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每日翻译20190502
Bearjazz 2019-5-2 07:53
# 编者信息 熊荣川 明湖实验室 xiongrongchuan@126.com http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz POLYTOMIES AND STRICT CONSENSUS TREES: The two cladograms below illustrate a common situation in phylogenetic analysis, when two or more competing fully resolved cladogram hypotheses may be equally well supported by parsimony. The following example is used to explain how such uncertainty is sometimes represented by a strict consensus tree. 多岐分支和严格一致树: 下面的两个支序图说明了系统发育分析中的一个常见情况,即两个或多个相互竞争(有差异)且完全解决的分支图假设可能都得到了最大简约支持。下面的例子用来解释这种不确定性有时是如何由一个严格的共识树表示的。 Consider cladograms A and B above. These cladograms differ in the hypothesized relationship of the turtle to other reptiles (*). Cladogram A is the hypothesis that the turtle is sister taxon to a clade, bird + crocodile (Archosauria). Cladogram A is the more conventional alternative hypothesis that turtle is, instead, sister taxon to all other reptiles (cladistically redefined to include birds in this course!). This latter reptilian subclade is referred to as either Sauria or Diapsida, depending on which name is preferred. 考虑上面的支序图 A 和 B 。这些支序结构的差别点在乌龟与其他爬行动物的聚类关系假设上。 cladogram A 假设,乌龟是鸟 + 鳄鱼( Archosauria )支系的一个姊妹群。 cladogram A 是一个更为传统的假设,乌龟是所有其他爬行动物的姊妹分类群(在本课程中,所谓的其它爬行动物包括鸟类) . 后一爬行动物分支根据命名被称为蜥蜴亚目或双孔亚纲。 Introduction to Phylogeny: Hard or Soft Polytomies? http://biology.fullerton.edu/biol404/phylo/polytomies.html
个人分类: 翻译作品|1509 次阅读|0 个评论
原来穿山甲不是爬行动物----本博主首次认错
热度 13 yanjx45 2012-8-8 11:47
