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[转载]长链非编码RNA MEG3在胚胎性横纹肌肉瘤凋亡中的研究: ericmapes 2017-4-6 12:45; http://xueshu.baidu.com/s?wd=paperuri%3A(1074d6f4b88d8d1c5264e2b587e1f912)filter=sc_long_signtn=SE_baiduxueshu_c1gjeupaie=utf-8sc_ks_para=q%3D%E9%95%BF%E9%93%BE%E9%9D%9E%E7%BC%96%E7%A0%81RNA%20MEG3%E5%9C%A8%E8%83%9A%E8%83%8E%E6%80%A7%E6%A8%AA%E7%BA%B9%E8%82%8C%E8%82%89%E7%98%A4%E5%87%8B%E4%BA%A1%E4%B8%AD%E7%9A%84%E7%A0%94%E7%A9%B6; 个人分类: 社会热点时评|303 次阅读|0 个评论

[转载]PNAS:美学者解析横纹肌肉肿瘤起源: 热度 1 ericmapes 2017-4-6 11:30; PNAS:美学者解析横纹肌肉肿瘤起源日期：2016-11-02来源：生物帮 http://www.bio1000.com/periodical/pnas/506534.html 摘要: 2016年10月31日，国际著名学术期刊《美国国家科学院院刊》杂志在线发表了美国弗吉尼亚大学李辉研究员的一篇研究论文，研究从干细胞肌肉分化发生的融合基因事件入手，分析了横纹肌肉瘤细胞的起源，研究首次从融合基因的角度来研究肿瘤细胞的起源。 2016年10月31日，国际著名学术期刊《美国国家科学院院刊》杂志在线发表了美国弗吉尼亚大学李辉研究员的一篇研究论文，研究从干细胞肌肉分化发生的融合基因事件入手，分析了横纹肌肉瘤细胞的起源，研究首次从融合基因的角度来研究肿瘤细胞的起源。基因融合一直被认为是肿瘤独有的特征。基因融合是指染色体上两个异位的基因嵌合在一起，这种现象一般是由于染色体发生易位、缺失或者倒置造成的，通常在癌症的发生发展扮演着重要的角色，并且可以作为诊断和治疗癌症的靶标。基因融合现象最早在慢性粒细胞白血病中BCR-ABL基因融合。随着对基因融合的深入研究，科研人员发现，除血液系统肿瘤外，在实体瘤中也存在着基因融合现象，例如横纹肌肉瘤PAX3-FOXO1,前列腺癌中的TMPRSS2-ERG、小细胞肺癌中的EML4-ALK、结直肠癌中的VTI1A-TCF7L2，等基因融合。横纹肌肉瘤(Rhabdomyosarcoma，RMS)是罕见的一种恶性肿瘤，但在小儿实体瘤中发病率较高，其临床亚型有胚胎型横纹肌肉瘤(ERMS)，腺泡型横纹肌肉瘤(ARMS)，在80-85%的ARMS中可检测到特异性染色体易位，两种易位分别形成相应的融合基因PAX3-FKHR(也称为PAX3-FOXO1)或PAX7-FOXO1。最新这项研究结合生物信息学和干细胞生物学，首次从融合基因的角度来研究肿瘤细胞的起源。在MSCs干细胞骨骼肌分化样品中发现有一个时间点样品和横纹肌肉瘤细胞RH30类似的融合基因组，这种瞬时的融合基因组发生事件提供了肿瘤细胞起源的新线索。原文链接： fusion transcriptomeprofilingprovidesinsightsintoalveolarrhabdomyosarcoma 原文摘要： Genefusionsandfusionproductswerethoughttobeuniquefeaturesofneoplasia.However,moreandmorestudieshaveidentifiedfusionRNAsinnormalphysiology.ThroughRNAsequencingof27humannoncancertissues,alargenumberoffusionRNAswerefound.Byanalyzingfusiontranscriptome,weobservedcloseclusteringsbetweensamplesofsameorsimilartissues,supportingthefeasibilityofusingfusionRNAprofilingtorevealconnectionsbetweenbiologicalsamples.Toputtheconceptintouse,weselectedalveolarrhabdomyosarcoma(ARMS),amyogenicpediatriccancerwhoseexactcelloforiginisnotclear.PAX3–FOXO1(pairedboxgene3fusedwithforkheadboxO1)fusionRNA,whichisconsideredahallmarkofARMS,wasrecentlyfoundduringnormalmusclecelldifferentiation.WeperformedandanalyzedRNAsequencingfromvarioustimepointsduringmyogenesisanduncoveredmanychimericfusionRNAs.Interestingly,wefoundthatthefusionRNAprofileofRH30,anARMScellline,ismostsimilartothemyogenesistimepointwhenPAX3–FOXO1isexpressed.Incontrast,fulltranscriptomeclusteringanalysisfailedtouncoverthisconnection.Strikingly,allofthe18chimericRNAsinRH30cellscouldbedetectedatthesamemyogenictimepoint(s).Inaddition,thesevenchimericRNAsthatfollowtheexacttransient expression patternasPAX3–FOXO1arespecifictorhabdomyosarcomacells.Furthertestingwithclinicalsamplesalsoconfirmedtheirspecificitytorhabdomyosarcoma.TheseresultsprovidefurthersupportforthelinkbetweenatleastsomeARMSsandthePAX3–FOXO1-expressingmyogeniccellsanddemonstratethatfusionRNAprofilingcanbeusedtoinvestigatetheetiologyoffusion-gene-associatedcancers. doi:10.1073/pnas.1612734113 作者：李辉点击： 200 次; 个人分类: 社会热点时评|351 次阅读|1 个评论

[转载]如何诊断肾外恶性横纹肌样瘤? - 爱问知识人: 热度 1 ericmapes 2017-4-6 11:21; 如何诊断肾外恶性横纹肌样瘤 ?-爱问知识人 http://iask.sina.com.cn/b/Xwd9YkXNL.html 恶性横纹肌样瘤（malignantrhabdoidtumor)有肾的和肾外之分，是因为开始认识这种肿瘤主要在婴幼儿的肾脏，故称之为肾脏恶性横纹肌样瘤。此后有许多报道发生于肾外的恶性横纹肌样瘤病例，发生的部位几乎包括身体各处，浅部或深部软组织占多数，而胸腹内脏以及脑内均可发生。在组织病理学上肾内和肾外者并无明显区别，并且都多见于婴幼儿。肿瘤细胞类圆形、多边形，胞界清楚，呈弥漫分布，排列不很紧密，成片细胞间可有纤维间隔。瘤细胞的特点为胞质丰富，嗜伊红染，核呈泡状、居中或偏位，核仁显著；部分瘤细胞胞质内有球形的包涵体样物，后者淡嗜伊红染或毛玻璃样，PAS染色阳性，电镜下证实其主要由中间丝组成。包涵体将核挤在细胞一侧时，瘤细胞像横纹肌母细胞因而得名横纹肌样细胞，但其起源未定，也可能是一组形态相似而异源性的肿瘤。肿瘤细胞的免疫组化表现，既有间叶性又有上皮性的标志物，vimentin经常阳性，约3/4病例呈CK、EMA阳性，此外少部分表达NSE、cx-AT、desmin等。因为横纹肌样细胞在HE切片中的形态并非特异，而免疫组化的表现又类似上皮样肉瘤、间皮瘤和青少年硬化性小细胞肿瘤，所以诊断本肿瘤首先需要排除其它多种间叶性或上皮性肿瘤。除上述提到的几种肿瘤外，还要鉴别横纹肌肉瘤、上皮样肉瘤、恶性黑色素瘤、滑膜肉瘤、间皮瘤、骨外软骨肉瘤、转移性低分化癌等。鉴别的基本方法是全面镜检并参考临床上病人年龄、肿瘤部位；如找到肿瘤细胞呈现其他方向分化的特点时，可应用免疫组化和（或）电镜观察帮助进一步鉴别诊断。; 个人分类: 社会热点时评|334 次阅读|1 个评论

