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histcite使用的一些更新
flowball 2016-1-31 18:06
histcite最初从科大罗昭锋老师blog了解到,可以由web of science(WOS)上下载的数据绘制引用关系图。 感觉对快速把握一个领域的核心文章很有帮助,源链接见这里 http://blog.sciencenet.cn/blog-304685-383399.html 官方给了一个免费的版本: http://science.thomsonreuters.com/scientific/m/HistCiteInstaller.msi 截止今天(2016-1-31)还可以下载。 可能由于版本变化等原因,需要手动做一些修改才能正确导入数据。 1. 在WOS上选择核心数据库(core),才能导出完整的引文信息。 2. 导出的文本文件,用任意文本编辑器打开,将第六个单词(Science™)改为Knowledge™ 3. 在导入histcite时,如果显示fakepath找不到,需要手动建立C:\fakepath文件夹,然后将txt先都copy进去,再导入 例子完成图: 1. 75 Patricelli MP, 2001, PROTEOMICS, V1, P1067 15 160 2. 79 Greenbaum D, 2002, MOL CELL PROTEOMICS, V1, P60 14 193 3. 107 Kumar S, 2004, P NATL ACAD SCI USA, V101, P7943 9 101 4. 137 Kato D, 2005, NAT CHEM BIOL, V1, P33 16 180 5. 156 Schmidinger H, 2006, AMINO ACIDS, V30, P333 6 40 6. 157 Pan ZY, 2006, BIOORG MED CHEM LETT, V16, P2882 6 35 7. 170 Fonovic M, 2007, CURR PHARM DESIGN, V13, P253 76 8. 175 Sadaghiani AM, 2007, CURR OPIN CHEM BIOL, V11, P20 11 122 9. 188 Blum G, 2007, NAT CHEM BIOL, V3, P668 8 179 10. 213 Weerapana E, 2008, NAT CHEM BIOL, V4, P405 13 87 11. 222 Fonovic M, 2008, EXPERT REV PROTEOMIC, V5, P721 8 89 12. 293 Weerapana E, 2010, NATURE, V468, P790 15 249
个人分类: tools|4570 次阅读|0 个评论
从菜鸟到达人-高效文献检索策略
热度 1 smilesun 2013-6-14 08:44
转自我的新浪博客: http://blog.sina.com.cn/s/blog_68be25e10101l5mz.html#comment1 以后新浪博客会比这里更新个更快。 以下这张图是今晚总结《文献管理与信息分析》课程时给出的一张图,掌握此图基本就掌握了此课程的精髓部分。 核心理念是:获取和阅读最重要的信息才是快速学习的根本! 面对海量的信息,无法逐一阅读,如果能阅读最重要的文献,就可以短时间获得最有价值的信息。如同我们做拼图游戏,如果手头有几块大的组件,很容易拼出全图;如果都是一些碎片,或许永远品不出全貌。文献阅读亦如此,其它领域的学习也是如此。不管你想了解什么领域,一定要尽可能阅读最重要的文献。这样才不会被海量的信息所淹没,才不会迷失方向。 操作步骤: 步骤一、检索 如果一无所知,建议通过SE进行初步了解 针对WOS收录的学科领域, 在WOS中进行检索 通过数据库的分析改进检索 通过endnote分析关键词并改进检索 步骤二、histcite分析 通过histcite做图初步判断检索的准确性,如有需要返回并改进检索 通过引文分析查找遗漏的关键文献,并予以补充 通过LCS和LCR确定待阅读文献 通过做图(graph marker)确定优先阅读次序 输出LCS前30篇和LCR前20篇到endnote 步骤三、文献下载和阅读 通过endnote下载重要文献全文 根据histcite确定的次序,阅读并做笔记 步骤四、思维导图整理 利用思维导图并参考histcite的做图对文献进行整理 根据思维导图,发现相互关联并寻找新的突破点 ------------------------------------------------- 以上只适合WOS收录的学科。 对于WOS未收录的学科,本人的建议是: 建议充分利用数据库的分析功能 利用文献管理软件的分析功能 利用其它分析工具进行分析 ------------------------------------------------- 信息分析正变得越来越重要(80/20),要争取通过阅读最少的文献,获取最大量的信息。 ------------------------------------------------- 阅读最有价值的资料才是高效学习的王道!不光指文献,其它领域的快速学习也是如此!
