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NetDraw 作者网络图谱
wault511 2019-4-4 10:57
我这个初学者一直在用NetDraw做作者和机构的合作网络,刚在文献里看到这么一个作者的发文网络,竟然不知所措了。这个数据矩阵是怎么来的?
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[转载]我国古代的解剖测量与图谱
fqng1008 2019-3-27 17:22
早在甲骨文中就有许多反映古人对人体认识的象形文字。例如甲骨文中:头(称首)作 ,面作 ,像人面形;目作 ,外圈像眼眶,内圈像眼球,圈中一点像眼珠;耳作 ,像耳形;口作 ,像口形;齿作 ,像口中牙齿;心作 ,像心脏形,还表示内部分膈;血作 ,字中的点表示血在器皿中,……这些甲骨文字表明,三四千年前,我国已经积累了不少有关人体的知识。 在先秦的文献中,就已经有关于人体解剖研究的记载。《灵枢经·经水》中说:“夫八尺之士,皮肉在此,外可度量切循而得之,其死可解剖而视之。其脏之坚脆、腑之大小、谷之多少,脉之长短;血之清浊、气之多少,十二经之多血少气,与其少血多气,与其皆多血气,与其皆少血气,皆有大数。”这表明我国在2000多年前确已进行过人体解剖研究。2000多年前发明的“解剖”这个 词 ,不仅一直沿用至今,还传到日本。 《灵枢经·肠胃》保存了当时所作的内脏解剖测量记录:谷所从出入浅深远近长短之度:唇至齿长九分,口广二寸半。齿以后至会厌,深三寸半,大容五合。舌重十两,长七寸、广二寸半。咽门重十两,广一寸半,至胃长一尺六寸。胃纡曲屈,伸之,长二尺六寸,大一尺五寸,径五寸,大容三斗五升。小肠后附脊,左环回周迭积,其注于回肠者,外附于脐上,回运环十六曲,大二寸半,径八分分之少半,长三丈二尺。 回肠当脐,左环回周叶积而下,回运环反十六曲。大四寸、径一寸寸之少半,长二丈一尺。广肠传脊,以受回肠,左环叶脊,上下辟,大八寸,径二寸寸之大半,长二尺八寸。肠胃所入至所出,长六丈四寸四分,回曲环反,三十二 曲 也。 《灵枢经·肠胃》对人体消化道各器官部位的测量,不仅记录了消化器官的长、宽度和容积,还记录了相对位置和分布情况,显然是经过多次实际解剖观察,并精细测量取得平均数值的结果。这些记录与近代解剖学的记录基本上是一致的。例如根据《灵枢经·肠胃》的记录,食道与肠的长度比值是1:36,而近代解剖学家斯巴德辞(Spalteholz)《人体解剖图》一书所提供的食道与肠道的长度比值为1:37,两者几乎相等。可见古代内脏解剖测量工作做得相当精细。 此外,古代还进行了活体表面测量研究。《灵枢经·骨度》中保存着古代通常人的高度和各部位的长短、大小尺度(见表1) 。 这是一份很少见很珍贵的古 代人体测量记录,其测量项目达38项之多,有长度、宽度和围度;从项目排列的先后顺序看,反映出当时人们作人体测量时的先后操作程序。千百年来,不少人对这份人体测量记录做过研究,特别是近年有人以现代人体测量结果与《骨度》篇的记载进行对照,发现两者数字基本相似。 《灵枢经·骨度》中的人体测量项目   部别 部位起止点 尺度(周尺) 全身 人长 七尺五寸 头面部 发所复者颅至项(前发际至后发际) 耳后当完骨者(耳后两侧乳突之间) 广 头之大骨围(头盖周围) 发以下至颐长 两颧之间相去 耳前当耳门者(耳前两侧外耳孔前缘之 间距离) 一尺二寸 九寸 二尺六寸 一尺 七寸 一尺三寸 角以下至柱骨长 一尺 颈项部 项发以下至背骨(即项后发际至大椎) 结喉以下至缺盆中长 二寸五分 四寸 胸腹部 缺盆以下至髑骬(胸骨上切迹至剑突)长 髑骬以下至天枢(剑突至脐)长 天枢以下至横骨长 横骨长 两乳之间广 胸围 九寸 八寸 六寸五分 六寸五分 九寸五分 四尺五寸 背腰部 膂骨以下至尾骶二十一节长 腰围 三尺 四尺二寸 侧胸腹部 腋以下至季肋长 季肋以下至髀枢长 一尺二寸 六寸 全身 人长 七尺五寸 上肢部 肩至肘长 行腋中不见者(柱骨至腋横纹头) 肘至腕长 腕至中指本节长 本节至其末长 一尺七寸 四寸 一尺二寸五分 四寸 四寸五分 下肢部 两髀之间广 横骨上廉以下至内辅骨之上廉 内辅骨上廉以下至下廉 内辅下廉至内踝长 膝腘以下至跗属长 跗属以下至地长 髀枢以下至膝中长 膝以下至外踝长 外踝以下至京骨长 京骨以下至地长 足长(足跖侧长) 足广(足跖侧宽) 六寸五分 一尺八分 三寸五分 一尺三寸 一尺六寸 三寸 一尺九寸 一尺六寸 三 寸 一寸 一尺二寸 四寸五分    《骨度》篇还根据人体各部位表面解剖特点,确定内脏器官与体表各部位的关系,并根据体表测量结果推断内脏器官的体积大小。如它指出,从缺盆中(胸骨上切迹)到□骬〔heyu合于〕(剑突)之间的距离一般为九寸(约合17.7厘米)。如果超过这个长度,就表明肺体积大,相反即表明肺小;从剑突至天枢(脐眼)距离通常为八寸(约合15.8厘米),过长则表明胃体积大,太短则表明胃体积小。这都同现代解剖学知识相一致。   图18 明·徐春甫《古今医统大全》中的人体尺寸图
个人分类: 思考中医|3557 次阅读|0 个评论
一段不该被忘却的中国植物学研究史
热度 10 周浙昆 2018-4-15 12:01
一段不该被忘却的中国植物学研究史 “ 1941 年,在昆明西北郊的大普吉坝子里的陈家营东边小河旁,有一座破烂不堪的土主庙,那大殿里土主神像旁也就容得下一台石印机和一张看标本、绘图的大方桌。绕着这台石印机,经常有三或四个二三十岁的年轻人 “忙乎”、“转悠”着,转了三年到 1943 终于“转”出了一本自写、自画、自印而成的《滇南本草图谱》” 这段文字摘自于吴征镒院士在抗战胜利六十周年( 2005 年)纪念日为《滇南本草图谱》重新刊印而做的跋文 。这段文字道出了在抗战时期从事植物学研究的艰辛和老一辈科学家为科学救国而付出的不懈努力 , 也是一段中国植物学研究的苦难史。 “本草”是记载中药的书籍,堪称古代中国人最早的植物学文献,自汉迄清,有上百种之多,其中李时珍的本草纲目最为有名,本草是中国人利用植物治疗疾病的开端,是中国文化的瑰宝,也是重要的植物学文献。从黄花蒿中提取青蒿素或多或少是受了“本草”的启发和影响的。然而,在“本草”中,同所记载的植物学名称到底对应现代植物学那一种拉丁学名?另一方面,同一种植物在不同的本草中又会有不同的名字,而同样的名字在不同的本草中可能会代表不同的完全不同的植物。比如大家所熟悉南瓜在《本草纲目》和《滇南本草》中叫“南瓜”,在《群芳谱》中又叫做“番南瓜”,在《滇南本草》叫“麦瓜”,各地也还有“番瓜”、“倭瓜”、“红南瓜”、“饭瓜”等不同的名称,经考证这些名称都对于现代拉丁学名 Cucubiia moschata 。在要想知道本草所记载的植物到达为何物,就需要既通古文又知晓现代植物学知识的学者对其进行考证。《滇南本草图谱》就是本草考证的开山之作。 抗战期间陈立夫主管国民政府的教育部,下令成立了一个“中国医药研究所”,试图利用中草药解决抗战期间大后方缺医少药的困难,于是就有了对《滇南本草》的考证。这个任务落到了经利彬、吴征镒、匡可任和蔡德惠等人身上。经利彬早年留学法国,获里昂大学理学和医学两个博士学位,回国后任“北平研究院生理研究所”所长, 1946 年去了台湾, 1958 年在台逝世 。匡可任 1935 年在日本北海道帝国大学攻读林学, 1937 年抗战一起,第二个月就毅然回国,参加了战区教师贵州服务团,又到云南腾冲中学教生物,后辗转到“昆明黑龙潭农林植物研究所(中国科学院昆明植物研究所的前身)工作,在黑龙潭认识吴先生及其业师吴韫珍先生遂转到中国医药研究所,参与了《图谱》的工作,绘制了很多精美的插图 。蔡德惠是西南联大的高材生,与两弹元勋邓嫁先同届,毕业时登榜第二名,因师从吴韫珍先生,也参与了《图谱》的工作 。蔡德惠喜好植物分类学 写字很娟秀,读书极勤,工作认真细致。曾在西南联大的标本馆外墙上立一土制日规以自励。不想天妒英才,蔡德惠不幸染上了肺结核,英年早逝 。这件事在著名作家汪曾褀 1947 年 3 月 7 日发布于大公报题为:《蔡德惠》的散文有记述 。吴韫珍先生是吴征镒院士的老师,吴征镒先生清华大学毕业后留校做吴韫珍先生的助教,抗战期间随校转至昆明西南联大任教。当时的医药研究所邀请吴韫珍先生来创办药用植物组,是该所的先行。吴韫珍先生不幸因病早世,药物研究所尚未开展的工作全部留给了吴征镒先生来料理 。 这部耗时 3 年才完成的图谱,考证了二十六种在《滇南本草》中记载的植物,其中包括了金铁锁、滇常山、白芨和臭灵丹等常见中草药。作者对每个物种都进行了考证,包括学名考订,中名考订,分布、文献并收集了已知的药理等,每个种都绘制的外形图和解剖图 。更为难能可贵的是《图谱》描述了一个新属——金铁锁属( Psammosilene )。金铁锁是云南白药的一种重要配方,又叫“昆明沙参”和“土人生参”等名。外形略似蝇子草属 (Silene) 植物,英国植物采集人 G.Forrest 曾在云南采得过标本。德国柏林植物园的 L.Diels 将其为 Silene cryptantha ,殊不知 cryptantha 在 Silene 中已被使用,这个名字就成了异名( Synonyms ) 。吴氏师徒二人经过详细的解剖发现,种子盾状着生,种脐在种子的背面中部,胚珠退化等特征与蝇子草属不符,应建立新属 。 《图谱》从标本采集、考证、绘图和文献查阅到刻制和印刷全部由作者自行完成。在今天要出版一本仅包含 26 种植物的图谱,也许不是难事,但是烽火连篇的抗战期间,经费短缺,资料不足,甚至连基本安全都没有保障,几位当时仅是三十出头的年轻人,凭一己之力出版这么一本专著,实在不是一件容易的事情。而且这部《图谱》还发表了一个新属。搞植物分类学的都知道,发表过新属的中国植物分类学家在今天也是屈指可数的。《图谱》原计划是分册出版,未曾想第一册出版以后,药物研究所即解散了。印制好的《图谱》吴征镒院士留下 5 本图册后,全部交给了“教育部”而未能对外发行,后均不知下落 。严格说,按着命名法规,《图谱》未能公开发行,也为送达图书馆和同行,金铁锁新属就不能算做有效发表。吴征镒院士在文革后访问“邱园”见到了 Silene cryptantha 的模式标本,为了保证金铁锁属的合格有效发表,把两本《图谱》分别赠予了“邱园”和科学院北京植物所图书馆,自己留下了三本,见过这本《图谱》的人应该是屈指可数。 2005 年在抗战胜利 60 周年的纪念日,吴征镒院士重印了《滇南本草图谱》。如今《图谱》的作者均已仙世,这是一段中国植物学研究的历史不该被忘却,故记录之。 附件 金铁锁属 * Psammosilene W. C. Wu et C. Y. Wu W. C. Wu et C. Y. Wu in L. P. King. et al. Icon. Pl. Medic. eLibro Tien-Nan-Pen-Tsao Lanmaoano 1: 1-2. tab. 1. 1945. 1. 金铁锁(滇南本草) 昆明沙参(植物名实图考),独钉子(昆明),土人参、金丝矮坨坨 (滇南本草) 图版 117 : 1-10 Psammosilene tunicoides W. C. Wu et C. Y. Wu in L. P. King et al. Icon. Pl. Medic. e Libro Tien-Nan-Pen-Tsao Lanmaoano 1: 1-2. tab. 1. 1945; 中国高等植物图鉴 1: 646. 图 1291. 1972.——Silene cryptantha Diels in Not. Bot. Gard. Edinb. 5: 180. 1912; Hand. -Mazz., Symb. Sin. 7: 203. 1929, non Viviani (1824). 参考文献 吴征镒, 2005. 跋。在经利彬、吴征镒、匡可任,蔡德惠,滇南本草图谱 2005 年重印本,云南科技出版社,昆明 汪曾褀, 1947 。 蔡德惠。大公报 经利彬、吴征镒、匡可任,蔡德惠,滇南本草图谱 2005 年重印本,云南科技出版社,昆明 图1. 2005重印的《滇南本草图谱》 图2. 1943年印制的滇南本草图谱 图3. 龙云为《滇南本草图谱》提的字 � � 图4. 《滇南本草图谱》的插图—金铁锁 � � 图5. 《滇南本草图谱》中金铁锁的描述 � � 图6. 《滇南本草图谱》中关于金铁锁的考证
