软件; 3.DNAStar： DNA和蛋白质分析工具； 4. SnapGene： 质粒图谱分析 生物信息基础工具 基础语音： Perl语音， Python语言，R语言，Shell语言 常用软件：FastQC，Bwa， SAMtools，Bowtie2，Bedtools 常用网站：OMICtools，Ensembl，UCSC，ENCODE 外文翻译工具 CNKI翻译助手；2. 有道/金山等翻译软件；3. Grammarly； 4. 百度/Google 文献下载网站 NCBI; 2. Sci-Hub； 3. Pubmed； 4. BookSC; 5. GeenMedical；6.Library Genesis 实验技能学习网站 JoVE； 2. Cold Spring Harbor Protocols； 3. Bio-101； 4. Protocol Online 引物设计 Primer Premier 5.0 软件； 2. NCBI primer-blast； 3. Oligo； 4. Array Designer 蛋白常用数据库 Uniprot： 蛋白质数据库；2. Paxdb 蛋白丰度数据库；3. BioGPS: 基因和蛋白功能查询；4. CiteAb 抗体搜索引擎数据库；5. NCBI 综合数据库；6. The Human Protein Atlas 人类蛋白图谱数据库；7. ExPASy： 蛋白质在线分析工具；8. UniHI: 蛋白相互作用数据库； 9. Protein Data Bank： 蛋白质信息数据库；10. BioGRID 蛋白质相互作用数据库；

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[建议] 中学、大学和研究生教育中增加“逻辑”知识

热度 3 zlyang 2019-7-26 19:47

中学、大学和研究生教育中 增加“逻辑”知识 爱因斯坦说： “实验、逻辑”是现代科技的两大工具。 因此，建议中学、大学和研究生教育中增加“逻辑”知识。 以《形式逻辑》为核心，介绍其中的基本知识。 辅以“第三次数学危机”，哥德尔不完全性定理，柴廷定理。 以及关于“逻辑”的更广泛的哲学-科学思考。 普及《逻辑学》的两个基本目的： 作为“工具”的积极意义； 以及作为“工具”的局限性。 http://braungardt.trialectics.com/mathematics/mathematicians/kurt-godel/ 爱因斯坦、哥德尔。 相关链接： 2015-04-29 ，翻译爱因斯坦回信博文链接汇集（3） http://blog.sciencenet.cn/blog-107667-886229.html 2011-04-07 ，《中国“科学网大学”逻辑基础研讨中心》活动之一：逻辑基础资源 http://blog.sciencenet.cn/blog-107667-430666.html 2013-10-01 ，密尔求因果五法 http://blog.sciencenet.cn/blog-107667-729352.html 2013-06-30 ，《中国“科学网大学”逻辑基础研讨中心》活动之四：因果性与逻辑 http://blog.sciencenet.cn/blog-107667-703983.html 2010-03-09， 逻辑方法的局限性 ：G?del incompleteness theorem和Chaitin theorem http://blog.sciencenet.cn/blog-107667-301287.html 感谢您的指教！ 感谢您指正以上任何错误！ 感谢您提供更多的相关资料！

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弓箭对灭火技术的启示

热度 1 dfedhw 2019-4-7 20:49

弓箭是人类懂得利用通过机械能储存，并释放能量的最早例子。摩尔根把弓箭的发明作为高级蒙昧社会开始的标志。其发明的意义与人类对火的使用相提并论。弓箭的发明 扩大了人类的食物来源，提高了自身的防卫性 ，而弓作为一种复合工具同时也意味着人类智力水平的极大提高，是蒙昧社会的最高技术成就。恩格斯说：“弓箭对于蒙昧时代，正如铁剑对于野蛮时代和火器对于文明时代一样，乃是决定性的武器。”直到后来弓箭被用为武器，更是青铜兵器不能与之匹敌的。弓箭的发明创造产生了无可替代的作用与影响，这种影响一直延续到后世的各个历史朝代。如果说，任何工具和武器都是人手的延长，那么 弓箭堪称是火器诞生之前，人手的最伟大的延长 。 弓箭的使用，使人手的作用范围大大增加。从此，人就可以弥补奔跑不如野兽快的不足，猎取较远距离或奔跑中的猎物，甚至飞禽，也可以用来射鱼，因而促进了渔猎生产的发展。同时，弓箭也可以更有效地抵御野兽的袭击，保护自身的安全。无论从技术史的角度看，还是从社会发展史的角度看，弓箭的发明和使用，都可以称之为一次重要的革命。当然，对于弓箭本身所包含着的复杂的科学道理，当时的人们是完全不理解的。 在缺少有效防护的原始时代，锋利的箭矢是无法抵挡的，甚至可以说谁掌握了弓箭技术，谁就能得到天下。“弦木为弧，剡木为矢，弧矢之利以威天下。”可见弓箭在古战场上的巨大威力。春秋时：“故言武事者，首曰弓矢”，弓箭为兵器之首。而明清朝皆以弓马得天下。 弓箭今天已成为人们娱乐和运动的一种器械，但是在枪炮发明之前，却是人们打猎和作战的重要远射武器。弓箭由弓、弦和箭三部分构成，人拉弓弦做的功转化成为拉开了的弓弦的势能，起着动力的作用；拉开的弓弦弹回，势能转化为动能，把箭弹出，射到一定的距离，这起的是传动的作用；箭镞〔zu族〕则起了工具的作用，它射到猎物或敌人身上，等于人用工具打击猎物或敌人。因此，可以说弓箭已具有机器的三大要素：发动机、传动机构和工具机。在这一意义上，也可以说弓箭是人类最早发明的机器。 　 再回到灭火中来，可以从中得到以下启示： 启示一：灭火兼具有进攻与防御的属性，既要能实现远距离定向打击，也要通过随时保持安全距离来降低或消除对方所构成的威胁。 启示二： 廉价的工具成本、武器整体重量的减轻、箭矢数量的相对充足、有效的杀伤力、灵活的使用方式 均有助于单兵作战能力得到明显提升，从而先发制“ 人 ”。 启示三：灭火需要借助轻巧的工具或武器来提升效率，由于对使用者体力要求的降低，更容易实现以弱胜强，以寡敌众，个人对初期火灾控制能力增强的同时，相应提升总体战斗力。 启示四：灭火工具武器的“进化”，不再需要过于仰仗个人体力与技能，甚至于勇气经验，可改变原有敌我力量对比的悬殊，并带来原有作战组织协调方式的调整。 在人类应对外界威胁及改造自然的历史进程中，相比于传统的武器工具，弓箭所发挥出的作用举足轻重，充分巧妙地利用人体潜能，符合人体工学设计原理，由此“获取”到更强的生存能力。同样，在应对火灾威胁的时候，也应该找到一种从某种意义上类似于“弓箭”的武器。 （本文大部分内容摘自于网络） 延伸阅读： 弓箭历史溯源浅谈——远古神器 人类发明弓箭是为了撸串？ 弓箭题材经典之作：最终兵器：弓

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[建议] 中学、大学和研究生教育中增加“逻辑”知识

热度 4 zlyang 2019-3-23 16:41

　　真正的马克思主义者是不怕什么的，任何人也不怕。不怕别人整不整，顶多没有饭吃，讨饭，挨整，坐班房，杀头，受冤枉。我没有讨过饭。要革命，不准备杀头是不行的。被敌人杀了不冤枉。被自己人错杀了就很不好，所以我们党内有一条：一个不杀 。 ——毛泽东，同文艺界代表的谈话， 1958-03-08 中学、大学和研究生教育中 增加“逻辑”知识 爱因斯坦说： “实验、逻辑”是现代科技的两大工具。 因此，建议中学、大学和研究生教育中增加“逻辑”知识。 以《形式逻辑》为核心，介绍其中的基本知识。 辅以“第三次数学危机”，哥德尔不完全性定理，柴廷定理。 以及关于“逻辑”的更广泛的哲学-科学思考。 普及《逻辑学》的两个基本目的： 作为“工具”的积极意义； 以及作为“工具”的局限性。 http://braungardt.trialectics.com/mathematics/mathematicians/kurt-godel/ 爱因斯坦、哥德尔。 相关链接： 2015-04-29 ，翻译爱因斯坦回信博文链接汇集（3） http://blog.sciencenet.cn/blog-107667-886229.html 2011-04-07 ，《中国“科学网大学”逻辑基础研讨中心》活动之一：逻辑基础资源 http://blog.sciencenet.cn/blog-107667-430666.html 2013-10-01 ，密尔求因果五法 http://blog.sciencenet.cn/blog-107667-729352.html 2013-06-30 ，《中国“科学网大学”逻辑基础研讨中心》活动之四：因果性与逻辑 http://blog.sciencenet.cn/blog-107667-703983.html 2010-03-09， 逻辑方法的局限性 ：G?del incompleteness theorem和Chaitin theorem http://blog.sciencenet.cn/blog-107667-301287.html 感谢您的指教！ 感谢您指正以上任何错误！ 感谢您提供更多的相关资料！

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语言也可成为杀生的工具

热度 1 jiangjiping 2018-9-15 07:46

语言也可成为杀生的工具 蒋继平 2018年9月15日 最近在微信上读到一篇【报刊文摘】， 作者是瑞敏。文章的标题是：骂了30 天， 植物被骂死， 你还敢对孩子恶言恶语？ 文章描述了如下的故事。 那盆被霸凌30天的植物， 终于被“骂”死了， 是不是不可思议？ 这是最近瑞敏看到的一个非常有趣的实验。 事情发生在阿联酋宜家， 实验者挑了两株生长情况一样的绿植， 给绿植们装上保护套， 放在学校大厅里， 每天接受一样的光照， 一样的浇水施肥， 唯一不同的是， 学生对它们的态度。左边绿植被贴上标签：“这株植物被霸凌”。而右边则是：“这株植物被褒奖”。 学生可以透过现场录音的形式， 留下积极或消极的话参与试验。这些话每天在绿植“耳边”被循环播放： “你看起来像快烂了一样。” “你还活着吗？” “你就是废物！” “你一无是处！” “没人喜欢你！“ 左边绿植每天”听着“恶狠狠的辱骂。 “一见你我就特开心。” “你真的很美！” “你正在改变世界。” “我喜欢你做自己的样子。” 右边的绿植每天洋溢在幸福的天堂。 循环播放30天后，被言语霸凌的植物， 叶子枯黄， 形态萎靡， 而饱受称赞的植物， 则生机勃勃， 朝气十足。 可见语言的威力是有多恐怖！ 看到这篇文章， 我自然而然地想到社会上发生的一些事。由于网络的匿名形式，许多网民利用这个不受法律和道德管束的“自由”，在网上任意施行霸凌的行动， 导致一些无辜者备受心灵的摧残， 有的人经不住这样的精神打击， 走上自杀轻生的不归路。 实际上， 这些网络暴民， 做的就是利用语言作为杀生工具的事。 这些人实际上已经成了“杀人犯”。现在， 这样的事例世界上到处都有， 正在引起世界各国的重视。 我很早就清楚积极的语言和消极的语言对人的影响。 因而， 在培养孩子的过程中， 我一直用积极正面的语言与孩子们交流沟通， 对他们取得任何成绩和进步都给予及时的赞美和鼓励。我从来不对孩子们实行惩罚的教育。 正因为如此， 我的两个孩子都表现不错。

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运筹优化工具——————jsoncpp

arccos0 2018-6-28 18:00

一、为什么使用Jsoncpp 运筹优化领域的科研人员与工程实践人员最常用的编程语言之一就是c++。它的优势非常明显，就是执行效率高。我之前尝试过，相同的逻辑使用matlab和c++，两者的运行速度相差10~20倍左右。 但是c++在处理文件输入输出时没有matlab或者python那么简洁方便。大多数运筹优化的从业人员并非擅长于编程，因为我们绝大多数来自于应用数学系、工业工程系、管理科学系等。尤其是在写c++代码时，输入输出的编写会占用我们大量的宝贵时间，而我们其实只想把时间更多地花在问题的核心——建模、算法上。 所以为了更快地实现“输入输出部分”，本文介绍Jsoncpp供各位在工作学习中使用。 二、什么是Json和Jsoncpp Json是 JavaScript Object Notation 的简称。具体的含义可以参考维基百科 https://en.wikipedia.org/wiki/JSON 。简单地说就是“key-value”类型的数据都可以用Json格式保存。举个例子，使用gurobi或者cplex时，有一些我们可调的与优化性能相关的参数，诸如：MIPGap等，又或者是设计元启发式算法时（比如遗传算法、禁忌搜索等）有很多参数需要我们调整。那么我们就可以用如下的格式表达： { “MIPGAP”: 0.001, “GA_MutationRate”: 0.05, “GA_CrossOverRate”: 0.2 } 这就是一个典型Json格式的数据。 Jsoncpp是C++解析Json格式的常用解析库之一。解析Json就仰仗它啦~~ 三、Jsoncpp的安装及vs2010环境配置 Jsoncpp的最新下载地址： https://github.com/open-source-parsers/jsoncpp 步骤一、 进入地址，点击release后下载最新版 \0 \0 步骤二、 使用vs2010或者其他工具（官方文档里用的时meson，但是我试了一下，没成功。。。）对jsoncpp进行编译。 注意！！在编译的时候如果选择的运行库是MD，那么对你自己的项目进行编译时也必须设置成为MD！！否则会出现大量的Link错误。 编译后在目录jsoncpp\\makefiles\\msvc2010\\Release中可以找到：lib_json.lib 步骤三、 打开你的vs项目，配置Jsoncpp的使用环境。 1）右击“项目”—》配置属性—》附加包含目录，加入jsoncpp下的include文件夹 2）附加库目录，加入lib_json.lib文件所在的路径； 3）最后把lib_json.lib加入到附加依赖项中 四、示例 以”test.json”为例： 我们建立一个新的项目，编写以下代码： intmain{ doublemip_gap; doublemutation_rate; doublecrossover_rate; std::ifstreamff(test.json); Json::Valueroot; Json::Readerreader; reader.parse(ff,root); mip_gap=root .asDouble(); mutation_rate=root .asDouble(); crossover_rate=root .asDouble(); std::cout\\n MIPGAPis:mip_gap\\n GA_MutationRateis:mutation_rate\\n GA_CrossOverRateis:crossover_rate\\n; system(pause); } 选择release模式后，运行结果如下： \0 \0 五、总结 文件的输入输出对于解决实际的运筹优化问题，虽然谈不上核心，却是必要的环节。处理不好这个环节，可能会严重耽误进程。 比如对科研工作者而言，算法的性能需要经过各种各样的算例测试后才能确定。而算例的生成就需要许多可调节的参数。这些参数尽量能够在“代码的外部”可以调节，从而加快计算实验的效率。反之，在代码中调整就必须多出了“编译”这个步骤，而编译通常是非常耗时间的。当然txt格式的传输也能做到这点，只是txt文件处理“key-value”这样的数据非常繁琐。

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[转载]超过六个元素的韦恩图你就玩不转了？

gncorner 2018-4-9 15:39

去年的《生信草堂》推文中介绍过如何利用 R 包和一个简易网页版工具绘制韦恩图的方法， 但那些工具只能有效地处理 5 组数据，因为当超过 5 组数据时，韦恩图就不能表达数据之间的关系了。今天小编给大家介绍一个更加直观反映多组数据相交个数的图像表达工具—— UpSetR （一） 初相识 首先这是一个 R 包，用 install.package 就可以安装。官方给出的英文说明是“ visualizes set intersections in a matrix layout and introduces aggregates based on groupings and queries ”。简单来讲就是矩阵数据中每个维度数据之间交集的可视化表达工具。 （二） 深入了解 UpSetR 支持两种数据形式的输入，直接命令行输入和文件形式输入。直接命令行输入也有两种形式的表达方式，一种是直接输入要比较的列表即可，另一种是输入已经计算好交互数量的值。 我们先看列表输入如何绘制。假设需要画出三个列表的交集，举例如下： # example of list input (list of named vectors) listInput - list ( one = c ( 1 , 2 , 3 , 5 , 7 , 8 , 11 , 12 , 13 ) , two = c ( 1 , 2 , 4 , 5 , 10 ) , three = c ( 1 , 5 , 6 , 7 , 8 , 9 , 10 , 12 , 13 )) upset(fromList(listInput)) 结果如图 1 ： 对于比较简单的任务，我们可以直接输入交互值，代码如下： #exampleofexpressioninput expressionInput-c(one=2,two=1,three=2,`onetwo`=1,`onethree`=4,`twothree`=1,`onetwothree`=2) upset(fromExpression(expressionInput)) 结果跟图一是一样的，因为我们用的就是其列表中的数据。但这种输入数据的方式需要额外的工作量，估计没多少人会选择。 接下来我们来学习一下怎么大批量的从文件中导入数据。 UpSetR 自带的示例文件（ mutations.csv ）能够很方便地帮助我们学习其支持的文件输入格式。该文件存储以逗号分隔的矩阵数据，包含 100 个 gene 的 283 个特性，其中“ 1 ”表示该基因有此特性，“ 0 ”表示该基因无此特性。 UpSetR 会计算全部基因中特性为 1 的交集个数。示例代码如下： mutations-read.csv(system.file(extdata,mutations.csv,package=UpSetR),header=T,sep=,) upset(mutations) 结果如图2，大家可以看到，在默认情况下，UpSetR默认输出交集个数大于0的组合。 除了默认模式，UpSetR支持指定需要交互的列以及输出交集个数为0的组合，代码如下： upset(mutations,sets=c(PTEN,TP53,EGFR,PIK3R1,RB1,SPTA1),sets.bar.color=red,order.by=freq,empty.intersections=on) 如图 3 ，在这个示例中，我们指定了 6 个待交互的元素，并设置颜色为红色，同时令交互个数为 0 的组合也显示出来，并按照交集个数由大到小排列。 \0 \0 总结：虽然 UpSetR 不是绘制本质上的韦恩图，但它以柱状图的形式清晰地表达了待研究集合之间的交集数目，它可以支持多种数据形式的输入，并且不受输入集合个数限制，是一款十分好用的绘图工具。 转自生信草堂，已授权 生信草堂 浙大生信博士团队倾力打造的一个科研人员学习交流的公众微信平台。我们致力于科研社区服务，分享最前沿的科技进展，提供生信分析方法，解读经典分析案例，公众数据库的挖掘和临床数据统计分析。在此我们欢迎各位的加入！ 加微信 bioinformatics88 拉您进生信交流群 \0 \0

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美国社会真相系列（66）

热度 1 jiangjiping 2018-1-9 08:03

美国社会真相系列（66） 六十六 美国的媒体是政府权力和社会弊端的监督工具 蒋继平 2018年1月8日 我在上一篇的美国社会真相系列中说美国人非常善于说恭维话。 但是， 这是指工作场合，公共场所， 或者私人聚会之间普通民众的言谈交往言辞。与此却却相反， 美国的媒体从来就言语牟利， 甚至尖端刻薄，尤其是对政府机关， 各级政府公务员，大牌明星和商场富豪，以及社会的弊端锋芒毕露， 针锋相对， 绝对不给面子。 美国的主流媒体， 如：美国全国广播公司（NBC）， 哥伦比亚广播系统（CBS）, Fox 电视台，时代期刊 （Times Journal), 美国有线新闻网络(CNN)，华盛顿邮报（Washington Post), 等等具有重要影响力的大众媒体， 一般很少花篇幅为政府部门和各级公务员唱赞歌， 而是实事求是地登载民众对他们的评价。 这主要通过民意调查来获得民众的看法。即使是总统， 一旦有行为不规的言行举止， 也会被媒体暴露在新闻媒体上。你们看看各种媒体对美国新任总统川普（Trump)的报道就可以证实我说的是真相。 美国的主流媒体更多的是展示各个不同政党和不同社团， 以及它们的代表人物的执政理念和价值观。 这在决定政府各级公务员的选举期间更为明显。这些主流媒体的另一个主要任务是及时地报道各种重大事件， 尤其是对民生有重要影响的事件， 他们会及时地揭露社会的各种弊端， 引起政府部门的关注。 文艺领域和街道社区的娱乐媒体， 更是把各种政要， 富商和明星人物当成茶前饭后的谈资笑料， 各种八卦消息都有， 有的甚至是瞎编的。 总而言之， 美国的媒体一直充当着对政府权力强烈监督的角色。虽然美国的政治体制是三权分立， 互相制衡，但是，真正的权力制衡和监督来自于真正民主下的舆论监督。 充分的言论自由， 让公众的意见和观点得到充分的表达， 是对权力滥用的最有效手段。 这样的言论自由，是人们不畏强权，具有自揭其短的勇气的根基。正是这样的舆论监督， 使美国一直处于比较平稳的状态和很少有权力滥用的例子。 言论自由是防止腐败的可靠保证， 是民族自信的具体表现，是民族自律的有效措施， 是人人平等的公正法则。 顺便说一下， 美国的媒体基本上都是私人公司， 不是政府的宣传机构。 所以， 它们不受政府在经费上的调控，它们只要提供广大民众喜爱的内容， 赢得观众市场就可生存下去。

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[转载]39个大数据可视化工具 数据研究必备

rbwxy197301 2018-1-6 10:01

39个大数据可视化工具 数据研究必备 数据可视化无处不在，而且比以前任何时候都重要。无论是在行政演示中为数据点创建一个可视化进程，还是用可视化概念来细分客户，数据可视化都显得尤为重要。以前的工具的基本不能处理大数据。 本文将推荐39个可用于处理大数据的可视化工具（排名不分先后）。 其中许多工具是开源的，能够共同使用或嵌入已经设计好的应用程序中使用，例如Java，JSON，SVG，Python，HTML5，甚至有些工具不需要任何编程语言基础。其他的则是商业智能平台，能够进行复杂的数据分析并生产报告，并配有多种方式实现数据可视化。无论你是需要对数据进行分析并且决定用最好的方式向你的客户或同事进行展示，还是你心里有一个视觉化布局但需要将此概念应用到生活中，该表单中总会有一款工具能够满足你的需求。 1.Polymaps 需要在地图上展示复杂的数据集？Polymaps是一个免费的Java库，也是SimpleGeo和Stamen的开发的一个联合项目。这种复杂的地图叠加工具可以加载多种规模的数据，提供多级别缩放功能，大到国家，小到街景。 主要特点： 使用可缩放矢量图形（SVG） 展示国家、州、城市、社区和街景 基本的CSS规则控制设计 图片是球形墨卡托瓦格式 费用：免费 2.NodeBox // @Nodebox 实验媒介研究小组（Experimental Media Research Group）开发的一组开源工具，NodeBox的兼容性是跨平台图片库或Mac的app都能创建Python编码的2D界面。 主要特点： 与标准设计应用程序集成 跨平台，基于节点的图形用户界面（GUI） NodeBox1 – Python编码、2D界面的Mac应用程序 导入多种类型的数据，包括Excel 动画效果 运用最少的编程技能建立一个生产设计 费用：免费 3. Flot JQuery的一个Java绘图库，Flot是一个基于浏览器的应用程序，并且能够兼容大多常见的浏览器，包括IE、Chrome、Firefox、Safari和Opera。Flot对于数据观点支持多种可视化选择，交互式图表、堆叠式图表、平移和缩放，以及通过各种插件实现各种特定功能。 主要特点： 支持线性、图片，用任何组合填充区域 在同一个数据序列里运用组合展示元素 绘图分类以及文本数据 增加DOM操作标准的HTML 产生切换系列交互式视觉效果 直接的画布准入绘制自定义形状 费用：免费 4.Processing // @ProcessingOrg Processing创建之初为教计算机基础知识在视觉环境的一种手段，但现在由学生、设计师、研究者、艺术家和业余爱好者使用，用于创造学习模型和实际产品的原型。用户可以创建简单或复杂的图像，动画，和相互作用。 主要特点： 2D、3D和PDF格式输出 交互作用程序 Open GL一体化 超过1000个库的附加功能 创建交互、文本、动作和动画 5. Processingjs Processing的姐妹站点，Processing.js这个工具可以处理复杂的数据视觉化、图形、图表或是其他视觉效果，并是网页可用的形式，并不需要任何扩展程序或插件。这就意味着你可以运用标准Processing语言写代码并且插入到你的网站，而且Processing.js并不需要额外的编码需求来实现其功能。 主要特点： 允许Processing代码可以在任何HTML5浏览器运行 动画和交互式可视化效果融入任何web 页 没有额外的编码需要 费用：免费 6. Tangle Tangle是一个Java库和工具，不仅仅是视觉化，还允许设计师和开发者创建reactive程序，对数据的关系可以提供深层理解。例如，一个网页端的转换计算器能够转换货币或测量。 主要特点： 允许读者来改变参数 基于定义的变量、格式和分类 运用Tangle类创建图表和其他可视化效果 能够创建动态的展示 同时使用多种变量建立控件和视图 费用：免费 7. D3.js 一个强调网页标准的用来创建数据可视化Java库。使用HTML、SVG和CSS，可以让使用者以数据驱动的方式去操作DOM，能够满足现在浏览器的兼容性并且不受专用框架的限制。 主要特点： 绑定任意数据到DOM 创建交互式SVG条形图 从数据集里产生HTML表格 多种组合和插件来增强兼容性 内置的可重复使用的组件以便于编码 费用：免费 8. FF Chartwell // @FontFont FF Chartwell将简单数字串转换会可编辑的数据可视化，并进一步的自定义使用OpenTy功能。它是能够用于标准设计套件，例如Adobe CreativeSuite，简单化图表的设计。 主要功能： 使用简单的数据串来产生图表 有利于创建一个大信息图元素 没有编码功能节省时间 与设计应用程序一体化 多种可视化类型 费用： 所有功能-$119 单个功能-每个$25 （条形、垂直图、线形图、饼图、雷达图、环形图、玫瑰图） 9. Google Maps // @GoogleMaps 谷歌地图提供一些APIs给开发者，例如谷歌地球、谷歌地图图像和谷歌地方信息。这些工具能够使开发者为任何应用程序或网站建立交互式视觉地图程序。 主要特点： 将地图嵌入网页中 提出有关机构、感兴趣的地方和其他位置的数据 能够使网站访问者在你的网站限制范围内使用谷歌地球。 10. SAS VisualAnalytics // @SASsoftware SAS可视化分析工具为了更加全面的分析能够探索各种尺寸的数据集可视化。拥有直观的平台和自动化预测工具，SAS视觉分析允许甚至可以让无技术基础的用户来探索数据和潜在机会之间更加深层次的关系。 主要特点： 在前置或公共或私人云上部署 拖放图表自动为数据选择最好的布局 弹出提示区识别潜在的重要的相关性 场景分析能够在变量变化基础上进行预测 存储视图为报告、图片或SAS移动端 用户易于使用数据来整合行为元素 费用： 完整功能免费演示版（不同环节之间不能储存报告） 按要求报价 11. Raphael 一个Java库用来在网页上创建矢量图形，Raphael使用SVG和VML，因此每一个被创建的图表同时也是一个DOM对象，Raphael的目标是能够矢量图表作品能够跨浏览器兼容。 主要特点： 网页上包括Raphael.js功能 创建多种多样的图形、表格和其他数据可视化 多图表能力 费用：免费 12. Inkscape // @Inkscape Inkscape提供的功能类似于Corel Draw和Illustrator软件，然而它的开源编辑器是矢量图形。Inkscape支持许多先进的SVG功能，因此能够轻易使用，并鼓励开发者在社区环境里合作。 主要特点： 类似标准软件处理复杂的图表任务 内置的SVG格式 创建网站原型 导入和显示位图的功能 文件储存为矢量图 费用：免费 13. Leaflet // @LeadletJS 一个开源Java库，Leaflet是用来创建移动友好性、交互式地图的工具。由VladimirAgafonkin和一个团队贡献开发而成，Leaflet设计的目标是简洁性、表现性和易用性。 主要特点： 所有主要桌面和移动浏览器上能工作 各种扩展功能的插件 一体化的互动功能 多重可用地图层 CSS3功能提供流行型的用户交互作用 消除移动设备上敲打延迟 费用：免费 14. Crossfilter Crossfilter使我们能够在浏览器里探索大量多元数据集，也是Java库，能够处理超过一百万记录的数据集。Crossfilter使用语义版本控制并且易于使用值、目标和其他元素和命令来自定义的创建数据可视化。实际上，它使Square Register的商家有权利操纵销售和购买数据。 主要特点： 使用语义版本控制 探索大量多元数据 快速增量过滤和减少 提高实时直方图的表现力 费用：免费 15. Open Layers 3 可以用OpenLayers在任何网页里插入一个动态地图。它执行Java API用于建立网页端地理学的应用程序，并且不需要服务端依赖关系能在大多数现在的网页浏览器工作。它是一个开源软件，结合了最新的HTML5和CSS功能，提高了3D功能。 主要特点： 在大多数现代网页浏览器里工作（平铺和矢量图册） 不需要服务端依赖 创建个性化嵌入的、动态的地图 缩放功能、地理位置和其他函数功能 开箱移动支持 费用：免费 16. Kartograph Kartograph即使Python库也是Java库，迎合了想要创建友好型Illustrator SVG地图和交互式地图的开发者，并且能够在各主要浏览器上运行。 主要特点： 两个库：Python和Java Kartograph.js能在几分钟内创建交互式地图 独立运作，不需要服务器 Kartograph使用简单型的Visvalingam创建紧凑型SVGs 地图上的数据集层能进行多层级可视化 费用：免费 17. Microsoft Excel Microsoft Excel因为它的数据处理和分析功能而广泛闻名，但是它经常用于创建强大的数据可视化。Excel的最新版本塞满了可视化工具，包括被推荐的图表，不同方法迅速分析并展现数据，有多重控制选择来改变和布局可视化。 主要特点： 在同一个程序里运行数据分析并且创建可视化 数据多种展现的方式进行比较 改变平铺、布局和其他格式选择 Excel推荐数据最好的可视化方式 能够兼容Microsoft Office产品 费用： Office 365 Home– 每年$99.99或每月$9.99 Office 365 Personal –每年$69.99或每月$6.99 Office Home Student 2016 – 永久购买$149.00 Office 365 Business Essentials – 每个用户每月$50（每年义务） Office 365 Business –每个用户每月$8.25（每年义务） Office 365 Business Premium – 每个用户每月$12.50（每年义务） 18. Modest Maps 对于想要将交互地图放进应用程序的开发者而言，Modest Maps是一个免费的而且能够扩展的库，由Stamen, Bloom,和MapBox合作开发。 主要特点： 用于为基础构建映射工具 用于少数扩展程序，例如MapBox.js,HTMAPL和Easey 保护基本控制的设计 费用：免费 19. CartoDB CartoDB允许你在数分钟内上传并视觉化数亿个数据值。它还具有地理空间分析功能探索、改进，并从您的数据获得的见解。 主要特点： 探索数据并获取见解 直接在地图上编辑数据 与PostGIS 兼容的更强大的分析 先进版本的CartoCSS▏支持栅格数据和矢量数据 费用： 免费—无限数据集/4层地图层，，250MB矢量数据，每月1000条推特 基础版-每月$149，无限数据集/5层地图层，500MB矢量数据，每月10000条推特，同步表格，私人地图，可移除标识 专业版-每月$449，无限数据集/6层地图层，1.5GB矢量数据，每月250000条推特，同步表格，私人地图，可移除标识 企业版-每月$825，无限数据集/6层地图层，5GB矢量数据起步，每月250000推特，同步表格，私人地图，可移除标识 20. Google Charts Google Charts提供大量数据可视化格式，从简单的散点图到分层树地图。可视化效果是完全个性化的，你可以通过动态数据进行实时连接。 主要特点： 谷歌利用同样的图表 将多个图表组装成直观的仪表板 兼容多个浏览器 多个平台可使用（IOS和安卓设备） 从各种图表中选择 费用：免费 21. Gephi // @Gephi Gephi是能在Windows、Linus和Mac OS系统上运行的开源应用程序。该平台允许用于可视化和探索数据，包括复杂的线性分析、社会网络分析等其他深入了解数据关系的模型。 主要特点： 插件更加个性化 深层数据分析来检测关系 内置的 3D 渲染引擎 实施视觉化 动态过滤 有内置的直观的工作量组织界面 费用：免费 22. Flare Adobe Flash Player里可以运行的创建数据可视化的Action库，Flare是一个开源应用程序，由一些知名组织和出版商使用，来创建强大的可视化图，包括Slate、IBM VisualCommunication Lab和ABC News。 主要特点： 处理复杂、交互式图表 支持数据管理、视觉编码、动画和交互作用 各种可视化表格从时间线到多层图表来说明关系 费用：免费 23. Envision.js 用Envision.js库创建快且交互式HTML5可视化，能够展示实时数据、时间序列、财务可视化、AJAX驱动财务图表和自定义可视化，包括分形。 主要特点： 内置各种图表和图形的模板 将可视化效果、交互作用和自定义组件一体化 自定义图表层类型 费用：免费 24. Miso 开发中的一个开源工具，Miso合并数据集、故事版和d3图表来创建交互式故事和数据可视化效果。Miso是The Guardian和Bocoup的联合项目，得到GlobalDevelopment、The Bill和Melinda GatesFoundation的支持。 主要特点： 高质量交互式故事 数据可视化内容 Java 客户端的数据管理和转换库 运用D3.js创建可重复使用图表 费用：免费 25. The R Project R Project是在UNIX、Windows和Mac OS上运作的统计计算软件。设计的目的是用于统计计算和统计制图，它考虑了不同应用的S语言，也包含了一些本身的S代码，在R里没有改变，虽然也有一些显著的不同。 主要特点： 数据处理、计算和图表展示 用于即时分析的集成工具 条件、 循环、 用户定义的递归函数和输入/输出设备 定义新功能来增加兼容性 费用：免费 26. Tableau Public // @Tableu Tableau是一个简单的、使用友好的用来迅速创建交互式可视化数据，并将它们嵌入你网站的工具。设计的目的是能由开发者、或无开发经验的人使用，例如博主、记者、研究员、律师、教授和学生。 主要特点： 可以网上使用，或者下载并处理可视化 桌面端完整版应用程序图片可以在公共服务器进行储存 存储数据空间有50MB（免费计划） 拖拉式界面，不需要编程技巧 费用： 公共版本-免费 个人版本-每个用户$999 专业版本-每个用户$1999 27. Timeline JS // @knightlabTimeline JS3 Timeline JS作为开源工具能够从多重资源中提出媒介，运用40中不同语言建立交互式时间轴。内置支持Twitter, Flickr,Google Maps, YouTube, Vine和其他应用程序，Timeline JS拥有大量功能，能够进一步的拓展进行自定义安装来兼容JSON。 主要特点： 运用GoogleSpreadsheet数据建立时间轴 上传电子表格，并生成嵌入代码 从第三方apps在时间轴里嵌入音频、视频 WordPress插件 从JSON数据库中填补数据 费用：免费 28. Quadrigram //@quadrigam Quadrigram使用户能够创建自定义可视化效果，运用他们的数据和来自内置里图表、图形等各种组件来quadrification 和叠流。基于可视化编程语言（VPL），Quadrigram是能从多个数据源提取并创建不断变化的原型和数据可视化效果。 主要特点： 完整的交互式可视化库 建立动画、仪表盘或更多其他的 草图想法和创建快速原型 基于云计算的快速数据处理 集成R 和 Gephi 的服务端 利用多个公开发布的数据集 费用（价格转换自欧元）： 学术版-每月$6.43（1个用户，100MB存储量） 个人版-每月$20.38（1个用户，3GB存储量） 专业版-每月$63.27（3个用户，10GB存储量） 工作版-每月$267.02（20个用户，100GB） 企业版-联系报价 29. Prefuse Prefuse是一个数据可视化工具，IBM视觉传播实验室用于该公司Many Eyes工具来创建可视化效果。Prefuse软件包为Java提供了可视化框架，而Prefuse Flare工具包为Action和Adobe FlashPlayer提供了可视化和动画化工具。 主要特点： 数据建模、数据交互化和可视化 为各种视觉布局进行数据结构优化 支持动画化、动态搜索和数据库连接 使用Java 2D图片库 30. Many Eyes Many Eyes是由IBM研究所和IBM Cognos软件小组的试验成果。该工具提供了一个平台，用于创建各种可视化效果说明数据点关系，比较的值集，创建线性和堆栈图、分析文本，或查看整个饼图或树图中的各个部分。 主要特点： 多种方式展示数据 上传供公众使用的数据集 运用Java和Flash展示数据 通过用户打分收集反馈 完全的控制或删除你的数据集和可视化图 使用其他用户现存的数据集或者你自己的数据 费用：免费 31. Cytoscape // @Cytoscape Cytoscape能够合成不同属性的数据形成可视化的复杂网络。针对特别领域分析的功能，例如生物信息学、语义网和社交网络分析，Cytoscape具有这些功能，并能创建邻人着迷的图表来表示数据之间的关系。 主要特点： 问题领域的应用 先进的分析及应用程序进行建模 人力策划数据集进行可视化 可视化社交网络中的人际关系 与其他工具一起联合使用（例如R、NetworkX） 费用：免费 32.NetworkX NetworkX基于Python编程语言，能够创建图表、有向图和多种多媒体格式合成的重图。Python是用于创建多种交叉兼容的数据可视化的多平台语言。 主要特点： 学习结构、动态和复杂网络功能 节点能够包含任何媒介类型，例如图像和XML 边缘能够包含任何数据，例如加权或时间序列 多种图表类型生成器，包括经典的曲线图、随机图和合成网络 费用：免费 33. Arbor.js Arbor由网络工作者和jQuery一起建立的，能够运用画布、SVG或是HTML定位元素来创建数据可视化的工具。Arbor旨在帮助开发者创建强调他们数据集唯一性而不是需要各种布局的物质性。 主要特点： 能够处理实时色彩和价值充斥 力导向布局图增加了抽象性 实际屏幕绘图由用户做出 费用：免费 34.iCharts // @iCharts iCharts是基于网络端的应用程序能够在网页上生成引人注目的数据可视化工具。这种云本地应用程序工具是“是为企业云应用内置的唯一数据可视化平台”。将图表和图形集成到网站/应用程序或通过社交媒体或iCharts图表频道分发完成可视化。 主要特点： 运用公司的logo进行品牌视觉化 为了更好的发现增加标签或描述 启用第三方网站重新嵌入可视化来扩大范围 数据是实时的 创建交互式、探索性图表 领先一代的激活自制表格 分析报告在图表视图、共享和嵌入 费用： 基础版-免费（仅限公共图表） 网络套装可视化报告和分析-每个用户每月$64.95 销售团队可视化报告和分析-测试版本请电联 35. Databoard 来自谷歌的工具，Databoard是Think平台的一部分，主要面向企业主。探索见解直接来自谷歌调查研究，来迅速的查找数据并且创建自定义的信息图表来嵌入网站或在社交网络上分享。 主要特点： 探索谷歌数据调查研究 直接生成图表元素 通过合成多种元素建立自制图表 主要专注移动数据 费用：免费 36. Q Research Software // @qstatistics 对于研究和数据可视化而言都是一个强大的数据库，Q Research软件时一个用于准备市场研究报告的工具，全是有价值的见解和可视化效果。以图表格式、CSV文件和PDF文档输出到Word、Excel和PowerPoint，并且从一大堆工具/元素中选择进行自制可视化效果。 主要特点： 可编辑的Office图表 多种图表类型（线性、气泡、饼图、列图等） 直方图和散点图 利用实时数据更新图标 创建变量值，应用过滤器，进行统计检验 强大的分析包括对应分析、logit分析、潜在类别分析、回归分析、Max-diff分析，随机参数分析、Kruskal Shapley、TURF分析等 费用： 30天免费试用期 标准授权许可 – 每年$1,499（所有功能） 可转让授权许可-每年$4,497（在多台计算机上安装） 37. Dapresy // @dapresy 专为研究分析师设计，Dapresy允许用户运用简易使用的拖拉界面建立为他们的幻灯片和仪表盘建立信息图表。Dapresy是一个综合性平台能够处理整个报道过程，从数据分析到视觉上具有吸引力的展示工具和仪表板。 主要特点： 简单的引入实地文件，Dapresy能够处理数据 图、表、交叉分析表和综合统计分析 为市场仪表板建立动态元素 从200张幻灯片里打包数据为较少动态Dapresy幻灯片 灵感创意箱 费用：电话联系报价 38. Visualize Free 基于商用可视化的工具InetSoft，Visualize Free是一款免费的替代方案，使您可以通过几个简单的点击来对多个数据集和变量进行筛选，确定趋势和处理数据。 主要特点： 用Excel或CSV格式上传你的数据 拖放元素来建立可视化效果 沙箱技术用于数据分析 公众或私人分析 费用：免费 39. Jolicharts // @Jolicharts Jolicharts将图表和表格嵌入你的应用程序里，能够兼容多种数据源并处理连接多种数据源的复杂性。利用集成的弹性计算能力，Jolicharts能轻易处理大数据。 主要特点： 拖放界面创建令人惊叹的仪表板 输出仪表板XLS、PDF或JPG格式 过滤器来确保各个用户的数据 基于Rest端的API能够兼容任何应用程序 云端应用保证你的数据和可视化的可获得性 HTML5仪表板能在任何设备上获得数据 费用（欧元转换的价格）： 永远免费计划-免费（50MB数据存储量，单一用户，展示不受限制，每个展示有一个数据源） 专业版-每月$31.13（10GB数据存储量，增加到5个用户，展示/数据源不受限制） 企业版-每月$74.06（250GB数据存储量，增加到5个用户，用户/展示/数据源不受限制） 这份清单包含了最后欢迎的大数据可视化分析的工具。 End. 转载请注明来自36大数据（36dsj.com)： 36大数据 » 39个大数据可视化工具 数据研究必备

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创新的精神与规矩，不止是画图——禅的行囊（之二十）

罗非 2017-12-5 10:22

导读：规矩是中国社会赖以维系的主要纲领。古人就说， “ 没有规矩不成方圆 ” 。规是画圆形的工具，而矩则是画直角的工具。没有这些工具，确实没办法搞几何作图。但这句古语想说的并不止于几何学或者工程学，而是任何事情想做成，都需要适当的工具。这样看来，社会的规矩，就是完成社会操作的工具。规矩放而大之，就是法令、法律、制度，乃至社会结构、思想结构。从这句古语的智慧，可见中国古人强调规矩，是因为它们是重要的工具，而不是因为它们神圣不可侵犯。有了电脑，我们可以放下直尺、三角板和圆规，但仍然可以更好地完成几何与工程作图。在任何领域都是如此，一旦有了更好的工具，原来的老古董就可以送进博物馆了。 这件事本来是如此明显，但同样明显的是，人类几乎总是不舍得放下老规矩。古代的王安石变法就遭遇了巨大阻力，最终失败；五四运动时期，中国的青年决心建立新的文化和社会组织方式，也遭遇了很大的阻力，经历无数流血牺牲，至今在人们心目中还没有完全完成。时代前进到信息、网络、大数据、云计算和人工智能时代，显然又到了重新选择工具的时候。但还是有许多人抱着来自古希腊、古罗马的某些制度不放，宣称它是神圣不可侵犯的普世真理。但实际上，它也只是一个工具，有它的时代和时空局限。懂得规矩只是用来成方圆的工具，人类就可以减少许多烦恼和冲突。就好像吃饭是为了生存，饭一定要吃，但怎样吃则各有各的喜好。一定要说我的饭才是普世真理，强迫全人类都必须吃我的饭，否则就大逆不道？如果这样的人出现在世界上，一定马上会被看作神经病或者偏执狂。不幸的是，这件事一旦涉及到某些社会组织形式，有些人就再也想不通，仿佛一叶障目，不见泰山。这个世界上，可悲可笑，不过如此！ 在今天的时代，真有本事、有见识、有关怀、有担当的人，应当想办法自己发明一套全新的、适合当代乃至未来时代的社会组织方式，不要再抱着古希腊传承下来的那套思想和方式不放了！虽然这条路肯定并不简单，但是， “ 丈夫自有冲天志，不向前贤行处行 ” ！自称关心社会、关心国民、关心人类的人，都请站出来做大丈夫吧！敢于创新，这才是科学精神！ 在七十公里界碑处，我们经过青瓷窑煤矿拥有的一座附属矿井。农闲时节，农民们会到矿上挣点外快，还有些倒霉蛋一年到头在这里挖煤。蜿蜒的山路终于把我们送出这道山脉，然后向西进入一条无比宽阔平坦的山谷，那一定是远古冰川运动的杰作。司机突然又把车停下了。他跳出驾驶室，在一个车轮上踹了两脚。那条车胎在慢撒气。但仍然不必担心 —— 中国的道路两旁，哪怕是再荒凉的地方，补胎的小铺子也随处可见。果不其然，前方几百米外的一座土坯房门口挂着块牌子：补胎。 司机找出千斤顶撬起车身，卸下轮胎，一路扶着它滚向土坯房，其他人都下了车，站在路边抽烟、放水或者活动着腿脚。我跟坐在我前面的一个男人聊了起来。这是个八十多岁的蒙古族老汉。在他干瘪的嘴里，我只发现了两颗牙齿。大概他每天只能就着稀粥吃点馒头了。他以为我是维族人，我以为他是藏族。互相搞清楚对方的身份之后，他告诉我，他认识五台山上一座庙里的喇嘛。每年春天，他都会去庙里修行一段时间，秋天再回大同去，如此坚持了七年。我跟他打听山上的住宿情况，他推荐了几家比较适合香客的旅馆。 我们正聊着，另一个蒙古族人走了过来，递给老汉一瓶白酒，老汉又递给了我。我笑着把酒瓶推了回去。这么一大早就喝酒太奇怪了，更何况还是在车上。另外，中国白酒是最让我难以接受的酒精饮料，只要想到它，我就能浑身一激灵。把酒还给老汉之后，我走开去和旁边的一名僧人聊天，他一个人站在路边，手里默默转动着念珠。僧人来自五台山的宝华寺，几天前到大同的华严上寺见了一些同修，现在正要返回五台山。宝华寺在北台的山脚下，靠近碧山寺。我告诉他我去过碧山寺，但从来没听说过宝华寺。他解释说，宝华寺里僧人不多，因此也没有多少香客 —— 清静的道场好修行。他邀请我到庙里住上一段时间，但我已经有别的安排了。也许下次吧，我说。 司机回来了。装好轮胎，我们继续西行，开进破烂不堪的砂河镇，从满街的行人身边呼啸而过。每天有两趟从北京出发的列车经停砂河镇，卸下那些去五台山朝圣的香客和游人之后，继续开往终点站太原。 1989 年，我曾来过砂河，如今十几年过去了，镇上几乎看不出什么变化：一条大街从镇中穿过，镇上的一切都杂乱无章地堆在大街两边。有人向司机招手，但司机没有理会，继续向前开去。正常情况下，中国的巴士总是尽可能的拉客，也不管车上还有没有座位。现在碰上这么一位高傲的司机，让我感到很困惑。我自言自语地嘟囔了几句，被坐在前面的蒙古族老汉听到了，他转过头来为我解惑：在砂河镇坐车的人，只能坐砂河镇的车，这是这儿的规矩。

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这样劝人喝酒到底是文化还是其他什么？

热度 9 jiangjiping 2017-6-30 08:26

这样劝人喝酒到底是文化还是其他什么？ 蒋继平 2017年6月29日 最近在微信圈中看到一段小视屏。 这个视屏实际是一部短剧， 剧中许多人物都是影视大明星。 视屏的题目是：四川美女劝酒， 笑死一桌子人。 现在我把视屏中的一些劝人喝酒的话语抄录如下。 男人不喝酒， 枉在世上走。酒是一包药， 不喝不快乐。 酒精虽有毒， 不喝不舒服。不吃又不喝，经济要滑坡。 只要感情对， 要喝就喝醉。 不会喝酒， 前途没有。 酒杯一端， 政策放宽。 只喝饮料， 领导不要。 一喝就倒， 工作难保。 一喝九两， 重点培养。能喝不输， 领导秘书。 一半就跑，升官还早。 全程领跑， 未来领导。 我看了这个视屏， 心中觉得很不舒服。虽然我懂得喝酒被中国人视为一种文化， 或者更确切地说， 是一种酒文化，但是， 我觉得这种酒文化到了当今的中国社会， 已经大大地偏离了老祖宗们创造酒文化的宗旨。 老祖宗们造酒和喝酒的主要目的是： 招待远方来客，表达友好情谊。 欢度良辰佳节，共享天伦之乐。 处理红白喜事，舒解心中喜忧。 庆祝胜利凯旋，抒发豪情壮志。 应酬熟人朋友，寻找文化知音。 而今日中国的酒文化已经演变成一种为达到某种目的工具。具体地来说，酒已经成为： 仕途上攀升的阶梯。 商场上投机的利器。 社会上迷魂的工具。 江湖上害人的毒药。 上面的劝酒词已经把这些说得很清楚了， 我不需要多解释。 我借用这篇博文表达与上面的劝酒词相反的意思。 酒的功过 健身益寿谷果精， 调味增鲜百菜赞。 请客会友作桥梁， 解郁除闷似灵丹。 热血壮胆长勇气， 提神激知出灵感。 沉湎贪杯伤财体， 狂饮烂醉讨人厌。

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JavaScript开发工具大全

stefanzan 2017-6-19 15:12

译者按: 最全的JavaScript开发工具列表，总有一款适合你！ 原文: THE ULTIMATE LIST OF JAVASCRIPT TOOLS 译者: Fundebug 为了保证可读性，本文采用意译而非直译。另外，本文版权归原作者所有，翻译仅用于学习 。 简介 2017年1月，Stack Overflow年度开发者 调研 一共访问了 64000 个程序员，发现JavaScript已经连续5年成为最流行的编程语言。 这篇博客将介绍一些常用的JavaScript开发工具： 构建自动化 IDE编辑器 文档 测试 调试 安全 代码优化分析 包管理 构建 自动化 Webpack 对JavaScript应用依赖的所有模块进行静态分析，生成依赖图，然后将它们打包成数个静态文件。 Grunt 以将重复耗时的任务自动化。Grunt的生态系统非常大，有超过6010个插件。 Gulp 发布于Grunt之后，采用了完全不同的方式，使用JavaScript函数定义任务。它有超过2770个插件，并且提供了更好的控制。 Browserify 使得开发者可以在浏览器使用 CommonJS模块 。开发者像在node环境一样，通过require('modules')来组织模块之间的引用和依赖，Browserify将这些依赖打包成浏览器可以直接引用的JS文件。 Brunch 非常简单，速度很快。Brunch的配置文件非常简单，入门文档非常详细。Brunch会自动生成Source Map，方便了开发者Debug。 Yeoman 可以用于任何编程语言(JavaScript, Python, C#, Java, etc.)。它是前端开发的脚手架，有6213个插件。 IDE 编辑器 WebStorm 是一款强大的JavaScript IDE。它支持多种框架和CSS语言，包括前端，后端，移动端以及桌面应用。WebStorm可以无缝整合第三方工具，例如构建构建、语法检查构建linter等等。它提供了代码补全，实时错误监测，导航，内置控制台，各种插件等一系统功能。 Atom 是GitHub团队开发的。开发者可以很容易地对Atom进行自定义。Atom自带了一个包管理工具，代码补全，文件系统浏览器，支持多个平台以及其他有用的功能。 Visual Studio Code 是微软开发的IDE，支持TypeScript。它提供了代码补全，语法高亮，支持Git命令等等。另外，它还有非常多的插件。 Brackets 是一个轻量级的开源编辑器。它专注于可视化工具，可以帮助开发者开发Web应用。Brackets支持实时预览以及行内编辑。 文档 Swagger 提供了一系列规则用于描述API。使用Swagger，可以创建清晰的文档，并且自动化API相关的操作(例如功能测试)。 JSDoc 可以根据javascript文件中注释信息，生成JavaScript应用程序或库、模块的API文档。JSDoc可以用于管理大型项目。 jGrouseDoc 是一个开源工具，可根据JavaScript注释生成类似Jaavdoc 的源码文档。它不仅可以为变量和函数生成文档，还可以为模块等其他元素生成文档。 YUIDoc 基于Nodejs，可以将文档中的注释生成API文档。它使用类似于Javadoc与Doxygen的语法，并且支持实时预览，支持各种语言，并且支持标记语言。 Docco 是免费的文档工具，由 Literate CoffeeScript 编写。它将代码中的注释生成HTML文档。Docco并不限于JavaScript，同时支持Python, Ruby, Clojure等语言。 测试 Jasmine 是一个行为驱动开发(BDD)框架，用于测试JavaScript代码。它不依赖任何第三方模块，也不需要DOM。它的语法非常简单易懂，使得编写测试变得很简单。另外，它也可以用于测试Node.js，Python以及Ruby。 Mocha 是一个功能测试框架，用于测试Node.js以及浏览器端JavaScript。作为开发者首选的测试框架，它可以自由的编写测试组，提供详细的测试报告，同时让异步测试非常简单。Mocha通常与断言库 Chai 来验证测试结果。 PhantomJS 用于前端单元测试。由于PhantomJS是一个无界面的Webkit浏览器引擎，与直接使用浏览器测试相比，使用PhantomJS脚本可以运行得更快。它支持各种网页标准，例如JSON, Canvas, DOM操作, SVG以及CSS选择器。 Protractor 是一个端到端测试框架，用于测试Angular应用。它是基于WebDriverJS构建的，它可以通过浏览器事件或者原生事件，从而模拟真实用户，来测试应用。 调试 JavaScript Debugger 由Mozilla Developer Network (MDN)开发，可以独立用于调试Node.js代码，或者用于其他浏览器。Firefox提供了本地和远程调试功能，并且，Firefox安卓端也用于调试运行在安卓应用。 Chrome Dev Tools 提供了一系列工具，可以用于调试JavaScript代码，编辑CSS，以及测试应用性能。 ng-inspector 是Firefox，Chrome和Safari浏览器插件，可以帮助开发者开发、理解以及调试AngularJS应用。它提供了实时更新，DOM高亮等功能。 Augury 是一个Chrome插件，可以用于调试Angular 2应用。它让开发者可以直接查看应用结构，操作特征以及状态变化。 安全 Snyk 是一个付费服务，用于发现、修复和预防JavaScript，Node.js和Ruby应用的已知漏洞。Snyk拥有自己的漏洞库，以及 NSP 和 NIST NVD 的漏洞数据。它允许开发者使用它们的补丁和更新来修复这些安全漏洞。 Node Security Project 提供了工具用于扫描依赖来监测漏洞。NSP使用自己的漏洞数据，以及来自 NIST NVD 的漏洞数据。NSP支持集成GitHub和CI软件，实时监测和报警，并且可以提供如何修复Node.js应用漏洞的建议。 RetireJS 是一个开源的依赖监测工具。它包含了多个组件，包括命令行工具，Grunt插件，Firefox和Chrome插件，Burp和OWASP ZAP插件。Retirejs从NIST NVD，漏洞追踪系统，博客和邮件列表等手机漏洞数据。 Gemnasium 是一个付费工具，不过有免费方案。它支持各种技术，比如Ruby, PHP, Bower, Python和npm。Gemnasium提供很多非常有用的特性，比如自动更新，实时报警以及Slack集成等。 OSSIndex 支持多个生态系统(Java, JavaScript和.NET/C#)，以及多个平台，例如NuGet, npm, Bower, Chocolatey, Maven, Composer, Drupal和MSI。它从NVD以及其他来源收集漏洞数据。 代码优化 分析 JSLint 是一个Web服务，用于验证JavaScript的代码质量。当它诊断到一个问题时，它会返回问题的大致位置和出错信息。JSLint可以分析一些编码规范以及语法错误。 JSHint 可以发现JavaScript中的错误以及一些潜在的问题。JSHint是一个静态代码分析工具，旨在帮助开发者编写大型的程序。它可以诊断语法错误、隐形类型转换等问题，但是它并不能确定你的应用是否正确、性能是否足够好、以及是否会发生内存泄漏。 JSHint是JSLint的一个fork。 ESLint 是一个开源诊断工具，用于JSX和JavaScript应用。它可以帮助开发者发现可疑的或者不符合特定编程规范的代码。它帮助开发者在没有执行代码之前发现JS代码中问题，节省了不少时间。ESLint由Node.js编写，可以使用NPM安装。 Flow 是JavaScript代码静态类型检测器，由Facebook开发。Flow可以在编码时检查到类型错误并做出提示。 包管理 Bower 是一个用于管理前端依赖的包管理器，Twitter创建。它提供了大量可供使用的依赖包，帮助JavaScript开发者更方便地管理前端依赖的JS库。 NPM 是 node package manager 的缩写，事实上NPM包可以用于前后端。它是JavaScript包管理系统，也是世界上最大的依赖库，有超过475,000个模块。 Yarn 是Facebook, Google, Exponent 和 Tilde 开发的一款新的 JavaScript 包管理工具。与NPM相比，它解决了安全、性能以及一致性问题。 Duo 吸取了 Component , Browserify 和 Go 的经验，致力于简化大型Web应用的构建过程。 欢迎加入 我们Fundebug 的 全栈BUG监控交流群: 622902485 。 版权声明:转载时请注明作者 Fundebug 以及本文地址： https://blog.fundebug.com/2017/06/19/javascript-tool-list/ 您的用户遇到BUG了吗？ 体验Demo 免费使用

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[转载]人类简史（5）

罗非 2017-6-3 07:24

　　厨师的种族 　　在踏上食物链顶端的路上，使用火可说是迈出了一大步。早在大约 80 万年前，就已经有部分人种偶尔会使用火，而到了大约 30 万年前，对直立人、尼安德特人以及智人的祖先来说，用火已是家常便饭。到了这个时候，人类不仅用火当作可靠的光源和热源，还可以用这项致命的武器和不怀好意的狮子一较高低。不久之后，人类甚至还刻意引火焚烧周遭的环境。只要悉心控制火势，就能让原本难以通行、不具利益的丛林转变成大片美好的原野，而且满是猎物。此外，等到火势停歇，这些石器时代的创业者走到还在冒烟的余烬当中，就能得到烤得香酥美味的动物、坚果和块茎。 　　然而，火带来的最大好处在于开始能够烹饪。有些食物，处于自然形态的时候无法为人类所消化吸收，像小麦、水稻、马铃薯，但正因有了烹饪技术，就成为我们的主食。火不只会让食物起化学变化，还会起生物上的变化：经过烹调，食物中的病菌和寄生虫就会被杀死。此外，对人类来说，就算吃的还是以往的食物 ( 例如水果、坚果、昆虫和动物尸体 ) ，所需要的咀嚼和消化时间也能大幅缩减。例如，黑猩猩要咀嚼生肉，每天得花上五个小时，但人类吃的是熟食，每天花上一小时就够。 　　烹调让人类能吃的食物种类更多，减少所需的进食时间，还能缩小牙齿、减少肠的长度。有学者认为，烹调技术的发明，与人体肠道缩短、大脑开始发育有直接关系。不论是较长的肠道或是较大的大脑，都必须消耗大量的能量，因此很难兼而有之。而既然有了烹调，人就能缩短肠道、降低能量消耗，可以说是在不经意之间，烹调让尼安德特人与智人走上了让大脑更大的道路。 1 　　此外， “ 用火 ” 也让人与其他动物之间首次有了明显的不同。对几乎所有动物来说，它们的力量靠的都是自己的身体：像是肌肉的力量、牙齿的大小和翅膀的宽度。虽然动物能利用风和海流，却无法控制这些自然的力量，而且也无法突破先天的身体限制。举例来说，老鹰能够找出由地面上升的热气流，只要展开巨大的翅膀，热空气就会带着它们自然上升。然而，老鹰无法控制热气流的位置，而且荷重能力几乎完全得由翼宽来决定。 　　但人类用火的时候，可以说是控制了一项既听话而又有无穷力量的工具。不像老鹰只能被动使用气流，人类可以选择在什么地点、什么时间放出一把火来，而且火的用途各式各样、不一而足。最重要的是，火的能量并不会受人类身体的形式、结构或力量所限。就算是个柔弱的女子，只要有一块燧石能敲出火花，或是有根火棍能够摩擦起火，就能在几个小时内毁掉整片森林。能够用火之后，有许多发展即将水到渠成。

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[转载]人类简史（4）

罗非 2017-6-2 09:36

　　 “ 思考 ” 的代价 　　虽然人种之间有诸多不同，但还是有几项共同的人类特征。其中最重要的一点，就是人类的大脑明显大于其他动物。对于 60 公斤的哺乳类来说，平均脑容量是 200 立方厘米，但早在 250 万年前最早的男男女女，脑容量就已有 600 立方厘米，至于现代的智人，平均脑容量更高 1200~1400 立方厘米。至于尼安德特人，其实脑容量更大。 　　这样看来似乎再清楚不过，物竞天择就该让脑越来越大才是。人类深深迷恋着我们自己的高智能，于是一心认为智力当然是越高越好。但如果真是如此，猫科动物也经过演化，为什么没有会微积分的猫 ? 究竟为什么，在整个动物界，只有人属演化出了比例如此庞大的思考器官 ? 　　答案在于：庞大的大脑也是个庞大的负担。大脑结构脆弱，原本就不利于活动，更别说还得用个巨大的头骨把它装着。而且大脑消耗的能量惊人。对智人来说，大脑只占身体总重约 2%~3% ，但在身体休息而不活动时，大脑的能量消耗却占了 25% 。相比之下，其他猿类的大脑在休息时的能量消耗大约只占 8% 。因为大脑较大，远古人类付出的代价有两种：首先是得花更多时间寻找食物，其次是肌肉退化萎缩。这就像是政府把国防预算转拨给了教育，人类也把手臂二头肌所需的能量拨给了大脑里的神经元。对于在非洲草原上这究竟是不是个好策略，事先只能说无人能知。虽然黑猩猩要讲道理绝对讲不赢智人，但它却能直接把智人像个布娃娃一样扯个稀烂。 　　时到今日，人类大脑带来的好处显而易见，我们能制造出汽车和枪炮，让我们的移动速度远高于黑猩猩，而且从远方就能将黑猩猩一枪毙命，而无须和它摔跤硬拼。只不过，汽车和枪炮是最近才有的事。在超过 200 万年间，虽然人类的神经网络不断增长，但除了能用燧石做出一些刀具，能把树枝削尖变成武器，人类的大脑实在没什么特殊表现。那么，究竟是为什么，才驱使人类的大脑在这 200 万年间不断这样演化 ? 　　坦白说，我们也不知道。 　　人类另一项独有的特点，在于我们用两条腿直立行走。能够站起来，就更容易扫视整片草原，看看哪里有猎物或敌人，而且既然手不需负责移动身体，就能发挥其他用途，像是丢石块或是做信号。手能做的事情越多，可以说人就变得越厉害 ; 于是人的演化也就越来越着重神经发展，也不断地对手掌和手指的肌肉做修正。于是，人类的手开始能够处理非常精细的任务，特别是能够生产、使用复杂的工具。最早有证据证明人类开始制作工具，大约可追溯到 250 万年前，而且工具的制作和使用也正是考古学家对远古人类的一种判断标准。 　　然而，直立行走也有不利的一面。原本，人类的远古祖先历经数百万年，才发展出以四肢行走、头部相对较小的骨架，而要将这种骨架调整成直立，可说是一大挑战，而且还得撑住一个超大的头盖骨，更是难上加难。于是，为了能望远、能有灵活的双手，现在人类只得面对背痛、颈脖僵硬的苦恼代价。 　　这点对妇女来说造成的负担更大。直立的步行方式需要让臀部变窄，于是产道宽度受限，而且别忘了婴儿的头还越来越大。于是，分娩死亡成了女性的一大风险。而如果早点儿生产，婴儿的大脑和头部都还比较小，也比较柔软，这位母亲就更有机会渡过难关，未来也可能再生下更多孩子。于是，自然选择 (natural selection ，又译 “ 天择 ” 或 “ 自然淘汰 ”) 就让生产开始提前。与其他动物相较，人类可说都是早产儿，许多重要器官的发育都还不够完善。看看小马，出生没多久就能开始小跑步 ; 小猫出生不过几周，也能离开母亲自行觅食。相较之下，人类的婴儿只能说没用得很，许多年都得当个啃老族来被抚养、保护和教育。 　　人类之所以会有突出的社交技巧 ( 以及同样人类独有的社会问题 ) ，有一大原因也正出自于此。独自一人的母亲，如果还得拖着孩子，就很难为自己和小孩取得足够的食物。所以，想养孩子，就需要其他家族成员和邻居持续提供协助。要养活一个小孩，得靠全部落共同的努力。 　　于是，演化也就偏好能够形成强大社会关系的种族。此外，由于人类出生的时候尚未发育完全，比起其他动物，也就更能够用教育和社会化的方式加以改变。大多数哺乳动物脱离子宫的时候，就像是已经上釉的陶器出了窑，如果还想再做什么调整，不是刮伤，就是碎裂。然而，人类脱离子宫的时候，却像是从炉里拿出了一团刚熔化的玻璃，可以旋转、拉长，可塑性高到令人叹为观止。正因如此，才会有人是基督徒或佛教徒，有人是资本主义者或社会主义者，又或有人好战，有人爱好和平。 　　 * * * 　　我们以为，有比较大的大脑、会使用工具、有超凡的学习能力还有复杂的社会结构，都可说是人类巨大的优势。而且似乎不证自明，正是这些优势使人类成为地球上最强大的动物。然而，其实人类早就具有这些优势，但在整整 200 万年期间，人类一直就只是一种弱小、边缘的生物。大约在 100 万年前，虽然人类已经有了容量较大的大脑和锋利的石器，却还是得一直担心害怕食肉动物的威胁，他们很少猎杀大型猎物，维生主要靠的就是采集植物、挖找昆虫、追杀小动物，还有跟在更强大的食肉动物后面吃些剩下的腐肉。 　　早期石器最常见的一种用途，就是把骨头敲开，人类才能吃到里面的骨髓。有些研究人员认为，这正是人类最原始的专长。就像是啄木鸟的专长是从树干里啄出昆虫，最早的人类专长就是从骨头里取出骨髓。骨髓有什么特别的 ? 假设我们现在看着一群狮子大口吃着一只长颈鹿。我们只能耐心等着，等它们吃饱再说。但还别急，就算狮子吃完了，旁边还有鬣狗和豺在等着，而且它们也不是好惹的 ; 于是它们又把剩下的肉再吃干抹净。最后才轮到我们这群原始人，我们走近长颈鹿的尸体，左看看右瞧瞧，最后只能想办法去挖出唯一还能吃的组织。 　　这一点对于了解人类历史和心理学至关紧要。长久以来，智人一直只是稳定位于食物链的中间位置，直到最近才有改变。在先前长达数百万年的时间里，人类会猎杀小动物、采集种种能得到的食物，但同时也会遭到较大型食肉动物猎杀。一直要到 40 万年前，有几种人种才开始固定追捕大型猎物，而要到 10 万年前智人崛起，人类才一跃而居于食物链顶端。 　　这场从中段到顶端的大跳跃，造成的影响翻天覆地。其他在金字塔顶端的动物 ( 例如狮子、鲨鱼 ) 得要花上好几百万年的时间，才终于通过演化站上顶峰。因此生态系统有时间发展出种种制衡，避免狮子和鲨鱼造成太大的破坏。随着狮子越来越强壮，演化也让瞪羚越跑越快，鬣狗越来越懂合作，犀牛脾气越来越差。相较之下，人类转眼就登上顶端，不仅让生态系统猝不及防，就连人类自己也不知所措。在过去，居于食物链顶端的食肉动物总是威风凛凛、霸气十足，数百万年的统治，让它们充满自信。但相比之下，智人就像是个香蕉共和国的独裁者。我们在不久之前，还是大草原上的小可怜，整天充满恐惧和焦虑，但这也让人类更加残酷和危险。人类历史上众多的灾难，不论是生灵涂炭的战乱还是生态遭逢的浩劫，其实都是源自这场过于仓促的地位跳跃。

