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进入管理研究的很好思维起点：社会“物”理学: 热度 13 陈安博士 2012-12-20 00:34; 　　各行各业的人都有转到管理这行当来的。　　应该都成普遍现象了。我赞赏这种现象，事实上，在我们研究团队招收博士后的时候，我们还特意写了“博士专业背景不限”，如果你是学中文的、学哲学的、学历史的、学训诂的，我们都会考虑，当然，如果你是学数理化天地生的，那也当然没有任何问题。　　我个人的看法，反而是这些博士背景出身的人，比其纯粹学管理科学的还要更入我老人家的法眼。因为他们懂的东西有我不懂的，而我懂的东西他们可以在最短的时间内掌握。　　而他们（尤其是数理化天地生背景）所以能够教我我不会的，是基于管理科学完全可以采用社会物理学的知识来描述、刻划、建模这一思维起点。　　你说你不懂社会物理学，好，我可以先简单告诉你，这里的物理不是physics，而是“万物之理”的物理，所以只要你是理工类出身，就已经具备了“物理”背景，只是这个背景可能是“化学”而已，也就是说这里的“物的理”指的主要是物之间相互反应以生成新的物质的内在规律。　　此时，我想你应该非常自信自己的背景和“社会物理学”只有一步之遥了。只是在你研究的“物的理”上面加了社会两个字作为修饰词罢了。　　因为管理的数学模型被认为是最高层次的模型，而物理模型则次之（尽管很多物理模型就是数学模型），大家大概还没想到过管理的化学模型一说吧，其实，这个说法也是“社会物理学用于管理建模”的一个部分而已，但是我们不会说“化学模型”，显得特没学问似的。　　化学模型里有很多有趣的东西，其实比物理、数学模型更能描述管理现象，比如，化合、分解反应，比如化学里常用的“催化剂”，参加或不参加反应都可以，现实的管理现象中完全可以找得到对应的地方。　　举一个例子，有一个著名广场，有时候会有人聚集，显得不好看，此时，会有唱白脸和唱黑脸的同时出现，唱黑脸的去组织临时聚集的人群，而在号召大家按照要求撤离转移的时候，不见得聚集人群会有响应，此时，就可以有唱白脸的人先跟着响应，因为其身份的隐蔽性，会带动大家转化思维，也许就顺利地从聚集地离开了。此时此人的身份和参与反应的催化剂又有何区别呢？　　当然，你可以说上面那个例子就是做“五毛党”，但是那也属于社会管理的一部分。事实上，这样的催化剂与“帮凶”身份是可以完全区分开来的，比如，在自然灾害的受难人群中间也需要这样的“催化剂”，以改变弥漫在人群中的低落气氛，并激发大家自救和救援他们的积极性。　　我一直想建立一套完整的化学模型来描述（应急）管理中的现象和本质，而从这套模型中，我相信和数学模型和物理模型一样，能够给管理者以启示，并基于此设计更好的应对机制。　　第一个博士后我们招收的是生物化工背景，而以后招收博士后也不会在专业上有什么要求。事实上，博士后经过短期的专业转换过程，我想现在完全可以写出很好的体现社会物理和社会管理之间的交叉与融合，而这一点，其实是尚未有人尝试的。　　当然，所谓“化学模型”看上去确实不如物理数学模型漂亮，在学科逻辑体系上，化学本来也确在数学和物理之下，但是我们现在很多管理问题用了数学或物理模型，但是并没有找到内在本质的规律，而也许化学能给我们一些启示。而且，现在很多生物学上的概念和模型正在管理学中试用，比如生态位的概念等。　　在2013年到来之后，我们将完成一篇这样一篇古怪的“社会物理学模型在应急管理中的应用研究”论文，试试水，看看效果如何。　　而这些，一定要依赖对于化学的本质有深刻理解的学者的参与。; 个人分类: 专论—管理学论稿|5068 次阅读|25 个评论

