科学网-[转载]2023年(3)：An updated ETCM v2.0 database for TCM research-徐志建的博文

[转载]2023年(3)：An updated ETCM v2.0 database for TCM research

2023-12-26 21:03

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有关中医药的自主知识产权开源数据库——中医药百科全书（ETCM）已于2018年底上线，截至目前，该数据库已被198个国家或地区访问，总访问量为56万次。该数据库的研究论文已于2019年在国际著名期刊《核酸研究》（《Nucleic Acids Research》）发表，至今已被他引279次，并入选“ESI高被引论文”。利用ETCM数据库发表的学术论文已有546篇，其中SCI论文276余篇。为满足中医药现代化事业飞速发展的需要，中国中医科学院中药研究所许海玉研究员、张彦琼研究员及中国科学院上海药物所徐志建研究员课题组，合作构建了更新版ETCM数据库—ETCM v2.0（http://www.tcmip.cn/ETCM2/front/#/）：

ETCM v2.0是一个结构化、高质量的多源数据整合数据库：该数据库对48442首古代方剂和9872种中成药中所涉及到的方剂名称、药材组成、主治疾病、证候、症状等中医术语进行了结构化、规范化工作，同时提供相似性中药方剂/中成药/中药材/化学成分列表、中药材图片、产地信息、指标性成分限度及等特色数据资源。相较于现有同类型数据库，ETCM v2.0在数据总量、数据质量、数据类型、可视化方式等方面均具有明显优势。

ETCM v2.0是一个权威算法集成、智能网络关联的分析平台：创建了中药成分靶点预测方法（D3CARP）、处方药物相似性评价方法（FDSE）、多维智能化关联网络可视化等方法，提供“方剂→中草药→成分→靶标基因→功能/通路→疾病”多维智能化关联分析及图形化呈现，全面解析中药复杂系统与机体分子网络之间的相互作用关系。

ETCM v2.0是一个开源生态中医药权威大数据，提升了中医药国际影响力：与Pubchem、Uniprot、Genecards等国际权威化学和生物学数据库建立外部链接，建立了中药方剂、中药材等基本信息和质谱鉴定用户数据上传功能，形成了中医药科研人员共建的生态中医药权威大数据。

作为联系中医药与现代医学研究的重要桥梁，ETCM v2.0将对全国乃至全世界的中医药临床和科研优势团队免费开发共享，并继续为中医药理论的科学内涵、中药质量控制、中药作用原理揭示、中药新药研发，尤其是现代药物组合发现和优化等，提供强有力的数据基础和分析平台。该文章发表在《药学学报》英文刊（Acta Pharmaceutica Sinica B）2023年6期。

ETCM v2.0: An update with comprehensive resource and rich annotations for traditional Chinese medicine

Yanqiong Zhang¹, Xin Li¹, Yulong Shi¹, Tong Chen, Zhijian Xu, Ping Wang, Meng Yu, Wenjia Chen, Bing Li, Zhiwei Jing, Hong Jiang, Lu Fu, Wenjing Gao, Yanhua Jiang, Xia Du, Zipeng Gong, Weiliang Zhu, Hongjun Yang, Haiyu Xu^*

Acta Pharm Sin B 2023;13(6):2559-2571

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