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微信——无“​微”不至 但“信”不信由你

热度 13 flysky97 2016-8-28 11:18

作者： 曾几何时，当网络大行其道的时候，很多人视网络为洪水猛兽，大呼“狼来了”……确实，如今，网络占据了我们生活中很大的一部分，而我们对网络的依赖也日渐加深。今天， 微信的过度使用，让人们开始反思，甚至反微信也成为一种潮流！尤其当诈骗等各类犯罪分子也对微信青睐有加的时候，微信作为双刃剑的另一面也展露锋芒、令人生畏！ 其实，可以看到，任何的潮流总有潮头，有潮尾，微信在大城市或许早已经司空见惯了，而在某些农村或者偏远地区或许才刚刚兴起…… 无论是网络还是微信，就像指环王中的魔戒，所谓的“危害”是与人的自制力成反比！ 有害？有益？如果只关注一方面，恐怕都会言过其实！所以—— 微信 ——终不过只是一种工具 微信——无“微”不至 但“信”不信由你 微信——无微不至 但信不信由你 文/齐云龙 摘要 ： 有人说，孤独是人类与生俱来的本质！ 微信中反映的人际关系，就是我们生活的现实 ！ 微信的好处显而易见——正是因为有微信，我们方便地找到了甚至是几十年未见的同学！甚至是国外的很多同学朋友也开始和我们使用了相同的沟通工具，大家汇聚到了相同的群里！微信里可以先于电话通信而实现了视频通话，微信里整合了滴滴打车…… 据统计， 截止2015年底，微信 已覆盖90%以上的智能手机， 活跃账户数已经达到6.97亿，换言之，我国将近一半的人口是其使用者。微信 已不单单只是一个充满创新功能的手机应用或者聊天工具，而是给我们的生活带来了巨大变化。 微信这位寄于移动终端上的客人开启了我们普通老百姓迈入“智慧型”生活方式的大门。首先，我们可以随时随地与好友通过文字、语音或视频交流，各种喜怒哀乐的表情符号把我们的心情表达的淋漓尽致且直接易懂。其次，朋友圈为我们肆意展示自我提供了广阔的舞台，晒美照、晒成绩、晒手艺、晒心情、晒骄傲、晒幸福 ...... 只有我们想不到，没有我们晒不了的。我们用心分享记录着生活的点滴，当明天回首过往的酸甜苦辣时，有图有声有真相的场景拉近了我们与曾经的距离。再次，我们 60 、 70 、 80 后受众经历了获取新闻的方式由依赖报纸到电视再到网络媒介再到现在盛行的微信朋友圈整个过程，如果把过去的信息传播比喻为乘坐马车，则现在则升级到了堪称为“秒杀”的火箭。前一秒中南沙群岛刚刚发生的骇人听闻的事件后一秒钟就会图文声并茂的通过朋友圈传达至黑龙江的漠河，进而以几何级数传遍全国各个角落。 微信的过度使用，让人们开始反思，甚至反微信也成为一种潮流！其实，可以看到，任何的潮流总有潮头，有潮尾，微信在大城市或许早已经司空见惯了，而在某些农村或者偏远地区或许才刚刚兴起…… 有害？有益？如果只关注一方面，恐怕都会言过其实！所以——微信终不过只是一种工具。 工具的存在的价值就是满足人的需要，而不是让人成为工具的附庸。工具也有其使用范围，超出了其范围的使用必定会产生危害。 从来都是“过犹不及”。微信，像一把利剑，只不过，它是双刃剑，它可以轻易地砍断某些沟通的阻碍，却也容易造成伤害！ 每天朋友圈发来和转发的微信，忽悠调侃者有之，胡编乱造者有之，道听途说者有之，以讹传讹者有之，广告发布者有之，心灵鸡汤式的警句箴言、人生感悟更是数不胜数，更有甚者造谣惑众、指鹿为马、颠倒黑白、别有用心！ 　 不是相同的圈子，就不必强融；不是平等一类人，很多都难以成为平等的朋友。 无论我们如何努力，终究无法取悦所有人！ 博客，属于精英人群，微博属于大众； QQ 群，像广场舞，人多，热闹，但是没有主角， 微信里，每个人都是自己圈子中的主角。 与“微信”一起出道的还有 “易信”、“有信 ”（其实，取“言而有信”之意，这个名字我觉得比微信可好上不知多少倍，只可惜，它也被竞争下去了）…… 而“微”字辈的各种在线聊天工具有：“ 微会”、“微密”、“微视”、“微聊”“微聚 ”……一番江湖纷争之后，其他最终不是“微不足道”、就是“ 陌陌 ”无闻，都难觅芳踪，只留下“ 微信 ”一家独大，真正“ 无微不至 ”…… 无论QQ，还是微信，亦或其他类似的软件，不过都只是一种工具……最终的结果，无非还是取决于使用它的人！ 有人说，孤独是人类与生俱来的本质！人类从一出生就开始寻找与自己灵魂契合的一类人！ “一个孤独的小人，面对地球站在那里，这就是微信的启动画面，几亿人对此都熟悉得不能再熟悉。作为一种人际沟通工具，没有第二张图能更好地表达出人类内心的孤独，以及地球家园的美好。所以，整个画面有一种孤清中的淡淡暖意，给人的感觉是文艺到死。等你知道了背后的故事，又会觉得闷骚到死。” 这张图也或许就是象征“一个人孤单地就像一颗星球”，TA所站立的地方也便是自身。怎么看直观上都有一种忧伤的氛围。一个火花闪过，一个答案、一种理解自然而然浮现脑中。这个画面在表达一种渴望：被邀请、召唤，进而去融入和交往的渴望；从一人面对世界的隔阂到进入世界，置身关系、分享和联络之中的渴望。 想当年聊QQ成为某些少数人的特权时，大家聊得一片火热；当年微信成为少数先行者的玩具时，他们摇得火热，乐此不疲……摇一摇，为了遇到某个同时也很无聊的人…… 也有调查得出结论：95后基本不用微信多使用QQ！——每一类人都在寻找着自己世界的沟通工具和语言！ 其实，如果没有微信 的流行 ，那肯定还有其他的微聚、微密、微聊、陌陌、易信、有信、来往、MSN、Skype…… 面对微信的凶猛来势，有很多人试着放弃微信，但还是有更多后来人继续为此而狂欢——除非有更好的、更流行的工具出现，否则，这个圈子里注定还会有很多人，就如同微信出现了，QQ的使用者在减少…… 时代终是要前进的，也许将来，我们身体里只需要植入一块芯片，就可以随心所欲地与想要沟通的人无障碍交流……可是现在，我们暂时还只能依赖手机或者电脑！ 微信，和QQ或者其他即时沟通工具一样，可能饱受诟病，比如：让人分心，不能专注于工作；长时间刷微信危害身体健康；容易传播谣言和大量垃圾信息；减少了个人的隐私、恶化了某些人际关系甚至于对目前中国式婚姻造成重大的冲击，因为中国式婚姻大多不是以爱情为基础，而是以关系为纽带。 无论QQ，还是微信，都只是一种工具……最终的结果，无非还是取决于使用它的人！ 工具的存在的价值就是满足人的需要，而不是让人成为工具的附庸。工具也有其使用范围，超出了其范围的使用必定会产生危害。 微信，像一把利剑，只不过，它是双刃剑，它可以轻易地砍断某些沟通的阻碍，却也容易造成伤害！从来都是“过犹不及”。 微信对 我们造成的各种危害，主要原因是我们没能正确用好微信，微信作为一个社交网络工具，本该在我们的工作、学习之余发挥补充身边社交不足的功能。而现在却被过度使用，或并被各种利益谋求者滥用。微信，很容易成为某些别有用心或者图谋不轨的人的作案工具！ 微信中反映的人际关系，就是我们生活中社交网络的现实！如果说微信破坏了我们的人际关系，应该说微信破坏的是，就是原本不充分的沟通、原本脆弱的关系！ 微信像 一把放大镜，能照出你和“朋友”间的千丝万缕，真真假假，若即若离…… 微信像 一块试金石，试出了不同人的思维模式和沟通方式的差异，试出了你与别人关系的深与浅…… 当然，如果你想真得试一试——先不要把我的结论告诉 TA ！ 微信，是这样伤害着我们的： 当你想要加一个人的时候，却始终得不到TA的认证！ 当你想发一条消息给对方的时候，却发现：TA已经不再是你的好友！ 当你们互加了好友，过了一段时间，你想看看TA的个人相册，却发现，TA屏蔽了你的权限！ 你能看到的只是一片灰白的底色！ 当你兴致勃勃，想要和某个人聊一会儿的时候，TA却只是简短地回复你：呵呵、哦、恩……你顿时意兴阑珊……你感觉到的冷淡其实未必是真的，也许对方是真得在忙！ 当别人对你发到朋友圈的图文一片叫好的时候，你关心的某个人却无动于衷，没有反应…… 你发现，某个人很频繁地在为别人点赞，但是却从来没有光顾过你的朋友圈…… “世界上最远的距离，不是生与死。而是我找你，却找不到，找到了却不回应。” 沟通是人与人之间的桥梁，是连接人人与人关系的纽带。合理的沟通能促进关系的和谐，同时也是矛盾的润滑剂。而不顺畅的沟通或者沟通模式不同则沟通反而能成为矛盾的制造者。——但沟通工具不应该成为罪魁祸首！ 不必说，“道不同不相为谋”，更多的时候，只不过是因为世界万象，五彩缤纷，我们每个人看到的不同而已！有时候，只不过是因为TA曾经受过的伤害，只不过是因为某颗柔弱的心在努力保护自己；有时候，我没有将全部消息发送给你，只是不愿意打扰到你！ 不是相同的圈子，就不必强融；不是平等一类人，很多都难以成为平等的朋友。 无论我们如何努力，终究无法取悦所有人！ 微信，无论多少人说好或者不好，终究不过是一种工具！ 关于那个庞大蓝色星球和渺小身影的画面，通常的答案是“表达了人类孤独的内心”，而微信走红的原因，也被解读为满足了人们交流与沟通的心灵渴求。但“ 腾讯高级副总裁”的张小龙 喜欢的却是一条用户提供的答案——“为什么这个人会站在地球之外？”或许，这在某种意义上暗合了他的形象：总是默默站在热闹喧杂的人群之外，静静观察大千世界的纷繁复杂，用近乎偏执的专注抽丝剥茧，找出事物的本质，再用看似最简单的方法解决问题。 无论QQ，还是微信，都只是一种工具……最终的结果，无非还是取决于使用它的人！ 工具的存在的价值就是满足人的需要，而不是让人成为工具的附庸。工具也有其使用范围，超出了其范围的使用必定会产生危害。 微信，像一把利剑，只不过，它是双刃剑，它可以轻易地砍断某些沟通的阻碍，却也容易造成伤害！从来都是“过犹不及”。 微信对 我们造成的各种危害，主要原因是我们没能正确用好微信，微信作为一个社交网络工具，本该在我们的工作、学习之余发挥补充身边社交不足的功能。而现在却被过度使用，或并被各种利益谋求者滥用。微信，很容易成为某些别有用心或者图谋不轨的人的作案工具！ 你可曾意识到，我们花在陌生人身上的时间，远远多于我们和父母、朋友、家人沟通的时间？ 其实，大多数使用微信的人是想通过微信增进朋友的了解和情谊，开拓新的朋友圈，而实际上这真的早已超出微信本身的能力。要实现这个目的更有效的方法是将自己的生活圈划分区域，核心区是自己和亲人，其次是最好的朋友、朋友、认识的人……对于核心区的亲人和最好朋友，要增加关心和面对面的交流或电话联系，然后积极参加身边的各种社交活动，最后才是用微信拓宽社交网络和补充这些活动的不足。千万不可本末倒置，不然容易产生极其严重的后果。 是的，如果沉迷，微信会夺走你的健康，甚至是你的家庭，你的事业！ 某些人慢慢地开始选择淡出……他们宁愿意多陪陪家人，朋友，而不只是与与你根本无关的人无聊之聊；他们宁愿多体验一下亲自下厨获得的美味而不仅对着朋友圈的美图垂涎三尺；他们宁愿挤出一点时间出去散散步，以能更长久地看着这世界的美好未来…… 微信现在是第一大平台但是当大家狂热过后有些东西会自然而然的回归本质，其实平平淡淡才是真，生活还是生活； 慢慢的你会发现微信其实没有你想的那么强大； 实体的崛起传统的崛起，是由互联网所不能代替的一些东西，如果你不去了解这些你会发现很多东西就没法去理解。 微信慢慢的就会成为一个工具，就和当年电话一样，我们会只有用的时候才会想起来，他不会和以前一样疯狂，这个时候 面对面的交流就变得尤为重要！ 如果现在，是在微信里读到我的文章，你又会作何感想呢？ 当然，微信作为人与人交流的工具，新媒体传播的手段和渠道，其方便、快捷的优势的却是目前流行一时的新宠，它不仅仅能随时随地让朋友之间交流感情，而且还可以比任何传媒速度还要快的时效，让大家在第一时间了解天下大事，游览最新新闻，有图有真相！ 　　微信，微信，不可全看不能不看。全看浪费时间和眼睛，浪费手机锂电和流量，浪费精力和感情；不看生怕误了朋友的事情，漏掉了世界上最新发生的奇闻异事，错过了值得一读和感悟的好文章！ 最后，不妨再拓展一下： 手机的应用软件APP，好多都想要，尤其是微信占用空间非常大，结果手机变得卡顿慢，内存不够，最后不够用了，就只能让手机升级换代…… 应该说，这也间接促进了消费，促进了产业升级，促进了科技创新…… 看来，微信的隐性作用还不止于沟通呢。想当年，人们对视网络的到来为洪水猛兽，而如今，已经有太多人离不开网络。网络已经成为了我们不可或缺的工具之一。全国上下皆网民。现如今，我们又何必对微信太过苛评呢…… 时代在进步，旧事物总是被新事物所取代，也许，用不了多久，比如像可穿戴设备等新的工具还会出现，微信也会慢慢淡出历史的舞台！ PS： 9月1日起，互联网广告要被规范了 ， 微博、微信等平台也有制止发布违法广告的义务 ， 付费搜索广告等五类必须标明“广告” 参见我下篇博文 《 9月1日起，互联网广告要被规范了 ，注意别违法》

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【工具】R包--e1071

Dutch 2016-8-10 20:26

e1071是做SVM以及二叉树分类的包；

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一个英文词频统计工具

热度 1 rbwxy197301 2016-4-14 23:42

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水文化概论札记——水的存在形态、水与环境、水工程、水工具

热度 2 jiangming800403 2016-4-5 19:24

第 2 章 \ 第 5 课次 水的存在形态与时空分布及转化过程 本节主要内容是水的存在形态与时空分布及转化过程（水循环）。水的存在形态包括气态水（水汽）、液态水、固态水（冰雪），重点是液态水。液态水是能为动植物生存和工农业生产直接利用的水。水的存在形态的时空差异对人类文明的发展与文化差异具有重要的影响。 1. 水的存在形态与时空分布 1.1 地球上水的数量 1.2 地球上水的存在形态与分布 重点强调人类能直接利用的淡水只是地球总水量中的很少一部分，是一种宝贵的自然资源。 2. 水的循环过程 2.1 从海洋到陆地：水汽输送 2.2 从陆地到海洋：径流的形成 水循环是陆地淡水资源可以不断得到循环和再生的根本原因，淡水资源是一种数量有限的可再生的资源。 3. 大气水 3.1 水在大气圈中的存在形式 云、雾、雨、露， ................ 3.2 大气 降水的形成 过程 （1） 水汽来源 （2） 凝结过程 3.3 大气降水的时间、空间分布 （1） 全年多雨地区 （2） 夏季多雨地区 （3） 冬季多雨地区 （4） 全年少雨地区 3.4 大气降水与人类文化 （1） 对农业生产和饮食文化的影响 （2） 对服饰文化的影响 （3） 对建筑文化的影响 （4） 对交通文化的影响 （5） 对雨神的崇拜 3.5 大气水的文化寓意 （ 1 ）飘渺虚空的道家意境：云雾缥缈，云遮雾绕，云深不知处，行云流水 （ 2 ）风起云涌的儒家理想：风起云合、风云际会 （ 3 ）“巫山云雨”的家国大事 4. 陆地水 4.1 江河水 4.1.1 河流 的类型与 形态 （1） 河流的类型 内流 / 外流，全年 / 季节 （2） 河流形态的多样性 （3） 河流的连续性与非连续性 4.1.2 河水的特点与主要来源 （1） 河水的特点 周转迅速，在陆地水量在分布的过程中起到了重要作用 （2） 河水的主要来源 降水，融水（冰川、积雪），地下水（泉水） （3） 径流量的时空分布 湿润带、半湿润带、过渡带、干旱带、干涸带、无流区 4.2.3 河 水的 功能 （1） 水源功能 人类容易获得的地表水源 （ 2 ）通道功能 不仅是水流的通道，也是水中携带的颗粒物和可溶性物质的通道；水生生物洄游的通道和栖息地；航运的通道 （ 3 ） 塑造地表形态的工程师 不仅造就了壮丽的风光，对土壤、植被的垂直地带性和非地带性分布具有重要影响，增加了生态系统与人类社会的多样性 （4） 矿产资源 、 水能形成和利用方面 的 重要作用 流水对表物质的分选是矿产资源形成的重要原因；流水剥蚀地表物质使地层深处的矿产资源逐渐接近地表，甚至形成露天矿床；集中河流落差发电 4.2.4 中国和世界的主要河流 （1） 中国的主要河流 四大江河（从江、河、淮、济到长、珠、黄、淮） / 七大江河 太平洋水系——江、淮、河、海、辽、黑、珠、东南（闽浙）诸河、 印度洋水系：主要是西南诸河、 内流水系：蒙甘、新疆、青海、西藏内流区 唯一一条流水北冰洋的河流 （2） 世界的主要江河： 亚洲：东南亚、南亚、西亚、中亚、北亚 欧洲：河流与欧洲文明 非洲：尼罗河、尼日尔河、刚果河、赞比西河 北美洲：大西洋流域、北冰洋流域、墨西哥湾流域、太平洋流域 南美洲：亚马逊河、奥里诺科河、拉普拉塔河 大洋洲 4.2.5 河流与人类社会 与人类关系密切，是重要的水源，影响着人口、农业与城市的布局 人类活动会对河流水质、水量产生巨大影响，形成取水 - 用水 - 排水人工侧枝和循环，自然 / 社会、实体水 / 虚拟水二元水文系统 降水与河流径流的周期性变化是人类对年周期的认识和最高立法（古埃及）产生的重要原因 文学作品和艺术创作中的主要对象 4.2.6 江河水的文化 寓意 （ 1 ）“水滴石穿”的锲而不舍、以弱胜强精神 （ 2 ）“奔流到海不复返”的拼搏精神和时间意识 （ 3 ）“流水不腐”、“问渠那得清如许”的廉正文化 （ 4 ）“共饮一江水”的流域合作共赢思想 4. 2 湖泊水 4.2.1 湖泊的类型和 成因 内流湖 / 外流湖，淡水湖 / 咸水湖，凹陷湖 / 堰塞湖，构造湖 / 火山湖 / 冰蚀湖 / 河成湖（牛轭湖） / 海成湖（潟湖） / 堆积物堰塞湖 / 风蚀湖 / 岩溶湖 / 陨坑湖 / 人工湖（水库） 4.2.2 湖泊的分布 （1） 我国的主要湖泊： 六大湖区——东部平原、东北、华南、西南、蒙新、青藏高原 （2） 世界的主要湖泊： 亚洲、欧洲、非洲 北美洲、南美洲、大洋洲 （3） 城市湖泊： 北京、南京、杭州、武汉、南昌，“东坡到处皆有西湖” 4.2.3 湖泊水的特点 和功能 湖泊一般有较大的容积，有吐纳洪水、稳定水源的作用，是流域水资源利用中重要的稳定器和调节器，湖泊是水生生物主要的栖息地。 4 . 2 .4 湖泊水的文化寓意 弱水三千，只取一瓢 4.3 池塘和沼泽水 4.3.1 池塘和水景园林 池塘是地球表面小面积的水体在农业灌溉、水产养殖和园林设计当中都具有重要的作用。 4.3.2 沼泽的成因和分布 （1） 沼泽的成因 沼泽是地球表面季节性积水的湿地，主要成因有湖泊淤积老化、地下存在不透水层（如永冻层）和地下水位上升。 （2） 沼泽的分布 4.3.3 沼泽的功能 （1） 滞纳洪水 （2） 净化水质 （3） 栖息地 （4） 固定碳，减轻温室效应 4.3.4 沼泽水的文化寓意 厚德载物，上善若水 4.4 地下水 4.4.1 地下水的类型与分布 （1） 潜水 第一个不透水层以上的水 （2） 承压水 两个不透水层之间，水头压力大于一个大气压 4.4.2 地下水的特点 （1） 储量较大，循环速度慢 （2） 水量、水质较为稳定 （3） 水温较稳定、相对较高 （4） 工农业生产和居民生活中良好的水源 4.4.3 地下水平衡 （1） 地下水的补给来源 降水和地表水入渗，侧向地下径流，承压水对潜水的越流补给 （2） 地下水的排泄方式 潜水蒸发，地下渗流，泉水，人工开采地下水 4.4.4 泉水和人工开采对地下水 （1） 泉水的 主要 类型 上升泉（承压水），下降泉（潜水） （2） 特殊类型的泉水 喷泉（间歇式喷泉），温泉（沸泉），冷泉，矿泉（药泉），鱼泉 （3） 地下水开采 竖直取水（井）、水平取水（坎儿井） 4.4.5 地下水的 文化 寓意 “上善若水，厚德载物”奉献精神 “ 为有源头活水来 ”廉政文化 泉水在中国茶文化中的重要意义 4.5 土壤水 土壤水处于潜水面以上的包气带中，是大气水、地表水、地下水、生物水联系的纽带；土壤水可以自由流动难以压缩，具有液态水的一般特征，但不同于一般的液态水。 4.5.1 土壤水的类型与分布 （1） 吸着水：受到分子、（水合）离子间作用，而吸附在土粒表面 （2） 毛管水：土壤毛细孔隙中，重力和表面张力相平衡的水分，是植物可以利用的水分的主体 （3） 重力水：土壤通气孔隙中，在重力作用下自由流动的液态水 （4） 土壤通气孔隙中土壤气体里存在的水分 两个不透水层之间，水头压力大于一个大气压 4.4.2 土壤水平衡 （ 1 ）土壤水的补给来源 降水和地表水入渗，农业灌溉，壤中流，地下水补给 （ 2 ）土壤水的排泄方式 地表蒸发，植物蒸腾、深层渗流，壤中流 4.4.3 土壤水的功能 （1） 大多数植物可以直接利用的唯一水源 （2） 养分只有进入土壤溶液中才可以被植物利用 （3） 土壤具有滞纳洪水、涵养水源、净化水质的作用 （4） 土壤水可以有效缓冲环境温度、湿度变化，减轻寒潮、霜冻、干热风等农业气象灾害的危害 4.4.5 土壤水的 文化 寓意 大象无形，上善若水 地势坤，厚德载物 5. 海洋水 5.1 大洋 大洋是大陆之间连续辽阔的部分，是海洋的主体，占地球总面积的 2/3 ；大洋水占了地球水的绝大部分；四大洋及其分界线 5.2 海的分类 5.2.1 陆间海（地中海） ：两块大陆之间的海 如地中海，加勒比海 5.2.2 边缘海 （争夺制海权的主战场）：大陆与外海岛链之间的海域 如珊瑚海、南海、东海、黄海、日本海 5.2.3 内海、海湾 （拥有最富饶的大陆架） ：深入内陆的海域 如渤海、黑海、爱琴海、孟加拉湾 5.2.4 海峡 与海岛 （现代战争的兵家必争之地） 如台湾海峡、马六甲海峡、朝鲜海峡、白令海峡 5.3 洋流 与气候 5.3.1 洋流的成因 风海流、密度流、补偿流 5.3.2 中低纬度洋流圈 顺时针转动，海洋的西侧（大陆东岸）暖流，海洋的东侧（大陆西岸）寒流 5.3.3 中高纬度洋流圈 逆时针转动，海洋的西侧（大陆东岸）寒流，海洋的东侧（大陆西岸）暖流 5.4 海洋 水 的 功能 5.4.1 对水循环和气候循环的影响 5.4.2 地质和成矿作用 5.4.3 生命的摇篮和海洋生物的栖息地 5.4.4 航运、海洋能 和旅游等方面的作用 5.5 海洋水的文化寓意 海纳百川，有容乃大 惊涛骇浪，波澜不惊 5.6 海洋民族 5.6.1 腓尼基 - 希腊人 5.6.3 诺曼 - 维京人 5.6.4 马来 - 波利尼西亚人 6. 冰川水和永冻层冰 冰川水和永冻层冰属于含量地区的固态水，也是地球上储量最大的淡水水体 6.1 冰川水 6.1.1 冰川的类型与分布 （1） 大陆冰川 （2） 山岳冰川 （3） 大洋浮冰 6.1.2 冰川的功能 （1） 稳定的水源 （2） 强大的侵蚀和搬运作用 （3） 冰川大量反射太阳辐射可以起到促进全球变冷的作用 （4） 冰河期大量水被冻结到陆地上而不能流入海洋，使全球水循环通量发生变化 6.1.3 第四纪冰川与人类文明起源和演化 （？）第四次冰川期，全球海平面下降，通过大陆之间的路桥和岛链，人类遍布除了南极以外的各个大陆，以及大陆周边的岛屿，成为了一个全球性的物种；路桥消失以后，各大陆的人类开始了独立的文明演化。 6.2 永冻土层 永冻土层冰灾地下形成了不透水层，是寒冷地区大面积沼泽形成的根本原因，冻土层每年交替发生的冻胀破坏和热融塌陷，直接影响着冻土区的工程建设，从而形成了独特的文化现象。 6.3 固态水的文化寓意 纯洁、纯净：冰清玉洁、冰雪聪明、冰寒于水 第 2 章 / 第 6 课水对环境要素的影响、中国的水环境问题及其对策 1 、水对环境要素的影响 1.1 对 气候 的影响 （1） 水陆热力性差异形成了 海洋 性 / 大陆性 气候、 季风环流和海（湖）陆风等局地气候现 （2） 热带海洋对高纬度地区的水汽输送对全球水热平衡的作用 （3） 洋流对气候的影响：暖流沿岸相对温暖湿润，寒流沿岸相对寒冷干燥 1.2 对土壤的影响 （1） 降雨及其淋溶作用的强弱决定了 酸性土 / 碱性土的 地带性规律 （2） 土壤水分情况对土壤氧化 - 还原状况的影响：直接决定了有机质含量、铁离子价态等重要的土壤理化性质，并进一步影响土壤肥力 中华民族在很早的历史时期就认识到不同地方土壤理化性质不一——东方青土、南方红土、西方白土、北方黑土、中央黄土，形成了“五色土”的朴素认识，并指代天下和社稷，五色土上应天象和四方部落图腾，从而形成“左青龙、右白虎、南朱雀、北玄武”这种中华民族特有的文化现象。 1.3 对生物 和生态系统 的影响 （1） 对植物和植被类型的影响 水分条件是影响植物光合作用强度和效率的关键因素 水分条件不同，植被类型不同：常年多雨的地区多常绿森林，季节性多雨的地区多落叶林和稀树草原，干旱地区以草原和荒漠为主，甚至寸草不生；干旱地区森林主要集中在河流沿岸等地下水位浅的地方。 植物种群分布微地貌特征的主要原因：不同水分条件的地方表现为不同的水生群落、湿生群落、旱生群落种群 不同植物对湿生和旱生生境的适应性：湿润条件下，植物一般植株高大、枝叶繁茂、叶片宽薄，根系浅、有气根和板状支撑根；荒漠植物 枝叶具有显著的旱生型形态表现，如叶退化、小枝绿化兼营光合作用、气孔下陷、枝叶批覆针毛、叶即嫩枝角质层增厚等，同时根系发达，有明显的深根性或强大的水平根系等，可以从土壤深处吸收 水分、 养分满足植物的需要， 多 具根瘤，有固氮能力，可以利用空气中的氮素，以弥补土壤肥力的不足 ； 抗风蚀沙埋 能力强， 根孽能力强或茎干被沙埋后能形成不定根，能串茎繁殖，在一定的沙埋情况下生长更旺，萌发出很多新的植株形成灌丛或繁衍成片，形成了群体的防风能力从而也抑制了风蚀 。 总体上 旱生 植物通过三种生态适应性来对抗干旱缺水 ：一抗旱性，具有强大的根系，能吸取深层土壤水，但耗水量一般不低，二耐旱型，蒸腾量低，但牺牲了光合效率；三速生型（避旱型），利用短暂雨季，迅速发芽、开花、结实，完成生命周期，以种子的形式度过漫长的旱季。 （2） 对动物的影响 水生和湿地动物表皮光滑，肾小管短 动物对干旱的生理适应性：肾小管长，能回收尿液中的水分，体液渗透压高；表皮厚或体表有鳞片，以减少水分蒸发 旱生动物适应干旱的特殊行为：如大型有蹄类“逐水草而居”的迁移，小型动物穴居、夏眠和储食等行为 （3） 对微生物的影响 湿润的地方，微生物种群繁茂，有机物易分解；干燥的地方，微生物少，有机物不易分解。 2、 水在生产生活中的应用 2.1 农业用水 （1） 作物生产用水 （2） 农田环境用水 防护林带用水 排盐用水 农田小气候用水（减轻寒潮、霜冻、干热风等气象灾害） 2.2 工业用水 工业用水包括消耗用水与非消耗用水，工业是一种低耗用水部门，耗水量占总取水量的不足 1/3 ，但是生产过程中一些污染物质（以及热）进入循环水体，并随着工业废水排放进入环境水体，造成水污染。 （1） 直接作为工业原料添加到产品中（食品、饮料、硝铵氯碱化工） （2） 在生产过程中作为溶液或分散剂（化工、印染、造纸等） （3） 作为导热剂或冷却剂（火电、冶金、炼化） （4） 利用水的力学性能输送固体物质（火电、冶金） （5） 除尘、降温等环境用水 （6） 水力发电用水 2.3 生活用水 生活用水也是一种低耗用水，居民日常生活是最大的水污染单一来源。 （1） 饮食用水 （2） 清洁卫生用水：占生活用水及水污染的主要组成部分 3 中国的水环境问题 3 .1 非污染 水环境问题 （1） 洪涝灾害 洪涝渍害的区别与联系 类 型：降雨型洪水，融水型洪水，溃决型洪水 成因：降 水 时 间 分布不均 ，短时期内大量降水 危害：以 98 年特大洪水为例 （ 2 ） 干旱缺水 类型：资源型缺 水， 工程型缺 水， 水质型缺 水， 浪费型缺 水 成因：降 水 时 空 分布不均 ，水土资源、水资源与人口分布不协调 危害：河流断流 ， 湖泊萎缩 ， 农田 受旱，工业、 生活用水缺乏 ， 生态环境恶化 ， 地沉、地裂 ， 海水入侵 （ 3 ）水土流失 类型：水力侵蚀（面蚀、沟蚀）、重力侵蚀、复合侵蚀（水力 + 重力 ） 成因： 降水及其引起的径流冲刷土壤及其母质 危害：土壤贫瘠，肥力下降 ，蚕食土地资源，威胁 粮食安全 ， 泥沙淤积 ， 抬高河床， 加剧 洪涝灾害 ，占压、沙埋土地， 造成荒漠化， 威胁城镇矿山，破坏基础设施、 易引发 尘 城暴等自然灾害。 3.2 水 环境 污染 问题 （ 1 ）水污染的类型 按污染 物的性质 ：物理 （热污染、固体颗粒） 、化学、生物污染 （病原微生物等） 按污染物 的 来源：点源污染、面源污染 其中化学污染物占主体部分，化学污染物有可以分为有机污染和无机污染，有毒污染物和无毒污染物，无毒污染物虽然不具有直接的生物毒性，但会破坏水生态系统平衡，威胁生物生存。 （ 2 ）水污染的主要形式 降低水体能见度：主要是固体颗粒、油污等化学物理污染 造成水体缺氧、窒息水生物：水中的有机污染物（无毒）在分解过程中会消耗大量的溶解氧，富养化造成水体中藻类爆发，藻类死亡后大量腐烂也会消耗溶解氧，固体颗粒、油污会堵塞水生动物鳃孔，直接造成窒息 种群结构失衡：酸碱盐等污染物、热污染等都会改变水质，影响水生生物种群结构；富营养化造成藻类爆发，藻类死亡腐烂后，大量产生消耗溶解氧甚至产生毒素，造成其他水生生物难以生存 生物毒性：直接造成生物中毒乃至死亡，并且通过食物链可以危害整个生态系统，主要有有机毒物、重金属离子、放射线污染物等 水传播传染病：各种生物污染，如霍乱 ........ （3） 水污染的主要危害 造成水资源短缺，影响工农业生产 恶化居住环境，危害人的生活和健康，乃至生存 破坏水生态多样性，影响渔业生产 3 、水环境问题的治理措施 3.1 防洪抗旱 （ 1 ）蓄水工程 （如水 坝 ） 解决 降 水时间分配不均 （ 2 ） 跨流域调水 工程（ 如 南水北调）解决 将 水空间分布不均 （ 3 ） 恢复植被，增强植被涵养水源能力， 建立海绵城市 ，加强地表水 - 地下水 - 土壤水联合调度，提高区域蓄水能力 （ 4 ）修筑堤防， 疏通河湖 ，加强排水体系建设 （ 5 ）开源 与节流并重，加强循环用水， 开发非传统水资源（海水淡化、雨洪利用、微咸水灌溉、再生水利用等） （ 6 ） 建设节水型社会，提高水资源利用率和利用效率 （ 7 ）引导产业布局与水资源分布相适应 （ 8 ）加强水文预测预报和避灾、减灾能力建设，优化水利工程调度 3. 2 水污染 防治 （ 1 ）促进科技进步，开发对环境污染少的产品和生产工艺 （ 2 ）贯彻“ 3R ”原则，通过 Reduce （减量化）、 Recycling （循环用水）和 Reuse （污水回用）减少污染物排放 （ 3 ）积极治理点源污染和非点源污染 （ 4 ）引导产业布局与水环境容量相适应，发展排污权交易 3. 3 水土 保持 （1） 恢复植被，充分发挥植被涵养水源、保持水土的能力 （2） 进行流域综合治理，充分发挥工程措施控制土壤侵蚀、拦蓄洪水泥沙、改善农业生产条件的作用 （3） 发展水土保持生态农业，保水保土保肥，提高农业生产力和水土资源利用效率，变广种薄收为精耕细作，提高农作物单产，为退耕还林、恢复植被创造条件，并减少农业面源污染 （4） 合理调度水利工程、调水调沙，减少泥沙在河渠湖库中的淤积 （5） 积极治理生产建设项目中的人为水土流失，减少大挖大填，保护天然植被，加强边坡治理和绿化，充分利用固体废弃物，重视临时防护，避免地表裸露 第 2 章 \ 第 7 课次 水工程的类型、功能与意义， 包括农田水利与 取水工程 、 运河工程 、水电站、堤防工程等工程文化。 1 水利工程的主要作用 1.1 兴利工程 灌溉供水工程，水能利用（水电）工程，港口航道工程 1.2 除害工程 防洪除涝工程，水土保持工程，水污染防控工程 2 水工建筑物 2.1 挡水建筑（堤坝） （1） 土石坝（堤） 主要特点，工程材料，断面结构，适用性 （2） 重力式堤坝 主要特点，工程材料，断面结构，适用性 （3） 拱坝 主要特点，工程材料，断面结构，适用性 2.2 输水（排、泄水）建筑 （1） 输水明渠 主要特点，工程材料，断面结构，适用性 （2） 无压管道（隧道） 主要特点，工程材料，断面结构，适用性 （3） 有压管道（隧道） 主要特点，工程材料，断面结构，适用性 2.3 控制建筑（闸门等） 3 水利工程的主要类型 3.1 农田水利与城镇供排水工程 （1） 水源工程：无坝取水，有坝取水，水库取水，提水（地表，地下） （2） 农田灌溉工程 （3） 城镇供水工程 （4） 排水工程 3.2 防洪工程 （1） 防洪水库 （2） 堤防 （ 3 ）排涝泵站 3.3 水电站工程 （1） 坝后式水电站 （2） 引水式水电站 3.4 运河和船闸工程 （1） 运河工程 （2） 船闸工程 4 水利工程发展简史与典型水利工程 4.1 水利工程简史 （1） 夏商周时期 （2） 秦朝至清朝 （3） 现代水利 4.2 典型水利工程案例 （1） 中国古代水利工程：都江堰、郑国渠、芍陂、灵渠、大运河、白瓮山引水工程、坎儿井、黄河（荆江）大堤、浙江海塘 （2） 中国现代水利工程：河套灌区工程、淠史杭灌区工程、红旗渠、三峡工程、南水北调工程 5 水利工程与社会 5.1 水利工程与农业文明 （1） 在与周期性洪水与干旱做斗争的过程中出现了原始的农业和水利 （2） 人类由游荡走向定居，由蒙昧走向文明的重要标志 （3） 原始农业和水利的发展，出现了国家的雏形，由“支流文化”走向“大河文化” 5.2 水利工程与工业和城镇文明 （1） 河流水利是工业文明早期最主要的动力来源和运输途径 （2） 城市发展离不开水利工程（供水、防洪、污废水排放） （3） 山前河流冲积扇和河口三角洲是最重要的城市化地带 6 水利工程的哲学与文化思考：人水和谐相处 6.1 水利工程建设要解决人类与河流生态之间的矛盾 人与水、人与河流之间（如洪涝、旱魃）的矛盾也不是以我们的主观好恶为转移的。河流具有多种功能，不同功能之间如灌溉与发电、航运，蓄洪与排沙之间也可能存在矛盾。水利工程建设主要是为了缓解水资源时空分布不均，过度用水带来的河道流量下降甚至断流、汛期径流集中造成的洪涝灾害等问题，充分发挥河道航运、发电等方面的功能与作用在河流形成、演变的地质过程中，堰塞湖、牛轭湖、潟湖也像人工水库一样堵塞河道、壅高水位，形成静水水体，改变着河流及与其联系生态系统。单独的水坝与堰塞湖并无本质的区别，并不能将水坝建设简单的视为“征服自然”。因为自然界并不是上帝的禁脔，也不是僵化不动的，自然界也在不停地自己改变着自己，一些堰塞湖长期存在，并已经与周围环境相结合形成了风光秀美的生态系统。这充分说明人们只要尊重客观规律，在河流上筑坝、兴修水利也可以是对自然界的一种良性的干扰，从而兴利除害，提高生态系统的服务功能。任何变化都是量变与质变的统一，真理再向前一步就是谬误。过度建坝也会带来水资源过度利用，阻碍河流的连通性等问题，因此水坝建设的关键就是尊重客观规律、掌握适度原则，实现人与自然的和谐相处与可持续发展。水坝建设还会对河流及与其联系的生态系统构成干扰与破坏，包括对库区景观与生态系统以及整个流域的干扰与破坏，但是这些干扰基本为可控的或可逆的，我们对其应该具体问题具体分析、因势利导、引导其向良性方向发展，对于生态系统不可逆的功能丧失应该建立补偿措施。 6.2 水利工程设计、建设充分体现辩证法 水利工程建设必须具体问题具体分析，将整体与局部统一起来，对不同方案进行比选和优化，处理好质变与量变的关系。 6.3 治河辩证法的首要问题是确定流域治理的主要目的 不同流域综合治理的目的与侧重点各不相同，必须根据实际情况科学确定。根据水土资源的总体大势，新中国著名的水利工作领导者、原长委主任——林一山先生曾指出，北方河流（黄河流域及以北）流域综合治理的主要目的是充分利用水沙资源，而不是花钱将资源送到大海里面去；应本着高水高用的原则安排水资源利用优先用于黄河上中游土地资源丰富的地区，华北地区不足的水量可以由南水北调来补充；南方河流治理中最大的问题则是防洪——解决超量洪水出路的问题，西南江河当地洪涝与供水的矛盾均不突出，流域治理的主要目的是水电开发和南水北调的水源地。 6.4 治河辩证法的前提在于尊重河流演化的客观规律与协调其间的矛盾 河流是一定地质过程与环境背景下的产物，有其产生、发展与消亡的规律。从河流发展的过程看，河流泛滥改道不可避免，因为只有这样才可以塑造冲击平原与平衡河道。自由泛滥改道的河性与人类防洪需求之间的矛盾是治河的主要矛盾。这一矛盾的直接后果是接受河流沉积物的范围极大的缩小，由辽阔的洪泛冲积平原变为被人工堤防束缚的狭窄的滩地与河槽。河流泥沙中除一部分被水流输送到河口三角洲及外海外，相当多的淤积在河流中下游的河道内，抬高了水位，从而迫使人们不得不再次加高堤防，如此恶性循环从而形成了“地上悬河”。“地上悬河”是河流治理矛盾的集中体现。为了缓解这一矛盾的对抗性，在长期的治河实践中人们总结了两种不同的策略。一是 “束水攻沙”、“蓄清刷黄”，按照现在水力学原理就是提高河水流速和输沙能力，将更多的泥沙输送到河口三角洲与外海中；另一是“宽河固堤”，即保持较大的两岸堤距，给洪水泥沙以出路，既可以减轻洪水对堤防的压力、防治堤防冲决，又可以利用广阔的滩地滞洪滞沙、减缓河床淤积的速度。以上二者皆从不同方面反映和运用了水泥运动的基本规律，但整体上又都具有较大的局限性。通过水利工程综合运用，采用“上拦、下排、两岸分滞、调水调沙”等手段可以有效化解水沙矛盾延长河流行洪时间。 6.5 解决复杂水事矛盾的关键是简化流域结构 为了缓解平原河道治理中防洪、除涝之间的矛盾，内外水、主客水分流的一项成功实践，如海河治理在开挖滏阳新河、子牙新河分流上游洪水的同时，右岸大堤阻断了黑龙港平原的排水出路，因此，大堤外侧开挖排水渠，有效解决了排洪与平原内涝之间的矛盾。针对多沙河流的水沙分治，利用清水支流新建引干入支水库，避（沙）峰蓄水，以及城市排水体系中的污（水）洪分排分用，也是化解流域治理中复杂水事矛盾的主要途径。 第 2 章 \ 第 8 课次 水工具的 主要 类型、功能与文化意义 自古以来的主要 水工具 的类型、功能与文化意义，如 船舶 、 桥梁 、 取水工具 、 水能利用工 等。 1 渡河工具 1.1 桥梁 （1） 不同地区的桥梁具有地域文化特色 （2） 桥梁技术的发展体现了人类文明的进步 1.2 舟楫 （3） 不同地区的舟楫具有地域文化特色 （4） 船舶技术的发展体现了人类文明的进步 2 取水工具 2.1 机械取水 翻车、桔槔、辘轳 2.2 活塞式抽水机 2.3 离心泵 2.4 取水工具进步与人类文明 （1） 矿井排水问题是蒸汽机发明的动力之一 （2） 离心泵的出现突破了大气压力对扬水高程的限制，扩大了人们利用水资源的能力，也使得抽水蓄能电站的建设成为可能 3 水能利用工具 （水能利用是工业革命的先声） 3.1 水磨、水碓、水车 3.2 水轮发电机 3.3 海洋能发电机 潮汐、波浪、温差、盐度差 发电机

个人分类: 水利工程与水域生态|5726 次阅读|3 个评论

科研之路--工欲善其事必先利其器（一）小木虫

LeeBruno 2016-3-23 16:54

从新虫到银虫 1、了解小木虫的版块 按照每个划红线的部分分区，包括：科研生活、文献求助、学术交流、公派出国、资源共享、专业版块区、 网络生活以及新版块等等组成。 常用的还有：我的主页，包括求助提醒、回复提醒等。 2、看看“我的主页” 比较重要的是关心自己的成长，而不是人云亦云！所以这一部分要重点关注 。 其中，有一项是“淘贴”，里面相当于一个列表，一般比较精华，可以省去自己寻找的时间。 3、资料下载和回复 每次下载之后，拉至最下面，有一个回复功能，可以减少金币的损失。 4、订阅版块 一一点入版块中，然后加入到自己的版块中去！ 5、SCI期刊是不能订阅的，需要时自己去找！

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正在使用的科研相关的开源或免费工具

ywmucn 2016-3-10 12:17

1.1 Word processing and Presentation To replace commercial MS Office (Win/Mac) *.docx/*.pptx: WPS office(Win/Linux)/LibreOffice (Win/Mac/Linux) + LatexEE1.01(OLE for Win office, Portable) *.tex: Miktex(Win/Linux)/MacTex (TeX Live for Mac) *.md: Pandoc (Win/Mac/Linux) + MathJax (Win/Mac/Linux, Portable) + LanguageTool (Win/Mac/Linux, Portable) 1.2 Pdf Reader and Processing To replace commercial Acrobat Pdf (Win) Merge/Split: Pdfsam (Win/Mac/Linux) Pdf Reader: Foxit Reader (Win/Mac/Linux, Creator)/Skim (Mac)/Evince (Win/Linux) Eps/Pdf Reader: Sumatra pdf (Win, Portable) 1.3 Text and Code Processing To replace commercial Emeditor or Editorplus (Win) *.txt/*.dat/*.md/*.tex: Notepad2-Mod (Win, Portable)/Atom (Win/Mac/Linux)/Vim (Win/Mac/Linux) 1.4 Reference Processing To replace commercial Endnote or Noteexpress (Win) Jabref (Win/Mac/Linux) 1.5 Image Processing To replace commercial Adobe Illustrator (Win) Ghostscript (Win/Mac/Linux) + ImageMagic (Win/Mac/Linux) + Inkscape (Win/Mac/Linux) 1.6 Data Plotting To replace commercial Origin 8 (Win) Veusz (Win/Mac/Linux) + Gnuplot (Win/Mac/Linux, Portable) 1.7 Geometry Viewer Jmol (Win/Mac/Linux, Portable) +Vesta (Win/Mac/Linux, Portable) +V_sim (Win/Mac/Linux, Portable) 1.8 RSS QuiteRSS (Win/Mac/Linux, Portable) 1.9 Programming/Scripting Language Python (Win/Mac/Linux) +Java (Win/Mac/Linux) +AutoHotkey (Win/Mac/Linux) 1.10 SSH To replace commercial Xmananger (Win, Free personal for Xshell+Xftp) MobaXerm (Win, Portable, SSH+SFTP+X11+Cygwin) 1.11 Other Tools XRD Simulation: Platon (Win)/Mercury XRD (Win) Periodic Table (Win, freshney.org) Calculator: SpeedCrunchPortable (Win, Portable) VLC Media Player (Win/Mac/Linux) Qsync (Win/Mac/Linux) TeamViewer (Win/Mac/Linux) CCleaner (Win/Mac) FreeFileSync (Win/Mac/Linux) 7-zip(Win, p7zip for Mac/Linux) 360 Total Security 360 WIFI 360 Browser Avast (Win/Mac)

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微信——终不过只是一种工具

热度 2 flysky97 2015-11-21 20:52

微信 ——终不过只是一种工具 文/齐云龙 摘要 ： 有人说，孤独是人类与生俱来的本质！ 微信中反映的人际关系，就是我们生活的现实 ！ 工具的存在的价值就是满足人的需要，而不是让人成为工具的附庸。工具也有其使用范围，超出了其范围的使用必定会产生危害。 从来都是“过犹不及”。微信，像一把利剑，只不过，它是双刃剑，它可以轻易地砍断某些沟通的阻碍，却也容易造成伤害！ 不是相同的圈子，就不必强融；不是平等一类人，很多都难以成为平等的朋友。 无论我们如何努力，终究无法取悦所有人！ 博客，属于精英人群，微博属于大众； QQ 群，像广场舞，人多，热闹，但是没有主角， 微信里，每个人都是自己圈子中的主角。 无论QQ，还是微信，都只是一种工具……最终的结果，无非还是取决于使用它的人！ 有人说，孤独是人类与生俱来的本质！人类从一出生就开始寻找与自己灵魂契合的一类人！ “一个孤独的小人，面对地球站在那里，这就是微信的启动画面，几亿人对此都熟悉得不能再熟悉。作为一种人际沟通工具，没有第二张图能更好地表达出人类内心的孤独，以及地球家园的美好。所以，整个画面有一种孤清中的淡淡暖意，给人的感觉是文艺到死。等你知道了背后的故事，又会觉得闷骚到死。” 这张图也或许就是象征“一个人孤单地就像一颗星球”，TA所站立的地方也便是自身。怎么看直观上都有一种忧伤的氛围。一个火花闪过，一个答案、一种理解自然而然浮现脑中。这个画面在表达一种渴望：被邀请、召唤，进而去融入和交往的渴望；从一人面对世界的隔阂到进入世界，置身关系、分享和联络之中的渴望。 想当年聊QQ成为某些少数人的特权时，大家聊得一片火热；当年微信成为少数先行者的玩具时，他们摇得火热，乐此不疲……摇一摇，为了遇到某个同时也很无聊的人…… 也有调查得出结论：95后基本不用微信多使用QQ！——每一类人都在寻找着自己世界的沟通工具和语言！ 其实，如果没有微信 的流行 ，那肯定还有其他的微聚、微密、微聊、陌陌、易信、有信、来往、MSN、Skype…… 面对微信的凶猛来势，有很多人试着放弃微信，但还是有更多后来人继续为此而狂欢——除非有更好的、更流行的工具出现，否则，这个圈子里注定还会有很多人，就如同微信出现了，QQ的使用者在减少…… 时代终是要前进的，也许将来，我们身体里只需要植入一块芯片，就可以随心所欲地与想要沟通的人无障碍交流……可是现在，我们暂时还只能依赖手机或者电脑！ 微信，和QQ或者其他即时沟通工具一样，可能饱受诟病，比如：让人分心，不能专注于工作；长时间刷微信危害身体健康；容易传播谣言和大量垃圾信息；减少了个人的隐私、恶化了某些人际关系甚至于对目前中国式婚姻造成重大的冲击，因为中国式婚姻大多不是以爱情为基础，而是以关系为纽带。 无论QQ，还是微信，都只是一种工具……最终的结果，无非还是取决于使用它的人！ 工具的存在的价值就是满足人的需要，而不是让人成为工具的附庸。工具也有其使用范围，超出了其范围的使用必定会产生危害。 微信，像一把利剑，只不过，它是双刃剑，它可以轻易地砍断某些沟通的阻碍，却也容易造成伤害！从来都是“过犹不及”。 微信对 我们造成的各种危害，主要原因是我们没能正确用好微信，微信作为一个社交网络工具，本该在我们的工作、学习之余发挥补充身边社交不足的功能。而现在却被过度使用，或并被各种利益谋求者滥用。微信，很容易成为某些别有用心或者图谋不轨的人的作案工具！ 微信中反映的人际关系，就是我们生活中社交网络的现实！如果说微信破坏了我们的人际关系，应该说微信破坏的是，就是原本不充分的沟通、原本脆弱的关系！ 微信像 一把放大镜，能照出你和“朋友”间的千丝万缕，真真假假，若即若离…… 微信像 一块试金石，试出了不同人的思维模式和沟通方式的差异，试出了你与别人关系的深与浅…… 当然，如果你想真得试一试——先不要把我的结论告诉 TA ！ 微信，是这样伤害着我们的： 当你想要加一个人的时候，却始终得不到TA的认证！ 当你想发一条消息给对方的时候，却发现：TA已经不再是你的好友！ 当你们互加了好友，过了一段时间，你想看看TA的个人相册，却发现，TA屏蔽了你的权限！ 你能看到的只是一片灰白的底色！ 当你兴致勃勃，想要和某个人聊一会儿的时候，TA却只是简短地回复你：呵呵、哦、恩……你顿时意兴阑珊……你感觉到的冷淡其实未必是真的，也许对方是真得在忙！ 当别人对你发到朋友圈的图文一片叫好的时候，你关心的某个人却无动于衷，没有反应…… 你发现，某个人很频繁地在为别人点赞，但是却从来没有光顾过你的朋友圈…… “世界上最远的距离，不是生与死。而是我找你，却找不到，找到了却不回应。” 沟通是人与人之间的桥梁，是连接人人与人关系的纽带。合理的沟通能促进关系的和谐，同时也是矛盾的润滑剂。而不顺畅的沟通或者沟通模式不同则沟通反而能成为矛盾的制造者。——但沟通工具不应该成为罪魁祸首！ 不必说，“道不同不相为谋”，更多的时候，只不过是因为世界万象，五彩缤纷，我们每个人看到的不同而已！有时候，只不过是因为TA曾经受过的伤害，只不过是因为某颗柔弱的心在努力保护自己；有时候，我没有将全部消息发送给你，只是不愿意打扰到你！ 不是相同的圈子，就不必强融；不是平等一类人，很多都难以成为平等的朋友。 无论我们如何努力，终究无法取悦所有人！ 微信，无论多少人说好或者不好，终究不过是一种工具！ 关于那个庞大蓝色星球和渺小身影的画面，通常的答案是“表达了人类孤独的内心”，而微信走红的原因，也被解读为满足了人们交流与沟通的心灵渴求。但“ 腾讯高级副总裁”的张小龙 喜欢的却是一条用户提供的答案——“为什么这个人会站在地球之外？”或许，这在某种意义上暗合了他的形象：总是默默站在热闹喧杂的人群之外，静静观察大千世界的纷繁复杂，用近乎偏执的专注抽丝剥茧，找出事物的本质，再用看似最简单的方法解决问题。 无论QQ，还是微信，都只是一种工具……最终的结果，无非还是取决于使用它的人！ 工具的存在的价值就是满足人的需要，而不是让人成为工具的附庸。工具也有其使用范围，超出了其范围的使用必定会产生危害。 微信，像一把利剑，只不过，它是双刃剑，它可以轻易地砍断某些沟通的阻碍，却也容易造成伤害！从来都是“过犹不及”。 微信对 我们造成的各种危害，主要原因是我们没能正确用好微信，微信作为一个社交网络工具，本该在我们的工作、学习之余发挥补充身边社交不足的功能。而现在却被过度使用，或并被各种利益谋求者滥用。微信，很容易成为某些别有用心或者图谋不轨的人的作案工具！ 你可曾意识到，我们花在陌生人身上的时间，远远多于我们和父母、朋友、家人沟通的时间？ 其实，大多数使用微信的人是想通过微信增进朋友的了解和情谊，开拓新的朋友圈，而实际上这真的早已超出微信本身的能力。要实现这个目的更有效的方法是将自己的生活圈划分区域，核心区是自己和亲人，其次是最好的朋友、朋友、认识的人……对于核心区的亲人和最好朋友，要增加关心和面对面的交流或电话联系，然后积极参加身边的各种社交活动，最后才是用微信拓宽社交网络和补充这些活动的不足。千万不可本末倒置，不然容易产生极其严重的后果。 是的，如果沉迷，微信会夺走你的健康，甚至是你的家庭，你的事业！ 某些人慢慢地开始选择淡出……他们宁愿意多陪陪家人，朋友，而不只是与与你根本无关的人无聊之聊；他们宁愿多体验一下亲自下厨获得的美味而不仅对着朋友圈的美图垂涎三尺；他们宁愿挤出一点时间出去散散步，以能更长久地看着这世界的美好未来…… 读着我的微信文章，你又会作何感想呢？

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[转载]SPSS Syntax tutorial

zhangdong 2015-5-18 22:12

Source: http://www.maths.surrey.ac.uk/explore/sivasakthyspages/spss_syntax.html 代码是最好的操作记录，所以即便是可以方便的Drag-and-click如SPSS的软件，也要掌握programming的方法，可大幅减少工作量，提高效率，并降低出错概率。Mark。 SPSS Syntax.pdf

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分享个面元方向检查工具

chenyunshan 2015-3-18 21:08

这是一个本人开发得小工具，在进行有限元计算时，处理四边形面元数据，面对大量面元数据， 无法判断方向是否正确，就做了这个小工具，可以直观发现哪个面元方向有问题， 调整方向错误数据： 调整后正确： 很简单。附件里包括源代码，文档及数据例子，具体请按DOC文档描述操作。 注意：必须安装AUTOCAD 我 用的是2004,应该哪个都可以。 在处理类似问题可以参考例子自行修改。 AutoCADcheckpanel.rar 那会写给美国那边工程师用的，我英文很烂，看文档DOC ，按照步骤 1,2,3 。。。 看懂绝对没问题

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每当发明一种新工具，人类就退化一步

热度 2 rongqiaohe 2015-1-2 17:22

没有想到，我们父辈能够在脑子记住那么多的电话号码！反过来，我询问过许多研究生，要其告诉我，他们亲朋好友的手机号码。然而，绝大多数被询问研究生的第一反应就是：“我手机里有，查查就知道了，等一会儿用短信把号码发给您。”为什么老一辈能够记住亲戚朋友的电话号码？是因为他们活跃的时代，没有手机，也没有掌上电脑。 因为发明了汽车，有汽车轮子代步，我们的行走能力退化了。孩子们一听说要步行十里路，都摇头不可能做到。而我们的在上山下乡时，每天走三四十里路，是家常便饭。 因为有了手机，我们不再训练自己用脑子记忆电话号码，我们的记忆能力逐渐退化了。 因为有了电脑，我们的写字能力退化了；拿起笔来，写几个歪歪扭扭汉字，就连自己也不满意。 因为有了短信，我们面对面的交流少了。有一次，我的一个研究生走进我的实验室，对我说了一句“老师，我有话跟你说”，说完就转身走了。我很诧异，她为什么不当面跟我说呢？但随即就收到了她从院子里给我发来的短信。学生们已经习惯用手机进行社交了，面对面交谈已经不太适应了。 因为有了钢笔，我们写毛笔字的能力退化了。我们的前辈，毛笔字写得非常棒，令人感叹。 因为有了一系列食品卫生进步，我们已经失去了吃腐食的能力。旧石器时代的人类，找到一块生了蛆的腐肉，拿到河边洗洗，然后吃掉，也可以补充他们的能量。 由于我们吃熟食，喝酸奶，喝豆浆等不需用牙咀嚼的食物，我们的牙齿在逐渐退化。而旧石器时代的人们，他们牙齿可以咬断一根山羊的肋骨。 因为人类不再受到野兽的袭击，奔跑能力逐渐下降，旧石器时代人们的奔跑速度和敏捷，远远超过现在人。 因为这些能力的退化，人类的脑容量也在逐渐减少退化，我们的脑正在变小。如果跟旧石器时代的人们相比，我们现代人的脑，平均退化缩小了150毫升（见PNAS USA, 2008）! 功能的退化，就是脑的退化。 但是，人类坐在计算机屏幕前，工作的能力提高了；发短信的能力提高了；挤车、开车的能力提高了；思考问题，考试的能力提高了；抵抗环境污染的能力增强了；癌症的患病率提高了；精神病的发病率提高了；我们还有许许多多的能力也正在提高。。。 在这个崭新的时代，我们在车站、车上、公园、街道、学校，处处都能够看见这样的景象： 一个人，弓腰驼背，两眼注视着手机，一动不动， 就像雕塑“思想者” 。他/她不时地抚摸酸痛的脖子和肩膀，然后，又沉浸在“弓腰驼背玩手机”的状态之中。。。 “思想者”也对手机上瘾了？ “弓腰驼背”痴迷于手机，是当代最可能影响人类进化的姿态。

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[转载][《Android.UI基础教程》Jason.Ostrander][学习资料][PDF/74M]

lcj2212916 2014-11-18 21:26

名称：《Android.UI基础教程》Jason.Ostrander 类型：学习资料 语言：简体中文 运行环境：电脑、手机 文件大小：74M Android是一个强大的移动操作系统，它结合了Java编程语言、基于XML的布局和配置文件。本章介绍Android开发环境，了解基础的Hello World应用，并且会介绍Android工具，重点讲解在Android开发者工具（ADT）插件中的用户界面（UI）工具。 本书共243页。 下载地址： http://www.400gb.com/file/78562067