12.12.03 科研必备工具的介绍——软件篇（一）文件搜索思维导图: 热度 7 lijianchunbull 2012-12-7 19:48; 工欲善其事，必先利其器。从事科研亦是如此，从大的方面上讲，我们需要一个良好的心态，健康的身体以及强大的自控能力，从细节的方面来讲我们也需要一些必要的辅助工具，我打算介绍一些必要且用好的工具给大家，希望大家可以充分的消化与享用。初步想法是文章分为三个系列，第一部分写如何使用好的软件来操作电脑、第二部分写如何读书、记笔记、作计划，充分的利用每一天；第三部分写如何上论坛写 Blog ，通过思想的交流来完成自己的一次超越。现在的研究报告或学习大多是直接在电脑上完成的，能够熟练的掌握工具会给我们的学习带来事倍功半的效果，因此如何正确使用软件就成了一个值得研讨的学问，本文就此展开，作为工具篇的第一部分。科研的软件我把它分为以下几类： ## 基本工具类 ## 顾名思义，就是一些最为基础，必须要熟练掌握的工具，或是必不可少的工具，主要有以下五个，分别是 word 、 excel 、 photoshop 、 freemind 和 everything ，这些软件中前三个想必大家用得都比较多了，因为它们太精典、太常用，以致于大家都没不再关注其核心方法与技术了，对于这些软件的使用我得开专题分别介绍，写完后在本文后加上链接。接下来讲的两个可能非专业人士不太常用，但是一旦使用就会带来生产力的巨大提升。 Everything 使文件搜索变成光速不爱整理文件的人因此有福了：有了 everything 使你找文件进入了一个新时代。怎么说呢？只要你能记住一点文件的名称，配合正则（表达式）的使用，那么你就可以利用 everything 进行快速定位，就像百度一样快，以致于有了她你都不愿意进入一些文件夹一个个的点开。推荐指数☆☆☆☆☆，易用指数☆☆☆☆☆。引用 nike 的广告词来表达吧， just do it! 先看看我的一个 demo 。例 1. 我记得自己的电脑里有一个基本农田整治的规程，但是想不起来放在什么地方了，怎么办？方法一：努力回想，一个个文件夹的找？…………哦终于找到了，大约 10 分钟吧，你会感叹自己的东西下次得好好放了，然后就想不起来刚才做的事情到哪里了。方法二：找不到位置用搜索啊，于是你用了 windows 自带的搜索…………怎么这么慢呢？我先看下新闻八卦放松一下？ n 分钟后，找到了，唉！也到吃饭点了，先放桌面上明天接着做吧（我们能再吊丝些么？）。方法三：打开 Everything! 输入“规程 doc ” 0.001 秒后你就看到了如下的答案。图1 Everything 的使用例子对于 Everything 的学习应该不用什么教程，直接下载后打开即可，用得多了，你自然明白一些简单的正则（表达式）的用法，而现在你需要做的只是开始使用她！软件是完全免费的，有中文语言扩展包的支持（不过实在必要）下载地址： http://www.voidtools.com/download.php ，需要注意的是你应该保证硬盘为 ntfs 的文件格式。当然，这个工具也使我们对于文件命名提出了新的要求，文件名需要加入一些线索，这会加速我们的寻找。当然，如果你还是意犹未尽，可以看一下，善用佳软对于 everything 的介绍，讲得不错，适合后期的进一步进阶 http://xbeta.info/everything-search-tool.htm 。 Freemind 自由与免费的思维导图提起这个，我得说下时下流行的思维导图，它是由东尼·巴赞（ Tony Buzan ）创立。早年间，我曾看过他写的一本介绍思维导图的书（好像是这本，当时太懒，没有及时写下读书笔记也没有留下书评 http://book.douban.com/subject/2233373/ ），其核心思想是充分利用大脑的结构来实现对于知识的理解和积累，当然他研习了达芬奇等伟人保留下来的笔记，发现牛人都尽可能利用自己的右脑的识别功能，把一些东西图形化、简单化，进而使自己能够专注于最本质的东西。对于导图的作用，是否如其所说那么有效，或是被夸大了，具体我也没有实验过。但是导图真的是在 IT 领域火起来了，甚至在 IT 公司内部的一些培训中都会讲他的使用，我想一个已经被大众化了的东西，必然会失去其原始的价值核心。简单来说，导图不适合用电脑做，而要用手画，就像了不起的画家不用 ps 做图一样，一些原始的东西是需要载体的。（这一部分我将来会展开来写一下，发到网易关于研究学习方法的 blog 上，先把链接留空）言归正传，思维导图至少有两个软件比较有名，一个是 freemind ，另一个是 mindmanger 。前者是完全免费的，后者价格不菲，而我们真正用到的是导图的树形提纲功能， mindmannger 就显得有些大材小用了，同时也会涉及到版权问题。现在我写东西都是左边开一个 freemind 写提纲，右边开一个 gvim 码字。（写论文用 freemind+word 2003+noteexpress ）。不少朋友可能要问这样一个问题“ freemind 能带来什么好处？其易用性又如何呢？”好处 1 ：提升了目录的维度，节约了电脑有限的屏幕。传统的目录结构是一维的，而树形结构使得一维变成了二维，在有限的空间中放下了更多的东西。好处 2 ：结构决定功能，位置决定意义。处于最中心的就是思考的核心，而周边的都是由核心引起的，从近到远反映出了问题的衍生性，从上到下反映出事情的顺序，左边可以表示显性因素，右边表示隐性相关因素。结构化的表达因此变得清晰有效。好处 3 ：结构调整也非常容易，如增加一个结点， ins ，提升一个级别， ctrl-left ，不一而足。听完后，晕了吧。：）没事，结合着我写 Blog 的思维导图，你会有所体会的，当然这更加需要一些悟性。图2 博客思路的提纲易用指数☆☆☆推荐指数☆☆☆☆☆。 freemind 使用其实并不难用，作为软件开发者而言也希望大众能够很快的学习并接受，因此不会让学习成本太高。使用时，涉及到的只是一个习惯问题，就算我们知道她有如此多的好处，但是如果不能习惯也是没有价值，因此你需要放手一试，以及改变习惯的勇气。 Freemind下载地址是为，http://freemind.sourceforge.net/wiki/index.php/Main_Page，先睹为快。下图是杰克逊自画的思维导图价值 30 万美金，这个能鼓励你尝试一下么？：）图3 迈克尔杰克逊的思维导图（转自百度知道）; 个人分类: 工具|10121 次阅读|11 个评论

[转载]最强劲的PDF工具Adobe Acrobat XI Pro 11 最新带破解: grapeson 2012-12-3 14:57; 最强劲的PDF工具Adobe Acrobat XI Pro 11终于与大家见面了！它已经不仅只是出色的PDF编辑、转换软件。此次更新深度整合了Microsoft Office套件，实现了PDF与Word、Excel以及PowerPoint等文档间的无缝相互转换，并整合了云服务，你可以将PDF文档存储在微软SharePoint服务器和Office 365之上，也可以存储在 Adobe自家的Acrobat.com云端服务器中。而且Adobe Acrobat XI Pro将完美支持IOS、Andriod和Wondows 8平台激活说明： 1、安装要求输入序更号时选择“使用试用版本或订阅”； 2、安装完成后使用附件提供的补丁替换软件安装目录同名文件。 QQ截图20121015215240.jpg 附件一：AcrobatXIPro安装档下载地址。附件二：破解AcrobatXIPro用的替换文件：附件三：版主jianganhe提供的破解文件，也可下。特向版主jianganhe致谢，感谢其及时补充资料。附件 1 : 下载地址.txt (2012-10-15 22:34:03,86 bytes, 已有 1738 次下载 ) 附件 2 : amtlib.dll (2012-10-21 08:25:36,928.43 K, 已有 1384 次下载 ) 附件 3 : AcrobatXIPro_Crk.7z (2012-10-15 23:54:37,289.54 K, 已有 1950 次下载 ); 0 个评论

