iGEM2015 中国参赛获 52 金、 18 银、 10 铜奖 ——附获奖一览表 诸平 浙江大学参赛 团队在答辩 南科大 iGEM 软件队全体成员与评委合影 2015 年国际基因工程机器大赛( international Genetically Engineered Machine Competition , iGEM ),简称 iGEM 2015 ,于 2015 年 9 月 24 日到 9 月 28 日在美国波士顿海因斯会议中心举办 , 有来自非洲( 2 个代表队)、亚洲( 101 支代表队)、欧洲( 69 支代表队)、拉丁美洲( 19 支代表队)、北美洲( 77 支代表队),总共注册参赛代表队有 280 家,到场参赛单位有 259 家,与会者有 2700 多名,参加了迄今为止最大的合成生物学竞赛。本次大赛经过角逐共产生金奖 115 项,银奖 57 项,铜奖 55 项。中国大、中学生参赛结果,有 52 项获得金奖、 18 项获得银奖,还有 10 项获得铜奖。如果同一参赛学校有不同项目获得同样档次的奖牌,将附有说明,具体统计结果见表 1 。更多信息请浏览 iGEM 2015 。 表 1 iGEM 2015 中国大、中学校获奖一览表 No Team Medal Award 1 华中科技大学 HUST-China 金奖 Nominated for Best New Basic Part, Undergrad 2 北京理工大学 BIT 金奖 3 北京理工大学 BIT-China 金奖 Nominated for Best New Appliation Project, Undergrad 4 电子科技大学 CHINA_CD_UESTC 金奖 5 同济大学 China_Tongji 金奖 6 香港城市大学 CityU_HK 金奖 7 合肥工业大学 HFUT-China 金奖 8 香港科技大学 - 赖斯大学 HKUST-Rice 金奖 Nominated for Best Environment Project, Undergrad 9 香港科技大学 - 赖斯大学 HKUST-Rice 金奖 Nominated for Best New Basic Part, Undergrad 10 香港中文大学 Hong_Kong-CUHK 金奖 11 台湾师大附属高中 HSNU-TAIPEI 金奖 Best Applied Design, High School 12 台湾师大附属高中 HSNU-TAIPEI 金奖 Best Integrated Human Practices, High School 13 台湾师大附属高中 HSNU-TAIPEI 金奖 Nominated for Best Education and Public Engagement, High School 14 台湾师大附属高中 HSNU-TAIPEI 金奖 Nominated for Best Wiki, High School 15 台湾师大附属高中 HSNU-TAIPEI 金奖 Nominated for Best Poster, High School 16 台湾师大附属高中 HSNU-TAIPEI 金奖 Nominated for Best High School Project 17 华中科技大学 HUST-China 金奖 Nominated for Best Environment Project, Undergrad 18 华中农业大学 HZAU-China 金奖 Nominated for Best Information Processing Project 19 南京大学 Nanjing-China 金奖 20 台湾交通大学 NCTU_Formosa 金奖 21 南京大学 NJU-China 金奖 Nominated for Best Health and Medicine Project, Undergrad 22 南京大学 NJU-China 金奖 Nominated for Best Model, Undergrad 23 南京大学 NJU-China 金奖 Nominated for Best Presentation, Undergrad 24 国防科技大学 NUDT_CHINA 金奖 Nominated for Best Part Collection, Undergrad 25 台北阳明大学 NYMU-Taipei 金奖 26 北京大学 Peking 金奖 Nominated for Best Health and Medicine Project, Undergrad 27 北京大学 Peking 金奖 Nominated for Best Wiki, Undergrad 28 北京大学 Peking 金奖 Best New Composite Part, Undergrad 29 北京大学 Peking 金奖 Best Part Collection, Undergrad 30 华南理工大学 SCUT-China 金奖 Nominated