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数据画图必备工具整理

ailiyakong 2014-4-9 10:02

人们常说，数据是新世界的货币，而 Web 则是新世界交易的外汇局。作为消费者，我们正在在数据中漫游；处处都是数据，从食品标签，到世界卫生组织组织的报告。其结果是，信息设计师在从数据流中呈现数据时愈发凸现窘境。 获得信息的最佳方式之一是，通过视觉化方式，快速抓住要点信息。另外，通过视觉化呈现数据，也揭示了令人惊奇的模式和观察结果，是不可能通过简单统计就能显而易见看到的模式和结论。正如作家、记者和信息设计师 David McCandless 在 TED 上说道：“通过视觉化，我们把信息变成了一道可用眼睛来探索的风景线，一种信息地图。当你在迷失在信息中时，信息地图非常实用。” 我之前自己做就是用EXCEL/SPSS+PPT+PHOTOSHOP。基本思路是：构思要表达的意思+寻找图片/图标素材+制作基本比例图（柱状图等）+然后思考表现形式，然后PS出来. 编者推荐大家看的一些数据可视化资料（先推荐2个吧）： http://datavlab.org/ http://www.ctocio.com/tag/%e6%95%b0%e6%8d%ae%e5%8f%af%e8%a7%86%e5%8c%96 01. iCharts iCharts 提供了一个用于创建并呈现引人注目图表的托管解决方案。有许多不同种类的图表可供选择，每种类型都完全可定制，以适合网站的颜色主题。iCharts 有交互元素，可以从 Google Doc、Excel 表单和其他来源中获取数据。iCharts 的免费版只允许你用基本的图表类型 02. Flot Flot 是一个用于 jQuery 的专业绘图库，有很多便捷的特性，最关键的是，跨 浏览器 （包括 IE6 ）。可把数据做成动画，因为它是一个jQuery插件，所以你完全可以控制动画、演示和用户交互的方方面面。 03. Raphaeuml;l Rapha euml; l 是一个能够在网页上创建和操作矢量图形的JavaScript 库。它使用SVGVML来创建图形。因为每个生成的图形都是一个DOM对象，所以可以通过JavaScript操作这些图形。 04. Modest Maps Modest Maps 是一个轻量级、简单、免费的地图工具（ JS 库 ），网页设计师和开发人员可轻松地把它整合到网站中。 05. Leaflet 一个地图工具，支持 HTML5 和 CSS3 ，Leaflet 可以轻松使用 OpenStreetMap 的数据，并且完全把交互可视化数据集成在一起。Leaflet 的内核库很小，但是有很多插件能扩展其功能，比如：动态标记、masks 和热图，非常适用于需要显示地理位置的项目。麻雀虽小，五脏俱全。 06. Timeline Timeline 是一个奇妙的小工具，坑绘制漂亮的交互式时间轴，用户滚动鼠标，时间轴会响应变化。点击时间轴上的元素，可显示更多信息。（MIT 开发） 07. Exhibit 和 Timeline 一样，Exhibit 也是 MIT 开发的，完全开源。借助 Exhibit ，用户可轻松做出交互地图，还有其他基于数据的可视化内容，比如国旗，名人的出生地。 08. WolframAlpha 　　Wolfram Alpha 是由Wolfram Research公司推出的一款在线自动问答系统。Wolfram Alpha这一款自动问答系统的特色是可以直接向用户返回答案，而不是像其它搜索引擎一样提供一系列可能含有用户所需答案的相关网页。如果输入公开数据，比如一个函数，可以生成函数曲线（见上图）。 09. Visual.ly 　　Visual.ly 是一个结合 gallery 和 信息图的生成器。它有一个简单的工具箱，用来展示数据信息，它也是一个分享作品的平台。 10. Visualize Free 　　Visualize Free 是一个托管工具，它允许你使用公用数据，或上传自己是数据，来做交互式的图片，以展示数据。可视化远超过了简单的图表，并且这个工具完全免费，不过它是用 Flash 输出结果，所以有些场景下用不了这个工具了。 11. Better World Flux 　　Orientated towards making positive change to the world, Better World Flux has some lovely visualisations of some pretty depressing data. It would be very useful, for example, if you were writing an article about world poverty, child undernourishment or access to clean water. This tool doesn’t allow you to upload your own data, but does offer a rich interactive output. 12. jQuery Visualize 　　这个工具由 jQuery 的 ThemeRoller 和 jQuery UI 幕后团队开发制作。jQuery Visualize 是一个开源的图表插件，使用 HTML Canvas 绘制多种不同类型的图表。这个插件有个重要的特性是支持 ARIA。可。 13. jqPlot 如果你已经在使用jQuery，不想为HighCharts付费，而且情况很简单，不需要D3那样复杂的库，那么jqPlot是很好的选择。 14. Dipity 　　Dipity 可用来创建丰富的交互式时间线，并嵌入到网站中。有免费版和商用版。不多介绍，请访问 Dipity 官网（提示：请自备梯子）实际查看。 15. Many Eyes 　　Many Eyes是由IBM研究的视觉通讯实验室（�0�2Visual Communication Lab）和IBM Cognos 软件集团于2007年所创建的一个在线可视化社区。通过这个社区，用户可以创建可视化作品，上传数据集，对其他用户所创建的可视化进行评论，或者分享，并可以对可视化作品加以评分。 　　Many Eyes允许用户快速从公开可用或已上次的数据集中完成可视化，并且有广泛的分析特性，比如：扫描文本，分析关键词的密度和饱和度。 16. D3.js 　　D3.js 是最流行的可视化库之一，它被很多其他的表格插件所使用。它允许绑定任意数据到DOM，然后将数据驱动转换应用到Document中。你可以使用它用一个数组创建基本的HMTL表格，或是利用它的流体过度和交互，用相似的数据创建惊人的SVG条形图。 17. JavaScript InfoVis Toolkit 　　JavaScript InfoVis Toolkit 是一个在 Web 上创建可交互式的数据图表 JS 库，同样包括了多种图表类型，并有漂亮的动画效果。虽然是免费工具，但建议有条件的童鞋捐赠作者。 　　JIT 的作者是 Nicolas Belmonte，目前是 Twitter 的 Data Visualization Scientist，除了这个项目，他还写了 PhiloGL 和 V8-GL 。 18. jpGraph 　　如果需要在服务器端生成图表或图片，jpGraph 提供了一个基于 PHP 的解决方案，只需从数据库中取出相关数据，定义标题，图表类型，剩下的事就交给 jpGraph 了。它很多种图表类型（见上图）。非商业使用是免费。 19. Highcharts 　　Highcharts 是一个用纯JavaScript编写的一个图表库。能够很简单便捷的在web网站或是web应用程序添加有交互性的图表，并且免费提供给个人学习、个人网站和非商业用途使用，也有商业授权。目前HighCharts支持的图表类型有曲线图、区域图、柱状图、饼状图、散状点图和综合图表。 　　Highcharts 在现代浏览器中支持输出 SVG 格式，也支持在 IE 浏览器中 VML 。 20. Google Charts 　　Google Chart Tools 给网站数据可视化提供了一种完美方式。从简单的线图， Geo 图、 gauges （测量仪），到复杂的树图，Google Chart Tools提供了大量设计优良的图表工具。

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记录一个好用的工具网站

热度 1 wzwahl36 2014-3-26 19:05

http://www.atool.org/ 功能很多，aTool在线工具，站长是我们华科的！

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图形展示工具的可视化研究

jojo199084 2014-1-1 22:27

本文主要以福州市五区八县2010年入室盗窃类案事件为例，利用Tableau 8.0工具进行犯罪可视化展示。 Tableau 8.0 工具中主要图表有：文本表、直方图、树地图、突出显示表、水平图、堆叠条、圆视图、并列圆、填充气泡图、趋势图、甘特图等等。文本表、直方图、水平图、堆叠条、圆视图、并列圆、趋势图、甘特图相对来说较简单、直观；树地图、突出显示表则主要通过色彩的深浅变化来反映数量的多少；填充气泡图则主要通过圆的大小来反映数量的多少。它们均可通过计算犯罪数量和犯罪率两种方式来进行统计分析。下面将选取一定的图形加入仪表板进行综合展示分析。 如图 1 所示文本表，可以看出不同季度、不同月份、不同星期的入室盗窃案的犯罪数量，如图 2 所示：从竖直条形图中可以看出2010年第三季度（绿色部分）入室盗窃的犯罪数量远远高于其他季度；从填充气泡图及树地图可以发现2010年9月份的入室盗窃的犯罪数量远远高于其他月份，主要通过填充气泡图中气泡的大小及树地图中颜色的深浅反映出犯罪数量的多少；而从趋势线很明显可以看出周五的入室盗窃数量特别多。 图1 文本表 图2 还可以通过两个时间维度相结合来分析入室盗窃数量的多少，如图 3 所示 图3 对于不同时间段本文一般用犯罪数量来统计，而对于不同辖区则通过犯罪数量和犯罪率结合统计更加准确直观。如图 4 所示：福清的犯罪数量远远高于其他地区，然而其犯罪数量也是在第三季度九月份的星期三达到最高值。 图4

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生物信息学资源与分析工具（2013.10.28）

jgu 2013-10-28 12:31

Resources and tools for bioinformatics study. Please contribute this document if you have new recommendations or some commments on current collections Some small tools are also provided under ./small_tools/, such as file merge, gene list merge, gene list comparison, etc. Created, Oct 6, 2011 Latest update, Oct 28, 2013 *************************************************************************** --------------------------------------------------------------------------- *************************************************************************** 1. Data resources 1.1 Protein-protein interaction HPRD (recommended for initial study; download the binary interaction file if you do not concern the quality; pay attention to the evidence codes, if you want to focus on the PPI detected by low-throughput experiments) BioGRID MINT IntAct MIPS BIND (Note: some protein-DNA interactions are also included) STRING (Note: they are many functional associations rather than physical interactions) 1.2 Pathways KEGG (You can download raw data files from its FTP site. Please look at the map_title.tab and hsa_gene_map.tab for GeneID mapping) BioCarta (No source file... Only include the core genes related to the signaling pathway) Reactome (Many more species avaliable) NetPath NCBI PID 1.3 Gene regulations TargetScan (predicted miRNA targets; tool is also avaliable) RNA22 (miRNA target prediction tool) miRBase (microRNA database) TarBase (experimentally verified microRNA target database) miR2Disease (a manually curated database, aims at providing a comprehensive resource of miRNA deregulation in various human diseases) TRED (transcription regulation database; curated from literature) TRANSFAC (TFBS PWMs; many useful information; Please pay attention to the quality of the PWMs;need license.....) JASPAR (Open-access PWMs) ENCODE (Huge number of data....) 1.4 Gene function Gene Ontology (A review paper is recommended: Rhee et al. Use and misuse of the gene ontology annotations. Nat Rev Genet 2008, 9:509-515.) NCBI Gene Database 1.5 Gene expression NCI-60 project (gene miRNA expressions from 60 cancer cell lines) Connectivity Map (gene expressions from many cell lines treated by different drugs under different dosages) NCBI GEO (you can download .CEL raw data for further processing) EBI ArrayExpress (I do not like the file format of ArrayExpress....) ENCODE (many resources including RNA-seq data) TCGA (http://cancergenome.nih.gov/ the cancer genome atlas) CCLE (http://www.broadinstitute.org/software/cprg/?q=node/11 cancer cell line encyclopedia) 1.6 Drug related DrugBank PubChem ATC code SIDER 1.7 Disease related HPO SIDER OMIM miR2Disease (a manually curated database, aims at providing a comprehensive resource of miRNA deregulation in various human diseases) TCGA (http://cancergenome.nih.gov/ the cancer genome atlas) CCLE (http://www.broadinstitute.org/software/cprg/?q=node/11 cancer cell line encyclopedia) 1.8 Standard vocabulary HNGC (mapping many IDs/Names to standard IDs; EntrezGeneID is recommended;http://www.genenames.org;a sample code is given ./id_mapper/) UMLS (Unified Medical Language System) MeSH (Medical Subject Headings) *************************************************************************** --------------------------------------------------------------------------- *************************************************************************** 2 Tools 2.1 Integrated portals and platforms UCSC Genome Browser (please learn how to use Table Browser and how to add Custom Track) IPA (Read documents from http://www.ingenuity.com/; a commercial integrated functional annotating systems) Expander Cytoscape (Network visualization and small scale network analysis) BioConductor (a R platform, including many packages for bioinformatics analysis; please read its documents) 2.2 Sequence analysis BLAST BLAT (compare similar and long sequence) Bowtie (recommended for deep sequencing analysis) ClustalX (local multiple alignment) Sim4 2.3 Literature mining Literature mining scripts written by Jun Yuan (Please refer to the dir ./literature_mining/) 2.4 Statistical packages fdrtool (calculate the q-values based on p-value, z-score, t-score and correlation) 2.5 Functional annotation or gene set analysis GSEA (gene set enrichment analysis package) DAVID web tools Ontologizer (gene set analysis for GOs with hierarchical information and visualization) 2.6 Gene regulation TargetScan (miRNA target prediction) RNA22 (miRNA target prediction;easy for use) DME/STORM (motif analysis package first written by Andrew Smith, recommended; many other tools in the same package) MEME (for small scale motif analysis, very slow) MINDy (modulator inference by network dynamics) miRHiC (regulatory inference from hierarchical gene co-experessed signatures) ARCANE (gene regulatory inference from large-scale gene expression data) 2.7 Microarray processing dChip (easy to use; please refer to the documents and some scripts under ./microarray_dchip/; Combat for adjusting batch effects) RMA (similar usage as dChip) SAM (Significance analysis of microarray, to detect differentially expressed genes; EXCEL plugin/R scripts; I recommend write your own code (t-test + fdr adjustment) to identify differentially expressed genes...) EDGE (Identify differentially expressed genes in time-course datasets; the sample size should be more than 10 according to my experience) STEM (Identify gene expression patterns from time-course datasets with limited number of time points; easy to use, java platform) FastDMA (analyzer for illumina humanmethylation450 beadchip) *************************************************************************** --------------------------------------------------------------------------- *************************************************************************** 3 Conferences and Journals 3.1.1 Bioinformatics 3.1.2 PLoS Computational Biology 3.1.3 BMC Bioinformatics/Genomics/Systems Biology 3.1.4 PLoS ONE 3.1.5 Nucleic Acids Research (Computational Biology/Webserver Issue/Database Issue) 3.1.6 Nature Biotechnology/Method (Computational Biolgy) 3.1.7 Quantitative Biology 3.2.1 ISMB/ECCB (Intelligent Systems for Molecular Biology) *** 3.2.2 RECOMB (Research in Computational Molecular Biology) *** 3.2.3 APBC (Asia Pacific Bioinformatics Conference) ** 3.2.3 InCOB (International Conference on Bioinformatics) ** 3.2.4 BIBM (IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine) 3.2.5 PSB (Pacific Symposium on Biocomputing)

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死亡（八）自己的工具

热度 2 smallland 2013-9-29 16:54

死亡是别人的工具，也可以是自己的工具。解脱痛苦，只是负面工具之一。 正面的，前面多次说过，对于雄性，其竞争就不能惧怕死亡。所以，雄性是死亡性别。 古代的将军，最高境界之一，就是战死疆场， 革马裹尸 。如果削了他的职，让他回家种地，他就很不高兴。当然，这个境界，其实是有原始动力的，比如，建功立业、三妻四妾，等等。 据说当年的秦国，奖惩机制很刺激，战士上了战场就很卖命，不怕死，因为，一旦活下来，割了几个敌人头颅，就能换回物质利益和生殖利益。 作为自己的工具，当然不止这个。比如黑老大，就常常会展示自己是拼命三郎，不怕死。如果身上有刀伤，就更应该充分展示一下，以此威吓喽罗门。 有的普通人，也会用类似的手段：我死给你看，不信？看看吧。孩子，也会用。对父母说，我死给你看。父母说，去死吧。如果真的死了，父母会很伤心。孩子的工具生效了，自己却看不到效果。 这个为自己服务的工具，也只有人类才会。

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死亡（六）工具

热度 1 smallland 2013-9-23 20:00

人类虽不是唯一学会使用工具的动物，但无疑是使用得最好的。任何东西都可能成为工具，死亡，也不例外。 9.11 后，有颇具正义感（引号）的国人，赞美，说，你看，那是什么样的仇恨啊！冒着必死的决心，稳健地操纵着飞机，撞向象征繁荣和腐朽的大楼。 那到底是什么样的仇恨呢？很可能，美国大兵没有占领其家园，也没有奸淫其妻女。那仇恨，很可能是驯化出来的（如何？ TED 有个视频，大概题目是人肉炸弹是怎样炼成的，方法，很简单）。 这样的工具，我们应该不陌生。一个 15 岁的少女，坦然走向鬼子（忘记是什么鬼子了，还是什么狗子）的铡刀。这，也受到表扬，一个有影响力的人物就很赞许，说，很好啊，生的伟大，死的光荣。哪里光荣呢？一个未成年人，没有能力判别 x-ism 和真伪，肯定是谁教的好。 旧时日本武士，不为仇恨，也能死的很壮观。切腹，方法当然有龟腚。很可能，连肠道的内容物也切出来。但，他们认为，那样做很神圣，或者，他的家人也会很有面子 ---- 尽管血和未消化完或已经消化完的食物混合着。 近两天， al Shabaab 的领导，可能在舒适的环境中用着手机或电脑，在社交媒体上发布着实时信息，遥控着那些圣战者 --who ，冒着必死的决心，占领了超市，制造了血流，扣押了人质。他们必死。或许，他们认为这很神圣。也或许，他们相信天堂的 72 个处女在等着。不管他们怎么想，或许，这想法就是发 twitter 者告诉他们的。 如果这事发生在帝国主义领土上，也会有国人为此欢呼。

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我的window效率软件汇总

热度 1 laplace 2013-8-18 10:07

工欲善其事必先利其器，面对一个好的软件，初期可能会有陌生感，但是只要踏出第一步，用上之，慢慢习惯之，价值和效率就会慢慢体现。所谓最高价值的产品，就在于买了它，它会随着时间的推移给你带来越来越多的价值，而不是像一根馒头，只能带来一次性的价值。所以从这个角度来说，面对一个不熟悉但是介绍上说很有价值的软件，还是很有必要勇敢的踏出第一步，去尝试一下，才会发现新的天地。 1、知识管理软件——evernote 这个就不展开说了，有一篇专门的博文，而且笔记软件或者知识管理软件的应用手法千差万别，没有统一的方法，只可个人不断积累经验。 2、知识管理软件——wiz（为知笔记） 官网： http://www.wiz.cn/index.html 3、文献管理软件——mendeley 官网： http://www.mendeley.com/ 抛弃了endnote转到该软件有一年多了，软件更新后有了越来越多的新功能，目前他被 Elsevier收购，有了干爹，用该软件更踏实了。 pdf全文检索，doi快速添加文献，云同步，网页快速导入文献，应用内可以直接检索mendeley文献数据库，用户之间协同处理文献，等等，优点多多，值得尝试。 对于刚进组的同学来说，尤其值得尝试。而对于老师来说，用这个软件作为公共的实验室文献管理平台，估计是最棒的了。 4、速度最快的文件搜索软件——search everything 推荐指数：五颗星！ 官网： http://www.voidtools.com/ 善用佳软： Everything:速度最快的文件名搜索工具 强调两点（1）设置快捷键，tools——options——keys——new wi ndow hotkey——按F4，将F4设为快捷键，这样就任何使用都可以一键F4呼出搜索框，直接输入要搜索的关键词/文件类型等等，（可选 键盘流 操作：点击TAB找到相应文件，enter即可直达了）。（2）在search中有几个match，如果大家用这个软件发现没有搜到本应该出来的，注意是不是这儿筛选所致。 （3）用习惯这个软件之后，就会潜移默化的注意文件和文件夹的命名的规范性，这样就不会找不到文件了，至于存放位置就无所谓了。（4）只支持NFFS格式磁盘，如果某一个磁盘不能被检索，注意格式是否正确。（5）当然只要用上手了，相信大家都会自然而然的把各个设置摸索一遍的。 5、剪切板增强软件——CLCL 推荐指数：五颗星！ 善用佳软： 剪贴板增强软件综述:CLCL,ClipX,Ditto等 虽然有各种剪切板增强软件，但是我还是最爱CLCL，平时随便ctrl+c和ctrl+v，需要粘贴之前的记录时，用alt+v呼出CLCL的复制记录，然后上下箭头找到记录按enter即可，又是流畅的鼠标流。 提醒一点：用CLCL复制非最新记录，可以将文字的格式除去，这样可以省好多麻烦。 6、截屏软件——FastStone Capture 你还在用qq截图吗？用这个软件，就能体会所谓的软件精细分工的意义，多少软件都自带截图功能，但是都没有这个只专注截屏的软件做得好。 7、同步盘——金山快盘，坚果云和dropbox 金山快盘：毫无疑问，它可能是目前用的最普遍的，我也在使用，将不需要过分安全储存的软件/图片等保存到快盘中，将其定位为“存储盘”。 坚果云：最推荐坚果云，增量同步功能会减少流量，只限制每月流量而不限制总容量的策略意味着无限的空间，可以同步电脑中的多个文件夹，更重要的是他的安全性绝对要甩开金山快盘好几条街，对安全的重视 甚至 要高过dropbox，后者只有危机之后才开始两步验证，前者早就实现了。我将该软件定位为“同步盘”。 dropbox速度慢，但是他的api连接了很多软件，所以，还是必须要用的。 8、浏览器——chrome 推荐指数：五颗星！ 我该用何种赞美的语言去夸奖chrome，或许这么说，能够对得起他给我的价值：“有了chrome浏览器，我心情舒畅了，活得更长了”。因为软件赋予我们的效率，就相当于给予了我们时间。 使用chrome浏览器，一个重要的感悟就如同科研idea的启发“只有想不到，没有做不到”，任何的一个需要的功能，我们都可以早浩瀚的插件和应用市场中找到。 9、快速启动程序的软件：FARR（fast and run robot） 需求：快速启动程序。 看似不起眼的功能，却能节省大量的时间。 尤其是软件较多，寻找不遍的时候。当年每次都要在桌面上翻一阵，或者在开始-程序中浏览半天才能找到自己想要的软件的时候，那就要想想，这个软件的存在必要性了。 启动方式：ctrl+space（自己可以设置）快速呼出对话框，如下图所示，然后直接输入ever，wiz，qq，dr，360等软件的前几个字母，即可回车打开该软件， 又是流畅的键盘流。 历史记录自动更新。 高级设置：（1）可以设置扫描的文件夹及其优先级，例如可以加入存放绿色软件的文件夹（2）可以将常用的软件放在对话框的右边，如下图所示的wiz图标和飞信图标，不过这个没啥必要，因为这样就需要用到鼠标了。。。（３）只是用来启动软件，就有点小看这个软件了，虽然我确实只是用来启动软件的。使用大量的扩展，很多功能，有兴趣的可以自己去研究一下。 PS：（2013年8月18日星期日） 纠结再三，还是发了这个博文吧，或许我在软件上有点过分的追求，就像前几天遇到的一个追星族的狂热一样让人感觉可笑，所谓生活过度的工具化，只会导致本末倒置的结果。这个还是需要谨记的。 但求对看过这个博文的人有点价值吧。

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当工具不再是工具--海德尔堡人的石斧

smallland 2013-8-16 11:26

古人类学者在研究几十万年前海德尔堡人（一说是现代人和尼安德特人的祖先）的石器时，发现了一个巨大的石斧。这石斧，做的很大，很精致，显然并不实用，就像普通士兵拿着关云长的大刀。因此，研究者说，这石斧，显然不是用来切肉的，而是给别人看的。也就是说，这是原始文化的发扬光大，主人通过石斧展示自己的智慧和能力。 因此，研究者接着说，当工具不再是工具，它就被赋予了原始的交流功能。 工具不再是工具？显然，说的是切肉的工具。其实，它依然是工具，展示自己的工具 -- 或许，通过这个工具，石斧的主人能获得雌性的青睐，能让他获得更多的交配机会（制作石斧显然是雄性的任务 ）。 在动物进化过程中，许多“工具”最终进化成另外的工具，具有 性 选择的功能，鱼虫鸟兽都不乏典范。譬如，腿的功能是奔跑，追逐猎物、躲避敌害，等等。 而刘翔的腿，显然超越了原始的功能，或者说，原始功能已经毫无意义-- 不用去捉兔子，不用去捉小偷。有意义的是，他只要苦练， 通过展示自己的奔跑能力，获得另外的好处 。 当工具不再是工具，才是生物创造奇迹的时刻 ，才是文明物种的起点。 海德尔堡人

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常用的专利分析工具

热度 3 dj2012 2013-5-26 12:01

分析软件名称 简 介 中国分析软件 PIAS 专利信息分析系统 该系统是由国家知识产权局知识产权出版社开发的专利分析系统。能够对专利信息进行二次加工，便于对技术发展趋势、申请人状况、专利保护地域等专利战略要素进行定性、定量分析。 该系统吸收并借鉴了国外成熟的分析理论和研究，从专利战略的多个视角透视专利技术，通过对大量专利文献数据的统计分析处理，形成各种直观、形象的数据图表，提供清晰、高校的信息情报，并且可以实现从国内外相关专利网站批量下载数据，并导入数据库内进行专利分析。 东方灵盾中外专利检索及战略 分析平台 该平台是北京东方灵盾科技有限公司自主开发的适用于社会大众不同专利检索和战略分析需求的系统软件。相比国内其它同类产品，该平台具有更加强大而个性化的检索和分析功能，能够更高效地满足用户对专利信息的查全、查准的需求，对检索结果进行准确的统计分析。该平台目前达到了国内领先水平，是东方灵盾为企业量身定制高质量专业专利数据库的有力工具。 该平台能够对技术发展趋势、专利保护地域、专利权人申请状况等专利战略要素进行多向位的统计分析。统计结果可以分别显示为一维、二维、三维的柱状图、饼状图、曲线图和表格形式，使用户能够方便直观地对各技术领域的发展趋势、竞争态势有一个综合了解，从而来更加深入地挖掘和有效利用专利信息的战略价值。 大为PatentEX专利信息创新平台 该平台具有高速下载、高稳定性、高易用性等特点，特别适用于企业、大学、研究机构等创新主体，用于建立本地主题数据库，监视竞争对手技术发展动向，跟踪行业新技术发展动态，挖掘现有人类智慧结晶，研发出世界范围内的优势专利，并通过对行业专利技术的分析，配合企业的经营战略，有效制定企业知识产权发展战略，形成企业的核心竞争力，达到进攻与防御的平衡。数据来源于中国、美国、欧洲官方免费专利数据库，也可扩展到日本、WIPO官方免费专利数据库。 该软件的分析功能有：技术生命周期分析，根据逐年专利申请件数和专利申请人（发明人）数量，生成技术生命周期分析图，直观揭示出技术发展的萌芽期、成长期、成熟期、衰退期；自定义矩阵分析：标引专利采取的技术手段与产生的功效，生成功效矩阵图，了解矩阵中的空白区、疏松区、密集区，以便于进行创新研发、规避风险、架构专利网或衍生新的专利；增长率分析：申请人、发明人、技术分类等年度申请量增减幅度分析，了解技术创新能力变化趋势；存活期分析：对行业、申请人、区域等专利法律状态、存活期进行分析，找出核心专利；引证分析：按专利的引证数量和相互引证关系生成引证图，分析技术演变过程；定量分析：对任意的专利著录项目或用户标引项目可进行简单统计分析和组合统计分析。 恒和顿HIT—恒库 HIT_ 恒库是恒和顿自主研发的，集专利信息检索、管理与分析为一体的专利分析系统。该系统的分析功能包括：授权信息统计；竞争对手当前的技术拥有情况；技术信息统计；专利引证分析；专利价值分析等。该系统对于专利著录项制作多种统计图表，还可以在图像中进行图像控制和其他操作，如颜色、数据、二维或三维、标题注释以及图例控制等。 根据用户需要，自动生成多种形式的统计报告，各种重要的统计信息和图表清楚地呈现在报告中，为用户提供极具价值的情报信息。原始文件可以转换为各种常用格式文件，方便使用和管理。 外国分析软件 Derwent Analytics Derwent Analytics 是一个对数据进行深度挖掘并展开可视化分析的软件。它具有界面友好和直观的特点，提供一种轻松的方法从Thomson Derwent专利数据库中的原始数据中，挖掘出更有意义的分析数据，为全面掌握行业动态提供有意义的依据。 自动汇总——Derwent Analytics会初步自动汇总、分析所输入的数据，按照不同的侧面分类快速显示所汇总的数据，初步给用户一个发展趋势的概况； 数据整理—— 数据分析的结果首先取决于数据的准确性与完整性：例如将已经合并的两家专利申请企业的专利清理、组合成一家合并后企业的总专利清单； 比较矩阵—— 将两种不同类型的数据生成比较矩阵，借此发现两种不同类型数据间内在的相互关系。例如将专利权属人（一般是公司）与专利发明人之间生成关系矩阵，了解同一个专利发明人是否曾经为多家公司做过专利发明； 数据图谱——将大量的数据汇总进行各种分析（如聚类分析、趋势分析等）并以二维和三维的方式图示的形式表示出来； 预置的分析模块（宏）——单击不同的分析模块，即可按照模块预定的分析功能自动分析所导入的数据，并最终生成分析报告； 工具包——用户可以利用工具包建立用户自己定义的词典等。 TDA Thomson Data Analyze (TDA) 是美国Thomson公司开发的专利分析工具，是Derwent Analytics的第二代产品。通过该软件可以对专利数据进行深度挖掘并展开可视化分析。TDA具有自动化程度高、界面友好、直观的特点，提供一种轻松的方法从Derwent世界专利索引和专利引文数据库中的原始数据中挖掘出游有用信息，为洞察技术发展趋势、掌握竞争对手的专利发展情况、找出多产的专利发明人及其供职的公司、发现行业近年新出现的技术、确定研究战略和发展方向等方面提供有价值的依据。在数据整理、比较矩阵、数据图谱、自动汇总等功能方面比较有优势。 Aureka Aureka 结合了世界主要的专利数据库、方便快捷的文件目录树、强大的搜寻引擎、独创的检索机制、先进的语意分析和文本聚类技术、无与伦比的可视化专利地图，可以更加轻松的管理知识产权，让专利与技术文献数据，自动解析成为结构化的知识，通过Aureka数据库可以进行：侵权研究；专利管理；掌握技术发展趋势；寻找合作伙伴；监控竞争对手等。 VantagePoint SearchTechnology 公司的产品Vantage-Point是一种数据挖掘工具，能深层次挖掘专利信息。主要是对数据域内的各种项目进行统计分析。如果该数据域里含有书面文本的话，该软件也能运用某些自然语言运算法则进行主题解析。系统采用多种算法如通过模型匹配、基础规则和自然语言加工技术等进行文本挖掘，系统使用的数据由用户直接从数据供应商处购买。 Patentlab- Ⅱ 该分析软件主要针对Delphion的专利进行分析。其功能较单一，主要是根据用户选定的指标生成二维、三维的直观图表。它的主要功能有：提供几种类型的HTML报告格式、Analysis Wizard为用户提供简便的专利数据分析、Patent Viewer为产看专利全文、ChartsGraphs提供可视化的图表分析能力，此外还提供了在线国际专利分类或美国专利分类的对照显示功能。 BizInt Smart Charts 该软件允许用户使用来自STN、Derwent、IFI以及Dialog上的化学文摘库的专利数据，并生成由其得到的信息图表。该系统可以简便地定制各种图表，并有多种存储和输出选择。 STN AnaVist STN AnaVist 是一个强大的交互分析和形象化的软件，提供各种科学文献和专利检索结果的分析工具并呈现研究模式与趋势。STN AnaVist 能分析从多学科 CAplusSM 数据库、专利数据库 USPATFULL 及 PCTFULL 里所搜索的结果。运用STN AnaVist可以分析专利，追踪竞争信息——找出您的竞争对手在做什么，发现现有技术的最新应用，决定研究趋势——了解研究领域是否为新兴领域、稳定成长的领域还是正在衰退，作为战略性商业决策支持。 Focust Focust 软件包含有检索模块、引文模块和分析模块。其分析模块提供诸如文本挖掘分析、高级可视化技术分析功能，以及灵活多样的专利文件管理，使分析方法灵活，结果更加可靠。文本挖掘分析，利用关键词建立专利文献聚类图形，用树状图形的形式帮助用户更好地了解专业术语。高级可视化技术分析功能允许用户定制二维或三维图表，分析相关专利情报。专利文件管理功能提供用户几种灵活的方式管理专利文献，方便专利分析。 Invention Machine Invention Machine 系列产品是由Invention Machine公司开发的一系列用于帮助进行计算机辅助发明设计的应用软件，其中在专利分析方面最相关的两个产品是Co-Brain和Knowledgist。这两个软件都用于实现从全文数据中提炼主题或功能或目的函数。

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知识工具

热度 1 dj2012 2013-5-26 11:57

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pixtool:栅格图像工具软件

liujs 2013-5-25 11:57

栅格图像工具软件是一组对sun栅格图像数据进行格式转换、自动剪裁、拼接、动画播放的工具集。共包含7个模块，1to8模块将一位面图像数据转为8位面格式；8to24模块将8位面图像转为24位图像数据；24tr8将24位图像转换为8位图像格式；rasrot模块对图像进行旋转、翻转等变换；pixcut根据给定的背景颜色自动对图像进行剪裁；pin24对两个图像进行拼接；xmvw模块对一组连续的图像进行动画播放。 软件可用于各种地球物理场图像及地质图像的后期处理、演示，用于揭示各种物理场值随时间和空间的连续变化。 软件著作权登记号：2013SR049712 pixtool-栅格图像工具软件使用说明.pdf

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预测蛋白质相关信息的在线工具

Bearjazz 2013-5-16 15:15

熊荣川 xiong rongchuan 六盘水师范学院生物信息学实验室 xiongrongchuan@126.com http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz 生物信息学可以根据已有的数据对蛋白质的信息进行预测. 再此介绍一个运行速度很快而且也比较权威的在线工具 ProtParam 网址: http://web.expasy.org/protparam/ 其网站上功能介绍如下: ProtParam ( References / Documentation ) is a tool which allows the computation of various physical and chemical parameters for a given protein stored in Swiss-Prot or TrEMBL or for a user entered sequence. The computed parameters include the molecular weight, theoretical pI, amino acid composition, atomic composition, extinction coefficient, estimated half-life, instability index, aliphatic index and grand average of hydropathicity (GRAVY) ( Disclaimer ). 只要在数据框中粘贴你的氨基酸序列并提交, 即可预测该该蛋白质的相关信息. 如等电点、分子量、分子式、不稳定系数(instability index, 40为稳定, 40为不稳定) 预测蛋白质功能作用位点的在线工具 http://myhits.isb-sib.ch/cgi-bin/motif_scan 在数据框中输入一定格式的氨基酸序列(具体可以先观察其带的例子),在数据框下面复选参考数据库,然后搜索. 可以查看类似蛋白激酶磷酸化位点之类的信息.

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选个好工具很重要（R）

seawan 2013-5-8 17:59

计算机编程搞多了，真是习惯势力严重。 最近花了很多功夫来编程， 用的是Java。。。 实际上是非常失策： Java中用于数据分析的模块还是没有其他一些环境多， 例如R。 例如，时间序列模式的运算，从Java中难以找到相应的模块，R中现成的。 重新来过吧。 ----- R还是开源的，很好。 http://www.r-project.org/

个人分类: 好工具|2173 次阅读|0 个评论

[转载]数字人文工具汇总

热度 2 limer 2013-5-5 11:11

DIGITAL HUMANITIES TOOLS DELICIOUS Delicious is a Social Bookmarking service, whereby one may save bookmarks online, share them with others, and see what other people are bookmarking. DIIGO Diigo is two services in one --a research/collaborative research tool, and a knowledge-sharing community/social content site. TWITTER Twitter is a real-time short messaging service that works over multiple networks and devices. In countries all around the world, people follow the sources most relevant to them and access information via Twitter as it happens-from breaking world news to updates from friends. WORDLE Wordle is a toy for generating word clouds from text that you provide. The clouds give greater prominence to words that appear more frequently in the source text. You can tweak your clouds with different fonts, layouts, and color schemes. The images you create with Wordle are yours to use however you like. You can print them out, or save them to the Wordle gallery to share with your friends. WORDPRESS WordPress is a state-of-the-art publishing platform with a focus on aesthetics, web standards, and usability. WordPress is both free and priceless at the same time. More simply, WordPress is what you use when you want to work with your blogging software, not fight it. OPEN SOURCE SOFTWARE FEDORA Fedora is a Linux-based operating system that showcases the latest in free and open source software. Fedora is always free for anyone to use, modify, and distribute. It is built by people across the globe who work together as a community: the Fedora Project. The Fedora Project is open and anyone is welcome to join. KUALI Kuali is a growing community of universities, colleges, businesses, and other organizations that have partnered to build and sustain open-source administrative software for higher eduction, by higher education. Kuali software is released under the Educational Community License. MIT OPEN COURSE WARE MIT OpenCourseWare (OCW) is a web-based publication of virtually all MIT course content. OCW is open and available to the world and is a permanent MIT activity. PHILOMINE PhiloMine is a drop-in extension to current releases of PhiloLogic, to support a variety of machine learning, text mining, and document clustering tasks. It is designed to work with databases currently loaded under PhiloLogic without further modification. Like PhiloLogic, PhiloMine is a Free Software implementation designed to support research and development activities at the ARTFL Project and the Digital Library Developement Center and the at the University of Chicago. SILVERLIGHT Microsoft Silverlight helps you create rich web applications that run on Mac OS, Windows, and Linux, providing a new level of engaging, rich, safe, secure, and scalable cross-platform experience. SOFTWARE ENVIRONMENT FOR THE ADVANCEMENT OF SCHOLARLY RESEARCH The Software Environment for the Advancement of Scholarly Research (SEASR), funded by the Andrew W. Mellon Foundation, provides a research and development environment capable of powering leading-edge digital humanities initiatives. SOPHIE 2.0 Sophie 2.0 is open source software for writing, reading and visualizing rich media documents in an interactive, networked environment. The program emerged from the desire to create an easy-to-use application that would allow authors to combine text, images, video, and sound quickly and simply, but with precision and sophistication. Sophie's users are interested in creating robust, elegant, networked, texts and multimedia works without having programming knowledge or training in the use of more complex and costly tools such as Flash.Sophie 2.0 was initially designed and developed by the Institute for the Future of the Book. In 2008, the University of Southern California's School of Cinematic Arts assumed sponsorship of Sophie 2.0 and, with a generous grant from the The Andrew W. Mellon Foundation, is significantly revising and improving a new 2.0 version to be released in the Fall of 2009. The Sophie 2.0 Project is being developed by Astea Solutions AD and additional contributors using a Java code base contributed to the project by Astea Solutions. TEXT CODING INITIATIVE The Text Encoding Initiative (TEI) is a consortium which collectively develops and maintains a standard for the representation of texts in digital form. Its chief deliverable is a set of Guidelines which specify encoding methods for machine-readable texts, chiefly in the humanities, social sciences and linguistics. Since 1994, the TEI Guidelines have been widely used by libraries, museums, publishers, and individual scholars to present texts for online research, teaching, and preservation. In addition to the Guidelines themselves, the Consortium provides a variety of supporting resources, including resources for learning TEI, information on projects using the TEI, TEI-related publications, and software developed for or adapted to the TEI. THOUGHTARK An open source, free web application and collaborative space that utilizes the search behaviors of the users to determine the value of various bibliographic resources. RESEARCH ENVIRONMENTAL SYSTEMS RESEARCH Founded as the Environmental Systems Research Institute, ESRI is built on the philosophy that a geographic approach to problem solving ensures better communication and collaboration. Geographic information system (GIS) technology leverages this geographic insight to address social, economic, business, and environmental concerns at local, regional, national, and global scales. HISTORY ENGINE The History Engine is an educational tool that gives students the opportunity to learn history by doing the work-researching, writing, and publishing-of a historian. The result is an ever-growing collection of historical articles or episodes that paints a wide-ranging portrait of life in the United States throughout its history and that is available to scholars, teachers, and the general public in our online database. OPEN JOURNAL SYSTEMS Open Journal Systems (OJS) is a journal management and publishing system that has been developed by the Public Knowledge Project through its federally funded efforts to expand and improve access to research. OJS assists with every stage of the refereed publishing process, from submissions through to online publication and indexing. Through its management systems, its finely grained indexing of research, and the context it provides for research, OJS seeks to improve both the scholarly and public quality of refereed research. PHILOLOGIC PhiloLogic™ is the primary full-text search, retrieval and analysis tool developed by the ARTFL Project and the Digital Library Development Center (DLDC) at the University of Chicago. This is a Free Software implementation of PhiloLogic for large TEI-Lite document collections. The wide array of XML data specifications and the recent deployment of basic XML processing tools provides an important opportunity for the collaborative development of higher-level, interoperable tools for Humanities Computing applications. The sophistication and power of the TEI-XML encoding specification supports the development of extremely rich textual data representations. WORLDCAT WorldCat connects you to the collections and services of more than 10,000 libraries worldwide. CITATION MANAGEMENT CONNOTEA Connotea: Free online reference management for clinicians and scientists. ZOTERO Zotero is a free, easy-to-use Firefox extension to help you collect, manage, and cite your research sources. It lives right where you do your work-in the web browser itself. ANALYTICAL RESEARCH METADATA OFFER NEW KNOWLEDGE (MONK) MONK is a digital environment designed to help humanities scholars discover and analyze patterns in the texts they study. The MONK project has been generously supported by the Andrew W. Mellon Foundation, from 2007-2009, and InCommon integration has been supported in 2009 by the CIC Library Directors. All code produced by the project is open source. MONK has a publicly available instance with texts contributed by Indiana University, the University of North Carolina at Chapel Hill, the University of Virginia, and Martin Mueller at Northwestern University. NEOFORMIX Discovering and Illustrating Patterns in Data: Blog editor who enjoys discovering the patterns in the apparent chaos of real life data and exploring new techniques for communicating in a visually compelling manner. Includes analytical project results, reviews of tools or techniques, and links to related resources. NVIVO Different than statistical or quantitative software, which analyze data using numbers, QSR software helps you to access, manage, shape and analyze detailed textual, audio and visual information. The NVivo 8 software product allows you to import, sort and analyze audio files, videos, digital photos, Word, PDF, rich text and plain text documents. WOLFRAM|ALPHA Wolfram|Alpha's long-term goal is to make all systematic knowledge immediately computable and accessible to everyone. We aim to collect and curate all objective data; implement every known model, method, and algorithm; and make it possible to compute whatever can be computed about anything. Today's Wolfram|Alpha is the first step in an ambitious, long-term project. Enter your question or calculation and Wolfram|Alpha uses its built-in algorithms and a growing collection of data to compute the answer. COURSE SUPPORT DEVELOPMENT CENTER FOR DIGITAL STORYTELLING An international not-for-profit community arts organization rooted in the craft of personal storytelling. We assist youth and adults around the world in using media tools to share, record, and value stories from their lives, in ways that promote artistic expression, health and well being, and justice. MOODLE Moodle is a Course Management System (CMS), also known as a Learning Management System (LMS) or a Virtual Learning Environment (VLE). It is a Free web application that educators can use to create effective online learning sites. Moodle.org is our community site where Moodle is made and discussed. Please explore and join in! PACHYDERM 2.0 Multimedia authoring for peanuts. Pachyderm is an easy-to-use multimedia authoring tool. Designed for people with little multimedia experience, Pachyderm is accessed through a web browser and is as easy to use as filling out a web form. Authors upload their own media (images, audio clips, and short video segments) and place them into pre-designed templates, which can play video and audio, link to other templates, zoom in on images, and more. Once the templates have been completed and linked together, the presentation is published and can then be downloaded and placed on the authora€™s website or on a CD or DVD ROM. Authors may also leave their presentations on the Pachyderm server and link directly to them there. The result is an attractive, interactive Flash-based multimedia presentation. PREZI Prezi is a living presentation tool... visualization and storytelling without slides. SAKAI The Sakai Collaboration and Learning Environment is developed by a community that strives to enable exceptional teaching, learning and research. Sakai collaborators - ranging from educators to engineers - share in their successes and challenges, honing the community's collective expertise to drive rapid development of this enterprise-ready platform. While Sakai is typically used for teaching and learning (similar to products like Blackboard and Moodle) we call it a Collaboration and Learning Environment (CLE) because it embraces uses beyond the classroom. Sakai is distributed as free and open source software under the Educational Community License. VISUAL UNDERSTANDING ENVIRONMENT The Visual Understanding Environment (VUE) is an Open Source project based at Tufts University. The VUE project is focused on creating flexible tools for managing and integrating digital resources in support of teaching, learning and research. VUE provides a flexible visual environment for structuring, presenting, and sharing digital information. WILLAMETTE INSTRUCTIONAL SUPPORT ENVIRONMENT WISE, the Willamette Instructional Support Environment, is a learning and collaboration system that provides course sites for official university courses and project sites for committee work, student organizations, collaborative research projects and other university-related activities. MULTIMEDIA THEORA Theora is a free and open video compression format from the Xiph.org Foundation. Like all our multimedia technology it can be used to distribute film and video online and on disc without the licensing and royalty fees or vendor lock-in associated with other formats. Theora scales from postage stamp to HD resolution, and is considered particularly competitive at low bitrates. It is in the same class as MPEG-4/DiVX, and like the Vorbis audio codec it has lots of room for improvement as encoder technology develops. Theora is in full public release as of November 3, 2008. UNESCO UNESCO : For Young Creators. A selection of free editing software for use in creative projects. Tools for editing audio, images and web pages.

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awk-use skills-1

dwd0826 2013-4-28 21:53

AWK的功能是什么？与sed和grep很相似，awk是一种样式扫描与处理工具。但其功能却大大强于sed和grep。awk提供了极其强大的功能：它几乎可以完成grep和sed所能完成的全部工作，同时，它还可以可以进行样式装入、流控制、数学运算符、进程控制语句甚至于内置的变量和函数。它具备了一个完整的语言所应具有的几乎所有精美特性。实际上，awk的确拥有自己的语言：awk程序设计语言，awk的三位创建者已将它正式定义为：样式扫描和处理语言。 awk是一个简单的工具，当然这是相对于其强大的功能来说的。的确，UNIX有许多优秀的工具，例如UNIX天然的开发工具C语言及其延续C++就非常的优秀。但相对于它们来说，awk完成同样的功能要方便和简捷得多。这首先是因为awk提供了适应多种需要的解决方案：从解决简单问题的awk命令行到复杂而精巧的awk程序设计语言，这样做的好处是，你可以不必用复杂的方法去解决本来很简单的问题。例如，你可以用一个命令行解决简单的问题，而C不行，即使一个再简单的程序，C语言也必须经过编写、编译的全过程。其次，awk本身是解释执行的，这就使得awk程序不必经过编译的过程，同时，这也使得它与shell script程序能够很好的契合。最后，awk本身较C语言简单，虽然awk吸收了C语言很多优秀的成分，熟悉C语言会对学习awk有很大的帮助，但awk本身不须要会使用C语言――一种功能强大但需要大量时间学习才能掌握其技巧的开发工具。 使用awk的第三个理由是awk是一个容易获得的工具。与C和C++语言不同，awk只有一个文件(/bin/awk)，而且几乎每个版本的UNIX都提供各自版本的awk，你完全不必费心去想如何获得awk。但C语言却不是这样，虽然C语言是UNIX天然的开发工具，但这个开发工具却是单独发行的，换言之，你必须为你的UNIX版本的C语言开发工具单独付费（当然使用D版者除外），获得并安装它，然后你才可以使用它。 基于以上理由，再加上awk强大的功能，我们有理由说，如果你要处理与文本样式扫描相关的工作，awk应该是你的第一选择。在这里有一个可遵循的一般原则：如果你用普通的shell工具或shell script有困难的话，试试awk,如果awk仍不能解决问题，则便用C语言，如果C语言仍然失败，则移至C++。 awk的调用方式 前面曾经说过，awk提供了适应多种需要的不同解决方案，它们是： 一、awk命令行，你可以象使用普通UNIX命令一样使用awk，在命令行中你也可以使用awk程序设计语言，虽然awk支持多行的录入，但是录入长长的命令行并保证其正确无误却是一件令人头疼的事，因此，这种方法一般只用于解决简单的问题。当然，你也可以在shell script程序中引用awk命令行甚至awk程序脚本。 二、使用-f选项调用awk程序。awk允许将一段awk程序写入一个文本文件，然后在awk命令行中用-f选项调用并执行这段程序。具体的方法我们将在后面的awk语法中讲到。 三、利用命令解释器调用awk程序：利用UNIX支持的命令解释器功能，我们可以将一段awk程序写入文本文件，然后在它的第一行加上: #!/bin/awk -f 并赋予这个文本文件以执行的权限。这样做之后，你就可以在命令行中用类似于下面这样的方式调用并执行这段awk程序了。 $awk脚本文本名 待处理文件 awk的语法： 与其它UNIX命令一样，awk拥有自己的语法： awk 参数说明： -F re:允许awk更改其字段分隔符。 parameter: 该参数帮助为不同的变量赋值。 'prog': awk的程序语句段。这个语句段必须用单拓号：'和'括起，以防被shell解释。这个程序语句段的标准形式为： 'pattern {action}' 其中pattern参数可以是egrep正则表达式中的任何一个，它可以使用语法/re/再加上一些样式匹配技巧构成。与sed类似，你也可以使用,分开两样式以选择某个范围。关于匹配的细节，你可以参考附录，如果仍不懂的话，找本UNIX书学学grep和sed（本人是在学习ed时掌握匹配技术的）。action参数总是被大括号包围，它由一系统awk语句组成，各语句之间用;分隔。awk解释它们，并在pattern给定的样式匹配的记录上执行其操作。与shell类似，你也可以使用“#”作为注释符，它使“#”到行尾的内容成为注释，在解释执行时，它们将被忽略。你可以省略pattern和action之一，但不能两者同时省略，当省略pattern时没有样式匹配，表示对所有行（记录）均执行操作，省略action时执行缺省的操作――在标准输出上显示。 -f progfile:允许awk调用并执行progfile指定有程序文件。progfile是一个文本文件，他必须符合awk的语法。 in_file:awk的输入文件，awk允许对多个输入文件进行处理。值得注意的是awk不修改输入文件。如果未指定输入文件，awk将接受标准输入，并将结果显示在标准输出上。awk支持输入输出重定向。 awk的记录、字段与内置变量： 前面说过，awk处理的工作与数据库的处理方式有相同之处，其相同处之一就是awk支持对记录和字段的处理，其中对字段的处理是grep和sed不能实现的，这也是awk优于二者的原因之一。在awk中，缺省的情况下总是将文本文件中的一行视为一个记录，而将一行中的某一部分作为记录中的一个字段。为了操作这些不同的字段，awk借用shell的方法，用$1,$2,$3...这样的方式来顺序地表示行（记录）中的不同字段。特殊地，awk用$0表示整个行（记录）。不同的字段之间是用称作分隔符的字符分隔开的。系统默认的分隔符是空格。awk允许在命令行中用-F re的形式来改变这个分隔符。事实上，awk用一个内置的变量FS来记忆这个分隔符。awk中有好几个这样的内置变量，例如，记录分隔符变量RS、当前工作的记录数NR等等，本文后面的附表列出了全部的内置变量。这些内置的变量可以在awk程序中引用或修改，例如，你可以利用NR变量在模式匹配中指定工作范围，也可以通过修改记录分隔符RS让一个特殊字符而不是换行符作为记录的分隔符。 例:显示文本文件myfile中第七行到第十五行中以字符%分隔的第一字段，第三字段和第七字段： awk -F % 'NR==7,NR==15 {printf $1 $3 $7}' awk的内置函数 awk之所以成为一种优秀的程序设计语言的原因之一是它吸收了某些优秀的程序设计语言（例如C）语言的许多优点。这些优点之一就是内置函数的使用，awk定义并支持了一系列的内置函数，由于这些函数的使用，使得awk提供的功能更为完善和强大，例如，awk使用了一系列的字符串处理内置函数(这些函数看起来与C语言的字符串处理函数相似，其使用方式与C语言中的函数也相差无几)，正是由于这些内置函数的使用，使awk处理字符串的功能更加强大。本文后面的附录中列有一般的awk所提供的内置函数，这些内置函数也许与你的awk版本有些出入，因此，在使用之前，最好参考一下你的系统中的联机帮助。 作为内置函数的一个例子，我们将在这里介绍awk的printf函数，这个函数使得awk与c语言的输出相一致。实际上，awk中有许多引用形式都是从C语言借用过来的。如果你熟悉C语言，你也许会记得其中的printf函数，它提供的强大格式输出功能曾经带我们许多的方便。幸运的是，我们在awk中又和它重逢了。awk中printf几乎与C语言中一模一样，如果你熟悉C语言的话，你完全可以照C语言的模式使用awk中的printf。因此在这里，我们只给出一个例子，如果你不熟悉的话，请随便找一本C语言的入门书翻翻。 例:显示文件myfile中的行号和第3字段： $awk '{printf%03d%s,NR,$1}' myfile 在命令行使用awk 按照顺序，我们应当讲解awk程序设计的内容了，但在讲解之前，我们将用一些例子来对前面的知识进行回顾，这些例子都是在命令行中使用的，由此我们可以知道在命令行中使用awk是多么的方便。这样做的原因一方面是为下面的内容作铺垫，另一方面是介绍一些解决简单问题的方法，我们完全没有必要用复杂的方法来解决简单的问题----既然awk提供了较为简单的方法的话。 例：显示文本文件mydoc匹配（含有）字符串sun的所有行。 $awk '/sun/{print}' mydoc 由于显示整个记录（全行）是awk的缺省动作，因此可以省略action项。 $awk '/sun/' mydoc 例：下面是一个较为复杂的匹配的示例： $awk '/ un/,/ oon/ {print}' myfile 它将显示第一个匹配Sun或sun的行与第一个匹配Moon或moon的行之间的行，并显示到标准输出上。 例：下面的示例显示了内置变量和内置函数length（）的使用： $awk 'length($0)80 {print NR}' myfile 该命令行将显示文本myfile中所有超过80个字符的行号，在这里，用$0表示整个记录（行），同时，内置变量NR不使用标志符'$'。 例：作为一个较为实际的例子，我们假设要对UNIX中的用户进行安全性检查，方法是考察/etc下的passwd文件，检查其中的passwd字段（第二字段）是否为*，如不为*，则表示该用户没有设置密码，显示出这些用户名（第一字段）。我们可以用如下语句实现： #awk -F: '$2== {printf(%s no password!,$1' /etc/passwd 在这个示例中，passwd文件的字段分隔符是“：”，因此，必须用-F：来更改默认的字段分隔符，这个示例中也涉及到了内置函数printf的使用。 awk的变量 如同其它程序设计语言一样，awk允许在程序语言中设置变量，事实上，提供变量的功能是程序设计语言的其本要求，不提供变量的程序设计语言本人还从未见过。 awk提供两种变量，一种是awk内置的变量，这前面我们已经讲过，需要着重指出的是，与后面提到的其它变量不同的是，在awk程序中引用内置变量不需要使用标志符$（回忆一下前面讲过的NR的使用）。awk提供的另一种变量是自定义变量。awk允许用户在awk程序语句中定义并调用自已的变量。当然这种变量不能与内置变量及其它awk保留字相同，在awk中引用自定义变量必须在它前面加上标志符$。与C语言不同的是，awk中不需要对变量进行初始化，awk根据其在awk中第一次出现的形式和上下文确定其具体的数据类型。当变量类型不确定时，awk默认其为字符串类型。这里有一个技巧：如果你要让你的awk程序知道你所使用的变量的明确类型，你应当在在程序中给它赋初值。在后面的实例中，我们将用到这一技巧。 运算与判断： 作为一种程序设计语言所应具有的特点之一，awk支持多种运算，这些运算与C语言提供的几本相同：如+、-、*、/、%等等，同时，awk也支持C语言中类似++、--、+=、-=、=+、=-之类的功能，这给熟悉C语言的使用者编写awk程序带来了极大的方便。作为对运算功能的一种扩展，awk还提供了一系列内置的运算函数（如log、sqr、cos、sin等等）和一些用于对字符串进行操作（运算）的函数（如length、substr等等）。这些函数的引用大大的提高了awk的运算功能。 作为对条件转移指令的一部分，关系判断是每种程序设计语言都具备的功能，awk也不例外。awk中允许进行多种测试，如常用的==（等于）、！=（不等于）、（大于）、（小于）、=（大于等于）、=（小于等于）等等，同时，作为样式匹配，还提供了~（匹配于）和！~（不匹配于）判断。 作为对测试的一种扩充，awk也支持用逻辑运算符:!(非)、（与）、||（或）和括号（）进行多重判断，这大大增强了awk的功能。本文的附录中列出了awk所允许的运算、判断以及操作符的优先级。 awk的流程控制 流程控制语句是任何程序设计语言都不能缺少的部分。任何好的语言都有一些执行流程控制的语句。awk提供的完备的流程控制语句类似于C语言，这给我们编程带来了极大的方便。 1、BEGIN和END: 在awk中两个特别的表达式，BEGIN和END，这两者都可用于pattern中（参考前面的awk语法），提供BEGIN和END的作用是给程序赋予初始状态和在程序结束之后执行一些扫尾的工作。任何在BEGIN之后列出的操作（在{}内）将在awk开始扫描输入之前执行，而END之后列出的操作将在扫描完全部的输入之后执行。因此，通常使用BEGIN来显示变量和预置（初始化）变量，使用END来输出最终结果。 例：累计销售文件xs中的销售金额（假设销售金额在记录的第三字段）： $awk 'BEGIN { FS=:;print 统计销售金额;total=0} {print $3;total=total+$3;} END {printf 销售金额总计：%.2f,total}' sx （注：是shell提供的第二提示符，如要在shell程序awk语句和awk语言中换行，则需在行尾加反斜杠） 在这里，BEGIN预置了内部变量FS（字段分隔符）和自定义变量total,同时在扫描之前显示出输出行头。而END则在扫描完成后打印出总合计。 2、流程控制语句 awk提供了完备的流程控制语句，其用法与C语言类似。下面我们一一加以说明： 2.1、if...else语句: 格式： if(表达式) 语句1 else 语句2 格式中语句1可以是多个语句，如果你为了方便awk判断也方便你自已阅读，你最好将多个语句用{}括起来。awk分枝结构允许嵌套，其格式为： if(表达式1） {if(表达式2） 语句1 else 语句2 } 语句3 else {if(表达式3) 语句4 else 语句5 } 语句6 当然实际操作过程中你可能不会用到如此复杂的分枝结构，这里只是为了给出其样式罢了。 2.2、while语句 格式为: while(表达式) 语句 2.3、do-while语句 格式为: do { 语句 }while(条件判断语句） 2.4、for语句 格式为： for(初始表达式;终止条件;步长表达式) {语句} 在awk的 while、do-while和for语句中允许使用break,continue语句来控制流程走向，也允许使用exit这样的语句来退出。break中断当前正在执行的循环并跳到循环外执行下一条语句。continue从当前位置跳到循环开始处执行。对于exit的执行有两种情况：当exit语句不在END中时，任何操作中的exit命令表现得如同到了文件尾，所有模式或操作执行将停止，END模式中的操作被执行。而出现在END中的exit将导致程序终止。 例：为了 awk中的自定义函数 定义和调用用户自己的函数是几乎每个高级语言都具有的功能，awk也不例外，但原始的awk并不提供函数功能，只有在nawk或较新的awk版本中才可以增加函数。 函数的使用包含两部分：函数的定义与函数调用。其中函数定义又包括要执行的代码（函数本身）和从主程序代码传递到该函数的临时调用。 awk函数的定义方法如下： function 函数名(参数表){ 函数体 } 在gawk中允许将function省略为func，但其它版本的awk不允许。函数名必须是一个合法的标志符，参数表中可以不提供参数（但在调用函数时函数名后的一对括号仍然是不可缺少的），也可以提供一个或多个参数。与C语言相似，awk的参数也是通过值来传递的。 在awk中调用函数比较简单，其方法与C语言相似，但awk比C语言更为灵活，它不执行参数有效性检查。换句话说，在你调用函数时，可以列出比函数预计（函数定义中规定）的多或少的参数，多余的参数会被awk所忽略，而不足的参数，awk将它们置为缺省值0或空字符串，具体置为何值，将取决于参数的使用方式。 awk函数有两种返回方式：隐式返回和显式返回。当awk执行到函数的结尾时，它自动地返回到调用程序，这是函数是隐式返回的。如果需要在结束之前退出函数，可以明确地使用返回语句提前退出。方法是在函数中使用形如：return 返回值 格式的语句。 例：下面的例子演示了函数的使用。在这个示例中，定义了一个名为print_header的函数，该函数调用了两个参数FileName和PageNum，FileName参数传给函数当前使用的文件名，PageNum参数是当前页的页号。这个函数的功能是打印（显示）出当前文件的文件名，和当前页的页号。完成这个功能后，这个函数将返回下一页的页号。 nawk 'BEGIN{pageno=1;file=FILENAME pageno=print_header(file，pageno)；#调用函数print_header printf(当前页页号是：%d,pageno); } #定义函数print_header function print_header(FileName,PageNum){ printf(%s %d,FileName,PageNum); PageNum++;return PageNUm; } }' myfile 执行这个程序将显示如下内容： myfile 1 当前页页号是：2 awk高级输入输出 1.读取下一条记录： awk的next语句导致awk读取下一个记录并完成模式匹配，然后立即执行相应的操作。通常它用匹配的模式执行操作中的代码。next导致这个记录的任何额外匹配模式被忽略。 2.简单地读取一条记录 awk的 getline语句用于简单地读取一条记录。如果用户有一个数据记录类似两个物理记录，那么getline将尤其有用。它完成一般字段的分离(设置字段变量$0 FNR NF NR)。如果成功则返回1，失败则返回0（到达文件尾）。如果需简单地读取一个文件，则可以编写以下代码： 例：示例getline的使用 {while(getline==1) { #process the inputted fields } } 也可以使getline保存输入数据在一个字段中，而不是通过使用getline variable的形式处理一般字段。当使用这种方式时，NF被置成0，FNR和NR被增值。 用户也可以使用getlinefilename方式从一个给定的文件中输入数据，而不是从命令行所列内容输入数据。此时，getline将完成一般字段分离（设置字段变量$0和NF)。如果文件不存在，返回-1,成功，返回1,返回0表示失败。用户可以从给定文件中读取数据到一个变量中，也可以用stdin(标准输入设备）或一个包含这个文件名的变量代替filename。值得注意的是当使用这种方式时不修改FNR和NR。 另一种使用getline语句的方法是从UNIX命令接受输入，例如下面的例子: 例：示例从UNIX命令接受输入 {while(who -u|getline) { #process each line from the who command } } 当然，也可以使用如下形式: command | getline variable 3.关闭文件: awk中允许在程序中关闭一个输入或输出文件，方法是使用awk的close语句。 close(filename) filename可以是getline打开的文件（也可以是stdin,包含文件名的变量或者getline使用的确切命令）。或一个输出文件（可以是stdout，包含文件名的变量或使用管道的确切命令）。 4.输出到一个文件: awk中允许用如下方式将结果输出到一个文件： printf(hello word!)datafile 或 printf(hello word!)datafile 5.输出到一个命令 awk中允许用如下方式将结果输出到一个命令： printf(hello word!)|sort-t',' awk与shell script混合编程 因为awk可以作为一个shell命令使用，因此awk能与shell批处理程序很好的融合在一起，这给实现awk与shell程序的混合编程提供了可能。实现混合编程的关键是awk与shell script之间的对话，换言之，就是awk与shell script之间的信息交流:awk从shell script中获取所需的信息（通常是变量的值）、在awk中执行shell命令行、shell script将命令执行的结果送给awk处理以及shell script读取awk的执行结果等等。 1.awk读取Shell script程序变量 在awk中我们可以通过“'$变量名'”的方式读取sell scrpit程序中的变量。 例：在下面的示例中，我们将读取sell scrpit程序中的变量Name，该变量存放的是文本myfile的撰写者，awk将打印出这个人名。 $cat writename : # @(#) # . . . Name=张三 nawk 'BEGIN {name='Name'; printf(%s撰写者%s,FILENAME,name);} {...}END{...}' myfile . . . 2.将shell命令的执行结果送给awk处理 作为信息传送的一种方法，我们可以将一条shell命令的结果通过管道线（|）传递给awk处理： 例：示例awk处理shell命令的执行结果 $who -u | awk '{printf(%s正在执行%s,$2,$1)}' 该命令将打印出注册终端正在执行的程序名。 3.shell script程序读awk的执行结果 为了实现shell script程序读取awk执行的结果，我们可以采取一些特殊的方法，例如我们可以用变量名=`awk语句`的形式将awk执行的结果存放入一个shell script变量。当然也可以用管道线的方法将awk执行结果传递给shell script程序处理。 例：作为传送消息的机制之一，UNIX提供了一个向其所有用户传送消息的命令wall（意思是write to all写给所有用户），该命令允许向所有工作中的用户（终端）发送消息。为此，我们可以通过一段shell批处理程序wall.shell来模拟这一程序（事实上比较老的版本中wall就是一段shell批处理程序： $cat wall.shell : # @(#) wall.shell:发送消息给每个已注册终端 # cat /tmp/$$ #用户录入消息文本 who -u | awk '{print $2}' | while read tty do cat /tmp/$$$tty done 在这个程序里，awk接受who -u命令的执行结果，该命令打印出所有已注册终端的信息，其中第二个字段是已注册终端的设备名，因此用awk命令析出该设备名，然后用while read tty语句循环读出这些文件名到变量（shell script变量）tty中，作为信息传送的终结地址。 4.在awk中执行shell命令行----嵌入函数system() system()是一个不适合字符或数字类型的嵌入函数，该函数的功能是处理作为参数传递给它的字符串。system对这个参数的处理就是将其作为命令处理，也就是说将其当作命令行一样加以执行。这使得用户在自己的awk程序需要时可以灵活地执行命令或脚本。 例：下面的程序将使用system嵌入函数打印用户编制好的报表文件，这个文件存放在名为myreport.txt的文件中。为简约起见，我们只列出了其END部分： . . . END {close(myreport.txt);system(lp myreport.txt);} 在这个示例中，我们首先使用close语句关闭了文件myreport.txt文件，然后使用system嵌入函数将myreport.txt送入打印机打印。 写到这里，我不得不跟朋友们说再见了，实在地说，这些内容仍然是awk的初步知识，电脑永远是前进的科学，awk也不例外，本篇所能做的只是在你前行的漫漫长途中铺平一段小小开端，剩下的路还得靠你自己去走。老实说，如果本文真能给你前行的路上带来些许的方便，那本人就知足了！ 如对本篇有任何疑问，请E-mail To:Chizlong@yeah.net或到主页http://chizling.yeah.net中留言。 附录： 1.awk的常规表达式元字符 换码序列 ^ 在字符串的开头开始匹配 $ 在字符串的结尾开始匹配 . 与任何单个字符串匹配 与 与A-C及a-c范围内的字符匹配（按字母表顺序） 与除 关联。与A、B、C中的任一字符匹配，且其后要跟D、E、F中的任一个字符。 * 与A、B或C中任一个出现0次或多次的字符相匹配 + 与A、B或C中任何一个出现1次或多次的字符相匹配 ？ 与一个空串或A、B或C在任何一个字符相匹配 （Blue|Black）berry 合并常规表达式，与Blueberry或Blackberry相匹配 2.awk算术运算符 运算符 用途 ------------------ x^y x的y次幂 x**y 同上 x%y 计算x/y的余数（求模） x+y x加y x-y x减y x*y x乘y x/y x除y -y 负y(y的开关符号);也称一目减 ++y y加1后使用y(前置加） y++ 使用y值后加1（后缀加） --y y减1后使用y(前置减） y-- 使用后y减1(后缀减） x=y 将y的值赋给x x+=y 将x+y的值赋给x x-=y 将x-y的值赋给x x*=y 将x*y的值赋给x x/=y 将x/y的值赋给x x%=y 将x%y的值赋给x x^=y 将x^y的值赋给x x**=y 将x**y的值赋给x 3.awk允许的测试： 操作符 含义 x==y x等于y x!=y x不等于y xy x大于y x=y x大于或等于y xy x小于y x=y x小于或等于y? x~re x匹配正则表达式re? x!~re x不匹配正则表达式re? 4.awk的操作符(按优先级升序排列) = 、+=、 -=、 *= 、/= 、 %= || = = == != ~ !~ xy (字符串连结，'x'y'变成xy） + - * / % ++ -- 5.awk内置变量（预定义变量） 说明：表中v项表示第一个支持变量的工具（下同）：A=awk，N=nawk,P=POSIX awk,G=gawk V 变量 含义 缺省值 -------------------------------------------------------- N ARGC 命令行参数个数 G ARGIND 当前被处理文件的ARGV标志符 N ARGV 命令行参数数组 G CONVFMT 数字转换格式 %.6g P ENVIRON UNIX环境变量 N ERRNO UNIX系统错误消息 G FIELDWIDTHS 输入字段宽度的空白分隔字符串 A FILENAME 当前输入文件的名字 P FNR 当前记录数 A FS 输入字段分隔符 空格 G IGNORECASE 控制大小写敏感0（大小写敏感） A NF 当前记录中的字段个数 A NR 已经读出的记录数 A OFMT 数字的输出格式 %.6g A OFS 输出字段分隔符 空格 A ORS 输出的记录分隔符 新行 A RS 输入的记录他隔符 新行 N RSTART 被匹配函数匹配的字符串首 N RLENGTH 被匹配函数匹配的字符串长度 N SUBSEP 下标分隔符 34 6.awk的内置函数 V 函数 用途或返回值 ------------------------------------------------ N gsub(reg,string,target) 每次常规表达式reg匹配时替换target中的string N index(search,string) 返回string中search串的位置 A length(string) 求串string中的字符个数 N match(string,reg) 返回常规表达式reg匹配的string中的位置 N printf(format,variable) 格式化输出，按format提供的格式输出变量variable。 N split(string,store,delim) 根据分界符delim,分解string为store的数组元素 N sprintf(format,variable) 返回一个包含基于format的格式化数据，variables是要放到串中的数据 G strftime(format,timestamp) 返回一个基于format的日期或者时间串，timestmp是systime()函数返回的时间 N sub(reg,string,target) 第一次当常规表达式reg匹配，替换target串中的字符串 A substr(string,position,len) 返回一个以position开始len个字符的子串 P totower(string) 返回string中对应的小写字符 P toupper(string) 返回string中对应的大写字符 A atan(x,y) x的余切(弧度) N cos(x) x的余弦(弧度) A exp(x) e的x幂 A int(x) x的整数部分 A log(x) x的自然对数值 N rand() 0-1之间的随机数 N sin(x) x的正弦(弧度) A sqrt(x) x的平方根 A srand(x) 初始化随机数发生器。如果忽略x，则使用system() G system() 返回自1970年1月1日以来经过的时间（按秒计算）