本博主对网友超过 6500 条留言以及大约 2000 条评论中的大部分都作了回复。本博客对网友的回复数量可能是科学网的博客中最多的。 本博主创造了科学网的一项新纪录? 在这数千条回复中,难免有笔误或表述不当的,但基本观点的错误或明显的基本知识的错误似还未发现 ( 或还未得到本博主承认 ) 。 不过,本博主最近不得不首次明确承认一个错误:在 回复 中将属于 哺乳动物 的 穿山甲 误认为是 爬行动物 。 可能将穿山甲误认为是爬行动物的非专业人士还有一些。现将相关 留言 和 回复 转述如下,希望能有助于纠正这种流行较广的误解: 留言 yzga 2012-7-30 …… 抗体检测为 20IU ,有效保护期可持续多久? 博主回复 (2012-7-31 07:26) : 抗体检测为 20IU, 有效保护期至少可持续 1 年。 留言 yzga 谢谢严老师的回答,还有今天发生一件事再向老师请教。 我是一个市政管理人员,今天上午配合本地林业公安查获了一起走私穿山甲案件,缴获从境外走私的穿山甲 30 多只,我在车厢里搬运穿山甲时,发现穿山甲的嘴里流出好多粘稠的涎液,并顺着纸箱不断滴到地上,搬完后我们在路边休息等候其它同事,这时我感觉脚背上的脚癣很痒(最近因为长脚癣,所以一直光脚穿拖鞋),就用两个脚互相摩擦止痒,并用脚甲挠脚癣,挠得很辣痛,出了一些血,过了 30 来分钟后,我发现脚趾很黏,仔细一看,才发现搬运穿山甲时有很多涎液滴在我脚癣上,脚癣是因为接触涎液过敏才痒的,我就用自来水冲了一下脚,然后用双氧水消毒,消毒时感觉很辣,应该有好几个地方都挠破皮了,现有些疑问想再请教老师一下。 1 、脚癣上沾有较多穿山甲嘴里的涎液,又在有涎液的情况下挠破出血多处,(而且因脚上多个地方长癣,有些地方消毒不到也不彻底,)这种情况下算不算特别严重的暴露? 2 、我在 47 天前到贵所检测抗体为 20IU ,因前几天刚被狗爪抓伤过,会不会使抗体下降很多,我现在体内的抗体对今天上午此次暴露还有保护作用吗,要不要再加强 2 针,如果不打能确保一定安全吗? 3 、在您的博文里找不到答案,穿山甲易感狂犬病毒吗?我在网上看到豹、豺是穿山甲的天敌,也常有穿山甲被流浪狗攻击的情况。 4 、穿山甲是从境外走私进来的,会不会带有 1 型以外的病毒,比如 MOKV 之类的?这几年在市政部门收治很多流浪狗,也打了很多针,真的不想再打了,但又有些担心,请严老师提供宝贵意见。再次感谢。 博主回复 (2012-8-1 06:32) :爬行动物与狂犬病无关,你不必担心。 留言 yzga ( 2012-8-3 00:02) 严老师,您可能弄错了,穿山甲不是爬行动物,是温血哺乳动物,如果是爬行动物我就不担心了。这几年因收治流浪狗,打了很多疫苗,已经属于严重滥用疫苗了,我知道如果去疾控中心咨询,肯定会叫我打针。因为今年 4 月份刚打过 3 针加强, 6 月 13 日又在贵所检测到 20IU 的抗体,但现在离检测已经 48 天了,而且几天前刚被狗爪抓伤过,有些担心抗体会因中和作用快速下降,所以我对是否再打加强针一直犹豫不决,老师您曾说过 " :特别严重的暴露是指头部、面部或手部多处同时被动物咬伤 " ,我是在穿山甲嘴里的很多涎液掉在我脚癣上,在涎液很多的情况下挠破脚癣多处出血,这种的情况下是否属于特别严重的暴露,还需要再次加强吗,不加强一定会安全吗?严老师,我碰到的动物和暴露情况都比较特殊,在您的博文里和网上都找不到答案,恳请老师再指导一下。暴露已经 3 天了我一直没打针,就想听听老师意见后再决定,但心里很纠结,再重复发帖一次,请老师原谅, 博主回复 ( 2012-8-6 13:11) : 谢谢你指出我的一个动物分类上的错误: “ 穿山甲不是爬行动物,是温血哺乳动物 ” 。 但穿山甲与老鼠和兔相似,虽然也属于哺乳动物,可以感染狂犬病毒,但它们通常不是狂犬病的传染源。在实验室可以对它们成功进行人工感染,但在自然界它们通常没有机会受到感染,不携带狂犬病毒,不会传播狂犬病 ( 可参看我关于老鼠和兔的相关博文 ) 。 能传播狂犬病毒的哺乳动物实际上主要只限于其中属于 食肉目 和 翼手目 ( 蝙蝠 ) 的动物,狂犬病毒可以在这些动物中维持病毒的存在。其他哺乳动物只在非常偶然的情况下被这些动物咬伤后才有可能得狂犬病,但通常没有机会再传染给其他动物并在本物种内维持病毒的存在。 现有文献中从未报导过穿山甲得狂犬病,更没有它引发狂犬病的病例。所以你完全不用担心。 而且你的疫苗已打得太多了,检测抗体的数值也很高,你对真正的疯动物咬伤也有足够的免疫力。
个人分类: 狂犬病防治|13504 次阅读|34 个评论
热烈祝贺亚洲蛇蛙研究(AHR)被SCI收录!
热度 1 李丕鹏 2011-8-8 14:51
热烈祝贺亚洲蛇蛙研究(AHR)被SCI收录!