for Best Integrated Human Practices, Undergrad 31 华南理工大学 SCUT-China 金奖 Nominated for Best New Composite Part, Undergrad 32 上海交通大学 SJTU-BioX-Shanghai 金奖 33 上海交通大学 SJTU-Software 金奖 34 中山大学 SYSU-Software 金奖 Best Software Project 35 中山大学 SYSU_CHINA 金奖 36 深圳大学 SZU_China 金奖 37 台北美国学校 TAS_Taipei 金奖 Finalist, High School 38 台北美国学校 TAS_Taipei 金奖 Grand Prize Winner, High School 39 台北美国学校 TAS_Taipei 金奖 Nominated for Best Education and Public Engagement, High School 40 台北美国学校 TAS_Taipei 金奖 Best Wiki, High School 41 台北美国学校 TAS_Taipei 金奖 Nominated for Best Poster, High School 42 台北美国学校 TAS_Taipei 金奖 Nominated for Best Presentation, High School 43 台北美国学校 TAS_Taipei 金奖 Nominated for Best New Composite Part, High School 44 台北美国学校 TAS_Taipei 金奖 Best High School Project 45 天津大学 Tianjin 金奖 Best New Application Project, Undergrad 46 天津大学 Tianjin 金奖 Best New Basic Part, Undergrad 47 天津大学 Tianjin 金奖 Nominated for Best New Composite Part, Undergrad 48 天津大学 TJU 金奖 Best Energy Project 49 清华大学 Tsinghua 金奖 50 电子科技大学 UESTC_Software 金奖 Nominated for Best Software Project 51 中国科技大学 USTC-Software 金奖 52 浙江大学 ZJU-China 金奖 1 安徽工业大学 AHUT_China 银奖 2 北京师范大学 BNU-CHINA 银奖 3 中国农业大学 CAU_China 银奖 4 台湾长庚大学 CGU_Taiwan 银奖 5 复旦大学 Fudan 银奖 6 杭州十四中 Hangzhou-H14Z 银奖 7 兰州大学 LZU-China 银奖 8 东北林业大学 NEFU_China 银奖 9 南京农业大学 NJAU_China 银奖 10 台湾大学 NTU-LIHPAO-Taiwan 银奖 11 纽约大学(上海) NYU_Shanghai 银奖 Nominated for Best Poster, Undergrad 12 中国海洋大学 OUC-China 银奖 13 四川大学 SCU_China 银奖 14 华南理工大学 SCUT 银奖 15 深圳外国语学校 Shenzhen_SFLS 银奖 Nominated for Best Poster, High School 16 台湾慈济大学 TCU_Taiwan 银奖 17 武汉大学 WHU-China 银奖 18 西安交通 - 利物浦大学 XJTLU-CHINA 银奖 1 福建农林大学 FAFU-CHINA 铜奖 2 吉林大学 Jilin_China 铜奖 3 南开大学 Nankai 铜奖 4 东北农业大学 NEAU-China 铜奖 5 华南理工大学 Scut-Champion-Park 铜奖 6 辽宁省实验高中 Shiyan_SY_China 铜奖 Best Education and Public Engagement, High School 7 中山大学广东实验中学 SKLBC-DGSYZX 铜奖 Best Supporting Entrepreneurship, High School 8 深圳中学 SZMS_15_Shenzhen 铜奖 9 清华大学 Tsinghua-A 铜奖 10 武汉大学药学院 WHU-Pharm 铜奖