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[转载]一网打尽13款开源Java大数据工具，从理论到实践的剖析

evonchang 2013-4-28 20:29

大数据几乎已成为所有商业领域共有的最新趋势，然而大数据究竟是什么？是噱头、泡沫，又或是真如传言一样的重要。 事实上，大数据是个非常简单的术语——就像它所说的一样，是非常大的数据集。那么究竟有大多？真实的答案就是“如你所想的那么大”！ 那么为什么会产生如此之大的数据集？因为当今的数据已经无所不在并且存在着巨大的回报：收集通信数据的RFID传感器，收集天气信息的传感器，移动设备给社交网站发送的GPRS数据包，图片视频，在线购物产生的交易记录，应有尽有！大数据是一个巨大的数据集，包含了任何数据源产生的信息，当然前提是这些信息是我们感兴趣的。 然而大数据的含义绝不只与体积相关，因为大数据还可以用于寻找新的真知、形成新的数据和内容；我们可以使用从大数据中提取的真知、数据和内容去使商业更加灵活，以及回答那些之前被认为远超当前范畴的问题。这也是大数据被从以下4个方面定义的原因： Volume（体积）、Variety（多样）、Velocity（效率）以及Veracity（Value，价值） ，也就是大数据的4V。下面将简述每个特性以及所面临的挑战： 1.Volume Volume说的是一个业务必须捕获、存储及访问的数据量，仅仅在过去两年内就生产了世界上所有数据的90%。现今的机构已完全被数据的体积所淹没，轻易的就会产生TB甚至是PB级不同类型的数据，并且其中有些数据需要被组织、防护（窃取）以及分析。 2.Variety 世界上产生的数据有80%都是半结构化的，传感器、智能设备和社交媒体都是通过Web页面、网络日志文件、社交媒体论坛、音频、视频、点击流、电子邮件、文档、传感系统等生成这些数据。传统的分析方案往往只适合结构化数据，举个例子：存储在关系型数据库中的数据就有完整的结构模型。数据类型的多样化同样意味着为支持当下的决策制定及真知处理，我们需要在数据储存和分析上面进行根本的改变。Variety代表了在传统关系数据库中无法轻易捕获和管理的数据类型，使用大数据技术却可以轻松的储存和分析。 3.Velocity Velocity则需要对数据进行近实时的分析，亦称“sometimes 2 minutes is too late!”。获取竞争优势意味着你需要在几分钟，甚至是几秒内识别一个新的趋势或机遇，同样还需要尽可能的快于你竞争对手。另外一个例子是时间敏感性数据的处理，比如说捕捉罪犯，在这里数据必须被收集后就完成被分析，这样才能获取最大价值。对时间敏感的数据保质期往往都很短，这就需求组织或机构使用近实时的方式对其分析。 4.Veracity 通过分析数据我们得出如何的抓住机遇及收获价值，数据的重要性就在于对决策的支持；当你着眼于一个可能会对你企业产生重要影响的决策，你希望获得尽可能多的信息与用例相关。单单数据的体积并不能决定其是否对决策产生帮助，数据的真实性和质量才是获得真知和思路最重要的因素，因此这才是制定成功决策最坚实的基础。 然而当下现有的商业智能和数据仓库技术并不完全支持4V理论，大数据解决方案的开发正是针对这些挑战。 下面将介绍大数据领域支持Java的主流开源工具 ： 1.HDFS HDFS是Hadoop应用程序中主要的分布式储存系统， HDFS集群包含了一个NameNode（主节点），这个节点负责管理所有文件系统的元数据及存储了真实数据的DataNode（数据节点，可以有很多）。HDFS针对海量数据所设计，所以相比传统文件系统在大批量小文件上的优化，HDFS优化的则是对小批量大型文件的访问和存储。 2.MapReduce Hadoop MapReduce是一个软件框架，用以轻松编写处理海量（TB级）数据的并行应用程序，以可靠和容错的方式连接 大型集群中 上万个节点（商用硬件）。 3.HBase Apache HBase是Hadoop数据库，一个分布式、可扩展的大数据存储。它提供了大数据集上随机和实时的读/写访问，并针对了商用服务器集群上的大型表格做出优化——上百亿行，上千万列。其核心是Google Bigtable论文的开源实现，分布式列式存储。就像Bigtable利用GFS（Google File System）提供的分布式数据存储一样，它是Apache Hadoop在HDFS基础上提供的一个类Bigatable。 4.Cassandra Apache Cassandra是一个高性能、可线性扩展、高有效性数据库，可以运行在商用硬件或云基础设施上打造完美的任务关键性数据平台。在横跨数据中心的复制中，Cassandra同类最佳，为用户提供更低的延时以及更可靠的灾难备份。通过log-structured update、反规范化和物化视图的强支持以及强大的内置缓存，Cassandra的数据模型提供了方便的二级索引（column indexe）。 5.Hive Apache Hive是Hadoop的一个数据仓库系统，促进了数据的综述（将结构化的数据文件映射为一张数据库表）、即席查询以及存储在Hadoop兼容系统中的大型数据集分析。Hive提供完整的SQL查询功能——HiveQL语言，同时当使用这个语言表达一个 逻辑 变得低效和繁琐 时，HiveQL还允许传统的Map/Reduce程序员使用自己定制的Mapper和Reducer。 6.Pig Apache Pig是一个用于大型数据集分析的平台，它包含了一个用于数据分析应用的高级语言以及评估这些应用的基础设施。Pig应用的闪光特性在于它们的结构经得起大量的并行，也就是说让它们支撑起非常大的数据集。Pig的基础设施层包含了产生Map-Reduce任务的编译器。Pig的语言层当前包含了一个原生语言——Pig Latin，开发的初衷是易于编程和保证可扩展性。 7.Chukwa Apache Chukwa是个开源的数据收集系统，用以监视大型分布系统。建立于HDFS和Map/Reduce框架之上，继承了Hadoop的可扩展性和稳定性。Chukwa同样包含了一个灵活和强大的工具包，用以显示、监视和分析结果，以保证数据的使用达到最佳效果。 8.Ambari Apache Ambari是一个基于web的工具，用于配置、管理和监视Apache Hadoop集群，支持Hadoop HDFS,、Hadoop MapReduce、Hive、HCatalog,、HBase、ZooKeeper、Oozie、Pig和Sqoop。Ambari同样还提供了集群状况仪表盘，比如heatmaps和查看MapReduce、Pig、Hive应用程序的能力，以友好的用户界面对它们的性能特性进行诊断。 9.ZooKeeper Apache ZooKeeper是一个针对大型分布式系统的可靠协调系统，提供的功能包括：配置维护、命名服务、分布式同步、组服务等。ZooKeeper的目标就是封装好复杂易出错的关键服务，将简单易用的接口和性能高效、功能稳定的系统提供给用户。 10.Sqoop Sqoop是一个用来将Hadoop和关系型数据库中的数据相互转移的工具，可以将一个关系型数据库中数据导入Hadoop的HDFS中，也可以将HDFS中数据导入关系型数据库中。 11.Oozie Apache Oozie是一个可扩展、可靠及可扩充的工作流调度系统，用以管理Hadoop作业。Oozie Workflow作业是活动的Directed Acyclical Graphs（DAGs）。Oozie Coordinator作业是由周期性的Oozie Workflow作业触发，周期一般决定于时间（频率）和数据可用性。Oozie与余下的Hadoop堆栈结合使用，开箱即用的支持多种类型Hadoop作业（比如：Java map-reduce、Streaming map-reduce、Pig、 Hive、Sqoop和Distcp）以及其它系统作业（比如Java程序和Shell脚本）。 12.Mahout Apache Mahout是个可扩展的机器学习和数据挖掘库，当前Mahout支持主要的4个用例： 推荐挖掘：搜集用户动作并以此给用户推荐可能喜欢的事物。 聚集：收集文件并进行相关文件分组。 分类：从现有的分类文档中学习，寻找文档中的相似特征，并为无标签的文档进行正确的归类。 频繁项集挖掘：将一组项分组，并识别哪些个别项会经常一起出现。 13.HCatalog Apache HCatalog是Hadoop建立数据的映射表和存储管理服务，它包括： 提供一个共享模式和数据类型机制。 提供一个抽象表，这样用户就不需要关注数据存储的方式和地址。 为类似Pig、MapReduce及Hive这些数据处理工具提供互操作性。 原文链接： What is Big Data – Theory to Implementation （编译/仲浩 审校/包研）

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[转载]在Word2007中把公式编辑器加入快速访问工具条

热度 1 ronaldpan 2013-4-25 22:21

Creating a Quick Access Toolbar button in Word 2007 to open Equation Editor 公式编辑器的使用 Build Equations with Microsoft Equation Editor

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工具

metanb 2013-4-20 00:16

科研和教学不应该沦为晋升的工具。

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[转载]ZZ微软新工具让你的 Excel “活起来”

热度 1 wmornlight 2013-4-13 10:05

Excel 和 3D 能扯上什么关系呢？ 据 TNW 消息 ，微软今天发布了一款叫做 GeoFlow 的插件，它是结合 Excel 和 Bing 地图所开发出来的 3D 数据可视化工具。这个工具可以以加载项的形式运行，目前支持 Excel 2013 或 Office 365 ProPlus。 GeoFlow 的概念最早于 2011 年 6 月被提出，微软也曾在 2012 年 11 月的 SharePoint 大会上推出过 GeoFlow。GeoFlow 可以帮助用户创建和浏览时间敏感型数据并与之交互，而这些数据也可以应用到数字地图上。同时，用户也可以使用 GeoFlow 将数据转换为 3D 图像的形式与他人分享。 按照微软的说法，我们可以把 GeoFlow 理解为 WorldWide Telescope 项目的更新版。它可以帮助信息工作者通过详细的 3D 数据图来搜寻和分享全新的数据视角。 据介绍，GeoFlow 目前支持的数据行规模最高可达 100 万行，并可以直接通过 Bing 地图引擎生成可视化 3D 地图。数据可以通过三维垂直或二维贴片的方式呈现，并且同时支持 Execl Data Model 和 PowerPivot 两种模型，还可实现对 Bing Maps 的区域可视化。目前，GeoFlow 支持包括立柱型、二维斑块以及“气泡图”在内的多种可视化类型。 来自微软研究院的 Curtis Wong 指出，他们是在构建一个巨大的“虚拟望远镜”，若想达到这个目的则先要构建一个“可视化宇宙”的引擎。他还表示 GeoFlow 将为全球公司带来动态、交互式的数据可视化功能。 微软在 Excel 的官方博客中解释了 GeoFlow 的工作方式。以德州达拉斯居民家庭能源使用数据为例，GeoFlow 先将这些用户的位置在地图上标记出来，而 Excel 则会将这些家庭的房屋面积和市价用三维图像显示出来。 随着时间的变化，这个“地图”也会实时改变。用户若想将数据分享给他人，只需在 GeoFlow 中截取“画面”，然后创建一个“场景导游”最后导出就可以了。 目前 GeoFlow 只支持 Office Professional Plus 2013 和 Office 365 ProPlus。

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[转载]22款免费的数据分析工具推荐

evonchang 2013-4-12 16:20

2011年4月20日的电脑世界沙龙上，介绍了22款免费的数据分析相关工具，他们有关于数据清洗的、有关于数据展现的还有关于数据分析的;他们或是来自IBM，谷歌。雅虎这样的互联网企业，或是出自麻省理工，斯坦福这样的高校，有在线的也有离线的。如果你正为一些地理分析图片而赶到焦虑，或是为做不出漂亮的社交网络关系图而烦恼，或许下面这些工具可以帮到你。 数据清理类工具 DataWrangler Google Refine 统计分析类工具 The R Project for Statistical Computing TimeFlow 数据展现类工具 Google Fusion Tables Impure Tableau Public Many Eyes VIDI Zoho Reports 代码帮助类工具 Choosel Exhibit 地图相关数据展示工具 Quantum GIS (QGIS) OpenHeatMap OpenLayers 文本类相关处理工具 IBM Word-Cloud Generator 社交网络类工具 Gephi NodeXL

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天文时序分析的好工具-Period04

deliangwang 2013-4-3 07:36

PERIOD04是专用于天文时间序列的统计分析的软件。该工具可以提取单个频率到多个频率，并提供一个灵活的接口进行多频拟合。 软件网址： http://www.univie.ac.at/tops/Period04/

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[转载]OVF 工具

icttanghongwei 2013-3-30 08:21

使用OVFToolkit构建虚拟工具： http://www.ibm.com/developerworks/cn/linux/l-ovf-toolkit/

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VC资源，工具条

baibing 2013-3-29 10:01

1、直接导入外部图片作为工具栏 这个好像在vc6中做不到。 一种方法是采用VisualToolbar+TrueColorToolBar类。 这个方法可以使用外部的位图，但是还是要在资源编辑器中做好相应的工具条，其本质是对这个工具条用弄好的位图换肤。 2.如何使用其他VC项目中的资源 其他vc源代码中已经有了各种工具条等资源，如何直接拷贝过来用呢？ 如果我们在IDE的资源界面下，好像怎么导入工具条都不行，最后导入的都是位图，而不是工具条。 怎么办呢？ 使用图形界面确实有局限性，并考虑到资源编辑器本质是对资源描述文件（resource.h,.rc文件）的描述， 使用这两个文件来描述资源是最好的，最自由的，因此，只要将其他程序中这两个文件相应内容拷贝过来，在资源编辑器界面上就会显示相应的工具条位图了，其他资源的复制也是一样。总之，在界面下很难弄。 这也是陈建春书中强调直接写资源文件的理由。

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[转载]一步步制作真彩工具条

baibing 2013-3-28 09:58

一步步制作真彩工具条 http://www.vckbase.com/index.php/wv/803

个人分类: 编程|0 个评论

[转载]LaTeX 实时预览编辑工具Gummi

热度 1 dajinzi 2013-3-23 13:52

Gummi 是一个利用 Python 和 GTK 技术开发的简易 LaTeX 编辑工具，具备实时预览、语法高亮、BibTex 支持、导出到 PDF 、纠错/拼写检查、预设模版等功能。 Ubuntu 用户可以通过这个 PPA 来安装： sudo apt-add-repository ppa:gummi/gummi sudo apt-get update sudo apt-get install gummi 项目主页: http://gummi.midnightcoding.org/

个人分类: latex|4632 次阅读|1 个评论

[转载]10款最好的信息图创建工具

热度 1 helloating1990 2013-3-21 09:11

你是否常常看到别人创建的专业信息图而眼红呢？来看看这十个工具吧，你也一样可以创建牛逼的图表哦！ 1. Visual.Ly 这是一个非常好用的应用，你可以用它来快速创建自定义的信息图。你不需要任何设计相关的知识。 2. StatSilk 这个工具有 web 和桌面两个版本，可以让你简易的分析数据。它可以让你创建非常好看的地图，表格，图形以及各种视觉元素来展示数据。通过 StatPlanet 的 Flash 模板你可以创建 Flash 地图！ 3. Infogr.Am 这个工具可以让你快速的创建静态的或者交互的信息图。你只需要导入数据，然后就可以通过这个工具的各种功能来创建绚丽的图表。 4. Vizualize.Me 这是一个用来创建超炫个人简历的工具。这样的简历一定有助于你获得一份好工作啊！ 5. Gliffy 这个工具可以用来创建高质量的流程图，平面设计图和技术图表等等。它可以支持拖拽操作。 6. ICharts 这是一个通用型的图标创建工具。 7. Dipity 这是一个用时间轴来展示各种信息图的网站。你可以在这里找到你所需要的信息图。 8. Easel.Ly 这是一个通过拖拽操作创建信息图的工具。它有各种预置的模板。 9. ChartsBin 这是一个用来创建互动地图的工具。 10. Photo Stats 这是一个 iPhone APP。这个应用分析你手机中拍摄的所有图片。在分析过后它会生成一个漂亮的图表，展示你在哪里在什么时候拍摄的图片。你可以知道你拍照的习惯，并分享给你的家人和朋友。 原文链接 ， OSChina.NET 编译

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[转载]卒中后失语患者的认知功能评估工具

zhongruiy 2013-3-20 21:30

血管性认知损害（vascularcognitiveimpairment ，VCI ）是指由血管因素导致的认知功能损害，卒中是其最主要的原因。卒中发病后6 个月内有44%-74% 的患者合并不同程度的认知损害，其中约半数在5 年内发展为痴呆。认知功能评定包括总体认知、记忆、语言、执行和视空间结构能力，其中语言是人类特有的复杂认知心理活动，与其他认知功能之间存在密切的相互关系。研究显示，约21%-38% 的卒中存活者存在失语。目前用于认知损害和痴呆筛查的量表，如简易智能状态检查量表（Mini-MentalStateExamination ，MMSE ）、蒙特利尔认知评估量表（MontrealCognitiveAssessment ，MoCA ）、 阿尔茨海默病 评定量表认知分表（ Alzheimer'sDiseaseAssessmentScale-cognitivesubscale ，ADAS-cog ）、Mattis 痴呆评估量表（MattisDementiaRatingScale ，DRS ）等在认知功能评估中具有很强的语言依赖性，难以用于失语患者。不过，一些学者研制的认知功能筛查量表包含了非语言项目，以尽可能降低对语言的依赖性，有助于识别卒中后失语等语言交流障碍患者的认知损害。这些非语言依赖性认知功能筛查量表有些主要针对某些特殊人群（如儿童、聋哑人、受教育程度较低者），有些针对脑损伤后患者，有些则专门用于失语患者。现就这些认知功能筛查量表做一简要综述。 1 主要针对某些特殊人群的认知功能量表 1.1 Kohs 立方体组合测验 1920 年，Kohs 设计出Kohs 立方体组合测验（TheKohsBlock-designTest ），旨在对一般智能进行评定。由于它是一种操作性智能测验，几乎不用借助语言即可进行，因此适用于聋哑人以及严重听力障碍者。Kohs 立方体组合测验包括16 个立方体，每个立方体涂有红、白、蓝、黄以及红白、蓝黄各半的6 种颜色，共18 个模式图版，包括1 个练习图版和17 个测试图版。在测验前先由测验者摆成练习图版，然后让受试者自行摆成练习图版的图形，正确后开始测验，要求受试者仿照图版按次序摆成相应的图形。超过时间或失败时中断并进行下一项，连续2 次失败或超时则中止测验。 国外的研究资料表明，Kohs 立方体组合测验可广泛应用于儿童、成年人、老年人以及脑功能障碍者的智能测查，且该测验与韦氏成人智力测查呈良好的正相关。国内王荫华等对50 名无器质性脑疾病的中老年人以及16 例急性卒中患者进行的Kohs 立方体组合测验显示，该测验与长谷川痴呆量表（Hasegawa'sDementiaScale ，HDS ）和MMSE 具有显著相关性，相关系数分别为0.66 和0.71 ，表明其的确为一种有效的智能测查工具。 Kohs 立方体组合测验具有简便、省时、无需语言介入、可计算智商等优点，尤其适用于文化水平不高的老年人、有语言理解障碍的失语患者以及聋哑人，值得推广应用。该测验的不足之处包括：（1 ）仅可作为轻度痴呆的筛查工具，鉴别中、重度痴呆的严重程度的价值相对较差；（2 ）得分与受教育水平呈正相关，但未进行不同文化水平的标准化以及制定相应的正常值；（3 ）与患者的视空间功能关系密切，顶叶受损患者的得分可能较低，缺少对其他认知功能的评估。 1.2 瑞文标准推理测验及瑞文测验联合型中国修订版 1938 年，英国心理学家Raven 开发出一种非文字几何图形推理测验，即瑞文标准推理测验（Raven'sProgressiveMatrices ，RPM ）。1987 年，王栋等对其进行了修订，命名为联合型瑞文测验中国农村版（CRT-RC ）和城市版（CRT-CC ），并分别编制出全国常模。该量表由瑞文测验的标准型与彩色型组成，即由彩色型的A 、AB 、B3 个单元和标准型的C 、D 、E3 个单元合成6 个单元72 道题的测验。每个单元有12 组彩色图案，每个图案均缺失一部分，缺失部分与其他类似图案混合在一起。测验时要求从这些混合的图案中选出缺失的部分，测评时间不超过40min 。每正确完成一个记1 分，否则记为0 分。 联合型瑞文测验为非文字测验，配有彩色图案，适用范围广泛，5-75 岁人群均适用。目前，该量表已被多个国家修订和广泛应用，我国多个省市也制定了相应的常模。其优点是操作简单、使用方便，且较少受文化、种族和语言的限制。但是，目前该量表并未在失语症患者中广泛应用，且应用于视空间明显障碍患者时不能反映其真实水平，因此其心理测量学评价有待进一步研究。 2 针对脑损伤患者的认知功能量表 2.1 卒中患者智能状态检查量表 1989 年，加拿大学者Hajek 等编制了卒中患者智能状态检查量表（StrokeUnitMentalStatusExamination ，SUMSE ）。该量表由29 个问题和13 个分测验组成，可分别对定向力、视觉瞬时记忆、听觉瞬时记忆、临摹、注意力、近期记忆、远期记忆、推理判断能力、一般知识以及语言功能进行评估，专门用于检查卒中患者的认知功能。检查需耗时约20min ，操作简单，可在床边应用。张瑛和陈 俊宁 在国内应用 SUMSE 对66 例急性卒中患者的认知功能进行了评估，结果表明SUMSE 重测一致性较好，与MMSE 和长谷川痴呆修正量表（RevisedHasegawa'sDementiaScale ，HDS-R ）的相关系数分别为0.808 和0.809 ，其信度和效度均较高，能进行主要认知域的评估，是一种较好的卒中患者认知功能评定量表，可用于卒中后认知功能评定。 SUMSE 的优点是抛弃了语言和运动方面的检查，侧重点放在认知方面，尽可能避免了语言技巧和运动功能对测试结果的影响。因此，它对合并语言功能受损患者认知损害的识别具有重要意义，可应用于卒中后失语患者的认知评估。不过，目前该量表在国内尚缺乏大规模的临床验证。 2.2 洛文斯顿认知评定量表 1989 年，以色列耶路撒冷洛文斯顿康复医院的Katz 等积累多年的临床实践经验，制定了洛文斯顿认知评定量表（LoewensteinOccupationalTherapyCognitiveAssessment ，LOTCA ）。其评定内容分为4 大类（定向力、知觉、视运动组织以及思维运作检查）共20 项分测验。除思维运作中的3 项检查为5 分制外，均采用4 分制评分。全套检查需耗时约30min 。该量表问世后很快在土耳其和美国等多个国家推广应用。1998 年中国康复研究中心将其引入国内。该量表适用于各种脑损伤患者的认知功能评定，可了解患者定向力、空间失认、单侧忽略、视空间组织推理能力、颜色失认、思维运作、注意力等多个认知域的损害程度。 Katz 等将LOTCA 应用于脑血管意外患者的认知状况研究时，各类受试者重复测试的相关系数为0.82-0.97 ，定向力、知觉、视运动组织和思维运作等各分测验的内部一致性检验信度系数为0.85 ，且与正常人检测结果存在显著差异，表明成套测验LOTCA 的敏感性较高，可用于筛查 脑血管病 患者的认知损害。我国学者先后开发了洛文斯顿认知评定量表（简体中文版）和改良洛文斯顿作业疗法认知评定量表（ ModifiedLoewensteinOccupationalTherapyCognitiveAssessment ，MLOTCA ），其信度和效度均良好。 LOTCA 是一种很有价值的认知损害评定量表。其优点是效度良好，检查内容较全面，特别是备有较多的参考图片以便在检查中替代指导语，尽可能地减少了语言理解障碍对检查结果的干扰或影响，使检查结果更为客观可靠。但是，该量表中的定向力检查部分缺乏相应的参考图片，使其指导语理解成为障碍，因此仅适合用于理解力损害较轻的运动性失语患者。另外，该量表在临床实际应用中是采用计算机软件编程的连贯性操作，不能有针对性地跳跃式进行；加之操作时间相对较长，且需要患者积极配合，使其在语言功能损害较重的失语患者中的应用受到一定的限制。 2.3 画钟试验 画钟试验（clockdrawingtest ，CDT ）是一种主要针对执行功能检查的单项测验，评价注意力集中和结构性失用，具有简便、易操作和重点突出等优点，完成时间为10-11min 。目前已广泛用于认知功能评价，可检测受试者的理解能力、计划性、视觉记忆、图形重建能力、视空间功能、动作执行功能、数字知识、抽象思维、注意力等。常用的评分体系包括ShulmanCDT 、RouleauCDT 和CLOXI ，不同评分体系可反映大脑不同部位的损害。CDT 的优点是无需语言介入，可降低失语患者的语言依赖性；局限性在于易受教育和文化程度的影响。Ehreke 等认为，不应将CDT 用于轻度认知损害患者的评价，因为其敏感性和特异性均较低。 2.4 简易神经心理学筛查量表 为了及时发现卒中患者是否存在认知损害及其损害程度，Lunardelli 等开发了简易神经心理学筛查量表（BriefNeuropsychologicalScreeningBNS ），评估内容包括言语、视知觉、记忆力、运用能力和抽象逻辑力，总分68 分。他们将该表应用于247 例正常人和134 例脑损伤患者的研究显示，正常组95% 在61 分以上，只有75-84 岁年龄段的评分结果与年龄呈显著负相关，其他各年龄组均在64-68 分之间波动，差异无统计学意义；而脑损伤组得分均低于同年龄段正常组，均低于60 分，表明BNS 是一个敏感的认知筛查工具。BNS 语言项目中的理解力、命名和阅读能力与失语症检查量表的相关系数分别为0.85 、0.75 和0.84 。因此，BNS 既能初步评估失语患者的语言损害程度，又能评估相关的认知损害。其优点是耗时短，操作简单，能早期识别脑损伤患者的认知损害。 3 专用于失语患者的认知功能量表 3.1 失语检查量表 2003 年，德国学者Kalbe 等针对失语患者相关认知损害的识别开发了失语检查量表（AphasiaCheckList ，ACL ）。该量表分为2 个部分：第1 部分为由7 个条目组成的语言评估，用于评定失语患者的语言功能，除语言的基本要素外，测评项目还加入了评估听理解的颜色图片测试和口语交流分级测试；第2 部分为经过修正的包含3 个条目的认知量表，测评项目为记忆力、注意力和推理能力。所有认知检测项目均采用图片形式以减少对语言的依赖性，整个测评时间约为30min 。Kalbe 等在154 例德国失语患者和106 名健康人中应用了ACL ，结果显示，失语患者和对照组总分及所有子测验均存在显著性差异（P ＜0.001 ），其截断值的判别率以及对失语患者认知损害的敏感性和特异性分别为0.946 、0.942 和0.952 ，提示该量表在失语患者认知损害的识别方面敏感性和特异性良好。 ACL 是一个专门针对失语患者的评估量表，适用于各种病因引起的失语患者，不仅能有效评估失语患者的语言损害程度，而且还能对失语患者的认知功能进行评估。与其他认知量表相比，ACL 的最大优点是考虑到了失语患者的语言障碍，采用非语言性条目对认知功能进行评估，为失语症的评定提供了合理的补充。然而，ACL 也存在一些不足，如其认知测评条目虽能检测失语患者的认知损害，但却无法提供受损程度的详细信息。另外，ACL 目前尚未在我国经过修订和应用，因此尚不清楚该量表在我国失语患者中的临床应用价值。 3.2 完全性失语神经心理评定量表 1992 年，荷兰学者VanMourik 等制定了完全性失语神经心理评定量表（TheGlobalAphasicNeuropsychologicalBattery ，GANBA ）。该量表是一套专门用于评估完全性失语患者认知功能的神经心理学量表。由于临床上常用的认知量表对于完全性失语患者的可操作性很差，甚至无法实施，因此作者针对完全性失语患者的临床特点，选用了多个认知量表中对语言依赖性最低且操作相对简单的项日，包括注意力、记忆、一般智力、视听觉理解以及语言功能等5 个方面。他们将其应用于17 例完全性失语患者，结果显示，GANBA 的可操作性良好，所有患者均能完成测评，是一套有效的完全性失语认知评估量表。 GANBA 的优点是测评项目均排除了语言的干扰，更重要的是还能对认知损害程度做出初步评估和分级，以便制定个体化治疗和康复计划。然而，GANBA 的不足之处是还不够完善，如目前还缺乏大样本的信度和效度检验结果。 4 展望 VCI 最常发生于卒中后，是影响患者全面康复的重要因素。即使仅出现轻度认知损害，卒中患者院内死亡的风险也显著高于不伴认知损害的患者，卒中后认知损害评定的必要性也就不言而喻。作为VCI 患者的认知功能评估手段工具之一，非语言性认知量表对于伴有失语的卒中患者有着更为重要的意义。目前这些量表尚未被广泛应用，其心理测量学评价有待进一步研究。

个人分类: 认知障碍|1582 次阅读|0 个评论

VegCover全自动草地盖度计算小工具

热度 2 hujianbo 2013-3-15 14:13

用于全自动草地盖度测量。不受相机、光照条件限制（应该不会在黑灯瞎火的时候拍吧？）。计算速度：约1秒/张。 软件界面 批量计算结果

个人分类: 科教相关|4248 次阅读|5 个评论

文献数据分析工具之EI数据库数据格式转换工具

热度 6 PSLibrarian 2013-3-5 17:25

使用说明： 1.将从EI中按Detailed record和Plain text格式导出的系列txt文件与本程序置于同一文件夹下。 2.点击按钮【导出xls】可导出为Excel文件； 点击按钮【导出txt】可导出为txt文件(目前该功能可一次转换数量约为1000篇），该文件可导入TDA（选择WOS Filter)或Citespace中使用。 本工具的编写致谢国科图青年人才领域前沿项目。 欢迎点击下载使用： EI转换工具.rar

个人分类: 数据分析工具|9128 次阅读|11 个评论

科研工具教程大全

热度 12 zhangzuocug 2013-2-28 11:14

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Unitary Linear Regression Tool

xyzg198891 2013-2-25 16:48

注：由于本计算工具过大导致启动缓慢故决定将其拆分为2个独立的工具，具体信息见新发布的相关博文。 由于在实验中经常要做标准曲线（蛋白定量），本人抽空做了这个工具。该工具对数据点个数小于等于12个的情况都适用。具有高度智能化的特征，即操作者只需要输入原始数据即可看到结果，包括回归直线的斜率、截距、测定系数、F检验和t检验的结果。工具的左侧利用动态图表实时展示结果。工具截图如下： 附件（1.2以前的版本没有保存）： Unitary Linear Regression 1.2.xlsm （基础版本） Unitary Linear Regression 1.3.xlsm （引入Macro造成循环引用警号，暂未解决） Unitary Linear Regression 1.4.xlsm （增加输入提示） Unitary Linear Regression 1.5.xlsm （完善利用标准曲线的计算和图表设计） Unitary Linear Regression 1.6.xlsm （优化计算模块） Unitary Linear Regression 1.7.rar （独立参数设计，改版后不允许上传XLSM文件，故用压缩文件） Unitary Linear Regression 1.8.rar （优化VBA代码） 拟增加的功能及存在的问题 1.继续增加Tips； 2.优化图表； 3.工具过于庞大，打开很缓慢； 4.打开和关闭时弹出循环引用警告； 声明： 1.本工具仅供个人在学术工作中使用，勿用于商业用途！ 2.版权及其他所有权由本人保留！

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您真的理解了“时间是检验真理的唯一标准”了吗？

热度 3 famingkuang 2013-2-22 17:40

“时间是检验真理的唯一标准”这句话无疑是真理中的真理，可是又有几人真能应用它来处理生活中遇到的问题呢？ 秦始皇焚书坑儒，以为自己一人的智慧胜过古人多多，结果强大的秦王朝二世而亡；领导中国人们翻身得解放的毛主席破四旧（旧思想、旧文化、旧风俗、旧习惯）——孔子被打倒了；菩萨也被当柴火烧了。期望 中的四新却没有立得起来，人民反而回到了精神的荒蛮时代。 一种思想、一种文化如果它已经经历过数千年的洗礼而能存在下来，它难道不是真理的化身吗？ 批评中国传统文化、中医、佛教......的人们呀，请佛祖赐给他一颗真正的慧心吧，唯如此他才能明白“时间是检验真理的唯一标准”是什么意思了。

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期刊选择工具在科学网个人中心正式上线

liwenbianji 2013-2-21 12:21

2013年2月20日，理文编辑期刊选定工具Journal Selector正式在科学网个人中心上线，今后，科学网用户在登录后，便可轻松体验这一工具为目标期刊选择带来的便利。

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[转载]IBM开发出新型安全工具：运用大数据识别安全威胁和不满员工

nanoworm 2013-2-4 12:17

IBM开发出新型安全工具：运用大数据识别安全威胁和不满员工 作者： boxiyang IBM推出了一项名为IBM大数据安全智能的新型安全工具，这一工具可以利用大数据来侦测企业内外部的安全威胁，甚至还可以扫描电子邮件和社交网络，并标示出明显心存不满的员工，以提醒企业注意，预防其泄露企业机密。 此项工具可以扫描分析数十年以来的电子邮件、金融交易、网络流量，然后通过模式匹配来检测其中可能存在的安全威胁及欺诈。跟传统防威胁工具不同的是，这一新的工具平台依托的是Hadoop。利用计算机集群来处理数据密集型的分析是Hadoop的特长。平台可以帮助CIO对员工邮件进行情绪分析，以帮助判断哪一位员工有可能泄露数据。工具会比较员工跟同事讨论工作与在社交网络上讨论工作时的不同表现，从而识别出哪些员工对公司心存积怨，因而具有更高的泄露公司信息倾向。 比如说，某位员工在电子邮件中跟领导汇报工作时，表达的是积极向上，内容充满了正能量，可是工具扫描其在社交网络的言论时却发现，他跟别人谈起工作时却总是抱怨、情绪负面。再把这一模式结合其他因素一起考虑，这位员工可能就会被标示为潜在的危险人物，可能会被进行更多的调查。通过对词语进行模式解析，工具可以识别出某条信息是正面、负面还是中性的。 平台还可以通过回顾被攻击历史来防止新的黑客攻击和欺诈—包括以往入侵尝试的发生时间、地点，以及被攻击对象等。 随着数据泄露和黑客攻击威胁的增加，企业对实时的信息安全愈发重视。越来越多的公司正在利用大数据来发现安全问题的模式。前不久被 思科收购的捷克实时信息安全初创企业Cognitive Security 也具备类似的能力。 当然利用情绪分析能力来鉴别可能的“坏”员工，尤其是对员工电子邮件的检查，这一侵犯隐私的行为本身也很“坏”，如果企业强推这一工具，可能会造成员工的强力反弹，所以估计公司应该会慎重考虑这项能力的使用。 除非注明，本站文章均为原创或编译，转载请注明： 文章来自 36氪

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经济研究中把物理当做工具可能比把数学当做工具好

热度 3 yanghualei 2013-2-1 20:01

数学在经济学中的地位远比物理学好，我一直认为：如果把物理学当做经济学的工具远比在经济学中把数学当做工具好，至少有四个原因： 一、物理学和数学一样，同样有很多数学公式和模型，物理学的模型有自然的现实意义，是很现实的，但不抽象，相反很多数学模型和公式，仅有数学意义，没有现实意义，所以在从事经济学研究中，物理模型更容易类比和应用。 二、很多数学的模型和公式是在解决自物理学问题中发展起来的，也就是最初诞生于物理学，近代数学是物理学推动的，所以把物理学学完后，几乎数学工具掌握的都产不多啦。就是近代物理学包含数学。 三、物理学是一门经验的学科，经济学也应该是一门经验的学科，物理和经济都是工程性质的学科，都不应该是研究思维的学科，也就其是非纯思辨和逻辑的学科，当然其更不是哲学。 四、数学仅仅要求推理上的一致性，物理学不仅要求推理上的一种性，其更强调基本假设符合现实，推理过程符合自然法则。物理要求有实验，数学没有。

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Synopsys工具使用

yzmhit 2013-2-1 00:07

发现Design Analysis其实是DC的一个图形化的版本，里面可以设置库，环境变量等，然后进行综合，编译，映射，但是它是否是独立的？还需要进一步研究。

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【围观】抢票攻略之抢票工具，你知道的和不知道的

cgh 2013-1-24 04:15

看抢票攻略之抢票工具 今儿个打开 163 邮箱，收到一封网易的邮件，标题是： 返程火车票即将开售，网易邮箱携手惠惠网送你抢票全攻略，助你轻松拿下返程票 。 虽然我今年暂时不需要，但是鉴于网上热议，进到链接里看看一下。有些东西了解一下也有益。另外，刘洋博主探讨 用【抢票软件】，算不算【不道德】？ 我的理解和评论是：不算不道德！其实 “ 抢票软件 ” 所做的都是 12306 网站应该提供的服务，即自动存储个人信息、自动化填写未完成订单、支付信息等等，这些都是可以实现的。现在 12306 把这些对所有顾客的服务取消，还要求 “ 抢票软件 ” 也不要对任何人提供服务，而是让顾客不停的手工重复。铁道部的 12306 才是最大的不道德。就相当于，要求美国人用先进武器攻打没有核武器的国家一样，不能指责美国不道德，相反大家都有核武器，谁也不随便战争了。不道德的是美国限制别国发展，还要用先进武器打别过。从抢票攻略中的各种插件原理看，也似乎和我先前的理解相似。 以下是摘录的部分内容，还是值得一读的。 抢票插件工作原理 在 12306 网站的基础上，把一些隐蔽的功能和繁琐的功能，通过二次开发，整合成插件，从而把普通订票需要操作的步骤尽量节省，比如上图输入完验证码后需 要点击登录才能进入订票界面（抢票插件可直接省略 “ 点击登录 ” 的步骤）。而就是节省了这几步的时间很有可能就会帮助你在千万竞争对手面前快那么一点点，从 而抢到票。 第一个杀手锏：简化操作步骤 简化步骤大致可分为两种，一种是需要人为选择的操作（如点击提交按钮，直接省略，插件完成提交）。第二种是把订票过程中需要填写的表单提前填写好，省略在订票时填写表单的时间，把填写时间提到订票前（如提前选好席别，出票后会自动删选席别）。 第二个杀手锏：有票提醒功能，并自动提交订单（已停用） 除了可以减少订票的步骤，大多数抢票插件另一个最重要的作用是“有票提示”和“自动提交”功能，抢票插件可以根据你想要的车票，最快每 5 秒钟刷新一次页面（会无形占用铁道部服务器资源），如果你需要的车票还有余票可订，就会弹出提示，并播放音乐，甚至可以“自动提交”订单（目前这个功能大多数插件已停用）。 最实用的地方在于高峰期抢票不成，后期扫尾票、退票等，省去了守在电脑前一直点“查询”刷新页面的手动操作，改成了插件的自动操作。 第三个杀手锏：抢票时可显示排队人数（已停用） 剩余票数和多少人在抢这张票，这张票还有多少张。也就是说如果排队人数过多，在还没输入验证码，提交之前就可知道，那么更有利于尽快转变目标，为抢票争取时间。 这个功能可以说是目前“抢票插件”最为变态的功能，因为如果不是用插件，没人知道你的票订没订上，前面有多少人排队和你抢。但很可惜，目前这一功能，大多数插件更新后也都停止使用了。 使用抢票工具需注意安全 使用第三方软件购票时，用户的用户名、密码等信息都会被记录下来，有个人信息泄露的可能。下载、使用来源不明的抢票软件，有造成计算机中毒、个人信息被窃取的风险。贸然购买声称具有抢票效果、事实上并无作用的抢票软件，可能遭遇诈骗。 抢票攻略.pdf

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MOSRA工具的学习

yzmhit 2013-1-13 15:41

曾经安排学生研究过HSPICE下的这些模型和工具，但是效果都不是很好，学生学习的结果与其它人文章上的内容相距甚远。还是要参考KRISH说的鸟和兔子的故事，没有好的环境，就要自己来做吧。 MOSRA工具 摘要： 在MOS集成电路中，器件老化主要是由于 栅极绝缘层 ，以及 栅极绝缘层和硅之间界面 的随时间退化所引起的。主要的两类退化效应主要是热载流子注入（HCI）和偏置温度不稳定性（BTI）。这些退化机制随着栅氧化层的厚度不断变小，以及高介电常数金属栅（high-K metal-gate）晶体管的使用而变得更加的显著。 These mechanisms are more prominent in advanced process nodes in which the gate oxide is scaled to only a few molecules in equivalent thickness, and with the use of high-K metal-gate transistors. 由于这些效应的影响，需要长时间，并且非常昂贵的测试来衡量电路性能的退化程度，并且要及时的发现电路失效情况，造成生产成本的急剧增加。而作为一种替代手段，设计者开始使用保守的策略来对关键电路进行超安全标准的过设计（简单说，即设计时序余量），这样会造成芯片成本的增大（Problem：难道仅仅是芯片成本增大吗？对性能也会造成不良的影响！）。因此，以较低成本对电路的生命周期（此生命周期可不是剩余寿命预测那样花里胡哨的，是真实的，可验证的！）进行预测，特别是对于一些可靠性要求极高的领域，是非常必要的。 HSPICE和CustomSim（是两种不同的工具？）中的MOS可靠性分析（MOSRA）工具提供了一种可靠的，经济的方法来进行时序余量设计和广义寿命测试（extensive lifetime testing）。利用内置模型或者用户自定义老化模型，MOSRA能够准确预测HCI和BTI所引起的电路性能上的老化情况。MOSRA使设计者能够在设计的早期检测到可靠性失效情况，从而可以显著的减小寿命测试的时间和成本。通过HSPICE与CustomSim的集成应用，老化分析可以与标准的瞬态仿真一样快速的运行。 介绍： 由于老化引起的MOS器件的退化情况已经成为45nm及以下器件可靠性的一个重要的衡量指标。它使得电路性能随时间发生退化，减小电路的寿命，并且可能会引入潜在的故障。一个影响器件老化的主要机制是HCI现象。在高电场环境下，载流子从沟道的耗尽层注入到栅极绝缘层，改变了它的电特性。另外一个重要的退化现象是p沟道MOSFET的NBTI效应和n沟道MOSFET的PBTI效应。PBTI效应在高介电常数金属栅（high-K metal-gate）层叠中有非常显著的影响。在两类BTI效应中，栅极绝缘层中的电荷的数量随着栅极偏置电压的改变而改变，由于电荷的捕获和释放作用。在恒定偏置电压的作用下，捕获的电荷不断地增加，进一步增大门限电压，并减小沟道载流子的移动性（mobility）。这个效应与器件工作温度有非常强烈的联系。当栅极电压是随时间变化的，一些捕获的电荷可以被释放，这取决于捕获的位置，以及捕获/释放的时间常数，这会引起退化效应的部分恢复特性现象的发生。 HSPICE与CustomSim中MOSRA已经被成功的应用于45nm及以下器件可靠性问题的识别和调试中。它可以提供： （1）准确的，并且是可以度量的HCI和BTI的模型，特别的，可以对BTI效应中特有的部分恢复特性进行建模。 （2）与HSPICE与CustomSim中的功率仿真引擎进行无缝的连接，在特定的操作条件下，进行电应力计算，在指定的时间范围内进行应力和退化的计算。 （3）可以很简单的与其它器件模型进行集成。 （4）可以对应力积累效应进行解释，例如MOS器件老化，漏电流减小等现象，从而减小可能由此引起的器件退化现象。 MOSRA老化模型 器件老化是器件参数在一定电应力条件作用下持续退化的一种现象。而MOSRA模型被用来将这些电应力条件转换为器件的实际退化情况。一般来说，这样的模型是器件工作条件，例如电压、电流、温度、以及器件拓扑特性等参数的函数。而得到的退化效应可以以以下两种方式进行使用： 1. 将电应力参数转化为关键的MOSFET集成模型参数的退化情况，例如门限电压、载流子迁移速率（mobility）等； 2. 另外一种方式是将应力直接转换为器件特性的退化程度，例如直接转换为漏电流，以及其导电率的退化百分比； 两种方法各具优势，第一种方法直观简单，而第二种方法可以将不同的退化效应分开考虑，进而在一个较宽的偏置电压的范围内，得到一个更为精确电流、导电率等参数的退化模型。（个人理解，一个是更为精确，另外一个更为直观） MOSRA模型通过基于物理参量的公式建立，并且通过参数系数的调整来增大模型的准确性，并使参数提取变得更加方便。 对于NBTI/PBTI模型，主要考虑两个物理机制：一是与退化对于界面陷阱（interface traps）的影响程度，另外一个是与绝缘层中陷阱相关。其实这里说的主要就是NBTI/PBTI效应对于MOS物理特性的影响。 For N/PBTI models, two principal physical mechanisms are considered: One related to the contribution of the (Equation 1) and the other related to the traps deep inside the dielectric layer (Equation 2). 在上式中，E(V GS ,V DS )表示绝缘体中的电场强度。器件门限电压的退化情况被用来表示BTI模型。 最近的亚深纳米器件数据表明NBTI和PBTI效应与沟道的长度有直接的关连，而依赖的趋势随着工艺条件的变化而变化。根据这些观察结果，我们得到了灵活的与沟道长度和宽度相关的数学公式。此外，我们的BTI模型中允许一个装箱方法（类似于集成方法，binning approach），the geometry scaling equations embedded in the model provide for accurate global modeling. 通过考虑应力激励的占空比，可以对部分恢复特性进行建模。当部分恢复特性被考虑的时候，整体的延迟特性能够变小。 图1 环形振荡器（最高）频率退化问题中的部分恢复效应，虚线表示没有考虑部分恢复特性时的退化情况 这个方法允许我们将BTI效应的部分恢复特性建模为电路工作时间的一个函数。 MOSRA HCI模型 HCI模型应该对宽范围内的漏电流、栅极和衬底的偏置电压以及不同温度之间的依赖关系进行准确的解释。这个准确性应该对于多种沟道长度和不同的氧化层厚度都是适用的。MOSRA HCI模型的基本公式是： 这个公式里的第一项对应于幸运电子模型（Lucky Electron Model），而第二项则是在高电场（大电流）环境下，让该模型变得更为准确。 为了说明MOSRA里面的模型非常准确，作者还比较了MOSRA HCI模型与BSIM4 模型

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1个核心和2个工具

rockyangke 2013-1-8 20:13

进行地质科技工作研究，需要具备1个核心和2个得力工具。 核心是脑，就是idea，这要靠多读文献，多琢磨，多与人交流才能获得灵感； 工具1：地理信息系统mapgis和Arcgis 工具2：统计分析数据挖潜的技术 ！工具别人能帮忙，核心可是竞争力！

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“君子不器”说什么？

zhanghuatian 2013-1-6 19:42

最近有“学者”讨论“君子不器”对中国科学的恶劣影响，我觉得在讨论之前是不是得弄明白“君子不器”讲的是什么？ 孔子说：“君子不器”。 这句话的内涵之一：器不是君子。　 器，即工具或用具，只有特定的用途。君子岂能像一件让别人称心称手的工具？君子应当有自己的主心骨，他应该作为“人”而存在，而不是作为“工具”而存在。 人若是器，便只能在特定的技术领域有用处。比如一个修鞋匠，或电脑工程师，假如他们的知识和兴趣只局限于修鞋或电脑，只在这两项事务中有见解，他们就只是一个“器”。而当他们对人类一般事务都关心，并有出于正义的判断，他们便可能是一个“君子”。 君子的能力不局限于一个行业，君子关注的对象更不局限于一个特定的专业，他关注人类一般事务，并保持自己的良心。对人类一般事务，或整体命运与未来，他都有基于正义的判断，基于判断的见识，基于见识的行动。他在一切人类事务上，都能立足于人类整体利益作价值判断。 这句话的内涵之二：君子不是器。 君子要有良心，有道德，有理想。君子要有是非判断。君子要宁为玉碎，不为瓦全。 假如君子仅仅是一个“器”，比如是一把刀，让他去切菜也行，让他去砍杀无辜也行，那他还能叫君子吗？ 所以，君子要有根据良心和正义作是非判断的能力和愿望，要有不为外力所胁迫而坚持正义的勇气。有了这个是非判断和勇气，假如他是一把刀，他可能帮人砍柴，帮人切菜，但决不会自己去或为人胁迫去杀害无辜。这样的刀，有精神的刀，就不再是器 ，不仅仅是器。 君子在古代就是对高级知识分子的概称，在今天可以等同于科学家、艺术家、哲学家等等。所谓“形而下谓之器”，“君子不器”就是说君子不仅仅是专家，这四个字的内涵绝对不像“学者”们望文生义的理解那么简单。在我看来，判断一个科研工作者是不是科学家，除了看他的科研成果之外，还要看他是不是以宗教一样的情怀去追寻世界的因果，找到了一两个原因的解释，如果他找到了，那么他就是科学家，也是孔子所说的君子。而人类文明的辉煌和灿烂正是因为凝聚了这些大家对世界的解读。 君子的格调注定会和小人不同，君子不会像所谓的“学者”一样雅兮兮地自以为清高地去做什么“学问”，终其一生去搞什么“某某学”的研究，混个某某学博士，然后以“学者”、“人才”的身份心安理得沾沾自喜地领取他的津贴，到他白发苍苍的时候，他就可以而受人（至少是几个博士弟子）尊敬了。真正的科学家的不会为“做学问”而做成“科学家”。为什么有人怀念牛顿时代的科学？原因就在于此！ 向古今中外的君子致敬！

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[转载]Sublime Text 2 入门

Minuskid 2012-12-22 19:59

看了 Nettuts+ 对 Sublime Text 2 的介绍 ，立刻就兴奋了，诚如作者 Jeffrey Way 所说：“《永远的毁灭公爵》都发布了，TextMate 2 还没发”，你还能指望它么？TextMate 开发者的消极态度已经无法让人忍受了。而作为一款跨 OS X、Linux 和 Windows 三大系统平台的文字编辑器， Sublime Text 2 功能日进，大有取 TextMate 而代之的势头， 以下就将 Nettuts+ 的这篇文章做一粗略翻译，固然不是面面俱到，用做入门却是足够了。以下均是以 Mac 版本为主，但对 Windows 和 Linux 版来说也是相通的。 内容列表 换个耐看点些的图标 尝试开发版本 快捷的命令面板 即时的文件切换 随心所欲的跳转 多重选择(Multi-Selection) 缩进指示(Indent Guide) 安装包控制(Package Control) 对齐 Vim 模式 无干扰模式(Distraction Free Mode) TextMate Bundle 主题 命令行工具 总结 换个耐看点些的图标 更新 ：更多 可用替换图标 Sublime Text 2 目前还处于测试阶段，默认的黑方块图标看起来实在不够养眼， Nate Beaty 制作了一个不错的 替代品 。 Mac 下的替换方法： 在 应用程序 目录中找到 Sublime Text 2，按住 Ctrl 并点击之，在弹出的菜单中选择“显示包内容”。 进入 Contents/Resources/ 目录，用新下载的图标替换 Sublime Text 2.icns。 尝试开发版本 Sublime Text 2 目前更新十分活跃，如果想要尝试最新的功能，建议下载并安装 dev 版本。 下载 Sublime Text 2 Dev 版 快捷的命令面板 和 TextMate 类似，Sublime Text 2 也提供了很方便的命令调用方式：Command Palette（命令面板）。调用方法：直接在 Tool 菜单中选择 Command Palette，或是用快捷键：Shift + Command + P，输入命令名称（中的字母）就可以实时搜索到相应的命令、选项、snippet 和 syntex， 按下回车就可以直接执行，减少了查找的麻烦。 即时的文件切换 按下 Command + P(Mac) 或是 Ctrl + P(Windows)，输入想要切换到的文件的文件名，都不用按下回车键，目标文件就已经展现在眼前了，虽然 Vim 配合 PeepOpen 也可以实现同样的功能，但速度却远没有这么迅速。 随心所欲的跳转 Cmd+P 之所以被叫做 Goto Anything 并不是虚名： 用 Command+P 可以快速跳转到当前项目中的任意文件，可进行关键词匹配。 用 Command+P 后 @ (或是Command+R)可以快速列出/跳转到某个函数（很爽的是在 markdown 当中是匹配到标题，而且还是带缩进的！）。 用 Command+P 后 # 可以在当前文件中进行搜索。 用 Command+P 后 : (或是Ctrl+G)加上数字可以跳转到相应的行。 而更酷的是你可以用 Command+P 加上一些关键词跳转到某个文件同时加上 @ 来列出/跳转到目标文件中的某个函数，或是同时加上 # 来在目标文件中进行搜索，或是同时加上 :和数字来跳转到目标文件中相应的行。 多重选择(Multi-Selection) 多重选择功能允许在页面中同时存在多个光标，让很多本来需要正则表达式、高级搜索和替换才能完成的任务也变得游刃有余了。看看 Nettut+ 提供的实例可能更为直观一些： 激活多重选择的方法有两几种： 按住 Command 或 Alt，然后在页面中希望中现光标的位置点击。 选择数行文本，然后按下 Shift + Command + L。 通过反复按下 Control/Command + D 即可将全文中与光标当前所在位置的词相同的词逐一加入选择，而直接按下 Alt+F3(Windows) 或是 Ctrl+Command+G(Mac) 即可一次性选择所有相同的词。 按下鼠标中键来进行垂直方向的纵列选择，也可以进入多重编辑状态。 缩进指示(Indent Guide) 更新 ：缩进指示已经被集成进 Sublime Text 2 中，不需要安装插件了。 缩进指示这个小功能可以让代码的层级关系更加清晰，在 Sublime Text 2 中，可以通过一个插件来实现这个功能。 安装方法： 下载 IndentGuides 插件。 解压后，将文件夹重命名为 Indent Guides，并放入 Packages 目录中。找到 Packages 目录的简单方法是在 Sublime Text 2 的 Preferences 菜单中选择 Browse Packages。 重启 Sublime Text 2 安装包控制(Package Control) 上一条中的安装插件的方法是不是很麻烦呢？其实和 TextMate 可安装 Bundle、Plugin 一样，Sublime Text 2 也拥有良好的扩展功能，这就是安装包(Package)；同样，就像 TextMate 有用来安装、升级、卸载 Bundle 的 GetBundles 一样，Sublime Text 2 也有其用来进行 Package 控制的插件： Sublime Package Control 。通过 Sublime Package Control，安装、升级和卸载 Package 也变得轻松写意了。 安装 Package Control 的方法： 打开 Sublime Text 2，按下 Control + ` 调出 Console 将以下代码粘贴进命令行中并回车： import urllib2,os;pf='Package Control.sublime-package';ipp=sublime.installed_packages_path();os.makedirs(ipp) if not os.path.exists(ipp) else None;open(os.path.join(ipp,pf),'wb').write(urllib2.urlopen('http://sublime.wbond.net/'+pf.replace(' ','%20')).read()) 重启 Sublime Text 2，如果在 Preferences - Package Settings中见到Package Control这一项，就说明安装成功了。 使用 Package Control 安装 Package 的方法将在后面用到的地方详述。 对齐 对于某些喜欢整齐的码农来说，看到下面这种情况可能是让其无法忍受的： var joe = 'joe'; var johnny = 'johnny'; var quaid = 'quaid'; 一定要改成这样才会安心： var joe = 'joe'; var johnny = 'johnny'; var quaid = 'quaid'; TextMate 里也有这样的功能(Option + Command + ])可以自动实现以上的对齐过程，而在 Sublime Text 2 之中，一个 Sublime Alignment 插件也可以轻松实现。 以下就通过 Package Control 来安装这个插件： 按下 Shift + Command + P 调出命令面板。 输入 install 调出 Package Control: Install Package 选项，按下回车。 在列表中找到 Alignment，按下回车进行安装。 重启 Sublime Text 2 使之生效。现在通过选中文本并按下 Shift + Command + A Ctrl + Command + A 就可以进行对齐操作了。 通过这个方法就可以简便的安装更多的插件，虽然目前的安装源中插件并不是很多，但相信以后会更加丰富的。 Vim 模式 是的，Sublime Text 2 dev 版已经支持 Vim 的编辑模式了，如果更喜欢 Vim 的编辑模式，可以通过以下方法来激活 Vintage mode： 按下 Shift + Command + P 调出命令面板。 输入 settings user 调出 Preferences：Settings - User，并按下回车。 以上两步也可以直接用cmd + ,完成。 这时会打开一个 Preferences.sublime-settings 的文件，如果是第一次修改，它应该是个空文件，把以下文本粘贴进去： { "ignored_packages": 也是可以放到 Packages 目录里直接用的。估计随着 Sublime Text 2 越来越火，会有更多 TextMate 的 Bundle 被移植过来。 主题 这里所讲的主题不同于针对代码的 Color Scheme，是指针对 Sublime 程序本身的主题，目前可以安装的是 Ian Hill 的 Soda 。 因为源中已经添加，所以这款主题的安装同样可以通过 Package Control，非常方便。目前 Soda 主题提供了明暗两种风格。 激活方法，同样要修改 Preferences：Settings - User： 按下 Shift + Command + P 调出命令面板。 输入 user settings 调出 Preferences：Settings - User，并按下回车。 添加以下代码激活 Soda Light 主题： { "theme": "Soda Light.sublime-theme" } 添加以下代码激活 Soda Dark 主题： { "theme": "Soda Dark.sublime-theme" } 保存生效。 命令行工具 和 TextMate 和 MacVim 一样，Sublime Text 2 也提供了很方便的 命令行工具 以方便通过终端来快速的调用 Sublime Text 2 程序来打开文件/目录/项目等。 要使用命令行工具，你需要创建一个符号链接，在终端(Terminal.app)中运行： ln -s "/Applications/Sublime Text 2.app/Contents/SharedSupport/bin/subl" ~/bin/subl 然后运行 subl --help 可以查看 subl 命令的使用方法： 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 使用: subl 编辑指定文件 或: subl 打开指定目录 或: subl - 编辑 stdin 可用参数: --project 项目: 读取指定项目 --command 命令: 运行指定命令 -n 或 --new-window: 打开新窗口 -a 或 --add: 向当前窗口中添加文件夹 -w 或 --wait: 等待文件关闭后再返回 -b 或 --background: 不激活程序窗口 -s 或 --stay: 关闭文件后保持程序窗口激活 -h 或 --help: 显示此帮助 -v 或 --version: 显示版本号 读取 stdin 时会使用 --wait 参数。通过 --stay 可以在文件关闭后不返回终端（仅针对单个文件）。 可以通过向文件名添加 `:行号` 或 `:行号:列号` 后缀来打开到更具体的位置。 总结 在试用 Sublime Text 2 的过程中，“ 快 ”和“ 顺 ”是给 Lucifr 最强烈的感受，就如同 Chrome 浏览器一样，Sublime 的各种操作都给人以很流畅的感受。良好的中文支持也是 TextMate 所不具备的，虽然以目前的插件数量和质量还不能完全替代 TextMate，但还是让人十分期待的。唯一让人纠结的是价格，$59 的注册价确实不便宜（明显是照着 TextMate 的 $58 加一块定的嘛），好在目前测试阶段还可以无限试用。 更多 Sublime Text 2 相关文章，请关注 这里 。 ====================================================================================================== 最近用到这款工具 觉得还不错，网上找了一些教程： 下面是 Lucifr 的三篇介绍: Sublime Text 2 入门及技巧 ZenCoding in Sublime Text 2 Sublime Text 2 实用快捷键 Sublime Text 2 右键菜单中的实用选项 以及 istyles 的: Sublime Text 2 快捷键 (windows) Ctrl+L 选择整行(按住-继续选择下行) Ctrl+KK 从光标处删除至行尾 Ctrl+Shift+K 删除整行 Ctrl+Shift+D 复制光标所在整行，插入在该行之前 Ctrl+J 合并行(已选择需要合并的多行时) ctrl+ku 改为大写 Ctrl+KL 改为小写 Ctrl+D 选词 (按住-继续选择下个相同的字符串) Ctrl+M 光标移动至括号内开始或结束的位置 Ctrl+Shift+M 选择括号内的内容(按住-继续选择父括号) Ctrl+/ 注释整行(如已选择内容，同“Ctrl+Shift+/”效果) Ctrl+Shift+/ 注释已选择内容 Ctrl+Space 自动完成(win与系统快捷键冲突，需修改) Ctrl+Z 撤销 Ctrl+Y 恢复撤销 Ctrl+Shift+V 粘贴并自动缩进 Ctrl+M 光标跳至对应的括号 Alt+. 闭合当前标签 Ctrl+Shift+A 选择光标位置父标签对 Ctrl+Shift+ 展开代码 Ctrl+KT 折叠属性 Ctrl+K0 展开所有 Ctrl+U 软撤销 Ctrl+T 词互换 Tab 缩进 Shift+Tab 去除缩进 Ctrl+Shift+UP 与上行互换 Ctrl+Shift+DOWN 与下行互换 Ctrl+K Backspace 从光标处删除至行首 Ctrl+Enter 插入行后 Ctrl+Shift Enter 插入行前 F9 行排序(按a-z) 对于喜欢整齐的玛民来说，这不失为一个省事的插件。该插件可以通过上面安装好的 Package Control 来安装： 按ctrl + shift + P调出命令面板； 输入 install 调出 Package Control：Install Package 选项，并回车； 输入Alignment，选中并按回车安装； 重启Sublime Text 2，选中文本并按ctrl + alt + a 就可以进行对齐操作了。