[转载]研究发现黑猩猩能看录像学习制造工具: genesquared 2012-11-16 15:52; 研究发现黑猩猩能看录像学习制造工具据英国媒体报道，研究人员发现，黑猩猩通过观看录像演示，可以学会制造工具。在实验中，研究人员给黑猩猩们演示一段录像，在录像中，一只训练有素的猩猩把两部分工具组成一个工具，用这个工具够取食品。看过录像后，研究人员递给这些黑猩猩相同的两部分工具，黑猩猩学会把两部分组成工具，并使用工具够取美食。该研究发表在英国《皇家学会学报B》（ Proceedings of the Royal Society B ）上，科学家称，该研究验证了社会学习对灵长类的有效作用。负责这项研究的苏格兰圣安德鲁斯大学的伊丽莎白·普利斯解释说：“通过录像，我们能准确控制动物看到的信息量，这样我们能准确理解它们需要学习的如何执行任务的信息量。” 在实验中，普利斯博士和她的同事把黑猩猩分成5组。一组被演示全部录像，在录像中，研究人员递给一只黑猩猩一根杆和一个管，是可对接在一起的两部分，然后演示者使用较长的组合工具从笼子外的平台够取得到一串葡萄。其他组被演示越来越少的信息，其中一组的黑猩猩只看到录像中黑猩猩吃葡萄的一幕。接下来，研究人员为这些受试者重新创造了这一情境。他们在每只黑猩猩笼子外的一个平台上放一串葡萄，然后递给这些动物一根杆和一个塑料管。普利斯说：“那些看完全部录像的黑猩猩学习制造够取食品的必要工具的情况较好。它们能学会如何为特定任务制造工具，这让我们感到非常兴奋。这种习性在野外非常罕见，这是人类工具使用的必要部分。” 普利斯说：“少数没有看完全部录像的黑猩猩学会了自己制造工具。对于这一组，更有趣的是，当我们把葡萄放在距离它们的不同位置，它们也能制造合适的工具够到葡萄。”并非简单模仿，这些动物还会依据距离葡萄的远近，在使用管或者杆和使用组合工具之间切换。普利斯博士说：“那些看过全部录像并学会制造长工具的猩猩即使在葡萄离它们很近很难使用工具的情况下仍继续制造工具。”可能，社会学习对黑猩猩来说是一种很强的力量以致它们应用“遵循你看到的”的规则，而不是最适合解决任务的规则。现在，研究组正计划对幼儿进行同样的测试以检测他们依赖社会学习的状况。研究仍不清楚为什么这类工具建造在野外较为不常见的原因。普利斯博士说：“我们发现，它们非常聪明，所以这一定有什么原因，可能是黑猩猩的年龄到达能执行那些更高水平技能的时候或许它们太老了无法通过演示学习。” 更多阅读苏格兰圣安德鲁斯大学相关报道（英文）; 个人分类: chimp|1522 次阅读|0 个评论

马来西亚的科研评价工具: 热度 3 Wuyishan 2012-11-12 06:49; 马来西亚的科研评价工具武夷山（这是我 2010 年 3 月 22 日在办公室通过 Skype “参加”澳门的一个研讨会所记录下的内容。发言者是马来西亚的一位姓 Mustafa 的先生。记录不完整，也不能保证完全准确，仅供参考。）马来西亚有一个 Research Assessment Instrument （简称 MyRA ，科研评价工具），其实是一套大学评价指标体系。 2007 年，马来西亚颁布了“ 2007 － 2020 高等教育战略规划”，包括 7 个推进计划（ thrust ），其中第五个推进计划是“加强科研与创新”，并提出一个目标：拿到诺贝尔奖。 MyRA 的目的是让大学自测。该体系共有 91 个指标。每个国立大学每年都得填报这些指标。私立大学若想申请国家科研项目，也得填报。政府每三年搞一次大学评价。评价得分大于 95 分的大学，为五星级， 2010 年时有 4 所； 70 － 94 分，为四星级，有 1 所；三星级的大学有 3 所； 2 星级的有 7 所。政府的目标是，到 2011 年，所有大学都至少成为 2 星级。评分大于 75 分者，才有资格申请“研究型大学”称号。评估组对大学进行现场考察后，认为评估对象达到了要求，可授予“研究型大学”称号。在 MyRA 中，科研质量的权重为 30 ％，人才队伍质量的权重为 25 ％。下面介绍 MyRA 的一些指标。 ――学术人员总数，包括：外国学术人员数； ――科研人员总数； ――学生总量，包括：外国留学生数量，外国研究生数量； ――研究中心或研究所的数量。 “科研人员”的下一级指标有： ――课题负责人（ PI ）数； ――拥有博士学位者人数； ――拥有专业资格者人数； ――科研经历：分为，大于 20 年、 10 至 20 年、 10 年以下。 ――发表情况：被 SCOPUS 或 SCI 收录论文数；发表论文期刊的累计影响因子数；非 SCI 刊物论文数；撰写的图书（必须是有 ISBN 号的）章节数，等等。 ――项目经费：政府项目、来自私人机构的项目、国际项目；每一项目的收支状况； ――博士后人数； ――获得博士学位顺利毕业者人数； ――教职员工队伍中拥有博士学位者比例； ――科研人员队伍中拥有博士学位者比例； ――研究生中 CGPA （平均累计积分）获得 3 分以上者所占比例； ――研究生中获得奖学金者所占比例。 ――新增专利数； ――在案审查专利数； ――研究成果转化为新产品的数量； ――技术诀窍获得转化的数量； ――各种创收，包括培训收入、研究生学费、技术转让收入，等等； ――与国外机构签订的合作协议或谅解备忘录数量； ――教职员工中获得国际学会 fellowship 的人数； ――获得认证的实验室数； ――图书收藏总量； ――可线上阅读的图书总量。; 个人分类: 科学计量学研究|6167 次阅读|6 个评论

