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R语言去掉Genbank序列号的.1后缀

已有 4236 次阅读 2014-3-26 13:11 |个人分类:我的研究|系统分类:科研笔记|关键词:学者| R语言, 去掉, Genbank序列号

R语言去掉Genbank序列号的.1后缀

#作者信息

熊荣川

六盘水师范学院生物信息学实验室

xiongrongchuan@126.com

http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz

# 预装函数

#Genbank中的序列越来越多，我们常常要一次性下载很多序列或者序列索取号，用于后续的生物信息学分析，然而我们常常发现，下载的索取号后面的有一个“.1”后缀，这样的索取号用起来不是很方便，而且写进文章的的索取号也没有这个后缀。所以，需要把它们去掉。最直接的方法就是，使用“查找替换”功能。然而多个文件的情况下，可能就不甚其烦了。下面们提供一个R语言小函数，以解决这一问题。

#原始代码已在发布24小时后删除。

#使用方法

path ="D:……" > setwd(path) #设置工作路劲> filelist = dir(path) #如果我们要把所有文件的后缀都去掉> i=1 > infile = filelist[i] #对第一个文件进行操作，其实可以使用一个循#环语句操作多个文件Detag.1(infile) #调用函数完成操作

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