接AHR编辑部信函,2010年在中国大陆“创”刊的亚洲蛇蛙研究(AHR)被SCI收录。 尽管对SCI收录仁者见仁智者见智,但能通过SCI的收录进一步扩大AHR论文的交流传播力,是值得庆幸的。 非常感谢杂志主编及编辑部多年来的辛勤工作和努力! 注:之所以在创刊的创子冠以双引号,是因为这一刊物前身其实已有10多年的历史。第一期为“中国蛇蛙研究”,在中国大陆刊发。此后,转入美国加州大学伯克利分校,由亚洲蛇蛙研究会和伯克利分校脊椎动物博物馆主办,并更名为“Asiatic Herpetological Research”。 此外,该刊也有译为“亚洲两栖爬行动物研究”。 …… 下面引编辑部文: Informed from an email sent by a staff of Thomson Reuters on July 15 2011, and according to the statements released on July 19 on the Website of Thomson Reuters ( http://science.thomsonreuters.com ) , we are glad to inform you that the journal Asian Herpetological Research (AHR) has been accepted by Thomson Reuters for coverage in Web of Science.The coverage begins in the Science Citation Index (SCI) Expanded with Issue One of Volume One, 2010.AHR has also been accepted for coverage in Current Contents - Agriculture, Biology Environmental Sciences , Zoological Record and BIOSIS Previews .
个人分类: 研究生教育|4062 次阅读|2 个评论
北京发现篇:蓝尾石龙子
热度 6 博物 2011-3-21 01:47
个人分类: 虫行天下|11032 次阅读|8 个评论
美国国家动物园
xudm 2010-1-31 10:33
大雪纷纷扬扬下了一天,冒雪去了动物园,真冷,感觉现在还没有缓过劲来。 动物园很大,可是今天下午1:00各室内馆就关门了(不知是不是下雪的原因),没有参观完,下次再补吧。 east market,周六有很大的集市,现在只有零零散散几家。 ZOO'S GATE 小型哺乳动物馆 爬行动物馆
个人分类: 人在旅途|3921 次阅读|2 个评论
"中国…爬行动物专业委员会成立大会暨首届中国爬行动物养殖研讨会"纪实
李丕鹏 2009-6-23 01:06
经过一年的筹备,由中国野生动物保护协会养殖委员会主办的《中国野生动物保护协会养殖委员会爬行动物专业委员会成立大会暨首届中国爬行动物养殖研讨会》于2009年6月20 - 22日在海口市21度假连锁品牌店海口四季花开店召开。 来自我国南方的12个省、市、自治区的野生动物保护协会和林业主管部门的100余位领导、学者和养殖专家(正式注册人数96人)参加了会议。中国野生动物保护协会李青文副秘书长,国家林业局野生动植物保护与自然保护区管理司张德辉副处长,中国野生动物保护协会养殖委员会主任、中国工程院院士、东北林业大学野生动物资源学院名誉院长马建章教授以及东北林业大学野生动物资源学院副院长刘治平教授出席会议并作了重要讲话,海南省野生动物保护协会陈康秘书长作了致词。 