小龙虾的安全记录: fs007 2010-9-6 08:18; 寻正【寻正按：本文已发表于《百科知识》，商业性转载请联系出版商。】摘要：本文讨论小龙虾的食用价值与安全记录，通过文献检索，证明小龙虾有着较好安全记录，不比普通食品差。中国江南一带适于发展小龙虾养殖业，中国国内市场不发达，导致大量小龙虾倾销到美国，被征以惩罚性关税，国人应纠正消费观念。全文：南京发生泻湖病，一时间中国大江南北风声鹤唳，人人望小龙虾而生畏，南京小龙虾价格跌破底板，仍然乏人问津。小龙虾是否是一种安全的食品呢？我们追踪一下小龙虾的安全记录。南京人食用的克氏小龙虾科学名称有三部分：Procambarus Clarkii Girard（吉拉德*克拉克*原螯虾，简称为克氏原螯虾，或者克氏小龙虾），法国生物学家吉拉德（Charles F. Girard）在1852年鉴定它的，将之命名为Clarkii是纪念标本收集者克拉克（John H. Clark，生物命名的常规方式之一）。小龙虾源于美国南部沼泽地区， Cambarus指蝲蛄科，而Procambarus原以为是蝲蛄科的一个亚种，现在单独成为一个科，原蝲蛄，或者译为原螯虾，其海产表兄称为龙虾（Lobster），个儿甚大，故而原螯虾也称为小龙虾。克氏小龙虾还有很多的俗称，分别指向它的某种特征，最常见的说法是Red Swamp Crawfish，红色沼泽小龙虾，因为它全身红色，在沼泽地区易于生长，它还可以叫露易丝安纳小龙虾（Louisiana crawfish）或者淤泥虫（Mudbug）。在克氏小龙虾之外，在1990年，美国学者哈布斯等还鉴定出新的常跟克氏小龙虾混在一起的Procambarus zonangulus Hobbs Hobbs，俗名白河小龙虾（White River Crawfish）。我不知道国内的小龙虾品种是单一的克氏小龙虾，还是象美国一样，混有白河虾。白河虾并不白，只是比克氏小龙虾颜色更淡而已，最显著的特征是翻过来看肚皮，看得见一条从上通到下的黑线者，是克氏虾，否则是白河虾，那条黑线是小龙虾的肠子。白河虾在美国占小龙虾产量的20-30%。小龙虾在美国露易丝安纳州是一个巨大的产业（年产值约1.2亿美元，占渔业的14%），早在印地安人时代，小龙虾就是野生美味之一，在19世纪初，人工捕捞小龙虾上市就成了当地人挣外快的方式之一，在1880年，有记录记载其产量约为1万多公斤，20年后增加到4万公斤，到1930年代，有人开始倡议发展小龙虾农业，到1950年代，露易丝安纳州成立相关机构专门研究小龙虾生态，为小龙虾业奠基。在1960年代，该州小龙虾产业占地约1万公顷，到1970年代，增加到4.4万公顷，而现在估计超过13万公顷，产出4000多万公斤的小龙虾。露易丝安纳州本地人要消耗其产量的70%，其余的出口到世界各地。作为有着数千年传统的渔业产品之一，小龙虾的食品价值不应当受到质疑，不过近来一个广泛流传于网上的贴子却借着南京小龙虾中毒事件广为传播，该贴子谣传小龙虾是日本人引入中国处理尸体用的，试图诱发国人的反日情结而抵制小龙虾。这样的说法极度缺乏生活常识，也根本不懂小龙虾的生态价值。对于普通读者来说，其造成对小龙虾的畏惧心理却是极容易的。小龙虾之所以造成不洁的印象，来源于它的生态习惯。小龙虾是一种腐食动物，它的最佳生活环境是长满植被的洼地随后被水淹，植被随即腐败，小龙虾即以腐败后的植物与其它以腐败植物为食的小昆虫、微生物、藻类、以及软体动物为食，如果够得着，小鱼也算它的美味。它对人肉兴趣不大，不过，对中国人喜爱的大米，它也百吃不厌，露易丝安纳州50%的小龙虾产地都是稻田，这可能是为什么小龙虾产业出现在鱼米之乡的江南一带。图一、示小龙虾常见食品，最上边为腐败植物图二、示小龙虾的食物链小龙虾有极强的生存能力，在潮湿温热的地区，它往往会在生存竞争中获胜，故而它被看作一种侵犯性的生物物种，一种害虫。