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进入管理研究的很好思维起点：社会“物”理学

热度 13 陈安博士 2012-12-20 00:34

　　各行各业的人都有转到管理这行当来的。 　　应该都成普遍现象了。我赞赏这种现象，事实上，在我们研究团队招收博士后的时候，我们还特意写了“博士专业背景不限”，如果你是学中文的、学哲学的、学历史的、学训诂的，我们都会考虑，当然，如果你是学数理化天地生的，那也当然没有任何问题。 　　我个人的看法，反而是这些博士背景出身的人，比其纯粹学管理科学的还要更入我老人家的法眼。因为他们懂的东西有我不懂的，而我懂的东西他们可以在最短的时间内掌握。 　　而他们（尤其是数理化天地生背景）所以能够教我我不会的，是基于管理科学完全可以采用社会物理学的知识来描述、刻划、建模这一思维起点。 　　你说你不懂社会物理学，好，我可以先简单告诉你，这里的物理不是physics，而是“万物之理”的物理，所以只要你是理工类出身，就已经具备了“物理”背景，只是这个背景可能是“化学”而已，也就是说这里的“物的理”指的主要是物之间相互反应以生成新的物质的内在规律。 　　此时，我想你应该非常自信自己的背景和“社会物理学”只有一步之遥了。只是在你研究的“物的理”上面加了社会两个字作为修饰词罢了。 　　因为管理的数学模型被认为是最高层次的模型，而物理模型则次之（尽管很多物理模型就是数学模型），大家大概还没想到过管理的化学模型一说吧，其实，这个说法也是“社会物理学用于管理建模”的一个部分而已，但是我们不会说“化学模型”，显得特没学问似的。 　　化学模型里有很多有趣的东西，其实比物理、数学模型更能描述管理现象，比如，化合、分解反应，比如化学里常用的“催化剂”，参加或不参加反应都可以，现实的管理现象中完全可以找得到对应的地方。 　　举一个例子，有一个著名广场，有时候会有人聚集，显得不好看，此时，会有唱白脸和唱黑脸的同时出现，唱黑脸的去组织临时聚集的人群，而在号召大家按照要求撤离转移的时候，不见得聚集人群会有响应，此时，就可以有唱白脸的人先跟着响应，因为其身份的隐蔽性，会带动大家转化思维，也许就顺利地从聚集地离开了。此时此人的身份和参与反应的催化剂又有何区别呢？ 　　当然，你可以说上面那个例子就是做“五毛党”，但是那也属于社会管理的一部分。事实上，这样的催化剂与“帮凶”身份是可以完全区分开来的，比如，在自然灾害的受难人群中间也需要这样的“催化剂”，以改变弥漫在人群中的低落气氛，并激发大家自救和救援他们的积极性。 　　我一直想建立一套完整的化学模型来描述（应急）管理中的现象和本质，而从这套模型中，我相信和数学模型和物理模型一样，能够给管理者以启示，并基于此设计更好的应对机制。 　　第一个博士后我们招收的是生物化工背景，而以后招收博士后也不会在专业上有什么要求。事实上，博士后经过短期的专业转换过程，我想现在完全可以写出很好的体现社会物理和社会管理之间的交叉与融合，而这一点，其实是尚未有人尝试的。 　　当然，所谓“化学模型”看上去确实不如物理数学模型漂亮，在学科逻辑体系上，化学本来也确在数学和物理之下，但是我们现在很多管理问题用了数学或物理模型，但是并没有找到内在本质的规律，而也许化学能给我们一些启示。而且，现在很多生物学上的概念和模型正在管理学中试用，比如生态位的概念等。 　　在2013年到来之后，我们将完成一篇这样一篇古怪的“社会物理学模型在应急管理中的应用研究”论文，试试水，看看效果如何。 　　而这些，一定要依赖对于化学的本质有深刻理解的学者的参与。

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12.12.03 科研必备工具的介绍——软件篇（一）文件搜索 思维导图

热度 7 lijianchunbull 2012-12-7 19:48

工欲善其事，必先利其器。从事科研亦是如此，从大的方面上讲，我们需要一个良好的心态，健康的身体以及强大的自控能力，从细节的方面来讲我们也需要一些必要的辅助工具，我打算介绍一些必要且用好的工具给大家，希望大家可以充分的消化与享用。 初步想法是文章分为三个系列，第一部分写如何使用好的软件来操作电脑、第二部分写如何读书、记笔记、作计划，充分的利用每一天；第三部分写如何上论坛写 Blog ，通过思想的交流来完成自己的一次超越。 现在的研究报告或学习大多是直接在电脑上完成的，能够熟练的掌握工具会给我们的学习带来事倍功半的效果，因此如何正确使用软件就成了一个值得研讨的学问，本文就此展开，作为工具篇的第一部分。 科研的软件我把它分为以下几类： ## 基本工具类 ## 顾名思义，就是一些最为基础，必须要熟练掌握的工具，或是必不可少的工具，主要有以下五个，分别是 word 、 excel 、 photoshop 、 freemind 和 everything ，这些软件中前三个想必大家用得都比较多了，因为它们太精典、太常用，以致于大家都没不再关注其核心方法与技术了，对于这些软件的使用我得开专题分别介绍，写完后在本文后加上链接。 接下来讲的两个可能非专业人士不太常用，但是一旦使用就会带来生产力的巨大提升。 Everything 使文件搜索变成光速 不爱整理文件的人因此有福了：有了 everything 使你找文件进入了一个新时代。怎么说呢？只要你能记住一点文件的名称，配合正则（表达式）的使用，那么你就可以利用 everything 进行快速定位，就像百度一样快，以致于有了她你都不愿意进入一些文件夹一个个的点开。推荐指数☆☆☆☆☆，易用指数☆☆☆☆☆。引用 nike 的广告词来表达吧， just do it! 先看看我的一个 demo 。 例 1. 我记得自己的电脑里有一个基本农田整治的规程，但是想不起来放在什么地方了，怎么办？ 方法一：努力回想，一个个文件夹的找？…………哦终于找到了，大约 10 分钟吧，你会感叹自己的东西下次得好好放了，然后就想不起来刚才做的事情到哪里了。 方法二：找不到位置用搜索啊，于是你用了 windows 自带的搜索…………怎么这么慢呢？我先看下新闻八卦放松一下？ n 分钟后，找到了，唉！也到吃饭点了，先放桌面上明天接着做吧（我们能再吊丝些么？）。 方法三：打开 Everything! 输入“规程 doc ” 0.001 秒后你就看到了如下的答案。 图1 Everything 的使用例子 对于 Everything 的学习应该不用什么教程，直接下载后打开即可，用得多了，你自然明白一些简单的正则（表达式）的用法，而现在你需要做的只是开始使用她！ 软件是完全免费的，有中文语言扩展包的支持（ 不过实在必要 ）下载地址： http://www.voidtools.com/download.php ，需要注意的是你应该保证硬盘为 ntfs 的文件格式。当然，这个工具也使我们对于文件命名提出了新的要求，文件名需要加入一些线索，这会加速我们的寻找。 当然，如果你还是意犹未尽，可以看一下，善用佳软对于 everything 的介绍，讲得不错，适合后期的进一步进阶 http://xbeta.info/everything-search-tool.htm 。 Freemind 自由与免费的思维导图 提起这个，我得说下时下流行的思维导图，它是由东尼·巴赞（ Tony Buzan ）创立。早年间，我曾看过他写的一本介绍思维导图的书（好像是这本，当时太懒，没有及时写下读书笔记也没有留下书评 http://book.douban.com/subject/2233373/ ），其核心思想是充分利用大脑的结构来实现对于知识的理解和积累，当然他研习了达芬奇等伟人保留下来的笔记，发现牛人都尽可能利用自己的右脑的识别功能，把一些东西图形化、简单化，进而使自己能够专注于最本质的东西。 对于导图的作用，是否如其所说那么有效，或是被夸大了，具体我也没有实验过。但是导图真的是在 IT 领域火起来了，甚至在 IT 公司内部的一些培训中都会讲他的使用，我想一个已经被大众化了的东西，必然会失去其原始的价值核心。简单来说，导图不适合用电脑做，而要用手画，就像了不起的画家不用 ps 做图一样，一些原始的东西是需要载体的。（这一部分我将来会展开来写一下，发到网易关于研究学习方法的 blog 上，先把链接留空） 言归正传，思维导图至少有两个软件比较有名，一个是 freemind ，另一个是 mindmanger 。前者是完全免费的，后者价格不菲，而我们真正用到的是导图的树形提纲功能， mindmannger 就显得有些大材小用了，同时也会涉及到版权问题。现在我写东西都是左边开一个 freemind 写提纲，右边开一个 gvim 码字。（写论文用 freemind+word 2003+noteexpress ）。 不少朋友可能要问这样一个问题“ freemind 能带来什么好处？其易用性又如何呢？”好处 1 ：提升了目录的维度，节约了电脑有限的屏幕。传统的目录结构是一维的，而树形结构使得一维变成了二维，在有限的空间中放下了更多的东西。好处 2 ：结构决定功能，位置决定意义。处于最中心的就是思考的核心，而周边的都是由核心引起的，从近到远反映出了问题的衍生性，从上到下反映出事情的顺序，左边可以表示显性因素，右边表示隐性相关因素。结构化的表达因此变得清晰有效。好处 3 ：结构调整也非常容易，如增加一个结点， ins ，提升一个级别， ctrl-left ，不一而足。听完后，晕了吧。：）没事，结合着我写 Blog 的思维导图，你会有所体会的，当然这更加需要一些悟性。 图2 博客思路的提纲 易用指数☆☆☆推荐指数☆☆☆☆☆。 freemind 使用其实并不难用，作为软件开发者而言也希望大众能够很快的学习并接受，因此不会让学习成本太高。使用时，涉及到的只是一个习惯问题，就算我们知道她有如此多的好处，但是如果不能习惯也是没有价值，因此你需要放手一试，以及改变习惯的勇气。 Freemind下载地址是为，http://freemind.sourceforge.net/wiki/index.php/Main_Page，先睹为快。 下图是杰克逊自画的思维导图价值 30 万美金，这个能鼓励你尝试一下么？ ：） 图3 迈克尔杰克逊的思维导图（转自百度知道）

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[转载]最强劲的PDF工具Adobe Acrobat XI Pro 11 最新带破解

grapeson 2012-12-3 14:57

最强劲的PDF工具Adobe Acrobat XI Pro 11终于与大家见面了！它已经不仅只是出色的PDF编辑、转换软件。此次更新深度整合了Microsoft Office套件，实现了PDF与Word、Excel以及PowerPoint等文档间的无缝相互转换，并整合了云服务，你可以将PDF文档存储在微软SharePoint服务器和Office 365之上，也可以存储在 Adobe自家的Acrobat.com云端服务器中。而且Adobe Acrobat XI Pro将完美支持IOS、Andriod和Wondows 8平台 激活说明： 1、安装要求输入序更号时选择“使用试用版本或订阅”； 2、安装完成后使用附件提供的补丁替换软件安装目录同名文件。 QQ截图20121015215240.jpg 附件一：AcrobatXIPro安装档下载地址。 附件二：破解AcrobatXIPro用的替换文件： 附件三：版主jianganhe提供的破解文件，也可下。 特向版主jianganhe致谢，感谢其及时补充资料。 附件 1 : 下载地址.txt (2012-10-15 22:34:03,86 bytes, 已有 1738 次下载 ) 附件 2 : amtlib.dll (2012-10-21 08:25:36,928.43 K, 已有 1384 次下载 ) 附件 3 : AcrobatXIPro_Crk.7z (2012-10-15 23:54:37,289.54 K, 已有 1950 次下载 )

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[转载]研究发现黑猩猩能看录像学习制造工具

genesquared 2012-11-16 15:52

研究发现黑猩猩能看录像学习制造工具 据英国媒体报道，研究人员发现，黑猩猩通过观看录像演示，可以学会制造工具。在实验中，研究人员给黑猩猩们演示一段录像，在录像中，一只训练有素的猩猩把两部分工具组成一个工具，用这个工具够取食品。 看过录像后，研究人员递给这些黑猩猩相同的两部分工具，黑猩猩学会把两部分组成工具，并使用工具够取美食。该研究发表在英国《皇家学会学报B》（ Proceedings of the Royal Society B ）上，科学家称，该研究验证了社会学习对灵长类的有效作用。负责这项研究的苏格兰圣安德鲁斯大学的伊丽莎白·普利斯解释说：“通过录像，我们能准确控制动物看到的信息量，这样我们能准确理解它们需要学习的如何执行任务的信息量。” 在实验中，普利斯博士和她的同事把黑猩猩分成5组。一组被演示全部录像，在录像中，研究人员递给一只黑猩猩一根杆和一个管，是可对接在一起的两部分，然后演示者使用较长的组合工具从笼子外的平台够取得到一串葡萄。其他组被演示越来越少的信息，其中一组的黑猩猩只看到录像中黑猩猩吃葡萄的一幕。接下来，研究人员为这些受试者重新创造了这一情境。他们在每只黑猩猩笼子外的一个平台上放一串葡萄，然后递给这些动物一根杆和一个塑料管。普利斯说：“那些看完全部录像的黑猩猩学习制造够取食品的必要工具的情况较好。它们能学会如何为特定任务制造工具，这让我们感到非常兴奋。这种习性在野外非常罕见，这是人类工具使用的必要部分。” 普利斯说：“少数没有看完全部录像的黑猩猩学会了自己制造工具。对于这一组，更有趣的是，当我们把葡萄放在距离它们的不同位置，它们也能制造合适的工具够到葡萄。”并非简单模仿，这些动物还会依据距离葡萄的远近，在使用管或者杆和使用组合工具之间切换。普利斯博士说：“那些看过全部录像并学会制造长工具的猩猩即使在葡萄离它们很近很难使用工具的情况下仍继续制造工具。”可能，社会学习对黑猩猩来说是一种很强的力量以致它们应用“遵循你看到的”的规则，而不是最适合解决任务的规则。 现在，研究组正计划对幼儿进行同样的测试以检测他们依赖社会学习的状况。研究仍不清楚为什么这类工具建造在野外较为不常见的原因。普利斯博士说：“我们发现，它们非常聪明，所以这一定有什么原因，可能是黑猩猩的年龄到达能执行那些更高水平技能的时候或许它们太老了无法通过演示学习。” 更多阅读 苏格兰圣安德鲁斯大学相关报道（英文）

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马来西亚的科研评价工具

热度 3 Wuyishan 2012-11-12 06:49

马来西亚的科研评价工具 武夷山 （ 这是我 2010 年 3 月 22 日在办公室通过 Skype “参加”澳门的一个研讨会所记录下的内容。发言者是马来西亚的一位姓 Mustafa 的先生。记录不完整，也不能保证完全准确，仅供参考。） 马来西亚有一个 Research Assessment Instrument （简称 MyRA ，科研评价工具），其实是一套大学评价指标体系。 2007 年，马来西亚颁布了“ 2007 － 2020 高等教育战略规划”，包括 7 个推进计划（ thrust ），其中第五个推进计划是“加强科研与创新”，并提出一个目标：拿到诺贝尔奖。 MyRA 的目的是让大学自测。该体系共有 91 个指标。每个国立大学每年都得填报这些指标。私立大学若想申请国家科研项目，也得填报。 政府每三年搞一次大学评价。评价得分大于 95 分的大学，为五星级， 2010 年时有 4 所； 70 － 94 分，为四星级，有 1 所；三星级的大学有 3 所； 2 星级的有 7 所。政府的目标是，到 2011 年，所有大学都至少成为 2 星级。 评分大于 75 分者，才有资格申请“研究型大学”称号。评估组对大学进行现场考察后，认为评估对象达到了要求，可授予“研究型大学”称号。 在 MyRA 中，科研质量的权重为 30 ％，人才队伍质量的权重为 25 ％。 下面介绍 MyRA 的一些指标。 ――学术人员总数，包括：外国学术人员数； ――科研人员总数； ――学生总量，包括：外国留学生数量，外国研究生数量； ――研究中心或研究所的数量。 “科研人员”的下一级指标有： ――课题负责人（ PI ）数； ――拥有博士学位者人数； ――拥有专业资格者人数； ――科研经历：分为，大于 20 年、 10 至 20 年、 10 年以下。 ――发表情况：被 SCOPUS 或 SCI 收录论文数；发表论文期刊的累计影响因子数；非 SCI 刊物论文数；撰写的图书（必须是有 ISBN 号的）章节数，等等。 ――项目经费：政府项目、来自私人机构的项目、国际项目；每一项目的收支状况； ――博士后人数； ――获得博士学位顺利毕业者人数； ――教职员工队伍中拥有博士学位者比例； ――科研人员队伍中拥有博士学位者比例； ――研究生中 CGPA （平均累计积分）获得 3 分以上者所占比例； ――研究生中获得奖学金者所占比例。 ――新增专利数； ――在案审查专利数； ――研究成果转化为新产品的数量； ――技术诀窍获得转化的数量； ――各种创收，包括培训收入、研究生学费、技术转让收入，等等； ――与国外机构签订的合作协议或谅解备忘录数量； ――教职员工中获得国际学会 fellowship 的人数； ――获得认证的实验室数； ――图书收藏总量； ――可线上阅读的图书总量。

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M$Windows的用处

blownsand 2012-11-8 10:44

除了打游戏和写Word文本，还可以上网。 另外，有一个做幻灯片的专用工具 。有些答辩或汇报通知明确规定提交PPT文件。此时不得不用微软公司的M$Windows系统和相关软件。

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安全就那么点事---安全审核/评估工具及其元素

热度 4 Greg66 2012-10-30 18:35

据我所知，目前有不少人/机构在研究组织的安全绩效评估、安全文化评估、管理体系评估（评估或者叫做审核）等，我国正在推行“标准化”评估，已经推行多年安全评价等。其实都是一回事情，都是评估组织的安全管理这个组织行为。评估时，都要设定一系列的元素，分组或者不分组，然后由专门审核员评估这些元素的分数，最后再来一个总分数作为该组织的安全管理水平。其实可以把各个元素或者元素分组的最低分数作为总分数，因为那个最低分数的元素或者元素分组就有可能导致事故的发生（也是短板原理）。所以我不赞成使用各种办法搞出一个权重，再计算加权总分的做法。如果把权重得出的数学计算过程作为研究的创新那就更加错误了和无用了，那只是纯粹的数学研究，而不是在做安全研究，现在这类文章可不少。 那一系列的元素，国际上使用的，基本不涉及生产过程的物理状况，都是关于管理（理念）、行为方式、体系组成、执行过程的等，国内的一些企业和管理人员实际上不太接受。事实上，不接受的原因是因为对安全原理的不理解。只有这些不涉及物理过程的指标体系才是个各行业、各类组织、组织内各个部分、组织内各个不同生产过程所通用的。 这些指标体系（元素）无非就是：管理者的承诺、visible leadership（忘了怎么翻译）、一切事故都可预防、员工参与、要有目标、安全与效益的关系、安全是每个人的责任等等，获得证据的方法大体有文件、访谈、现场观察等。尽管各国、各家的评估体系所用的元素及其组合、运转方式不一样，但是元素也就是这么多个，从10个到几十个不等。如杜邦用10个理念，安全文化测量系统用32个，GE用21个，澳大利亚的IFAP用的是38个、DNV用多少个不记得了。所以评估/审核指标（元素）体系大同小异。这些元素和OHSAS18000也大体是相容的或者就是来自于OHSAS18000及其相关标准的。 关于评估/审核结果的使用，各国不尽相同，有的要求评估结果、评估人/法人对今后的安全性负责，有的不要求。对于前者，谁还敢审核/评估呀？评估过程务必要坦率、客观，否则审核结果是没用的，被评估者要支持坦率、客观的审核、评估，否则对自己没好处，白花钱。被评估者一定要明白，这是为了改善自己的安全的，是为自己少发生事故，帮助自己找改进机会的，所以又为什么不支持“坦率”和“客观”呢？但是有时这种坦率和客观还就是做不到。由于体系（OHSAS18000及ISO9000等）来自于西方，中国企业使用时，必须解决文化冲突和知识冲突（加强对每条元素作用原理的理解）问题，否则达不到良好的应用效果。

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微软的开发工具

baibing 2012-10-23 15:43

1. C/C++历史介绍 C和C++名称由来 http://zhidao.baidu.com/question/25048805 2. Visual C++ 1.0：C++编译器的终结者 http://www.yesky.com/382/1858882.shtml 3. Microsoft Visual C++ http://baike.baidu.com/view/100377.htm 4.Visual Studio 提供的额外工具 （1） WinDbg 很好的 http://www.cnblogs.com/happyhippy/archive/2007/04/08/710933.html （2）spy++ http://baike.baidu.com/view/2258859.htm （3）WinDiff WinDiff是进行Windows的文件比较工具软件。　使用这个工具可对2个文件或2个文件夹中的文件进行ASCII码形式的比较,从而找出两者间的不同之处,并以显而易见方式标示出来。这一工具对于经常编一些程序、手写html文件、文本处理的用户来说是十分有用的。 (4)DataObject Viewer 能查看COM的属性（本身的） (5) Microsoft Visual Modeler 用途很大（建模工具） (6)DDE Spy 可以监视数据交换 (7)Depends 查看动态库中的函数 (8) DDE Spy 可以监视数据交换 (9) Depends 查看动态库中的函数 补充： （10） API Text Viewer 查看WIN32 API常量、声明和类型的工具 (11) DocFile Viewer 显示OLE2文件的内容 （12）Error Lookup 查看API错误码 （13）Help Workshop 这是一个可以用来创建.hlp帮助文件，编辑工程和内容文件，并且测试和发布帮助文件的工具... （13）OLE Client Test （14）ole客户端测试工具 OLE Server Test ole服务器端测试工具 OLE Tools OLE工具的帮助文件，包括DFView - DocFile Viewer，DObjView - IDataObject Viewer，IROTView - Running Object Table Viewer，OLE2View - OLE 2.0 Object Viewer的说明 OLE View 查看本机的所有已注册的COM控件 Package Deployment Wizard 帮助你创建VB应用程序的最终用户安装程序 Process Viewer 可查看本机或远程的win95,win98系统中的进程、内存使用状况 ROT Viewer OLE运行对象表查看器，可实时显示所有注册的OLE运行对象表的名称 Tracer TRACER.EXE是一个允许你设置afx.ini文件的小型MFC编程工具例子程序，它被安装在你的VC目录中，并提供了源代码，因此，捏可以rebuild它，也可以按你的需求自定义它的功能。 Windiff 用来比较路径或文件的不同，并将比较结果以图形方式显示出来 Windows NT Symbols Setup unknown Zoomin 放大显示WINDOWS桌面的区域

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[转载]关于ANSYS颜色设置

arcechen 2012-10-22 22:20

ANSYS颜色修改 总结： 1、修改背景颜色好的方法：a、先plotstrlsstylebackground 取消 display picture background 选项 或在shaded Background中选择Dark Gray，之后hard copy to file，注意选 上reverse video 选项；b、先plotstrlsstylebackground 取消 display picture background 选项 或在shaded Background中选择Dark Gray，之后redirect plotto file，注意选上选force white bg and black fg 选项；c、利用FileReport Generator；d、Utility menuplotctrlsstylecolorsreverse vedio，之后利用截图工具截图； 2、修改实体颜色，包括线、面、单元和体的颜色：Utility MenuplotCtrlsStyleColorspicked Entity Clors；恢复实体颜色：Utility MenuplotCtrlsStyleColorsReset Colors /COLOR, Lab, Clab, N1, N2, NINC 3、修改窗口中曲线、坐标轴或文字的颜色。曲线、坐标轴等的颜色可以通过PlotCtrlsStyleColorsGraph Color修改。文字大小可以通过PlotCtrlsFont Controls里面的内容修改。 4、云图打印前修改云图显示颜色黑色深浅：Plotctrls/style/colors/create color map，将彩色模块改为黑白模块，并设置不同的R\G\B，之后点WRITE按钮，即可出现黑白显示了，注意的是之前要在PlotctrlsDevice Option中选择Shading WIN32，不能选Countours WIN32C。另外最好利用Plotctrls/style/colors/Save color map，将设置的黑白模块保存一下，文件名中不能含有汉字；恢复原彩色模块：Plotctrls/style/colors/Default color map；

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爱国与工具

热度 1 smallland 2012-10-21 22:15

几十年前， 有人发现黑猩猩也会制作和使用工具，譬如树叶海棉或钓鱼（白蚁）等等， 这个发现震惊了学术界，因为人们总是觉得只有人才会使用工具，并将使用方法一代一代传承。 对于人类，工具的范畴无限延伸，任何东西都可能成为工具，比如生命、国家、领土等等。 前段时间， 地图上看不见的几个小岛就成了多个国家、无数政客和人民的工具，并且，有人利用这个工具搞打砸抢。 也有人，因此借用了另外的工具，譬如，将一个小小的国旗盖在自家汽车的“H”上--此时，小旗大概变成了fig leaf，据说能遮掩一点什么。 关于爱国， 去世不久的 嘻哈奴客 似乎也为人做了一个 榜样。作为国王，或king-father，古老皇族的传承者，自然没有理由不爱国。 当年，红色高棉掌权，他作为名义上的国家元首， 虽然没参与什么恶行，但也让红色高棉充分利用了他的影响力，此时，他就是红色高棉的rig leaf。 布尔波特及红色高棉做过什么事，许多人没听说过，我也不在这里造谣了，反正，听说，毛的引蛇出洞 ，或“自然灾害”， 或文革，对红色高棉来说都是小白菜，不值一提。这个政权 在短短几年内让国家损失了 大量人口， 几乎毁灭了整个国家 ，后来被越南消灭 。 这时，被越南解救出来的嘻哈奴客重返国际舞台， 却 为布尔波特辩解，说 柬埔寨 真正的敌人是越南。 为什么呢？在他的心里，布尔波特虽然消灭了大量的人民，但依然让他做国家元首--尽管后来被软禁，而越南侵略军不愿 让他继续当国王。 爱国主义是一种原始的情结，却常常进化成无形的工具。我们的媒体就宣称，钓鱼岛是日本政客手中的工具。我同意 ......

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[转载]知识可视化工具与视觉素养

zhengxuejun 2012-10-11 16:11

摘自：南京师范大学郭丹学位论文 知识可视化的理论基础为双重编码理论，该理论于1986年由Paivi提出，试图把语言和非语言放在同等重要的位置上，它的一个重要原则是:同时以视觉形式和语言形式呈现信息能够增强记忆和识别。知识可视化将知识以图解的方式表示出来，为基于语言的理解提供了很好的辅助和补充，大大降低了语言通道的认知负荷，加速了思维的发生。 常用的知识可视化工具有概念图、思维导图、认知地图、语义网络、思维地图。 知识可视化工具培养学生的学习能力，最终促进学生视觉素养的有效提高。 1、促进知识的整合:作为一种学习工具，知识可视化工具是以视觉化、结构化的形式表征知识，帮助学习者把握某个知识领域的全貌，理解己有概念之间的联系;帮助学习者将新知识与己有的知识联系起来，将知识融会贯通，发展对知识体系的理解;从而有助于学习者收集新知识和新信息并与他人共享。此外，知识可视化工具常以逻辑的方式去组织信息，帮助学习者消化吸收新信息、新观念，帮助学生形成完整的知识结构，引导学生抓住知识的内在联系与要领，纵揽全局，对所学的知识进行整合，从而形成良好的认知结构。 2、改变学生的认知方式:认知方式是个体对外部世界稳定的知觉形式和概念归类模式，是人们对所输入的各种信息的一种处理策略。它赋予了个体在感知、记忆、思维和问题解决的常见方式。据研究，学习者在学习过程中选择的认知方式有:记忆、规则、质疑和应用。一般认为，规则这种认知方式是进行有意义学习的较佳方式。利用知识可视化工具能较形象地展示和说明概念的含义及概念间的意义连接，有利于学生采用规则为主要认知方式，培养学生在学习新概念时，习惯采用分析概念之间的关系，并加以理解与记忆。 3、促进对话与合作:利用知识可视化工具能有效地促进学生进行合作学习并提供合作学习平台，促进学生进行对话与合作，加速学生对知识的意义建构，共同建构知识。例如，在概念图的应用中，通过引导学生对自己制作的概念图与他人的比较、讨论，小结修改、完善自己的概念图。从概念图的合作建构过程可以发现，概念图是学生对话的结果，同时，概念图 的建立也会反过来作用对话的平台，促进知识的重新组织。 4、促进学生高级思维发展与问题解决:学生在利用知识可视化工具学习时，必须搞清楚概念之间的关系及其相关程度，这实际上是要求学生在概念水平上思考问题，属于高级思维，因此利用知识可视化工具有助于这一思维的发展。它可以帮助学生整理资料、整合知识、形成概念，寻找解决办法并提出解决方案。 《知识可视化的视觉表征研究》南京师范大学博士论文赵慧臣（指导教师：张舒予） 数据可视化、信息可视化与知识可视化（ http://blog.sina.com.cn/s/blog_4b700c4c0102dr38.html ） 本体知识可视化、 信息可视化与知识检索、 一种可视化的知识组织系统Credo全球工具书大全 基于CiteSpaceII的专利知识可视化的实现机制及其应用 可视化知识前沿：科学知识图谱 学科交叉知识发现及可视化 知识普及：信息可视化 可视化与情报学

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任何网络或媒体“红人“都是某种利益群体的工具或打手

duke01361 2012-10-4 18:48

任何网络或媒体“红人“都是某种利益群体的工具或打手 这一点大家心里都有数！ 其实，一些纯文学网站或纯粹类似街头打把势卖艺的民间网站上的“红人”们除外。这些人属于江湖人士，过着闲云野鹤一样的生活，这样的人本质上属于跳出三届外，不在五行中的那么一类人。 但是，请注意，被集团利益收买或操控的网站、媒体上的“红人”，这些人的背后代表的是一股势力！ 作为普普通通，具有强烈愿望过生活的人士，切忌相信这些人的任何话语。

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[转载]鉴别DNA甲基化，总有一款工具适合你

bioseq 2012-9-27 17:45

一谈到真核遗传，众所周知基因组仅仅是个起点，此外还有表观基因组，这种可遗传的DNA和组蛋白化学修饰控制着基因组的表达。 5-mC和5-hmc DNA甲基化就是这类化学修饰中的一员，甲基化一般发生在哺乳动物基因组CpG二核苷酸中的胞嘧啶残基（5-甲基胞嘧啶/5-mC），主要集中于CpG岛和基因调控元件，与基因沉默有关。 其实人们早在几十年前就发现了DNA甲基化现象，5-甲基胞嘧啶还被称为DNA的“第五种碱基”，表观遗传学研究者们开发了大量的分子工具来追踪和分析它。然而在2009年，两组研究团队（洛克菲勒大学Nathaniel Heintz团队和哈佛医学院Anjana Rao团队）同时在Nature杂志上发表了重要文章，他们发现了另一种甲基化修饰形式——5-羟甲基胞嘧啶(5-hmC)，这无异于在生物学界投下一枚重磅炸弹。 “自2009年以来最大的变化可能就是，现在大家的研究主要集中在这些DNA甲基化变体上，”Active Motif公司产品经理Kyle Hondorp说，Active Motif公司是一家以“促进表观遗传学研究”为宗旨的美国知名公司。 在上述两篇文章中，研究人员分别在小鼠Purkinje神经元和胚胎干细胞中发现了5-hmC，5-hmC与5-mC在细胞和基因组中的分布不同，5-hmC主要集中在基因片段中。TET蛋白家族的酶对5-mC进行修饰形成了5-hmC。然而，许多传统DNA甲基化研究方法都无法分辨这两种类型的修饰，默克密理博的表观遗传学产品经理Michael Sturges说，这意味着人们需要重新审视过去几十年的一些甲基化分析。 “这说明在过去15至20年间，人们收集到的数据在一定程度上包括了羟甲基胞嘧啶事件，”Sturges的同事，默克密理博的表观遗传学研发经理John Rosenfeld说。 5-fC和5-caC 不过，遗传学字母表中可不止这六个成员，除了A、C、G、T、5-mC和5-hmC，至少还存在两种甲基化修饰类型。DNA甲基转移酶负责对真核生物的胞嘧啶残基进行甲基化。Tet1能够将5-mC转化为5-hmC，但这种酶并未就此罢手，它能够进一步将5-hmC氧化成为5-甲酰胞嘧啶(5-fC)，甚至再转化成为5-羧基胞嘧啶 (5-caC)，这一酶促通路似乎参与了去除DNA 5-mC标志的过程，Rosenfeld说。（该通路的更多信息，请参阅Active Motif的DNA甲基化指引手册。） 研究以上各种甲基化类型的方法之一就是亲和捕获。标准5-甲基胞嘧啶的传统研究方法是甲基化DNA免疫沉淀MeDIP和MIRA（methylated CpG island recovery assay），这两种方法分别利用抗5-mC的抗体和甲基化DNA结合蛋白 (MBD)来捕获被修饰的DNA片段。而现在，研究人员也同样能够使用特异性抗体对5-hmC进行研究。 目前包括默克密理博在内的许多公司都提供抗5-hmC的抗体，Active Motif当然也不例外。Active Motif将这种抗体打包在hMeDIP（羟甲基化DNA免疫沉淀）试剂盒中，用来捕获包含甲基化修饰的DNA序列。除此以外，研究者们还可以使用该公司新品Hydroxymethyl Collector™试剂盒来富集含5-hmC的DNA片段。（Active Motif也为那些对5-fC或者5-caC的研究者们提供了相应抗体。） “Hydroxymethyl Collector是我们去年发布的最引人注目的技术，”Hondorp说。 Active Motif公司的MethylCollector Ultra™ 试剂盒是利用MBD2b和MBD3L1来纯化甲基化的DNA。而Hydroxymethyl Collector试剂盒则不同，它利用了一种酶——beta-葡萄糖基转移酶（Millipore也有相应产品提供），这种酶能够特异性的使5-hmC糖基化。这种被转移的葡萄糖基是经历过叠氮化合物修饰的，它能与生物素相连，使得Hydroxymethyl Collector试剂盒中的链霉亲和素磁珠能够捕获含5-hmC的DNA片段。 使用hMeDIP和Hydroxymethyl Collector试剂盒得到的都是是DNA片段的混合物，其中每条片段中都至少含有一个5-hmC修饰。研究人员可以对这一混合物进行测序来得到整个基因组的羟甲基化信息，或者也可以通过PCR进行逐个位点的分析。当然这种混合产物还可以用于芯片分析。专门针对甲基化研究的芯片包括：美国安捷伦科技公司的DNA Methylation Human CpG Island芯片和Illumina公司的Infinium HumanMethylation450 BeadChip等。罗氏NimbleGen也有一款包括10个芯片的Human DNA Methylation 2.1M Whole-Genome Tiling芯片组合，不过据罗氏应用科学公司的市场部经理Clotilde Teiling称，由于NimbleGen准备将重心从芯片领域转到序列捕获产品，该芯片产品将于今年年底停产。 New England Biolab公司的EpiMark 5-hmC and 5-mC analysis 试剂盒也是同样利用beta-葡萄糖基转移酶对5-hmC进行糖基化。不过，这一试剂盒是根据糖基化后5-hmC和5-mC对限制性内切酶的敏感性不同来进行区分，未糖基化的甲基化位点含有对MspI(5'-C / CGG-3')敏感的序列，而糖基化的序列则对MspI酶不敏感。 此外还有一种特异性识别5-hmC的酶，限制性内切酶PvuRts1I，这种酶Active Motif也有提供。PvuRts1I与含5-hmC的DNA结合，在相应核苷酸位点（9和13）对双链进行切割，得到含5-hmC的24bp片段。用这种酶处理基因组DNA就会得到上述片段的混合物，对这种片段混合物进行测序的效果与MeDIP测序相同，都能够揭示基因组范围的5-hmC位点。 重亚硫酸盐测序 为了达到准确的bp级分辨率，研究人员还需要采取特殊策略。重亚硫酸盐测序是公认的甲基化DNA测序“金标准”。用亚硫酸氢钠处理DNA能够将未修饰的胞嘧啶转化为尿嘧啶，在DNA测序反应中最后显示为胸腺嘧啶。将该数据与未处理的DNA测序数据相比对就能够确定甲基化的位点。 然而，与其他一些甲基化分析方法一样，重亚硫酸盐也无法区分5-mC和5-hmC。不过今年早些时候，研究者们提出了解决这一难题的两种方法。 其一是Tet辅助的重亚硫酸盐测序TAB-Seq，这种方法利用TET蛋白的活性将5-mC氧化为5-caC。在用亚硫酸氢钠处理时，5-caC就像未修饰的胞嘧啶一样被转化为尿嘧啶。该方法先用beta-葡萄糖基转移酶将5-hmC糖基化保护起来。随后用TET处理DNA，使其他甲基化胞嘧啶转变为5-caC。最后再用重亚硫酸盐处理DNA。在测序过程中，所有胞嘧啶和5-甲基胞嘧啶都被读为T，而5-hmC仍然为C。将这一数据与标准重亚硫酸盐测序生成的数据相比，就能使研究人员确定哪个碱基包含何种修饰。位于芝加哥的WiseGene公司已经成功将这一技术商业化。 另一种方法是氧化重亚硫酸盐测序（oxBS-Seq），用高钌酸钾将5-hmC氧化为5-fC。在用重亚硫酸盐处理后，5-fC（就像胞嘧啶）测序读取为T。同理，将标准重亚硫酸盐处理的DNA序列与oxBS-Seq DNA序列相比对就能够区分5-mC与5-hmC。 当然，供应商们并没有忽略5-甲基胞嘧啶。用Sturges的话说，重亚硫酸盐转化是“出了名的繁琐”，需要研究人员把握好试剂、时间和温度的平衡，才能将胞嘧啶完全转化而又不影响到甲基化胞嘧啶。为此，默克密理博发布了增强版的重亚硫酸盐转化试剂盒，CpGenome Turbo Bisulfite Kit。 据Sturges介绍Turbo kit物如其名，该试剂盒采用新化学物质和优化的反应温度，将重亚硫酸盐16小时的标准转化流程缩短到了90分钟。在内部测试中，这一试剂盒的转化效率达到了99.9%，并且丝毫没有发生过度转化。 定向选择甲基化DNA 默克密理博公司还发布了可与Turbo kit配套使用的甲基化DNA富集试剂盒CpG MethylQuest。这种试剂盒用MBD2特异性捕获含5-甲基胞嘧啶的DNA，并且能够控制所收集的产物中不含未修饰的碱基或者5-hmC。 安捷伦科技公司也为甲基化DNA的二代测序提供了一款目标富集产品，SureSelect XT Human Methyl-Seq kit试剂盒。该公司基因组学业务部市场副总监Yong Yi介绍，与用于目标外显子测序的SureSelect exome kit类似，该试剂盒能够有效减少目标区域的测序成本和测序时间。 “人类全基因组测序成本高耗时长，令不少研究者望而却步，相比之下外显子测序的效率就高多了，”Yi说。“我们将这一理念应用于Methyl-Seq试剂盒，使Methyl-Seq实验更有针对性。” 该试剂盒包含120-mer RNA饵，用于捕获人类基因组CpG岛、以及“shores”“ shelves”区域中的甲基化片段。（Shores和shelves分别是指距CpG岛边缘2kb和4kb的区域，在这些区域中发现了许多差异性甲基化的序列，Yi说。）该试剂盒总共能够捕获3.7百万CpG超过84Mb序列。而安捷伦的methylation-focused DNA芯片是覆盖整个基因组的27,800 CpG岛。 “这是相当复杂而全面的设计，”Yi说。 罗氏NimbleGen不提供现成的DNA甲基化目标富集产品，但用户可以量体裁衣自行设计，公司能够为客户将2.1百万的探针混合在单个小管中，Teiling说。测序中国（ www.seq.cn ） 当然，随着表观遗传学越来越重要，扩展到的领域越来越多，也许您会被这些五花八门的技术和方案弄得有些无所适从。不用担心，自有公司能为您提供贴心又省心的服务，这些公司的专业人员提供的技术服务，能为您免去了大量的优化工作，节省宝贵的时间和精力。举例来说，Active Motif公司最近收购了GenPathway，这意味着该公司现在能够提供诸如重亚硫酸盐测序、生物信息学分析、hMeDIP等技术服务。“现在我们能够为无法自己进行这类实验和数据分析的客户提供帮助。”Hondorp说。

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几个典型的生物信息处理工具

liujd 2012-9-17 22:38

对行进行拆分： 对fasta格式拆分： 对blast比对信息提取：

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P民最傻

热度 1 StephenCatholic 2012-9-16 21:52

今天你是爱国者 明天你就是不明真相的群众 被人卖了给人数钱 平时遭受千百倍的屈辱，连P都不敢放 为了一件不知所谓的事，显起自己的男儿之驱了 科网几个粪老 拿出点真实行动来 只在电脑前动手指有啥本事 在道德至高点上站的越高，显的越虚伪。

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郑风田：不能让计划生育沦为罚款工具

zft2000 2012-9-12 12:54

郑风田：不能让计划生育沦为罚款工具 计生部门靠罚款生存的惯性思维已越来越没有市场了，不如顺应时代，转向专门为老龄社会服务，获得新生，造福社会。 新华社 9 月 10 日的消息称，宁波双独夫妻未经审批生二胎被强征 7 万抚养费， 计生部门向法院申请对这名夫妇采取强制执行措施。法官表示，符合再生育条件的夫妻生第二胎也要经过批准。该报道引起众多媒体的关注。 我国的计划生育是特殊历史阶段的产物，也曾在降低中国生育率上有所作为，但在新时代下面临着巨大的转变。计生部门如果不能够顺应时代，还沿袭惯性思维，靠片面追求罚款生存，最后的结局只能被时代所抛弃。 记得几年前与一位在县计生部门工作的朋友聊天，据他讲现在他们计生部门其实特别希望农民们超生，这让我很惊讶。因为计生部门主要任务应该是管控生育问题，怎么能够盼望农民超生呢？问其原因，原来是目前大量农民工外出打工，尤其是女同志出外打工长了见识长了，再也不愿成为生育的机器，过去为了传宗接代拚命要生男孩的超生游击队早已不见了踪影。农村自愿生一个的比例大大提高，想生两个以上的越来越少。这种生育观念的大幅度转变，可苦了过去靠超生罚款生存的基层干部。 曾经计划生育的超生罚款是地方一大稳定收入，不曾想农民兄弟进城后，也学起了城里人不愿意多生，要少生优生。但已习惯于靠罚款生存的干部们就陷入财政困境，不少穷地方当地干部工资发放一直是个大难题。于是乎，盼望农民超生而后获得超生罚款成为一些计生部门的奇怪生存逻辑。 计生部门虽然在城市少人问津，但在乡镇部门一直是很抢手的位置，原因就是可以超生罚款，给当地紧缺的财源带来补给，而且罚款的幅度还有很大的弹性。超生的抚养费名字也叫得怪怪的，究竟这个费用抚养了谁 ? 这个悲摧的结论真是让人惊奇：计生部门本是因为控制生育量而设计，最后却沦落为超生而罚款创收的工具。这样的故事其实也并不少见，部分环保部门的工资就是靠排污费罚款，如果企业都遵循排污标准达标了，环保部门的生路就成了问题。 目前我国已提前进入老龄化社会，取消一胎政策已成为社会共识，但却迟迟得不到实施。究其原因，最大的阻力应该来自计生部门。其实也不难想象，一胎政策一旦实施，受影响最大的部门当属计生部门，这个部门能否继续存在都应该是一个大问题。所以遇到抵抗，拖延实施都是预料到的结局。 其实计生部门除了罚款之外还是可以大有作为的。随着我国老龄化的到来，把计生局改为老年局，专门应对老龄化社会问题，这样的转型潜力其实很大，这样的方向才是计生工作的未来所在。 现在北京一个好的养老院据说要排数十年的队，差的养老院让人恐怖，有人戏言：如果让一个老人早点死就把它送到养老院去吧。种种养老问题，说明中国一直没有为老龄化社会准备好。当大批 50-60 年代婴儿潮到退休养老高峰时，这个社会准备好了吗 ? 老人服务是一个很大的朝阳产业，未来老人数量庞大。计生部门真的应该从罚款依赖症中解放出来，把工作重点从产前罚款发放准生证的“入世”转向老年人“离世”的后期服务上，多建些养老院，多培训些为老人服务的家政人员，多提供着优质的老人服务，潜力要比超生罚款大很多。现在老人基本上也都是有产阶级了，大部分都有房子，过去是家庭养老，养儿防老。现在独生子女政策实施多年，出现一些不孝之子并不少见。如果老人把财产交给社会能够换得一个好的养老，其实对过去的养儿防老是一个大的替代，潜力很大。记住去江西最美的村庄参观时，当地的领导人正在规划这个朝阳产业，他们希望建一些好的养老院，让北京、上海的退休老人来住 ，入住的条件就是老人们在北京、上海的房产可以交由他们出租打理。山清水秀风光好，退休后的老人再也不用每日赶着上班，逃离大都市，到环境好的地方养老，这个创意很好。其实这样的机会很多，生计部门如果把中国的老年人产业规划好了，定会大有作为。比起现在的小打小闹罚款，前途大多了。

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生物医学知识发现工具

热度 1 xupeiyang 2012-8-23 12:36

常用的生物医学知识发现工具有以下三个平台，各有特色，都是免费的，科研人员在科研工作中应该多多使用。 在我的博客知识发现栏目里有大量实例，可以参考。 http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=spaceuid=280034do=blogclassid=115378view=mefrom=space Arrowsmith http://arrowsmith.psych.uic.edu/cgi-bin/arrowsmith_uic/start.cgi BITOLA http://ibmi.mf.uni-lj.si/bitola/ Anne O'Tate http://arrowsmith.psych.uic.edu/cgi-bin/arrowsmith_uic/AnneOTate.cgi 知识发现智慧老人 （见图）

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【翻译】RNA结构预测工具PPfold 3.0

Bearjazz 2012-8-16 07:55

RNA 结构预测工具 PPfold 3.0 熊荣川 译 六盘水师范学院生物信息学实验室 xiongrongchuan@126.com http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz 随着物理方法测定的 RNA 结构数据越来越丰富，以及 RNA 初级、高级结构之间关系研究的深入，现在涌现出一大批基于系统发生和已有 RNA 结构数据库来预测未知 RNA 结构的生物信息学方法，相应也产生了学多软件工具，下面简单的介绍其中一款软件 PPfold 3.0 。 PPfold 3.0 一款基于 Pfold 算法的 RNA 二级结构预测工具软件，是 PPfold 的升级，更丰富了既有 RNA 结构的参考和算法的优化。该软件为 java 程序，不依赖任何操作系统，可以到以下地址下载安装使用。 http://birc.au.dk/software/ppfold. 原文： PPfold 3.0: Fast RNA secondary structure prediction using phylogeny and auxiliary data Zsuzsanna S¨uk¨osd 1 ; 2 ; 3 _ , Bjarne Knudsen 4 , Jrgen Kjems 1 ; 2 , and Christian NS Pedersen 3 ; 5 ABSTRACT PPfold is a multithreaded implementation of the Pfold algorithm for RNA secondary structure prediction. Here we present a new version of PPfold, which extends the evolutionary analysis with a exible probabilistic model for incorporating auxiliary data, such as data from structure probing experiments. Our tests show that the accuracy of single-sequence secondary structure prediction using experimental data in PPfold 3.0 is comparable to RNAstructure. Furthermore, alignment structure prediction quality is improved even further by the addition of experimental data. PPfold 3.0 therefore has the potential of producing more accurate predictions than it was previously possible. Availability and Implementation PPfold 3.0 is available as a platform-independent Java application, and can be downloaded from http://birc.au.dk/software/ppfold. Contact Zsuzsanna S¨uk¨osd, zs@birc.au.dk.

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[转载]分析类工具 3

icstu1 2012-8-13 10:39

这些有用么？ 绿色营销.doc 马尔科夫转移矩阵法.doc 内部环境--SWOT 分析法（常用工具）.doc 情境服务.doc 微笑曲线.doc 问卷法.doc 五种力量模型.doc 相互关系有向图.doc 因果图法.doc 续完。 希望支持和补充。

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[转载]分析类工具 2

icstu1 2012-8-13 10:33

续 公司业务组合矩阵1.doc 关系营销1.doc 决策七步法.doc 决策树.doc 雷达图.doc 利益相关者分析.doc

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[转载]分析类工具 1

icstu1 2012-8-13 10:31

如果对你有用请支持一下：） 5W1H分析法（常用工具）.doc SWOT分析法（常用工具）.doc 定位营销.doc 服务营销1.doc

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新《要真正的党员书记，不要造假团伙的工具和镖师》

热度 2 cyj 2012-8-2 20:24

新 《要真正的党员书记，不要造假团伙的工具和镖师》 《焦点访谈》曝光时承认李连生造假，一转身在北京又说“泰德公司出具了假经济效益证明，造成李连生上当受骗”的党委书记，能把交大教育成为老实诚信不造假的大学吗？ 到处宣扬对待作假“从来严肃果断，查明有教师造假的，立即清除出教师队伍”的王建华，却只给李连生留党察看一年的处分，帮腔偷偷摸摸不保送到合肥，继续二级教授待遇；把束鵬程御封为与造假无关的好人， 而且，通通采用“不向全校师生做一个字的交代 ” 的手法处理。 整个 5 年来，学校发生了李束长期的、多方面的弄虚作假，名扬海内外，震动党中央和国务院。 学校当局居然没有向全校师生做一次报告，告诉老百姓：“这是怎么回事？学校当局做了什么？为什么李连生偷偷摸摸走啦？为什么束鹏程没事人一样？为什么 5 年来学校当局从来没有给群众介绍一点点事实真相？” 王建华完全像封建社会的皇帝处理宫女太监一样不需要告知任何人。王建华是皇帝吗？西安交大全校师生是蝼蚁和草芥吗？ 一个没有党性，没有善恶，没有是非，没有信誉，没有国家需要，没有社会责任感，只有低级趣味的普通人， 一个将造假分子当宠臣亲信交大的台柱子，将全校师生员工当奴隶的造假后台，有什么资格要将西安交大桎梏至死才松手？ 全体西安交大的师生员工们，用实际行动把这个毁坏了母校风气和声誉的瞎眼舵手，送到养老院去颐养天年去吧！西安交大是全国人民的大学，不是王姓的家私！我们要做中国人民的好儿子，不做王氏家族的奴隶！ 我们建议：全校师生员工，向王建华提出一个起码的要求：- 对李连生束鵬程持续十几年的，多方面的造假事件，对惊动全世界的造假事件，到了向全校师生员工，做一次交代的时候了！ 我们是西安交大的主人，不是王建华的奴隶，王建华不是封建社会的帝王，他有责任而且早就到了向我们做一次交代的时候了！事件已经5年了。王建华不做报告进行交代，就引咎辞职！ 博主 2012 年 8 月 2 日 博主2012年8月6日附言：近日中央电视台白岩松在《奥运1+1》节目中，为林丹获得奥运会羽毛球男子单打冠军，总教练李永波激动万分将林丹压倒在地，并且he3林丹热情亲吻，做了“良师益友”的总结，并且因此有感而发，说是“如果是一头狮子带着一群羊打仗，这一群羊都会像狮子一样；反之，羊带着一群狮子，狮子也会变成羊。” 这个比喻，令人越发的不安。西安交通大学具有百余年悠久的光荣史，如果教育部，硬是让这位藏污纳垢与造假分子狼狈为奸的，不如普通人的王建华继续带领西安交大，恐怕他会像2011年3月在北京冲着媒体，不停顿地大叫“我们照样”弄虚作假，“照样”欺骗国家愚弄人民群众的！造假团伙造假事发5年后，王建华口口声声“照样”“照样”。西安交大全校师生员工却没有一个真正的人，接受他部队“照样”！ 既然王建华一伙，要“照样”，我们就打假不停！

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[转载]人类已能有效遏制艾滋病疫情 “无艾滋一代”有望实现

xuxiaxx 2012-7-29 13:20

美国国家过敏和传染病研究所所长安东尼·福奇在世界艾滋病大会期间接受了新华社记者的专访。他说，我们拥有约30种抗逆转录病毒药物构成的医疗工具，如果联合使用，就能挽救生命，使获得治疗的人们活得更健康，更有质量。 　　福奇说，除改善健康，抗逆转录病毒药物还能大幅降低感染者将病毒传染给性伴侣以及孕妇传播给婴儿的机会，在预防和治疗两方面都拥有巨大潜力。 　　据福奇介绍，生理学基础的干预模型结果令人鼓舞。例如，男性包皮环切在一些艾滋病高发国家逐步推行，这一简单手术被证明能有效、持久保护异性恋男子免受艾滋病病毒感染。如果配合以避孕套和其他预防工具，包皮环切术能给我们带来减少新发感染的巨大希望，特别是在艾滋病高发而环切术比例较低的非洲国家。 　　他认为，这些进展为人们提供了预防和治疗干预的强有力工具，目前需要做的是协作努力，更好地使用这些已被证明有效的干预工具，使“无艾滋病一代”的目标真正成为现实。这就需要增加财政资源、创新、政治意愿和对抗歧视等多方面的努力。 　　数据显示，全球死于艾滋病的人数在2005年达到230万的峰值，到2011年，这一数字已降为170万。自1995年以来，全球已有1400万人的生命因为抗逆转录病毒药物而得到挽救。 来源：人民网

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[转载]Sigmaplot-科研工具之图表制作

caity2008 2012-7-29 08:51

Sigmaplot-科研工具之图表制作.ppt Sigmaplot论文简易幻灯片版本-答辩用.ppt

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[转载]管理类工具 2

icstu1 2012-7-24 15:32

六西格码质量管理方法（常用工具）.doc 客户关系管理.doc 乔哈里资讯窗.doc 情境领导.doc 头脑风暴法（常用工具）.doc 因素比较法.doc 鱼骨图法（常用工具）.doc 约束理论.doc

个人分类: E 请教专家看法和学习的访谈|951 次阅读|0 个评论

[转载]管理类工具 1

icstu1 2012-7-24 15:21

希望您支持 补充 共享 谢谢 4P营销组合.doc PDCA循环图1.doc 访谈法（常用工具）.doc 管理方格图.doc 绩效工具.doc 九型人格工具（常用工具）.doc 矩阵图法.doc 4c营销组合.doc

个人分类: W 学生的生活指导|732 次阅读|0 个评论

[转载]计划类工具

icstu1 2012-7-24 14:25

或许对你有点帮助：） 待续 ABC法则.doc 工作计划表（常用工具）.doc 目标多杈树.doc 时间管理（常用工具）.doc 时间管理的5W2H（常用工具）.doc

个人分类: M 用图表或数据呈现的成果|847 次阅读|0 个评论

[转载]地图工具

lidongxuan 2012-7-12 08:05

地图工具 Google 地图和 Google 地球 Google 地图毫无疑问是最常用的网络地图工具，整个世界巨细无遗地展现在你的眼前。 Google 地球可以让你以 3D 视角自由观察地球的每个角落。从可视化的角度而言，这些工具的真正价值来源于它们的相关 API （ Google Maps API 、 Google 可视化 API ）以及与 KML 数据的结合。你可以把你自己的可视化数据叠加在 2D 和 3D 地图之上。 精彩案例和站点： Google Earth Tutorials | Google Maps Tutorial | Thematic Mapping | GMapCreator ArcGIS ArcGIS 是 ESRI 发布的一组功能强大的地图工具。这些产品允许你通过桌面软件将数据层整合到地图、 3 维地球以及其他模型上，并发布到浏览器或移动设备上。对于开发者， ArcGIS 为你提供了构建带富交互应用的 API ，这些应用以 JavaScript ， Flex 或 Silverlight 的形式呈现，可以嵌入网页，也可作为独立的网络应用发布。 更多信息 | 免费软件，付费许可 | 标签 : 桌面版，网络版， API 精彩案例和站点： ArcGIS Desktop | ArcGIS Web Mapping | ArcGIS Explorer | Gallery GeoCommons GeoCommons 可以使用户构建富交互可视化应用来解决问题，即使他们没有任何传统地图工具使用经验。你可以将实时社会化数据或者 GeoCommons 保存的超 5 万份开源数据在地图上可视化，创造带交互的可视化分析作品，并将作品其嵌入网站，博客或分享到社交网络上。为开发者提供了 API 扩大了 GeoCommons 的应用范围， GeoIQ 扩展了 GeoCommons 的功能，提供更好的安全保障，企业级大数据支持以及更强的地理位置分析功能。 更多信息 | GeoCommons 为免费软件， GeoIQ 需付费许可 | 标签 : 交互，网络版，数据集， API 精彩案例和站点： GeoIQ | User Manual | IssueMap OpenHeatMap OpenHeatMap 简单易用，用户可以用它上传数据、创建地图、交流信息。它的开发者是 Pete Warden ，与 OpenStreetMap 的地图数据很好地兼容。它可以把数据（如 Google Spreadsheet 的表单）转化为交互式的地图应用，并在网上分享。它为开发者提供了 JQuery 插件，可以方便地利用开源地图组件来构建 Flash 或 HTML5 Canvas 应用。 更多信息 | 免费软件 | 标签 : 电子表格，交互， JQuery 精彩案例和站点： Gallery | Documentation Indiemapper Indiemapper 自称是一种更智能、易用、优雅的数据热力图可视化工具，弥补了数据和地图之间的鸿沟。它是网络应用，用户上传数据，定制地图交互，就能以矢量图或点阵图的形式导出静态图片。 Indiemapper 的最大特色就是其便捷的用户体验，用户无需面对无数的地理信息系统函数，只需轻点几下鼠标，就能轻松地得到漂亮的热力图。 更多信息 | 付费软件，有试用版 | 标签 : 便捷， KML ，交互 精彩案例和站点： Gallery | System information | FlowingData Review InstantAtlas InstantAtlas 是非常好的地理统计数据可视化软件，特别适合信息分析员和研究者试用。除了实现可视化交互，它的最大特色就是能提供统计报告，将统计数据和地图数据结合，帮助使用者进行决策。各种特性和报表功能使它成为处理这类可视化难题的强大工具。 更多信息 | 付费软件，有试用版 | 标签 : 桌面版，网络版，交互，合作 精彩案例和站点： Products | Tutorials and Support Zone | Single Map Examples | FlowingData Review Target Map TargetMap 由巴塞罗那的 MapGenia 小组开发，致力于简化数据地图的开发和分享，允许任何人和组织在世界地图上展示他们的数据，并通过在线社区和作品相册分享他们的作品。 更多信息 | 免费软件 | 标签 : 社区，嵌入式 精彩案例和站点： Blog/Help TileMill TileMill 是基于开源技术的现代地图设计软件。它是地图制作工具，可以方便地将地理数据来定制网络地图，并加上可视化交互。它的最终作品融合了 Google Maps API ， OpenLayers 以及其他开源项目的技术。 更多信息 | 免费软件 | 标签 : 开源， KML ， Mac/Ubuntu 精彩案例和站点： Manual | TileMill Announcement | MapBox | TileMill: Open Source Map Design Polymaps PloyMaps 是基于 SimpleGeo 和 Stamen 的开源项目，提供了能在现代浏览器中构建动态交互应用的 JavaScript 库。它能快速显示多层次地理数据，实现矢量数据的平铺。因为 Polymap 支持各种规模的数据，所以可以用它显示从国家到州、城市、社区、街道的信息。 更多信息 | 免费软件 | 标签 : JavaScript, 交互，嵌入式 精彩案例和站点： Examples | Documentation Color Brewer Color Brewer 的功能与以上工具有点小差异。你可以用它来测试色彩系统，特别是创建区域热力图时。一套好的取色系统能使你的地图可视化更准确直观地传达信息。 更多信息 | 免费软件 | 标签 : 色彩应用，地图设计 精彩案例和站点： Academic Paper | Cynthia Brewer | TypeBrewer 其余值得关注的工具…… Dotspotting | Dotspotting 是开源工程 Stamen 的第一个项目，作为 Citytracking 项目的一部分发布。 Citytracking 由 Knight News Challenge 资助，致力于帮助人们收集城市数据，并使数据易于理解。 DataMaps.eu | DataMaps.eu 为可以让你将复杂的地理数据转化为易于理解的可视化应用，而无需任何编程技巧。 GeoTime | 这个获奖可视化分析工具强调了可视化展示的作用，为不同时间发生的事件提供了新的可视化展现形式，并能挖掘出你的数据中的统计属性。

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论文阅读——生物信息学资源组学(Resourceome)

llt001 2012-6-28 08:56

【论文阅读笔记，Leiting, Jun 27, 2012】 A decade of web server updates at the bioinformatics links directory: 2003–2012 Nucl. Acids Res. (2012) 40 (W1): W3-W12. doi: 10.1093/nar/gks632 因为数量的大量增加，对于生物信息学的研究人员来说，跟踪生物信息学工具和数据库变得越来越困难，因此，根据内容和用途建立一个生物信息学算法、数据库和文献的索引变得越来越重要。 而 Bioinformatics Links Directory 的建立便是用于解决这个问题。这个目录收集了序列资源(Molecular resources)、工具和数据库的链接，并分成了 11 个大类，和若干小类，共 134 个资源 (Resources)，455 个数据库 (Databases)，和 1205 个网络服务器工具 (Web server tools)。 11 个大类是： Computer Related DNA Education Expression Human Genome Literature Model Organisms Other Modules Protein RNA Sequence Comparison

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[转载]又出现一个“汤森路透 ”和“新版3.1” ？

icstu1 2012-6-14 13:44

NoteFirst Ver3.1 （发布日期： 2012-5-30 ） · 增加 RSS 导入导出 OPML 。 · RSS 中相同资讯的自动过滤。 · RSS 智能历史记录清理，可自动删除无用的历史记录。 · 文献全文批量下载同步。 · 科研协作系统中用户体验的改善。 · 进一步提升效率。 · 修复已知 Bug 。 软件下载 : http://www.notefirst.com/download/data/NoteFirst_Full.zip http://www.notefirst.com/download/ NoteFirst 文献管理软件视频演示教程 http://www.notefirst.com/faq/default.aspx?id=0pxfaq 破解版 *NoteFirst.rar 另： NoteExpress NoteExpress 是 北京 爱琴海软件公司 http://www.AegeanSoftware.net ) 开发的一款专业级别的文献检索与管理系统，其核心功能涵盖 “ 知识采集，管理，应用，挖掘 ” 的知识管理的所有环节，是学术研究，知识管理的必备工具，发表论文的好帮手。 Noteexpress教程.ppt 本人尚未使用！ 所以没有评论。 但可以作为“替代工具”一试， 毕竟竞争对于客户来讲是一件好事。 EndNote简介 EndNote 的个人文献管理功能 收集资料 资料整理 全文管理 EndNote 的写作功能 写作模板 边写作边引用 格式化论文 常见问题 提问与解答 见： http://il.las.ac.cn/index.php/%E5%88%86%E7%B1%BB:EndNote http://www.mediawiki.org/wiki/MediaWiki http://il.las.ac.cn/skins/common/images/poweredby_mediawiki_88x31.png

个人分类: H 发现有用文章的推荐、摘录和指向链接|1309 次阅读|0 个评论

剪刀用的挺溜的，你知道剪哪里吗？

pfdragon 2012-6-6 13:22

总是有人纠结与技术和工具， 什么叫会。会用工具就叫会吗？学会了工具就算毕业了。在现代化技术装点和软件技术装点下工具看起来比刀子剪子斧头复杂多了，所以学会一个工具似乎就变成了神奇的事情，也导致了大批量的学生天天教着巨额学费到处去学工具了。学完就等着老板因为会用工具而用钱拍他脑袋了。 到处踱着步子昂着脑袋，提着自己那两把剪子走来走去，街上四处看看，这个店不行，那个庙不进的。进去对不起那两把明晃晃的名牌剪子。 会用剪刀就是理发师?会用剪刀就是设计师？会抡勺就是大厨？会写博客就是作家？ 别扯了。。。 满街都是说自己带才的人，都是拿着剪刀不知道剪哪的水平，具有机械功能不具有智能功能。 每次招聘都像看惊悚片，每次带人都像托儿所，还颇好意思给自己标价 。 同意名人所说的中国没有培养人才，仅仅不同意最后一句，谁说女子不如男！

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晶体结构数据工具网页

orlando 2012-5-29 17:29

晶体结构数据工具网页 http://www.cryst.ehu.es/ 包括用对称群给出原子坐标（ WYCKPOS Wyckoff Positions of Space Groups ）， 布里渊区高对称点（ KVEC The k-vector types and Brillouin zones of Space Groups ）， 等数据库。

