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水稻基因组100k
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每100k水稻基因组里都有些什么?刚发现了SQL查询函数的一个有意思的功能,所以能很快的给出一组统计数据.这个数据可以为在精细定位的时候进行分子标记开发提供参考.因为它可以告诉你100k内有多少DEL和Insert,有几个非转座子编码基因.
参考基因组序列为tigrv5.这是一个让人怀念的水稻基因组版本.因为在这版以后的水稻基因组浏览器中,已经没有了indel数据(或者由于我自己的疏忽而没有发现).为什么现在的版本中不给出这么重要的数据,这是一个让人困惑的事情.要用PCR的方法进行定位的话,还是InDel比较好用点.
工欲善其事,必先利其器.SQL,perl都是非常好的东西,当然还有tigrv5.
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