iGEM_whu_2011将会在今年10月15日赴HKUST参加iGEM亚太地区盛会 ,与全亚太地区来自其他顶尖学府共46支团队同台竞技。 (下图是今年igem亚太地区logo) 毕竟平日里本科生被日常课程、实验室实验、鸡阿姨等折腾的燋头烂额,研究生又多埋头于自己所谓的科研课题,恐怕没有多少人知道iGEM的存在。但是无奈的是,院内诸多本科生竟然并不知晓今年武大(以生科本科生为主)参加了iGEM?昨日看见各种人人状态,本人一边感叹“终于有本科生开始宣传iGEM”了,另一边唏嘘本科生们竟然不知道真实发生在自己身边的超学术社团?也不知道院里投了这么多钱赞助iGEM-WHU?列位浪费了多好的机会呀!参加iGEM可比在实验室打杂、GRE考1500超值多了!毕竟以后列位出国了去研究机构了是去做研究的,而不是单纯刷试管、单纯配试剂、单纯炫英语的。 这么好的东西,有必要给个侧重在生物方面的fast review,抛砖引玉,让大家一窥iGEM究竟是什么?什么是合成生物学?什么是人造生命?什么是基因组学未来必然趋势? iGEM的全程是International Genetically Engineered Machine competition。基因、工程是关键词。这是一场主要面向全球高校本科生的“学术party”,将合成生物学这一热门学科带进高校,主要给本科生提供展示想象力和科研创造力的舞台。在这里,谁说本科生干不出大事业?在这里,只有你想不到,没有你做不到。 (下图为全球igem注册情况) 那iGEM的核心,合成生物学,是什么?这是一门高度多学科交叉的热门科学,融合了生命科学、数学建模和统计、编程、工程学。生命科学提供课题原理、机制,数学建模和统计可以模拟和预测基因调控关系、编程快速分析、工程学思想提供基因回路设计框架。 (下图为2011年9月2日Science关于synbio的专刊) 如果说计算机大赛的玩具是代码、数学建模大赛的玩具是公式,那iGEM的玩具就是biobrick(生物砖)。这是合成生物学不同于其他遗传、基因工程的最大亮点。每个基因或者基因调控元件被标准化为一块“基因乐高积木”。可以发挥你的想象力,构建一座华丽的基因大厦,赋予生命新的功能。 (下图为2007年iGEM上PKU设计的on-off开关并在2010年nature发表) 还记得微生物实验课上用E.coli在平板上简单涂布写字?弱爆了,在iGEM你可以制作E.coli自拍照片! 觉得E.coli养起来太难闻而不愿进微生物实验室?hold住,在iGEM你可以养迷人香蕉味的E.coli! 觉得细菌们几乎都是清一色太丑?not fashion,在iGEM你可以养七彩色的E.coli! 还有更多,还有更多…… 重金属环境检测等各类biosesor,赋予E.coli人性、生物学里的电子振荡器(oscillator)等各色电子元件、构建最小基因组(essential genes of minimal genomes)等等。不过可惜的是,这些都挺犀利的想法,但都已经是iGEM历年的话题。新的iGEM世界大门为你打开,等待你们谱写新的画卷。 跳出iGEM小圈子,来到大学科,合成生物学。总的来说,合成生物学对生命有新的解读和理解。生命,非常像一台机器。基因组作为软件、细胞器进而到组织作为硬件。每个生命都是一台不可思议的机器。大家学生物,归根结底不就是想理清楚这台机器的运作原理么?基因功能分析、蛋白质功能分析,不就是为了测评机器部件的工作状态么?最小基因组(p.s.现在改口叫做essential genes of minimal genomes)不就是测评机器运转的最低配置么?等等…… 更重要的是,这门学科将这种理念付诸实践。之所以说这才是重点,是因为生物上早有这个思想。也许你在分子生物学课上会听到老师说某某蛋白recruit了某某组成machinery。可仔细想想既然是machinery,那就应该可以人工优化改造改进。但是分子生物学里有后话了么?貌似没有。相比之,合成生物学学术界犀利的斯坦福少年Drew Endy说:"If you consider nature to be a machine, you can see that is not perfect and it can be revised and improved. " 太多脑残甚至被人骂做不务实的想法,带来了太多新奇的发现。 不知你想过没有,终止密码子有三种,可是如果把所有的终止密码子替换成一种,生命会完蛋么?哈佛的老头George Church就做了这么件事情。 太多新奇的发现越发促进了太多不可思议的创造。 你想一个生命的基因组里“刻有”自己的名字么?曾经帮助人类基因组计划大步提前完成的“半神半人”的Craig Venter人工合成细菌,取名Synthia,在其基因组里加入了自己的名字。 鉴于最近一项名字为AEGIS(six-letter Artificially Expanded Genetic Information Systems)的科研项目正在启动,未来出现DNA是六种碱基的生命也不是怪事。也许若干年后出现Synthetica,打破Bacteria、Archaea、Eucarya三足鼎立局面的教科书,可千万不要惊讶。 太多不可思议的创造了结了太多曾经不可能的遗憾。 最近吵的火热的青蒿素和所谓离“诺贝尔”最近一步,让人惋惜。因为发现有效药物是一回事,生产药物又是一回事,毕竟工业化制造青蒿素是非常困难的事情(一窥红豆杉便知)。而2006年来自UC Berkeley的大叔J.D. Keasling (右下图) 赋予了yeast合成青蒿素前体的功能,此前体经过简单后期化学处理就可以得到青蒿素。