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好像也有个中文分词工具

edwinuestc 2012-5-18 16:21

http://alias-i.com/lingpipe/index.html 总之这个网站上信息较多 给人比较靠谱啊 http://www.sighan.org/bakeoff2003/ 更多信息请查看 http://www.sighan.org/ 论文吧 http://aclweb.org/anthology-new/ 斯坦福大学的 感觉怎么源码都比较大啊 还没有下载成功 玩一玩 http://nlp.stanford.edu/software/index.shtml

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mayo的自然语言处理工具

edwinuestc 2012-5-18 15:42

http://orbit.nlm.nih.gov/resource/ctakes http://sourceforge.net/projects/ohnlp/ 好像是被墙了的

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[转载]SCI文章写作与相关资料、工具等（不定期更新）

jiaaniu 2012-5-13 09:03

来源 1 http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=3748553 1.StyleWriter （润色首推） 嵌入 word 使用。主要功能：检查拼写、语法等错误，润色文章。 本软件的诱人之处在于润色文章，可以有提示你对同义词做选择，让你的文章更地道。 http://www.editorsoftware.com/downloads/DWSWT.html 另外还有统计文章特征的功能，详见李泳老师的博文：从 Stylewriter 看英文写作 2.Triivi （检查首选） 英文输入软件，免费开源，具备词频调整、智能纠错，根据已经输入的字母猜出想写点词或短语，提高英文输入速度！标准版具有 50 万词汇量 , 专业词库 ( 约 20 万词汇 ). http://www.triivi.com/ 3.Intellicomplete( 推荐 ) 虽没有 triivi 专业词汇丰富，但定义性较强，且自定义语库方便，只需要一个快捷键 Ctrl+Alt+J 。 http://www.download.com/IntelliComplete/3000-2079_4-10062169.html 4.As-U-Type 是一款英文输入单词自动校正软件，根据软件自带的和自定义的校正词典，当你编辑文档输入的单词有误是，它会自动帮你校正。 此软件是在输入后按空格键后给出提示，没有实时提醒功能，这个很遗憾。 http://www.asutype.com/files/asutype-setup.exe 5.TypeTip 与 As-U-Type 功能雷同的辅助录入软件，具有实时提示及校正功能，但不能输入词组 phrase, 不过兼容性较好。 http://www.sharewareconnection.com/typetip.htm 6. 金山写作助手 金山词霸自带工具。编写英文文档时，常常会遭遇当前语境不知该用哪个单词的尴尬，这时你会怎么办？打开词霸查找一通？哦，那太麻烦了。其实最简单的方法，是快速按动两下 Alt 键。这时词霸将自动弹出一个特别设计的 “ 写作助手 ” 模块，试着输入一下中文词汇吧。看到了吗？软件将自动弹出一组与搜索词对应的英文单词，如果感觉片面的解释无法帮助判断，还可以继续输入一个 “ 分号 ” ，这时 “ 写作助手 ” 将会在翻译结果中自动加入精选例句。 7.Bullfighter 可用作微软 Word 和 PowerPoint 的插件 ( www.fightthebull.com/bullfighter.asp) ，不过它只能在 Windows 操作系统中运行。 Bullfighter 的目标是找到并且删除你文章中那些难懂的部分。 8.whitesomke, WriteExperss 虽然 WhiteSmoke 也向中国和印度的母语非英语者推销这款产品，但公司表示他们最大的目标客户群仍是那些想让自己的文笔变得典雅一些的以英语为母语者。 http://www.jz5u.com/Soft/teach/waiyu/13557.html 来源 2 http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=3669411 各位虫友们，各位科研工作者们大家好，对于大家来说成果最后都是要通过文章来表现出来，为了让更多的人了解自己的成果，所以科研论文写作，尤其是外文科研论文的写作显得尤为重要。下面由我向大家推荐本版关于论文写作的一些优秀的帖子，其中包括中外大牛或大数据库机构对论文写作的经验和建议。 1 ，首先是国外的一些大牛们的宝贵的经验和建议，帖子如下： 【教程】大牛教你写论文（哈佛大学）； http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=3514631fpage=1 【素材】从科研到写作（国外教授教你如何写论文）； http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=3484927fpage=1 【课件】如何写科技论文（哈佛大学）； http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=3390211fpage=1 【素材】如何写论文（剑桥大学）； http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=3572060fpage=1 2 ，接下来是一些著名的论坛和数据库们的经验和建议，帖子如下： 【教程】 Secrets to Writing Better Scientific Articles （ ACP ）； http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=3665940fpage=1 【素材】 Paper 论文实用手册（上海交大 BBS ）； http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=3663948fpage=1 【课件】 Writing for Success ； http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=3227958fpage=2 3 ，然后就是一些关于论文写作的分步解析和常见问题解析，帖子如下： 【课件】如何写好一篇 SCI 论文的题名 SCI 高被引论文题名分析； http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=3437674fpage=1 【素材】科技论文写作分步解析； http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=3538342fpage=1 【课件】论文常见问题及成因辨析； http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=3637978fpage=2 4 ，然后就是关于英语写作和翻译方面的一些心得和建议，帖子如下： 【素材】科技英语翻译和写作； http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=3568684fpage=1 【教程】中国人英文可以论文最容易犯的 200 个错误； http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=1094989fpage=2 【素材】英文论文写作 - 很不错的； http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=1651857fpage=2 【教程】英文文章的写作心得分享； http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=3420259fpage=2 5 ，最后是一些英语论文写作的惯用句式句型和一个英语写作的润色软件，帖子如下： 【素材】写外文论文的一些惯用句式； http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=3437640fpage=1 【素材】写英文论文常用句型； http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=3482914fpage=2 【原创】强烈推荐一款英文润色软件 WhiteSmoke2010 带破解方法； http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=2290563fpage=2 以上内容仅为个人推荐，想要获取更多更好的科研素材精华资源，请链接到下面的地址： http://emuch.net/bbs/forumdisplay.php?fid=300view=digest 。 来源 3 http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=1329206fpage=1 小弟不才，迄今才撰写了三篇英文文章，但写作过程中也积累了一点经验，不敢敝帚自珍，今天也斗胆向各位虫友贡献一下。我这几篇文章，不论内容如何，但每次审稿人对于语言的评价都是还不错的， well written ，总结起来不外有三个小窍门： 一是平时多积累。我在日常读文献的时候，如果发现很好的句子句式，都会记录在一个文档里面，如下面的一段话，就是我在一篇文章的摘要中发现的： This paper describes the concept of sensor networks which has been made viable by the convergence of microelectro-mechanical systems technology, wireless communications and digital electronics. First, the sensing tasks and the potential sensor networks applications are explored, and a review of factors influencing the design of sensor networks is provided. Then, the communication architecture for sensor networks is outlined, and the algorithms and protocols developed for each layer in the literature are explored. Open research issues for the realization of sensor networks are also discussed. 文章用词忌重复，中文如此，英文亦然。特别是动词的使用，如在一段话中出现了几个相同的动词，感觉文章就跌价不少，而如果用了几个意思相近而又贴切的词，自然就会增色几分。如上文中的 describe ， explore ， provide ， outline 和 discuss ，就使得文章有了文采，值得学习和收藏。坚持收集例句，素材多了，自然自己的造句的时候就有底子了。此外，还要注意，在收集例句的过程，随着例句的增多，也需要对例句进行整理和分类，方便学习和检索。 二是注意行文中 Transition words 的使用。 Transition words 就是在行文过程中，连接意义相关句子的词，如 Therefore ， thus ， in particular 等等。使用这些词，会使得文章连贯性好，逻辑性强，读起来一气呵成，自然会给审稿人好印象。下面是一个关于 Transition words 的一个总结，供各位虫友参考： Transitions Study Sheet Transitions for time: before, afterward, after, next, then, as soon as, later, until, when, finally, last, meanwhile, during, at times, sometimes, oftentimes Example: WWII broke out in Europe in 1939. During this time the United States remained neutral. It wasn’t until 1941, after Japan bombed Pearl Harbor, that the United States entered the war. After its entry, it was only a matter of time before the Allies defeated Germany and the Axis powers. Transitions for place: in the background, in the distance, beyond, behind, above, below, in front of, elsewhere, in the middle, to the left, to the right Example: My favorite painting is Botticelli’s Birth of Venus. In the middle of the painting stands Venus, the Roman goddess of love, standing on a seashell. She floats majestically above the beautiful water below her. To her left a figure representing wind blows fierce clouds of wind in her direction. To her right a figure behind her attempts to cover her with a blanket and protect her. It is a truly breath-taking piece of art. Transitions for examples: for example, for instance, as an example, like, specifically, consider as an illustration, that is, such as, similar, similarly Example: Oftentimes people who study from history fail to learn from the mistakes of the past. For example, during WWII Hitler decided to invade Russia just before wintertime. This decision was the same decision Napoleon made over a hundred years earlier, and Hitler’s army met a similar fate. Had he learned from his history, Hitler might have avoided making this costly mistake and the outcome for the war might have been different. For instance, if Hitler had decided to invade England by sea rather than Russia by land, he might well have won the war. Transitions for emphasis: chiefly, equally, indeed, even more important, in particular, most important, without a doubt, indubitably, unquestionably, definitely Example: Without a doubt, Chinese food is one of my favorite cuisines. Although I find Japanese and Thai food equally delicious at times, Chinese food is definitely my favorite Asian cuisine. In particular I enjoy the spicy Szechuan style of cooking commonly found in Chinese food. Transitions for restatement: in short, that is, in effect, in other words Example: When I asked my girlfriend to marry me she said, in effect, that she wouldn’t be ready for marriage until after she completed her PhD program. At first I was crushed, that is, I felt like she said no because she didn’t love me anymore. However, after she explained her reasons to me I felt better and agreed with her. In other words, I came away feeling better than I had anticipated. Transitions for comparison: similarly, likewise, also, the same as, different than, opposite, unlike, instead Example: When my older brother was deciding where to go to college he spoke to my father about where he should go. Not surprisingly he went to the same school my father did, MIT. When it was time for me to choose a college I did the exact opposite. I didn’t ask my father where I should go, and as a result, I didn’t also go to MIT like he and my brother did. Instead I went to UCLA. Transitions for concession: although, of course, admittedly, true, doubtless, granted that, no doubt, indubitably, without a doubt, definitely, certainly Example: Some people might be surprised to learn that the two most successful NBA teams of all-time are the Boston Celtics and the Los Angeles Lakers. Although neither of these teams is very good right now, they are the two teams with the most champions in NBA history. The Celtics definitely had the best streak of these two teams; winning eight championships in a row at one point. Admittedly there is always the chance that some future team could break this record, but this seems unlikely. Of course no one can predict the future with any certainty. Transitions for consequence: thus, so, then, it follows, as a result, therefore, hence, consequently, accordingly, because Example: I’m sorry, but I can’t let you turn in your homework late because it wouldn’t be fair to the other students. As a result your grade has dropped lower and you are now failing the class. Consequently you need to get 100% on the final so you can pass the class and then graduate from CAS. Therefore, I suggest you study very hard so I don’t have to fail you. Good luck! Transitions for conclusion: to sum up, in summary, finally, therefore, thus, in conclusion, to conclude Example: Finally, Beijing has a lot of nice places to shop that appeal to tourists. To sum up then, Beijing is a wonderful place to visit because it has beautiful parks and historical monuments, friendly people and lots of nice places to shop. Thus any travelers who are planning to come to China should definitely visit Beijing during their stay. Transitions for addition: furthermore, in addition, besides, next, first, second, moreover Example: UCLA is a wonderful university to attend as an undergraduate. First, it is respected academically and is well-known for its high standards of education. Furthermore, UCLA has a strong network of alumni who often recruit students to come work for them. Moreover students who do such work as undergraduates often receive jobs with these same companies once they graduate. In addition to these two benefits, UCLA also has exciting sports teams that are fun to watch. Besides, with so many good reasons to go to UCLA, why would you want to go anywhere else? 我的第三条经验就是句酷网站， www.jukuu.com ，一个专门找例句的网站，也许有些虫友也知道。我们写文章的时候，很自然会想到一些中文的表达方法，但是常常苦于找不到贴切的英文表达，查电子词典，往往凑出来的句子也是面目全非。句酷网站提供了一个很好的查找例句的渠道（不是广告奥，呵呵），你可以通过中英文关键字，找到很多例句。比如，我想说 “ 值得指出的是 ” ，在句酷里面查了一下，找到了如下几个句子： It is worth emphasizing that... it is worth pointing out that ... A point worth emphasizing is that... 感觉都还不错，都可以选用。更为关键的是，这些例句一般都会有出处，这样就可以根据例句内容和出处来选择比较地道的表述了。我的一个经验是，对于来自 cnki.net 的例句就得小心点，这些都是国内兄弟写的文章中的句子，常常不是很合适。 今天起得早，又睡不着，写这点东西，希望能对大家有一点点启发。上个月自己的第一篇 trans 的 minor revision 刚刚投出去，这些天一直在焦急的等待中，写点东西与大家分享，也顺便给自己祈祈福。第一次在小木虫写帖子，希望大家能喜欢，欢迎大家一起讨论，批评指正，谢谢！

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[转载]COBALT：NCBI在线蛋白多序列比对（比ClustalW还强大的工具）

charles08 2012-5-10 08:53

COBALT 是一个蛋白的 多序列比对 工具，其实用法跟 ClustalW 是很像的。算法应该是不一样的。在我看来，COBALT是应该更加精确的。因为COBALT在多 序列 比对的同时，也用到RPS-BLAST, BLASTP, 和PHI-BLAST等工具，并且也用到了conserved domain database (CDD) 和PROSITE protein-motif database来保证COBALT比对结果的质量。最后比对的结果可以生成 系统进化树 。COBALT算是 NCBI 在线Blast功能的一个的延伸。 COBALT的用法与结果分析 在线COBALT的网址可以在 NCBI 在线Blast的主页能找到或是直接用下来的网址： www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/cobalt/ 进入COBALT的界面如图1-A所示，跟Blast的界面是相似的，比较简单，也是用 Fasta 格式的序列，这里就不多讲了。在最下面”Advanced parameters”也可以设置比对的参数，一般来讲，默认的参数是保证结果质量和比对速度最优化的参数，乱改的话反而会使比对的性能下降。 图1-B所示是COBALT序列比对的结果，可以看出其中有条序列(XP_511495)跟其它序列的差别很大，使整个比对的结果多了好多Gap，并且打断了可能的蛋白结构域。由图1-C所知，XP_511495是一个预测的序列，这样的序列对序列比对是没有任何参考作用的，反而对比对的结果造成影响。 COBALT另一个好的功能就是可以把不好的序列去掉再重新比对，看图1C，把XP_511495前面的勾去掉，然后点击Re-align，这样多次的筛选与比对，才能达到精确的结果，看图1-D。 图 1. COBALT interface and multiple alignments. 从NCBI在线Blast结果运行COBALT 另外，也可以从在线Blast运行后的结果中再接着运行COBALT，这样子可以更容易地收集同源蛋白。例如以人的参考序列NP_000939为例做Blastp找bony fishes的同源蛋白，参数选择如下：Database = Reference proteins (refseq_protein); Organism = bony fishes; Entrez query = srcdb RefSeq known ; Expect threshold = 1e-6。运行的结果如图2-A所示。图中2-A 箭头所示，点击“Multiple alignment”就链接到COBALT接着做 多序列比对 。 生成系统进化树 Blast的结果跟COBALT的结果都是可以直接生成系统进化树的，如图2-B所示，点击“Phylogenetic tree”就能显示进化树。进化树结果如图2-C所示。 图 2. BLAST, COBALT results, and phylogenetic tree of growth hormone family members 重新找回COBALT运行的结果 COBALT运行的结果会生成一个Cobalt RID值，并且这个结果会在NCBI保存36个小时，如果在这段时间，你需要重新看回这个结果，你可以根据这个Cobalt RID找回COBALT运行的结果。保存的结果页面在COBALT页面最顶端的左边，点击”Recent Results”进入。 总结与COBALT接下来的改进方向 COBALT是一个新的蛋折分析工具，是对Blast的一个补充。COBALT接下来需要改进的是，可以重新设定和下载比对结果的格式。

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[转载]博克文摘10：中国户籍制度略史

laserdai 2012-5-10 05:24

我又联想到前几天争论的中国户籍制度。 据说目前全世界只有中华人民共和国、朝鲜和贝宁三个国家实行严格的户籍制度。 不错，户籍制度就是对农民专政，它剥夺了农民的基本权利，使农民成了二等公民。 其实，批判户籍制度的朋友还没有意识到另一涉及更广的问题：户籍制度影响的不单单是农民，任何一个中国人，都是不可以跨省市迁徙的，一个户口本就决定的你的命运。 可惜中国的事情往往不是那么简单的，简单的，只是我们自己的大脑。 只要稍微回顾一下历史，我们就知道中国最早对人口进行管理的记录从商代就开始了。甲骨文中，常常出现“登人”的字样，就是登记人口的意思。 至秦代变法之后，秦的户籍制度即规定“（献公)十年为户籍相伍”（《史记•秦始皇本纪》）。“相伍”,大约是按五家为“伍”编制户口册，“伍”也是当时户口编制的最基层单位。至此，户籍制度成为秦国作控制社会，加强专制统治的工具。 历朝历代，户籍记载各民户的人口和土地，凡稽查人口、征集兵丁、调派劳役、征收赋税皆以户籍为主要依据。这种统治手法一直延至明清。历代帝王对户籍都十分重视，把它作为统治、剥削、奴役人民，维护专制的重要工具。 当然，专制社会的户籍制度并不仅仅是一个登记名字的花名册，它实实在在地控制了人口的自然迁徙和流动，尤其是把农民束缚在土地上，以保障赋税和兵役的顺利进行。 秦汉魏晋时期实行乡里制。“乡间居民十里为一亭，亭有长；十亭一乡，乡有三老、啬夫和游徼。三老掌教化，啬夫职听讼、收赋税，游徼循禁贼盗。” “里有里魁，民有什伍，善恶以告”。北魏时实行三长制，“五家立一邻长，五邻立一里长，五里立一党长；长取乡人强谨者”。 为了防止脱籍，政府严禁自由迁徙，规定未经乡亭批准、结清赋税，不得迁徙更籍，违者受罚。这种“街道居委会”的基层组织无形中就有了控制农民迁徙自由的权力。 唐朝实行乡保制，五家为一保，四家为一邻，百户为一里，五百户为一乡。每里置正一人。里长的职责是掌“按比户口，课植农桑，检察非伪，催驱赋役。” 上海师范大学历史系的王育民先生曾对历朝历代的户籍制度作了多年研究。他认为，中国的户籍制度自唐朝开始完善，唐代的“貌阅”制度就是按其年龄、相貌对男丁逐一核对，规定“每岁一团貌”，连脸上的疤痕和记痣等都要记录在案。所以，户籍关系到社稷的兴亡，朝廷对于户籍的管理以及对这一制度的违反的惩罚也是异常严厉的。《唐律疏议•讼律》载：“同伍保内在家有犯，知而不纠者，死罪，徒一年；流罪，杖一百；徒罪，杖七十”。 到了元代，在登记鼠尾簿（户口）时，“凡丁口死亡，或成丁，或产业孳畜增添消乏，社长随即报官，于各户下令掌簿吏人即便标注”。并规定“邻佑、主首、社长互相保结，不实者罪之”。 朱元璋推行的“户帖制度”，则是今天户口本的原型。 洪武三年，明政府开始在全国推行“户帖”制度。《明太祖实录》卷58记载： 洪武三年十一月，明太祖命户部籍天下户口，每户给以户帖。于是户部制户籍、户帖，各书其户之乡贯、丁口、名、岁。合籍与帖，以字号编为勘合，识以部印，籍藏于部，帖给之民。仍令有司岁计其户口之登耗，类为籍册以进，著为令。 为保证户帖制度的顺利推行，订有严格的惩处条例：“令有司点闸比对，有不合者，发充军，官吏隐瞒者处斩。” 在推行“户帖”时，朱元璋更是利用大军“点户”和严刑酷法，以达到控制人口的目的。 明朝法律规定：“凡民户逃往邻境州县，躲避差役者，杖一百，发还原籍当差。其亲管里长，提调官吏鼓纵及邻境人户隐蔽在己者与罪。”洪武二十七年三月又颁布榜文：“今后里甲邻人、老人所管人户，务要见丁著业，互相觉察。有出外，要知本人下落，作何生理，干何事务。若是不知下落及日久不回，老人、邻人不行赴官首者，一体迁发充军。” 清朝的户籍成为保甲制，光绪《大清会典事例•户部》规定：州县城乡十户立一牌头，十牌立一甲头，十甲立一保长，户给印牌一张，备书姓名丁数，出则注明所往，入则稽其所来。来路不明者，就要捉去治罪。户有迁移，随时报明，换给门牌。 到了民国，“户籍”有“法”可依了，国民政府推行《户籍法》，1937年，又颁布《保甲条例》，在全国建立保甲组织，实行“联保连坐”制。即使台湾，自1945年一直沿用日治时期的户籍管理制度， 直到取消戒严之后，台湾的户籍才实现了户警分立，民众迁徙才有了真正的自由。 当然，国民党在大陆时代的保甲条例很长一段时间是一张废纸，但这并不说明国民党愿意给民众迁徙的自由，而是因为它自己连首都都一路从南京“迁徙”到了重庆，还有神马本领管住百姓不叫他们迁徙呢！？ 其实中国历史上民众最具迁徙自由的有两个时代，一是北洋军阀混战时代，军阀们打的不可开交，老百姓躲避战火四处逃窜；另一个是共产党三年“自然灾害”时期，不“自由迁徙”，就是死路一条了。 简单地回顾了一下历史，我们要思考的问题是：户籍制度是如何形成的？户籍制度和社会的经济发展与文化理念有什么联系？今天我们取消户籍制度背后真正的动力和原因是什么，通过取消户籍制度，我们又如何进一步的推动中国社会的进步和发展？ …… 具体来说，从户籍的取消，对于我们今天讨论的承认双重国籍有什么积极的意义和影响？既然一国国民可以在本国之内自由迁徙而和他人享有同样权利，那么移居他国之后“祖国”为啥就把这些人当抹布一样扔了呢？中国究竟应当实行双重国籍吗？ 骂娘是不管用的，愤青们，咱一起来学一点中国历史，理性地审视一下中国的现实不是更好？ 最后，我想请大家再认真思考一下： 今天，中国的许多地区严格的户口管理制度已经名存实亡，人民，主要是农村人口可以自由迁徙了，但是，当农村人口来到城市，尽管政府给他们提供了一定的生活和医疗保障，尽管他们的孩子也可以去民工子弟学校就读，可是，他们最大的无奈和痛苦来自哪里？那些“城里人”有几个把“外地人”、“乡下人”当人看的？那些“上等人”、“有钱人”有几个在人格上和精神上平等对待那些普通的“乡下人”清洁工，钟点工，保姆和服务员的？ 比起“户口制度”，这种无形的枷锁和桎梏来自何方？ 由悟空孙张贴 @ 2012-05-09

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PPT动画工具

xyzg198891 2012-5-9 19:19

（1）PowerPoint动画库扩展2.5 这是一款商业软件，目前的注册费是40元。（后续版本的价格会更高，但是已经注册的用户可以免费升级）该工具是PPT中动画功能的增强软件。欲了解更多信息，请访问作者的博客“0度跨越”（ http://pptaddins.blogbus.com/ ）。该博客的作者还开发了一款软件Extend More，包含多个PPT工具，看起来功能很强大。由于目前还处于开发阶段，所以没有实际使用过。 附件： PowerPoint动画库扩展2.5.rar （2)PPT2010动画补缺插件 PPT2010中缺失了PPT2003中的一些动画，虽然可以通过其他方法进行补救，但都不是太方便。使用VBA对普通用户也是不太靠谱的事情。鉴于此，有人制作了这个插件，虽然不是太完美，但是救急还是可以的。如果不想安装插件就直接从第二个PPT文件中用动画刷来复制PPT2010中隐藏的动画吧 。资料来源于锐普PPT论坛。 附件： PPT2010动画补缺.exe PowerPoint 2010隐藏的动画.pptx （3)PPT动画大师 PPT插件是指能够增强PPT功能的小软件或者单个文件，目前常见的格式有EXE、MSI、DLL、PPA和PPAM。各种插件的安装方法不一样，PPT动画大师是PPA格式的插件，安装方法请在锐普PPT论坛中搜索“PPT动画大师安装教程”。它是网友ye4241用VBE开发的，目前的版本是V1.1。相比于其他插件，这个小工具比较的复杂。加上教程又不是很完善，所以学习起来有一定的难度。不过只要在论坛里面多看看网友的讨论应该是不难掌握的。 附件： PPT动画大师V1_1.ppa (4)FastCross 一个PPT插件，在锐普论坛上看到的。功能有两条： 选择形状，快速生成精确的 X ，来实现稍微精确一点的定位。 选择两个形状，为第一个形状添加两个动画，路径和缩放到后一个形状的状态。 附件： FastCross.ppa （5）动画循环 做动画做多了你就会发现这个真的可以让你节约很多时间，而且多帧动画循环也可以轻而易举的实现了。Win7用户以管理员身份运行“注册.bat”进行安装。 附件： 动画循环2.0.rar （6）文本框分割和合并工具 如果你希望将一个文本框按行分割成多个文本框或者想将多个文本框合并成一个文本框，那么这个插件正是你要的。 附件： 文本框分割.ppam （7）图片切割 某些动画效果会要求将一张图片分割成多张小图片，这个时候你可以用PS中切片工具。但是如果你是PS盲那就只有另谋它法了。第一个附件是一个PPT插件，可以实现对图片的多种形式的切割。第二个附件是一个免安装的图片分割软件，主要是可以批量分割。资料来源于锐普PPT论坛。实际上，利用PPT本身就可以实现图片切割。具体方法请在锐普论坛里自己搜索。 附件： picCrop 2.1.rar 批量图片分割器.rar (8)形状转路径 如何让任意形状转变为路径呢？这个工具可以实现这一点。不过作者并没有进一步开发这个插件，所以功能不是很完善。 附件： 形状转路径.ppa

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[转载]Tags | blast, NCBIBlast的汇总，从入门到应用

charles08 2012-5-7 10:55

Tags | blast, NCBIBlast的汇总，从入门到应用 Blast是真是非常常用的一个生物信息工具。只要是接触过序列的朋友，没玩过Blast，那好像是不大可能的。 Blast基本上也就是生物信息的入门工具。虽说是入门，但要真正学好，还是蛮复杂的。但是常用的，还是要了解一些的。 今天就来汇总一下，关于Blast的文章。包括Blast介绍。Blast的下载。本地Blast。与NCBI的Blast。 都是热门啊。 Blast入门 1，什么是Blast? BLAST 核酸/氨基酸序列相似性比较的工具: http://liucheng.name/1008/ Blast (Basic Local Alignment Search Tool)是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较...................... 2，NCBI 里用到的几种不同的Blast（核酸的） BlastN/MegaBlast/Discontiguous MegaBlast 的区别： http://liucheng.name/1009/ 三者之间的共同之处就是 BlastN/Megablast/Discontiguous megablast 都是BlastN,就是核酸序列比对核酸序列的算法............. 3，NCBI 里用到的几种不同的Blast（蛋白的） Blastp/PSI-BLAST/PHI-BLAST 的详细介绍： http://liucheng.name/1010/ Blastp/PSI-Blast/PHI-BLAST都是蛋白序列与蛋白序列之间的Blast比对.............. 4，NCBI里的各个Blast库 NCBI在线blast数据库的简要说明： http://liucheng.name/476/ Blast下载 最新版的blast下载： http://liucheng.name/785/ 你可以直接通过登陆到NCBI的FTP直接下载。通过迅雷和快车等工具也是可以的。 本文详细出处参考： http://liucheng.name/1299/

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[转载]GO 分析工具

helloating1990 2012-5-4 21:51

GO分析的相关工具（转） GO委员会工具 AmiGO AmiGO 提供检索和浏览GO委员会提供的本体学(ontology)和注释(annotation)数据。用户可以通过检索蛋白获得相应的GO术语，可以检索GO术语得到相应的细节和相关的蛋白注释，AmiGO还提供了BLAST搜索引擎，比对有GO术语注释的基因和基因产物的序列。 OBO-Edit OBO-Edit是一个开源的、与平台无关的应用程序，用于显示和编辑OBO格式的本体文件.OBO-Edit是基于图的工具，强调本体的全部图结构，给生物学家提供了一个友好的接口。OBO-Edit是个很好的工具，关注于相对简单的门类的相互关系,有助于本体学的快速更新。 非GO委员会工具 用于搜索和浏览GO的工具：显示、浏览和搜索相应的本体和注释 ** CGAP GO Browser 提供浏览GO词汇，可以找人和小鼠基因对应的GO术语, 每隔几个月更新GO的数据。 ** COBrA 一个基于Java的本体编辑器，区别于其它编辑器在于其提供了两个本体间概念上的连接，以及提供了精细的分析和验证功能。除了支持GO和OBO格式之外，COBrA还能导入和导出本体为语义web(Semantic Web)格式如RDF、RDFS、OWL。 ** Comparative Toxicogenomics Database CTD是一个公用的数据库，加强了对环境中化学物质对人类健康的理解，整合了GO数据和GO浏览器。使得用户可以理解暴露在化学物质下相关靶标的生物功能、过程和细胞定位。 ** DynGO 是一个客户端-服务器模式的应用程序，提供了许多高级的功能，除了标准的浏览功能外，DynGO允许用户批量地检索一系列基因和基因产物的GO注释，以及语义检索一系列基因和基因产物所共有的相似GO注释，结果根据GO的等级显示为树状结构，支持许多动态显示的选项如对树节点排序或改变树的方向。对于GO管理者和经常使用GO的用户，DynGO提供了快速和方便的访问GO注释数据。DynGO广泛地应用到有GO术语注释的任意数据集。 ** EP GO Browser EP GO Browser是EBI的Expression Profiler中的一个组件(Expression Profiler是一个工具集，用于聚类、分析和可视化显示基因表达和其它基因组数据)，通过它，你可以搜索GO术语和识别基因相关的节点，以及相应的子节点。 ** Gene Class Expression Gene Class Expression允许使用GO数据库对SAGE数据进行功能注释。这个工具对每一个SAGE标签在GO数据库里进行搜索，对选定的GO类别和选定的等级进行关联。这个系统对于映射SAGE数据到GO结构上提供了用户友好的数据导肮和可视化。还对SAGE标签在每一个GO类别里的百分比提供了图形可视化以及置信区间和假设检验。 ** GeneInfoViz GeneInfoViz是一个基于web的工具，提供批量检索基因功能信息、可视化GO结构和构建基因相关网络。用户需要提供一个基因列表(格式可为LocusLink ID、UniGeneID、gene symbol、accession number)，结果返回功能基因组信息。基于对给定基因的GO注释，GeneInfoViz允许用户以GO的DAG结构显示这些基因，以及在选定的DAG水平上构建基因相关网络。 ** GeneOntology at RZPD RZPD提供了GO标识符和相关联的UniGene ClusterIDs、Genes(Name/Symbol)、Clones的检索，目前GO注释关联了人和小鼠的基因/克隆。 ** GenNav 检索GO术语和注释的基因产物，提供在GO DAG图中可视化显示GO术语。 ? ** GOblet GOblet服务器考虑了GO术语，执行序列(cDNA，蛋白)分析。如相似性搜索(BLAST),在使用已有的GO注释构建的不同物种的数据库的前提下，服务器展示了所有匹配的细节描述以及基于匹配到的GO术语构建GO概要树(summary tree) ** GoFish GoFish是在线的java程序，也可以下载到本地运行。允许用户使用GO属性构建任意的布尔检索，对符合条件的基因产物进行排列，GoFish也对每一个基因产物估算其符合布尔查询的概率 ** GONUTS GONUTS是基于wiki的GO术语和少量物种基因关联的浏览器，wiki接口允许用户创建和分享每一个GO术语用法的注解。 ** MGI GO Browser 通过MGI GO Browser可以搜索GO术语和显示所有小鼠基因注释到每一个术语或子术语。也可以浏览本体来观察术语之间的关系、术语定义、对于给定的术语和它的子术语所注释的小鼠基因数量。MGI GO Browser直接访问MGI数据库中的GO数据(每晚更新)。 ** Ontology Lookup Service OLS整合了公开的可用生物医学本体到单一的数据库。所有修正的本体是每天更新的。一个当前加载的本体列表可以在线获得，这个数据库能够通过检索获得单一术语的信息或使用AJAX浏览完整的本体。自动补齐提供一个用户友好的搜索机制。一个基于AJAX的本体显示器可以有效地浏览完整的本体或其子集。一个可编程接口可以通用使用SOAP来检索网络服务。服务由一个WSDL描述器描述，此文件可在线获得。一个简单的java客户端使用SOAP来连接网络服务，可以从SourceForge上下载到。所有的OLS源代码是公开的，使用Apache许可证发布。OLS提供了一个用户友好的单一入口指向公开可获得的本体(Open Biomedical Ontology格式)。 ** PANDORA 使用PANDORA可以搜索蛋白的任何非一致集(non-uniform sets)和检测共享独特生物属性的蛋白子集，以及这些集合的交集。PANDORA支持GO注释和额外的关键字(来自于UniProt Knowledgebase, InterPro, ENZYME,SCOP等等)。PANDORA被整合进ProtoNet system，从而允许测试上以万计的自动产生的蛋白家庭。PANDORA已经取代了由同一个团队开发的ProtoGO浏览器。 ** QuickGO at EBI QuickGO是一个GO浏览器，由EBI开发，是InterPro的一个组件，可以搜索GO术语来观察它的相关节点和定义，还可以映射到SWISS-PROT关键词、酶分类，转运分类数据库或者InterPro入口。GO数据每日更新。 ** TAIR Keyword Browser 搜索和浏览GO、TAIR解剖(Anatomy)、TAIR发育阶段术语(developmental stage terms)，允许显示术语的细节及其相关的术语。包括基因、文献、芯片实验和相应术语的或子术语的注释之间的关联。 ** Tk-GO 这个工具是对BDGP的GO::AppHandle库基本功能的一个GUI包装。GO术语在一个explorer-like浏览器里展示，程序可以通过修改perl脚本来配置。Tk-GO使用的GO数据库(默认直接连接BDGP的数据库)是用户可以修改的。 注释工具:使用GO对基因和基因产物注释的工具 ** g:Profiler g:Profiler是一个公用的web服务器，用于挖掘高通量基因组数据。g:Profiler有一个简单、用户友好的网页接口，对于获取GO、通路或转录结合因子在单个基因水平上的富集等具有强大的可视化功能。除了标准的多重检验校正(multiple testing corrections)外，引进了一个对复杂结构(如GO)进行多重检验的真实效果估算的改良方法。解释基因列表通过一个高效的算法由同一接口支持。其它实用的数据分析通过模块支持。整合进g:Profiler的模块有：g:Convert转换不同数据库的ID，g:Orth找寻不同物种的直向同源基因(orthologous genes)，g:Sorter搜索绝大部分的公用基因表达数据找寻共表达的数据。g:Profiler支持31个不同的物种，数据定期从数据源(如Ensembl数据库)更新。生物信息学社区希望g:Profiler能支持简单的文本输出。 ? ** GeneTools GeneTools收集了许多基于web的工具，从许多不同的资源里收集信息，提供可用的基因组分析，两个主要的工具连接到这一数据库是NMC注释数据库V2.0和eGOn V2.0。NMC注释数据库V2.0提供了来自于UniGene、EntrezGene、SwissProt和GO的信息。 ** GOanna 使用相似性搜索来找寻蛋白的注释，输入可以是一系列的ID或是一系列FASTA格式的序列。如有需要GOanna会检索序列，并对用户指定的数据库进行BLAST搜索。结果包含BLAST搜索到的相似性高的序列的GO注释和序列比对的结果。 ** GoAnnotator 此工具对从文献里提取的蛋白GO术语注释进行验证。 ** GOCat:Gene Ontology Categorizer? GOCat是一个自动的文本分类器，此工具归类任意的输入文本(几个词，一篇摘要，一系列的PubMed识别符等等)到GO分类。这个系统目标在于通过文本挖掘方法方便对基因和基因产物进行功能注释。对于每一个的预测类别，提供一个置信打分和一段抽取于输入文本的简短文本。 ** GoFigure 对未知的检索序列通过BLAST来识别其同源的注释，以此来预测其GO注释。DNA或蛋白质序列都允许提交，多重的检索可以通过提交包含FASTA格式的文件来完成。检索到的结果通过email返回给用户，结果显示为图或者是tab分割的文件。结果可以通过tar打包文件下载。 ** GoPubMed GoPubMed是一个网络服务器，允许用户结合GO探索PubMed搜索结果，GoPubMed提交用户的关键字到PubMed，检索摘要，检测摘要中的GO术语，显示与最初检索结果相关的GO子集，允许用户通过语义浏览和显示相应的文献和它们的GO注释。 ** GOtcha GOtcha提供了对于给定的检索序列相关GO术语的预测。每一个术语相对于引用搜索是分数独立(scored independently)和分数校准(scores calibrated)的，以便给出正确性的准确百分比可能性(to give an accurate percentage likelihood of correctness)。 ** HT-GO-FAT:High Throughput Gene Ontology Functional Annotation Toolkit HT-GO-FAT允许高通量映射未知或其它基因序列如ESTs、mRNA、蛋白数据到GO注释、EC numbers、KEGG通路。它使用序列相似性和结构域匹配。此工具使用自定义的校正数据库以及拥有诸如窗口局域网分布式BLAST(windows LAN distributed BLAST)，能够通过窗口局域网分布高通量的BLAST搜索。HT-GO-FAT还拥有高通量的BLAST输出观察器，以及能对匹配度高或人工校正的数据导出为许多的文件格式。数据能导出为AmiGO相关的文件，通路图会高亮显示用户数据集中的酶/基因。 ??? ** InGOt (商业软件) InGOt是Inpharmatica的新模块系统中的一个模块。这个系统用于蛋白注释，是一个应用GO到所有蛋白的一个商业系统。它提供一个无与伦比的资源来阐释蛋白功能：它的图形用户界面让你轻松地从各个链接中跳转，从汇总数据到分层语境(hierachical context)和文献/证据(literature/evidence)。InGOt拥有比公开资源更为丰富的序列和最广泛的GO关联资源。InGOt可以和其它模块整合，如Domain Professor用于蛋白结构域的细节注释和Blu-Chip用于即时和准确的探测蛋白赋值(protein assignments)。 ** InterProScan 蛋白结构域和功能位点数据库对于蛋白功能的预测是一个关键的资源。十年来，许多标识识别(signature-recognition)方法逐步形成来解决不同序列分析问题。产生不同和独立的数据库。由于强调不同的分析方法，这些资源有着各自不同的优点和缺点，各自有着不同的最优应用。从而，为了得到最好的结果，搜索策略必须完美地结合所有的资源。InterProScan是一个基于Perl的程序，它能够结合不同的蛋白标识识别方法到一个资源上。 ** JAFA:Joint Assembly of Functional Annotations JAFA接收蛋白序列，提交它到数个功能预测程序，并将预测结果聚集到一个单一的、易读的、基于GO术语的文件，用户可以点击各个服务器、AmiGO和QuickGO。JAFA还提供包含所有结果的XML文件下载。 ** Manatee Manatee是基于web的基因评估和基因组注释工具，Manatee能够存储和显示原核和真核基因组注释。Manatee界面允许生物学家快速识别基因以及对其进行高质量的功能赋值(诸如GO分类，使用搜索数据，paralogous家族和由自动分析所产生的注释)，Manatee能够下载和安装，运行于CGI网络服务器，比如Apache。 ** PubSearch PubSearch是基于web的文本管理工具，允许管理者搜索和注释基因到文献的关键字。它的后端有一个简单的mySQL数据库，PubSearch使用一系列Java伺服小程式和JSPs来完成检索、修改、增加基因、基因注释和文献信息。此工具可以从GMOD上下载到。 用于基因表达/芯片分析的工具 ** Avadis - gene expression analysis with GO browser (商业软件) Avadis是基因表达数据的数据分析和可视化工具，内置一个显示GO等层的浏览器，许多基因有共同的本体途径(common ontology paths)，对基因表达聚类可以通过GO语义进行聚类以识别功能标识(functional signatures) ** BiNGO 开源的java工具，在一个基因集合里确定那个GO类别是统计上过表达(over-represented)的。BinGO以Cytoscape的插件实现，Cytoscape是分子相互作用网络数据整合和可视化的软件平台。BinGO映射给定基因集的主要功能主题到GO等级上，并输出这一映射为Cytoscape图。 ** CLENCH:CLuster ENriCHment CLENCH允许拟南芥(A. Thaliana)研究者从TAIR上执行自动的GO注释检索并计算给定的基因集(相对于参考集)的GO术语富集。在计算富集之前，CLENCH允许把返回的注释映射到GO slim术语表(能够被用户编辑)和本地安装的GO上的任何粗糙水平， ** DAVID:Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery 基于web的工具，提供由高通量技术产生的基因组水平数据集(诸如表达谱和蛋白组平台)的注释和分析的整合解决方案。分析结果和图形显示保留动态链接到主要的数据库和外部数据仓库，从深度和广度上覆盖数据。DAVID为数据收集到生物意义的转变提供便利，加速了基因组水平数据的分析。 ** EASE EASE对于一个给定的基因列表概述主要的生物学主题。给定的基因列表来自于表达谱或其它的基因组水平实验，EASE能够快速计算相对于数据集里所有基因每一个统计上可能的过表达GO术语。 ** eGOn v2.0:explore Gene Ontology 基于web的工具，映射表达谱数据到GO结构上。多个的输入文件能够同时分析以比较两个或多个实验的注释基因的分布。 eGOn V2.0的核心特性： .可视化：基因注释以GO DAG可视化显示或以表格的形式显示，GO DAG的尺寸能够由用户自由定义。 .过滤：GO注释能够基于evidence codes进行过滤。 .包含用户定义的GO注释：事先加入到NMC注释数据库中。 .统计分析：多个基因列表能够同时分析以比较GO等级上注释基因的分布，统计测验设计成允许用户在两个基因列表之内或之间计算GO注释的不同(dissimilarities)。 .连接注释数据库：连接到NMC注释数据库，基因和蛋白的信息直接由GO DAG或导出的数据提供。 .导出：GO DAG信息、统计结果、基因和蛋白信息能够导出为Excel、text、XML格式。 ** ermineJ 分析表达数据中的基因集(用户定义或通过GO术语定义)的工具。这个软件设计为给只有很少或没有信息学背景的生物学家使用。为想使用ermineJ脚本的用户提供一个命令行接口。实现了多个不同的对基因集的打分方法，不是简单地集中于依赖过分表达(over-representaion)方法上。 ** FatiGO FatiGO对给定的基因集，以代表性的功能信息(低表达或过表达GO术语)对其赋值。通过多重检验纠正(multiple-testing correction)得到统计显著性。FatiGO被设计成在DNA芯片数据分析的上下文里进行功能注释，FatiGO链接到基因表达模式分析套件(Gene Expression Pattern Analysis Suite)里。FatiGO使用主要的基因组和蛋白组数据库(GeneBank, UniProt, Unigene, Ensembl,etc)的基因IDs。FatiGO适用于任何类型的大规模实验进行功能注释。 ** FIVA:Functional Information Viewer and Analyzer FIVA协助原核生物社区的研究者进行转录组分析时快速识别相关生物过程。此软件分析大量基因的功能谱并对影响的生物过程产生一个综合的概述 ** FuncAssociate FuncAssociate是一个基于web的工具，接受一个基因列表作为输入，并返回输入列表中过表达或低表达(over- or under-represented)的GO属性。经过多重假设检验后只有那些统计上具有显著性的过表达或低表达的属性才会被报道。目前有10个物种被支持。除了输入基因列表外，用户还可以指定a)这一列表是否被认为是排序还是乱序的。b)FuncAssociate所认为的总基因(the universe of genes)。c)单独报道过表达或低表达的属性，还是两者都报道。d)p-value cutoff值。 新版的FuncAssociate(还处于测试阶段)支持更广泛的基因命名方案，并使用更为频繁更新的GO相关文件(GO associations)，然而原来版本的一些特性诸如按LOD排序或查看基因属性表格的选项还没有实现。 ** FuncExpression FuncExpression是一个基于web的资源，对大规模的基因组数据进行功能解析。FuncExpression能对植物、动物和真菌的基因列表(从基因组和蛋白组实验中产生)进行功能比较。多个的基因列表能够被分类、比较和可视化显示。FuncExpression支持双通道整合(two way-integration)植物功能信息和基因表达数据，这使得后续的交叉验证(cross-validation)成为可能，交叉验证使用BarleyBase相关实验获得的植物芯片数据。 ** FunCluster:FunCluster, Functinal Profiling of Microarray Expression Data FunCluster是一个基因组数据分析工具，设计成对cDNA芯片实验产生的基因表达数据进行功能分析。除了自动对基因表达数据进行功能注释外，FunCluster通过特定设计的共棸类对涉及到的生物注释和基因表达数据进行功能分析，能够检测出共调控的生物过程(注释基因组主题所展示)。FuncCluster的功能分析依赖于GO和KEGG注释，并且只支持三个物种：人(Homo sapiens)、小鼠(Mus musculu)和酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)。 ** FunNet:Functional Analysis of Transcriptional Networks FunNet设计为一个分析基因共表达网络(由芯片表达数据所构建)的整合工具，此工具的分析模块的实现涉及到两个抽像层：转录(如基因表达谱)和功能(如转录分析所显现的生物学主题)。依赖于GO和KEGG注释的功能分析技术，应用于从基因芯片表达数据中抽提一系列相关生物学主题。多重情况表达(multiple-instance representations)用来关联注释转录本和相关的生物学主题。一个原创(original)的非线性动态模型被用来量化相关基因组主题(genomic themes)上下文的接近度，这一量化基于在基因共表达网络(如在注释主题中捕获转录本的相似的表达谱)中基因组主题的增殖模型(patterns of propagation)。最后，一个非监督的多重情况光谱聚类过程(an unsupervised multiple-instance spectral clustering procedure)被用来探索共表达网络的模块结构，这是通过聚集共表达网络所显示出来的显著性相互关系的生物主题来实现的。提供了共表达网络的功能、转录表达、相关的转录和基因组主题的上下文详细信息。 FunNet提供了基于web的工具以及作为一个标准的R包。标准R实现能够运行在任何能运行R环境的操作系统(windows, Mac OS, 各种Linxu和Unix)上，能够从FunNet网站或者从CRAN的镜像站上下载到。两种实现的FunNet都是使用GPL2.0发布的。 ** G-SESAME G-SESAME包含了一系列工具，分别是： 1.衡量GO术语语义相似性的工具。 2.衡量基因功能相似性的工具。 3.基于GO术语注释信息聚类基因的工具。 ** GARBAN GARBAN是对cDNA芯片和蛋白质组技术产生的数据进行分析和快速功能注释的工具，GARBAN实现为生物信息学工具，以快速比较、分类和图形展示各种数据集(genes/ESTs或proteins)，目的在于为病理和药学研究中识别分子标记(molecular markers)提供便利。GARBAN链接到主要的基因组和蛋白质组数据库(Ensembl, GeneBank, UniProt Knowledgebase, InterPro,etc.)并遵循GO委员会的标准进行语义分类。代码是共享的: e-mail garban@ceit.es ** GENECODIS GENECODIS是一个基于web的对基因列表进行功能分析的工具，它整合了不同的信息资源来搜索最频繁的共存在基因集的注释，并通过统计显著性排列它们。注释分析来自于不同的数据库如GO,KEGG或SwissProt。 ** GeneMerge GeneMerge对于一个给定的基因集返回功能基因组信息，并提供此基因集里过表达的特定功能或分类的统计秩值(statistical rank scores)。展示了所有的GO类别和功能基因组数据。 ** GFINDer: Genome Function INtegrated Discoverer GFINDer是一个多重数据库系统(multi-database system)提供了大规模的用户分类的序列标识列表和基因组生物学信息以及列表中不同基因类别的特征生物学功能谱。GFINDer自动从不同的资源检索更新功能分类的注释信息，识别用户分类的基因列表中每个分类的富集类别。并计算每一个类别的统计显著性。而且，GFINDer能够根据挖掘的功能类别对基因进行功能分类并且对这些分类进行统计分析，使得能够更好地解释芯片实验结果。 ** GOALIE: Generalized Ontological Algorithmic Logical Invariants Extractor GOALIE是用来构建时间序列依赖富集的工具，需要ODBC连接到GO数据库。 ** GOArray GOArray是一个Perl程序，输入一系列基因注释为“感兴趣(of interest)”(GOI)或者不感兴趣，并确定相关的GO术语对于GOI是否过表达。一个置换检验(permutation test)是可选的，用来评估结果的可靠性。输出包括了多个可视化图和补充信息以及进一步的参考，还有对所使用的统计方法的概述。 ** GOdist GOdist是一个Matlab程序，用于分析Affymetrix芯片表达数据，实现了Kolmogorov-Smirnov(KS)连续统计方法。还引入一个两侧超几何分布(two-tailed hypergeometric distribution)使用Fisher exact检验实现了离散方法。GOdist能够检测出芯片基因相关的GO术语相对于不同总体的差别，总体可是是全局芯片总体、分析的GO术语的直接父节点或全局父节点。 ** GOHyperGAll 检验样本总体基因得到过表达的GO术语，R/BioC函数GOHyperGAll对所有的GO节点进行超几何分布检验计算并返回相应的P值，后续的过滤函数使用默认的或自定义的GO Slim类别执行GO Slim分析，使用此工具必须有基本的R和BioConductor知识。 ** GoMiner and MatchMiner High-Throughput GoMiner是一个工业级别的整合GO工具，用于解析多芯片实验。GOMiner是基于Java的程序包，对感兴趣的基因(如芯片实验里上调或下调基因)在GO的上下文里进行生物学解析。GoMiner提供定量和统计的输出文件和两个有用的可视化文件：(i)树状结构类似于AmiGO浏览器里所显示的(ii)一个压缩的，动态交互的DAG。GoMiner所展示的基因链接到主要的公开生物信息学资源。一个陪伴工具(companion)MatchMiner用于做前处理，为GoMiner或其它的GO工具的输入获取基因名称，提供了一个自动化脚本以便于安装本地化的数据库。 ** GOstat GOstat是一个易于使用的web工具，用于确定基因列表中过表达或低表达的GO类别的统计显著性。数据每月更新。 ** GoSurfer GoSurfer在分析基因集(来自于基因组范围的计算、芯片分析或其它相应的高端方法)时使用GO信息，GoSurfer包含了严格的统计检验，交互的图形和自动更新注释信息(基因标识符(UniGene,LocusLink)或Affymetrix探针集)。 ** GO Term Finder GO Term Finder对给定基因列表的基因产物的GO术语或其父节点作显著性的分析。Saccharomyces Genome Database 实现了一个基于web的GO Term Finder用于为出芽酵母基因产物搜索注释。一个通用的GO Term Finder由Standford Microarray Database创建，可以从CPAN下载到。这个代码被普林斯顿基因组研究组(Princeton genomics group)用于创建基于web的通用GO Term Finder，通过该web工具提供了分析GO站点上所公开的有GO注释的任何种属(包括人)的基因。 ** GOTM:Gene Ontology Tree Machine GOTM是一个基于web的工具，基于GO等级结构分析和显示感兴趣的基因集。这个工具提供了用户友好的数据导航和可视化。产生可扩展的树用于浏览GO等级结构，以HTML的形式生成固定的树用于对不同注释水平进行归档并生成柱状图，GOTM提供统计分析以显示GO类别和相对富集的基因数目以及暗示(suggest)了进一步研究的生物领域。富集的GO类别能够以子树或DAGs的形式展示。基因的子集能够检索GO术语或进行关键字搜索。每一个基因的细节信息能够直接从GeneKeyDB里检索到。 ** GOToolBox GOToolBox是一系列基于web的程序，允许从一个基因集(相对于被检索的参考基因集)识别统计上过表达或低表达的术语、基因集里对功能相关的基因进行聚类和检索基因集里共享的注释。GO注释能够限制在GO slim等级上或者是给定的GO术语水平上，而且术语可以使用evidence codes进行过滤。GO和基因关联文件每月更新。 ** L2L L2L是一个简单但功能强大的工具，用于发现芯片数据中隐藏的生物学显著性，通过易于使用的web界面，L2L挖掘GO术语显著富集的上调或下调的基因，L2L还将基因列表与数据库中上以千计的芯片实验作比较，以识别共有的基因调控模式。此工具可以下载到一个命令行的版本，可以自定义运行或者批量分析。 ** Machaon Clustering and Validation Environment Machaon Clustering and Validation Environment是一个聚类验证的工具，将样本或基因按相似的基因表达模式进行分类并评估聚类的质量。在基因表达数据分析中GO术语用于衡量基因间的相似性(生物学距离)以支持生物医学知识发现(biomedical knowledge discovery)。 ** MAPPFinder MAPPFinder是GenMAPP的辅助程序。这个程序允许用户检索任何存在的，相对于GO基因相关和GenMAPP芯片通路谱(MAPPs, microarray pathway profiles)的表达谱数据标准。分析产生的结果能够通过选择感兴趣的术语或MAPPs直接以GO等级或在GenMAPP中展示出来。 ** Onto-Compare Onto-Compare是一个基于web的工具，可以基于GO对商业芯片进行比较。Onto-Compare允许用户对每一个芯片做功能偏好性评估并确定对于某个特定生物学现象(由GO术语描述)最好的芯片。 ** Onto-Design Onto-Design允许用户设计定制芯片，通过选择一系列UniGene cluster IDs，这些IDs代表了一个给定的生物过程子集(使用GO术语描述)。 ** Onto-Express Onto-Express搜索公共数据库并返回一系列表格，包换相关表达谱、基因细胞发生定位(cytogenetic gene locations)、生物医学和分子功能、生物过程、细胞组分和翻译的蛋白的细胞功能。 ** Onto-Miner Onto-Miner允许用户通过clone ID, UniGene gene symbol, LocusLink ID, accession number等搜索不同的公开生物信息学数据库，允许使用基因列表进行批量检索。第三方开发者可以把这个站点作为资源，提供对于任意的基因列表的详细基因信息。 ?? * Onto-Translate Onto-Translate是基于web的工具，允许用户对下列ID进行快速转换：accessions IDs, Unigene cluster IDs 和Affymetrix probe IDs。Onto-Translate使用不同的数据库并降低任意基因列表的冗余，帮助识别相同的信息。 ** OntoGate OntoGate提供使用GO术语和与GO术语相关的外部数据库进入GenomeMatrix(GM)的入口，以找寻GM中不同物种的基因，这些基因能到映射到GO术语上。OntoGate包含了对相应注释基因的氨基酸序列进行BLAST搜索。 ** Ontologizer Ontologizer能够对一组或多组基因或基因产物产生相应 的GO注释，并根据每一个聚类的使用频率进行排列，以HTML或XML格式显示。如果提供了总体的数据集，程序会对每一个GO术语执行过表达的统计分析。产生“Dot"(GraphViz)文件对过表达的GO术语提供图形化概述。提供了每一个基因的详细列表。 ** Ontology Traverser Ontology Traverser是芯片基因列表富集工具，此工具为一些cDNA芯片和相对于芯片类型所使用的所有探针/克隆集列表提供了简单的上传格式，接收AffyIDs和NIAIDs。支持许多报告格式：flat html,flat tsv, xml和展示GO结构的动态可点击HTML。对每一个GO节点报告不同的统计/结果:列表fq, 芯片fq, fold change,? Fisher's exact test P值和基因的映射到的节点或子节点的标识。 ** Probe Explorer Probe Explorer是一个开放使用的基于web的生物信息学程序，显示芯片寡核苷酸探针和在基因组上下文中的转录本的关联，此软件很灵活，可以简单地作为基因组和转录组的浏览器。提供了15种后生动物(metazoa)和两种酵母提供基因组实体(genomic entities)(位点, 外显子, 转录本)的序列和对等物包括矢量图输出。序列比对工具用来建立Affymetrix芯片探针序列和转录组(人，小鼠，大鼠和酵母)之间的关联。提供使用任何的DNA或蛋白序列进行关键字搜索、用户搜索和在基因组上进行比对。 ** ProfCom: ProfCom, Profiling of Complex Functionality ProfCom是基于web的工具，用于对实验相关的基因列表进行功能解释。使得ProfCom成为独特工具的一个特征是除了GO术语外还可以使用复杂函数(complex function)进行富集分析。复杂函数由可用的GO术语的布尔组合构建。ProfCom对复杂函数作推断能够更加特异地比较单个的术语并更为准确地描述基因的功能。 ** SeqExpress SeqExpress是一个综合的分析和可视化软件包，用于基因表达实验。组合了特定开发的技术和通用的统计学方法，GO被用来对聚类的功能富集进行打分。这些结果能够在内嵌的浏览工具或通过通过网页进行浏览。SeqExpress还支持许多数据转换，投影(projection)，可视化显示，文件输入/输出，搜索，与R整合，和聚类等选项。 ** SerbGO SerbGO是基于web的工具，帮助研究者确定那一个基因芯片分析工具、GO语义分析工具适合他们的项目。SerbGO是一个双向(bidirectional)程序。用户能通过检索表单索要感兴趣的工具的特性，用户还能比较每一个工具所实现的特性。 ** SOURCE SOURCE编辑来自多个公开访问的数据库(包括UniGene, dbEST, UniProt Knowledgebase, GeneMap99, RHdb, GeneCards和LocusLink)的信息，SOURCE使用的GO术语与LocusLink相关。 ** Spotfire Gene Ontology Advantage Application (商业软件) Spotfire Gene Ontology Advantage Application整合GO注释和基因表达分析。研究者在DecisionSite里可视化地选择一个子集的基因，软件展示了基因的GO等级分布。类似地，在GO等级里选择任何的过程、功能或细胞定位可以在DecisionSite里可视化地显示其相应的基因。 ** STEM: Short Time-series Expression Miner STEM是一个Java程序，用于聚类、比较和可视化短时间序列的基因表达数据(少于或等于8个时间点)。STEM允许研究者识别显著性的时间表达谱和与这些表达谱相关的基因，并比较不同条件下这些基因的行为。STEM完整地整合了GO数据库，并支持对具有相同的时间表达谱的基因集做GO类别富集分析。STEM还支持对特定GO类别的基因行为进行简易的识别和可视化，识别在这些基因中那些时间表达谱被富集。 ** T-Profiler T-Profiler使用t检验对预定义的基因集的平均活性改变进行打分。基因集分别基于GO类别、ChIP-chip实验、上游与相应的转录因子结合模体匹配、在相同染色体上的定位进行定义。一个大折刀(jack-knife)过程使得计算比其它软件要更为稳健。T-Profiler使得对芯片数据进行解析以直观和严格统计成为可能，而不需要结合实验或者选择参数。 ** THEA:Tools for High-throughput Experiments Analysis THEA是一个整合的信息处理系统，用于分析后基因组数据。可以自动化进行数据(由通过选择的生物学信息包括GO进行分类)注释。用户可以对这些注释手动搜索和浏览，或根据统计标准(数据挖掘)产生有意义的概述。 其它工具 ** APID：Agile Protein Interaction Data Analyzer? APID是一个交互的生物信息学web工具，在一个统一的和比较性的主要平台，用于整合和分析，目前已知的信息是由特定的小规模或大规模的实验方法所展示的蛋白质相互作用。目前，此应用程序包含来自于5个主要数据库资源的信息，装入于单一服务器以探索4万个不同蛋白和接近于15万已证实的不同相互作用。网站包含搜索工具以检索和浏览数据，允许通过计算的参数选择相互作用对，这些参数衡量每一个特定的蛋白相互作用的可靠性。蛋白的参数是连通性、聚类系数、GO功能环境、GO环境富集;相互作用方式的数目、GO重叠(GO overlapping)、iPfam结构域-结构域相互作用。APID同样包含了一个图形互动的工具用来显示选择的子网或者整个网络以及对其导航。 ** Blast2GO B2G基于GO注释和功能分析进行相似性搜索。B2G对基因功能信息可能性提供直接的统计分析并在GO有向非循环图中高亮显示相应的功能特性。而且B2G包含了不同的统计图表概述了包括BLASTing、GO映射、注释和富集分析(Fisher's Exact Test)。所有的分析过程是可配置的以及支持在任何分析阶段进行数据的输入和输出。这一程序同样接受已存在的BLAST或注释文件并将它们加入到后续的分析中。这个工具还提供了非常合适的平台来进行非模式生物的高通量功能基因组研究。B2G是一个不依赖于物种、直观和互动的桌面程序，允许监示和理解整个注释和分析过程，分析过程支持附加的特性如GO Slim整合，考虑evidence code(EC)，批量模式或GO多水平饼图。 ** Db for Dummies! DBD是一个小数据库，导入GO Slim，它允许数据以树的形式显示。 ** Flash GViewer Fash GViewer是一定制的Flash电影能够轻易地被嵌入到网页以显示染色体上单独特性的位点。它试图提供特定特征集(如基因相关的特定GO术语等)的基因组位点的概述，而不是显示基因组的特性。特性能超链接到外部的网页以获得细节信息，使得GView能够作为一个导航工具。提供了大鼠、小鼠、人和线虫的基因组图谱(其它的基因组图谱也能够创建)。注释数据以静态的文本文件提供或者通过服务器端的脚本产生XML文件。 这个工具不是GO特异的，但是设计成可以显示GO注释数据。 ** FunSpec FunSpec是一个基于web的工具，对基因和蛋白集(如共调控基因、蛋白复合体、基因相互作用)基于已存在的注释包括GO术语进行统计评估。 ** FuSSiMeG:Functional Semantic Similarity Measure between Gene Products 能够通过比较基因注释中GO术语间的语义相似性来衡量基因产物间的功能相似性。还可以对任意GO术语进行语义相似性评估。 ** Generic GO Term Mapper Generic GO Term Mapper映射基因列表中的粒状GO注释(granular GO annotations)到更为广泛、更高水平的GO父节点术语(有时候索引到GO Slim术语上)，允许把基因归到更大的类别里。 ** Genes2Diseases Gene2Disease是一个映射到人类遗传疾病的候选基因的数据库。通过使用分析相关的表型特征和生化实体(chemical objects)、从生化实体到GO蛋白功能术语以及基于MEDLINE和RefSeq数据库产生了本数据库。能够用来显示特定遗传疾病相关的所有GO术语。 ** GO Slim Mapper GO Slim Mapper用来注释出芽酵母基因产物，使用SGD GO Slim集，映射特定的粒状GO术语(granular GO terms)到相应的更为通用的GO slim父节点术语上。 ** GO Terms Classification Counter GO Terms Classification Counter以一个包含GO术语IDs的格式化或非格式化文本文件作为输入，用户选择以下可供选择的类别如GO_slim、GOA、EGAD、MGI_GO_slim或GO-ROOT，程序执行计数，并返回结果于网页上(如果时间长的话，程序会给用户发送含有结果的链接)。结果包含了计数表格、百分比和一个饼图。 ** GOBU:Gene Ontology Browsing Utility GOBU是一个基于Java的程序，使用GO和用户定义的等级两大目录(catalogs)在一个可扩展的体系下整合生物学注释目录(biological annotation catalogs)。GOBU拥有以下的特性:(1)用户特定的等级数据作为输入数据，(2)用户定义描述不同注释的数据类型，(3)一个处理用户定义的数据类型的可扩展软件体系。 ** GOChase GOChase是一系列基于web的工具，用于检测和纠正基于GO注释的错误。 .GOChase-History解决所有GO IDs修改的历史。 .GOChase-Correct高亮显示整合的GO IDs和重定向到正确主术语并进一步到整合的二级ID。对于过时的GO术语，GOChase推荐使用最短距离的非丢弃父术语。这个功能被用于GO浏览器如AmiGO和QuickGO以修复失效的超链接。 .完整的数据库(如LocusLink)可以作为平文件载入到GOChase里，报导注释错误和GOChase的纠正。 .当给一个GO ID输入时，GOChase会给出所有主要数据库里被这一GO ID所注释的所有基因产物。 ** GOProfiler GOProfiler对AgBase中可用的GO注释提供一个概述。用户提供一个物种(分类学id)，GOProfiler显示此物种GO相关的数目和蛋白注释的数目。结果以evidence code列出，并提供了一个未被注释的蛋白列表。 ** GORetriever 用户提供一个蛋白ID列表，GORetriever在AgBase里搜索相应的GO注释，目前支持的ID类型是Uniprot ID、Uniprot Accession、GO ID。GORetriever产生蛋白和相应注释的列表以及一个没有GO注释的入口列表(list of entries)。没有GO注释的列表可以作为Goanna工具的输入以寻找相似序列(如果有注释的话会提供)。 ** GOSlimViewer GOSlimViewer对一个数据集提供高水平的GO类别概述。它设计成使用GORetriever的输出。你可以为GORetriever文件添加附加的注释(来自于GOanna或其它的资源).GOSlim Viewer目前只支持GOSlim集。 ** ProteInOn ProteInOn能够找寻相互作用的蛋白、找寻相应的GO术语并计算蛋白相似的功能语义并获取信息内容和计算每个GO术语的功能语义相似性。 ** TXTGate TXTGate基于web-service，结合选择的公开生物学资源的文献索引到一个灵活的文本挖掘系统以分析不同的基因集。通过裁剪词汇表(tailored vacabularies)、选择文本文件、LocusLink的MedLine摘要和索引SGD。子聚类(subcluster)和到各个外部资源的链接提供了对结果进行深度分析。 ** Wandora Wandora是一个基于Topic Maps(ISO 13250)的通用知识抽提、管理和发布环境。Wandora支持OBO平文件v1.2格式，能够对OBO文件(包括GO)和topic map进行相互转换。Wandora对于非常适合于显示OBO以及结合OBO、RDF和Topic Map资源进行知识整合(knowledge mashups)。 ** WEGO:Web Gene Ontology Annotation Plot WEGO是一个简单但有用的工具，用于绘制GO注释结果图。与其它的商业软件的图表创建不同，WEGO设计成处理GO的有向非循环图(directed acyclic graph, DAG)结构以便于为GO注释结果创建直方图。WEGO已经在许多的生物学研究项目中得到应用，包括水稻基因组项目和蚕基因组项目。它已经成为一个下游基因注释分析的有用工具，特别适合于执行比较基因组任务。 ** Whatizit Whatizit是一个web程序，重点突出在文档中所有感兴趣的东西。它的一个模块标识所有的GO术语和来自于UniProt蛋白跟基因的名称，并分别链接到GO和UniProt上。 为了您的安全，请只打开来源可靠的网址 打开网站 取消 来自: http://hi.baidu.com/createmiracle/blog/item/6f03bc19e1dcba61dbb4bd57.html