M$Windows的用处: blownsand 2012-11-8 10:44; 除了打游戏和写Word文本，还可以上网。另外，有一个做幻灯片的专用工具。有些答辩或汇报通知明确规定提交PPT文件。此时不得不用微软公司的M$Windows系统和相关软件。; 2545 次阅读|0 个评论

安全就那么点事---安全审核/评估工具及其元素: 热度 4 Greg66 2012-10-30 18:35; 据我所知，目前有不少人/机构在研究组织的安全绩效评估、安全文化评估、管理体系评估（评估或者叫做审核）等，我国正在推行“标准化”评估，已经推行多年安全评价等。其实都是一回事情，都是评估组织的安全管理这个组织行为。评估时，都要设定一系列的元素，分组或者不分组，然后由专门审核员评估这些元素的分数，最后再来一个总分数作为该组织的安全管理水平。其实可以把各个元素或者元素分组的最低分数作为总分数，因为那个最低分数的元素或者元素分组就有可能导致事故的发生（也是短板原理）。所以我不赞成使用各种办法搞出一个权重，再计算加权总分的做法。如果把权重得出的数学计算过程作为研究的创新那就更加错误了和无用了，那只是纯粹的数学研究，而不是在做安全研究，现在这类文章可不少。那一系列的元素，国际上使用的，基本不涉及生产过程的物理状况，都是关于管理（理念）、行为方式、体系组成、执行过程的等，国内的一些企业和管理人员实际上不太接受。事实上，不接受的原因是因为对安全原理的不理解。只有这些不涉及物理过程的指标体系才是个各行业、各类组织、组织内各个部分、组织内各个不同生产过程所通用的。这些指标体系（元素）无非就是：管理者的承诺、visible leadership（忘了怎么翻译）、一切事故都可预防、员工参与、要有目标、安全与效益的关系、安全是每个人的责任等等，获得证据的方法大体有文件、访谈、现场观察等。尽管各国、各家的评估体系所用的元素及其组合、运转方式不一样，但是元素也就是这么多个，从10个到几十个不等。如杜邦用10个理念，安全文化测量系统用32个，GE用21个，澳大利亚的IFAP用的是38个、DNV用多少个不记得了。所以评估/审核指标（元素）体系大同小异。这些元素和OHSAS18000也大体是相容的或者就是来自于OHSAS18000及其相关标准的。关于评估/审核结果的使用，各国不尽相同，有的要求评估结果、评估人/法人对今后的安全性负责，有的不要求。对于前者，谁还敢审核/评估呀？评估过程务必要坦率、客观，否则审核结果是没用的，被评估者要支持坦率、客观的审核、评估，否则对自己没好处，白花钱。被评估者一定要明白，这是为了改善自己的安全的，是为自己少发生事故，帮助自己找改进机会的，所以又为什么不支持“坦率”和“客观”呢？但是有时这种坦率和客观还就是做不到。由于体系（OHSAS18000及ISO9000等）来自于西方，中国企业使用时，必须解决文化冲突和知识冲突（加强对每条元素作用原理的理解）问题，否则达不到良好的应用效果。; 个人分类: 4|5753 次阅读|10 个评论

微软的开发工具: baibing 2012-10-23 15:43; 1. C/C++历史介绍 C和C++名称由来 http://zhidao.baidu.com/question/25048805 2. Visual C++ 1.0：C++编译器的终结者 http://www.yesky.com/382/1858882.shtml 3. Microsoft Visual C++ http://baike.baidu.com/view/100377.htm 4.Visual Studio 提供的额外工具（1） WinDbg 很好的 http://www.cnblogs.com/happyhippy/archive/2007/04/08/710933.html （2）spy++ http://baike.baidu.com/view/2258859.htm （3）WinDiff WinDiff是进行Windows的文件比较工具软件。　使用这个工具可对2个文件或2个文件夹中的文件进行ASCII码形式的比较,从而找出两者间的不同之处,并以显而易见方式标示出来。这一工具对于经常编一些程序、手写html文件、文本处理的用户来说是十分有用的。 (4)DataObject Viewer 能查看COM的属性（本身的） (5) Microsoft Visual Modeler 用途很大（建模工具） (6)DDE Spy 可以监视数据交换 (7)Depends 查看动态库中的函数 (8) DDE Spy 可以监视数据交换 (9) Depends 查看动态库中的函数补充：（10） API Text Viewer 查看WIN32 API常量、声明和类型的工具 (11) DocFile Viewer 显示OLE2文件的内容（12）Error Lookup 查看API错误码（13）Help Workshop 这是一个可以用来创建.hlp帮助文件，编辑工程和内容文件，并且测试和发布帮助文件的工具... （13）OLE Client Test （14）ole客户端测试工具 OLE Server Test ole服务器端测试工具 OLE Tools OLE工具的帮助文件，包括DFView - DocFile Viewer，DObjView - IDataObject Viewer，IROTView - Running Object Table Viewer，OLE2View - OLE 2.0 Object Viewer的说明 OLE View 查看本机的所有已注册的COM控件 Package Deployment Wizard 帮助你创建VB应用程序的最终用户安装程序 Process Viewer 可查看本机或远程的win95,win98系统中的进程、内存使用状况 ROT Viewer OLE运行对象表查看器，可实时显示所有注册的OLE运行对象表的名称 Tracer TRACER.EXE是一个允许你设置afx.ini文件的小型MFC编程工具例子程序，它被安装在你的VC目录中，并提供了源代码，因此，捏可以rebuild它，也可以按你的需求自定义它的功能。 Windiff 用来比较路径或文件的不同，并将比较结果以图形方式显示出来 Windows NT Symbols Setup unknown Zoomin 放大显示WINDOWS桌面的区域; 个人分类: 编程|2 次阅读|0 个评论