个人分类: 人生感悟|14991 次阅读|20 个评论
【语义计算:李白王铿锵行】
liwei999 2017-4-4 20:20
【立委按】 “真心说,语言学虽然不是显学,乍看颇落寞穷酸,但的确是最有趣的学问之一,是少有的能与上帝同在和对话的“科学”。要不世界几千年美国几百年不世出的千古学霸乔老爷能以此扬名立万呢。” 当然,乔老爷的天下无敌的引用数与崇高名声,只能说最多一半是语言学的功劳,另一半是他的左派社会主义的独立知识分子情怀及其犀利的现实批判精神。 王: 这本书把我看晕了。 这本书把我砸晕了。 N1 把 N2 V1 V2 了。 V2和哪个N发生语义关系、发生什么样的语义关系好像比较好确定;但是对V1来说,如果不看具体的句子,好像就不能确定,当N1 N2与V1结合后,各自的论元角色是什么。 Me: 不确定这个句法树画得对不对…… 白: 要用次范畴 但是,如果句法的目的仅仅是确定“谁跟谁有关系”而不在乎“是什么关系”,是主是宾,根本无须过问。“看”和“砸”都有两个坑,“我”填一个,剩下的N填另一个。句法的任务就完成了。所以这两句的分析在我的体系里长得没差别: 王: 谢谢白老师!下一步确定哪个萝卜进哪个坑,是不是就是知识本体的工作了。 就是您说的次范畴设计,是不是就是在词库里设定一些语义相谐的规则,萝卜只能进和它语义相谐的坑。 白老师,您的体系里只有两种pos tag? 白: 利用subcat可以确定“我看书” 但“书砸我”并不典型。 “我砸书”也不是不可以。 N、S、X 三种 X意思是“可N可S”。真正排除“我砸书”需要常识或者统计,subcat并不能做出这样的区分。通常是“硬砸软”而不会“软砸硬”,人体属于“标配软”,书则“标配硬”,也不排除硬的人体(冻僵了那种)和软的书(帛书)。 王: 谢谢白老师指点! 白: 语义相谐不一定要通过规则,也可以通过统计。 subcat只对词条标注,不对短语标注。 注意到我画的图里,“我”一个萝卜填了“看/砸”“晕”两个坑。这是因为补语动词并入谓语动词,相应的坑不占同一个萝卜的额度。 王: 对, 李维老师上周推的文章 里好像也说了,本体是人编的,知识图谱是统计出来的,都可以用来判断语义相谐。 Me: 本体(ontology)也可以从大数据统计学出来 叫习得(acquisition),但跨领域的一般性本体不值得费劲儿去学。一来有现成的高质量的本体在 如董老师的 hownet, 语义大师 几十年打造的。跨领域跨语言的基本放之四海而皆准,仅次于上帝的工作。二来 学了半天 也难系统化 。但是 本体自动习得还是有一席之地,主要在,习得可以对领域 对数据有自动调适能力。更主要的是 习得可以包含本体常识的相谐的程度和或然性比较,这是人工标注 哪怕是大师的工作 所难以达到的。最终 常常是二者的结合。以专家本体框架为指导 以数据为对象 学出领域本体。 白: 相对标记,并不是每个本体都有的:“你打了他不该打的朋友。” 打,二价,但“朋友”自身仍有坑。 Me: 当然 玩本体 这种 元层次语义 需要一些修为 非新手可玩 玩了也不会用 。但是 玩知识图谱这种 倒是相对人人可为 基本就是个力气活,砸的是人力和计算资源,不需要一定有语义全局的高度。 白: 标注种子词条,习得种子关联,推荐更多词条,推荐更多关联。所谓bootstrap。 Me: 另外 所谓相谐(semantic coherence, or, attribute-value appropriateness) 是元知识 是本体的属性和功能 与一般的知识图谱无大干系。如果硬要 argue,在碎片化信息抽取整合成知识图谱的过程中,领域概念之间的相谐蕴含在图谱中,也不是没道理。但是关键在,相谐是作为一个软条件帮助语言分析理解,从而帮助抽取挖掘图谱的。图谱是结果,达到结果了 相谐已然过去式了。过河不必拆桥,但桥是为过河而设置,过了河就没桥什么事儿了。 另,“subcat只对词条标注,不对短语标注”,白老师这话不错。不过短语也可以继承词条的 subcat,继承的时候 已经填坑的要“折算”。换句话说 短语的 subcat 坑减少了。减少为0的时候 就功德圆满了 就没有了 subcat,譬如 s,那是最高的短语。 白: 坑的subcat没了,自身作为萝卜的还有 Me: 当然 譬如右嵌套:s 可以作为子句 作宾语,是VP的右嵌套。这时候不圆满还不行 不圆满就做不了所要求的宾语子句。语言学理论里面 把这种条件叫做 configurational constraints, 也就是乔老爷的 x bar 的条件。如果这个条件要求的是尚未圆满(not fully saturated, or partially saturated) 的短语,就带着未填满的坑前行,各种好玩的语言逻辑的戏就开场了。 白: 如果词负载结构,这一切都在填坑中自然完成,无需另外的句法来“制导”。 Me: 譬如 【书砸我】 还是 【我砸书】 这样的公案就出现了。到了 【书看我】 还是 【我看书】,本体常识或本体统计可以发力,当然 这种强搭配也可以不劳驾本体,而是当成词法或词典与句法的交互和接口,但是不强的搭配太柔软,句法就无计可施了,只能 identify 可能性 不能确认语义的唯一性。本体或反映本体的大数据 不得不上场。如果由于数据稀疏 上场了也不能解决 ,那只能保留歧义 有可能本来的语言表达就是双关。 真心说,语言学虽然不是显学,乍看颇落寞穷酸,但的确是最有趣的学问之一,是少有的能与上帝同在和对话的“科学”。要不世界几千年美国几百年不世出的千古学霸乔老爷能以此扬名立万呢。 【相关】 【语义网笔记:本体与知识图谱之辨】 《 语义三巨人 》 《泥沙龙笔记:知识习得对本体知识,信息抽取对知识图谱》 【泥沙龙笔记:再谈知识图谱和知识习得】 中文处理 Parsing 【立委科普:信息抽取】 【关于知识图谱】 【置顶:立委NLP博文一览】 《朝华午拾》总目录
个人分类: 立委科普|3954 次阅读|0 个评论
[转载]QTL作图的一些常见问题
mashengwei 2017-1-19 23:37
这是一篇转载的博文。全文见 李慧慧 张鲁燕 王建康 * 发表的“ 数量性状基因 定位 研究 中 若干 常见问题的 分析与解答” 对初次进行的QTL分析同学帮助挺大,有助于更好的理解QTL作图。转载结论部分,做个记录。 LOD 是 2 种假设检验下极大似然函数比值的常用对数,较高的 LOD 临界值将更好地控制假 QTL 的发生,同时遗传效应较小的真 QTL 就不易被检测出来。如何平衡两类错误的概率,不仅是统计学问题,还要考虑到具体的研究目标。 QTL 作图包含着复杂的统计假设检验,一般采用模拟方法估计 QTL 检测功效和假阳性的大小,功效高同时又具有较低假阳性在统计上就是较好的方法。增加群体大小、减小表型误差、创造近等基因系和染色体片断置换系、大群体中适当增加标记密度都是提高 QTL 检测功效的有效途径。 QTL 的遗传方差占表型方差的比例定义为 QTL 的贡献率,遗传方差受 QTL 的遗传效应和 QTL 基因型频率共同影响,不同 QTL 的贡献率一般不具有可加性。 有利等位基因的判断依赖于 QTL 作图时如何编码 2 个亲本,正加性效应 QTL 意味着编码为 2 的亲本携带的等位基因能提高性状值,反之编码为 0 的亲本携带的等位基因能提高性状值。 补充一点,我认为这一句不是全对,所谓有利等位基因对粒重来讲,提高粒重是有利基因,而对于抗病性状来讲有利性状则意味着负加性效应。 选择 基因型分析的检测功效一般都高于 IM 的检测功效,但低于 ICIM 的检测功效。与构成性状相比,复合性状 QTL 作图功效比构成性状下的功效明显下降,因此使用复合性状进行 QTL 作图的意义不大,但并不排除育种中使用复合性状进行选择。 表型正态分布不是该性状是否适合 QTL 作图的必要条件,但一般要求表型数据的随机误差服从正态分布。 高密度分子标记为分离紧密连锁 QTL 提供了可能,但高密度标记必须辅以大作图群体,才能提高 QTL 作图的准确度。缺失标记对 QTL 作图的影响等同于一个缩小了的作图群体。奇异分离标记对作图的影响可以用与其连锁的 QTL 遗传方差的变化来衡量,有时奇异分离标记会增大 QTL 的方差进而提高检测功效,这种影响会随着连锁距离的增大而减弱。缺失标记和奇异分离对 QTL 位置和效应估计的影响不大,对于效应较大的 QTL 和较大的群体,缺失标记和奇异分离对 QTL 作图的影响可以忽略。
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[转载]七旬男晚年出书记载蝴蝶梦
李智选 2016-10-31 15:12
七旬老人圆了蝴蝶梦 晚年出书收录了15337种蝴蝶标本 发布:2016-10-31 07:35      寿建新向记者展示他出的书《世界蝴蝶名录图鉴》 记者 张雷 摄 寿建新老人展示他出的书《世界蝴蝶名录图鉴》 记者 张雷 摄   电子城72岁的寿建新老人从小就有一个“蝴蝶梦”,最近他的这个梦想终于实现了,出版了4卷本《世界蝴蝶名录图鉴》,卷中收录了全世界范围内的蝴蝶共计15337种,他也因此成了周围有名气的“蝴蝶专家”。   昨天上午,记者来到电子城陕西省银行学校家属院寿建新老人的家中,一进家门,让人仿佛来到了一个蝴蝶的世界,客厅、卧室全都挂满了蝴蝶的标本。“怎么样,蝴蝶好看吧,你可别小看这些标本,都是我几十年收藏的。”寿建新一边说着,一边拿出4卷本《世界蝴蝶名录图鉴》给记者看。记者看到,这4卷本分为:凤蝶总科、蚜蝶总科、灰蝶总科、弄蝶总科。打开其中一本,记者看到书里的文字分为中文及英文两种语言,里面记录的不光是中国蝴蝶,还有全世界各国的蝴蝶标本。除了标本图画外,每只蝴蝶的名称、出现的国家属地、发现日期及世界各国发行的蝴蝶邮票样式都有详细的说明。寿建新说,这4卷本共收录世界蝴蝶15337种,其中中国蝴蝶2233种。里面所有蝴蝶种类都来自他多年集邮的邮票与自己采集制作的标本,其中国外的蝴蝶标本是从台湾的一个蝴蝶爱好者手中要来的。至于为何书中有英文?寿建新说,考虑到它是一本值得收藏的工具书,这样方便外国友人借阅。   寿建新说,周围人都称他是一个“蝴蝶专家”,可他自己却是一个非这类专科的专业人士,只因他从小对蝴蝶痴迷,有一个“蝴蝶梦”,这么多年来他一直追着这个梦想,在全国各地收藏蝴蝶标本,就连他的家里也成了蝴蝶的一个“巢穴”,每年立春过后化蛹成蝶的蝴蝶就会在整个屋子里飞来飞去。他在欣赏这些蝴蝶的同时,也用于研究收集资料,整理相关方面知识以便日后出书所用。“世界蝴蝶分类系统及中文命名是一个庞大、复杂的工程,其工作量之大、投入时间和精力之多,是难以想象的。”寿建新说,他通过几十年的不断查阅各类专科杂志及自己的标本积累,终于在晚年时,可以将儿时的“蝴蝶梦”付诸实现,出版书籍。“蝴蝶的一生很短暂,最短的就几天,最长也不超一个月。所以我要将蝴蝶短暂的美收藏起来。”寿建新说。记者 张雷 来源: 西安新闻网-西安晚报    编辑:雷莹 分享到: 0
个人分类: 科研|1554 次阅读|0 个评论
同样是拍花,人家怎么就拍得那么漂亮!