6月21日上午8时,爬行动物专业委员会成立大会正式召开,养殖委常务副主任兼办公室主任田秀华教授主持会议并宣布专业委员会正式成立,马建章主任宣读了养殖委关于成立中国野生动物保护协会养殖委员会爬行动物专业委员会(简称中国爬行动物专业委员会)的决定文件,并为主任委员颁发了聘书,马建章主任、张德辉副处长和李青文副秘书长一起先后为专业委员会副主任委员和顾问颁发了聘书。田秀华教授代表养殖委对专业委员会的筹建和会议的筹备过程向与会领导和代表作了说明。 李青文副秘书长和张德辉副处长分别代表中动协和保护司回顾和分析了我国爬行动物养殖与保护的关系,养殖的发展、现状和存在的问题,以及专业委员会的重要作用;并为专业委员会今后的工作重点作了重要指示。 成立大会结束后,马建章主任、李青文副秘书长和张德辉副处长和与会代表合影留念。 在养殖研讨会上,田秀华、李丕鹏、吴孝兵和史海涛教授先后主持了大会报告。来自沈阳师范大学的李丕鹏教授、安徽师范大学的吴孝兵教授、海南龟鳖协会的周婷秘书长、黄山学院的吕顺清教授、广西大学的曾芸副教授等先后就我国蛇类养殖现状及蛇和蛤蚧国家养殖试点工作的进展,世界鳄类养殖及鳄产品贸易现状,中国龟鳖类养殖业现状,斑鳖人工繁殖试验研究进展和蛇疾病诊断与治疗作了专题报告;养殖企业代表:海南东盛弘蟒业科技股份有限公司李迅副总经理、海南龟鳖协会韩克勤会长、广东贞山鳄鱼养殖有限公司许金旺董事长和广西南宁馨宇蛇类繁育基地张馨文总经理分别就蟒蛇养殖及发展规划,海南省龟鳖养殖现状,贞山鳄鱼养殖现状和馨宇蛇类繁育基地国家试点工作进展向与会领导和代表作了汇报。 21日下午3 - 6时,为了进一步了解我国爬行动物养殖和经营利用中存在的问题,研讨会安排了蛇和蛤蚧养殖小组与龟鳖和鳄鱼养殖小组进行分组讨论,马建章院士、李青文副秘书长和张德辉副处长分别参加了2个小组的讨论会,并与代表进行了热烈的讨论,详细听取了代表们的意见。在田秀华和史海涛教授主持的龟鳖和鳄鱼养殖小组的讨论会上,张德辉副处长进一步对鳄鱼和龟鳖养殖发展做了重要指示,来自广东华南濒危动物研究所的龚世平博士就中国鳄鱼养殖业现状与存在的问题作了主题报告,鳄鱼养殖与利用的管理问题成为该小组最为热烈的讨论。在李丕鹏、饶定齐和杨道德教授主持的蛇和蛤蚧养殖小组讨论上,马建章院士和李青文副秘书长对蛇和蛤蚧的养殖发展做了重要指示,蛇和蛤蚧的试点推广和爬行动物资源利用与产品深加工等话题成为讨论的主要内容。广大代表各抒己见,畅所欲言,感谢政府对爬行动物养殖业的关怀和扶持,对我国爬行动物养殖和资源利用的健康发展充满了信心。 6月22日上午11时,田秀华副主任主持会议闭幕式,爬行动物专业委员会第一届主任李丕鹏先生宣读了《中国野生动物保护协会养殖委员会爬行动物专业委员会工作条例(草案)》,宣布了专业委员会第一届委员名单,并代表专业委员会对本次会议作了总结。11时35分,养殖委常务副主任田秀华教授宣布大会闭幕。 会议期间,马建章院士、李青文副秘书长、张德辉副处长和广西、湖南野保协及林业主管部门的领导牺牲休息时间,不顾连日来的奔波劳累,分别参观了海南东盛弘蟒业科技股份有限公司南洋养殖基地和海口泓旺农业养殖有限公司龟鳖养殖基地等养殖场。 6月22日下午,与会代表和其他领导同志集体参观了海南东盛弘蟒业科技股份有限公司南洋养殖基地。蟒蛇养殖基地的建设和管理机制给参观者留下了深刻的印象,极大地鼓舞了养殖业同行向规模化、科学化、工厂化、产业化养殖发展的信心。 本次会议是我国爬行动物养殖业的第一次盛会,广大与会代表对专业委员会的成立深表欢迎,对委员会今后在促进爬行动物养殖发展中的作用寄予厚望。专业委员会对今后五年如何执行全国野生动物管理与经营利用标准技术委员会的规划和主管部门的指示,结合爬行动物养殖业存在的问题和需要,所要开展的工作重点向与会领导和代表作了简要汇报。