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[转载]工具理性与创意学问

guoweihehe 2012-5-4 19:34

工具理性与创意学问 ( 链接 http://www.infzm.com/content/74858) 作者： 李弘祺 真正有创意的学问只要纸和笔就可以了，而且只要你肯花时间，便可以读得懂 1979 年，我有次在斯坦福大学休假，不意触及几何平均与算术平均的问题，虽然大概知道是怎么一回事，但不能确定自己的了解无误，就去问我的一位数学家朋友，萧荫堂教授，他简单地确认我的了解还算正确，但是告诉我说，如果想进一步知道有关数学统计的问题，可以看某本波兰人写的书。萧荫堂教授随即就把那本书丢给了我。 我读了一大半天，经过一个多礼拜，连第二页都无法翻过去。整本书密密麻麻都是公式，所以只好掷笔三叹，承认隔行如隔山，回去跟萧荫堂教授讲，实在没有办法看得懂。他听了大笑，告诉我说，如果先看过另外一本书，那就看得懂了。于是我就跑去图书馆借那本书来看。果不其然，这本书仍然是天书，我只能仰天长叹，觉得自己天分何以这么有限。过了几天，我又去找萧荫堂教授说，实在看不懂。他又笑笑说，如果您看了一本统计学概论，而在那之前学过微积分，那么就看得懂了。我说这岂不是要花个两三年功夫，我才能真正知道“数学平均”的奥秘。他说看得懂那本波兰人写的数学统计的书，就有博士班学生的程度了，所以是要一些时间，但也不至于要那么多的功夫，大约一年多就够了。 这件事已经过了三十多年，我也一直不曾有计划或系统地读有关数学统计的东西。但是按照萧荫堂教授的说法，要看得懂数学的书，只需用一支笔、一块橡皮擦和一些纸，花一些时间，这就够了，没什么大不了的事。我觉得他的意思是更不需要什么仪器或工具。对他来说，这才是数学家的真正境界，简直就好像哲学家或艺术家一样。有些数学家用计算器来推算圆周率的数值，虽然可以推到小数点后的几百万位数，但在他看来，这不过是拿计算器这个工具反反复复的“机械”工作，完全没能达到创意的境界，不算是真正值得学的数学。 说起铅笔，说起仪器，这些都是工具。对什么是“工具”，我是一再地反复思考。显然，在萧荫堂教授看来，越不用工具，创造性才越是彰显；用了很多工具的，往往都只是替人家作注解。像爱因斯坦的理论，人家必须用复杂的天文工具来证实，但他可是在邮局做事时，用包装纸写出来的。如果用库恩（ Thomas Kuhn ）的话来说，爱因斯坦是创造典范的人，其他很多物理学家做的不过只是继续发展这个典范，是做“常态科学”（ normal science ）的事。后者便常常借用许多不同的工具，而不像前者只靠一支简单的笔。 借用大量工具来做学问的人，工具一旦被控制、被剥夺，他就如同丧失了自己，变成了“我不在，故我不思”了。不思了，当然失去创造力。 马克思批判资本主义社会，就是说在资本主义社会，人们被迫和他的工具疏离，因为工具被资本家控制了。这就是有名的“疏离”的观念，是马克思年轻时就发展出来的，是非常深刻的分析。能控制工人维生的工具的，最主要是国家或是大资本家。 无怪乎梭罗（ Thoreau ）反抗麻州政府的税制时，跑到波士顿城郊的瓦尔登湖，逃避缴税。他亲手造铅笔谋生，同时写作著名的《湖滨散记》。他依赖铅笔维生，带有充分的象征意义，对一个作家来说，铅笔是不可剥夺的重要工具。 人被迫和他的工具疏离，这是资本家控制“无产阶级”的方法。因为阶级的剥削，遂种下共产革命的种子。人很怕失去工具，不愿随便让人家控制工具。而资本家要控制人，他就必须先垄断他的工具。 数学家瞧不起工具性的研究，这是很值得重视的现象，这个现象或许不能从马克思的角度来论述， 但是现代科学仰赖工具的情况日益严重，像原子加速器，或是纳米的实验室，这些都只能仰赖资本家或国家（或学阀）的力量才能建造，缺乏这样的“工具”，许多实验无法进行，对学术和社会的影响非常巨大。 许多学科必须通过仪器或机器的使用来进行，因此谁控制了“工具”，谁就控制了该学科的内容和发展，这是不争的事实。 我常常在想，仰赖仪器或工具的学科，真是与艺术、哲学或数学这些充满创意的学术有天壤之别。上面说，只要一个人循序自修，阅读教材，他不只可以完全了解哲学或艺术作品，而且甚至于可以达到数学研究生的程度。但是他如果想要了解高温物理，或是一般的工程知识，那么就必须有使用各种设施及仪器的机会，没有这样的机会，就无法真正了解教科书的内容。这就使得这些学科充满了工具性。这两样看来不同的学术，其差别竟然是在于工具的取得与否，好似没有本质上的差异。 科技知识与人文知识的差别大概在 17 世纪以后被凸显出来。因为笛卡儿的影响，我们往往以为科技知识一般人读不懂，而人文艺术的知识则是一般人所可以读得懂的。其实读得懂或读不懂主要在于工具的掌握，而不在于学问的本质。 资本家、大学或国家控制求知的工具，美其名为高等的知识，是一般人所读不懂的，甚至于说不经过他们指定的老师或专家来教便学不会。许多知识就这么被垄断了。具有创意的学科，反而常常被认为不是专业知识，人人都可以自由发挥，而只要花点时间都读得懂。 当然，知识的累积不能不循序渐进，仰赖工具的使用与发展。但另一方面，正如我的朋友所说的，真正有创意的学问只要纸和笔就可以了，而且只要你肯花时间，便可以读得懂。我做中国教育史，随手拈来便可以提到像“解额”、“南北榜”、“省试”或“蒙求”这些名词。它们看似高深莫测，但是只要花一些时间也就看得懂。然而，历史的知识毕竟还是必须通过掌握基本数据才能得到初步的认识。另一方面，只要借用工具书，却又很容易看得懂它们。工具的掌握的确很重要。但工具本身当然不算“学问”。 由此看来，定义学术的本质不应该以工具的使用为标准。 一门好的学问应该是如何能在不受工具的限制之下，仍然发展合乎理性的思维，以让那些具有追求之心灵（ inquisitive mind ）的读书人容易了解，并且读起来有趣，一辈子都受益，不断地想再读它，而且会因年齿长大而了解益为深刻，这才是最有创意的学术。 也许可以这么说，天下的学问都是相同的，但必须对现有的成果尊重，并努力探索如何可以突破。只依赖垄断工具，不加思考地认为使用越复杂的工具的学问，才是真正高深的学术，这是资本家或政治机器控制人的创意和独立思考的托词。 探索伟大的自然和其中的奥秘，人一定要仰赖工具，并不断改善它的使用，但是人的最大挑战就在于避免工具的被控制或垄断。 德国社会学家马克斯·韦伯在反省这些课题时，认为科技知识仰赖的不外是“工具理性”。虽然他说的和我这里讲的并不完全相同，但韦伯的用语却很有趣，非常生动地替科技知识作了贴切的描绘。 （作者为历史学教授）

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《在交大哪有学术委员会的权力，她只不过是王书记的工具！

热度 4 cyj 2012-5-3 13:12

《在交大哪有学术委员会的权力，她只不过是王书记的工具！》 卢天健（在录音带第 57 分钟的时候）说道： “专家感到无能为力。我建意学校呢，让纪委，财务，包括冯全科，或谁谁，那么您和成立一个调查组 ， 但是我又在想，成立这样一个调查组，能起多大的作用，学校，如果不理，你也没办法。如果理，你是也是完全有可能，能够得的到一个你们希望看到的结果。” 作为学校的科技副校长，他居然这样的无奈失落和没有信心，是因为他已经在处理教育部一等奖的过程中，尝到王书记独断专行的滋味。他说道：“ 当时我是评论学术委员会程序主任，虞烈老师是学术委员会关键人，由他来协调，主打协调我们学术委员会的其他人，当时是 21 人。 （录音带第 10 分钟 50 秒） ，最终还是形成了一个两三条意见，认为李连生在教育部这个奖申报的过程当中有一些，我们认为不太符合规范，或者说不检点。最终形成了这个决议，上报教育部，把当年这个奖给撤消了。” 卢天健当然清楚，王书记并没有采纳学术委员会的意见，所以，后来能够很容易的把教育部一等奖又从教育部要回来给了李连生。 不然，李连生怎么会又要申报国家科技进步奖？ 卢天健尽管说了 “我不给李连生盖章子，如果他以自然人去申报，那我管不着。最后学校还是没有让李连生申报成。 ”这样的话，然而，他是十分的无可奈何，卢天健当然明白，那个教育部奖早就到了李连生手中。 因此说，王建华虽然说的头头是道 “学校又不是一个人说了算，我们有一整套…… 。”其实，学校的学术委员会，只不过是王建华书记的一个挡箭牌，拿来做幌子而已，历史告诉我们 ; 在西安交通大学，就是王建华一个人说了算！！ 陈永江 2012年5月3日

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辩证

热度 1 metanb 2012-4-23 06:56

不论是儒家经典还是马列主义，一旦用作青少年的思想灌输工具，它们就具有了反动性。

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工具

热度 1 metanb 2012-4-19 12:49

物理和数学都可以看作哲学的工具，而后者为前者提供看法。

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明确科学博客大赛【参赛主题】

热度 3 outcrop 2012-4-19 09:11

昨晚仔细看了下科学博客大赛的细则，发现休博一周可能亏了；为了写好接下来的博文，做到以参赛促进知识的总结，决定明确一下自己参赛的主题。 想来想去，觉得可写的主题不少，不过还是决定选一个目前比较冷的主题；暂时确定为： 开放源代码工具在科研与生活中的应用 。 这是一个实用性比较强的主题，初步考虑下面的具体内容： 展现开源文化与理念 。一直觉得开源软件与工具很适合科研人员使用与研究，开放源代码使得软件用起来很自由，科研工作者也有可能有能力去使用、改良这些软件。相关专业的，在开源软件的基础上做进一步的研究，也是很多的。这部分打算聊聊开源的历史、文化、相关协议等内容。 展现开源工具在科研与生活中的应用 。对于计算机技术爱好者以外的老师和同学来说，接触开源软件的机会较少。所以这部分就打算介绍一些我安装使用过，并认为不错的科研、生活相关开源软件，对这些软件做一个简要的描述与链接。 因此这次我参赛的主题关键字是： 开源、科研、应用 。 欢迎更多没有报名的朋友参赛，请点击下面链接报名即可： http://bbs.sciencenet.cn/home.php?mod=spacedo=teamview=joinfromuid=1750mark=blog 邀请您参赛，我有积分，哈哈~~拜托点击报名参赛： 重在参与，友谊第一！ 接下来，规划下参赛博文的内容与结构。 =============================关于博主============================= 博主的主要兴趣是：知识管理；相关兴趣有：语义网、机电及DIY、哲学与心理、信息安全、科幻等。 我的常用博客在科学网 （访问可点链接，下同）； 新浪微博是@outcrop ，欢迎互粉；建了一个超级QQ群：17662971，希望能闲聊无白丁，欢迎加入；自己打理着一个 机电工程师 小网站，欢迎来玩。无宗教信仰，提倡动物保护。最近在科学网关注“ 科学网大学 ”，欢迎加入 科学网大学群组 讨论、尝试。

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ncbi上的格式转换工具

liujd 2012-4-7 23:49

ftp://ftp.ncbi.nih.gov/toolbox/ncbi_tools/converters

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科研协作与协作工具

热度 3 zhaodl 2012-4-7 10:15

当今社会，是一个协作的时代，单打独斗很难参与竞争。科学研究也是如此，没有协作，很难承接大的项目，为此国家层面上开始推动“协同创新”计划。昨天，在没有被邀请的情况下，参加了青年教师协会组织的“学科交叉座谈会”。七位能源动力学科的青年教师，介绍了自己的研究方向，并提出了需要其他学科配合的技术需求，一定程度上实现了不同学科之间的交流。 据此，我也发现了一个问题：在基于本学科拓展的过程中，所涉及到的相关学科，实际校内就有人做的比较好，而自己都不知道。针对能动学科来讲，传热、流动和燃烧是基础学科，但是在解决社会问题时，往往需要数学、化学和物理学，以及材料、医学甚至是社会科学的支撑。隔行如隔山，实际上是各行业的研究者之间的不了解、少交往是其中的重要原因。 如何能够使不同学科之间的研究者能够做到相互之间的交流日常化？我在5年前的教代会提案中提过“借助网络，搭建校内学科交流平台”，就是试图实现学校内部不同学科之间的“日常”交流。尽管是获得了“优秀提案奖”，但是并没有见到实质的推动效果。 为此，我再次思考起“科研协作”的途径和工具问题。所以想起来，多年来与钱博士一起研发的科研协作系统。前几天，钱博士短信通知我基于网络的科研协作系统3.0已经上线，反映良好。 我注册了一个帐号，上去使用了一下。我感觉，也值得祝贺一下，基本实现了我的设想！首先，是基于研究团队的：文献收集和整理、文献阅读和笔记、文献分享和交流，包括一定程度的团队内的讨论和负责人（管理员）对成员的业绩考核。如果再扩大一下，也可以邀请一些团队外成员的参与，或者是将自己团队的研究动态和信息，开放给公共平台的相关学科人员了解。 这样，基于同一个协作平台的用户，就可以实现“小团队”的紧密联系与公共平台上用户的可控制的适当交流。还可以根据自己关注的学科或团队，订阅其动态信息。这样就在不费神的情况下，将学科间的交流日常化。另外，还有一个基本功能“论文写作助手”——管理参考文献并自动插入文献列表。

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[转载]改革的要义

热度 2 maomaoyu 2012-4-1 09:16

以下转载的是在素颜格格网站上的一篇文章，希望不会被删掉，呵呵。 http://wenyu.wen.blog.163.com/blog/#m=0 一系列的政治动荡，随着“亮相主义”的实施表面趋于平静，但暗流涌动却是不争的事实。这股暗流并不在于背后的大换血，并不在于背后的新权力分配，而在于13亿迷茫的眼睛。而我就是十三亿之一。 专制体制下，无休止的权力斗争所造成的恶果最终都要民众来买单。人民成了一个随意被塑造的工具，时而可以被塑造为“主人”，时而可以被塑造成“超粉”，时而可以被塑造成“暴民”。但他们的社会地位始终没有改变。毕竟社会前进的动力是人，就算愚民也有觉醒的那一天。让他们觉醒的倒未必是什么思想、什么主义，往往只是一碗饭的问题。社会在发展，人的要求也会越来越高。而许多问题不及时解决，到最后就会形成总爆发。中国改开30年的弊端到如今已经无法继续雪藏，已经无法用一个手指和九个手指来说明了，因为这一个手指已经粗如儿臂了。所以纵观国内外局势，说中国到了最危险的时候毫不过分。 在这种情况下，如何能带领国人走出逆境，是摆在最高政府面前的首要任务。而要做得好得有几个客观结果来证明。首先中国要稳定，不能乱，不能在搞什么“轰轰烈烈”“文攻武卫”了。从这点说，“亮相主义”也有他的“可取性”，起码告诉民众你们很“和谐”。中国不能翻船，因为无论什么样的动荡，最后倒霉的都是老百姓，正所谓“兴，百姓苦，亡，百姓苦。”所以，能用改革解决的问题就不要用革命。而改革这一词语，已经在三十年来被演变成鸡肋。每次“狼来了”带给“羊”的都是更加深重的灾难。所谓这么多年的体制改革，不过是利益集团的就地分赃。而对于“羊”来说，依然没能改变被吃的命运。所以，如果这一次不能让改革的口号脚踏实地的“着陆”，准确的降落到“羊圈”里，那么“羊跳圈”迟早的事情。 据说改革的时间表路线图已经画好，而且目前在温州已经开始动作。但在我看来这些远远不够。在我看来，中国一切改革的要义在于政改，因为中国的一切问题的根本就是权力私有化的问题，无论封建社会还是社会主义社会还是现在的特色社会，实际上他们统治本质都没变，那就是“依权治国”。真正能治理一个国家的还是他的人民，而唯一的治国方法那就是“黜权治国”。如果不解决这个问题，所有的改革最终还是会演变成“坐地分赃”。即便给百姓几根骨头，那也是为“分赃大局”抛出的诱饵，解决不了最根本的问题。我没奢望一觉醒来，人手一票，三权分立，这对改革者来说太难，做不到。但是你可以做到的是官员公布财产，可以把裸官清除出权力空间。我没要求你做到马上把借出去的钱要回来，但你可以做到严惩卖国贼，可以做到公布一些真相。我没要求你一夜之间言论ZI由、开放报禁，但起码你可以做到不打压民众言论。整天公布制裁了造谣网站不是好办法，因为谣言空间是你们给的，民众所以信谣，是因为没有别的参考。言论都不敢放开，你跟我大谈特谈人民群众监督权力？广东省12家大地产商都是高干子弟，上海市10家大地产商，有9家为高干子弟为老板；15家工程建筑承包商，除2家属于国企外，13家都是高干子弟。江苏省有22家大地产商、15家工程建筑承包商，清一色由干部子女操控。这些人的父亲包括现职副省长、省人大副主任、前省委副书记、前省法院院长等。你敢不敢跟人民解释一下？让民众监督一下？ 我并不奢望一夜之间都成为有钱人，都有车有房。那样你们做不到，但你可以做到让他们有基本的生活保障，你的保障房可以建设了，而不是停留在口号上，而不是三年才完成进度的30%。你可以控制物价上涨，你可以让职工工资像公务员工资一样的上涨速度。你可以把国家教育预算费用真正用到位。 改革需要民众的觉醒与支持这句话说的很对，但问题在于我认为当前情况下，民众已经算是觉醒了。他们知道谁给他们好处他们就拥护谁，这不是最大的觉醒吗？因而你如果能真心的给他们好处，他们会不支持吗？西南人不在乎三少是阴谋家还是野心家，更不在乎他是白色恐怖还是文革余孽，更不会在乎他的如何贪赃枉法，他们只在乎谁给了他们的好处。这一点不值得你们借鉴吗？不要奢望老百姓有多高的思想政治觉悟，你先满足他们的基础需求再说。这才是改革的真正的要义。 所以，现在谈拥护谁还太早，民众的觉醒在于不会再听谁空喊了。如果不能真正给老百姓带来切实利益，你就算喊破喉咙也不过是演戏而已。听其言、观其行，这才是正道。而如果还是一如既往的雷声大雨点小，或者挂羊头卖狗肉，那么就不会有人在相信了。老百姓可以让子弹飞一会儿，但绝不会等到它脱靶落地了还无动于衷。而对于任何一个当权者来说，无论从时间到空间，都不许再打“穷胡”了，这一盘很大的“麻将”已经打了几十年了。如果你们还不胡，那百姓可真的要迫不及待的“点炮”了。 承认你们有阻力，但我更相信，只要你真的代表人民的利益，真的敢于担负起历史重任，人民就一定会支持你们。有了民众的支持，还有什么可怕的呢？

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思考题（九）利用日晷能否测定地理纬度？

qianlivan 2012-3-31 14:08

使用日晷能否测量地理纬度？除了日晷，还需要什么工具？

个人分类: 知识|4015 次阅读|0 个评论

史上最全学术论文网站聚合工具，没有你查不到的资源

热度 3 ChinaAbel 2012-3-27 00:25

郑重声明：本博文收集的软件仅限学术研究使用，请勿商用，否则后果自负！ 方便大家可以搜索到来自谷歌学术、万方数据、ilib2、知网、MBA智库、scirus、microsoft academic、HighWire等国内外学术网站的资料，让资料 的寻找更简单、快捷。 http://www.soba8.com/paper.htm （注：切换国家后，用相应语言搜索效果更好）如果不能使用请认真看教程，下载所需的插件。 论文文献资料搜索助手.rar 豆丁、百度文库免费下载器 还是一款不错的软件，可以免费下载豆丁、百度文库里要钱要积分的文章，使用这个下载后文件会转为PDF格式的文件。 latest.rar 转自 http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=4245104 或者使用下述方法来破解百度文库的文章下载限制： 首先，我们按照平常的习惯，找到自己要的文章，但有时候不能复制，题目总是可以的吧。我们把题目记住之后， 在搜索引擎的框框里输入： site :wenku.baidu.com +题目 【site命令是指在制定的网站里搜索，加号也是要的，如果嫌输入加号麻烦，可以用空格代替。】 如搜索android+论文，输入：site:wenku.baidu.com android+论文 （中间有空格） 搜索引擎都有网页网页快照，如百度有百度快照，谷歌有网页快照，我们点击快照进入网址. 打开网页快照或百度快照之后，我们就可以看到以网页形式显示的百度文库正文内容了。 最后，我们只需要将内容复制下来就可以，粘贴到WORD等文本编辑器里，就可以保存下来了。 百度快照：任意搜一个东西，每一条信息最后会有一项是--百度快照，就是它。 就这几步，就轻松的破解百度文库下载，简单又实用。 无论磁盘、U盘文件删除多久，重新找回不是梦。推荐一款永久免费、免安装软件： DiskGenius DG371Free_x86.zip 王伟华：最全面的文献检索知识讲座

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好用的通用专家系统开发工具是？可否方便（免费）获得？

lg21c 2012-3-23 11:01

好用的通用专家系统开发工具是？可否方便（免费）获得？

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来自vi文本编辑器的魔力

热度 2 GoogleMIT 2012-3-20 21:01

自上次深刻忏悔自己在Linux这片沃土上不务正业以来，我开始花费时间和精力在这处女地之上。 最近“把玩”的是vi文本编辑器，可能是玩性不改的缘故，我还是喜欢将玩和Linux中的任何元素联系在一起。 尽管之前不务正业，但是发现现在学习起来的效率还是很高的，兴致也是相当高昂的，于是我趁热打铁顺手，借着办公室的网络先把这篇小文献上，借以抛砖引玉，希望Linux的新手们能够关注vi文本编辑器这一强大的工具，而不至于像我当年那样对此工具熟视无睹。 我经常用的是vim version 7.2.330 by Bram Moolenaar，也就是vi improved,升级版本而已。vi最初是在Unix系统中的，深受程序员的喜爱，但是由于一些功能限制，有人（此人就是上文中的 Bram Moolenaar，大牛级人物，著名程式设计师，vim的创造者，在自由软件领域享有声望，2010年进入微软工作 ）发明了vim这个东东，最初的缩写是Vi IMitation，随着功能的增加才叫做vi improved. 如果你现在用的也是和我一样的Ubuntu Linux，那你在终端就下个指令vi吧，目前大部分Linux系统中也都是装了vi编辑器的，指令下vi！这个指令就会告诉你你系统中的vi编辑器的版本信息以及粗略的版本信息。 如果你要深度学习，可以推荐的书就是我自己也用的《学习vi》（第六版），目前应该是第七版了，叫做《学习vi和vim编辑器》，我跟这几位大牛作者不熟，所以我可不是来推销书的。书中章节清晰，循序渐进，从基本操作到深度组合操作，介绍了vi，ex等编辑方式，是一本让我读了之后欲罢不能的书，读了之后还想继续读下去。可能这也得看个人吧，至少它很对我胃口。我时常能够在书中找到神来之笔，也许不是来自书中，或许是vi编辑器本身的魔力，我想你也会喜欢它的。 学习Linux，学习vi的朋友们都应该懂的，光说不练加把式，所以要深度掌握，唯一的方法就是不断得练习，不断的测试。 也许初学者觉得干嘛要用这种需要下指令才能编辑的编辑器呢？为什么我的鼠标不用偏要全键盘呢？至少我猜测我妈会这么问我的。 这个我无法回答你，因为我说了你也不信。 just have a try！感受来自vi的魔力。 刚刚无疑看到ed,ex,vi,vim的发展，是一位老师写的，在此引用这位不知姓名的老师在cnblogs上发表的博文 http://www.cnblogs.com/jplee/archive/2006/10/24/538732.html ： 一、VIM的历史 1. ed ed是UNIX上最古老最基本的编辑器，它最初是UNIX之父Ken Thompson编写的，他第一次在 ed中应用了正则表达式（regular expression），这个创举将RE理论带入了实践，对UNIX界造 成了深远的影响。 实际上ed是受来自加州伯克利大学的QED编辑器的影响，Ken便是从这所院 校这里毕业的。 ed是一种行模式编辑器，下面是一个ed会话的例子： $ ed greeting 0# 因为新创建文件，所以读入了0个字节 a# 进入编辑模式（append） hello world, eveyone.# 输入一行文本 .# 回到命令模式 1p# 显示（print）第一行 hello world, eveyone. 1c# 最后一个词写错了，修改（change）第一行 hello world, everyone. .# 回到命令模式 1p# 重新显示第一行，这回发现无误 hello world, everyone. q# 退出（quit） ?# ?表示没有保存或者命令不认识 w# 保存（write） 23# 提示写了23个字节 q# 退出 也许大家觉得这个编辑器很难用，可是在70年代，许多使用UNIX的人都是用廉价的终端机 通过电话线连到UNIX服务器上的，因为传输速率慢，所以这种简洁的行模式编辑就很有意义， 现在虽然硬件有了长足的发展，ed编辑器很少有人用了，但是它的很多理念比如命令字符、正 则表达式却在它的很多后辈身上体现出来。下面这个网址有一些ed的笑话，从中我们或多或少 能体会到那个时代人们的某种精神。 http://www.gnu.org/fun/jokes/ed.msg.html GNU ed:http://www.gnu.org/software/ed/ed.html Reference:http://en.wikipedia.org/wiki/ed http://snap.nlc.dcccd.edu/learn/nlc/ed.html http://cm.bell-labs.com/cm/cs/who/dmr/qed.html http://www.answers.com/topic/ken-thompson 2. ex ex是ed的扩展，实际上vi构建在ex之上，vi引入了现在我们所熟悉的全屏编辑模式。 3. vi 随着硬件的发展，UNIX上许多全屏模式编辑器被开发出来，pico，nano，joe，jed，jove， 但是最为广泛使用的无疑就是VI（nvi，elvis，vim等）和Emacs（GNU Emacs，XEmacs等）。 1976年左右Bill Joy开发了vi，他也是伯克利大学的毕业生，后来他跟其他人一起成立了 Sun Microsystems公司并成为了Sun的首席科学家。一开始Bill开发了ex，尔后开发了vi作为 ex的visual interface，也就是说vi允许一次能看到一屏的文本而非一行，vi也因此得名。在 当今的UNIX系统上，可能没有缺省安装Emacs，但是肯定会有vi，当然，ed编辑器也必定存在 下面引用《Unix技术大全——Internet卷》的一段文字： “ 早期，当键盘和视频终端成为最新的计算机交互手段时，人们开发了VI。那时候的键盘不 具有目前熟悉的全部功能键，所以，VI就设计成只需要打字机的键盘加上退出键就能完成对文 本的输入和修改（现在有的还接受一些其他的键输入方式，如光标控制键）。尽管看起来受了 限制，不能充分利用现代键盘新增的许多键，可是‘祸中有福’，限制带来的好处是手指不离 开打字区就能完成所有的编辑工作。” Reference:http://www.bellevuelinux.org/vi/history.html http://www.theregister.co.uk/2003/09/11/bill_joys_greatest_gift/ 4. VIM 技术不断进步，需求也在不断提高，VI的各种变种也不断涌现，知名的有nvi，elvis， VIM，vile，yzis，其中移植性最好、特性最多、使用最广的当属VIM，VIM主要是Bram Moolenaar 开发的。最初Bram在Amiga计算机上改进一个叫Stevie的VI版本，他称之为“Vi IMitation”。 随着功能的逐渐丰富，VIM的含义也就改成了“Vi IMproved”。相比原始的VI，VIM增加的一 项最重要的功能便是多级撤销，VI只支持一级撤销。

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[转载]ubuntu自启动选项设置

PengJiDing 2012-3-19 19:52

用来设置ubuntu启动选项的工具是 rcconf： sudo apt-get rcconf sudo apt-get install rcconf 在root权限下运行: rcconf 功能更全的是：sysv-rc-conf sudo apt-get update sudo apt-get install sysv-rc-conf 运行： sudo sysv-rc-conf 也可以直接修改/etc/rc0.d ~ /etc/rc6.d和/etc/rcS.d下的东西，S开头的表示启动，K开头的表示不启动。 例如：想关闭vsftpd的开机自动启动，只需sudo mv /etc/rc2.d/S20vsftpd /etc/rc2.d/K20vsftpd就可以了。

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天文图像处理傻瓜操作（一）ds9处理两幅图像

qianlivan 2012-3-19 10:16

天文研究中很多时候需要进行图像处理。根据我自己的经验，刚开始接触的时候总想找一个软件完成所有的操作，但是通常只是能做到用这个软件查看一下图像。因为这些软件里有很多按钮，但是完全不知道该按那一个，尝试一段时间之后，最终还是会觉得自己写程序进行处理比较方便。事实证明，自己写程序确实有足够的灵活性，可以达到各种效果，包括出错。所以有时候还是需要一个标准的软件来比对一下。 最近研究了一下用ds9进行简单的图像处理。以前没怎么用过ds9，我一直把这个软件看做是图像“查看”工具而不是“处理”工具。其实很多图像“查看”工具都是强大的图像“处理”工具，这就像通常被看着“写字板”的word实际上是强大的排版软件。下面就列举一些ds9的傻瓜操作以备不时之需。 1. 同时打开两幅图像 这是一个相对基本的操作，要是做不到这一点，想比较两幅图像、叠放两幅图像就是说梦话了。不要试图使用两次File-Open来打开两幅图像，那样的话最终只打开第二幅图像。正确的做法是 先打开一幅图像，然后新开一页（Frame） Frame-New Frame 然后再 File-Open 打开第二幅图像 2. 把一幅图像的等值线图叠放到第二幅图像上 这是一个常用操作。在打开两幅图像的基础上进行一些操作就可以实现，具体步骤如下。 Analysis 选中Contours，然后选 Contour Parameters 弹出对话框，然后选对话框的 File-Copy Contours 然后到另外一页（Frame，选主界面） Frame-Goto Frame 然后选 Analysis-Contour Parameters 弹出对话框，选对话框的 File-Paste Contours 至此就把第一幅图像的等值线图叠放到了第二幅图上。 本文提到的都是傻瓜操作。当然，实现同样的功能也可以有非傻瓜操作，比如同时打开两幅图，可以在命令行里 ds9 figure1 figure2 至于叠放，估计就没那么简单了。

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[转载]细胞内分子过程成像与控制新技术研究领域取得重要进展

xh618 2012-3-15 10:32

作者:郑企雨、杜灿屏、张艳、陈拥军　　　发表时间:2012-03-06　　　来源:化学科学部 　　在时间与空间上对细胞内的分子过程与新陈代谢进行成像与控制的技术，可为复杂生物学问题的解析提供重要的工具，是现代生命科学研究的前沿与热点。然而，该领域大部分的原创性技术研究都始于西方发达国家。 　　华东理工大学杨弋教授课题组近年来致力于利用化学生物学理念，发展可原位、实时、动态地控制与监测细胞内分子过程与新陈代谢的新方法。在前期的研究中，他们建立了针对二硫键、相邻巯基等蛋白质巯基氧化还原形式的荧光探针及原位与活细胞成像技术，并揭示了线粒体活性氧对这些巯基修饰形式中的重要调控作用，为心血管、炎症等疾病的机制研究提供了重要的工具（Angew. Chem. 2011, 123, 7693）；针对细胞代谢研究的技术瓶颈问题，发明了系列特异性检测核心代谢物NADH的基因编码荧光探针，实现了活细胞各亚细胞结构中对细胞代谢的动态检测与成像，不仅可为细胞、发育等基础研究提供创新方法，也为癌症和代谢类疾病的机制研究与创新药物发现提供了有力工具（Cell Metab. 2011, 14, 555.）。 　　最近，该课题组利用合成生物学与化学生物学方法，成功开发出一种简单、稳定、容易使用的光调控基因表达系统。该系统称为LightOn系统，由一种光调控的转录因子和含有目的基因的转录单元构成。在蓝光存在的情况下，转录因子能够迅速被激活，从而启动目的基因的转录与表达。该系统不仅具有诱导表达效率高、背景低、激活快、表达量可调节等普通诱导表达系统也具有的优点，而且能够在时间和空间上的精确、可逆地控制目标基因的表达水平。课题组利用该系统在小鼠活体内进行实验，实现了红色荧光蛋白在小鼠肝脏的指定区域的光控表达。与此同时，课题组还用光来控制胰岛素的表达与分泌，成功地将患有I型糖尿病小鼠的血糖降到较低水平。由于这些优点，该第三代基因表达系统将可使人类以前所未有的精度在调控目的基因的表达，进而控制各种生命活动，可为发育、神经生物学的复杂生物学问题解析提供有力研究工具，也为干细胞三维定向分化与人工器官构建、时间剂量可调的基因治疗等前沿医疗领域提供新的思路。研究结果发表在2012年3月出版的《Nature Methods》上，这是我国科学家在该杂志发表的首篇论文。由于该研究的重要性，《Nature Methods》杂志还对杨弋教授进行了专访，并在同期的“The Author File”栏目刊出了该发现的背景故事。 　　上述研究得到了国家自然科学基金重大研究计划项目“基于化学小分子探针的信号转导过程研究”的资助。

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[转载]latex+bibtex+jabref

linpandr 2012-3-12 21:26

latex+bibtex+jabref 前言： 能寫的太多了，从方法论到具体细节其实很多都可以说上几句。 簡直不可能一次全部介绍完，所以这里我尽量简洁地给出一些keyword来记录点点滴滴。 工具篇： latex+bibtex+jabref等一系列工具。在office我主要用CTeX套装，而在Linux环境下我用texlive。CTeX的好处是，在windows下使用非常方便，安装好即可使用。另外配套的WinEdt工具已经做好了TeX、LaTeX、PDFLaTeX几种工具，非常方便编译与运行PDF viewer。 bibtex与jabref主要是用来管理文献，我想这里需要另外一篇文章来介绍，不过搜索后发觉这篇文章几经介绍得不错了： 《bibtex现学现卖》： http://derecks.blog.sohu.com/118984444.html 另外，我希望能找到一篇总结bibtex里面各个entry作用，如article，conference， inproceedings(会议录) 等的区别； 以及reference里面排版惯例的介绍。(后来知道conference=inproceedings) 在文档 《How to Use the IEEEtran BibTeX Style》里有一点介绍，我想已经足够日常使用了。 我在附注2总结了一些重要的points。 最后， 则是利用aspell等工具，来检查你的拼写错误、语法建议等。 here 有一篇非常不错的文章。 格式篇： 因为我提交的paper主要是IEEE的，所以一般会按照它的格式进行编写。 IEEE的不同会议一般提供了LaTeX的模板（style file），其实就是双栏以及一些字体等细节方面的格式设置。 它是这样使用的： (1) 如果是sty文件，则当成一个package使用，下面是最近的ASP-DAC‘10 会议提供的aspdac2e.sty的使用方法： \documentclass {article} \usepackage {aspdac2e} (2) 如果是cls文件，则直接使用为文档类，如下： \documentclass {IEEETrans} 总是，效果大致是相同的。 在一开头就使用预定的格式写作论文，好处是paper被接收后，要准备camera ready version时不会改得这么痛苦， 我第一次交时就改格式改了好久，当时碰到了三个问题： 包含了超链接——IEEE不允许使用 包含了书签——也不允许 没有内嵌所有字体——这个是最重要的，因为考虑到不同系统的PDF viewer不一定提供了你使用的字体。 在提交paper时，必须通过一个叫做 IEEE PDF eXpress 的工具的检查才能使用。这个工具提供了检测、转换等一系列服务，以生成合适格式的论文。 我还没研究透，以后可以另外写一篇总结。 当然，在论文初始提交阶段，也许可以不用那么严格。比如，一般会议要求不超过8页，那么可以先自行设置页宽等参数来放更多内容。 但是以后交final version时，势必要改。所以为了避免重复劳动，最好 一开头就严格使用一定的标准 。 特别是对于bibtex的item，每个entry最好都严格按照格式输入好，不然后面改起来很辛苦，经验之谈啊。 写作篇： 当一切格式均已制定好，所有工具准备就绪时，以后再写paper就方便多了。 当然，一开始总是生疏的，总要摸索多几次才能调整出自己最顺手的工作环境。 一般来说，我个人的风格是先做好实验再撰写文章，这样写起来比较得心应手，文思泉涌。 其实写这种文章都有一定的套路可循，无非是那几大环节，我这里稍微写一下经验： - title : 我没什么很多的经验，个人觉得一个formal又不哗众取宠，不太长又不太短的title适合我风格 - abstract : 很考验一个人的总结水平。基本上是整片文章的缩影。 - introduction : 很考验一个人的写作能力, 写得好的intro会让审稿人迅速把握中心思想, 不会看得烦. - literature review : 介绍前人工作, 似乎不宜写得太长, 否则会占去太多篇幅, 有reviewer喜欢用这个来说你的contribution少 - methodology : 主要介绍自己的contribution, 我喜欢先在这里或之前的section里总结一下, 让人明了你究竟做了什么. 然后再展开来描述你的工作的各个细节. 这里可以分几个不同的section来写, 一般我会用单独的一个secion来分析问题. 然后1-2个section来说明算法/方法. - experimental result : 也是很重要的一个环节，用图表来证明自己方法的效率以及比起前人工作的优越性 - conclusion : 基本上就是再说一次，我喜欢加上future work 写好后，就是跟老板的互动反馈意见了。虽然很简单，但是我很喜欢这种style。 基本上论文都是我自己写的，所以很考验人的写作能力，虽然辛苦，但是也算是一种学习过程。 然后通过老板的反馈意见修改文章时，也会发现自己的不足，就这样修改个3-5次，基本上就得到了能投的文章。 当然我还希望有peer review，可惜实验室没人有空帮我看 :( 附注1：搭建一個合适的jabref+bibtex工作环境 之前我的方法很山寨：一个paper开一个文件夹，里面放tex的src以及bibtex的.bib文件。 这样的话，不同的paper往往会使用同一个bib，管理起来很不方便（比如A paper里面的bib改了，其他也需要更新）。 现在的解决方法是： 专门用一个文件夹来装paper + .bib，要完成这个任务具体需要三个步骤： 1. 假设这个文件夹叫做allpapers，则建立一个allpapers/bibtex 文件夾，把.bib放里面 2. 设置jabref论文的搜索路径，比如我简单起见，把所有paper都塞到bibtex文件夹里，则jabref搜索路径设为当前文件夹"."即可。 3. 设置tex发行版的搜索路径(search path)，比如CTeX可以设置miktex的option，在root里面加上allpapers文件夹。 （发觉miktex搜索的路径貌似只能是allpapers/bibtex，而不是allpapers本身....所以之前把.bib放在bibtex文件夾里） 设置好后，用 initexmf -vu 更新数据库，用 findtexmf xxx.bib 测试是否能正确搜索到，如果可以则会打印出文件的路径。 这么下来，论文里面要引用这个.bib只需简单地用 \bibliography{xxx} 即可。 pdflatex、bibtex会在指定的目录下面搜索对应的bib文件，再也不用一个文件夹放一个bib了！ * 更理想的管理方法是，能把paper稍微分类，这样也许可以通过指定jabref的搜索路径为上一层目录解决。 比如allpapers/{bibtex, PL, CAD, OS}这种目录结构，管理起来会方便很多。 参考： - http://www.haptonstahl.org/latex/work_bibtex.php - http://www.fceia.unr.edu.ar/lcc/cdrom/Instalaciones/LaTex/MiKTex/doc/ch08.html 这里有一篇 很好的 jabref 使用指南。 附注2：关于IEEETran BibTeX style以及参考文献引用规范 IEEETran BibTeX style file是用于生成符合IEEE规范的参考文献列表的BibTeX样式文件。 有很多种不同的样式，最常用的应该是IEEEtran.bst这个文件。 要使用它非常简单，只需在对应tex distro的texmf/bibtex/bst文件里放好对应bst文件， 然后在tex src里面加入这句即可： \biblilographystyle{IEEEtran} \bibliography{IEEEabrv, mybibfile} 其中的IEEEabrv是一些会忆名字的缩写，以方便你后面快速引用，mybibfile是你的bibtex文件。 下面介绍一些重要的entry type(article,conference/inproceedings,book)以及一些注意事项。 1. journal article (@article) 由于example已经在document里面详细给出，这里不再赘述。 IEEE 鼓励在author里详细给出作者的名字，生成最后的reference时，bibtex会根据bst文件自动缩写姓名首字母等。 并且可以在超过一定数量的作者时，自动缩写成`et al.' 在title里面，大括号用于保持单词的大小写状态，因为bibtex会根据bst文件自动更改title里面的一些大小写。 journal的输入是一个缩写string，这样可以很方便地根据要求，在full name(IEEEfull.bib)与abbreviations之间更换。 月份的输入是三个字母的输入，这样可以使bibtex识别并自动格式化日期。 2. conference proceedings @conference与@inproceedings是一样的，没有区别。 要注意的是，对于这种entry，IEEE把page number，volume number等放到日期的后面。 3. book 这个……没什么好说的。 4. electronic(IEEEtran.bst extension) 这是ieee bst里面的拓展。用于引用一些电子资源。 其中可以使用url域（其实是所有entry type都可以使用的） bibtex会生成一个 . Available: + url的字符串以提供下载。 5. 未出版、待出版文章 使用@misc 这个类型，里面加上 note = "to be published" 来说明。 或者是在@article的year field里写上"submitted for publication"。 6. 控制开关 （具体做法请参考 原文档 。）我喜欢把CTLdash_repeated_names设为no 否则如果一个reference item后续的item作者相同，则会省略为一条横线。 估计很多人看不惯，但却是IEEE推荐的格式。 不过，在bib里面添加了 @IEEEtranBSTCTL{BSTcontrol, CTLdash_repeated_names = "no", } 这个entry后，每次打开jabref会有warning，有点烦。 附注3: ACM要求直接给出所有bibitem，而不是使用bibtex 很简单，只需使用上述流程正常生成文件后，在得到的bbl文件里复制即可。因为bibtex的原理也是用latex来预处理bib文件得到最终的tex代码，然后再包含进tex文件重新编译的。 参考自 这里 。

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好工具：创建自己的热键响应

seawan 2012-3-11 22:21

http://www.autohotkey.com/ AutoHotkey is a free, open-source utility for Windows. With it, you can: Automate almost anything by sending keystrokes and mouse clicks. You can write a mouse or keyboard macro by hand or use the macro recorder. Create hotkeys for keyboard, joystick, and mouse. Virtually any key, button, or combination can become a hotkey. Expand abbreviations as you type them. For example, typing "btw" can automatically produce "by the way". Create custom data-entry forms, user interfaces, and menu bars. See GUI for details. Remap keys and buttons on your keyboard, joystick, and mouse. Respond to signals from hand-held remote controls via the WinLIRC client script . Run existing AutoIt v2 scripts and enhance them with new capabilities . Convert any script into an EXE file that can be run on computers that don't have AutoHotkey installed. Getting started might be easier than you think. Check out the quick-start tutorial . 下面的脚本可以在ctrl+alt+n时，拷贝当前选中文本，然后启动记事本。。方法是先发ctrl-C，实现拷贝文本到剪贴板，然后启动自己的程序。（里面的粘贴部分不起作用，以后再研究。。。） ^!n:: send, ^c IfWinExist Untitled - Notepad { WinActivate Send, ^v } else { Run Notepad WinActivate Send, ^v } return

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系统生物学与实验生物学的鸿沟

热度 2 aozhou 2012-3-9 02:56

今天和导师提到了一个关于将Next Generation Sequencing的数据和系统生物学方法相结合的idea，于是话题很自然地又回到了系统生物学的验证的问题。许多系统生物学研究得出的假设很难得到实验生物学上的验证，导致他们的工作并不能得到最大程度的接受和利用。那么为何计算科学家和实验科学家无法合作验证呢？ 应该是有以下几个原因： 1. 资金：通常计算科学家的经费要比实验科学家少很多，所以计算组无法对实验组支付实验费用； 2. 文章冠名：如果假设是计算科学家给出的，那么合作出来的成果发表的时候谁的名字冠在前面呢？ 3. 兴趣：许多实验科学家不相信由网络和复杂模型得出的假设，所以不屑于做实验验证； 4. 需求：假如信息随手可得，我们就不需要google；同样，假设随处可得，实验科学家也不需要软件来协助产生假设； 我想最根本的原因或许还是目前生物学知识的积累还不够多；因为积累不够，所以暂时还用不到高性能的信息整合工具；因为积累不够，所以用这些工具得到的结论也不能让人信服；既然需求和说服力都不够，相应的科研经费自然就少了。但是我们也要看到，生物毕竟是一个庞杂的有机整体，各种元素在不同时间以不同方式相互作用着，这不是某个孤立的实验就可以描述的。相信当生物学知识积累已经足够多，实验假设已经不那么随处可得的时候，当实验生物学家不得不依赖于计算机来协助他们整合大量庞杂信息、产生假设并且凭此申请经费的时候，系统生物学的黄金时代才会到来。 此外，在坚实的实验数据的基础上建立起来的生物模型将可以用于指导生物工程，药物设计等实用的方向。这么说来，从往系统添加新元素的角度看，系统生物学就是理科；从为了实用目的而修改系统的角度看，它就是工科吧（笑）

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免费网站点击计数地图工具

vcitym 2012-3-7 16:00

ClustrMaps网站流量分布地图。 ClustrMaps是 唯一 具有以下功能的点击计数器： (1)可在嵌入您网页的微缩图上准确地显示出所有访问者的位置。 (2)使用能显示巨大数量的点集。 (3)允许您把旧地图存档。 ClustrMaps Pro的优势在于： 如果想查看放大的地图详情，您可以把地图嵌入到您自己的网站里，而不是链接到ClustrMaps网站上去查看。而另一方面，ClustrMaps Pro需要更多的网站管理专业知识，因为您必须能够进入您自己的服务器日志并在服务器和ClustrMaps之间来回传送统计数据。相对而言，ClustrMaps和ClustrMaps+只需您把几行HTML代码放在您的网站或博客上，之后所有地图全部由ClustrMaps网站提供。我们提供的基本服务“ClustrMaps”是免费的，但不是“试用产品”，也没有“时间限制”。 http://www.clustrmaps.com/zh/index.htm

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免费网站点击计数地图工具

vcitym 2012-3-7 15:38

ClustrMaps网站流量分布地图。 ClustrMaps是 唯一 具有以下功能的点击计数器： (1)可在嵌入您网页的微缩图上准确地显示出所有访问者的位置。 (2)使用能显示巨大数量的点集。 (3)允许您把旧地图存档。 ClustrMaps Pro的优势在于： 如果想查看放大的地图详情，您可以把地图嵌入到您自己的网站里，而不是链接到ClustrMaps网站上去查看。而另一方面，ClustrMaps Pro需要更多的网站管理专业知识，因为您必须能够进入您自己的服务器日志并在服务器和ClustrMaps之间来回传送统计数据。相对而言，ClustrMaps和ClustrMaps+只需您把几行HTML代码放在您的网站或博客上，之后所有地图全部由ClustrMaps网站提供。我们提供的基本服务“ClustrMaps”是免费的，但不是“试用产品”，也没有“时间限制”。 http://www.clustrmaps.com/zh/index.htm

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三款Web开发工具的比较

xirongguo 2012-3-7 09:46

IntelliJ，一款比较经典的商业开发工具，其Project和Module的概念类似于Eclipse的Workspace和Project，有专业的技术支持，并配置很多简介的开发插件，对于Web开发也很便利，能方便的加入SSSH开发框架，不过其Web Server的配置是和Module关联的，经过几天的试用，发现这款工具对用惯Eclipse和Netbeans的码农来说不太好上手。 Netbeans，原生Java公司Sun（现为Oracle）推出的一款免费的Java开发利器，集成各类的开发插件，有漂亮的UI开发支持，对于新手来说很容易上手，特别对Web开发能较方便的加入各种框架支持，缺点在于插件库更新较慢，比如目前还没有官方的struts2框架支持。 Eclipse,无需多言，超级经典Java开发工具，具有高度的自由配置能力，但由于插件均为自由开发，好的开发插件需要自己去慢慢摸索。

个人分类: 系统工程|3558 次阅读|0 个评论

当代帝国统治的三种工具

zhwy6441 2012-3-4 16:24

当代帝国统治的三种主要工具包括：政治定价权、经济定价权和文化定价权（见附图）。 其中，政治定价权是针对政府或公权力阶层的，经济定价权是针对经济机构或工商企业阶层的，文化定价权是针对薪酬阶层或广大劳工阶级的。 透过公开可见的各种当代虚拟市场，不难看到货币、资源、技术、国际服务等经济要素的帝国经济定价权是如何实现的。 公众对于政治定价权和文化定价权相对陌生一些。 帝国政治定价权，目标是影响和改造附属国政治游戏规则和结构，确保帝国对于其各种公权力，尤其是政府行政权力的威慑力和决定性影响力。 帝国政治定价权主要依靠持续不断、循序渐进的学术和媒体覆盖，辅以经济、军事和文化手段，最终实现的。选举民主是这些影响的良好实现模式。 帝国文化定价权，目标是更加长久、根本地实现帝国政治经济统治。 帝国在确定的规划下，不断发力，向附属国输入大量文化产品，削弱附属国传统文化结构，直至悄然改造其传统文化基因，接受帝国基本价值观，不断持续的增加对于帝国文化的认同和归属、皈依。 政治定价权、经济定价权和文化定价权等三种主要定价权的实现，通常一定是相互配合使用的，附属国若没有足够文化抵抗力和强大政治核心，很难摆脱被动命运。 帝国定价权的核心是经济定价权 ---- 正所谓“生产方式决定生活方式”，道理一样。 中国后改革时代，突然爆发的所谓意识形态决战，战场包括“中西学术”、“普世价值”、“民主政改”及“国企私有化”等，正是帝国在已经获得了对于附属国经济定价权和文化定价权后，组织实施的一次夺取附属国政治定价权的火力侦察。 如果中国人民、中共和左派不屈服， 帝国必将联盟国际和国内极右派和汉奸势力，加大经济和文化压力，演出摧毁对手的决战。 自此前 60 年，毛泽东中共之革命时代到战胜“帝国封锁”时代，在与帝国争斗中，本来是接续了一盘非常主动的好棋，但是，中国改革只会鼠目寸光“摸石头”，“局”而无“势”，早已掉入帝国陷阱。 政治定价权和残存的文化自信心，是中国反抗帝国统治，夺回自主权，主宰民族命运的最后依据。 20120304

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工欲善其事，必先利其器 ——浅谈如何选择科研工具

热度 4 zzyyhh 2012-2-29 09:08

工欲善其事，必先利其器 ——浅谈如何选择科研工具 传统的科研方式由于其具有较大的封闭性，导致不同地区的科研机构和人员间交流不足，导致重复劳动，这造成了科研资源的巨大浪费。而今，科研的方法和环境在不 断变化。特别是在互联网时代，科研活动之间的交流、科研信息的获取和处理，都在发生着许多新的情况和新的问题。因此，最大限度地满足科研机构和人员之间交 流与协作的需要，有效共享浩如烟海的信息，是现代信息通信技术给传统科研带来的巨大变革。 如何改变传统科研模式，充分利用信息化的手段来促进科研活动，提高科研效率就成了科研信息化的主要目标。所谓“工欲善其事，必先利其器”，提高科研效率关键的是要找到一款适合科研团队的管理工具。 结合科研活动的特点，科研工具需要解决如下的问题： 1.团队成员之间的协作交流 通常认为科研过程更多的是自己独立完成，但是多人共同完成一项任务时，了解同伴的进度、与他们分享交流试验心得，能减少大量重复或不必要的劳动。而且交流过程中也时常出现创意火花，极大提高工作效率。 2.内部文档资料的组织分享 在 多人合作的团队内部，文档共享是必须的。常用的方式是通过email/FTP等方式进行，这种方式虽然能达到共享的目的，但会出现版本的不一致性，大 量文档也不便于查找。这就需要科研工具可以很好的处理文档的组织分类，还能通过特定功能在团队内部进行方便的传递和分享。 3.团队知识库的建立 当 某个项目完成，会产生与项目相关的大量文档和资料，同时还有项目过程中经验文档，这些经过实践的文档资料对于项目团队是非常宝贵的知识，应该将它们整理存 档，形成团队知识库。这样一旦团队成员变更，这些项目经验和文档却不会被带走，新人加入，也可以通过团队知识库快速融入项目。 4.安全的存储和随时随地的访问 对于科研团队而言，科研活动最后的产出就是知识，所以知识的安全存储非常重要。科研工具需要提供安全的存储空间。随着互联网的发展，随时随地多设备的访问也是发展趋势，这样无论何时有了灵感或者想法，都可以随时记录与团队成员沟通分享。 以上是一般科研活动中需要解决的问题，每个团队可能都有一些特定的需求。结合团队的自身特点挑选合适的科研工具，对加强团队成员的沟通及科研效率的提高都会有极大的帮助。 最后顺便推荐一款科研管理工具： http://www.escience.cn

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[转载]三大检索工具(SCI、ISTP、Ei)收录检索技巧及核心期刊投稿导引

热度 1 chm818 2012-2-28 10:34

一、 绪论 1 ．三大检索工具简介 　　科技部下属的"中国科学技术信息研究所"从1987年起，每年以国外四大检索工具SCI、ISTP、Ei、ISR为数据源进行学术排行。由于ISR(《科学评论索引》)收录的论文与SCI有较多重复，且收录我国的论文偏少；因此，自1993年起，不再把ISR作为论文的统计源。而其中的SCI、ISTP、Ei数据库就是图书情报界常说的国外三大检索工具。 　　SCI，即《科学引文索引》，是自然科学领域基础理论学科方面的重要的期刊文摘索引数据库。它创建于1961年，创始人为美国科学情报研究所所长Eugene Garfield(1925.9.15)。利用它，可以检索数学、物理学、化学、天文学、生物学、医学、农业科学以及计算机科学、材料科学等学科方面自1900年以来重要的学术成果信息；SCI还被国内外学术界当做制定学科发展规划和进行学术排名的重要依据。 　　ISTP，即《科学技术会议录索引》，创刊于1978年，由美国科学情报研究所编制，主要收录国际上著名的科技会议文献。它所收录的数据包括农业、环境科学、生物化学、分子生物学、生物技术、医学、工程、计算机科学、化学、物理学等学科。从1990-2003年间，ISTP和ISSHP(后文将要讲到ISSHP)共收录了60，000个会议的近300万篇论文的信息。2008年，ISTP更名为CPCI-S(Conference Proceedings Citation Index-Science)。 　　Ei，即《工程索引》，创刊于1884年，由Elsevier Engineering Information Inc.编辑出版。主要收录工程技术领域的论文(主要为科技期刊和会议录论文)，数据覆盖了核技术、生物工程、交通运输、化学和工艺工程、照明和光学技术、农业工程和食品技术、计算机和数据处理、应用物理、电子和通信、控制工程、土木工程、机械工程、材料工程、石油、宇航、汽车工程等学科领域。 2．与三大检索工具相关的其它数据库介绍 　　SSCI，即《社会科学引文索引》，创刊于1969年，收录数据从1956年至今；是社会科学领域重要的期刊文摘索引数据库。数据覆盖了历史学、政治学、法学、语言学、哲学、心理学、图书情报学、公共卫生等社会科学领域。 　　AHCI，即《艺术与人文科学引文索引》，创刊于1976年，收录数据从1975年至今；是艺术与人文科学领域重要的期刊文摘索引数据库。数据覆盖了考古学、建筑学、艺术、文学、哲学、宗教、历史等社会科学领域。 　　ISSHP，即《社会科学和人文会议录索引》，创刊于1979年，收录数据从19？年至今；数据涵盖了社会科学、艺术与人文科学领域的会议文献。这些学科包括：哲学、心理学、社会学、经济学、管理学、艺术、文学、历史学、公共卫生等领域。2008年，ISSHP更名为CPCI-SSH（Conference Proceedings Citation Index-Social Science Humanities）。 3．三大检索工具在索引体系中的位置 (1) 目录和索引的概念及关系 　　目录是著录一批相关文献(图书、期刊等)，并按照一定的次序编排而成的一种揭示与报导文献的工具。目，指文献的篇目名称；录，指文献的内容简介。例如：图书馆的联机公共书目、全国期刊联合目录，OCLC WorldCat、Ulrich's International Periodicals Directory 。 　　索引是将文献(图书、期刊等)中的篇目、语词、主题、人名、地名、事件及其它事物名称，按照一定的方式编排，并指名出处的一种检索工具。 　　例如：《十三经索引》、《全国报刊索引》、SCI、Ei等。目录与索引均属二次文献的范畴，都是用来帮助读者利用一次文献(又称"原始文献")的；细微的区别在于：目录揭示文献的整体，索引揭示文献的局部。 (2) 索引的分类 　　按照索引的编排方式可以分为：形式索引(著者索引、机构索引、号码索引)、内容索引(分类索引、主题索引、语词索引)和关系索引(引文索引、再版索引)。 按照索引的对象(即索引所揭示的原始文献)来可以分为：可以将索引分为：专著索引、报刊索引、会议录索引等。 (3) 三大检索工具在索引体系中的位置 　　从索引的编排方式来看，SCI属于关系索引，同时兼具形式索引和内容索引的特征；ISTP和Ei具有形式索引和内容索引的特征。 　　从索引的对象来看，SCI揭示的是期刊中的论文；ISTP揭示的是会议录中的论文；Ei则兼而有之。 二、 如何利用三大检索工具等数据库检索相关主题文献 1．利用SCI、SSCI、AHCI数据库检索相关主题文献 (1) 通过往TOPIC检索入口输入检索主题词获得相关主题文献 (2) 通过往TOPIC检索入口输入检索主题词，然后对检索结果进一步分析获得相关主题文献 (3) 通过往TOPIC和SOURCE TITLE检索入口同时输入检索主题词获得相关主题文献 　　例子：往TOPIC中输入"nano*"，同时往SOURCE TITLE 中输入"ARTIFICIAL CELLS BLOOD SUBSTITUTES AND IMMOBILIZATION BIOTECHNOLOGY or BIO-MEDICAL MATERIALS AND ENGINEERING or BIOMATERIALS or CELLULAR POLYMERS or DENTAL MATERIALS or JOURNAL OF BIOACTIVE AND COMPATIBLE POLYMERS or JOURNAL OF BIOMATERIALS SCIENCE-POLYMER EDITION or JOURNAL OF BIOMATERIALS APPLICATIONS or JOURNAL OF BIOMEDICAL MATERIALS RESEARCH or JOURNAL OF MATERIALS SCIENCE-MATERIALS IN MEDICINE or MACROMOLECULAR BIOSCIENCE"， 利用上面的检索式，可以检索出SCI网络版2002年数据库收录"MATERIALS SCIENCE, BIOMATERIALS"类的文章102篇。 2．利用ISTP数据库检索相关主题文献 　　可以通过TOPIC、SOURCE TITLE、CONFERENCE相结合的方式来检索 3．利用Ei数据库检索相关主题文献 　　例子：检索医学领域中含有"pipe"的文献 如果仅仅用"pipe"检索在所有字段中检索，会命中4万多条记录；即使同时限制在TITLE中检索，结果也有1万多条，数据冗余太大。这时，可以考虑从学科的角度进行限制检索： 　　先检索到从Ei Thesaurus中检索医学类目： Medicine：461.6， Medical care：461.7， Medical imaging：461.1，Medical problems， Medical supplies：462.1，Medical computing：723.5，Medical diagnosis， Medical education， Medical equipment，Medical monitoring：462.2 　　利用"Expert Search"：(461.1 wn CL OR 461.6 wn CL OR 461.7 wn CL OR 462.1 wn CL OR 723.5 wn CL) AND (pipe wn TI) 命中500多条记录，因723.5类与计算机应用有关，命中记录中有许多看不出是与医学有关的，可以考虑将该类去掉检索。结果就比较令人满意。 4．利用SCOPUS数据库检索相关主题文献 该数据库提供了学科限制，因而相对容易。 三、 如何利用三大检索工具等数据库检索论文收录情况 1. 利用三大检索工具等数据库检索单位/集体论文收录情况 　　以清华大学为例： (1) 利用SCI数据库检索单位/集体论文收录情况 (tsinghua univ or tsing hua univ or qinghua univ or qing hua univ or 100084) same (peoples r china or beijing or bei jing) (2) 利用ISTP数据库检索单位/集体论文收录情况 (tsinghua univ or tsing hua univ or qinghua univ or qing hua univ or 100084) same (peoples r china or beijing or bei jing) (3) 利用Ei数据库检索单位/集体论文收录情况 　　利用作者索引或用复杂检索，但效果均不好。 (4) 利用SCOPUS数据库检索单位/集体论文收录情况 AFFIL(100084 AND tsinghua) (5) 利用CSSCI、《中国期刊网》、《中文科技期刊数据库》检索单位/集体论文收录情况 　　三个数据库均提供机构检索入口，可以查找单位/集体论文收录情况。 2. 利用三大检索工具等数据库检索个人论文收录情况 　　以周远翔老师的论文为例子(见附录)： (1) 利用SCI数据库检索个人论文收录情况 　　作者的文献(文章或报告)共有104篇，在这些文章中，他的合作者包括以下八人：N. Yoshimura, 关志成，H. Katoh, 严萍，梁曦东，李光范，M. Nifuku, Atsushi Satake 构建检索式：(zhou yx or yunxiang z) and (Yoshimura n or guan zc or zhicheng g or Katoh h or yan p or ping y or liang xd or xidong l or li gf or guangfan l or Nifuku m or Satake a or Atsushi S) 在AUTHOR字段中输入上述检索式，命中9条记录。与作者提供的论文核对后发现：这9条记录全是作者本人的论文。 　　还有几篇文献是作者单独完成的，对于这些文献，需要单独处理。 (2) 利用ISTP数据库检索个人论文收录情况 　　与检索SCI数据库类似，用同样的检索式和同样的方法即可。 　　在AUTHOR字段中输入上述检索式，命中14条记录。与作者提供的论文核对后发现：这14条记录全是作者本人的论文。比作者事先查好的12篇还多2篇。 (3) 利用Ei数据库检索个人论文收录情况 　　在高级检索中输入(Ei数据库作者标引与SCI有很大不同：Ei一般要将姓和名写全，而SCI是要求姓写全，名用第一个字母)： 　　(zhou, y.x. wn AU OR zhou, yuanxiang wn AU OR yuanxiang, z. OR yuanxiang, zhou OR zhou, y.-x. wn AU OR zhou, yx wn AU) AND (Yoshimura wn AU OR guan, z.c. wn AU OR guan, z.-c. wn AU OR zhicheng, g wn AU OR guan, zhicheng wn AU OR guan, zc wn AU OR Katoh wn AU OR yan, p wn AU OR yan, ping wn AU OR ping, y. wn AU OR ping, yan wn AU OR liang, x.-d. wn AU OR liang, x.d. wn AU OR liang, xd wn AU OR xidong, liang wn AU OR liang, xidong wn AU OR xidong, l. wn AU OR li, gf wn AU OR li, g.f. wn AU OR li, g.-f. wn AU OR guangfan, l. wn AU OR guangfan, li wn AU OR li, guangfan wn AU OR Nifuku wn AU OR Satake wn AU OR Atsushi wn AU) 　　命中19条记录，这与读者自己检索的27条记录相差8条。 　　后经检查，发现漏检的8条记录中，有7条作者是"zhou, y"，有一条是"zhou, yuanxing"。所以，用上述检索式会漏掉一部分记录；因而我们应再修改一下检索式： 　　把上述检索式修改为：(zhou, y* wn AU OR yuanxiang, z. OR yuanxiang, zhou) AND (Yoshimura wn AU OR guan, z.c. wn AU OR guan, z.-c. wn AU OR zhicheng, g wn AU OR guan, zhicheng wn AU OR guan, zc wn AU OR Katoh wn AU OR yan, p wn AU OR yan, ping wn AU OR ping, y. wn AU OR ping, yan wn AU OR liang, x.-d. wn AU OR liang, x.d. wn AU OR liang, xd wn AU OR xidong, liang wn AU OR liang, xidong wn AU OR xidong, l. wn AU OR li, gf wn AU OR li, g.f. wn AU OR li, g.-f. wn AU OR guangfan, l. wn AU OR guangfan, li wn AU OR li, guangfan wn AU OR Nifuku wn AU OR Satake wn AU OR Atsushi wn AU)命中34条记录，从中找出了读者有27篇文献被Ei数据库收录。 　　需要说明的是：利用第一个检索式基本上可以比较准确地检索到作者的文献。只所以利用第二个检索式，是考虑到Ei数据库在数据标引过程中可能出现的小的差错，可以基本上没有遗漏地检索出作者所有被Ei数据库收录的文献。 (4) 利用SCOPUS数据库检索个人论文收录情况 (5) 利用CSSCI、《中国期刊网》、《中文科技期刊数据库》检索个人论文收录情况 四、 如何检索论文被引用情况 1. 检索单位/集体论文被引用情况 (1) 利用SCI、SSCI、AHCI检索论文被引用情况 从收录的角度检索，例子： (tsinghua univ or tsing hua univ or qinghua univ or qing hua univ or 100084) same (peoples r china or beijing or bei jing) (2) 利用SCOPUS检索论文被引用情况 (3) 利用《中国期刊网》检索论文被引用情况 备注：CSSCI、《中国科技论文引文统计分析数据库》均没有提供按单位/集体检索论文被引用情况的入口。 2. 检索个人论文被引用情况 (1) 利用SCI、SSCI、AHCI检索论文被引用情况 从收录的角度检索，例子： (2) 利用SCOPUS检索论文被引用情况 (3) 利用CSSCI、《中国科技论文引文统计分析数据库》、《中国期刊网》检索论文被引用情况 五、 核心期刊投稿导引 1. 期刊评价及评价工具 　　期刊评价目前已经成为国内外学术界的一个研究热点。在不久前刚刚结束的“第四届大学评价与科研评价国际学术研讨会”上，还将期刊评价同大学评价和科研评价一起作为大会研讨的主题。可见期刊评价的重要性。 　　关于期刊评价，目前国内学术界有两种观点：一是核心期刊评价法，二是期刊综合评价梯度法。前者简称"0/1法则"，后者简称"综合法则"。两种法则都是以传统的情报学文献离散定律、引文分析定律等为理论依据的。只是"综合法则"涵盖了"0/1法则"，更加强调梯度的概念。 　　期刊评价的工具，国外以JCR(Journal Citation Reports)为代表，国内以《中文核心期刊要目总览》、《中国科技期刊引证报告》和《中国学术期刊综合引证报告》为代表。《中文核心期刊要目总览》和《中国科技期刊引证报告》是"0/1法则"评价的结果，《中国学术期刊综合引证报告》是"综合法则"评价的结果。目前我校在研究生培养、科研管理和人事管理工作中以《中文核心期刊要目总览》和《中国科技期刊引证报告》为参考依据。 2. 核心期刊的内涵及国内、国际核心期刊外延的界定 　　核心期刊的概念可以用一句话来概括：某一学科中高水平、高影响力的期刊。不难看出，核心期刊有两个主要特性：一是学科性，二是学术性。 　　一般情况下，核心期刊都是在某一个学科范围内来界定的某一个学科的核心期刊，到另一个学科就不一定是核心期刊(当然，综合性学科的核心期刊，如NATURE、SCIENCE等例外)。 核心期刊的学术性主要要是以期刊影响因子来测定的。关于影响因子，有两种统计方法：一种是三年统计法，一种是中期统计法。按三年统计法得出的结果就是目前我们常说的影响因子(IF: Impact Factor：某一种期刊在第三年得到的引文数与该刊前两年的总论文数之比。)，按中期统计法得出的结果叫"中期影响因子"(MIF: Median Impact Factor某一种期刊的引文累计达到1/2时，引文数与此时的总论文数之比。)。 　　目前我校承认的、国际核心期刊主要是指SCI、SSCI、AHCI、Ei数据库收录的期刊；国内核心期刊主要是指《中文核心期刊要目总览》和《中国科技期刊引证报告》收录的期刊(CSSCI 收录的期刊在《中文核心期刊要目总览》中基本上都有)。详细信息参考图书馆 SCI咨询中心 相关栏目。 3. 如何向国内、国际核心期刊投稿？ 　　投国际刊物，请参考 JCR (包括科技版和社科版)，选择自己想要找的学科类目，按照影响因子排序，挑选适合的刊物。然后上 《乌利希国际期刊指南》数据库 查找刊物的地址或网站信息，登陆刊物的网站，查找在线投稿信息。 　　投国内刊物，请参考《中文核心期刊要目总览》和《中国科技期刊引证报告》，从中选择自己想要找的学科类别，然后按照影响力，挑选适合的刊物。投稿地址信息可以参考工具书《中文核心期刊要目总览》，也可以登录" 中国期刊网 "，查找刊物的投稿信息。 　　在向核心期刊投稿的过程中，需要注意的事项： (1) 尽量不要投增刊。 (2) 单位署名要规范。写清华大学要同时写上Beijing, Peoples Republic of China. 这在SCI中尤其要注意。