scienceart 2016-3-23 15:52
仿佛一夜之间, 朋友圈里突然就冒出了很多花, 含苞的,怒放的 ,万绿丛中一点红的, 美的不要不要的 …… 如果不能更 慧心妙手 地 拍点 花, 感觉都不好意思发朋友圈啦, 幸好小编运气好,喜得妙招, 请君慢慢往下瞧。。。 来自宁波的abb 将每个季节的落花残叶拾取收集 留在了自己的镜头里 ▼ 《我为歌狂》系列,不能浪费了树上掉下来的这美丽花瓣~ 菊花谢得差不多了,秋天就这样过去了,园子里最后几朵菊花跟玉米仙人合影一张,《仙女散花》 林中双燕 一场秋雨打落了我一地的美女樱,很漂亮,收拾一下拍一张《江南落花季》 进入梅季,天天下雨,对喜欢伺花弄草的我来说,倒一点不讨厌这样的天气,培育花苗的好时机啊!今天插了一些日日春,多余的花叶尝试着拼一图,真是什么都不浪费哈 ▼ 来自广东的miaomiao将花冷冻结冰 让我们看到零下状态里的花 她也拿起手机 捕捉遗落的瞬间 将花儿写成一首诗 ▼ 西湖钓神拍的花透着自己的个性 一眼就能知道这是他的照片 简约的画面、清新的色彩 别有一番空灵和禅意 从空中拍平常看不到的花海 ▼ 拍花还不过瘾怎么办? 那就一起来翻翻书吧, 跟着著名的玫瑰大师雷杜德一起 徜徉花海 【本期编辑:多多】 投稿、合作邮箱: yunhewwh@sina.com QQ 群:535743664
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【新智元笔记:深度结构分析的逻辑化 】
liwei999 2016-1-6 11:54
D: 问题是parsing的目标是什么?如果和具体应用对接的话,也不一定需要parsing,或者传统意义上的句法parsing,可能是某些其他结构的提取和转化,类似翻译出一种机器可理解的语言。 我: parsing 的目标就是帮助降低应用开发的 costs,这个以前的沙龙讨论中详细论过。有了靠谱的 parser,做抽取或很多NL应用,就大大节省了成本, 因为 dirty work 都被 parser 在 domain independent 的语言学层面干掉了。有靠谱的parser,抽取简直就是玩儿。(见: 《新智元:有了deep parsing,信息抽取就是个玩儿》 )没有 parser 也可以做,但就变成一个繁难的任务。 D: 如果是这么宽的目标,有时候起的作用就很有限,只能起到辅助性作用。 我: 怎么叫宽? 抽取中多数任务可以从 parsing 中得到太大的帮助了。 D: 你说降低costs,很宽泛的目标呀。 我: 可以测量的啊,譬如,如果没有 parser,我要完成一个产品规定的情报抽取任务: (1)如果用规则去做的话,需要 n 人天 才能完成表层的 patterns (2)如果用统计的话,需要 n 多人力去做标注,然后去设计 features 和调试系统等。 如果有了 parser,简单的任务 一两天的开发,复杂的任务 一两周的开发。最复杂的任务,譬如社交媒体的舆情抽取,要几个月的时间。都是可以定量比较 costs 的节省的。 往: 文本parser后有结构信息,肯定对情报抽取意义重大。 D: 您说的这些有道理,但对于更高级的目标,比如我要把自然语言转成某种形式化语言,我看重的是形式化单位很语言单位含义的对应,句法性的标记都还只是初级阶段,且并不是必要阶段。 我: parser 把本来是千变万化的表层 patterns,变得可以从结构上见底。就是这个道理。这个 “初级阶段” 对于高效的情报抽取很关键,虽然并不是“必要”的:事实上,绕过 parser 做抽取依旧是共同体的常态,不过这里有些不得已的因素(很多人没有靠谱的 parser 可用,还有人不愿意把结构加入抽取系统怕算法或model太过复杂伺候不了,等等)。 你说的那些目标我不太了解。做得多的就是具体的情报抽取挖掘任务。一般来说,任务是这样的,产品经理根据客户需求,做了这样的 specs, 一端是 text,另一端是要抽取的情报。产品经理跟我说, text 中的其他东西我不感兴趣,但是我需要你把这些情报抽取出来(就是情报填表)给我的客户。面对的就是这样的要求,这时候你会发现,没有 deep parser 就太吃亏了。 D: 我明白,相当于您抽象了底层模版,可以限制任意模版的写法在某个合适的范围。 我: 就是乔姆斯基上世纪50年代革命时候开始提出的概念:表层结构 parse 成了底层结构,语言在结构上被逻辑化了,所以后来又叫做 logical form。在逻辑结构层面做抽取,比起在语言表层(譬如 ngram)做抽取,那个功效不是以一当十,而是以一当百或千。而且,不仅仅是规则开发量的区别,还有表层根本就无法捕捉的所谓 long distance 现象,在 parser 的支持下变得 tractable,可以涵盖了。 D: 但是这个逻辑结构具体是什么形式?我是说是哪类逻辑? 我: 就是董老师说的逻辑语义结构( 董振东: 逻辑语义及其在机译中的应用 ), 说到底就是逻辑结构树,以 argument structure 为核心的依存关系,逻辑主谓宾补+各类定状。 D: 老师有这种把自然语言转化为逻辑形式的系统吗? 我: 有啊,一直不就是在吹的这个么? D: 不是数学上的逻辑形式是吧,还只是语言学上的限定关系 我: 基本是语言学上的( 【征文参赛:美梦成真】 )。 D: 赞如此坚持,如果能进一步转化为数学形式就完美了,机器就能理解。我设计了一套系统尝试把自然语言转成数学化语言,以支持后续演算,后续多交流。 我: 自然语言中只有很小的一个子集可能 mapping 到形式逻辑的数学表达,数学教科书中的表述与日常用语的表达的不同也揭示了这一点。当年初学形式逻辑的时候很着迷,曾经幻想过把自然语言最终都表达为形式逻辑,那多干净漂亮啊。后来做了一些尝试,包括思维实验,发现基本上此路不通。 D: 按照蒙太古的理论自然语言和形式语言没有本质区别。 我: 譬如,“当且仅当” 这样的表述根本就是从逻辑反推到语言的,根本就不是自然的“人话”。研究一下语言中的“与或非”相关的表达就会发现,要理解成形式逻辑的语义表达很难。当然如果你的应用局限在数学 domain,朝这个目标做语义是有理的。本群的老革命严老师就做过这方面的工作,他的任务是把几何题的表述 parse 成内部表达,然后进入几何解题。 D: 不全是,精确搜索相关的。我猜wolframe的系统也用类似做法 我: 语言学的结构表达,就已经可以大大提高精准搜索的很多要求。这个以前也论过,说的是 parsing 是智能搜索和问答系统的核武器( 泥沙龙笔记:parsing 是引擎的核武器,再论NLP与搜索 )。 D: 身高一米六八的日本男明星,parsing出来有什么用?离结构化查询还很远。 我: 问题在哪里?你需要什么? D: 我需要这个query的结果。实际上和解数学题一样。 我: 知识图谱啊。知识图谱中把人的 entity 的图谱 normalize 就好。 ISA: 明星 Height: 1.8m D: 我觉得这个和理解数学题是一样,可以通用处理 我: query parsing 中也有一个 normalize 的过程:一米六八 --》 1.68 m。你这个问题,顺着图谱的思路,是有迹可循的:parsing + 抽取 + normalize。 D: 我要说的其实是觉得parsing太语言学了,离计算机可处理的形式太远,应该还是一种初级表达,需要往前走一步 我: parsing 的语言学化是自然的,因为它是独立于domain的纯语言的表达。计算机可处理的形式可以是 parse tree,但更经常的则是图谱(IE Template or AVM),都是结构化数据,本性上就是逻辑的。图谱可以由用户或代表用户需求的产品经理来定义,他要怎么逻辑就怎么逻辑。IE 的任务不外就是从语言学的 parse 表达 map 到用户或产品经理定义的图谱上去。语义逻辑化说的实际上就是这个过程,与你的要求没有冲突和距离。 你的要求中需要有抽取,parsing 是很好的支持,至于抽取的值如何 normalize,至少对于数量结构,这是一个 tractable 的子任务,可以单做。只要做就可以做出来:数的 normalization 和单位的 normalization,例如,单位如果是 foot 可以 normalize 到默认的 meter,如此等等,清晰的路子。 D: 我也认为这些细节怎么做都不是问题,问题是语言到底用什么形式描述可以很好地支持运算,以及这个形式是描述语法就可以了,还是可以统筹语义,最后可以训练和学习,并对接到机器接口上,这些看起来更加底层和有意义。用什么形式描述可以很好地支持运算,以及这个形式是描述语法就可以了,还是可以统筹语义,最后可以训练和学习,并对接到机器接口上,这些看起来更加底层和有意义。 铺: 谢谢李老师的分享,我们也很感兴趣这类问题。 我: 语言的抽取逻辑化,分成两大部分:如果把图谱目标形式化地定义为 AVM (Attribute Value Matrix)的话,第一个是 A 的定义,譬如 Name 、ISA、Height、Weight、Age 等等;第二个是 V 的 normalization。换句话说,要对语义结果做逻辑操作,需要逻辑化的结构关系,还需要节点值的逻辑化,这包括 时间的 normalization: 如 14:30 --》2:30pm,地点的normalization: Beijing --》 Geo的表达;数量单位的 normalization,等等。在这些任务中,V 的逻辑化都是一个个子任务,大多是 tractable 的,一个模块一个模块的开发好了。当然也可能有一个歧义的问题,但是对于搜索,歧义并不可怕,根本就不要排除歧义,就产生 nondeterministic 结果就好了。至于 A 的定义,本质就是反映 IE 情报填空的需求,parser 在这里是最核心的保障和支持。 往: 李老师的parser支持试用吗? 我: 公司没有动机去开放 parser,虽然有 API。 漆: 这种Parser应该也不会是通用的对吧 我: 是通用的 fast (near linear speed) robust domain independent precise good recall good recall because 有一些长尾未及解决或者选择不去解决。 但是长尾以外,recall 还是很好的 漆: 这个Parser是基于Offline构建的知识图谱吗? 我: 不懂你的问题。 知识图谱需要 parser, parser 不需图谱 往: parser对情报分析应当有用! 漆: 我看到有一个工作是用FreeBase来做Semantic Parsing的。 Semantic Parsing on Freebase from Question-Answer Pairs, 斯坦福大学的一个博士做的。 我: 我们用了一些 HowNet . 漆: 李老师,您做的Parser可以做到接近线性速度吗? 是否适合并行处理? 我: 线性。 适合。 用到大数据+ 云计算。 【相关】 【围脖:做 parsing 还是要靠语言学家,机器学习不给力】 《新智元:有了deep parsing,信息抽取就是个玩儿》 【ZT: 王伟 - 李老师的观点整理】 董振东: 逻辑语义及其在机译中的应用 《泥沙龙笔记:漫谈自动句法分析和树形图表达》 【立委科普:语法结构树之美】 【立委科普:语法结构树之美(之二)】 【征文参赛:美梦成真】 泥沙龙笔记:parsing 是引擎的核武器,再论NLP与搜索 泥沙龙笔记:从 sparse data 再论parsing乃是NLP应用的核武器 【置顶:立委科学网博客NLP博文一览(定期更新版)】
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[转载]Science:人类蛋白质图谱分析大进展
bionion 2015-1-26 09:25
最新一期的 Science 公布了基于人类蛋白质图谱的大分析结果,包括与癌症相关的详细蛋白质图片,血液中蛋白质种类和数量,以及市场上被批准的所有药物所作用的目标蛋白质。 人类蛋白质图谱(The Human Protein Atlas),是由Knut and Alice Wallenberg基金会于2014年11月支持的一个大型跨国研究项目。近期他们又开放了一个以人器官组织为基础的蛋白质图谱数据库。基于1300万个注释的图像,整个数据库涵盖了人体中的所有主要组织和器官的蛋白质分布,也标注了仅表达在特定组织,如脑,心脏或肝脏的蛋白。作为一个开放的数据资源,这个数据库提高了对人类生物学的基本见解,更有望帮助推动新的诊断和药物的开发。 在 Scienc e的这篇文章里,基于组织的人类蛋白质组图谱 结合基因组学,转录组学,蛋白质组学,以及基于抗体的分析,详细分析了大约20,000个蛋白质编码基因。分析结果表明,蛋白编码基因几乎一半都是普遍表达在所有分析的组织。而有大概的15%的蛋白质编码基因大量表达在一个或几个特定的组织或器官,包括众所周知的组织特异性蛋白质,如胰岛素和肌钙蛋白。睾丸是含有最丰富种类蛋白质的器官,其后是大脑和肝脏。分析结果还表明,大约3000种蛋白质是从细胞中分泌释放的,另有5500种蛋白位于细胞膜结构。 这一蛋白质图分析结果为制药行业的提供了重要信息。研究小组的Uhlén表示,他们发现了市场上使用的药品有70%的作用目标是分泌或膜结合蛋白。有趣的是,另外30%被发现是作用其他组织和器官,这可能有助于解释药物的一些副作用,并且对未来药物开发提供一定的参考价值。 该数据库已经免费对外开放,网址是www.proteinatlas.org
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遗传图谱常见问题
j314159 2015-1-9 15:01
概念:偏分离与图谱扩张,图谱扩张因子期望值。玉米Syn10和Syn4的图谱扩张因子期望值分别为6.5和4。 刘红军,四川农业大学博士论文,“玉米IBM Syn10 群体高分辨率遗传连锁图谱构建及穗部相关性状QTL/miRNA遗传解析”
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[转载]美科学家成功给“整个大脑”画图谱
sciencepress 2014-4-4 08:35
