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QTL与环境互作 文献解读

已有 4287 次阅读 2016-1-7 10:01 |个人分类:农学统计|系统分类:科研笔记|关键词:学者

芜菁在不同干旱处理下考察开花前生理生态性状相关QTL与环境的互作Genotype–environmentinteractions affecting preflowering physiological and morphological traits ofBrassica rapa grown in two watering regimes物种:芜菁期刊:Journalof Experimental Botany影响因子:5.79发表单位:瓦赫宁根大学发表时间:20142 

研究背景:

 

植物产量受干旱的影响较大。随着全球变暖,植物的抗旱性研究十分迫切。研究复杂数量性状与干旱互作的分子机理以及相关基因,将有利于培养出适应性广、产量高的生产品种。

 

研究方法:

 

选取芜菁的RIL群体(F7),随机分为两组处理,一组为对照,一组为干旱处理,重复三次(三个区组),测生理生态表型数据,估计表型的BLUP值作为QTL定位的表型。用GenStat多性状多环境QTL定位模型,估计QTL X E 互作,找到不同类型互作的QTL位点。

 

应用GenStat软件中的模型:

 

1BLUP估计:每组处理有三个区组,将品种和区组作为随机因子,估计方差组分和BLUP,计算遗传率:

模型如下图:

01

文本框:方差分量文本框:遗传率文本框:BLUP预测

 

2、表型相关显著性测验:

 

3QTL定位

 

4G X E


5、聚类分析

 

研究结果

1、20个表型数据进行QTL定位,共定位到54个相关QTL


2、54QTL进行聚类,可划分为11


3、17QTL显示与环境互作达到极显著水平

 

4、根据表型关联分析的结果,将QTL与环境互作的QTL定位到第七条染色体上

 

参考文献

Mohamed El-Soda,Martin P. Boer, Hedayat Bagheri, et al. Genotype–environmentinteractions affecting preflowering physiological and morphological traits ofBrassica rapa grown in two watering regimes [J]. Journal of ExperimentalBotany, 2014.

文章链接

http://www.researchgate.net/publication/259961011_Genotypeenvironment_interactions_affecting_preflowering_physiological_and_morphological_traits_of_Brassica_rapa_grown_in_two_watering_regimes




https://m.sciencenet.cn/blog-2577109-948676.html

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