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荷兰格罗宁根大学Siewert J. Marrink、Paulo C. T. Souza等研究人员合作开发出改进版粗粒化马提尼力场模型。相关论文于2021年3月29日在线发表于国际学术期刊《自然—方法学》。

研究人员报道了改进的模型Martini 3（http://cgmartini.nl），该模型具有改进的相互作用平衡、新的颗粒类型以及扩展的功能，包括氢键和电子极化率的特定相互作用表现。

更新后的模型可以更准确地预测总体的分子堆积和相互作用，这在广泛的应用领域中得到了证明，从油/水分配和混溶性数据到复杂的分子系统，包括蛋白质-蛋白质和蛋白质-脂质相互作用，以及在材料科学中的应用，离子液体和乙二胺。 

据悉，粗粒化马提尼力场被广泛用于生物分子模拟。

附：英文原文

Title: Martini 3: a general purpose force field for coarse-grained molecular dynamics

Author: Paulo C. T. Souza, Riccardo Alessandri, Jonathan Barnoud, Sebastian Thallmair, Ignacio Faustino, Fabian Grnewald, Ilias Patmanidis, Haleh Abdizadeh, Bart M. H. Bruininks, Tsjerk A. Wassenaar, Peter C. Kroon, Josef Melcr, Vincent Nieto, Valentina Corradi, Hanif M. Khan, Jan Domaski, Matti Javanainen, Hector Martinez-Seara, Nathalie Reuter, Robert B. Best, Ilpo Vattulainen, Luca Monticelli, Xavier Periole, D. Peter Tieleman, Alex H. de Vries, Siewert J. Marrink

Issue&Volume: 2021-03-29

Abstract: The coarse-grained Martini force field is widely used in biomolecular simulations. Here we present the refined model, Martini 3 (http://cgmartini.nl), with an improved interaction balance, new bead types and expanded ability to include specific interactions representing, for example, hydrogen bonding and electronic polarizability. The updated model allows more accurate predictions of molecular packing and interactions in general, which is exemplified with a vast and diverse set of applications, ranging from oil/water partitioning and miscibility data to complex molecular systems, involving protein–protein and protein–lipid interactions and material science applications as ionic liquids and aedamers.

DOI: 10.1038/s41592-021-01098-3

Source: https://www.nature.com/articles/s41592-021-01098-3

Nature Methods：《自然—方法学》，创刊于2004年。隶属于施普林格·自然出版集团，最新IF：47.99
官方网址：https://www.nature.com/nmeth/
投稿链接：https://mts-nmeth.nature.com/cgi-bin/main.plex