小龙虾的生存能力主要有两个来源，一是它耐缺水，二是它耐病。在南方低洼的地区，常伴了季节性的灌注，春夏来临，雨水增多，原来茂盛的绿色植被水淹了，腐败沉积，秋冬来临，河流干枯，洼地再成陆地，植被恢复，要在这种环境下生存，就得有水陆两栖的能力。小龙虾靠打洞保湿度过干旱季节，在来年的雨水丰盛时再破洞而出，拼命地觅食进补。小龙虾相当于生态垃圾工，它靠大量的植物腐败产生的自然垃圾为生，这跟大家听着不舒服的人为垃圾可不是一回事，人为垃圾受各种人类生产出来的化工物质的污染，故而很多人会怀疑小龙虾会在体内积累污染成份，但这就冤枉小龙虾了，它对处理人造垃圾毫无兴趣，不要妄想把你家的生活垃圾沉于池塘就可以养小龙虾。小龙虾的食物链相对简单与简短，简短的食物链在污染物积聚上就相对较少，主要取决于环境中污染物的含量。对小龙虾来说，就取决于水源污染程度与土壤中含有的有毒成份的多少，当然，还受到当地植物对这些污染物的吸收与积聚状态的影响。有研究证明小龙虾可以在长期暴露于高砷环境中时积聚砷，主要积聚在它的肝胰器中，肝胰器就是小龙虾炸了吃起来很香的那块虾黄。小龙虾还跟其它的甲壳动物（包括螃蟹、龙虾、虾等）一样，可以引起吸虫病（Trematode Infection）。肺吸虫病产生流感一样的症状，另外就是好几种肝吸虫以产生消化道症状为主。吸虫病在临床上易于误诊，但一旦诊断明确，也容易治疗。吸虫通过加热烹调易于消灭，因此，吃这些产品引起肺吸虫的更多的是食用方式不当造成的，即使是在美国的病例，很大多跟亚洲人相关，其中很多是中国人，可见国人需要更强的饮食卫生习惯。在吸虫之外，就要数各种原因导致的食物中毒了，相对而言，小龙虾在产生食物中毒上有比较良好的记录。由于小龙虾靠在水底腐烂的植被为生，其中也的确带有大量的微生物，不过，大多成了它的食品，跟它本身是否干净不太相关。对于微生物而言，煮食后即可消灭绝大部分，因此，甚少听闻吃小龙虾引起食物中毒的案例。在寄生虫与食物中毒之外，就是食物过敏，几乎所有食物都可能在某些人引起过敏反应，有强有弱，小龙虾在这方面也并不突出，可视为安全食品。如果你的确对它过敏，当然能避则避，否则不用担心。下面是用特定疾病加上特定食品在Medline（最重要的医学文献检索工具之一）上进行文献搜索产生的结果：图三、小龙虾食品安全记录（Medline医学文献搜索结果）小龙虾生产实际上就是把一大片人类无法直接食用的植物变成肉类，其生产过程可能比其它任何养殖业都更加自然，其中的关键，就在于小龙虾对自然界的适应能力。小龙虾不易生病，在其它养殖业常发生的暴发性传染病在小龙虾几乎不发生，散发性的疾病对小龙虾的产量毫无影响。暴发性传染病常常让业主颗粒无收，比如在虾产业中有一种叫弧菌感染的病，虾死亡率高达70%，业主对使用抗生素控制与治疗的诱惑就无法抵御。对鸡肉、牛肉、猪肉我们都要担忧激素、农药、抗生素等的残留，但这种担忧在小龙虾就是多余的。图四、小龙虾把这样的植被转化为人类可以食用的肉类（小龙虾生产稻田）小龙虾有着顽强的生命力，但那不标志着它在任何条件下都能大量地繁殖生长，它对大部分的农药可能都比较敏感，如果在稻田养小龙虾，其使用农药就会受到限制，否则小龙虾的确可以成活，但收成是不会好的。在现代小龙虾产业中，业主需要对植被、水的酸碱度、硬度、以及氧含量都要有妥善的管理，不然，小龙虾的产量是不会高的。野生虾在美国占市场份额的10-20%，产量不稳定，国人对野生虾抱有不切实际的幻想，其实野生虾不比养殖虾更好。养殖虾处于可控条件下生产，由于业主追求产量，对水质控制要求更高，虾的成长收获期更短，肉质更好更少污染物积聚。中国水环境受污染严重，野生小龙虾品质可疑，应避免食用。小龙虾的唯一缺点就是肉太少，看上去比虾个儿大，但却吃不到肉。小龙虾如果个儿小，其含肉量可达20%，而如果很大个儿，就只占8%了。因此，买小龙虾，论斤头则一定选小不选大。一个人一天需要3两肉，如果单吃小龙虾，你一个人就需要2斤左右，而买全虾，半斤就够了。1:4是大家应有的小龙虾与普通虾从营养角度的等价比。泻湖病是罕见疾病，自发现以来，在各国只是偶尔发生。2001年美国露易丝安纳州曾因吃小龙虾发生9例泻湖病，此后再也没有发生过，不构成流行病学意义上的担心。国人对小龙虾应当持理性的看法，在价格大降时，小龙虾是不错的食品。最近一个法庭诉讼裁决，把进口自除州锦江食品公司的小龙虾关税从223.01%降到188.52%。中国国内市场不发达，中国产的大量小龙虾反而倾销到美国，被美国征以90-200%（平均估计123%）的反倾销关税，在2007年，中国出口小龙虾尾1400多万磅到美国，加关税后价格只有3美元1磅，去除关税，只有1.50美元1斤虾尾，而换算成活虾，就是0.22美元1斤。目前美国市场的小龙虾尾肉，零售约15美元1斤，相当于2.30美元1斤生虾。如果国人形成理性的食品消费观念，或许中国小龙虾就用不着倾销到小龙虾最大生产国而为美国政府做最大贡献。; 个人分类: 科学普及|5942 次阅读|1 个评论