[转载]关于ANSYS颜色设置: arcechen 2012-10-22 22:20; ANSYS颜色修改总结： 1、修改背景颜色好的方法：a、先plotstrlsstylebackground 取消 display picture background 选项或在shaded Background中选择Dark Gray，之后hard copy to file，注意选上reverse video 选项；b、先plotstrlsstylebackground 取消 display picture background 选项或在shaded Background中选择Dark Gray，之后redirect plotto file，注意选上选force white bg and black fg 选项；c、利用FileReport Generator；d、Utility menuplotctrlsstylecolorsreverse vedio，之后利用截图工具截图； 2、修改实体颜色，包括线、面、单元和体的颜色：Utility MenuplotCtrlsStyleColorspicked Entity Clors；恢复实体颜色：Utility MenuplotCtrlsStyleColorsReset Colors /COLOR, Lab, Clab, N1, N2, NINC 3、修改窗口中曲线、坐标轴或文字的颜色。曲线、坐标轴等的颜色可以通过PlotCtrlsStyleColorsGraph Color修改。文字大小可以通过PlotCtrlsFont Controls里面的内容修改。 4、云图打印前修改云图显示颜色黑色深浅：Plotctrls/style/colors/create color map，将彩色模块改为黑白模块，并设置不同的R\G\B，之后点WRITE按钮，即可出现黑白显示了，注意的是之前要在PlotctrlsDevice Option中选择Shading WIN32，不能选Countours WIN32C。另外最好利用Plotctrls/style/colors/Save color map，将设置的黑白模块保存一下，文件名中不能含有汉字；恢复原彩色模块：Plotctrls/style/colors/Default color map；; 7666 次阅读|0 个评论

爱国与工具: 热度 1 smallland 2012-10-21 22:15; 几十年前，有人发现黑猩猩也会制作和使用工具，譬如树叶海棉或钓鱼（白蚁）等等，这个发现震惊了学术界，因为人们总是觉得只有人才会使用工具，并将使用方法一代一代传承。对于人类，工具的范畴无限延伸，任何东西都可能成为工具，比如生命、国家、领土等等。前段时间，地图上看不见的几个小岛就成了多个国家、无数政客和人民的工具，并且，有人利用这个工具搞打砸抢。也有人，因此借用了另外的工具，譬如，将一个小小的国旗盖在自家汽车的“H”上--此时，小旗大概变成了fig leaf，据说能遮掩一点什么。关于爱国，去世不久的嘻哈奴客似乎也为人做了一个榜样。作为国王，或king-father，古老皇族的传承者，自然没有理由不爱国。当年，红色高棉掌权，他作为名义上的国家元首，虽然没参与什么恶行，但也让红色高棉充分利用了他的影响力，此时，他就是红色高棉的rig leaf。布尔波特及红色高棉做过什么事，许多人没听说过，我也不在这里造谣了，反正，听说，毛的引蛇出洞，或“自然灾害”，或文革，对红色高棉来说都是小白菜，不值一提。这个政权在短短几年内让国家损失了大量人口，几乎毁灭了整个国家，后来被越南消灭。这时，被越南解救出来的嘻哈奴客重返国际舞台，却为布尔波特辩解，说柬埔寨真正的敌人是越南。为什么呢？在他的心里，布尔波特虽然消灭了大量的人民，但依然让他做国家元首--尽管后来被软禁，而越南侵略军不愿让他继续当国王。爱国主义是一种原始的情结，却常常进化成无形的工具。我们的媒体就宣称，钓鱼岛是日本政客手中的工具。我同意 ......; 3992 次阅读|2 个评论

[转载]知识可视化工具与视觉素养: zhengxuejun 2012-10-11 16:11; 摘自：南京师范大学郭丹学位论文知识可视化的理论基础为双重编码理论，该理论于1986年由Paivi提出，试图把语言和非语言放在同等重要的位置上，它的一个重要原则是:同时以视觉形式和语言形式呈现信息能够增强记忆和识别。知识可视化将知识以图解的方式表示出来，为基于语言的理解提供了很好的辅助和补充，大大降低了语言通道的认知负荷，加速了思维的发生。常用的知识可视化工具有概念图、思维导图、认知地图、语义网络、思维地图。知识可视化工具培养学生的学习能力，最终促进学生视觉素养的有效提高。 1、促进知识的整合:作为一种学习工具，知识可视化工具是以视觉化、结构化的形式表征知识，帮助学习者把握某个知识领域的全貌，理解己有概念之间的联系;帮助学习者将新知识与己有的知识联系起来，将知识融会贯通，发展对知识体系的理解;从而有助于学习者收集新知识和新信息并与他人共享。此外，知识可视化工具常以逻辑的方式去组织信息，帮助学习者消化吸收新信息、新观念，帮助学生形成完整的知识结构，引导学生抓住知识的内在联系与要领，纵揽全局，对所学的知识进行整合，从而形成良好的认知结构。 2、改变学生的认知方式:认知方式是个体对外部世界稳定的知觉形式和概念归类模式，是人们对所输入的各种信息的一种处理策略。它赋予了个体在感知、记忆、思维和问题解决的常见方式。据研究，学习者在学习过程中选择的认知方式有:记忆、规则、质疑和应用。一般认为，规则这种认知方式是进行有意义学习的较佳方式。利用知识可视化工具能较形象地展示和说明概念的含义及概念间的意义连接，有利于学生采用规则为主要认知方式，培养学生在学习新概念时，习惯采用分析概念之间的关系，并加以理解与记忆。 3、促进对话与合作:利用知识可视化工具能有效地促进学生进行合作学习并提供合作学习平台，促进学生进行对话与合作，加速学生对知识的意义建构，共同建构知识。例如，在概念图的应用中，通过引导学生对自己制作的概念图与他人的比较、讨论，小结修改、完善自己的概念图。从概念图的合作建构过程可以发现，概念图是学生对话的结果，同时，概念图的建立也会反过来作用对话的平台，促进知识的重新组织。 4、促进学生高级思维发展与问题解决:学生在利用知识可视化工具学习时，必须搞清楚概念之间的关系及其相关程度，这实际上是要求学生在概念水平上思考问题，属于高级思维，因此利用知识可视化工具有助于这一思维的发展。它可以帮助学生整理资料、整合知识、形成概念，寻找解决办法并提出解决方案。《知识可视化的视觉表征研究》南京师范大学博士论文赵慧臣（指导教师：张舒予）数据可视化、信息可视化与知识可视化（ http://blog.sina.com.cn/s/blog_4b700c4c0102dr38.html ）本体知识可视化、信息可视化与知识检索、一种可视化的知识组织系统Credo全球工具书大全基于CiteSpaceII的专利知识可视化的实现机制及其应用可视化知识前沿：科学知识图谱学科交叉知识发现及可视化知识普及：信息可视化可视化与情报学; 3332 次阅读|0 个评论