李丕鹏教授代表科研院所和大专院校从事爬行动物养殖研究与教学的科技工作者向养殖业代表承诺:我们将坚持为爬行动物养殖和保护服务、为社会发展和经济建设服务的宗旨,本着理论为实践服务、理论与应用实践相结合的理念,不断向你们学习管理和养殖经验,及时配合你们科学的总结养殖技术,结合我们的研究和研究生培养,积极主动地与你们保持联系和合作,有针对性地为你们服务,解决你们在养殖中发现的问题。 本次会议得到了海南东盛弘蟒业科技股份有限公司、广东贞山鳄鱼养殖科技有限公司、海南省文昌长寿园龟类养殖基地、海口泓旺农业养殖有限公司和浙江湖州上跃龟鳖苗种有限公司的大力支持,养殖委常务副主任田秀华教授和专业委员会李丕鹏教授多次代表会务组表示衷心的感谢。
个人分类: 研究生教育|8129 次阅读|0 个评论
生物名片中的两栖爬行动物
李丕鹏 2009-4-24 22:55
Amphibians and Reptiles in Chinese Local Biological Card 独特生物 精彩家乡全国大学生辩论赛在北京决赛 34 省市自治区代表生物名单发布仪式 到 2009 年 3 月 20 日下午 6 点为止各省代表动物评选投票统计表 省份 得票最多的动物 票数 动物总投票数 安徽 扬子鳄 2566 4813 澳门 小白腰雨燕 111 274 北京 北京宽耳蝠 1246 2021 福建 金斑喙凤蝶 270 569 甘肃 雪豹 266 546 广东 潮汕蝾螈 1116 1987 广西 白头叶猴 841 1098 贵州 黔金丝猴 241 343 海南 海南长臂猿 159 272 河北 鸳鸯 386 711 河南 豫南小鲵 1852 2433 黑龙江 丹顶鹤 1173 2479 湖北 短嘴金丝燕 2152 3570 湖南 莽山烙铁头 4168 5191 吉林 虎 2885 6012 江苏 中华虎凤蝶 1529 2185 江西 井岗脊蛇 119354 99179 辽宁 蛇岛蝮 7344 9348 内蒙古 蒙古原羚 528 903 宁夏 岩羊 136 248 青海 普氏原羚 262 357 山东 大天鹅 1196 1385 山西 金钱豹 375 630 陕西 朱鹮 480 576 上海 震旦鸦雀 385 892 四川 大熊猫 922 1088 台湾 台湾蓝鹊 152 348 天津 东方白鹳 259 413 西藏 藏羚羊 340 434 香港 中华白海豚 254 321 新疆 普氏野马 647 742 云南 绿孔雀 422 858 浙江 黑嘴端凤头燕鸥 92958 144483 重庆 胭脂鱼 836 1035 总票数     297744 两栖爬行动物占到动物的 17.65% ,这可是一个相当高的比例, 说明国人开始重视两栖爬行动物在动物界中的地位和生态系统中的作用! 恭喜了!!!
个人分类: 研究生教育|3446 次阅读|0 个评论
两栖爬行动物保护与可持续发展国际研讨会通知
李丕鹏 2009-1-15 00:43
据悉,20092010年间,将在海南岛召开一次两栖爬行动物保护与可持续发展国际研讨会。会议将邀请国际动物保护经济学家、两栖爬行动物保护与可持续发展研究者和国内著名学者作大会报告,欢迎我国从事两栖爬行动物保护与养殖的学者、实践者和管理专家参加会议并准备中英文会议论文和会议交流报告。会议将正式出版研讨会论文集。 会议初步拟定主题涉及:两栖爬行动物保育与可持续发展的战略和策略研讨, 两栖爬行动物保护工程、 两栖动物保护行动计划、 中国两栖爬行动物人工驯养繁育技术现状和前景,以及 中国两栖爬行动物监测网络的建立, 等。 欢迎大家对会议主题和邀请人员等发表意见和建议!