南京横纹肌溶解案例当诊断为泻湖病: fs007 2010-8-26 08:31; 按：这是我最近发的相关微博，收集于下，具体科普作品要等到约稿杂志发文之后再转载。寻正：南京吃小龙虾吃出了横纹肌溶解，当地卫生局、医生、及科学爱好者都在寻找根本原因。编辑叫我关注，不由得又好气又好笑。南京的医生下了个不适当的诊断，导致了一群人跟着要解决世界难题，有些不自量力吧？适当的诊断是泻湖病（Haff Disease），致病毒素尚需生化学家努力。寻正：寄语南京的医生，泻湖病并不常见，把病例报道出来，就做了巨大贡献，不要好高骛远去查找什么病因，你有本事把致病毒素鉴定出来，北美欧洲估计可以横着走了。泻湖病太不常见了，小龙虾是可以继续吃的。但我是不太喜欢国内的小龙虾的，怎么看都象有污染的样子。寻正：这病在1924年发现，在当时德国的波罗的海地区发现，估计跟吃了泻湖中的鱼有关系，因此后来叫泻湖病（Haff Disease）在此后10多年中，共发现了上千例病例，但1940年以后，就少见了。@ pearlher 给点这个病的相关背景可以么寻正：泻湖病等到1984年才在美国有报道，此后报道了20多例。总的来说，在美国、欧洲、巴西、日本都有发生，现在加上中国。泻湖病在很多种鱼类中发生，在不同地区由不同的鱼类产生，在美国发生过数例小龙虾致泻湖病。泻湖病致病毒素尚处于推测阶段，它对热不敏感，大多数人都是熟食发病。寻正：巴西发病者都有肌肉痛，而美国则不一定，有的人先有黑尿（赤尿）。吃鱼类食品24小时内出现这些症状，一查血CK过高，诊断甚易。治疗也不复杂。不必过份担心，但仍有死亡病例，也不能掉以轻心。死亡者主要是治疗不及时。@ pearlher 那典型的症状是什么呢？寻正：肌肉痛，无力，呼吸困难，恶心呕吐，肌肉强直，震颤，触痛，大汗是常见症状，其它还有黑尿，全身不适，麻木，背痛，胃痛之类的症状。查血肌肉破坏释放的酶大增（CK增高几十上百倍），诊断甚易。 @pearlher 那典型的症状是什么呢？寻正：巴西发病者都有肌肉痛，而美国则不一定，有的人先有黑尿（赤尿）。吃鱼类食品24小时内出现这些症状，一查血CK过高，诊断甚易。治疗也不复杂。不必过份担心，但仍有死亡病例，也不能掉以轻心。死亡者主要是治疗不及时。 @pearlher 那典型的症状是什么呢？寻正：泻湖病的严重后果是肾衰或心跳骤停导致死亡。治疗大量补液是关键，肌肉溶解导致大量钾从肌肉释放，高钾血症引起血律失常，心跳骤停，大量补液可以给肾排钾机会。肌肉还释放肌红蛋白，如果肾脏需要保水，则会导致肌红蛋白在肾小管中凝集堵塞，从而导致肾衰，大量补液有预防作用。寻正：美国多例小龙虾致泻湖病都是患者买了自己回家煮的，跟中国的案例很类似。露易丝安拉州卫生部及时获得样本分析，仍然没分析出东西来。CDC与日本学者都曾获得样本进行分析，无果而终。因此，我不认为南京市卫生行政部门与有关医生能做得更好，不必浪费资源了，做点踏实的案例汇报工作吧。下面是南京市政府对世界难题的高调反应：南京市政府成立由常务副市长沈健担任组长，分管秘书长担任副组长的应急工作领导小组，其成员包括：市卫生局、市农委、市工商局、市质监局、市商务局、市药监局，由市食安办承担具体协调工作。由市卫生部门制定相关诊疗规范，并将积极组织好医疗救治工作，同时建立起相关病例的报告制度，做到早发现、早诊断、早治疗。由市食安办牵头组织专家学者就食用龙虾与横纹肌溶解症的关联因素进行分析调查，尽早查明原因。市工商部门牵头的在全市开展龙虾养殖、运输、销售、餐饮加工等各个环节的专项整治，以保证市民食用龙虾的安全。; 个人分类: 医学普及|5883 次阅读|2 个评论

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