任何网络或媒体“红人“都是某种利益群体的工具或打手: duke01361 2012-10-4 18:48; 任何网络或媒体“红人“都是某种利益群体的工具或打手这一点大家心里都有数！其实，一些纯文学网站或纯粹类似街头打把势卖艺的民间网站上的“红人”们除外。这些人属于江湖人士，过着闲云野鹤一样的生活，这样的人本质上属于跳出三届外，不在五行中的那么一类人。但是，请注意，被集团利益收买或操控的网站、媒体上的“红人”，这些人的背后代表的是一股势力！作为普普通通，具有强烈愿望过生活的人士，切忌相信这些人的任何话语。; 个人分类: My Ideas|2516 次阅读|0 个评论

[转载]鉴别DNA甲基化，总有一款工具适合你: bioseq 2012-9-27 17:45; 一谈到真核遗传，众所周知基因组仅仅是个起点，此外还有表观基因组，这种可遗传的DNA和组蛋白化学修饰控制着基因组的表达。 5-mC和5-hmc DNA甲基化就是这类化学修饰中的一员，甲基化一般发生在哺乳动物基因组CpG二核苷酸中的胞嘧啶残基（5-甲基胞嘧啶/5-mC），主要集中于CpG岛和基因调控元件，与基因沉默有关。其实人们早在几十年前就发现了DNA甲基化现象，5-甲基胞嘧啶还被称为DNA的“第五种碱基”，表观遗传学研究者们开发了大量的分子工具来追踪和分析它。然而在2009年，两组研究团队（洛克菲勒大学Nathaniel Heintz团队和哈佛医学院Anjana Rao团队）同时在Nature杂志上发表了重要文章，他们发现了另一种甲基化修饰形式——5-羟甲基胞嘧啶(5-hmC)，这无异于在生物学界投下一枚重磅炸弹。 “自2009年以来最大的变化可能就是，现在大家的研究主要集中在这些DNA甲基化变体上，”Active Motif公司产品经理Kyle Hondorp说，Active Motif公司是一家以“促进表观遗传学研究”为宗旨的美国知名公司。在上述两篇文章中，研究人员分别在小鼠Purkinje神经元和胚胎干细胞中发现了5-hmC，5-hmC与5-mC在细胞和基因组中的分布不同，5-hmC主要集中在基因片段中。TET蛋白家族的酶对5-mC进行修饰形成了5-hmC。然而，许多传统DNA甲基化研究方法都无法分辨这两种类型的修饰，默克密理博的表观遗传学产品经理Michael Sturges说，这意味着人们需要重新审视过去几十年的一些甲基化分析。 “这说明在过去15至20年间，人们收集到的数据在一定程度上包括了羟甲基胞嘧啶事件，”Sturges的同事，默克密理博的表观遗传学研发经理John Rosenfeld说。 5-fC和5-caC 不过，遗传学字母表中可不止这六个成员，除了A、C、G、T、5-mC和5-hmC，至少还存在两种甲基化修饰类型。DNA甲基转移酶负责对真核生物的胞嘧啶残基进行甲基化。Tet1能够将5-mC转化为5-hmC，但这种酶并未就此罢手，它能够进一步将5-hmC氧化成为5-甲酰胞嘧啶(5-fC)，甚至再转化成为5-羧基胞嘧啶 (5-caC)，这一酶促通路似乎参与了去除DNA 5-mC标志的过程，Rosenfeld说。（该通路的更多信息，请参阅Active Motif的DNA甲基化指引手册。）研究以上各种甲基化类型的方法之一就是亲和捕获。标准5-甲基胞嘧啶的传统研究方法是甲基化DNA免疫沉淀MeDIP和MIRA（methylated CpG island recovery assay），这两种方法分别利用抗5-mC的抗体和甲基化DNA结合蛋白 (MBD)来捕获被修饰的DNA片段。而现在，研究人员也同样能够使用特异性抗体对5-hmC进行研究。目前包括默克密理博在内的许多公司都提供抗5-hmC的抗体，Active Motif当然也不例外。Active Motif将这种抗体打包在hMeDIP（羟甲基化DNA免疫沉淀）试剂盒中，用来捕获包含甲基化修饰的DNA序列。除此以外，研究者们还可以使用该公司新品Hydroxymethyl Collector™试剂盒来富集含5-hmC的DNA片段。（Active Motif也为那些对5-fC或者5-caC的研究者们提供了相应抗体。） “Hydroxymethyl Collector是我们去年发布的最引人注目的技术，”Hondorp说。 Active Motif公司的MethylCollector Ultra™ 试剂盒是利用MBD2b和MBD3L1来纯化甲基化的DNA。而Hydroxymethyl Collector试剂盒则不同，它利用了一种酶——beta-葡萄糖基转移酶（Millipore也有相应产品提供），这种酶能够特异性的使5-hmC糖基化。这种被转移的葡萄糖基是经历过叠氮化合物修饰的，它能与生物素相连，使得Hydroxymethyl Collector试剂盒中的链霉亲和素磁珠能够捕获含5-hmC的DNA片段。使用hMeDIP和Hydroxymethyl Collector试剂盒得到的都是是DNA片段的混合物，其中每条片段中都至少含有一个5-hmC修饰。研究人员可以对这一混合物进行测序来得到整个基因组的羟甲基化信息，或者也可以通过PCR进行逐个位点的分析。当然这种混合产物还可以用于芯片分析。专门针对甲基化研究的芯片包括：美国安捷伦科技公司的DNA Methylation Human CpG Island芯片和Illumina公司的Infinium HumanMethylation450 BeadChip等。