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生物地球化学词汇日积月累【2】: Rainbowcn2018 2020-5-22 09:07; 敬请相关专业的各位老师赐教和斧正！谢谢！ MEP甲基赤藓糖醇磷酸（？） hopanoids 藿烷类化合物 hopanoid triterpenoids 藿烷三萜类化合物 hemes血红素（？） natural abundances 天然丰度（自然丰度？） 1H-pyrrole2,5-diones1H-吡咯2，5-二酮 methyl and ethyl substitution甲基和乙基取代作用 Me n-propyl甲基正丙基 Me i-butyl甲基异丁基 highly specific高度特异性 filamentous bacteria 丝膜菌（丝状菌？） Chloroflexaceae 绿丝菌科（绿色丝状菌科？） green sulfur bacteria绿硫细菌 Chlorobiaceae绿硫细菌（绿菌科？） Yellowstone isolate美国黄石公园菌株 Chloracidobacterium thermophilum 嗜热氯酸杆菌（嗜热细菌？） Kupferschiefer含铜页岩（？） steroids甾族化合物（类固醇？） oxidosqualene氧化鲨烯（环氧鲨烯？） β-amyrinβ-香树脂醇 tetrahymanol四膜虫醇 20 DMAPP 二甲基烯丙基二磷酸（二甲基烯丙基焦磷酸？） 21 IPP 异戊基二磷酸（异戊基焦磷酸？） 22 GPP 牻牛儿基二磷酸（牻牛儿基焦磷酸？） 23 phytol 植物醇 24 squalene 鲨烯（角鲨烯？） SHC 鲨烯-藿烯（？）环化酶 25 diploptene里白烯（？） SQMO鲨烯单加氧酶 26 squalene epoxide 鲨烯环氧化物（环氧鲨烯？） OSC 氧化鲨烯环化酶（环氧角鲨烯环化酶？） 27 lanosterol 羊毛甾醇 28 cycloartenol 环阿屯醇 cholesterol 胆固醇; 个人分类: 地球生物学点滴|2032 次阅读|0 个评论

同样是双歧杆菌，你咋就能让人聪明呢？: 热度 3 hongkuan15 2016-1-4 10:19; 作者：Doctor D 越来越多的研究显示，肠道微生物能够通过菌 - 肠 - 脑轴影响大脑，通过调节肠道微生物能够影响人的心理和行为。前不久已经报道了益生菌在较少焦虑，抑郁，自闭症症状和内脏疼痛等方面具有重要作用。最近的一项研究表明，常用的益生菌 - 双歧杆菌（ Bifidobacterium ）能够影响焦虑小鼠的认知能力，提高小鼠的学习和记忆能力。（这还了得？！这不是聪明药吗？难道吃了这个菌就能让笨蛋考上大学？虽然现在是给老鼠，相信以后会给人用。）双歧杆菌是一种严格厌氧的益生菌，最早从母乳喂养的婴儿粪便中分离，在婴儿肠道中比例较高，随年龄增加有下降趋势。因其样子像拍照时上镜率极高的“剪刀手（丫）”而得名。包括多种类型，如长双歧杆菌，短双歧杆菌，婴儿双歧杆菌和两歧双歧杆菌等。目前的研究发现，其具有多种有益人体健康的作用。在这个研究中，他们选用了一种 BALB/c 小鼠， BALB/c 小鼠是一种近交系小鼠，天生焦虑水平比较高，社会交往能力欠缺，也被用于自闭症研究。在研究中，他们准备了三组小鼠，分别饲喂 PBS（溶解益生菌的溶剂），短双歧杆菌 1205 和长双歧杆菌 1714 ，共持续 11 周。在此期间，分别测试两种双歧杆菌对老鼠的学习和记忆等能力的影响。结果发现，在物体识别测试中，长双歧杆菌 1714 饲喂的小鼠的记忆能力更强（如下图所示）；服用长双歧杆菌的小鼠在第三次测试时就表现出很好的识别能力，而短双歧杆菌的小鼠要到第四次，对照组则到第五次时才明显。