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拓扑相关域的存在与功能
2020-01-16 09:43

美国宾夕法尼亚大学Jennifer E. Phillips-Cremins等研究人员对拓扑相关结构域(TAD)的存在与功能进行了讨论。相关论文2020年1月10日在线发表于国际学术期刊《自然—遗传学》。

研究人员表示,在广泛的真核生物中,基因组被折叠成更高结构的染色质结构域。TAD最初是在低分辨率Hi-C热图中凭经验发现的,这表示来自数百万个细胞的整体平均交互频率。

研究人员讨论了高分辨率Hi-C、单细胞成像实验和功能遗传研究的最新进展,这些进展为基因组的层次结构与功能关系提供了越来越复杂的视图。在这些新发现的基础上,研究人员根据相关结构、机制和功能特性的新认知,更新了不同类别染色质域的定义。

附:英文原文

Title: On the existence and functionality of topologically associating domains

Author: Jonathan A. Beagan, Jennifer E. Phillips-Cremins

Issue&Volume: 2020-01-10

Abstract: Genomes across a wide range of eukaryotic organisms fold into higher-order chromatin domains. Topologically associating domains (TADs) were originally discovered empirically in low-resolution Hi-C heat maps representing ensemble average interaction frequencies from millions of cells. Here, we discuss recent advances in high-resolution Hi-C, single-cell imaging experiments, and functional genetic studies, which provide an increasingly complex view of the genome’s hierarchical structure–function relationship. On the basis of these new findings, we update the definitions of distinct classes of chromatin domains according to emerging knowledge of their structural, mechanistic and functional properties.

DOI: 10.1038/s41588-019-0561-1

Source: https://www.nature.com/articles/s41588-019-0561-1

Nature Genetics:《自然—遗传学》,创刊于1992年。隶属于施普林格·自然出版集团,最新IF:41.307
官方网址:https://www.nature.com/ng/
投稿链接:https://mts-ng.nature.com/cgi-bin/main.plex


本期文章:《自然—遗传学》:Online/在线发表

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