个人分类: 文献管理与信息分析|44437 次阅读|3 个评论
第九讲 引文分析软件HistCite简介
热度 3 smilesun 2012-4-15 09:49
《文献管理与信息分析》课程报告内容之一: 可以帮助你快速找出一个领域的关键文献;绘制出一个领域的发展脉络;发现关键词遗漏的重要文献等等。 文字版介绍可以参考科学网博文 http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=spaceuid=304685do=blogid=383399 屏幕录像的视频(用压缩包中的播放器观看) http://biotech.ustc.edu.cn/upload/RMRA/2012/20120412Histcite.rar 现场视频录像在线观看地址 http://dsxtmovie.ustc.edu.cn/dsxtMoviePlay.asp?cvid=1430 http://dsxtmovie.ustc.edu.cn/dsxtMoviePlay.asp?cvid=1431 现场视频录像下载地址 http://dsxtmovie.ustc.edu.cn/dsxtMovieRead.asp?cvUniqId=ca6091f8411ae1bf081d1674ca6091f8c59a266f1430 http://dsxtmovie.ustc.edu.cn/dsxtMovieRead.asp?cvUniqId=14ae69c2e11943a6031a0e6114ae69c2576179801431
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HistCite分析结果示例的视频讲解
热度 2 smilesun 2011-4-21 23:12
今晚的《文献管理与信息分析》课程主要讲解 引文分析软件HistCite,这个软件的操作并不难。 主要理解几个参数基本就可以了。 文献分析软件的难点在于对分析结果的解释上,如何根据软件分析的结果,得出有价值的信息。 下面的视频中,选取了部分学生的作业图,进行了一些分析。 这些分析带有个人的主观性,未必都正确,仅供大家参考。 视频和ppt下载 http://biotech.ustc.edu.cn/upload/RMRA/2011/HistCitesample.pptx http://biotech.ustc.edu.cn/upload/RMRA/2011/sample.wmv 今晚的课件忘了录制屏幕了,希望全面学习HistCite软件的朋友可以参照我三月份的报告, 科研工作者的信息修炼 系列之三 http://biotech.ustc.edu.cn/forum/viewthread.php?tid=9036extra=page%3D1
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科研工作着的信息修炼系列全部课件及现场视频
热度 6 smilesun 2011-3-30 22:22
科研工作者的信息修炼系列报告由中科大图书馆和生命科学实验中心联合举办。 分别从:1、快速信息获取;2、高效信息管理;3、深度信息挖掘;4、思维工具四个方 面举办了四场报告。 每次报告分别于周二晚在东区1302教室,周三晚在西区3117教室举行,历时四周。 这次报告得到一些资深教授、图书馆老师、广大同学以及众多网友的热情支持,在此一 并表示感谢。 四场报告的所有课件,pptx格式和pdf格式,以及现场的视频录像,都可以从下面地址下 载: http://biotech.ustc.edu.cn/forum/viewthread.php?tid=9036extra=page%3D1page=1 如果你觉得这些报告对你有帮助,欢迎介绍给你身边的朋友。 尽管我一直努力让更多的人知道这些有用的工具,但一个人的力量毕竟是微弱的。我已 经做了近7年的文献管理软件endnote的推广,仍有很多人不曾听说或不会使用。因此, 推广这些工具需要您的共同参与。对所有帮助推广和传播这些工具的朋友,在此一并表 示感谢。 今后我还会继续为大家介绍有用的工具和资源,希望用这种方式来实现我们的梦想:通 过提高科研工作者的效率,来推动科技进步。 如果你愿意继续关注我的报告或课程,可以通过以下途径和我保持联系: 生命科学实验中心论坛 http://biotech.ustc.edu.cn/forum 科学网博客 http://blog.sciencenet.cn/u/smilesun 更及时的消息,我会第一时间发布在新浪微博上 http://t.sina.com.cn/science20
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科研工作者的信息修炼系列之三:引文分析软件HistCite简介
热度 4 smilesun 2011-3-19 19:29
