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狂犬病毒的进化(7)

已有 995 次阅读 2023-12-28 23:51 |个人分类:狂犬病防治|系统分类:科普集锦

狂犬病毒的进化——

大型学术专著《狂犬病》最新版新增的一章

目前国际上关于狂犬病最权威最全面的大型学术专著《狂犬病的科学基础和管控（RABIES: SCIENTIFIC BASIS OF THE DISEASE AND ITS MANAGEMENT）》，简称《狂犬病(Rabies)》。该书被誉为有关狂犬病的百科全书。该书初版于2002年，第2版和第3版分别出版于2007年和2013年。其最新版（第4版）于2020年5月出版，共有22章，732页。与前一版相比，最新版新增了两章，体现了近十年来狂犬病研究领域的重要进展。

原书内容丰富，本博客在过去三年多的时间里曾陆续对此书的部分内容进行过译介。今天开始译介此书较旧版新增的两章之一：第３章－狂犬病毒的进化。

本章目录：

3.1 概述

3.2 狂犬病毒在稳定的宿主－病毒关联中的微观进化动力学

3.3 狂犬病毒的宏观进化动力学

3.4 适应性进化在跨物种传播中作用的证据：调和（Reconciling）毒株

3.5 进化数据在狂犬病预防和控制中的应用——遗传学作为传播的标签

3.6 结论

第３章－狂犬病毒的进化(7)

3.3 狂犬病毒的宏观进化动力学(4)

（Macroevolutionary dynamics of rabies）

3.3狂犬病毒的宏观进化动力学(4)

（Macroevolutionary dynamics of rabies ）

　　 图3.5　经过充分研究和推断的宿主转移的例证：狂犬病毒向哺乳动物中不同目的动物的转移。

图表中首行（目录）：接收病毒的宿主，病毒来源宿主，引进／结果，地区，时间轴，进化的适应，关键文献。

图表中２－８行：哺乳动物７个目的动物中狂犬病毒转移的情况。

图片来自维基共享资源 (https://commons.wikimedia.org)。

有趣的是，一些推断的RABV（狂犬病毒）新传播周期的报告涉及非典型宿主，包括南美灵长类动物(Condori-Condori, Streicker, Cabezas-Sanchez, & Velasco-Villa, 2013; Favoretto et al., 2013; Favoretto, de Mattos, Morais, Araujo, & de Mattos, 2001; Kotait et al., 2018) 和非洲的一种偶蹄目动物（artiodactyl ）(Barnard, Hassel, Geyer, & De Koker, 1982; Hassel et al., 2018; Mansfield et al., 2006; Scott et al., 2013)。长期存在的看法是RABV仅由蝙蝠和食肉动物维持，上述明显的宿主转移现象对此看法提出了质疑(图3.5)。这些物种多年来的大量病例及其病毒在RABV系统发生树上聚集在一起，表明在这些动物中也存在RABV的持续传播。然而，通常很难辨别这些病例是真正的宿主转移，还是源于取样不足的物种中的病毒的周期性溢出，抑或是两者的某种结合。由于在其他物种中未发现密切相关的病毒，因此这些新变种的起源存在不确定性，从而使问题进一步复杂化。这种情况阻碍了对潜在适应性进化的评估，因为很难评估观察到的氨基酸变化是发生在新宿主还是发生在未识别的储存宿主中(图3.4)。例如，在南美洲遇到的狨猴（marmoset）RABV出现在一个较大的食虫蝙蝠进化枝（clade）的一个长分枝上，这使得与已知蝙蝠病毒的所有差异不太可能发生在狨猴病毒身上 (Kotait et al., 2018)。从现有数据中发现的一个新模式是，将RABV成功引入新宿主物种的情况通常不止一次地发生在提供病毒来源的同一个储存宿主物种中(图3.5)。这表明，这些病毒出现事件可能并不仅仅是出于偶然，而是涉及确定的特征(例如，所涉及的病毒谱系的预适应)。这还创造了一个有趣的机会来测试病毒在多次引入过程中的平行进化变化，其结果可以提供强有力的指征，表明这些变化是适应性的 (Gutierrez, Escalera-Zamudio, & Pybus, 2019)。

（未完待续）

相关链接：

Anthony R. Fooks & Alan C. Jackson主编，《RABIES: SCIENTIFIC BASIS OF THE DISEASE AND ITS MANAGEMENT（狂犬病的科学基础和管控）》，简称《狂犬病(Rabies)》。该书最新版（第４版）共有22章，732页，由Elsevier Inc.旗下的学术出版社（Academic Press）出版。