植物分子育种分享 http://blog.sciencenet.cn/u/bioysy 欢迎对分子育种有兴趣的朋友们!

博文

水稻QTL

已有 5902 次阅读 2011-5-26 07:49 |系统分类:科研笔记|关键词:学者

这里有张表,里面有水稻中已经发现的QTL数据
这是我昨晚下载的
根据这个表可以估计水稻中已经鉴定的QTL的数量

什么是QTL

Quantitative Trait Loci (QTL) are essentially a statistical creation that identifies a particular region of the genome as containing one or more genes, and that region is associated with the trait being measured. A QTL is shown as an interval across a chromosome where the probability of association is plotted for each marker used in the mapping experiment.

The Gramene QTL database includes QTL identified for numerous agronomic traits in rice, maize, barley, oat, sorghum, pearl millet, foxtail millet and wild rice. The emphasis is on presenting QTLs with both information on associated traits and a mapped locus on a genetic map.

不过这个地址给的表好象内容是不全的,因为这个表只有5列,分别为:qtl_accession_id qtl_name chromosome start end.按http://docs.gramene.org/QTL_Load_File_Format这个数据不全.

QTL统计信息:ftp://ftp.gramene.org/pub/gramene/release33/data/statistics/,其中release33是版本号,如果版本更新这个数据会发生变化

目前关于QTL的统计信息

qtl_statistics,这个文件可以用EXCEL打开

gramene的学习资料:ftp://ftp.gramene.org/pub/gramene/tutorials/



https://m.sciencenet.cn/blog-479743-448040.html

上一篇:院士侯选人也可能上当受骗
下一篇:中文期刊随笔

0

发表评论 评论 (4 个评论)

数据加载中...
扫一扫,分享此博文

全部作者的精选博文

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-5-23 12:28

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部