继美国总统奥巴马宣布“推进创新神经技术脑研究计划”(简称BRAIN计划或脑计划)一年后,美国科学家成功给“整个大脑”做了图谱,大脑完整基因表达图谱和神经元联系图谱绘制完成。 科技日报讯 继美国总统奥巴马宣布“推进创新神经技术脑研究计划”(简称BRAIN计划或脑计划)一年后,美国科学家成功给“整个大脑”做了图谱。4月3日出版的英国《自然》杂志发表两项相关研究,介绍了哺乳动物大脑中完整的基因表达图谱和神经元联系图谱。此次的图谱对于研究人类大脑发育和神经回路,从而理解人类的行为和认知过程的健康状态与疾病状态提供了极其重要的资源。 人类大脑的结构和功能在很大程度上是由胎儿时期基因转录启动的基因表达决定,但是我们对于大脑的发育过程了解甚少。2013年4月2日由奥巴马政府公布的“脑计划”,就旨在探索人类大脑工作机制、绘制脑活动全图,并最终开发出针对大脑疾病的疗法,其重要程度被认为可与人类基因组计划相媲美。 美国华盛顿州西雅图艾伦脑科学研究所的艾德·雷恩与他的科研团队,此次提供的人类胎儿妊娠中期详细的大脑基因表达图谱,则填补了我们知识中的这一空白。由他们发现的转录标记与不同的解剖特点和发育过程相关。这些数据也识别出了许多和神经或精神障碍相关的基因表达动态。 而在本期《自然》杂志上发表的另一篇论文中,同是艾伦脑科学研究所的曾红葵与她的研究团队提供了一个小鼠大脑连接图谱,此图谱是第一个哺乳动物全脑神经元连接图谱,也是至今为止最全面的脊椎动物的大脑连接图谱,为了解大脑的不同区域如何沟通与交流提供了新的见解。这篇论文的作者们认为,这一研究结果将有助于探索人类大脑的神经元网络,从而加深我们对于人类大脑连接方式和相关疾病的了解。(张梦然) 本篇文章来源于: 中国科技网 www.wokeji.com 原文链接: http://www.stdaily.com/jbsj/eb/201404/t20140403_681634.shtml
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《图谱》纪事
sstone2009 2013-9-18 10:48
前几日,《手足外科手术记录图谱》(以下简称《图谱》)终于拿到手了,手抚素洁新书,淡淡墨香沁鼻,我的心里仍有十分欣慰。十余年前,我和同事们开始推广手术记录绘图,几经波折,终于渐渐成点气候,去年年后开始布置收集材料,然后筛选出500来套,再然后联系出版社……现在,终于尘埃落定,新书面世,这本来就该庆幸的事情。 除了作为一项多年辛劳的成果,这本《图谱》还有其他一些特点值得我记录:一是与时下不少专业书籍抄来抄去不同,这是纯原创的作品,尽管还很稚嫩,真诚所在,人可尽知;二是编者队伍以年轻、不知名的医生为骨干,大家在日常工作中的日积月累,不经意间成就了这本著作,这与总多的专业著作都是名人或者名人的高徒,也甚是不同;三是在编辑老师的努力下,设计、装帧别具一格,颇有新味。 《图谱》是我正式出版的第四本书籍了,每有自己的新书在手,心境不同,感想不同,但它们对我的激励却是一样的。《图谱》,依然会给我无限的激励,催我奋进。 在此,我要表达对所有关心、帮助我的人的感谢,他们让我可以完成一件又一件有趣的事情;我也要感谢那些在不同诋毁、攻击我的人,他们激发了我深埋心底的奋进的心智!
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我参与编写的诊断图谱
guozhenru 2013-1-15 06:58
我参与编写的诊断图谱
刚收到有WILEY出版的电镜诊断图谱-Diagnostic Electron Microscopy,我参与编写了其中一部分。很高兴,有一点成就感。中国人很少有人愿意花时间编写好的图谱,可能因为晋升用不上,基金申请也没用吧。我认为编写高质量的图谱对国家的科学发展来说是一件重要事情,更能体现一个国家的科学实力。 晒晒就可以了。 1
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最近很火的微博传播图及水军的简单判别
supermac 2012-8-3 10:35
最近很火的微博传播图及水军的简单判别
得益于沈浩老师漂亮的杜蕾斯微博传播分形图,这个话题最近几个月大热,知微为新浪微博提供了一个分析平台,可以得出传播影响值、传播深度、感情倾向、性别比例、真实用户or水军用户辨别等等结果,传播图支持无级放大,非常有趣。随意抓了三条微博,可见其传播图有明显不同。 随意在热门博文中选一条明星博文,传播图是圆形 韩国潮流服饰的传播图,有扇形特征 昨晚决出的乒乓球男单金牌,传播深度达到5 可以看出所有的传播图都有分形自相似的特征~~ 另外可以通过传播图简单判断是否存在水军 此图的微博地址: http://weibo.com/1642051034/yuOKriOVJ 知微入口: http://www.weiboreach.com/index.jsp
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我的科学网好友图谱
热度 1 supermac 2012-7-19 10:35
我的科学网好友图谱
借助谢龙老师的爬虫,我也抓了下我的科学网好友图谱。 可以看出,复杂网络领域的几位青年大牛盘踞在好友网络的中心,并保持紧密联系,我等小辈则力争团结在大牛周围,紧跟时代潮流! 谢老师的程序博文链接: http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=spaceuid=483379do=blogid=593102
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分享《自然-生物技术》谷子超高密度SNP图谱等
热度 4 xuewenwangcn 2012-5-23 10:13
分享《自然-生物技术》谷子超高密度SNP图谱等
分享自己的一部分研究成果:至今分子标记最多的谷子(foxtail millet)超高密度SNP分子标记和遗传图谱等在《自然-生物技术》2012年5月发表 在此报道一下,希望为分子育种和生物能源基因组组装等提供有用的帮助。 这是第一个超高密度的SNP图谱,覆盖整个基因组;为基因组装配和分子育种提供最有利的工具。 具体内容见《自然 生物技术》文章: 文章标题:Reference genome sequence of the model plant Setaria 文章连接 http://www.nature.com/nbt/journal/vaop/ncurrent/full/nbt.2196.html 图谱截图
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[转载]今天从陈博士博客上了解到citespace已经开始出新版了(转)
cqdoudou 2011-9-13 00:19
新版本3.0 R1从今天起可以从CiteSpace的主页下载。 修复了2.2.R12中的一个问题(节点名称大小按比例显示部分)。 现在的2.2.R11的WebStart于2011年7月底停止启动。如果你需要继续使用这一版本,最简单地办法是把你计算机的时钟拨回到2011年7月31日之前。用完以后在把钟调回正常时间。 新版本不在由WebStart启动。你需要下载一个dist.zip的压缩文件(大约26MB).主页上有英文提示。这里简单说一下步骤。 1。先在你C盘的根目录下建立一个目录:CiteSpaceII。 2。下载dist.zip到CiteSpaceII.就地解压缩。 3。核对一下,如果看到: C:/CiteSpaceII/dist/launch.jnlp 就对了。双击这个launch.jnlp即可。 如果熟悉jnlp,可自行修改其中的codebase. 主要的新功能: 图谱显示窗口的菜单中的综合报告功能(Synthesizing),其中包括“一气呵成”(Batch Mode)和“聚类浏览”(Cluster Explorer). “一气呵成”能一气生成聚类,标识,统计,列表。如有事先存储的截图,也会自动包括在文件中。 “聚类浏览”可用来查看各个聚类的施引和被引文献以及最有代表性的语句 (基于中心性或PageRank)。 新功能尚无更详细的使用说明,大家试着用。有什么问题,经验,建议请在这儿交流。我有时间再给些详细点儿的例子。 更新的功能: Google地球(CiteSpaceGeospatial),相应于Web of Science v.5最近的格式变化做了调整。 其它改动参见CiteSpaceHelpWhat's New. ————————————————————————————说明:以上内容转自陈超美博士《科学网》博客http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=spaceuid=496649do=blogid=469240
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[转载]两篇图谱的综述与应用,又加1篇图论文章
热度 1 Fangjinqin 2011-2-17 07:56
110217-Graphs_with_given_diameter_maximizing_the_algebraic_connectivity.pdf 110217-评论文章fyi2.zip 两篇图谱的综述与应用 1。R E S E A R C H R E P O R T APPLICATIONS OF GRAPH SPECTRA TO COMPUTER SCIENCE1 Graph Spectral Techniques as Tools in Information and Communication Technologies Dragos Cvetkovic, Mathematical Institute SANU, Beograd with collaborators Tatjana Aleksic, University of Kragujevac, Faculty of Sciences Slobodan Simic, Mathematical Institute SANU, Beograd Dragan Stevanovic, University of Nis, Faculty of Sciences Ljiljana Trajkovic, Simon Fraser University, Vancouver Email: ecvetkod@etf.rs , aleksictatjana@yahoo.com , sksimic@mi.sanu.ac.rs , dragance106@yahoo.com , ljilja@cs.sfu.ca March 10, 2010 Mathematical Institute SANU P.O. Box 367, 11000 Belgrade, Serbia Abstract. In this report we shall give a survey of applications of the theory of graph spectra to computer science. Eigenvalues and eigenvectors of several graph matrices appear in numerous papers on various subjects relevant to information and communication technologies. Keywords: graph theory, graph spectra, applications, computer science, information technology, communication technology, internet, complex networks AMS Classi cation: 05C50 , 68M07, 68P20, 68R10 2。APPLICATIONS OF GRAPH SPECTRA: AN INTRODUCTION TO THE LITERATURE Dragoˇs Cvetkovic Abstract. We give basic definitions and some results related to the theory of graph spectra. We present a short survey of applications of this theory. In addition, selected bibliographies on applications to particular branches of science are given. Mathematics Subject Classification (2000): 05C50, 05C90, 01A90 Keywords: graph spectra, application, bibliography, chemistry, physics, computer science
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中国海浮游桡足类图谱 种名字母顺序索引
WuchangZhang 2010-8-31 12:02
