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Isotopic distribution pattern

已有 5828 次阅读 2010-2-7 13:34 |个人分类:质谱|系统分类:科普集锦|关键词:学者| 同位素

计算Isotopic distribution pattern的方法有很多,最基本是算二项式系数,简单的还可以,元素种类多一些,每种元素所含的同位素数目多于两种,这个就很麻烦了。而且即使计算出来了,得到的成千上万个数据中,有用只有那几个而已。所以,在这方面,简化的算法最好。

目前比较流行的是利用FFT的方法,最初的方法由Rockwood 等人提出的,发表在AC,1995,27, 2699与AC,1996,68,2027等. Decon2LS( http://omics.pnl.gov/software/Decon2LS.php)中的mercury使用的就是这个方法,感兴趣的可以下载它的源代码研究研究。

另一个简化的方式是由Kubinyi提出的,发表在Analytica Chimica Acta , 247 (1991) 107-119。最初是使用basci写的。The University of Washington的Michael J. MacCoss教授用VB写的"IDCalc"即使采用了这个算法。这个算法很简单,计算起来速度很快。日本电子(JEOL)的masscenter中的 isotope simulator 似乎也是采用这个算法做的。

另一个比较另类的是thermal的xcalibur,2.0之后的xcalibur提供了,根据分子式模拟同位素分布的功能,但是我感觉似乎是采用计算二项式系数的方法。如果输入比较大的分子式例如C3900H4902N1500 O2401P400,将会导致xcalibur的崩溃。建议thermal在下一个版本中修改这方面的算法,使之适应面更广些。

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1 党子衡

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