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使用Modeltest筛选核苷酸替换模型

已有 7286 次阅读 2011-7-17 15:54 |个人分类:我的研究|系统分类:科研笔记|关键词:学者| 核苷酸, Modeltest, 软件使用, 替代模型

使用Modeltest筛选核苷酸替换模型

熊荣川

六盘水师范学院生物系 xiongrongchuan@126.com

 

我们使用模型最全的jModelTest.jar,位置D:downloadBio tools softwaresjmodeltest0.1jModelTest 0.1 package

这个软件的目的是挑选最适合我们所分析的序列文件中核苷酸替代的模型,因此理论上讲是需要输入一个比对后的核苷酸序列文件。

软件包提供了一些可以作为例子分析的比对序列D:downloadBio tools softwaresjmodeltest0.1jModelTest 0.1 packageexamples

我们以small.fas为例来演示怎样使用软件进行模型选择:


https://m.sciencenet.cn/blog-508298-465649.html

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1 陈飞

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