《中国海浮游桡足类图谱》出版后,有读者反映没有字母顺序排列的索引。对此我很抱歉,并在博客中添加这个内容,请读者自己打印出来,和图谱一起使用,按照序号查找该种的图谱。 我国海区浮游桡足类名录兼图谱索引(按字母顺序排列) 学名 中文学名 序号 Acartia (Acanthacartia) bifilosa (Giesbrecht, 1881) 双毛纺锤水蚤 094 Acartia (Acanthacartia) fossae Gurney, 1927 095 Acartia (Acanthacartia) sinjiensis Mori, 1940 096 Acartia (Acanthacartia) steueri Smirnov, 1936 097 Acartia (Acanthacartia) tsuensis Ito, 1956 098 Acartia (Acartia) danae Giesbrecht, 1889 丹氏纺锤水蚤 099 Acartia (Acartia) negligens Dana, 1849 小纺锤水蚤 100 Acartia (Acartiura) clausi Giesbrecht, 1889 克氏纺锤水蚤 101 Acartia (Acartiura) hongi Soh Suh, 2000 102 Acartia (Acartiura) longiremis (Lilljeborg, 1853) 长纺锤水蚤 103 Acartia (Acartiura) omorii Bradford, 1976 104 Acartia (Euacartia) southwelli Sewell, 1914 披针纺锤水蚤 105 Acartia (Odontacartia) erythraea Giesbrecht, 1889 红纺锤水蚤 106 Acartia (Odontacartia) pacifica Steuer, 1915 太平洋纺锤水蚤 107 Acartia (Odontacartia) spinicauda Giesbrecht, 1889 刺尾纺锤水蚤 108 Acartiella sinensis Shen Lee, 1963 中华异水蚤 109 Acrocalanus andersoni Bowman, 1958 安氏隆哲水蚤 225 Acrocalanus gibber Giesbrecht, 1888 驼背隆哲水蚤 226 Acrocalanus gracilis Giesbrecht, 1888 微驼隆哲水蚤 227 Acrocalanus longicornis Giesbrecht, 1888 长角隆哲水蚤 228 Acrocalanus monachus Giesbrecht, 1888 单隆哲水蚤/中华隆哲水蚤 229 Aegisthus aculeatus Giesbrecht, 1891 针额保猛水蚤 487 Aegisthus mucronatus Giesbrecht, 1891 尖额保猛水蚤 488 Aegisthus spinulosus Farran, 1905 489 Aetideopsis armata (Boeck, 1872) 268 Aetideus acutus Farran, 1929 尖真鹰嘴水蚤 269 Aetideus armatus (Boeck, 1872) 武装鹰嘴水蚤 270 Aetideus bradyi A. Scott, 1909 271 Aetideus giesbrechti Cleve, 1904 纪氏真鹰嘴水蚤 272 Allodiaptomus gladiolus 短刀复镖水蚤 501 Amallothrix arcuata (Sars, 1920) 弓小厚壳水蚤 343 Amallothrix gracilis (Sars, 1905) 瘦小厚壳水蚤 344 Archescolecithrix auropecten (Giesbrecht, 1892) 金小厚壳水蚤 345 Arietellus aculeatus (T. Scott, 1894) 真刺尖头水蚤 001 Arietellus armatus Wolfenden, 1911 002 Arietellus plumifer Sars, 1905 羽尖头水蚤 003 Arietellus setosus Giesbrecht, 1892 多毛尖头水蚤 004 Arietellus simplex Sars, 1905 005 Arietellus tripartitus C.B. Wilson, 1950 006 Augaptilus anceps Farran, 1908 剑亮羽水蚤 009 Augaptilus glacialis Sars, 1900 冻亮羽水蚤 010 Augaptilus longicaudatus (Claus, 1863) 长尾亮羽水蚤 011 Augaptilus megalurus Giesbrecht, 1889 大亮羽水蚤 012 Augaptilus spinifrons Sars, 1907 刺额亮羽水蚤 013 Bathycalanus richardi Sars, 1905 223 Bestiolina amoyensis (Li Huang, 1984) 厦门矮隆哲水蚤  230 Bestiolina sinica (Shen Lee, 1966) 中华矮隆哲水蚤/ 中华隆哲水蚤 231 Bradyidius armatus Giesbrecht, 1897 盔甲刺额水蚤 273 Calanoides carinatus (Kryer, 1848) 隆线拟哲水蚤 210 Calanoides philippinensis Kitou Tanaka, 1969 211 Calanopia elliptica (Dana, 1849) 椭形长足水蚤 143 Calanopia minor A. Scott, 1902 小长足水蚤 144 Calanopia thompsoni A. Scott, 1909 汤氏长足水蚤 145 Calanus jashnovi Hulsemann, 1994 212 Calanus sinicus Brodsky, 1965 中华哲水蚤 213 Calocalanus contractus Farran, 1926 短缩丽哲水蚤 232 Calocalanus gracilis Tanaka, 1956 瘦丽哲水蚤  233 Calocalanus monospinus Chen Zhang, 1974 单刺丽哲水蚤  234 Calocalanus pavo (Dana, 1849) 孔雀丽哲水蚤 235 Calocalanus pavoninus Farran, 1936 锦丽哲水蚤 236 Calocalanus plumulosus (Claus, 1863) 羽丽哲水蚤 237 Calocalanus styliremis Giesbrecht, 1888 针丽哲水蚤 238 Candacia armata (Boeck, 1872) 110 Candacia bipinnata (Giesbrecht, 1889) 双刺平头水蚤 111 Candacia bispinosa (Claus, 1863) 两棘平头水蚤 112 Candacia bradyi A. Scott, 1902 伯氏平头水蚤 113 Candacia catula (Giesbrecht, 1889) 幼平头水蚤 114 Candacia columbiae Campbell, 1929 哥伦布平头水蚤 115 Candacia curta (Dana, 1849) 短平头水蚤 116 Candacia discaudata A. Scott, 1909 异尾平头水蚤 117 Candacia ethiopica (Dana, 1849) 黑斑平头水蚤 118 Candacia guggenheimi Grice Jones, 1960 耳突平头水蚤 119 Candacia longimana (Claus, 1863) 长(突)平头水蚤 120 Candacia pachydactyla (Dana, 1849) 厚指平头水蚤 121 Candacia simplex (Giesbrecht, 1889) 简平头水蚤 122 Candacia tenuimana (Giesbrecht, 1889) 瘦平头水蚤 123 Candacia truncata (Dana, 1849) 截平头水蚤 124 Candacia tuberculata (Wolfenden, 1905) 125 Candacia varicans (Giesbrecht, 1892) 腹突平头水蚤 126 Candacia worthingtoni (Grice, 1981) 127 Canthocalanus pauper (Giesbrecht, 1888) 微刺哲水蚤 214 Centraugaptilus porcellus Johnson, 1936 014 Centraugaptilus rattrayi (T. Scott, 1894) 鼠刺亮羽水蚤 015 Centropages abdominalis Sato, 1913 腹针胸刺水蚤/墨氏胸刺水蚤 128 Centropages bradyi Wheeler, 1901 129 Centropages brevifurcus Shen Lee, 1963 短尾胸刺水蚤 130 Centropages calaninus (Dana, 1849) 哲胸刺水蚤 131 Centropages dorsispinatus Thompson Scott, 1903 背针胸刺水蚤 132 Centropages elongatus Giesbrecht, 1896 瘦长胸刺水蚤 133 Centropages furcatus (Dana, 1849) 叉胸刺水蚤 134 Centropages gracilis (Dana, 1849) 细胸刺水蚤 135 Centropages hamatus (Lilljeborg, 1853) 136 Centropages longicornis Mori, 1932 长角胸刺水蚤 137 Centropages orsinii Giesbrecht, 1889 奥氏胸刺水蚤 138 Centropages sinensis Chen Zhang, 1965 中华胸刺水蚤 139 Centropages tenuiremis Thompson Scott, 1903 瘦尾胸刺水蚤 140 Centropages violaceus (Claus, 1863) 紫胸刺水蚤 141 Chiridiella macrodactyla Sars, 1907 粗指小袖水蚤  274 Chiridius gracilis Farran, 1908 瘦袖水蚤  275 Chiridius poppei Giesbrecht, 1892 波氏袖水蚤 276 Chirundina streetsii Giesbrecht, 1895 斯氏手水蚤 277 Clausocalanus arcuicornis (Dana, 1849) 弓角基齿哲水蚤 301 Clausocalanus farrani Sewell, 1929 法氏基齿水蚤 302 Clausocalanus furcatus (Brady, 1883) 长尾基齿哲水蚤 303 Clausocalanus ingens Frost Fleminger, 1968 304 Clausocalanus jobei Frost Fleminger, 1968 305 Clausocalanus laticeps Farran, 1929 宽头基齿哲水蚤 306 Clausocalanus lividus Frost Fleminger, 1968 307 Clausocalanus mastigophorus (Claus, 1863) 拟鞭基齿哲水蚤  308 Clausocalanus minor Sewell, 1929 小基齿哲水蚤  309 Clausocalanus parapergens Frost Fleminger, 1968 尖基齿哲水蚤  310 Clausocalanus paululus Farran, 1926 厚基齿水蚤  311 Clytemnestra scutellata Dana, 1848 硬鳞暴猛水蚤 490 Copilia lata Giesbrecht, 1891 大桨剑水蚤 461 Copilia longistylis Mori, 1932 长桨剑水蚤 462 Copilia mediterranea (Claus, 1863) 463 Copilia mirabilis Dana, 1849 奇桨剑水蚤 464 Copilia quadrata Dana, 1849 方桨剑水蚤/直桨剑水蚤 465 Copilia vitrea (Haeckel, 1864) 晶桨剑水蚤 466 Corycaeus (Agetus) flaccus Giesbrecht, 1891 柔大眼剑水蚤 395 Corycaeus (Agetus) limbatus Brady, 1883 菱形大眼剑水蚤 396 Corycaeus (Agetus) typicus (Kryer, 1849) 典型大眼剑水蚤 397 Corycaeus (Corycaeus) clausi F. Dahl, 1894 克氏大眼剑水蚤 398 Corycaeus (Corycaeus) crassiusculus Dana, 1849 微胖大眼剑水蚤 399 Corycaeus (Corycaeus) speciosus Dana, 1849 美丽大眼剑水蚤/ 长尾大眼剑水蚤 400 Corycaeus (Corycaeus) vitreus Dana, 1849 绿大眼剑水蚤 401 Corycaeus (Ditrichocorycaeus) affinis McMurrich, 1916 近缘大眼剑水蚤/日本大眼剑水蚤 402 Corycaeus (Ditrichocorycaeus) andrewsi Farran, 1911 亮大眼剑水蚤 403 Corycaeus (Ditrichocorycaeus) anglicus Lubbock, 1857 404 Corycaeus (Ditrichocorycaeus) asiaticus F. Dahl, 1894 东亚大眼剑水蚤 405 Corycaeus (Ditrichocorycaeus) dahli Tanaka, 1957 406 Corycaeus (Ditrichocorycaeus) erythraeus Cleve, 1904 红大眼剑水蚤 407 Corycaeus (Ditrichocorycaeus) lubbocki Giesbrecht, 1891 小突大眼剑水蚤 408 Corycaeus (Ditrichocorycaeus) subtilis M. Dahl, 1912 细大眼剑水蚤 409 Corycaeus (Monocorycaeus) robustus Giesbrecht, 1891 粗大眼剑水蚤 410 Corycaeus (Onychocorycaeus) agilis Dana, 1849 活泼大眼剑水蚤 411 Corycaeus (Onychocorycaeus) catus F. Dahl, 1894 灵巧大眼剑水蚤 412 Corycaeus (Onychocorycaeus) giesbrechti F. Dahl, 1894 短大眼剑水蚤 