罗氏NimbleGen也有一款包括10个芯片的Human DNA Methylation 2.1M Whole-Genome Tiling芯片组合，不过据罗氏应用科学公司的市场部经理Clotilde Teiling称，由于NimbleGen准备将重心从芯片领域转到序列捕获产品，该芯片产品将于今年年底停产。 New England Biolab公司的EpiMark 5-hmC and 5-mC analysis 试剂盒也是同样利用beta-葡萄糖基转移酶对5-hmC进行糖基化。不过，这一试剂盒是根据糖基化后5-hmC和5-mC对限制性内切酶的敏感性不同来进行区分，未糖基化的甲基化位点含有对MspI(5'-C / CGG-3')敏感的序列，而糖基化的序列则对MspI酶不敏感。此外还有一种特异性识别5-hmC的酶，限制性内切酶PvuRts1I，这种酶Active Motif也有提供。PvuRts1I与含5-hmC的DNA结合，在相应核苷酸位点（9和13）对双链进行切割，得到含5-hmC的24bp片段。用这种酶处理基因组DNA就会得到上述片段的混合物，对这种片段混合物进行测序的效果与MeDIP测序相同，都能够揭示基因组范围的5-hmC位点。重亚硫酸盐测序为了达到准确的bp级分辨率，研究人员还需要采取特殊策略。重亚硫酸盐测序是公认的甲基化DNA测序“金标准”。用亚硫酸氢钠处理DNA能够将未修饰的胞嘧啶转化为尿嘧啶，在DNA测序反应中最后显示为胸腺嘧啶。将该数据与未处理的DNA测序数据相比对就能够确定甲基化的位点。然而，与其他一些甲基化分析方法一样，重亚硫酸盐也无法区分5-mC和5-hmC。不过今年早些时候，研究者们提出了解决这一难题的两种方法。其一是Tet辅助的重亚硫酸盐测序TAB-Seq，这种方法利用TET蛋白的活性将5-mC氧化为5-caC。在用亚硫酸氢钠处理时，5-caC就像未修饰的胞嘧啶一样被转化为尿嘧啶。该方法先用beta-葡萄糖基转移酶将5-hmC糖基化保护起来。随后用TET处理DNA，使其他甲基化胞嘧啶转变为5-caC。最后再用重亚硫酸盐处理DNA。在测序过程中，所有胞嘧啶和5-甲基胞嘧啶都被读为T，而5-hmC仍然为C。将这一数据与标准重亚硫酸盐测序生成的数据相比，就能使研究人员确定哪个碱基包含何种修饰。位于芝加哥的WiseGene公司已经成功将这一技术商业化。另一种方法是氧化重亚硫酸盐测序（oxBS-Seq），用高钌酸钾将5-hmC氧化为5-fC。在用重亚硫酸盐处理后，5-fC（就像胞嘧啶）测序读取为T。同理，将标准重亚硫酸盐处理的DNA序列与oxBS-Seq DNA序列相比对就能够区分5-mC与5-hmC。当然，供应商们并没有忽略5-甲基胞嘧啶。用Sturges的话说，重亚硫酸盐转化是“出了名的繁琐”，需要研究人员把握好试剂、时间和温度的平衡，才能将胞嘧啶完全转化而又不影响到甲基化胞嘧啶。为此，默克密理博发布了增强版的重亚硫酸盐转化试剂盒，CpGenome Turbo Bisulfite Kit。据Sturges介绍Turbo kit物如其名，该试剂盒采用新化学物质和优化的反应温度，将重亚硫酸盐16小时的标准转化流程缩短到了90分钟。在内部测试中，这一试剂盒的转化效率达到了99.9%，并且丝毫没有发生过度转化。定向选择甲基化DNA 默克密理博公司还发布了可与Turbo kit配套使用的甲基化DNA富集试剂盒CpG MethylQuest。这种试剂盒用MBD2特异性捕获含5-甲基胞嘧啶的DNA，并且能够控制所收集的产物中不含未修饰的碱基或者5-hmC。安捷伦科技公司也为甲基化DNA的二代测序提供了一款目标富集产品，SureSelect XT Human Methyl-Seq kit试剂盒。该公司基因组学业务部市场副总监Yong Yi介绍，与用于目标外显子测序的SureSelect exome kit类似，该试剂盒能够有效减少目标区域的测序成本和测序时间。 “人类全基因组测序成本高耗时长，令不少研究者望而却步，相比之下外显子测序的效率就高多了，”Yi说。“我们将这一理念应用于Methyl-Seq试剂盒，使Methyl-Seq实验更有针对性。” 该试剂盒包含120-mer RNA饵，用于捕获人类基因组CpG岛、以及“shores”“ shelves”区域中的甲基化片段。（Shores和shelves分别是指距CpG岛边缘2kb和4kb的区域，在这些区域中发现了许多差异性甲基化的序列，Yi说。）该试剂盒总共能够捕获3.7百万CpG超过84Mb序列。而安捷伦的methylation-focused DNA芯片是覆盖整个基因组的27,800 CpG岛。 “这是相当复杂而全面的设计，”Yi说。罗氏NimbleGen不提供现成的DNA甲基化目标富集产品，但用户可以量体裁衣自行设计，公司能够为客户将2.1百万的探针混合在单个小管中，Teiling说。测序中国（ www.seq.cn ）当然，随着表观遗传学越来越重要，扩展到的领域越来越多，也许您会被这些五花八门的技术和方案弄得有些无所适从。不用担心，自有公司能为您提供贴心又省心的服务，这些公司的专业人员提供的技术服务，能为您免去了大量的优化工作，节省宝贵的时间和精力。举例来说，Active Motif公司最近收购了GenPathway，这意味着该公司现在能够提供诸如重亚硫酸盐测序、生物信息学分析、hMeDIP等技术服务。“现在我们能够为无法自己进行这类实验和数据分析的客户提供帮助。”Hondorp说。; 3396 次阅读|0 个评论

