最新一期的 Science 公布了基于人类蛋白质图谱的大分析结果,包括与癌症相关的详细蛋白质图片,血液中蛋白质种类和数量,以及市场上被批准的所有药物所作用的目标蛋白质。 人类蛋白质图谱(The Human Protein Atlas),是由Knut and Alice Wallenberg基金会于2014年11月支持的一个大型跨国研究项目。近期他们又开放了一个以人器官组织为基础的蛋白质图谱数据库。基于1300万个注释的图像,整个数据库涵盖了人体中的所有主要组织和器官的蛋白质分布,也标注了仅表达在特定组织,如脑,心脏或肝脏的蛋白。作为一个开放的数据资源,这个数据库提高了对人类生物学的基本见解,更有望帮助推动新的诊断和药物的开发。 在 Scienc e的这篇文章里,基于组织的人类蛋白质组图谱 结合基因组学,转录组学,蛋白质组学,以及基于抗体的分析,详细分析了大约20,000个蛋白质编码基因。分析结果表明,蛋白编码基因几乎一半都是普遍表达在所有分析的组织。而有大概的15%的蛋白质编码基因大量表达在一个或几个特定的组织或器官,包括众所周知的组织特异性蛋白质,如胰岛素和肌钙蛋白。睾丸是含有最丰富种类蛋白质的器官,其后是大脑和肝脏。分析结果还表明,大约3000种蛋白质是从细胞中分泌释放的,另有5500种蛋白位于细胞膜结构。 这一蛋白质图分析结果为制药行业的提供了重要信息。研究小组的Uhlén表示,他们发现了市场上使用的药品有70%的作用目标是分泌或膜结合蛋白。有趣的是,另外30%被发现是作用其他组织和器官,这可能有助于解释药物的一些副作用,并且对未来药物开发提供一定的参考价值。 该数据库已经免费对外开放,网址是www.proteinatlas.org
刚收到有WILEY出版的电镜诊断图谱-Diagnostic Electron Microscopy,我参与编写了其中一部分。很高兴,有一点成就感。中国人很少有人愿意花时间编写好的图谱,可能因为晋升用不上,基金申请也没用吧。我认为编写高质量的图谱对国家的科学发展来说是一件重要事情,更能体现一个国家的科学实力。 晒晒就可以了。 1
110217-Graphs_with_given_diameter_maximizing_the_algebraic_connectivity.pdf 110217-评论文章fyi2.zip 两篇图谱的综述与应用 1。R E S E A R C H R E P O R T APPLICATIONS OF GRAPH SPECTRA TO COMPUTER SCIENCE1 Graph Spectral Techniques as Tools in Information and Communication Technologies Dragos Cvetkovic, Mathematical Institute SANU, Beograd with collaborators Tatjana Aleksic, University of Kragujevac, Faculty of Sciences Slobodan Simic, Mathematical Institute SANU, Beograd Dragan Stevanovic, University of Nis, Faculty of Sciences Ljiljana Trajkovic, Simon Fraser University, Vancouver Email: ecvetkod@etf.rs , aleksictatjana@yahoo.com , sksimic@mi.sanu.ac.rs , dragance106@yahoo.com , ljilja@cs.sfu.ca March 10, 2010 Mathematical Institute SANU P.O. Box 367, 11000 Belgrade, Serbia Abstract. In this report we shall give a survey of applications of the theory of graph spectra to computer science. Eigenvalues and eigenvectors of several graph matrices appear in numerous papers on various subjects relevant to information and communication technologies. Keywords: graph theory, graph spectra, applications, computer science, information technology, communication technology, internet, complex networks AMS Classi cation: 05C50 , 68M07, 68P20, 68R10 2。APPLICATIONS OF GRAPH SPECTRA: AN INTRODUCTION TO THE LITERATURE Dragoˇs Cvetkovic Abstract. We give basic definitions and some results related to the theory of graph spectra. We present a short survey of applications of this theory. In addition, selected bibliographies on applications to particular branches of science are given. Mathematics Subject Classification (2000): 05C50, 05C90, 01A90 Keywords: graph spectra, application, bibliography, chemistry, physics, computer science