413 Corycaeus (Onychocorycaeus) ovalis Claus, 1863 卵大眼剑水蚤 414 Corycaeus (Onychocorycaeus) pacificus F. Dahl, 1894 太平洋大眼剑水蚤 415 Corycaeus (Onychocorycaeus) pumilus M. Dahl, 1912 小型大眼剑水蚤 416 Corycaeus (Urocorycaeus) furcifer Claus, 1863 叉大眼剑水蚤 417 Corycaeus (Urocorycaeus) lautus Dana, 1849 伶俐大眼剑水蚤 418 Corycaeus (Urocorycaeus) longistylis Dana, 1849 长刺大眼剑水蚤 419 Cosmocalanus darwini (Lubbock, 1860) 达氏波水蚤 215 Ctenocalanus vanus Giesbrecht, 1888 空栉哲水蚤  312 Cyclops vicinus Uijanin 近邻剑水蚤 502 Delius nudus (Sewell, 1929) 裸拟哲水蚤/ 印度隆哲水蚤  239 Dioithona oculata Farran, 1913 427 Dioithona rigida (Giesbrecht, 1896) 坚长腹剑水蚤 428 Disseta palumbii Giesbrecht, 1889 帕氏双刺水蚤 044 Disseta scopularis (Brady, 1883) 045 Euaugaptilus affinis Sars, 1920 近缘真亮羽水蚤 016 Euaugaptilus angustus (Sars, 1905) 017 Euaugaptilus elongatus (Sars, 1905) 瘦长真亮羽水蚤 018 Euaugaptilus facilis (Farran, 1908) 面真亮羽水蚤 019 Euaugaptilus filigerus (Claus, 1863) 线真亮羽水蚤 020 Euaugaptilus hecticus (Giesbrecht, 1889) 长毛真亮羽水蚤 021 Euaugaptilus laticeps (Sars, 1905) 宽头真亮羽水蚤 022 Euaugaptilus longimanus (Sars, 1905) 023 Euaugaptilus magnus (Wolfenden, 1904) 024 Euaugaptilus marginatus Tanaka, 1964 粗齿真亮羽水蚤 025 Euaugaptilus mixtus (Sars, 1907) 杂真亮羽水蚤 026 Euaugaptilus nodifrons (Sars, 1905) 瘤角真亮羽水蚤 027 Euaugaptilus palumbii (Giesbrecht, 1889) 帕氏真亮羽水蚤 028 Eucalanus bungii Giesbrecht, 1892 邦氏真哲水蚤 253 Eucalanus californicus Johnson, 1938 254 Eucalanus elongatus (Dana, 1849) 瘦长真哲水蚤 255 Eucalanus hyalinus (Claus, 1866) 256 Euchaeta acuta Giesbrecht, 1892 尖真刺水蚤 316 Euchaeta concinna Dana, 1849 精致真刺水蚤 317 Euchaeta indica Wolfenden, 1905 吴氏真刺水蚤 318 Euchaeta longicornis Giesbrecht, 1888 长角真刺水蚤 319 Euchaeta media Giesbrecht, 1888 中型真刺水蚤 320 Euchaeta plana Mori, 1937 平滑真刺水蚤 321 Euchaeta rimana Bradford, 1974 海洋真刺水蚤/ 叉真刺水蚤 322 Euchaeta spinosa Giesbrecht, 1892 小刺真刺水蚤 323 Euchaeta tenuis Esterly, 1906 瘦真刺水蚤 324 Euchirella amoena Giesbrecht, 1888 粗壮真胖水蚤 278 Euchirella bella Giesbrecht, 1888 秀丽真胖水蚤 279 Euchirella bitumida With, 1915 双突真胖水蚤  280 Euchirella curticauda Giesbrecht, 1888 短尾真胖水蚤 281 Euchirella galeatea Giesbrecht, 1888 盔头真胖水蚤  282 Euchirella maxima Wolfenden, 1905 巨真胖水蚤  283 Euchirella messinensis (Claus, 1863) 墨塞真胖水蚤/ 印度真胖水蚤 284 Euchirella orientalis Sewell, 1929 东方真胖水蚤  285 Euchirella pulchra (Lubbock, 1856) 锦真胖水蚤  286 Euchirella rostrata (Claus, 1866) 喙真胖水蚤 287 Euchirella speciosa Grice Hlsemann, 1968 288 Euchirella unispina Park, 1968 单刺真胖水蚤  289 Euchirella venusta Giesbrecht, 1888 丽真胖水蚤  290 Eurytemora affinis Poppe, 1880 191 Eurytemora pacificaSato, 1913 太平洋真宽水蚤 192 Euterpina acutifrons (Dana, 1848) 尖额谐猛水蚤 494 Farrania frigida (Wolfenden, 1911) 冷镰水蚤  313 Farrania orba (Tanaka, 1956) 缺足镰水蚤 314 Farranula carinata (Giesbrecht, 1891) 隆脊大眼剑水蚤 420 Farranula concinna (Dana, 1849) 精致大眼剑水蚤 421 Farranula gibbula (Giesbrecht, 1891) 驼背大眼剑水蚤 422 Farranula rostrata (Claus, 1863) 拟额大眼剑水蚤 423 Gaetanus brevicornis Esterly, 1906 短角枪水蚤  291 Gaetanus miles Giesbrecht, 1888 长角枪水蚤  292 Gaetanus minor Farran, 1905 小枪水蚤  293 Gaetanus pileatus Farran, 1903 帽形枪水蚤  294 Gaetanus pungens (Giesbrecht, 1895) 粗刺盾水蚤 295 Goniopsyllus rostratus Brady, 1883 有额暴猛水蚤 491 Haloptilus acutifrons (Giesbrecht, 1892) 锐额海羽水蚤 029 Haloptilus austini Grice, 1959 奥氏海羽水蚤 030 Haloptilus bulliceps Farran, 1926 宽额海羽水蚤 031 Haloptilus fertilis (Giesbrecht, 1892) 瘤海羽水蚤 032 Haloptilus longicirrus Brodsky, 1950 长须海羽水蚤 033 Haloptilus longicornis (Claus, 1863) 长角海羽水蚤 034 Haloptilus mucronatus (Claus, 1863) 尖额海羽水蚤 035 Haloptilus ornatus (Giesbrecht, 1892) 圆额海羽水蚤 036 Haloptilus oxycephalus (Giesbrecht, 1889) 尖头海羽水蚤 037 Haloptilus paralongicirrus Park, 1970 拟长须海羽水蚤 038 Haloptilus setuliger Tanaka, 1964 多毛海羽水蚤 039 Haloptilus spiniceps (Giesbrecht, 1892) 刺额海羽水蚤 040 Haloptilus tenuis Farran, 1908 瘦海羽水蚤 041 Harpacticus uniremis Kroyer, 1842 单尾猛水蚤 519 Heliodiaptomus falxus Shen and Tai 1964 镰钩明镖水蚤 503 Heterorhabdus abyssalis (Giesbrecht, 1889) 深异肢水蚤 046 Heterorhabdus ankylocolus Park, 2000 047 Heterorhabdus clausi (Giesbrecht, 1889) 克氏异肢水蚤 048 Heterorhabdus cohibilis Park, 2000 049 Heterorhabdus insukae Park, 2000 050 Heterorhabdus oikoumenikis Park, 2000 051 Heterorhabdus papilliger Claus, 1863 乳状异肢水蚤 052 Heterorhabdus spinifrons (Claus, 1863) 刺额异肢水蚤 053 Heterorhabdus spinosus Bradford, 1971 054 Heterorhabdus subspinifrons Tanaka, 1964 亚刺额异肢水蚤 055 Heterorhabdus tuberculus Park, 2000 056 Heterostylites longicornis (Giesbrecht, 1889) 长角异刺水蚤 057 Heterostylites submajor Park, 2000 058 Idya furcata (Baird, 1837) 分叉小猛水蚤 520 Kelleria propinquus (Scott T., 1894) 近邻开勒水蚤 521 Labidocera acuta (Dana, 1849) 尖刺唇角水蚤 146 Labidocera acutifrons (Dana, 1849) 锐唇角水蚤 147 Labidocera bataviae A. Scott, 1909 巴塔唇角水蚤 148 Labidocera detruncata (Dana, 1849) 后截唇角水蚤 149 Labidocera euchaeta Giesbrecht, 1889 真刺唇角水蚤 150 Labidocera japonica Mori, 1935 151 Labidocera kryeri (Brady, 1883) 科氏唇角水蚤 152 Labidocera laevidentata (Brady, 1883) 小齿唇角水蚤 153 Labidocera minuta Giesbrecht, 1889 小唇角水蚤 154 Labidocera pavo Giesbrecht, 1889 孔雀唇角水蚤 155 Labidocera rotunda Mori, 1929 双刺唇角水蚤 156 Labidocera sinilobata Shen Lee, 1963 左突唇角水蚤 157 Limnoithona sinensis (Burckhardt, 1912) 中华窄腹剑水蚤 429 Limnoithona tetraspina Zhang Li, 1976 四刺窄腹剑水蚤 430 Longipedia coronata Claus, 1863 花冠长脚水蚤 522 Lophothrix frontalis Giesbrecht, 1895 高额脊水蚤 346 Lophothrix latipes (T. Scott, 1894) 低额脊水蚤 347 Lubbockia aculeata Giesbrecht, 1891 针刺梭剑水蚤 424 Lubbockia marukawai Mori, 1937 马氏梭剑水蚤 425 Lubbockia squillimana Claus, 1863 掌刺梭剑水蚤 426 Lucicutia aurita Cleve, 1904 耳光水蚤 064 Lucicutia bicornuta Wolfenden, 1905 双角光水蚤 065 Lucicutia clausi (Giesbrecht, 1889) 克氏光水蚤 066 Lucicutia curta Farran, 1905 短光水蚤 067 Lucicutia flavicornis (Claus, 1863) 黄角光水蚤 068 Lucicutia gaussae Grice, 1963 卵形光水蚤 069 Lucicutia gemina Farran, 1926 双光水蚤 070 Lucicutia longiserrata (Giesbrecht, 1889) 长齿光水蚤 071 Lucicutia magna Wolfenden, 1903 大光水蚤 072 Lucicutia maxima Steuer, 1904 巨光水蚤 073 Lucicutia ovalis (Giesbrecht, 1889) 卵形等刺水蚤 074 Lucicutia tenuicauda Sars, 1907 瘦尾光水蚤 075 Lucicutia wolfendeni Sewell, 1932 吴氏光水蚤 076 Macandrewella joanae A. Scott, 1909 双刺麦壳水蚤 348 Macandrewella tuberculata Chen, 1987 小突麦壳水蚤 349 Macrochira brevipes Shen et Lee, 1966 短肢大蚩龙水蚤 523 Macrosetella gracilis (Dana, 1848) 瘦长毛猛水蚤 495 Mecynocera clausi Thompson, 1888 克氏长角哲水蚤 