几个典型的生物信息处理工具: liujd 2012-9-17 22:38; 对行进行拆分：对fasta格式拆分：对blast比对信息提取：; 个人分类: 生物信息|1234 次阅读|0 个评论

P民最傻: 热度 1 StephenCatholic 2012-9-16 21:52; 今天你是爱国者明天你就是不明真相的群众被人卖了给人数钱平时遭受千百倍的屈辱，连P都不敢放为了一件不知所谓的事，显起自己的男儿之驱了科网几个粪老拿出点真实行动来只在电脑前动手指有啥本事在道德至高点上站的越高，显的越虚伪。; 1645 次阅读|1 个评论

郑风田：不能让计划生育沦为罚款工具: zft2000 2012-9-12 12:54; 郑风田：不能让计划生育沦为罚款工具计生部门靠罚款生存的惯性思维已越来越没有市场了，不如顺应时代，转向专门为老龄社会服务，获得新生，造福社会。新华社 9 月 10 日的消息称，宁波双独夫妻未经审批生二胎被强征 7 万抚养费，计生部门向法院申请对这名夫妇采取强制执行措施。法官表示，符合再生育条件的夫妻生第二胎也要经过批准。该报道引起众多媒体的关注。我国的计划生育是特殊历史阶段的产物，也曾在降低中国生育率上有所作为，但在新时代下面临着巨大的转变。计生部门如果不能够顺应时代，还沿袭惯性思维，靠片面追求罚款生存，最后的结局只能被时代所抛弃。记得几年前与一位在县计生部门工作的朋友聊天，据他讲现在他们计生部门其实特别希望农民们超生，这让我很惊讶。因为计生部门主要任务应该是管控生育问题，怎么能够盼望农民超生呢？问其原因，原来是目前大量农民工外出打工，尤其是女同志出外打工长了见识长了，再也不愿成为生育的机器，过去为了传宗接代拚命要生男孩的超生游击队早已不见了踪影。农村自愿生一个的比例大大提高，想生两个以上的越来越少。这种生育观念的大幅度转变，可苦了过去靠超生罚款生存的基层干部。曾经计划生育的超生罚款是地方一大稳定收入，不曾想农民兄弟进城后，也学起了城里人不愿意多生，要少生优生。但已习惯于靠罚款生存的干部们就陷入财政困境，不少穷地方当地干部工资发放一直是个大难题。于是乎，盼望农民超生而后获得超生罚款成为一些计生部门的奇怪生存逻辑。计生部门虽然在城市少人问津，但在乡镇部门一直是很抢手的位置，原因就是可以超生罚款，给当地紧缺的财源带来补给，而且罚款的幅度还有很大的弹性。超生的抚养费名字也叫得怪怪的，究竟这个费用抚养了谁 ? 这个悲摧的结论真是让人惊奇：计生部门本是因为控制生育量而设计，最后却沦落为超生而罚款创收的工具。这样的故事其实也并不少见，部分环保部门的工资就是靠排污费罚款，如果企业都遵循排污标准达标了，环保部门的生路就成了问题。目前我国已提前进入老龄化社会，取消一胎政策已成为社会共识，但却迟迟得不到实施。究其原因，最大的阻力应该来自计生部门。其实也不难想象，一胎政策一旦实施，受影响最大的部门当属计生部门，这个部门能否继续存在都应该是一个大问题。所以遇到抵抗，拖延实施都是预料到的结局。其实计生部门除了罚款之外还是可以大有作为的。随着我国老龄化的到来，把计生局改为老年局，专门应对老龄化社会问题，这样的转型潜力其实很大，这样的方向才是计生工作的未来所在。现在北京一个好的养老院据说要排数十年的队，差的养老院让人恐怖，有人戏言：如果让一个老人早点死就把它送到养老院去吧。种种养老问题，说明中国一直没有为老龄化社会准备好。当大批 50-60 年代婴儿潮到退休养老高峰时，这个社会准备好了吗 ? 老人服务是一个很大的朝阳产业，未来老人数量庞大。计生部门真的应该从罚款依赖症中解放出来，把工作重点从产前罚款发放准生证的“入世”转向老年人“离世”的后期服务上，多建些养老院，多培训些为老人服务的家政人员，多提供着优质的老人服务，潜力要比超生罚款大很多。现在老人基本上也都是有产阶级了，大部分都有房子，过去是家庭养老，养儿防老。现在独生子女政策实施多年，出现一些不孝之子并不少见。如果老人把财产交给社会能够换得一个好的养老，其实对过去的养儿防老是一个大的替代，潜力很大。记住去江西最美的村庄参观时，当地的领导人正在规划这个朝阳产业，他们希望建一些好的养老院，让北京、上海的退休老人来住，入住的条件就是老人们在北京、上海的房产可以交由他们出租打理。山清水秀风光好，退休后的老人再也不用每日赶着上班，逃离大都市，到环境好的地方养老，这个创意很好。其实这样的机会很多，生计部门如果把中国的老年人产业规划好了，定会大有作为。比起现在的小打小闹罚款，前途大多了。; 2390 次阅读|0 个评论

生物医学知识发现工具: 热度 1 xupeiyang 2012-8-23 12:36; 常用的生物医学知识发现工具有以下三个平台，各有特色，都是免费的，科研人员在科研工作中应该多多使用。在我的博客知识发现栏目里有大量实例，可以参考。 http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=spaceuid=280034do=blogclassid=115378view=mefrom=space Arrowsmith http://arrowsmith.psych.uic.edu/cgi-bin/arrowsmith_uic/start.cgi BITOLA http://ibmi.mf.uni-lj.si/bitola/ Anne O'Tate http://arrowsmith.psych.uic.edu/cgi-bin/arrowsmith_uic/AnneOTate.cgi 知识发现智慧老人（见图）; 个人分类: 知识发现|6213 次阅读|1 个评论

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