在巴恩斯迷宫测试中，长双歧杆菌 1714 处理的小鼠的错误率比其他群体更少，这意味着更好的学习能力（如下图所示）。在恐惧条件下，经过测试发现长双歧杆菌 1714 处理的小鼠也表现出较好的学习和记忆能力（见下图）。综合来看，相比较来说，双歧杆菌 1714 对提高小鼠的认知能力更强，而短双歧杆菌的作用很小，甚至没有什么作用（见下图）。这个结果说明，不同菌种的同种益生菌的作用差别较大，不同的菌株具有不同的作用。具体引起差异的原因还不清楚，可能是不同菌株的代谢产物不同，还得继续研究。同样是益生菌，同样是双歧杆菌，凭啥1714就行，1205就不行呢？短双歧杆菌表示不服：哼！你长得比俺长点就厉害了？通过这个研究，我们就能理解，为什么很多研究报道益生菌的作用不一样，甚至有些具有相反的作用了。单纯的说益生菌具有某些功能，或者说某种益生菌具有某些功能都是不科学的，应该指明具体是哪种菌的哪一个菌株具有某种作用。以后，再看到某广告宣传某菌具有某项神奇效果，果断判定：忽悠，接着忽悠！有种说出菌株名来！参考文献：http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0166432815001230 Bifidobacteria modulate cognitive processes in an anxious mouse strain. Behavioral Brain Research，287 (2015) 59–72. BALB/c mice: Low sociability and other phenotypes that may be relevant to autism; 14792 次阅读|7 个评论

科研创新---始旋链霉菌高产菌株高产普那霉素: xupeiyang 2010-9-7 09:21; 2009210 研究项目创新点： 1 由于普那霉素发酵液稳定性较差，在室温下放置单位下降较快，对提取收率有较大影响。本项目采用原位分离技术大大减少了发酵液的处理时间。另外，树脂脱色提纯后得到的解析液浓度较低，本项目采用纳滤技术对解析液浓缩纯化，整个过程在常温下进行，普那霉素不会由于热敏性而受到破坏。当解析液浓缩到一定的程度，即可用溶媒结晶法得到纯度较高的普那霉素产品。本项目所采用的分离纯化工艺具有能耗极低（仅为传统蒸发浓缩能耗的1/5），设备结构简洁紧凑、操作方便、适合实现自动化生产的特点，还可以减少产品中的无机盐含量，减少产品灰分。 2 以始旋链霉菌ZP2为原始菌种，采用微波诱变和激光诱变相结合的复合诱变技术和抗性筛选技术选育出一株高产菌株，发酵单位可达1873mg/L。并采用上述高产菌株通过微生物发酵-原位分离耦合技术生产普那霉素，消除或减轻了产物的反馈抑制、提高反应速率，同时还有助于降低产物分离时的能耗、简化产物的分离过程。 3 缺乏稳定遗传的高产菌株和现有分离纯化方法均不能以足够稳定和可重现性的质量进行批量生产，纯度和产率均是制约普那霉素发酵生产和临床应用的主要原因。由于天然普那霉素的工业批量产品经纯化后还含有高达20%的杂质，这就无法满足一些国家在药品注册方面的法规要求，所以普那霉素的销售被严格限制在诸如法国、比利时等少数欧洲国家，导致了不少地区失去了对超级细菌引起的严重感染的有效治疗。本项目采用高产菌株发酵法生产普那霉素，并辅以原为分离技术、纳滤浓缩纯化技术和蓉妹结晶技术，可大大提高产物的产量与纯度，因此有望打破上述瓶颈，为我国抗生素产业增添新品种。; 个人分类: 创新评论|3989 次阅读|0 个评论

