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1159个水稻InDel标记

已有 5897 次阅读 2012-11-13 23:31 |个人分类:多态性|系统分类:科研笔记|关键词:学者

    查询语句:select Chr,polystar,polyend,polylength,lprimer,rprimer,pcrlenth,cM,bac_id,chr_start,chr_end from tigrv5_indel_cM
    参考序列序列还是tigr version 5.polystar:多态序列在序列中的起始位置,polyend,终止位置.polylength:多态片段长度.这里的cM和bac_id都是有来头的了,cM是小日本那个高密度水稻遗传图中的cM,bac_id也是标准的编号,可以在NCBI那个网站上查得到.
    附件提供的表的特点:有遗传位置,有物理位置,有引物序列,有籼粳间的多态,PCR片段的大小在130到200间,标记名由染色体和遗传距离组成.
    我要是需要新合成引物来作图,当然宁愿选择这个表里的引物.呵呵.唯一不足的是:对数据的来源我没做交代.这个慢慢来.

1159_indel_primers.XLS



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2 吴亚辉 sz1961sy

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