#科研工作者的信息修炼#系列报告之三,引文分析软件HistCite培训将于下周二、周三 举办。 Histcite能够帮助我们快速锁定一个领域的重要文献、重要作者和重要的研究机构,帮 助我们快速绘制出一个领域的发展脉络,以及找到一个领域最新的进展情况。 在所有文献分析软件当中,这个软件可能算是学习成本最低的一个。 这个软件适合WOS收录的学科。当你想了解一个领域的整体情况,这个软件可以帮你节约 筛选文献的时间。 适合刚进入科研的研究生,以及想法非常多的科研人员,因为你需要快速了解一些并不是非常熟悉的领域。 如果你错过了之前的两场报告,下面有培训课件和视频录像下载 http://biotech.ustc.edu.cn/forum/viewthread.php?tid=9036extra=page%3D1 本次报告时间地点: 第一场 3月22日晚7:30东区1302教室 第二场 3月23日晚7:30西区3117教室
个人分类: 文献管理与信息分析|9136 次阅读|6 个评论
科研工作者的信息修炼系列报告-日程安排
热度 4 smilesun 2011-3-13 14:08
科研工作者的信息修炼系列报告,致力于为您提供高效的信息解决方案,提高您的工作效率,推动科学进步。 当时间变得越来越宝贵时,您是否希望自己每天拥有 25 小时?其实,只要我们把平时 2 小时完成的工作,用更高效的方法在 1 小时内完成,那么我们的一天就变成了 25 小时。 学习高效的方法能让我们的工作和学习更轻松,每天拥有更多的时间,也是最好的时间投资。但人总是有惰性的,我们总是愿意用自己熟悉的方法,去做自己熟悉的事情。我们整日忙碌,很可能是因为我们放弃了学习,不愿意学习更高效的工作方法。对新生事物,我们总会难免有排斥和畏惧心理,觉得不习惯或者是太难了。这次组织的系列报告充分考虑了学习的难易程度,保证两小时能让您得心应手地使用它们。网络和信息技术的发展,已经极大地改变了社会。海量的信息、更快的节奏、激烈的科研竞争,稍有懈怠,我们重要的发现很可能不再是首创,而成为了别人的重复实验。面对变化了的社会,我们必须做出改变。 科研工作者的信息修炼系列 报告分别从 文献信息收集 、 文献信息管理 、 文献信息分析 以及 思维导图和创新 等方面介绍几个简单实用的重要工具。切实提升您的工作效率,助力科研。具体内容和安排如下: 系列报告之一: 同步世界最新资讯 -RSS ,科研工作者的必备武器 介绍如何利用 RSS 实时高效追踪大量的信息资源,实时关注世界某个研究领域、某个研究组的最新进展。使用 RSS 订阅,您无需登陆数据库或者杂志社网站,所有资讯一网打尽。可以大大缩短您每天阅读文献、获取信息的时间。 时间地点 1 : 3 月 8 日晚, 7 : 30 ,东区 1302 教室 时间地点 2 : 3 月 9 日晚, 7 : 30 ,西区 3117 教室 PPT 和现场视频录像下载见: http://biotech.ustc.edu.cn/forum 2011 文献管理与信息分析 版 或直接点击 http://biotech.ustc.edu.cn/forum/forumdisplay.php?fid=110page=1 系列报告之二: 文献管理软件 EndnoteX4 简介 大名鼎鼎的文献管理软件,可以帮助你高效管理海量文献信息,撰写论文或书籍时自动编辑参考文献格式,快速进行文献统计分析,自动下载文献全文,支持自动将 pdf 导入到数据库中等功能。 时间地点 1 : 3 月 15 日晚, 7 : 30 ,东区 1302 教室 时间地点 2 : 3 月 16 日晚, 7 : 30 ,西区 3117 教室 系列报告之三: 文献信息分析软件 HistCite 简介 基于引文的分析软件,利用 WOS 的数据库,快速锁定某个领域的重要文献,并自动绘制出文献之间的关联图。可快速绘出某一个领域的发展脉络,也可洞察一个领域的最新进展。该软件适用于 WOS 数据库中有大量文献收录的学科。这款免费的软件对从事交叉科学研究,经常关注其它领域进展的研究者,以及研究生都具有重要的参考价值。 时间地点 1 : 3 月 22 日晚, 7 : 30 ,东区 1302 教室 时间地点 2 : 3 月 23 日晚, 7 : 30 ,西区 3117 教室 系列报告之四: 思维导图软件 mindmanager 应用指南 思维导图软件充分利用图像化思维,开启大脑的潜能,提高学习和工作效率,提升创新能力。无论是项目规划、课题讨论、头脑风暴、目标设定、时间管理、资源分配、创新思考、会议报告,还是人生规划,在任何关键时刻,面对错综复杂的事情,思维导图都可以给您最有力的支持!思维导图软件 mindmanager 同 Microsoftoffice 软件无缝集成,可以快速将 mindmanager 文件导出到 Word 、 Power Point 、 Excel 、 Outlook 、 Project 和 Visio 等软件中,受到众多高效人士的青睐。 时间地点 1 : 3 月 29 日晚, 7 : 30 ,东区 1302 教室 时间地点 2 : 3 月 30 日晚, 7 : 30 ,西区 3117 教室 本次系列报告为满足广大老师和同学的需求,在东西区各安排一场。东区于周二晚 7 : 30 ,在 1302 教室。西区于周三晚在 3117 教室。