创新评论：多重耐药鲍曼不动杆菌耐药机制与菌株亲缘性研究: xupeiyang 2010-6-25 09:27; 该研究成果的创新： 1 、国内外可见多重耐药鲍曼不动杆菌抗菌药物耐药机制与整合子、转座子遗传标记的相关研究报道：（ 1 ）鲍曼不动杆菌中aac（ 6 ）-Ⅰb基因衍生出的新亚型的研究，并以aac( 6 )-Ⅰb-hangzhou命名, 被美国国立生物信息中心（NCBI）收录（NCBI注册号为FJ503047）；国内研究涉及 15 种氨基糖苷类修饰酶基因和 6 种 16S rRNA 甲基化酶基因，并检出了氨基糖苷类修饰酶基因 aph( 3 )- Ⅰ 、 aph( 3 )- Ⅱ b 基因；国内文献涉及鲍氏不动杆菌新型转座酶基因 tnp513 研究；国内文献涉及11种抗菌药物的敏感性及整合子和转座子 tnpU 的研究；国内文献涉及ISAbal的检测的研究。（2）国外文献涉及aph( 3 )-Ⅰ的研究，国外文献涉及 AAC(6')-Ib 的研究，国外文献涉及 tetA 、 tetB 的研究，国外文献涉及 IS1133 、国外文献涉及 ISEcp1 等研究，国外文献报道基因芯片技术定量和筛选鲍曼不动杆菌耐药性基因表达，芯片载有 205 种基因包括 47 种外排系统基因、 55 种耐药决定基因和 35 种看家基因 (house-keeping gene) 。（ 3 ）但国内外未涉及以 aac( 6 )- Ⅰ b-hangzhou 命名的鲍曼不动杆菌中 aac （ 6 ） - Ⅰ b 基因衍生出的新亚型的研究；（ 4 ）国内文献未涉及同时对鲍曼不动杆菌中 73 种耐药相关基因的研究；（ 5 ）国内文献未涉及鲍曼不动杆菌中存在氨基糖苷类修饰酶基因 aph( 3 )- Ⅰ的研究，国内外文献未涉及鲍曼不动杆菌中存在氨基糖苷类修饰酶基因 aph( 3 )- Ⅱ b 的研究；（ 6 ）国内文献未涉及鲍曼不动杆菌中检出四环素特异性外排泵编码基因 tetB 、多种化合物外排泵蛋白基因 tehA 的研究；国内外未见鲍曼不动杆菌中抗菌药物和灭菌剂化合物外排泵蛋白基因 mdfA 的研究；（ 7 ）国内外文献未涉及鲍曼不动杆菌进行接合性质粒遗传标记 (traA 、 trbC) 、插入序列 (ISaba1 、 IS1133 、 ISEcp1) 、转座子遗传标记 (merA 、 tnsA 、 tnpU 、 tnp513) 、整合子遗传标记 (int Ⅰ 1 、 int Ⅰ 2 、 int Ⅰ 3) 等 12 种可移动遗传元件检测分析的研究；（ 8 ）国内外文献未涉及鲍曼不动杆菌中检出 tnp513 的研究。 2 、国内外文献未涉及以 aac( 6 )- Ⅰ b-hangzhou 命名的鲍曼不动杆菌中 aac （ 6 ） - Ⅰ b 基因衍生出的新亚型的研究报道；国内未见鲍曼不动杆菌中 73 种耐药相关基因研究的研究报道；国内文献未见鲍曼不动杆菌中存在氨基糖苷类修饰酶基因 aph( 3 )- Ⅰ的研究，国内外文献未见鲍曼不动杆菌中存在氨基糖苷类修饰酶基因 aph( 3 )- Ⅱ b 的研究；国内未见鲍曼不动杆菌中检出四环素特异性外排泵编码基因 tetB 、多种化合物外排泵蛋白基因 tehA 的研究，国内外未见鲍曼不动杆菌中抗菌药物和灭菌剂化合物外排泵蛋白基因 mdfA 的研究报道；国内外未见鲍曼不动杆菌进行接合性质粒遗传标记 (traA 、 trbC) 、插入序列 (ISaba1 、 IS1133 、 ISEcp1) 、转座子遗传标记 (merA 、 tnsA 、 tnpU 、 tnp513) 、整合子遗传标记 (int Ⅰ 1 、 int Ⅰ 2 、 int Ⅰ 3) 等 12 种可移动遗传元件检测分析的研究报道；国内外文献未见鲍曼不动杆菌中检出新型转座酶基因 tnp513 的研究报道。编号 2009211027; 个人分类: 创新评论|3975 次阅读|0 个评论

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