222 Megacalanus longicornis (Sars, 1905) 224 Mesocalanus tenuicornis (Dana, 1849) 细角新哲水蚤 216 Mesocyclops leuckarti (Claus) 广布中剑水蚤 刘氏中剑水蚤 504 Mesorhabdus angustus Sars, 1907 059 Mesorhabdus gracilis Sars, 1907 瘦半肢水蚤 060 Mesorhabdus poriphorus Park, 2000 061 Metacalanus aurivilli Cleve, 1901 欧氏后哲水蚤 007 Metridia brevicauda Giesbrecht, 1889 短尾长腹水蚤 077 Metridia curticauda Giesbrecht, 1889 078 Metridia macrura Sars, 1905 大长腹水蚤 079 Metridia princeps Giesbrecht, 1889 前长腹水蚤 080 Metridia venusta Giesbrecht, 1889 美丽长腹水蚤 081 Microcalanus pusillus Sars, 1903 小微哲水蚤  315 Microsetella norvegica (Boeck, 1864) 小毛猛水蚤 492 Microsetella rosea (Dana, 1848) 红小毛猛水蚤/挪威小星猛水蚤 493 Mimocalanus cultrifer Farran, 1908 刀仿哲水蚤 386 Miracia efferata (Dana, 1849) 496 Mixtocalanus alter (Farran, 1929) 异小厚壳水蚤 350 Monacilla gracilis (Wolfenden, 1911) 387 Monacilla typica Sars, 1905 典型异足水蚤  388 Mongolodiaptomus birulai (Rylov) 锥肢蒙哲水蚤 505 Mongolodiaptomus formosanus Kiefer, 1937 台湾蒙镖水蚤 506 Monstrilla grandis Giesbrecht, 1891 巨大怪水蚤 497 Mormonilla phasma Giesbrecht, 1891 长毛奇水蚤 498 Nannocalanus minor (Claus, 1863) 小哲水蚤 217 Neocalanus cristatus(Kryer, 1845) 218 Neocalanus gracilis (Dana, 1849) 瘦新哲水蚤 219 Neocalanus robustior (Giesbrecht, 1888) 粗新哲水蚤 220 Neodiaptomus handeli Brehm 韩氏新镖水蚤 507 Neodiaptomus schmackeri 右突新镖水蚤 508 Neodiaptomus yangtsekiangensis Mashiko 长江新哲水蚤 509 Neoscolecithrix japonica Ohtsuka, Boxshall Fosshagen, 2003 双齿卵毛水蚤 351 Neutrodiaptomus incongruens (Poppe) 特异荡哲水蚤 510 Nullosetigera aequalis (Sars, 1920) 等叶足水蚤 089 Nullosetigera bidentata (Brady, 1883) 双齿叶足水蚤 090 Nullosetigera helgae (Farran, 1908) 长指叶足水蚤 091 Nullosetigera impar (Farran, 1908) 异叶足水蚤 092 Nullosetigera mutata (Tanaka, 1964) 变叶足水蚤 093 Oithona atlantica Farran, 1908 431 Oithona attenuata Farran, 1913 细长腹剑水蚤 432 Oithona brevicornis Giesbrecht, 1891 短角长腹剑水蚤 433 Oithona davisae Ferrari Orsi, 1984 434 Oithona decipiens Farran, 1913 隐长腹剑水蚤 435 Oithona dissimilis Lindberg, 1940 436 Oithona fallax Farran, 1913 伪长腹剑水蚤 437 Oithona fragilis Nishida, 1979 438 Oithona hamata Rosendorn, 1917 439 Oithona linearis Giesbrecht, 1891 440 Oithona longispina Nishida, 1977 长刺长腹剑水蚤 441 Oithona nana Giesbrecht, 1892 小长腹剑水蚤 442 Oithona plumifera Baird, 1843 羽长腹剑水蚤 443 Oithona pseudofrigida Rosendorn, 1917 444 Oithona robusta Giesbrecht, 1891 粗长腹剑水蚤 445 Oithona setigera (Dana, 1849) 刺长腹剑水蚤 446 Oithona similis Claus, 1866 拟长腹剑水蚤/大同长腹剑水蚤 447 Oithona simplex Farran, 1913 简长腹剑水蚤 448 Oithona tenuis Rosendorn, 1917 瘦长腹剑水蚤 449 Oithona vivida Farran, 1913 敏长腹剑水蚤 450 Oithona wellershausi Ferrari, 1981 451 Oncaea clevei Frchtl, 1923 背突隆剑水蚤 452 Oncaea media Giesbrecht, 1891 中隆剑水蚤 453 Oncaea mediterranea (Claus, 1863) 等刺隆剑水蚤 454 Oncaea ornata Giesbrecht, 1891 锦隆剑水蚤 455 Oncaea venusta Philippi, 1843 丽隆剑水蚤 456 Onchocalanus cristatus (Wolfenden, 1904) 冠爪哲水蚤 337 Pachos dentatum (Mori, 1932) 齿厚剑水蚤 485 Pachos punctatum (Claus, 1863) 斑点厚剑水蚤 486 Paracalanus aculeatus Giesbrecht, 1888 针刺拟哲水蚤/短刺拟哲水蚤 240 Paracalanus gracilis Chen Zhang, 1965 瘦拟哲水蚤 241 Paracalanus indicus Wolfenden, 1905 242 Paracalanus intermedius Shen Bai, 1956 中型拟哲水蚤 243 Paracalanus nanus Sars, 1907 矮拟哲水蚤 244 Paracalanus parvus (Claus, 1863) 小拟哲水蚤 245 Paracalanus serrulus Shen Lee, 1963 锯缘拟哲水蚤 246 Paraeuchaeta biloba Farran, 1929 325 Paraeuchaeta bisinuata (Sars, 1907) 326 Paraeuchaeta elongata (Esterly, 1913) 327 Paraeuchaeta flava (Giesbrecht, 1888) 黄拟真刺水蚤 328 Paraeuchaeta gracilicauda A. Scott, 1909 329 Paraeuchaeta investigatoris Sewell, 1929 330 Paraeuchaeta malayensis Sewell, 1929 马来拟真刺水蚤 331 Paraeuchaeta rubra Brodsky, 1950 332 Paraeuchaeta russelli (Farran, 1936) 芦氏拟真刺水蚤 333 Paraeuchaeta tuberculata A. Scott, 1909 舟拟真刺水蚤/瘤拟真刺水蚤 334 Paraeuchaeta vorax (Grice Hulsemann, 1968) 335 Paraeuchaeta weberi A. Scott, 1909 韦氏拟真刺水蚤 336 Paraheterorhabdus (Antirhabdus) compactus (Sars, 1900) 密异肢水蚤 062 Paraheterorhabdus (Paraheterorhabdus) vipera (Giesbrecht, 1889) 蛇异肢水蚤 063 Paraugaptilus buchani Wolfenden, 1904 布氏拟亮羽水蚤 008 Pareucalanus attenuatus (Dana, 1849) 细真哲水蚤/伪细真哲水蚤 257 Pareucalanus langae (Fleminger, 1973) 258 Pareucalanus sewelli (Fleminger, 1973) 259 Parvocalanus crassirostris (F. Dahl, 1894) 强额拟哲水蚤 247 Phaenna spinifera Claus, 1863 刺褐水蚤 338 Phyllodiaptomus tunguidus Shen and Tai 1964 舌状叶镖水蚤 511 Pleuromamma abdominalis (Lubbock, 1856) 腹突乳点水蚤 082 Pleuromamma borealis (F. Dahl, 1893) 北方乳点水蚤 083 Pleuromamma gracilis (Claus, 1863) 瘦乳点水蚤 084 Pleuromamma piseki Farran, 1929 085 Pleuromamma quadrungulata (F. Dahl, 1893) 四刺乳点水蚤 086 Pleuromamma robusta (F. Dahl, 1893) 粗乳点水蚤 087 Pleuromamma xiphias (Giesbrecht, 1889) 剑乳点水蚤 088 Pontella alata A. Scott, 1909 158 Pontella chierchiae Giesbrecht, 1889 叉刺角水蚤 159 Pontella danae Giesbrecht, 1889 丹氏角水蚤 160 Pontella denticauda A. Scott, 1909 161 Pontella fera Dana, 1849 阔节角水蚤 162 Pontella kieferi Pesta, 1933 克福角水蚤 163 Pontella latifurca Chen Zhang, 1965 宽尾角水蚤 164 Pontella princeps Dana, 1849 前角水蚤 165 Pontella securifer Brady, 1883 腹斧角水蚤 166 Pontella sinica Chen Zhang, 1965 中华角水蚤 167 Pontella spinicauda Mori, 1937 刺尾角水蚤 168 Pontella tenuiremis Giesbrecht, 1889 169 Pontella tridactyla Shen Lee, 1963 三指角水蚤 170 Pontellina morii Fleminger Hulsemann, 1974 171 Pontellina plumata (Dana, 1849) 羽小角水蚤 172 Pontellopsis armata (Giesbrecht, 1889) 武装简角水蚤 173 Pontellopsis inflatodigitata Chen Shen, 1974 扩指简角水蚤 174 Pontellopsis krmeri (Giesbrecht, 1896) 克氏简角水蚤 175 Pontellopsis macronyx A. Scott, 1909 长指简角水蚤 176 Pontellopsis regalis (Dana, 1849) 皇简角水蚤 177 Pontellopsis strenua (Dana, 1849) 勇简角水蚤 178 Pontellopsis tenuicauda (Giesbrecht, 1889) 瘦尾简角水蚤 179 Pontellopsis villosa Brady, 1883 粗毛简角水蚤 180 Pontellopsis yamadae Mori, 1937 钝简角水蚤 181 Pontoeciella abyssicola (T. Scott, 1894) 深角剑水蚤 499 Pseudaugaptilus orientalis Tanaka, 1964 东方伪亮羽水蚤 042 Pseudhaloptilus eurygnathus (Sars, 1920) 043 Pseudoamallothrix emarginata (Farran, 1905) 微凸小厚壳水蚤 352 Pseudoamallothrix ovata (Farran, 1905) 卵形小厚壳水蚤 353 Pseudochirella scopularis (Sars, 1905) 茸伪胖水蚤 296 Pseudodiaptomus annandalei Sewell, 1919 双齿许水蚤 182 Pseudodiaptomus forbesi (Poppe Richard, 1890) 球状许水蚤 183 Pseudodiaptomus incisus Shen Lee, 1963 缺刻伪哲水蚤 184 Pseudodiaptomus inopinus Burckhardt, 1913 指状许水蚤 185 Pseudodiaptomus marinus Sato, 1913 海洋伪哲水蚤 186 Pseudodiaptomus pacificus Walter, 1986 