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1, 叶绿素是个含糊的指标，笼统的指标，权宜的指标。

我们想反应水体浮游植物的情况，又没有分类鉴定方面的人，而浮游植物又不是主要的讨论对象，叶绿素是可以用用用的。

但是这个指标只反映了一个总浮游植物的部分特征，最近刘老师一个评价鲢鳙控藻的帖子里可以看出，很多人在用叶绿素这个指标来评价浮游植物的特征，这是不完整的，掩盖或混淆或忽视了浮游植物种群间的差异，仅靠它下的结论都不可靠。

2,叶绿素测量误差大。这是方法的缺陷，客观存在的，至少如此。新方法用酒精抽提，酒精抽提效果差，有些明明膜上有藻的差异，但差异经常反应不出来。丙酮抽提效果好多了，因为丙酮对身体不好，所以要注意防护。膜泡到丙酮里，结果受以下因素影响，滤膜的藻面直接接触丙酮还是卷进去靠渗透接触，浸泡时间长短，浸泡液体积和高度，测量时碎渣的影响，倾倒出的是哪部分，底部偏绿。还有个就是测量人的态度，这些都影响到结果。

3,叶绿素做背景指标供参考或锦上添花可以，靠它下结论就不太科学了。

4,仪器测量更不靠谱，至少目前如此。ysi的叶绿素探头不好使，至少目前没有发现或听说有好使的便携仪器测它。