两场报告内容相同,您可以根据自己的情况自行安排。 报告人简介: 罗昭锋,图书馆高级顾问,生命科学实验中心高级实验师,国内知名的培训师。在我校开设了《文献管理与信息分析》课程,在国内同行中获得高度认可。多年来,致力于推广高效实用的科研工具,提升科研者的工作效率。编写的《 EndnoteX 中文手册》、《文献管理与文献信息分析》等电子手册在网上广为流传。录制的《 EndnoteX3 系列视频教程》被八十多个网站引用和转载,仅在生命科学实验中心论坛就被访问了四万八千多次,受到科研工作者、广大研究生以及同行的一致好评,在国内享有较高声誉。 罗昭锋老师的报告通俗易懂、风趣幽默,课堂气氛活跃,能让您在轻松愉快的氛围中掌握最实用的技能。欢迎广大师生踊跃参加。 举办单位:图书馆 / 生命科学实验中心 2011/03/10
个人分类: 文献管理与信息分析|9860 次阅读|5 个评论
[转载]Histcite 9.8.24 现在已经可以免费使用
热度 8 smilesun 2011-2-28 22:00
感谢中科大生命科学实验中心论坛 jzguowhu 网友 Histcite 9.8.24 现在已经可以免费使用 Thomson Reuters公司居然大发慈悲,把Histcite 软件 改成了免费了,如图(附件)有真相。大家可以赶紧 下载 。 PS:这个公司挺可爱的,说是要 注册 邮箱才能下,其实下载地址是一个固定的网址,不过既然他免费提供给咱们了,还是去提供个电子邮箱呗,我就不直接把下载网址提供出来了。支持下Thomson Reuters公司的这个行为。 下载地址:http://science.thomsonreuters.com/scientific/m/HistCiteInstaller.msi 本博客前面有篇文章介绍,近期会出一个视频教程。
个人分类: 文献管理与信息分析|25344 次阅读|10 个评论
知识图谱报告-周宁丽citespace的报告ppt及录像
热度 1 smilesun 2010-12-5 23:14
11月25日邀请周宁丽老师给我班上的同学上了一次课,介绍citespace,感兴趣的朋友可以下载ppt和上课的视频录像学习。 下载地址: 第十一讲 周宁丽老师11月25日讲座的PPT和视频录像 http://biotech.ustc.edu.cn/upload/RMRA/2010/citespace20101125.wmv http://biotech.ustc.edu.cn/upload/RMRA/2010/citespace操作.wmv http://biotech.ustc.edu.cn/upload/RMRA/2010/citespace1125.ppt 《文献管理与信息分析》其它课件可以从下面的地址下载 http://biotech.ustc.edu.cn/forum/viewthread.php?tid=6479amp;page=1
个人分类: 文献管理与信息分析|9574 次阅读|2 个评论
周宁丽研究馆员报告:知识图谱
热度 1 smilesun 2010-11-24 20:33
周老师今天在科大做了一场知识图谱的报告,介绍了引文分析理论和citespace的用法等。 PPT下载地址如下: http://biotech.ustc.edu.cn/upload/RMRA/2010/zhouningli.ppt 明天还将邀请周老师给《文献管理与信息分析》西区班的同学上一次类似的课,届时应该会有视频录像。 欢迎关注。 明天上课时间是:6:15pM,西区3124教室。
个人分类: 文献管理与信息分析|6578 次阅读|2 个评论
引文分析软件HistCite视频教程
热度 4 smilesun 2010-5-20 21:47
今晚是《文献管理与信息分析》课的第十二讲,我给大家介绍了基于引文分析的软件HistCite。 这个软件上手很容易,分析的结果也很有价值,能够快速帮你找出重要的文献,大家可以了解一下。 第十二讲 文献信息分析之一-基于引文分析的histcite介绍 下面包含PPT和录像,PPT实际上只有前面介绍的一部分内容,软件操作部分直接演示的。 http://biotech.ustc.edu.cn/upload/RMRA/2010/histcite.rar 这次还布置了本学期的课堂报告要求以及histcite的作业要求 http://biotech.ustc.edu.cn/upload/RMRA/2010/zuoye.rar 如果这个解压文件有问题,可以直接下载解压后的三个文件 http://biotech.ustc.edu.cn/upload/RMRA/2010/histcite.ppt http://biotech.ustc.edu.cn/upload/RMRA/2010/histcite1.exe http://biotech.ustc.edu.cn/upload/RMRA/2010/histcite2.exe
个人分类: 文献管理与信息分析|22215 次阅读|19 个评论

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