187 Pseudodiaptomus penicillus Li Huang, 1984 刷状伪哲水蚤 188 Pseudodiaptomus poplesia (Shen, 1955) 火腿许水蚤 189 Pseudodiaptomus trihamatus Wright, 1937 190 Racovitzanus levis Tanaka, 1961 平滑异尾水蚤 354 Ratania flava Giesbrecht, 1892 黄棒剑水蚤 500 Rhincalanus cornutus (Dana, 1849) 角锚哲水蚤 265 Rhincalanus nasutus Giesbrecht, 1888 鼻锚哲水蚤 266 Rhincalanus rostrifrons (Dana, 1849) 彩额锚真哲水蚤 267 Sapphirina angusta Dana, 1849 狭叶剑水蚤 467 Sapphirina auronitens Claus, 1863 曙光叶剑水蚤 468 Sapphirina bicuspidata Giesbrecht, 1891 双尖叶剑水蚤 469 Sapphirina darwini Haeckel, 1864 达氏叶剑水蚤 470 Sapphirina gastrica Giesbrecht, 1891 胃叶剑水蚤 471 Sapphirina gemma Dana, 1849 芽叶剑水蚤 472 Sapphirina intestinata Giesbrecht, 1891 肠叶剑水蚤 473 Sapphirina iris Dana, 1849 虹叶剑水蚤 474 Sapphirina lactens Giesbrecht, 1892 狭尾叶剑水蚤 475 Sapphirina maculosa Giesbrecht, 1892 斑点叶剑水蚤 476 Sapphirina metallina Dana, 1849 金叶剑水蚤 477 Sapphirina nigromaculata Claus, 1863 黑点叶剑水蚤 478 Sapphirina opalina Dana, 1849 玛瑙叶剑水蚤 479 Sapphirina ovatolanceolata Dana, 1849 圆矛叶剑水蚤 480 Sapphirina scarlata Giesbrecht, 1891 红叶剑水蚤 481 Sapphirina sinuicauda Brady, 1883 弯尾叶剑水蚤 482 Sapphirina stellata Giesbrecht, 1891 星叶剑水蚤 483 Scaphocalanus brevicornis (Sars, 1900) 短角舟哲水蚤 355 Scaphocalanus echinatus (Farran, 1905) 锯齿舟哲水蚤 356 Scaphocalanus longifurca (Giesbrecht, 1888) 长叉舟哲水蚤 357 Scaphocalanus magnus (T. Scott, 1894) 大舟哲水蚤 358 Scaphocalanus major (T. Scott, 1894) 巨舟哲水蚤 359 Scolecithricella abyssalis (Giesbrecht, 1888) 深小厚壳水蚤 360 Scolecithricella dentata (Giesbrecht, 1892) 叶足小厚壳水蚤 361 Scolecithricella globulosa Brodsky, 1950 362 Scolecithricella longispinosa Chen Zhang, 1965 长刺小厚壳水蚤 363 Scolecithricella marginata (Giesbrecht, 1888) 364 Scolecithricella minor (Brady, 1883) 小型小厚壳水蚤 365 Scolecithricella nicobarica (Sewell, 1929) 缘齿厚壳水蚤 366 Scolecithricella tenuiserrata (Giesbrecht, 1892) 细齿小厚壳水蚤 367 Scolecithricella timida Tanaka, 1962 弱小厚壳水蚤 368 Scolecithricella tropica Grice, 1962 热带小厚壳水蚤 369 Scolecithricella vittata (Giesbrecht, 1892) 活泼小厚壳水蚤 370 Scolecithrix bradyi Giesbrecht, 1888 伯氏小厚壳水蚤 371 Scolecithrix danae (Lubbock, 1856) 丹氏厚壳水蚤 372 Scolecithrix fowleri Farran, 1926 法氏小厚壳水蚤 373 Scolecithrix valens Farran, 1926 强小厚壳水蚤 374 Scolecitrichopsis ctenopus (Giesbrecht, 1888) 栉小厚壳水蚤 375 Scolecocalanus spinifer C.B. Wilson, 1950 376 Scottocalanus farrani A. Scott, 1909 法氏暗哲水蚤 377 Scottocalanus helenae (Lubbock, 1856) 海伦暗哲水蚤/ 奥暗哲水蚤 378 Scottocalanus persecans (Giesbrecht, 1895) 叉暗哲水蚤 379 Scottocalanus rotundatus Tanaka, 1961 圆暗哲水蚤 380 Scottocalanus securifrons (T. Scott, 1894) 斧暗哲水蚤 381 Scottocalanus sedatus Farran, 1936 静暗哲水蚤 382 Scottocalanus terranovae Farran, 1929 383 Scottocalanus thomasi A. Scott, 1909 汤氏暗哲水蚤 384 Sinocalanus dorrii (Brehm, 1909),Sinocalanus mystrophorus Nurckhardt 1913 合并到该种 汤匙华哲水蚤 神秘华哲水蚤 512 Sinocalanus laevidactylus Shen et Tai 左指华哲水蚤 513 Sinocalanus sinensis (Poppe) 中华华哲水蚤 514 Sinocalanus solstitialis Brehm 长日华哲水蚤 515 Sinocalanus tenellus 细巧华哲水蚤 516 Spinocalanus angusticeps Sars, 1920 窄头刺哲水蚤 389 Spinocalanus horridus Wolfenden, 1911 粗刺哲水蚤 390 Spinocalanus magnus Wolfenden, 1904 大刺哲水蚤  391 Spinocalanus oligospinosus Park, 1970 寡毛刺哲水蚤 392 Spinocalanus spinosus Farran, 1908 多毛刺哲水蚤 393 Spinocalanus usitatus Park, 1970 394 Stephos pentacanthos Chen Zhang, 1965 五刺冠水蚤 385 Subeucalanus crassus (Giesbrecht, 1888) 强真哲水蚤 260 Subeucalanus mucronatus (Giesbrecht, 1888) 尖额真哲水蚤 261 Subeucalanus pileatus (Giesbrecht, 1888) 帽形真哲水蚤 262 Subeucalanus subcrassus (Giesbrecht, 1888) 亚强真哲水蚤 263 Subeucalanus subtenuis (Giesbrecht, 1888) 狭额真哲水蚤 264 Temora discaudata Giesbrecht, 1889 异尾宽水蚤 193 Temora stylifera Dana, 1849 柱形宽水蚤 194 Temora turbinata (Dana, 1849) 锥形宽水蚤 195 Temorites brevis Sars, 1900 短小宽水蚤 248 Temorites longicornis (Tanaka, 1965) 长角深角水蚤 249 Temorites minor (Wolfenden, 1906) 小深角水蚤 250 Temorites similis (Tanaka, 1965) 拟深角水蚤 251 Temorites spinifera (A. Scott, 1909) 刺深角水蚤 252 Temoropia mayumbaensis T. Scott, 1894 腹突拟宽水蚤 142 Thermocyclops mongolicus 蒙古温剑水蚤 517 Tortanus (Atortus) murrayi A. Scott, 1909 小突歪水蚤 196 Tortanus (Atortus) scaphus Bowman, 1971 杓状歪水蚤 197 Tortanus (Atortus) sinicus Chen, 1983 中华歪水蚤 198 Tortanus (Atortus) taiwanicus Chen Hwang, 1999 199 Tortanus (Atortus) tumidus Chen, Hwang Yin, 2004 200 Tortanus (Boreotortanus) discaudatus (Thompson Scott, 1897) 201 Tortanus (Eutortanus) derjugini Smirnov, 1935 捷氏歪水蚤 202 Tortanus (Eutortanus) dextrilobatus Chen Zhang, 1965 右突歪水蚤 203 Tortanus (Eutortanus) sheni Hulsemann, 1988 锯齿歪水蚤 204 Tortanus (Eutortanus) spinicaudatus Shen Bai, 1956 刺尾歪水蚤 205 Tortanus (Eutortanus) vermiculus Shen, 1955 虫肢歪水蚤 206 Tortanus (Tortanus) barbatus (Brady, 1883) 须歪水蚤 207 Tortanus (Tortanus) forcipatus Giesbrecht, 1889 钳形歪水蚤 208 Tortanus (Tortanus) gracilis (Brady, 1883) 瘦歪水蚤 209 Triconia conifera (Giesbrecht, 1891) 角突隆剑水蚤 457 Triconia dentipes (Giesbrecht, 1891) 齿隆剑水蚤 458 Triconia minuta Giesbrecht, 1892 小隆剑水蚤 459 Triconia similis (Sars, 1918) 拟隆剑水蚤 460 Tropodiaptomus oryzanus Kiefer 米粒近哲水蚤 518 Undeuchaeta incisa Esterly, 1911 缺刻波刺水蚤 297 Undeuchaeta intermedia A. Scott, 1909 中型波刺水蚤 298 Undeuchaeta major Giesbrecht, 1888 大波刺水蚤 299 Undeuchaeta plumosa (Lubbock, 1856) 羽波刺水蚤 300 Undinula vulgaris (Dana, 1849) 普通波水蚤 221 Vettoria granulosa (Giesbrecht, 1891) 颗粒心剑水蚤 484 Xanthocalanus agilis Giesbrecht, 1892 活泼黄水蚤 339 Xanthocalanus dilatus Grice, 1962 双突黄水蚤 340 Xanthocalanus multispinus Chen Zhang, 1965 多刺黄水蚤 341 Xanthocalanus pulcher Esterly, 1911 美丽黄水蚤 342
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[转载]科学家绘制基因相互作用图谱
annehuang 2010-3-21 13:43
科学家绘制基因相互作用图谱 加拿大多伦多大学的科学家找到了一种方法,可绘制出表现细胞内基因之间相互作用的图谱。这一重大突破可帮助科学家更好地理解疾病的成因,进而制定目标更为精确的药物治疗方案。 尽管人类基因组图谱已经绘制成功,但是这些基因的功能和彼此之间的相互作用并未充分地为科学家所知晓。由多伦多大学特伦斯唐纳里细胞与生物分子研究中心主任布伦达安德鲁斯,以及该中心首席研究员查尔斯布恩领导的国际研究小组开发了一种方法,能够破解因自然遗传变异而引起的细胞内基因的相互作用奥秘。安德鲁斯表示,此前没有人制作过关于基因相互作用的图谱,这项成果使得研究人员有可能破解一个细胞内全部数千个基因的功能。 研究小组在1月25日出版的《科学》杂志上发表报告称,他们利用酵母细胞开发出了这种图谱绘制方法,可以解读其细胞内基因的相互作用,这是首次在生物体上进行这样的工作。由于酵母细胞同人类细胞的基因非常相似,这项研究可以极大地促进各项关系到人类健康的研究,比如更好地了解疾病的遗传基础等。同时,这样一份图谱还能提供有价值的信息,有助于认识人类个体的基因型(一个人独有的基因组成)和表型(此人的基因的行为表现)之间的联系,从而了解当身体患上某种疾病时,是哪些基因相互作用导致出现问题。 研究小组还绘制出基因和化学药品之间的相互作用图谱,以更好地预测药物对细胞的作用,使未来在确定治疗方案时更能够对症下药。(来源:科技日报 陈丹) 引用地址: http://paper.sciencenet.cn//htmlpaper/2010318104747168657.shtm
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