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关于基因语的思考(下)

已有 1188 次阅读 2022-7-6 10:24 |系统分类:科研笔记

        基因语如果最终被发现,应该是以什么形式呈现呢?基于四进制编码最方便的当然是字母文字,但同时会有比较高的冗余度,也许是更简洁的类似于汉字的象形文字。

        如果我们从基因语的视角,去看待目前面对的诸多疑惑,就能豁然开朗,如以下例子。

        1. 多个看似不相关的基因,共同关联着一个生物学功能。从基因语的视角可以理解为这些基因对应的文字,从语言的角度来说有明显的逻辑关系,语言所表达的含义就是要所实现的功能。比如在计算机编程里的for循环、生成随机数组或逻辑运算等命令语句。

        2. 基于这种观点,那基因组里的非编码DNA所对应的又是什么呢?可能对应的是虚词或表达语气的词。当然还有一种可能是基因表达过程更精细化的表述,因为受现有实验精度所限,还观测不到更精细的微过程。这就好比是化学反应中的催化剂,虽然在反应前后质量不变,但更精细的测量可以发现其贯穿于化学反应之中。

        3. 对于影响表观遗传的DNA甲基化修饰,则更像语言中的修辞,可能并非是影响基因表达与否,而是以一种更优雅的方式表达一些更细致的信息,比如否定之否定相当于肯定。

        如果人类真的能读懂基因语,也许可以领悟在冷冰冰碱基组合背后更深层次的美丽。考虑到生物体本身是一个极度复杂的系统,敲除、修改任何一个基因都有可能牵一发而动全身,这大概相当于随便加一个no就会完全改变原先要表达的意思。如果有效的从语言的角度去编写代码,借助于语法和句法有逻辑的进行基因编辑会是一个很好的方式。

        从另一个方面来说,如果我们能读懂基因组的语言,能做的事情可以更多。一个很自然的问题就是这种语言源自于哪里?是外星文明,是太古文明(比如上一代智慧生命),还是自然选择的产物?

        1. 如果是前者,对于基因语的深刻解读无疑可以更好的理解外星文明和太古文明。就像当年托马斯•杨和山商博良破译罗塞塔石碑那样使得现代人真正理解了古埃及文明。

        2. 如果是自然选择塑造的,即除了功能契合外还产生了一套复杂的逻辑,那可以认为自然选择看似随机的背后有定量的规律,也许可以定量的写出自然选择方程。



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2 汪凯 张学文

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