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硬盘测试小工具，发现比较好用，呵呵

dubo 2012-2-26 14:24

http://www.hdtune.com/download.html

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2012-02-22早8:30-忙中偷闲

热度 2 snowboyice 2012-2-22 08:37

• 基金申请任重道远，忙中偷闲之感悟与总结： 劳动、技术、科学、哲学、道德－人的社会通路之一－劳技科道、劳技哲道之人生。 科学是我人生社会、学习语言的利刃，哲学是我触类旁通的工具，科学是自洽运动，科学是哲学自相似的扩展，是面对不同对象的赋予关系。 化学是进化的基础，超越分子化学、超越人类化学－自然化学原理相似于人类科学之化学，层次关系说明：化学－进化－自然－生命。

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原生态工程，文明传续的古老载体

kejidaobao 2012-2-17 11:07

文/范春萍 《手艺中国：中国手工业调查图录》是在一位有远见和人文关怀的美国人亨利·查普曼·莫瑟（Henry Chapman Mercer）策划并资助下，由德裔美国人鲁道夫·P.霍梅尔（Rudolf P. Hommel）在20世纪20年代的中国乡村走访、拍摄、记录8年，又经10年潜心钻研，著就的记载着中华古工艺文化的史册，该书1937年由纽约John Day Company出版。 本书所涉及的手艺，基本与艺术无关，是生产和生活劳作中所使用的，使生活得以维系、物质文化得以传承，多由经验积累而成的技术和工艺，以及作为其载体和手段的工具，是原生态工程的展现，也是祖先们的生产方式和生活方式。在没有现代化、自动化，靠手工生产劳作的古代，就是这些载体支撑着历史和文化的传续和进步。 全书以工具为载体展开记述，分为5章：基本工具，农业工具，制衣工具，建筑工具，交通工具。对于所记述的内容，霍梅尔大多用照相机拍摄了照片，又用标尺记录了数据。 霍梅尔在中国乡村游历的时期，距离19世纪欧洲人发明照相机已近100年，可是中国百姓还基本未曾见过照相机这样的东西。这也使得霍梅尔的考察增加了难度，因为人们不愿意甚至不允许他拿着那样一个会“摄走魂魄”的东西对着他们以及他们的工具。然而，霍梅尔还是以他的执着和真诚达成了他的考察目的。本书中，霍梅尔附了536幅照片，从缝衣针、熨斗、渔钩、钉模、打号锤、门锁、刀锯到独轮车、磨盘、渔船、矿井、砖窑、染色法、砌砖法、水车，数不胜数。 也有没加照片的记述，比方说鄱阳湖渔民月夜诱鱼上船的捕鱼方法：“渔夫稳坐在他的小船上，鱼儿纷纷跃出，离开湖泊的怀抱，自愿地跳入船中，多么奇妙！渔船长而窄，从船舷边伸出一块木板，向下倾斜至插入水中。木板当然要涂上白漆，月光必定照到它的上面。这听起来非常浪漫，但不可思议的事情确实发生了：渔船驶近，扰乱鱼群，鱼被木板反射的月光诱惑，纷纷跳起躲避这一‘障碍’，而恰好落入船中。”虽无照片，然情景跃然纸上，清晰明了，仿佛历历在目。遗憾的是，这样浪漫优雅的捕鱼法现在已经失传了。 古老的民族是有故事的民族，这样的故事是一个民族的进化路径，是现代人的根。好的技术史一定离不开具象的细节，是霍梅尔为中国记录下了这些宝贵的文化遗产。这些文明的基因，是我们曾经习以为常、视为落后、甚至负累的东西，这些我们自己都遗忘了的东西，霍梅尔为我们保留了下来。 本书几乎涉及了自然经济时代中国底层民众生产性劳作的各个方面。马未都在该书序言中说：“每一细微之处都是中华文化的精华所在，都是我们赖以生存的精神。” 近年来，一些有识之士一直在呼吁对非物质文化遗产加强保护，呼吁对传统技术史料的抢救。也许有人会问这样一个问题：20世纪20年代距今不过八九十年，如何能说是我们的古代？那不是近现代吗？是的，从社会史的角度看是近现代，而从技术史的角度看就是古代。因为在没有大工业、自动化和“现代化”之前，工具和技艺就是伴生在农业之中的手工业。 易中天为该书所写荐言说：“本书为我们记录了西方科技大举涌入之前，中华先人延续了数千年的生产生活细节和场景，难能可贵。”张柏春评价此书为“洋人版的《天工开物》”。 自然经济状态下的中国的科技进步是缓慢的，中国农村底层民众的生活在几千年中，是一种趋于静态的原生态。在20世纪60—70年代，书中记录的器物在中国乡村也是随处可见。然而，数千年的传承，在刚刚过去的这三四十年间几乎蒸发了——被从西方涌入的现代科技、现代工业、自动化等冲溃了、冲垮了。霍梅尔在该书中盛赞的中国人节俭的生活方式也被丢弃了。 社会当下发生着的，是整个生产方式和生活方式的改变，是被西方科技和文化的同化，从前那些质朴、纯粹的，与自然亲近的生产方式和生活方式难得一见了，而那些都是极其宝贵的东西。 当后人从中发现新知识的时候，所有的历史都是新闻；只要有人记录并得以留续，所有当下的时事也都是历史。如果你拥有科技和环境意识，那么所有的历史都是科技史和环境史，所有的新闻也都是科技新闻和环境新闻。《手艺中国》给我们的感觉正是如此，翻看这些古旧蒙尘的老照片，竟有无比惊艳之感，有网友将其喻为“近代穿越谋生工具百科全书”。 当我们吃着以工业化饲料、肥料，经工业化流程养殖、种植出的，已经失去了原生鲜香味道的各种工业肉、工业菜的时候，我们脱离了地气；当乡尘不再，却有了尘暴；当街市一尘不染，却有了光化学烟雾和气溶胶。这一切，让我们看到了俭朴自然的原生态生活方式的优雅。 该书中文版第一序作者华觉明认为，难能可贵的不止是该书的“重要学术价值和历史地位”，还有作者霍梅尔的人文情怀：“这本书不但引导我们该如何做田野调查，而且教导我们要关切底层托人的首期，将抢救保护传统工艺这一民族科技宝库引为己任。” 在技术史料、非物质文化遗产的价值之外，我们似乎也可以把《手艺中国》当成一本故事书来看。倘如此，它的原生态工程展现，所给予我们的启发，将远远超出已经相当宝贵的史料和非物质文化遗产的价值。

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PDF打印工具

yuanjy123 2011-6-15 22:58

PDF打印工具 http://dl.dbank.com/c098hqgu1g

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我常用的文献管理工具（个人用户）

doublejing 2011-3-28 13:57

使用环境仅为互联网。很多软件的功能在有权限时才可用或好用，以下介绍的均为没有权限或不需权限即可顺利使用的软件工具。 1、NoteExpress：常用功能是输出论文的参考文献和编写、查看批量文献的笔记。 http://www.reflib.org/index_chs.htm/ 2、Quosa：常用功能是批量下载、打开、浏览文献。 http://www.9669.com/soft/2/60/64/14117.html 3、灵者更名：常用功能是批量文件改名中的“删除”和“插入”。 http://www.05sun.com/downinfo/50191.html 4、随着研究深入待续……

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人類爲什麽要過這種效率不高的節日？

热度 6 jiangjinsong 2011-2-2 23:34

前些天看到有著名博主提出類似的問題 我很能理解 因為我自己過去曾是極端無趣男 曾經只用一個功利的標準去衡量一切 還沾沾自喜地認為自己非常理性 這是典型的工具理性氾濫 非常可笑 手段膨脹 而遺忘目的 不知道生活是人類一切活動的出發點和歸宿 而誤以為生活本身是一個可以當做手段 可以任意定制、切割、鍛壓、壓榨的對象 節日這種看似極其低效率的生活方式 實際上有深刻的哲學意涵 爲什麽節日里大人辛苦小孩高興 因為爲了功名利祿、GDP、SCI整日勞碌辛苦的大人們 其實是不適應節日的那種生活方式的 節日其實不在於大吃大喝各種儀式 關鍵在於徹底放鬆享受生活 大人們鬆不下來 總是在緊張 即使很努力地放鬆 卻越放鬆越鬆不下來 對於放鬆來說努力沒有著力之處 而孩子們天然們就掌握了放鬆的能力 或者說他們根本就不知道啥叫放鬆的能力 一切天然現成 節日其實是從沉淪於功利、刻板的活動中解放出來 回到生存的本真狀態 節日的意義正是一種中斷、停頓 正是對效率的否定 對合理性的超越 正是不必計算 沒有節日的人生是多麼的荒蕪 它不是沒有娛樂 而是沒有意義

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[转载]提高科研效率的五个软件

LuDoor 2010-12-23 07:40

提高科研效率的五个软件，总结的可以哦。在收藏中也有 http://www.sciencenet.cn/m/user_content.aspx?id=395760

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演示文稿的制作技巧、人文精神与科学精神(续八) _全景链接

icstu1 2010-11-15 15:11

全景链接 讲演，做 PPT ，写文章等 是我们每个人经常遇到的任务． 但是，面对这些任务，很多的人总是不能 做的非常完美。 做 PPT ，写文章等与讲演在整理思路和表达技巧方面的规律是相同的 我们将给您介绍一种结合传统和现代最新技术的 沟通与说服技巧， —— 演讲制作工具 帮助您通过讲演，做 PPT ，写文章等等途径来获得成功。 十大关键步骤包括： 始终牢记目的性 —— 通往 B 点 ； http://www.sciencenet.cn/m/user_content.aspx?id=383971 脑力激荡 —— 通过 左脑右脑分工 http://www.sciencenet.cn/m/user_content.aspx?id=383971 （思维管理）、 开发 思维的创造性 ， 管理 知识（白板） ，实现 知 识的综合或者细化 ； 罗马柱 —— 形成 分主题要点 ； 选择合适的 叙述结构 ； 选择合适的 开场白； 文字的表现技巧 ； 图表 的使用原则； 内部链接 、 外部链接 ； 个性化定制； 附表检查工具 。

个人分类: E 请教专家看法和学习的访谈|495 次阅读|0 个评论

关于文献工具使用的一点忧虑

zilu85 2010-11-7 09:57

总有人向我请教citeSpace的用法，所以有些本来不想说的话，不得不说。和大家一样，觉得这是个很好的文献分析工具，尤其是可视化方面做的非常好，所以一接触到这个软件的时候，也满心欢喜地研究了一番，写了几篇如何使用的体会，写这些博文，一是为了和大家交流，也是为了记下来给自己看；另外一个原因，就是发现这个软件一直缺乏一个系统想尽的说明书，作者所发表的文章几乎都是介绍其内部算法的，比如什么是前沿啊，基础啊，之类的，所以觉得有必要把使用这个软件的基本步骤梳理一下。 但是，现在看来，有关知识图谱的研究论文已经呈现了铺天盖地的趋势，有同学给我留言就是我要用Citespace写文章，请您指导我如何使用。 这么说吧，比如你要了解未知的世界，如远方一片被浓雾笼罩着的森林，你会用望远镜，也可能用夜视镜，或者卫星图，或者通过Google的地图，总之，你要借助一个工具。不同的工具会给你呈现出不同的视觉图像，比如是俯瞰还是平视，比如是红外线的，为什么？因为这些工具的工作原理不同。所以，在使用一个文献研究的工具之前，你要弄清楚，这个工具是如何定义前沿，如何定义知识基础，它计算突发词的方法你是否接受？这些还都是在讨论中的问题，你可以在一边使用中一边体会和判断，但是不应该毫无保留地全盘接受这个工具内部所蕴含的算法。换言之，你要记住，你如果使用Citespace分析某个领域，就意味着你已经接受认可了陈超美老师所提出的关于前沿、基础等等的观点，并愿意将用这些观点所看到的世界景象传播出去。 这就是软件发明者一再发表论文解释其原理而非软件具体使用步骤的原因吧。 有的工具，如微波炉，仅仅是一个加热功能，出来的是半成品，虽然也附带给你一些菜谱，但是具体如何用你自己创造，你做什么菜都可以。 但是，有的工具，集成化的程度高，已经把发明者的一些思想固化在里面了，这无可厚非。 只是作为使用者你要想清楚，如果你要吃火锅就用从厨房里拿火锅炉子，不要用错了。如果全中国文献计量的研究者都用一种方式展示某个学科主题的研究历史、现状或结构，那就和全国人民都认为美国人民都生活在水深火热之中是一样的。

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主题概率模型模型仿真工具

LuDoor 2010-11-3 05:50

国外流行的主题概率模型工具： 国外流行的主题概率模型工具

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基于工具的设计

jianghzhit 2010-9-14 05:17

刚一看到这个题目，您马上就会提出这样一个问题：有非基于工具的设计吗？ 人类是先进工具的创造者和使用者；人类的发展历史也就是发明生产工具的发展史；子曰：工欲善其事，必先利其器（《论语 . 卫灵公篇》）。例如，如果有一种或一组十分有效的工具能够容易地解决在系统仿真及相关领域的教学与研究遇到的问题，它可以将使用者从繁琐、无谓的底层编程中解放出来，把有限的宝贵时间更多地花在解决科学问题中，这无疑会提高工作效率。 据我所知，基于工具的设计（ Tool-based Design ）思想最早见于 Hanselmann 博士的论文 。 实际上其就是工具的集成，它是一体化设计思想（或者叫集成优化设计思想）的充分体现。路甬祥曾提出五化一新的概念来概括机械电子技术的发展趋势。五化一新包括集成化、智能化、网络化、绿色化、多样化和持续创新。持续创新包括突破性创新和集成化创新。他特别强调：集成化创新： 根据应用的需要，把已有的技术、最适合的技术集成起来，组成一个新的技术，这也是创新，而且是非常有作为的创新。中国航空工业发展研究中心的赵群力 指出集成设计包括技术的集成、系统的集成、过程的集成、人员的集成和管理信息的集成。我想还应该包括工具的集成，而基于工具的设计正是这种集成的体现。 那么什么才算是先进的基于工具的设计过程？产品的设计或开发过程实际上就是设计信息被加工传递的过程，如何正确快速地加工信息，并使其完整顺畅地流向下个设计阶段呢？最好的解决办法就是，在开发过程的各个阶段，都采用先进的工具，组成一个接口一致的工具链，从而形成流线化设计，达到快速、高质量地完成产品开发的目的。这里的要点就是 工具链与接口一致性 。工具之间要匹配，包括 功能、性能和接口的匹配 。 我们不仅要发明单一的先进工具，而且要发明易于集成的工具，这正是我们最应该投入资源去做的。 参考文献： H. Hanselmann, Development Speed-Up for Electronic Control Systems，Distributed on the occasion of Convergence 98, October 1921, 1998, Dearborn, USA 赵群力，飞机一体化设计技术，航空科学技术，2004，3

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怎样让孩子喜欢英语学习

lhj701 2010-8-7 19:09

自己的孩子不太喜欢学习英语，拿来考试试卷一看，尽管是初中二年级英语，却是听力、阅读、写作无一不考，词汇语法、阅读理解、完型填空主客观试题无一缺省。深感现在英语要求也的确比原来高了，自己知道英语学习需要慢功夫，仅仅背单词就令孩子头大了，加上缺乏语言环境，如果早先的基础没有打好，不喜欢是必然的事情了。 怎么让孩子喜欢英语学习呢？看到孩子的暑假作业有一个自学推荐内容：学习《新概念英语第二册》10课。眼睛顿时一亮，自己就是通过学习新概念英语开始了英语自学之旅，现在闭着眼睛立即可以背出许多课文。第二册那些文章短小精干、语法集中、情节有趣，适合重复学习。现在让孩子学习这些文章，显然可以增加孩子的阅读量，增强孩子英语学习的语境，非常适合初中学生的英语学习。 网上的音频资料很多，有美音的、英音的，还有现成的pdf文本格式。先用《千千静听》带歌词显示播放2遍，然后帮孩子排除一下生词，再边读英语边讲解每一句汉语意思，最后让孩子读熟就算可以了。 自己特别推荐一款软件《三耳电脑可视数字复读机》，因为我在教孩子过程中发现尽管文章很有趣，可孩子还是觉得有些枯燥，硬压着学又不行。因为孩子喜欢电脑敲字，这个软件可以将文章音频自动断句（当自动断句位置不太对时，也可以自己手动调节），利用它的歌词听写功能，将每一句的复读次数设置为永远，这样可以让孩子重复听写每一句，然后将内容敲到电脑上（我开始不是让孩子靠听懂默打到电脑上，而是看着文字打到电脑上，这样可以降低难度。当然如果能靠听就将文字打出来，最好不过了）。我发现利用这种打的方式，可以充分利用孩子的听、看、写（手敲字）协同作用，提高孩子的学习兴趣和学习效率。此外，这种方法还会带来另外一种好处：让孩子学会电脑盲打。所以在一开始就要教会孩子正确的双手盲打姿势。 现在和孩子一起，已经学习了近30课，孩子觉得这些文章很不错，学习起来有兴趣，说他做梦遇到和外国人讲英语了。我自己也更有信心利用一学期将96课和孩子全部学完，然后重复。另外，利用早晨吃饭的时间，播放所有课文的音频内容以增加语感，也是一种不错的多接触英语的办法。过去自己忙于自己的事情，很少帮助孩子学习。现在通过这种方式，希望孩子能喜欢上英语。

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试一试，把citeSpace 再说明白些

热度 3 zilu85 2010-1-22 17:13

【博主按】这是我编写的一部教材中对CiteSpace的介绍，估计这一次我是把这个东西想明白了，就是不知道能不能说明白。请各位赐教。 CiteSpace ： 由美国德雷赛尔大学信息科学与技术学院的陈超美开发。该程序可以登录到cluster.cis.drexel.edu/~cchen/citespace后免费使用。 如何表现一个研究领域？CiteSpace的开发者陈超美认为：可以用研究前沿和知识基础随着时间相对应地变化情况来表示一个研究领域的状况。 研究前沿（Research Fronts）：在CiteSpace中，采用一种突发词检测算法来确定研究前沿中的概念，基本原理就是统计相关领域论文的标题和摘要中词汇频率，根据这些词汇的增长率来确定哪些是研究前沿的热点词汇。根据这些术语在同一篇文章中共同出现的情况进行聚类分析后，可以得到研究前沿术语的共现网络。因此，研究前沿系指临时形成的某个研究课题及其基础研究问题的概念组合，也是正在兴起或突然涌现的理论趋势和新主题，代表一个研究领域的思想现状。 研究前沿的知识基础（Intellective Base）：即含有研究前沿的术语词汇的文章的引文，实际上它们反映的是研究前沿中的概念在科学文献中的吸收利用知识的情况。对这些引文也可以通过它们同时被其他论文引用的情况进行聚类分析，这就是同被引聚类分析（co-citation cluster analysis），最后形成了一组被研究前沿所引用的科学出版物的演进网络，即知识基础文章的同被引网络。 因此上，CiteSpace就是利用三个网络（研究前沿术语的共现，知识基础文章的同被引和研究前沿术语引用知识基础文章）随着时间演变的情况来寻找研究热点及趋势，并以可视化的方式展示出来。 具体做法包括：首先，下载相关文献，用户可以从Web of Science中检索并以固定格式下载某一主题的文献记录，主要包括作者、题目、摘要和文献的引文等字段，将检索到的文献记录输入到系统之后，系统会生成对文章标题、文摘和描述词的频率统计，然后设置参数，如确定要分析领域的总的时间段范围和分割后每一个时间片段的长度等；运行系统后会得到研究前沿术语的共现网络，知识基础文章的同被引网络和研究前沿术语引用知识基础文章网络三种可视化的结果。

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模型检验（结束语）（100101）

ymin 2010-1-1 15:24

模型检验（结束语）（100101） 闵应骅 学习完模型检验(model checking)三位创建者的文章以后，现在可以说几句结束语了。 科学大家就是科学大家。他们就模型检验28年来的发展，对历史、研究动机、已有成就及今后发展做了高度的概括和总结，指明了方向。但是，真要想做这方面的研究，还需要就其中的一个问题，查阅文献，深入下去才行。 当今，在计算机工程与科学领域，困扰我们的一个问题是复杂性。系统很复杂，计算很复杂。但是，真要定义什么叫复杂，倒是一个很困难的问题。计算复杂性有一成套的理论，基于图灵机可计算性，有所谓P问题、NP问题。但是，实际上，一个多项式复杂性的问题可能你算不了。例如解线性方程组是多项式复杂的，但是，13亿人建一个13亿阶的方程组，可能现在的超级计算机也算不了。反过来，NP难的问题，在IC设计与测试领域比比皆是。SAT就是一个典型的NP难问题。对于特定的NP问题，我们完全能够用启发式方法，得到很有效率的解。有些过去望而生畏的问题现在已经有了有效的解。例如，OBDD（有序二进制判决图），测试生成，模型检验等。本人上世纪提出的布尔过程，由于复杂性问题而得不到响应。但是，你想一想，我们现在IC设计与测试中碰到的判决问题、优化问题，哪一个是简单的。计算机发展到如此强大，不就是为了处理复杂问题的吗？所以人类的智慧一定会越来越善于处理复杂问题。 我想，如果我们请一位博士生，读几篇模型检验的文章，然后写一篇综述，他一定会列出许多模型检验工具，说明它们有哪些功能。林林总总一大堆，内容似乎很丰富。三位大师的文章不是这样的。他们指出的是基础性的问题、前瞻性的问题。这对科学研究才是最有益的。商业工具只是根据基础研究成果，变成大众便于使用的工具。所以，工具一定是要落后于研究的。没有研究出方法来，就不会有工具出现。当然，并不是所有的方法都会变成工具。工业界认为有助于实际问题解决的方法，工业界才会把它变为工具，工具好不好最后要看用户满不满意。所以，研究成果的意义最后还是要工业界说话、要实际说话。实践是检验真理的唯一标准嘛！正因为如此，基础研究一定不能削弱，但又不能追着出成果。产品开发很需要做，但不能代替基础研究。

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一个文献分析的软件：Bibexcel

热度 13 zilu85 2009-11-16 11:04

把自己开发的文献共现矩阵生成软件叫做BICOMS，在给研究生上选修课《文本挖掘在科研选题中应用》的时候试用，同学们总是问我，我们没有软件，课程结束后怎么办？其实我也没有想好这个软件将来怎么使用：是收费？还是全免费？还是开发网络版？还是注册后可以免费下载？ 忽然有一位同事告诉我网上也有一个免费使用的文献计量分析的软件，免费下载。拿来用一用，功能和我的差不多，总归不是自己开发的，用起来还是不顺手。但是，英文说明书看过了，顺手就翻译过来了。把它上传到了CSDN的下载频道上了，竟然如石沉大海。所以就在这里再发一个吧：） 利用 Bibexcel 进行文献计量分析和引文分析快速指南 Alan Pilkington 【 a.pilkington@rhul.ac.uk 】 概述与安装 本人使用 Bibexcel 业已多年，一直向大家推荐这个工具。但是，总是被人们问及如何上手使用，每次拿它进行分析的时候，总是要回头再次读一读自己手写的笔记。所以，我感到有必要就如何利用 Bibexcel 进行文献计量分析写出一个介绍性的东西，希望能给大家提供有用的信息。如果有任何建议或者发现任何错误，请通知我。 Bibexcel 是一个用于文献计量分析、特别是引文分析的完美工具。用户可以在 www.umu.se/inforsk 网站上获得最新版本。其安装也十分简单，只需要把文件拷贝到硬盘的目录下即可，记住要把帮助文档也放在一个目录下。如果本指南不能满足你的需求请到该网站上浏览网页。 利用 Bibexcel 进行引文分析 第一步要有用于分析的来源数据。在引文分析中，来源数据就是从《科学引文索引》、《社会科学引文索引》中检索到来源文献。这两个数据库是商业数据库，是 Web of Science 或者 ISI 数据服务的组成部分，你所在的大学可能已经订购了它们。 《科学引文索引》和《社会科学引文索引》的使用 和平时一样，使用 WOS/ISI 检索功能检索到来源文献。在开始下载文献之前，必须了解你研究的内容。如果是对一种期刊的文章内容进行分析，其来源文献很容易确认下来。比较复杂的研究有可能是针对某一作者或者大学的某个系的文献记录。无论你的计划是什么，如果你是要从《科学引文索引》和《社会科学引文索引》中下载数据，下载和准备数据的步骤都是一样的： 在 WOS ，下载前需要对要下载的记录进行标记。然后开始下载所选择的论文，保证下载项目中包括论文的引文。可以通过 download for future analysis （为进一步分析而下载）或者通过电子邮件发给自己，两种方式都生成纯文本文件。 如果下载的文献记录过多，下载中有的时候会导致数据传输超时。可以打开已经得到的文件查看（可以用 Bibexcel 中左上角的窗口找到文件，在左下角的窗口中可以看到文件的内容，也可以使用文本编辑器），找到文件的最后几行，看看是否存在 HTML 格式错误，如果有错误就表明下载中出现了超时。如果出现超时，解决的办法只有重新下载并注意减少下载记录的数量，比如减少检索的年限。如果是分段下载的，必须记住，在下一步分析之前，要把分离的文件重新组合到一起。用文本编辑器（如记事本）打开这些文件，剪切和粘贴，要保证在合成的文件的顶部只有一个文件头，而不是在已下载的每一个部分的开头： FN ISI Export Format VR 1.0 利用文本编辑器可以很容易查看纯文本中的数据，但是在使用诸如 MS word 之类的字处理器时候要当心，因为它们会增加字符、重新定义过的行格式和其他可以在后来引起问题的东西。 需要注意观察的是 unix 和 Windows 的行末尾和换行是不同的，而 Bibexcel 是采用 Windows 格式，所以需要在 Bibexcel 中打开来源文件（在左上区域）然后观察文件是否只含有一行文字（在右下角）而不是整整齐齐的文字块，这时你需要把换行改为 Windows 格式。利用 editpad lite 完成这项工作，该软件可以在 JGSoft 上免费下载。 为了进一步准备和分析，在 Bibexcel 或者文本编辑器中打开的原始数据文件应该是下面这个样子： FN ISI Export Format VR 1.0 PT Journal AU Brown, S Blackmon, K TI Aligning manufacturing strategy and business-level competitive strategy in new competitive environments: The case for strategic resonance SO JOURNAL OF MANAGEMENT STUDIES NR 190 CR 1998, IND WEEK 1207, V247, P22 YOUNDT MA, 1996, ACAD MANAGE J, V39, P836 ZAJAC EJ, 2000, STRATEGIC MANAGE J, V21, P429 ZAJAC EJ, 1989, STRATEGIC MANAGE J, V10, P413 BP 793 EP 815 PG 23 JI J. Manage. Stud. PY 2005 PD JUN VL 42 IS 4 GA 929TJ J9 J MANAGE STUD-OXFORD UT ISI:000229369000004 ER PT Journal AU Brown, S Cousins, PD TI Supply and operations: Parallel paths and integrated strategies SO BRITISH JOURNAL OF MANAGEMENT NR 105 CR ANDERSON JC, 1991, INT J OPER PROD MAN, V11, P86 BADRI MA, 2000, OMEGA, V2, P155 BEACH R, 2000, INT J OPER PROD MAN, V20, P7 WOMACK J, 1996, LEAN THINKING WOMACK J, 1990, MACHINE CHANGED WORL ZAIRI M, 1992, INT J OPER PROD MAN, V12, P34 BP 303 EP 320 PG 18 JI BRIT. J. MANAGE. PY 2004 PD DEC VL 15 IS 4 GA 874LZ J9 BRIT J MANAGE UT ISI:000225353200002 ER PT Journal AU Laycock, M TI Transforming Rover, renewal against the odds 1981-1994 - Pilkington,A SO LONG RANGE PLANNING NR 1 CR PILKINGTON A, 1994, T ROVER RENEWAL ODDS BP 738 EP 739 PG 2 JI Long Range Plan. PY 1996 PD OCT VL 29 IS 5 GA VW288 J9 LONG RANGE PLANN UT ISI:A1996VW28800021 ER 现在，你可以开始使用 Bibexcel 了 ... 开始分析 Bibexcel 因其灵活性而十分强大，但过于灵活会在刚开始使用的时候会带来一点点困惑，有的时候好几件事情通过一个步骤就完成了，有的时候需要把几种不同数据集结合在一起来处理文件。使用 Bibexcel 过程中需要帮助的时候可以按 F1 获得帮助，但是这个帮助往往是面向比较熟练的用户，老用户明确自己要做什么因而需要略加指点后在 Bibexcel 下完成的任务。幸运的是还有一些笔记来填充教程和快速指南留下的空缺。 首先，确定要分析的数据。按照上述步骤已经下载了文本文件中，有一个字段标识符为 CR （或者 CD ）表示引文（在下载来源文献记录时，你需要明确指出要下载引文），因为这是文献计量学最关注的内容，很多分析会使用到这个数据，但是你也可以利用软件分析其他感兴趣的字段。 转换到 Dialog 格式 为了把你的数据转换成 Bibexcel 可以处理的格式，需要对数据做进一步的准备。这方面内容在 Bibexcel 的帮助文件中有很多介绍，运行 Bibexcel 时按下 F1 进入帮助系统，查询索引和条目，如下载、转换到 dialog 和数据准备（ downloading, convert to dialog, preparing the data ）。在阅读分析步骤之前阅读介绍部分有益无害。 简短地说，准备数据包括如下步骤： 首先，检查文件是否是 Windows 格式的结尾（如前所述）。 为了进行转换，利用 Bibexcel 左上角的窗口来导航来查看从 SCI 中获得的数据，这些数据将在右侧标有 the list 的窗口上出现。在 Bibexcel ， 一般使用左上角的窗口来选择要处理的文件，在菜单中选择一个项目来执行任务，或者点击 start/prep 按钮中的一个。 让你的数据变成 Bibexcel 的正确格式的第一步是选择好你的数据文件然后点击 Misc/ Converttodialog/ convertfromWebofScience 菜单。 如果没有这样处理过文件，则需要通过在左上角选择原始数据（使用 view file 查看文件按钮来检查），然后利用菜单命令： Misc/Converttodialog/ convertfromWebofScience 。最后会得到一个 .doc 文件（与你原始文件同文件名，只不过是以 .doc 结尾）。 在抽取出你要进一步分析的字段之前，选择和查看这个文件，比如在每一行的开头是否有完好的标签（ PT-, AU-, SO-, CD-, PY- 等），这些标签表明记录的内容，是否有干净的行结束标识 | 和记录结束标志 ER || 。注意 Bibexcel 如何把分号作为的字段中多个条目的分隔符，比如作者和引文。这些分隔符会有助于以后分析中把各个条目分割开来。 PT- Journal| AU- Brown S; Blackmon K| TI- Aligning manufacturing strategy and business-level competitive strategy in new competitive environments: The case for strategic resonance| SO- JOURNAL OF MANAGEMENT STUDIES| NR- 190| CD- 1998, IND WEEK 1207, P22, V247; 1998, IND WEEK 1207, P24, V247; ADLER PS, 1990, P55, CALIFORNIA MANAG SPR; ANDERSON J, 1991, V1, P86, INT J PRODUCTION OPE; ZAJAC EJ, 2000, V21, P429, STRATEGIC MANAGE J; ZAJAC EJ, 1989, V10, P413, STRATEGIC MANAGE J|BP- 793| EP- 815| PG- 23| JI- J. Manage. Stud| PY- 2005| PD- JUN| VL- 42| IS- 4| GA- 929TJ| J9- J MANAGE STUD-OXFORD| JN- JOURNAL OF MANAGEMENT STUDIES, 2005, V42, N4, P793-815| UT- ISI:000229369000004 ER || 简单抽取字段 查看 .doc 文件的时候，你会注意到有一个叫做 TI- 的字段（表示标题，其他的如 AU 表示作者， PY 标识出版年， CR 或者 CD 标识引文等）每一个字段都可以抽取出来形成一个文件用于进一步分析。 例如，如果要分析论文的标题词，可以当作寻找将不同论文联系到一起的关键词，最常用的单词是什么？ 这个时候，需要抽取出 TI- 字段的内容，通过选择 .doc 文件（如前面查看文件时候的步骤）开始，将（ TI ）标签放到 old tag （旧标签）框内（左下角），从中间上部的 PREP 旁边的下拉菜单选择正确的数据格式（ blank separated field to treat each word alone ，字段由空格分隔使每一个单词独立计数），然后按下 PREP 按钮来执行操作，产生一个新的 .out 文件，这个 .out 文件用于进一步分析，按下 F1 查看进一步操作这些数据的帮助内容。利用左上角的框来查看 .out 文件，注意所需要的单词是如何保留下来的，还有对标题中含有这些单词的来源文献的链接（第一列中的数字），这个程序功能强大的原因之一可以很容易地查看不同来源论文之间的链接。下面是一个 title.out 文件的例子（第一列的数字表示来源文献）： 1 Aligning 1 manufacturing 1 strategy 1 business-level 1 competitive 1 strategy 1 case 1 strategic 1 resonance 2 Supply 2 operations 2 Parallel 2 paths 2 integrated 2 strategies 3 conceptual 3 synergy 3 model 3 strategy 3 formlation 3 manufacturing 4 Technology 4 portfolio 4 alignment 4 commercialisation 4 investigation 4 fuel 4 cell 4 patenting 你还可以用来自其他数据源（如数据库或者 excel ）生成自己的 .out 文件，然后用 Bibexcel 执行下面分析步骤。只要保证是同一格式并且是纯文本。 基本分析 通过在选择和查看文件（屏幕左上角）产生了 .out 文件中（如果升级了可能叫做 .oux ）项目的频次，然后用左边中间的窗口中使用 whole string, sort descending, start 生成一个 .cit （ citation ）频次文件。现在，我们就可以打开 .cit 文件查看哪些词在来源论文的标题中出现最多。我现在使用的文件显示出 manufacturing 出现了 9 次，然后是 strategy 和 strategic: 9 manufacturing 8 strategy 6 Strategic 4 management 3 operations 3 competitive 3 investigation 2 learning 2 Literature 2 relationships 2 links 引文分析 文献计量学中最为常用的方法之一就是引文分析，而 Bibexcel 使得数据获取的步骤以及分析都相对容易。最大的问题往往是从原始数据中仅仅抽取出部分所需要的引文信息。 第一步是从 .doc 文件中抽取全部引文信息，所以要重复上述步骤只是在 old tag box 窗口中用 CD 标签并且选择 any ; separated field ，产生 .out 文件，文件中列出每一条引文及其来源文献号： 1 ADLER PS, 1990, P55, CALIFORNIA MANAG SPR 1 ANDERSON J, 1991, V1, P86, INT J PRODUCTION OPE 1 ANDREWS KR, 1971, CONCEPT CORPORATE ST 1 ANSOFF HI, 1965, CORPORATE STRATEGY A 1 PILKINGTON A, 1998, V41, P31, CALIF MANAGE REV 1 ZAJAC EJ, 2000, V21, P429, STRATEGIC MANAGE J 2 BEACH R, 2000, V20, P7, INT J OPER PROD MAN 2 BESSANT J, 2003, V23, P167, INT J OPER PROD MAN 2 BRAGLIA M, 2000, V28, P195, OMEGA-INT J MANAGE S 一般用户都愿意对全引文格式进行分析，但是最好是抽出来按照作者 + 标题分别进行分析，还可以在使用 author.title 和年代进行分析之前对数据进行清洗（例如对一种缩写进行标准化）。 如果想要在 .out 文件中抽出作者，首先查看 .out 文件，在左面中部的面板上选择被引作者，选择去掉重复和生成新的 .out 文件，按下 start 开始按钮，生成一个 .oux 文件，仅仅列出作者（或者至少是应该在作者字段位置上的条目，如果文件格式正确的话） 1 ADLER PS 1 ANDERSON J 1 ANDREWS KR 1 ANSOFF HI 1 BAHRAMI H 1 BAIN JS 1 BARNEY J 1 BARNEY JB 1 BATES KA 1 BEACH R 1 BERRY WL 1 BESSANT J 1 BOEKER W 2 COUSINS PD 2 CROSBY P 2 DANGAYACH GS 2 DSOUZA DE 2 DURAY R 2 DYER JH 2 ELLRAM L 2 ELLRAM LM 2 FARMER D 2 FEITZINGER E 2 FLYNN BB 3 GRANT RM 3 HAKSEVER C 3 HAMMER M 3 HART SL 3 HAX AC 3 HAYES RH 3 HENDERSON JC 3 HEWLETT CA 用户可能希望在进一步分析之前用 excel 或者其他软件来去掉第二个首字母缩写，使得数据更加规范。我一般愿意使用 excel 的分列菜单把姓和名字首字母缩写分开，然后用 LEFT 功能把第一个首字母缩写提出来然后与名字 CONCATENATE （串联）在一起。这样一来，用文本编辑器或者 excel 可以把这些数据一起放到与 Bibexcel 的 .out/.oux 兼容的同一个纯文本格式的文件中。 这样你就可以对其进行频数统计生成 .cit 文件，如此一来可以发现高被引作者： 27 PILKINGTON A 11 HAYES RH 11 SKINNER W 9 HILL T 7 PRAHALAD CK 6 LEONG GK 6 MINTZBERG H 6 PORTER ME 6 STALK G 6 SWINK M 6 VOSS CA 6 BARNEY J 6 WOMACK J 6 HAYES R 从 .out 文件还可以采用同样的步骤来抽取其他元素，比如出版物的标题，甚至一些元素的组合。 Bibexcel 利用 SCI 中的条目格式来辨认所要抽取的部分，所以如果想要期刊条目，你只需要获得那些带有有效的卷标和页码信息的条目，这些工具小心使用，因为在 SCI 中的数据经常出现格式不正确的情况。 共现和网络 了解了来源文献或者引文中的各个字段的频数之后，一种有意义的探索是了解引文或者字词之间的关系和网络 / 地图。这种探索在 Bibexcel 中叫做共现，在帮助文件的生成矩阵部分有介绍。 可以用你需要的任何数据建立共现矩阵，比较有意义的共现包括标题词、作者、期刊名或者项目的组合，比如用作者、期刊、年代来确认某一篇论文。我经常手工制作一个 .out 样的文件输入给 Bibexcel ，分析来自不同数据库的专利数据的共现。 共现分析中必要的步骤包括生成一个含有频数的 .cit 文件，有助于选择分析的项目，然后使用这个索引来分析 .out/.oux 文件，在 .coc 文件中生成共现数据。然后这个文件可以转换成为类似 excel 四格表的矩阵，其中单元格的数字是行和列标题的频数。 在进行这种分析的时候，我们往往只是关心引文之间的关系是否存在而不是一篇论文是否有很多引文，所以一般最好采取额外的步骤来去掉重复的条目。可以使用中间左边的框，对 .out 或者 .oux 去掉重复标识，生成一个新的文件。 为了生成共现或 .out 文件，首先查看 .cit 文件，然后选择你要分析的单词 / 作者 / 标题 / 引文字串（在主窗口中涂蓝）。在 .cit 文件中把要分析的条目加亮之后，按照 Analyse: Coocurrance: slectunits via list box 操作：仅仅获得在 the list 窗口中的项目。然后，在左上角中选择你的 .out 文件（不要查看该文件，因为你要保持你刚刚选择的单词加亮中），然后操作 Analyse: Coocurrance: make pairs via listbox ，生成了 .coc 或者共现文件。查看这个文件看看结果。 .coc 文件中包含共现频次以及配对的两个项目，例如对于作者共现文件： 17 PILKINGTON_A HAYES_R 16 VOSS_C HAYES_R 15 HAYES_R HILL_T 14 MEREDITH_J HAYES_R 14 VOSS_C MEREDITH_J 14 HAYES_R SKINNER_W 13 VOSS_C HILL_T 12 PILKINGTON_A HILL_T 或者标题词共现文件： 6 manufacturing strategy 4 Strategic Management 3 strategy competitive 2 strategy new 2 mass customisation 2 manufacturing study 2 strategy case 2 manufacturing competitive 2 strategy strategic 2 competitive case 2 competitive strategic 我个人一般使用像 UCINET 之类的程序对这些数据进行进一步的网络分析，因为 .coc 文件与带有标记的 .DL 格式数据文件类似，但是把频数放在最左边而不是右边的一列，把数据转移到 UCINET 相对容易。如果你也想做这些分析，请阅读 UCINET 的帮助文件了解如何把数据输入到分析软件中去。 我采用的步骤包括把 .coc 文件输入到 excel 中去，剪切左侧一列的频数并复制到右边，把所有三列剪切粘贴到一个文本编辑器，给文件添加标题使其具有 DL 格式，比如： 从 UCINET 中获得的结果往往会提供有关数据矩阵状态的清晰视图，如下图，并且可以使用更多的分析工具。 Pilkington 个体网的作者同被引图 一般用户都需要一个含有 .coc 文件中项目的正方形矩阵。为了把 .coc 文件中数据列表转换为矩阵，像从前那样选择同样的单词加亮它们：使用 analyse: coocurrance: select units via listbox ，然后选择你的 .cit 文件，操作 analyse: make a matrix ，生成一个 .ma2 结果矩阵文件，由于它仍然是纯文本文件，可以用于其他程序中。 将这些矩阵文件输入到其他程序中的一个问题是，矩阵中只有每一列的顶部带有标签而侧面行则没有。为了解决这个问题，可以把文件输入到 excel ，插入一个新的空列，把顶部第一行拷贝下来然后选择 edit: paste special: transpose ，把标签加到每一行的前面。这就生成了一个带有完整标签的正方共现矩阵，更像一个四格表可以输入到 SPSS 中进行因子分析，对项目进行统计分组。 引文耦合 对于引文共现和同被引分析在描绘文献之间关系上还有一些争议，有人推荐使用引文耦合（ bibliometric coupling ，书目对）。引文耦合不是分析不同被引文献之间的联系，而是显示和分析来源文献之间的联系，不用说，使用 Bibexcel 中的共现单元方法也可以实现这种分析。 今后的可能 这只是我用 Bibexcel 完成自己工作时候所需要的步骤，等到你查看菜单和帮助文件的时候你会很清楚认识到这个软件还可以做很多事情。 Alan Pilkington 9.1.06 10 【翻译： zilu85@hotmail.com 】

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“钻木取火”所用的工具猜想图及质疑

famingkuang 2009-9-30 13:02

虽然我能复制原始人钻木取火的工具，但我不承认钻木取火是人类最早的取火方法。象这样的工具应该是人类文明已经很发达了才能做成。百度词典是这样说的： 燧 人氏 Su r nsh 中国古代传说钻木取火的发明者 , 教人熟食 有圣人作 , 钻 燧 取火以化腥臊 , 而民说之 , 使王天下 , 号之曰 燧 人氏。《韩非子五蠹》 我相信，燧人氏所使用的取火工具与我上图的应该相类似。 记得小时候上山放牛的时候，山上有一种非常硬的白石头（石英？），我们经常用这种石头在晚上相互撞发出火花，我的父亲在没有别的取火工具的时候常常用这种石头撞击出来的火花点燃用艾草叶子加工做成的艾絮来点烟。 所以我猜想，原始人最早的取火工具是用石头相互撞击的方法，发明的过程大概是这样的： 在新石器时代，原始人类已经懂得制造石斧、石刀之类的了，当然他们总是去寻找最坚硬的石头做他们的石斧、石刀，在加工的过程中，石头与石头的碰撞过程中经常会冒出火花，当时的原始人类肯定会想尽一切办法用这种火星去点燃枯木、枯草，当一颗火星掉进棉絮里的时候，他们终于成功了！ 所以我认为，钻木取火不是人类最早的取火工具。撞石取火才是人类最早使用的取火工具。 古代木工用的摆钻，又叫弓钻。

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人类思维的八大工具

chrujun 2009-9-15 21:39

人类思维的八大基本工具如下： 1. 记忆。 思维的基础 2. 联想。 3. 模式识别。儿子小时把狗识别成奶牛。 4. 推理。包括归纳推理和演绎推理。 5. 经验。 很多时候并不可靠 6. 发明创造。 发明天才很少 7. 实验。 8. 直觉。 有时发挥重要作用 前四点用在思维过程中。 初稿，未完整！

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自造武器：能判断常识的，一定不是常识

大毛忽洞 2009-9-13 07:53

自造武器：能判断常识的，一定不是常识 武器就是一种工具，而且是一种最昂贵的工具。 我们学习和研究，也需要一种武器（工具）。 好的武器一般买不到，只能自己造！ 造工具也需要工具，能造工具的工具，一般不是普通的工具。 能判断常识的，一定不是常识。 进化论认为，人是从猿猴进化而来的。 有两个动作对进化非常重要： 第一是直立行走； 第二是制造工具。 对人的身体而言，直立行走的转折点是屁股。从爬行到直立，身体的上部以屁股为中心转动了一个角度， 这是人类所进行的最早的 转动操作 。 制造工具是人类进化的第二个里程碑。 实际上，国家发达和不发达的主要差别在于制造工具的水平。 如果我们自己能把这个工具造出来，则说明我们有造工具的工具。否则，我们只能去买一个商品工具，然后再来造我们自己的工具。 关于基础研究，我们嚷嚷了很多年了。 究竟什么是基础研究？ 答案是五花八门：公说公有理，婆说婆有理；智者见智，仁者见仁。 俺的观点是折腾科学的基础就是一种基础研究。 例如，在量子力学建立的初期，就有两种表示，可是后来费曼又折腾出一个路径积分。 余瑞璜 先生的经验电子理论，是归纳出来的，其理论核心包括两部分内容： 原子的杂化态构造和原子的空间分布规律（等同键数目）。 前者（原子杂化态）很复杂，即使能折腾（研究）出一点新的结果，也无法直接检验。后者（等同键数目）却是可以检验的，但是需要一个工具。 如何清点晶体空间里的化学键数目，这涉及到晶体学最基本的东西，其中包括很多常识性的东西。 折腾科学的基础（包括教科书里的东西）是一种很危险的研究工作，如果让学生来干，很容易犯一些概念性的错误，这对学生的答辩是致命的。 因此，折腾基础的东西，需要很长的时间，因为先要造一个工具，在这漫长的自造工具的过程中，既出不了文章，也出不了什么鉴定。如果让俺领着几个年轻人干，最后的结果是把年轻人给害了（没有文章，没有成果，你让人家怎么活呀？除非你是银行分行的行长）。 因此，只能，也只有俺自己折腾了。 对于评审人的所谓团队评论，俺斥之为鸡毛（蒜皮）性的评议。 参见：《同行评议意见》：只评鸡毛，不评科学 230 空间群理论（空间群表）虽然被写进了教科书，但是空间群本身（或被使用过程中）仍然有一些问题。 例如， Cu 的空间群是 225 号。 Pearsons Handbook 告诉你， Cu 的 4 个原子呆在 4a 位置。 实际上， Cu 的 4 个原子也可以呆在 4b 位置。 原子呆在 4a 位置的 Cu 和原子呆在 4b 位置的 Cu ，是 100 ％等价的晶体结构。 由此可见，用空间群（原子坐标）来描述晶体结构仍然是不惟一的。 客观上， Cu 原子在空间的排列是惟一的。 既然空间群的描述不是惟一的，就应该存在一种惟一的描述方法。 这方法就是键络模型，究竟有几个参数，这要等到俺把 230 空间群扫描完之后，才能有最后的结论。俺用的是归纳法，除此之外，别无他法。 如果用一个魔方来隐喻， 4a 位置的 Cu 就是原子呆在魔方的 8 个角上和 6 个面的中心。 4b 位置的 Cu 就是原子呆在魔方的中心和 12 个棱的中心。 严格讲，魔方角上的对称性和魔方面心的对称性是不同的，在复杂结构有时会反映出这些差别。 又例如， Mg2Ni 是一种比较简单的结构，空间群为 180 号。 文献 Physical Review B 76, 075125(2007) 的描述是： Ni(3 b ) ， Ni(3 d ) ， Mg( 6 f ) ， Mg(6 i ) 多数实验文献都如上描述。 而文献 Landolt-Brnstein - Group III Condensed Matter 的描述是： Ni ( 3 a ) ， Ni ( 3 c ) ， Mg( 6 f ) ， Mg( 6 j) 一个 Mg2Ni 晶体（空间群 180 号），不同的研究者给出了不同的表述方法。 实际上以上两种描述是完全等价的。 虽然从空间群（ No. 180 ）看， 3a 、 3c 、 3b 、 3d 位置的对称性是一样的， 6i 和 6j 的对称性也是一样的。 实际上， 3b 位置上的原子，在 Mg2Ni 中的环境是不同的；同样， 6i 位置上的原子，在 Mg2Ni 中的环境也是不同的。 例如，在相同键距的情况下，有的 3b 原子周围有 4 个 6i-Mg 原子，而有的 3b 原子，周围只有 2 个 6i-Mg 原子。 然而， 180 号空间群标注出所有的 3b 原子都有相同的对称性，实际上不是这样的。 由此可见，确定 余瑞璜 先生电子理论的等同键数目，是一个非常棘手的问题，其本质是如何清点晶体空间中的化学键（键络）。 附录（原子后面的数据是笛卡尔坐标， SP 坐标是晶体学坐标） 6i-Mg---3b-Ni d===,2.6518 6i-Mg:,3.935,.7302,-11.0256, Z=,1 SP coordinates=,.675,.837,-.333 配位原子： 3b-Ni: ,5.205,0,-13.236 SP coordinates=,1,1,-.5 3b-Ni:,5.205,0,-13.236, Z=,4 SP coordinates=,1,1,-.5 配位原子： 6i-Mg: ,3.935,.7302,-11.0256 SP coordinates=,.675,.837,-.333 配位原子： 6i-Mg: ,5.205,-1.4695,-15.4464 SP coordinates=,1.163,.837,-.667 配位原子： 6i-Mg: ,5.205,1.4695,-15.4464 SP coordinates=,.837,1.163,-.667 配位原子： 6i-Mg: ,6.475,-.7302,-11.0256 SP coordinates=,1.325,1.163,-.333 6i-Mg---3b-Ni d===,2.6518 6i-Mg:,3.935,-.7302,-19.854, Z=,2 SP coordinates=,.837,.675,-1 配位原子： 3b-Ni: ,5.205,0,-22.0644 SP coordinates=,1,1,-1.167 配位原子： 3b-Ni: ,5.205,0,-17.6436 SP coordinates=,1,1,-.833 3b-Ni:,5.205,0,-17.6436, Z=,2 SP coordinates=,1,1,-.833 配位原子： 6i-Mg: ,3.935,-.7302,-19.854 SP coordinates=,.837,.675,-1 配位原子： 6i-Mg: ,6.475,.7302,-19.854 SP coordinates=,1.163,1.325,-1

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钱伟长论科研工具与问题

musicriver 2009-9-6 14:29

钱伟长论科研工具与问题 40 年前我认识几位老先生，其中包括我和钱学森的老师冯卡门，还有我的博士导师辛棋教授。他们两个人都给我讲过，做一番事情，我们用的工具要恰到好处，目的在于解决问题。我们应该是解决问题的屠夫，屠夫需要很好的刀，杀猪杀牛，一刀下去恰到好处立刻就死了，没有什么挣扎。这把刀不要超过需要，刚好就行了。还有一批人是专门做刀，整天在磨刀，是刀匠.刀匠是需要的，可是如果整天地欣赏，我这把刀磨得多好啊，而不去用就不好了。一个是著名数学家，一个是在科学上卓有成就的工程师，他们都反对科技工作者轻视实用，这个思想非常明确。换句话说， 不要作刀匠，要作屠夫 。我们非线性科学的发展，这句话也很关键。 希望大家能去找最好的刀，去杀最难的间题 。一刀下去正好，不要迷恋于不断改进刀。还有一种说法是发明电子计算机的冯诺依曼讲的，他讲得更明白，他说我们为了解决问题，必须从所有的方面来找解决间题的办法，去找出这个工具来解决间题。要捏着鼻子跳海，跳海很危险。因为不会游泳就会被淹死。所以要学会游泳，会在数学的海洋里寻找工具，可是一定要懂得找到了工具就算了，不要老待在里头，这个海太大，你一辈子也游不完。 摘自 钱伟长：谈谈非线性科学，1994

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科学网博客需要更方便用户

apiaceae 2009-5-12 15:51

Windows Live Writer 现在已经是Bloger门经常使用的工具。科学网的博客系统的API没有发现，希望能够有所改善，这样方便大家发布自己的博文。

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人的本质

刘玉平 2009-3-19 00:22

很早就考虑写这个话题了，它可能源自朦沌的亘古，并将延续到遥远的未来许多哲学文章那种罗列堆砌概念、缺少适当实例的表达方式，让一般人感觉云里雾里。加上本人非哲学专业，因此，想尽量写得简单明了一些。与大家交流自己的一点粗浅认识，欢迎批评指正！ 人的本质 人 ，作为一种特殊的高智能生物， 人性 应当包括人的生物属性和人的非生物属性这两个不可或缺的方面。人的生物属性，体现了人与生物的统一，是人的基本属性；人的非生物属性，体现了人与生物的对立，是人的特殊属性。 人的本质 ，按我们大多数人所接受的 马克思 的经典定义，是指 人的非生物属性， 又称为 人的特性 。 马克思理解的 人的特性 ，是 自觉自由的活动 、是 劳动 、是 社会关系的总和 。在我国理论界，通常也分别从意识性、劳动实践性、社会性三方面使用 人性 或 人的本质 一语。 马克思在一百多年前的经济、科学、文化等背景下，提出这样的认识，无疑是人类认识的一次重大飞跃。但是目前对人的本质的理解，有陷于空泛化、教条化的迹象，已经与现代科学技术的诸多新发现不相适应，也违背了辩证唯物主义和历史唯物主义两大基本认识原则。 那么，人与生物的本质差别是什么呢？就从分析马克思提出的 自觉自由的活动 、 劳动 和 社会关系的总和 这三个方面入手，谈一下自己的粗浅认识吧。 首先，自觉自由的活动即通常所说的意识性，其重要标志是语言文字。 树叶随着季节的变更，颜色由鹅黄 绿黄 / 红； 含羞草，会因外物触碰而收拢可见，一般意义上的意识，是生命活动的一种重要形式，是区分生物与非生物的重要标志，而不能成为区分人与生物的依据。 那么作为人类意识性重要标志的语言呢？其实许多动物种类内部也是有语言交流的，只不过这些语言没有完全被人类所理解罢了：我们常说鸟语花香，鸟类的谈情说爱，通风报信，都是靠鸣叫来完成的；猫，悠闲高兴时会发出呼噜呼噜的声音，而我们一般熟悉的喵声，兴奋渴求时短暂而柔和，恐惧哀怨时绵延而凄厉。此外，动物还会使用分泌或感觉特殊的化学物质，以及发射或接受特定的物理信号，来传达或获取信息。诸如：蝙蝠会用超声波感知障碍物和猎物，小狗会用它的尿液和粪便来标记领地和记住往来路径，鸽子通过对磁场的灵敏感应来判断方向和确认位置，某一类蝴蝶会从弥散在空气中的千万种不同的花香中分辨出自己喜欢的那一种花香等等。 但是，作为信息交流工具的生物语言，往往局限于某一特定的种群内部，而且没有抽象出独立于自然的形式。而人类的语言，通过进一步抽象成独立于自然的文字，承载着人类对周围世界的信息的识别、提取、加工、交流和传播，以其形式的抽象性、（不同种群间的）可交流性以及发展演化性等为重要特点，可能算得上人与生物在意识性方面的一个关键区别。 其次，我们来看一下劳动或劳动实践性。 按照马克思思想的观点，劳动是整个人类生活的第一个基本条件，它既是人类社会从自然界独立出来的基础，又是人类社会区别于自然界的标志。马克思主义还认为，劳动创造了人本身。一般， 劳动 是指具有一定生产经验和劳动技能的劳动者使用劳动工具所进行的有目的的生产活动，是生产的最基本要素，是人类对自然界的积极改造，其根本标志在于制造工具。 因此，为了生存而进行的本能性实践活动，并非严格意义上的劳动。例如：许多动物会从自然界选取合适的材料，选择适当的位置，修建出供它们避风挡雨、繁衍生息的巢穴，而且有些动物种类巢穴的精致程度不逊色人类的豪宅。此外，许多种动物会打猎捕食，还会教育下一代学会劳动及捕食及娱乐。比如海豚就有一套让人叹为观止的捕猎技巧和方法。 那么，以通常所认为的制造工具这一具有标志意义的判据来看呢？似乎是人所独有，但在我最喜爱的 CCTV-3 动物世界这一栏目中，曾多次看到诸如：大猩猩也会制造简单工具，如打磨石块等（参见 视频 ： 科学家拍到黑猩猩会制造工具捕食白蚁 ）； 会制造工具的乌鸦（视频） ； 生活在佛蒙特州森林里的盘腹蚁 ，会把植物碎片或小泥团当作海绵吸收尸体里的汁液，然后再进行搬运等等之类的报道。 看来某些动物具备了制造简单工具的能力，但人类从自然界中获取的制造工具的物质材料，不仅仅是对自然物质物理性状的加工，而且演化发展到提取其中的金属、能源等特殊物质成分，用来制造比较复杂的、并不断变化改进的工具，可能是人类与生物在劳动上的重要区别。其中，对火与水这两大自然力量之潜能的开发和利用，应该具有重要的标志意义。 第三，什么又能体现人的本质是社会关系的总和呢？ 小刺猬认为，社会，实质就是同一生物种类内部，为了生存与发展而形成的协调不同个体之间利益分配的组织。 蜜蜂、蚂蚁、鸟、海豚、狼、猿猴等等，从低等的节肢动物到高等的哺乳动物，许多种类的生物是社会化的。它们都有与同类的其他种群相区分的、在一定范围内的领袖与疆域，而且等级森严、分工明确、协作生存。例如蜜蜂和蚂蚁这些低等动物所建立的王国，其社会化及严密的组织分工所体现出来的智慧，在一定程度上也让人类自叹弗如。 前一段时间，在 CCTV-3 动物世界播出的家族的荣耀系列专集中，看到过这样一则故事：狮子是一种小规模群居社会型动物，通常一个狮子群落由一只雄狮、 2~3 只雌狮以及他们的幼狮组成。因争夺领地，一个群落的雄狮战死，两只丧失了丈夫的母狮，一只无奈地跟随了胜利者，另一只被迫流落他乡，到了另外一个群落寻求加入，经过了好几天的考验而被收留下来。 反观人类社会的历史，各个不同的群体分分合合，群体中个体数量从少到多，群体规模从小到大，伴随着种群、民族、种族的融合，社会分工、社会阶层等诸多社会关系的形成与发展演化，是人类社会历史的总体发展趋势。这在表象上，很难以与生物界严格地加以区分。因此，要从社会性方面，将人与动物截然分开，可能还需要更深入的探讨、需要从更高层次上来提取合适的判别依据。

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