个人分类: 研究生教育|3581 次阅读|0 个评论
播种的2008
李丕鹏 2008-12-31 13:33
2008年,对我来说,是一个从年初出差、写报告忙到年末的一年。也是开始我科学博客的第一年。 说到忙,我确实很忙。这不,今天起来,想着到了2008年的最后一天,我还有3个计划中的申请没有完成。就急急忙忙火烧火燎的忙活开了。当然牙是刷了一下,脸也洗了一把,只是没有吃早饭,而是以抽为食。一上午就写了一个小项目的申请,为社会贡献了一包多烟的利税,至于能不能得到这个项目,那就拜托同行专家和领导。在这里先给他们拜个年,牛年手下留情,嘴上言德,共同进步! 有时我想,烟真是减肥的好办法,肚子咕咕叫的时候,抽烟可以当饭哦。但是说到这个坏习惯,那我真是一个大烟筒了。我是一直想戒掉烟,也不断的计划和实践着。但只要一工作,如写字或者修改文章或者照相等等,就要抽烟,也许是一种对紧张的神经的松弛。曾经听有个好朋友说,学生知道他喜欢XX烟,修改文章时就送他,这样他就能尽快完成差事。而我忙到晚上12点后,如果没有烟了,就自己跑到楼下24小时的小超市买一包。而享受学生送烟,说心里话是有过那么二,三次。过后我总觉得欠了什么似的。其实,抽烟并不男人,倒有点不自信的可能哦。但愿2009年我能真正的戒掉烟或者控制住抽烟量。 因此,说到2008年忙,那我的第一忙就是抽烟了。我此刻还在一边忙着打字,一边忙着抽烟。烟雾缭绕 第二忙,应该算写申请和汇报了。这些年从事科学探索工作,最大的体会就是年初忙申请,年终忙汇报。其实有些申请和汇报还要在年中或年末完成,这要看主管部门的具体安排了。至于重点学科、重点实验室、研究生点等等的材料,那我戏称自己就是一个秘书。年初的项目申请,尽管不是大满贯,但应该说基本完成了任务。在同行专家和领导的关照和支持下,总算为明年乃至今后3年的工作争取到了经费。也许在大单位的大学者不存在这样的问题和顾虑,但对于三流学校的非著名探索者,没有这点经费那就如同无米下锅啊。我想,这不是我个人的感受,而是很多人的感受。 第三忙,那是最忙的,忙得我身心疲惫啊。从1月开始去天府之国到刚刚从南方蛇场回来,这一年总共近20次是在省外出差,而且2/3是野外工作。其中有三次都是长达一个月的野外调查,当然也有有10天左右的养殖场实际考察,更有那早出晚归的省外会议等等。一些突发性的通知也使我前脚进家门,后脚又奔机场。为了工作,为了完成领导交给的任务,只要扎扎实实把工作做好,让各方面满意,我尽力而为着。好在几次国际会议因来不及签证而终止,不然真成了朋友们说的满天飞了。 一年的大半时间不是在家里在实验室度过的。这种忙,没有论文性的成果收获,我想了好久把其归为一种播种。就算厚积薄发的一年,愿来年能有所收获。这种忙,忙得顾不上在实验室做实验了,忙得顾不上写文章了。有时候想想真有点对不起学生,因为不能跟着学生实验 一个喜欢自己做点事情而不会当实验室老板的人,这样忙确实极大的影响着实验室工作2009年,把精力放在实验室吧。 第四忙,忙里偷闲写博客。写博客需要一种感觉,更需要时间。我这种调侃式的博客除过处理照片花费过多时间外,文字是想到那里写到那,顺其自然。算一种对忙中休闲吧。因此,很多时候没有写的欲望了,那是因为其他事情太忙了。害得关心的朋友时不时问怎么没有新的啊。 来到科学网,如同走进了另一个科学图书馆和名人殿堂,在这里获得了很多有用的信息,结识了很多独特的人(性)。 非常感谢科学网管理者和博友,祝科学网来年更红火,祝大家新年快乐身体健康笑口常开!
个人分类: 研究生教育|3395 次阅读|1 个评论
再上吊罗山(2)
李丕鹏 2008-9-22 09:40
信手拈来几张非蛇蛙照片,传上来润润眼,让大家休息一下。 吊罗山确实生物资源丰富,白天蝴蝶满天飞,虫子遍地蹦。 夜间蛙鸣虫叫此起彼伏,已有点噪音的感觉了。 不过对于我们来自现代文明城市的人来讲,那可是天籁之音。 这次在吊罗山我们也有不少笑话,大白天迷路于原始森林差点出不来, 每次蚂蟥只咬小周,且中招特具传奇色彩,看来当院士指日可待了。 这座神山被小周认为是蚂蟥山,其实五指山的蚂蟥比吊罗山多多了。 看看我那可怜的脚就知道了,同时被好几只大小不同的三种蚂蟥攻击着。 信手拈来几张非蛇蛙照片(蝌蚪除外哦,哈哈),传上来润润眼,让大家休息一下。
个人分类: 研究生教育|3828 次阅读|3 个评论

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