这样在抵抗疟疾上合成生物学写下光辉一笔。 太多被了结的遗憾孕育太多等待书写的新未来。 石油能源有朝一日必会枯竭,生物替代能源必主导能源世界。以后开车不再加汽油,而是加废报纸。Tulane University的团队已经实现了这一想法 。也许你知道用粮食来发酵产酒精,但那都弱爆了。想想苦难中的几内亚坦桑尼亚没有饭吃的儿童吧。所以合成生物学家们正在利用纤维素作为原材料,不仅仅是产生能源,更加是高效生产能源。 如果你觉得这些都挺好玩的,那就关注iGEM吧!上述的一切以及未来的更多精彩未知数,都会浓缩在iGEM这个party里! p.s. 很多项目和观点鉴于篇幅限制都没有展开。国外做这些的人很多,在加州抓起来一大把,日后列位出国可以往那里奔。国内也有部分人在做,相对成熟的有中科大、天津大学等,不过能方便大家迅速参与的科研机构首推华大基因研究院合成生物学单元(Unit of Synthetic Biology at BGI即USB@BGI)。武大和华大有创新班联合培养,每年暑假7月底8月初BGI会组织夏令营活动。USB@BGI的团队也很有爱,首推其Leader(美女+才女)以及全才型大号正太。 p.p.s. 武大生科做这个的人屈指可数。2010年武大第一支iGEM团队,种种原因没有得到院里赞助。今年2011年终于如愿以偿,有了第一支参加iGEM的团队。 --end reference 可以这么说,如果你是一名功力的科研者,那做synbio吧,发的文章都必须高质量,因为这是基因组学的未来和必然趋势。 http://2011.igem.org/Regions/Asia/Jamboree 2004 UCSF/UC Austin: http://partsregistry.org/cgi/htdocs/SBC04/austin.cgi 2006 MIT: http://openwetware.org/wiki/IGEM:MIT/2006/Blurb 2009 Cambridge: http://2009.igem.org/Team:Cambridge Gibson, D. G., Glass, J. I., Lartigue, C., Noskov, V. N., Chuang, R. Y., Algire, M. a, Benders, G. a, et al. (2010). Creation of a Bacterial Cell Controlled by a Chemically Synthesized Genome. Science , (May). doi:10.1126/science.1190719 Isaacs, F. J., Carr, P. a, Wang, H. H., Lajoie, M. J., Sterling, B., Kraal, L., Tolonen, a C., et al. (2011). Precise Manipulation of Chromosomes in Vivo Enables Genome-Wide Codon Replacement. Science , 333(6040), 348-353. doi:10.1126/science.1205822 Ro, D.-K., Paradise, E. M., Ouellet, M., Fisher, K. J., Newman, K. L., Ndungu, J. M., Ho, K. A., et al. (2006). Production of the antimalarial drug precursor artemisinic acid in engineered yeast. Nature , 440(7086), 940-943. Retrieved from http://dx.doi.org/10.1038/nature04640 Bond-Watts, B. B., Bellerose, R. J., Chang, M. C. Y. (2011). Enzyme mechanism as a kinetic control element for designing synthetic biofuel pathways. Nature chemical biology , 7(4), 222-7. Nature Publishing Group. doi:10.1038/nchembio.537 Ha, S.-jin, Galazka, J. 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Retrieved from http://dx.doi.org/10.1038/nature04640 http://tulane.edu/news/newwave/082511_fuel.cfm last echo 本来着实不想写这种玩意,但是看着iGEM_WHU自己未完的粗糙主页,不知道是不是会桑到不少新生那好奇的心。 iGEM_WHU_2011,祝好