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梭状芽孢杆菌的分类
Collins等人对梭状芽孢杆菌进行详细的系统发育分析后,建议将其分为19个类群。他们在1994年10月的《国际细菌系统》发表了他们的文章“梭状芽孢杆菌属的系统发育:五个新属十一个新种组合的提出”(Collins et al.,1994)。他们用PCR直接测序法测定了34株已命名和未命名梭状芽胞杆菌的16S rRNA基因序列,并与80余个已测定的梭状芽胞杆菌序列和其它低G+C含量革兰氏阳性属代表种的已发表序列进行了比较,从而提供了梭状芽胞杆菌的谱系关系的几乎完整的图像。他们的系统发育分析结果证实并扩展了以前的研究结果,表明梭状芽孢杆菌属是非常异质的,许多种在系统发育上与其他孢子形成属和非孢子形成属混杂在一起。他们提出梭状芽胞杆菌属显然需要大的修订,该研究和以前的研究中确定的rRNA结构可能为将来的分类重组提供良好的基础。根据表型和系统发育数据讨论了重组的问题和不同的可能性,并提出了梭状芽孢杆菌及其近亲可能的层次结构。根据表型标准和系统发育分析结果,提出了以下5个新属和11个新组合:
1)Caloramator gen. nov., with Caloramator fervidus comb. nov.;
2)Filifactor gen. nov., with Filifactor villosus comb. nov.;
3)Moorella gen. nov., with Moorella thermoacetica comb. nov.;
4)Moorella thermoautotrophica comb. nov.;
5)Oxobacter gen. nov., with Oxobacter pfennigii comb. nov.;
6)Oxalophagus gen. nov., with Oxalophagus oxalicus comb. nov.;
7)Eubacterium barkeri comb. nov.;
8)Paenibacillus durum comb. nov.;
9)Thermoanaerobacter kivui comb. nov.;
10)Thermoanaerobacter thermocopriae comb. nov.;
11)Thermoanerobacterium thermosaccharolyticum comb. nov.
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